| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 18,127 | G→A | V213V (GTG→GTA) | nhaA → | Na(+):H(+) antiporter NhaA |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 18,127 | 0 | G | A | 93.3% | 119.8 / ‑5.2 | 47 | V213V (GTG→GTA) | nhaA | Na(+):H(+) antiporter NhaA |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/2); major base A (21/21); minor base T (2/1); total (23/24) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
CTACTGACATTGCTTTTGCACTTGGTGTACTGGCGCTGTTGGGAAGTCGTGTTCCGTTAGCGCTGAAGATCTTTTTGATGGCTCTGGCTATTATCGACGATCTTGGGGCCATCATTATCATCGCATTGTTCTACACTAATGACTTATCGATGGCCTCTCTTGGCGTCGCGGCTGTAGCAATTGCGGTACTCGCGGTATTGAATCTGTGTGGTGCACGCCGCACGGGCGTCTATATTCTTGTTGGCGTGGTGTTGTGGACTGCGGTGTTGAAATCGGGGGTTCACGCAACTCTGGCGGGGGTAATTGTCGGCTTCTTTATTCCTTTGAAAGAGAAGCATGGGCGTTCTCCAGCGAAGCGACTGGAGCATGTGTTGCACCCGTGGGTGGCGTATCTGATTTTGCCGCTGTTTGCATTTGCTAATGCTGGCGTTTCACTGCAAGGCGTCACGCTGGATGGCTTGACCTCCATTCTGCCATTGGGGAT > NC_000913/17880‑18363 | cTACTGACATTGCCTTTGCACTTGGTGTGCTGGCGCTGTTGGGAAGTCGTGTTCCGTTAGCGCTGAAGATCTTTTTGATGGCTCTGGCTATTATCGACGATCTTGGGGCCATCATTATCATCGCATTGTTCTACACTAATGACTTATCGATGGCCTCTCTTGGCGTCGCGGCTGTAGCAATTGCGGTACTCGCGGTATTGAATCTGTGTGGTGTACGCCGCACGGGCGTCTATATTCTGGTTGGCgtagtg > 1:297171/1‑251 (MQ=255) tGACATTGCCTATGCACTTGGCGTGCTGGCGCTGTTGGGACGTCGTGTTCCGTTAGCGCTGAAGATCTTTTTGATGGCTCTGGCTATTATCGACGATCTTGGGGCCATAATTATCATCGCCTTGTTCTACACTAATGACTTATCGATGGCCTCTCTTGGCGTCGCGGCTGTAGCAATTGCGGTAACCGCGGTATTGAATCTTTGTGGGGTACGCCGCACGGGCGTATATATTCTGGTTGGGGTTGtgttgg > 2:206444/1‑250 (MQ=255) ttGCCTTTGCACTTGGTGTGCTGTCGCTGTGTGGAAGTCGTGTTCCTTTAGCGCTGAAGATCTTTTTGATGGCTCTGGCTTTTATCGACGATCTTGGGGCCATCATTATCATCGCATTGTTCTACTCTAATGACTTAGCGTTGGCCTCTCTTGGCGTCGCGGCTGTAGCAATTTCGGTACTCTCGGTATTGAATCTGTGTGGTGTACGCCGCACGGGCGTCTATATTCTGGTTGGCGTAGTGTTGTGGa < 2:487534/249‑1 (MQ=255) gcTGGCGCTGTTGGGAAGTCGTGTTCCGTTCGCGCTGAAGATCTTTTTGATGGCTCTGGCTATTATCGACGATCTTGGGGCCATCATTATCATCGCATTGTTCTACACTAATGACTTATCGCTGGCCTCTCTTGGCGTCGCGGCTGTAGCAATTGCGGTACTCGCGGTATTGAATCTGTGTGGTGTACGCCGCACGGGGGGCTATATTCTGGTTGGCGTTGTGTTGAGGCCTGGGGTGTTGAAATCggggg > 2:80326/2‑251 (MQ=255) ggAAGTCGTGTTCCGTTAGCGCTGAAGATCTTTTTGATGGCTCTGGCTATTATCGACGATCTTGGGGCCATCATTATCATCGCATTGTTCTACACTAATGACTTATCGATGGCCTCTCTTGGCGTCGCGGCTGTAGCAATTGCGGTACTCGCGGTATTGAATCTGTGTGGTGTACGCTGCACGGGCGTCTATATTCTGGTTGGCGTAGTGTTGTGGACTGCGGTGTTGAAATCGGGGGTTCACGCAAccct < 1:367849/251‑4 (MQ=255) ggAAGTCGTGTTCCGTTAGCGCTGAAGATCTTTTTGATGGCTCTGGCTATTATCGACGATCTTAGGGCCATCATTATCATCGCATTGTTCTACACTAATGACTTATCGATGGCCTCTCTTGGCGTCGCGGCTGTAGCAATTGCGGTACTCTCGGTATTGAATCTGTGTGGTGTACGCCGCACGGTCGTCTATATTCTGGTTGGCGTAGTGTTGTGGACTGCGTTGTTGAAATCGGGGGTTCGCGCAAccct > 1:79408/1‑248 (MQ=255) gTCGTGTTCCGTTAGCGCTGAAGATCTTTTTGATGGCTCTGGCTATTATCGACGATCTTGGGGCCATCATTATCATCGCATTGTTCTACACTAATGACTTATCGATGGCCTCTCTTGGCGTCGCGGCTGTAGCAATTGCGGTACTCGCGGTATTGAATCTGTGTGGTGTACGCCGCACGGGCGTCTATATTCTGGTTGGCGTAGTGTTGTGGACTGCGGTGTTGAAATCGGGGGTTCACGCAACCCTGGCg < 2:297171/251‑1 (MQ=255) gttccgtttgacgcgAAGATCGTGTTGATGGCTCTGGCTATTATCGTGGATCTTTGGGCCAGTATTTTCATCTCATTGTGCTACACTAATGTCTTATCGATGGCCTCTCTTGGCGTCGCGGCTGTAGCAATTGCGGTACTCGCGGTATTGAATCTGTGTGTTGTACGCCGCACGGGCGTCTATATTCTGGTTGGCGTAGTGTTGTGGACTGCGGTGTCGAAATCGGGGGTGCACGCAACCCTGGCgggggg < 2:26699/237‑2 (MQ=255) gtTCCGTTAGCTCTGAAGATCTTTTGTATGGCTCTGGCTATGACCGACGATTTTGGGGCCATCATTATCATCGCATTGTTCTACTCTAATGACTTATCGATGGCCTCTCTTGGCGTCGCGGCTGTAGCAATTGCGGTACTCGCGGTATTGAATCTGTGTGGTGTACGCCGCACGGGCGTCTATAGTCTGGTTGGCGTAGTGTTGTGGACTGCGGTGTTGAAAGCGGGGGTTCACGCAACCCTGGCggggg < 2:461422/250‑1 (MQ=255) aGCGCTGAAGATCTTTTTGATGGCTCTGGCTATTATCGACGATCTTGGGGCCATCATTATCATCGCATTGTTCTACACTAATGACTTATCGATGGCCTCTCTTGGCGTCGCGGCTGTAGCAATTGCGGTACTCGCGGTATTGAATCTGTGTGGTGTACGCCGCACGGGCGTCTATATTCTGGTTGGCGTAGTGTTGTGGACTGCGGTGTTGAAATCGGGGGTTCACGCAACCCTGGCGGGGGTAATTGTCg < 1:235112/251‑1 (MQ=255) aGCGCTGAAGATCTGTTTGAAGGCTTTGGCTATTATCGACGATCTTGGGGCCATCATTATCATCGCATTGTTCTACATTAATGACTTATCTATTGCCTCGTTTGGCGTCGCGGCTGTAGCAATTGCGGTACTCGCGGTATTGAAGCTGTTTTGTGTACGCCGCACGGGCGGCTATATTCTGGTTGGCGTAGTGTTGTGGACTGCGGTGGTGAAATCGGGGGTTCACTCAACCCTGGCGGTGGTAATTGTc < 2:73513/250‑1 (MQ=255) cgcTGAAGATCTTTTTGATGGCTCTGGCTATTATCGCCGATCTTGGGGCCATCATTATCATCGCATTGTTCTACACTAATGACTTATCGATGGCCTCTCTTGGCGTCGCGGCTGTAGCAATTGCGGTACTCGCGGTATTGAATCTGTGTGGTGTACGCCGCACGGGCGTCTATATTCTGGTTGGCGTAGTGTTGTGGACTGCGGTGTTGAAATCGGGGGTTCACGCAACCCTGGCGGGGGTAATTGTCGGc < 2:199864/251‑1 (MQ=255) ccTGAAGATCTTTTTTATGGCTCTGGCTTTTATCGACTATCTTGGGGCCCTCATTATCATCGCATTGTTCTACACTAATGACTTATCGATGGCCTCTCTTGGCGTCGCGGCTGTAGCAATTTCGGTTCTCGCGGTATTGAATCTGTTTGGTGTACGTCGCACGGTCGTCTATATTCTGGTTGGCGTAGTGTTGTGGACTGCGGTGTTGAAATCGGGGGTTCACGCATCCCTGGCGGGGGTAATTGTCGGct < 1:656856/250‑1 (MQ=255) gAAGATCTTTTGTATGGCTCTGGCTATTAGCGACGATCTTTGGGCCATTATTATCATCGCATTGTTCTACACTAATGACTTATCGAGGGCCTCTCTTGGCGTGGCGGCTGTAGCAATTGCGGTACTCGCGGTATTGAATCTGTGGGGTGTACGCCGAGCGGGCGTCTAGATTCTGGTTGGCGGAGTGTTGTGGACTGCGGTGTTGAAATCGGGGGTTCACGCAACCCTGGCGGGGGTAAGTGTCGGcttct < 2:597271/251‑1 (MQ=255) aaGATCTTTTTGATGGCTCTGGCTATTATCGACGATCTTGGGGCCATCATTATCATCGCATTGTTCTACACTAATGACTTATCGATGGCCTCTCTTGGCGTCGCGGCTGTAGCAATTGCGGTACTCGCGGTATTGAATCTGTGTGGTGTACGCCGCACGGGCGTCTATATTCTGGTTGGCGTAGTGTTGTGGACTGCGGTGTTGAAATCGGGGGTTCACGCAACCCTTGCGGTGGTAATTGTCGGcttctt < 2:427146/251‑1 (MQ=255) aGATCTTTTTGATGGCTCTGGCTATTATCGACGATCTTGGGGCCATCATTATCATCGCATTGTTCTCCACTAATGACTTATCGATGGCCTCTCTTGGCGTCGCGGCTGTAGCAATTGCGGTACTCGCGGTATTGAATCTGTGTGGTGTACGCCGCACGGGCGTCTATATTCTGGTTGGCGTAGTGTTGTGGACTGCGGTGTTGAAATCGGGGGTTCACGCAACCCTGGCGGGGGTAATTGTGGGCtttttt > 2:488408/1‑251 (MQ=255) ttttGATGGCTCTGGCTATTATCGACGATCTTGGGGCCATCATTATCATCGCATTGTTCTACACTAATGACTTATCGATGGCCTCTCTTGGCGTCGCGGCTGTAGCAATTGCGGTACTCGCGGTATTGAAGCTGTGTGGTGTACGCCGCACGGGCGTCTATATTCTGGTTGGCGTAGTGTTGTGGACTGCGGTGTTGAAATCGGGGGTTCACGCAACCCTGGCGGGGGTAATTGTCGGCTTCTTTAtt < 1:593622/248‑1 (MQ=255) ggCTCTGGCTATTATCGACGATCTTGGGGCCATCATTATCATCGCATTGTTCTACACTAATGACTTATCGATGGCCTCTCTTGGCGTCGCGGCTGTAGCAATTGCGGTACTCGCGGTATTGAATCTGTGTGGTGCACGCCGCACGGGCGTCTATATTCTTGTTGGCGTGGTGTTGTGGACTGCGGTGTTGAAATCGGGGGTTCACGCAACTCTGGCGGGGGTAATTGTCGGCTTCTTTATTCCTTTGaaa < 1:292247/250‑1 (MQ=255) gtctcttatCGACGATCGTTGGGCCATCATTATCAGCGCATTGTTCTACACTAATTACTTAGCGATTGCCTCTCTTGGCGGCGCGGCTGTAGCAATTGCGGTACTCGCGGTATTGAATCTGTGGGGTGTACGCCGCACTGGCGTCTATATTCTGGTTGGCGTAGTGGTGTGGACTGCGGTGTTGAAATCGGGGGTTCACGCAACCCTGGCGGGGGTAATTGTCGGCTTCTTTATTCCTTTGAAAGAGaa < 2:626040/244‑1 (MQ=255) ttatCGACGATCTTGGGGCCATCATTATCATCGCATTGTTCTACACTAATGACTTATCGATGGCCTCTCTTGGCGTCGCGGCTGTAGCAATTGCGGTACTCGCGGTATTGAATCTGTGTGGTGTACGCCGCACGGGCGTCTATATTCTGGTTGGCGTAGTGTTGTGGACTGCGGTGTTGAAATCGGGGGTTCACGCAACCCTGGCGGGGGTAATTTTCGGCTTCTTTTTTCCTTTGCAAGAGAAgactggg > 2:138594/1‑245 (MQ=255) gggCCATCATTATCATCGCATTGTTCTACACTAATGACTTATCGATGGCCTCTCTTGGCGTCGCGGCTGTAGCAATTGCGGTACTCGCGGTATTGAATCTGTGTGGTGTACGCCGCACGGGCGTCTATATTCTGGTTGGCGTAGTGTTGTGGACTGCGGTGTTGAAATCGGGGGTTCACGCAACCCTGGCGGGGGGAATTGTCGGCTTCTTTATTCCTTTGAAAGAGAAGCATGGGCGTTCTCCagcga > 1:285325/1‑249 (MQ=255) ccATCATTATCATCGCATTGTTCTACACTAATGACTTATCGATGGCCTCTCTTGGCGTCGCGGCTGTAGCAATTGCGGTCCTCGCGGTATTGCATCTGTGTGGTGTACGCCGCACGGGCGTCTATATTCTGGTTGGCGTAGTGTTGTGGACTGCGGTGTTGAAATCGGGGGTTCACGCAACCCTGGCGGGGGTAATTGTCGGCTTCTTTATTCCTTTGAAAGAGAAGCATGGGCGGTCTCCagcgaagcg > 1:49909/1‑250 (MQ=255) atcatTATCATCGCATTGTTCTACACTAATGACTTATCGATGGCCTCTCTTGGCGTCGCGGCTGTAGCAATTGCGGTACTCGCGGTATTGAATCTGTGTGGTGTACGCCGCACGGGCGTCTATATTCTGGTTGGCGTAGTGTTGTGGACTGCGGTGTTGAAATCGGGGGTTCACGCAACCCTGGCGGGGGTAATTGTCGGCTTCTTTATTCCTTTGAAAGAGAAGCATGGGCGTTCTCCAGCGAAGCGACt < 1:451853/251‑1 (MQ=255) ttATCATCGAATTGTTCTACACTAATGACTTATCGATGGCCTCTCTTGGCGTAGCGGCTGTAGCAATTGCGGTACTCGCGGTTTTGAATCTGTGTGGTGTACGCCGCACGGGCGTCTATATTCTGGTTGGCGTAGTGTTGTGGAATGCGGTGTTGAAATCGGGGGTTCACGCAACACTGGCGGGGGTAATTTTCGGCTTCTTTATTCCTTTGAAAGGGATGCATgggggtactgcagggacacgaattgcg > 2:345190/1‑227 (MQ=255) gCATTTTTCTACACTAATGATGTATCGATGGCATATCTTGGCGTCGCGGCTGTAGCAATTGCGGTACTCGCGGTATTGAATCTGTGTGGTGTACGCCGCACGGGCGTCTATATTCTGGTTGGCGTAGTGTTGTGGACTGCGGTGTTGAAATCGGGGGTTCACGCAACCCTGGCGGGGGTAATTGTCGGCTTCTTTATTCCTTTGAAAGAGAAGCATGGGCGTTCTCCAGCGAAGCGACTGGAGCATGTGtt < 2:258334/251‑1 (MQ=255) gCATTGTTCTACACTAATGACTTATCGATGGCCTCTCTTGGCGTCGCGGCTGTAGCAATTGCGGTACTCGCGGTATTGAATCTGTGTGGTGTACGCCGCACGGGCGTCTATATTCTGGTTGGCGTAGTGTTGTGGACTGCGGTGTTGAAATCGGGGGTTCACGCAACCCTGGCGGGGGTAATTGTCGGCTTCTTTATTCCTTTGAAAGAGAAGCATGGGCGTTCTCCAGCGCAGCGACTGGAGCATGTGtt > 1:160300/1‑251 (MQ=255) cagtGTTCTACACTAATGACTTATCGATGGCCTCTCTTGGCGTCGCGGCTGTAGCAATTGCGGTACTCGCGGTATTGAATCTGTGTGGTGTACGCCGCACGGGCGTCTATATTCTGGTTGGCGTAGTGTTGTGGACTGCGGTGTTGAAATCGGGGGTTCACGCAACCCTGGCGGGGGTAATTGTCGGCTTCTTTATTCCTTTGAAAGAGAAGCATGGGCGTTCTCCAGCGAAGCGACTGGAGCATGTGtta < 1:225756/248‑2 (MQ=255) aTTGTTCTACACTACTGACTTATCGAAGGCCTCTCTTGGCGTAGCGGCTGTAGCAAGTGCGGTACTCGCGGGATTGAATCTGTGTGGTGTACGCCGCACGGGCGTCTATATTCTGGTTGGCGTAGCGGTGTGGACTGCGGTGTTGAAATCGGGGGTTCACGCAACCCTGGCGGGGGTAATTATAGGCGTCTTTATTCCTTTGAAAGAGGAGCAAGGGCGTTCTCCagcgaagcggatggaagaagtgtaac > 2:432280/1‑234 (MQ=255) tCTACACTAATGACTTATCGATGGCCTCTCTTGGCGTCGCGGCTGTAGCAATTGCGGTACTCGCGGTATTGAATCTGTGTGGTGTACGCCGCACGGGCGTCTATATTCTGGTTGGCGTAGTGTTGTGGACTGCGGTGTTGAAATCGGGGGTTCACGCAACCCTGGCGGGGGTAATTGTCGGCTTCTTTATTCCTTTGAAAGAGAAGCATGGGCGTTCTCCAGCGAAGCGACTGGAGCATGTGTTACACCCg > 1:547244/1‑251 (MQ=255) aaTGACTTATCGATGGCCTCTCTTGGCGTCGCGGCTGTAGCAATTGCGGTACTCGCGGTATTGAATCTGTGTGGTGTACGCCGCACGGGCGTCTATATTCTGGTTGGCGTAGTGTTGTGGACTGCGGTGTTGAAATCGGGGGTTCACGCAACCCTGGCGGGGGTAATTGTCGGCTTCTTTATTCCTTTGAAAGAGAAGCATGGGCGTTCTCCAGCGAAGCGACTGGAGCATGTGTTACACCCgtgggtggg > 1:190933/1‑250 (MQ=255) tGACTTATCGATGGCCTCTCTTGGCGTCGCGGCTGTAGCAATTGCGGTACTCGCGGTATTGAATCTGTGTGGTGTACGCCGCACGGGCGTCTATATTCTGGTTGGCGTAGAGTTGTGGACTGCGGTGTTGAAATCGGGGGTTCACGCAACCCTGGCGGGGGTAATTGTCGGCTTCTTTCTTCCTTTGAAAAAGAAGCATGGGCGTTCTCCAGCGAAGCGACTGGAGCATGTGTTACACCCGTGGGTGGCGt > 1:293561/1‑251 (MQ=255) cGATGGCCTCTCTTGGCGTCGCGGCTGTAGCAATTGCGGTACTCGCGGTATTGAATCTGTGTGGTGTACGCCGCCCGGGCGTCTATATTCTGGTTGGCGTAGTGTTGTGGACTGCGGTGTTGAAATCGGGTGTTCACGCAACCCTGGCGGGGGGAATTGTCGGCTTCTTTATTTCTTTGAAAGAGAAGCCTGGGCGGTCTCCCGCGCAGCGACTGGAGCATGTGTTACACCCGAGGGTGGCGGATCTggtt > 2:176916/1‑248 (MQ=255) cgGCTGTAGCAATTGCGGTACTCGCGGTATTGAATCTGTGTGGTGTACGCCGCACGGGCGTCTATATTCTGGTTGGCGTAGTGTTGTGGACTGCGGTGTTGAAATCGGGGGTTCACGCAACCCTGGCGGGGGTAATTGTCGGCTTCTTTATTCCTTTGAAAGAGAAGCATGGGCGTTCTCCAGCGAAGCGACTGGAGCATGTGTTACACCCGTGGGTGGCGTATCTGATTTTGCCGCTGTTTGCATTTGCt > 1:629589/1‑251 (MQ=255) aGCAATTGCGGTACTCGCGGTATTGAATCTGTGTGGTGTACGCCGCACGGGCGTCTATATTCTGGTTGGCGTAGTGTTGTGGACTGCGGTGTTGAAATCGGGGGTTCACGCAACCCTGGCGGGGGTAATTGTCGGCTTCTTTATTCCTTTGAAAGAGAAGCATGGGCGTTCTCCa > 1:658573/1‑175 (MQ=255) aGCAATTGCGGTACTCGCGGTATTGAATCTGTGTGGTGTACGCCGCACGGGCGTCTATATTCTGGTTGGCGTAGTGTTGTGGACTGCGGTGTTGAAATCGGGGGTTCACGCAACCCTGGCGGGGGTAATTGTCGGCTTCTTTATTCCTTTGAAAGAGAAGCATGGGCGTTCTCCa < 2:658573/175‑1 (MQ=255) cGGTACTCGCGGTATTGAATCTGTGTGGTGTACGCCGCACGGGCGTCTATATTCTGGTTGGCGTAGTGTTGTGGACTGCGGTGTTGAAATCGGGGGTTCACGCAACCCTGGCGGGGGTAATTGTCGGCTTCTTTATTCCTTTGAAAGAGAAGCATGGGCGTTCTCCAGCGAAGCGACTGGAGCATGTGTTACACCCGTGGGTGGCGTATCTGATTTTGCCGCTGTTTGCATTTGCTAATGCTGGCGTTTc > 1:212514/1‑250 (MQ=255) gTATTGAATCTGTGTGGTGTACGCCGCACGGGCGTCTATATTCTGGTTGGCGTAGTGTTGGGGACTGCGGTGTTGAAATCGGGGGTTCACGCAACCCTGGCGGGGGTAATTGTCGGCTTCTGTATTCCTTTGAAAGAGAAGCATGGGCGTTCTCCAGCGAAGCGACTGGAGCATGTGTTACACCCGTGGGTGGCGTATCTGATTTTGCCGCTGTTTGCATTTGCTAATGCTGGCGTTTCACTGCAAggtgt < 1:97844/251‑4 (MQ=255) gtggtgTACGCCGCACGGGCGTCTATATTCTGGTTGGCGTAGTGTTGTGGACTGCGGTGTTGAAATCGGGGGTTCACGCAACCCTGGCGGGGGTAATTGTCGGCTTCTTTATTCCTTTGAAAGAGAAGCATGGGCGTTCTCCAGCGAAGCGACTGGAGCATGTGTTACACCCGTGGGTGGCGTATCTGATTTTGCCGCTGTTTGCATTTGCTAATGCTGGCGTTTCACTGCAAGGTGTCACGCTGGATgg < 1:80326/250‑1 (MQ=255) gtaCGCCGCACGGGCGTCTATATTCTGGTTGGCGTAGTGTTGTGGACTGCGGTGTTGAAATCGGGGGTTCACGCAACCCTGGCGGGGGTAATTGTCGGCTTCTTTATTCCTTTGAAAGAGAAGCATGGGCGTTCTCCAGCGAAGCGACTGGAGCATGTGTTACACCCGTGGGTGGCGTATCTGATTTTGCCGCTGTTTGCATTTGCTAATGCTGGCGTTTCACTGCAAGGTGTCACGCTGGCTGGCTTGAc > 1:93678/3‑251 (MQ=255) aCGGGCGTCTATATTCTGGTTGGCGTAGTGTTGTGGACTGCGGTGTTGAAATCGGGGGTTCACGCAACCCTGGCGGGGGTAATTGTCGGCTTCTTTATTCCTTTGAAAGAGAAGCATGGGCGTTCTCCAGCGAAGCGACTGGAGCATGTGTTACACCCGTGGGTGGCGTATCTGATTTTGCCGCTGTTTGCATTTGCTAATGCTGGCGTTTCACTGCAAGGTGTCACGCTGGATGGCTTGACCTCCATTCt > 1:429424/1‑251 (MQ=255) cGGGCGTCTATATTCTGGTTGGCGTAGTGTTGTGGACTGCGGTGTTGAAATCGGGGGTTCACGCAACCCTGGCGGGGGTAATTGTCGGCTTCTTTATTCCTTTGAAAGAGAAGCATGGGCGTTCTCCAGCGAAGCGACTGGAGCATGTGTTACACCCGTGGGTGGCGTATCTGATTTTTCCGCTGTTTGCATTTGCTAATGCTGGCGTTTCACTGCCAGGTGTCAAGCTGGATGGCTTGACCTCCATTCTg > 2:198592/1‑251 (MQ=255) ggCGTCTATATTCTGGTTGGCGTAGTGTTGTGGACTGCGGTGTTGAAATCGGGGGTTCACGCAACCCTGGCGGGGGTAATTGTCGGCTTCTTTATTCCTTTGAAAGAGAAGCATGGGCGTTCTCCAGCGAAGCGACTGGAGCATGTGTTACACCCGTGGGTGGCGTATCTGTTTTTGCCGCTGTTTCCATTTGCTACTGCTGCCGTTTCACTGCAAGGTTTCCCGCTGGATGGCTTAACCTCCATTCtccc > 1:125051/1‑248 (MQ=255) ggCGTCTATATTCTGGTTGGCGTAGGGTTGTGGACTTCGGTGTTGAAATCGGGGGTTCACGCAACCCTGGCGGGGGTAATTGTCGGCTTCTTTATTCCTTTGAAAGAGAAGCATGGGCGTTCTCCAGCGAAGCGACTGGAGCATGTGTTACACCCGTGGGTGGCGTATCTGATTTTGCCGCTGTTTGCATTTGCTAATGCTGGCGTTTCACTGCAAGGTGTCACGCTGGATGGCTTGACCTCCATTCTGcc < 1:421238/251‑1 (MQ=255) cGTCTATATTCTGGTTGGCGTAGTGTTGTGGACTGCGGTGTTGAAATCGGGGGTTCACGCAACCCTGGCGGGGGGAATTGTCGGCTTCTTTATTCCTTTGAAAGAGAAGCATGGGCGTTCTCCAGCGAAGCGACTGGAGAATGTGTTACACCCGTGGGTGGCGTATCTGATTTTGCCGCGGTTTGCATTTTCTAAGGCTGGCGTTTCACTGCAAGGGGTCACGGTGGATGGCTTGACCTCCATTCTGCCAt > 2:269988/1‑251 (MQ=255) atatTCTGGTTGGCGTAGTGTTGTGGACTGCGGTGTTGAAATCGGGGGTTCACGCAACCCTGGCGGGGGTAATTGTCGGCTTCTTTATTCCTTTGAAAGAGAAGCATGGGCGTTCTCCAGCGAAGCGACTGGAGCATGTGTTACACCCGTGGGTGGCGTATCTGATTTTGCCGCTGTTTGCATTTGCTAATGCTGGCGTTTCACTGCAAGGTGTCACGCTGGATGGCTTGACCTCCATTCTGCCATTgggg > 1:652491/1‑251 (MQ=255) tattcgggttgGGGTGGTGGTGTGGTCTGCGGTGTTGAAATCGGGGGTGCACGCAACCCTGGCGGGGGTAATTGGCTGCTTCTTTATTCCTTTGAAAGAGAAGCATGGGCGTTCTCCAGCGAAGCGACTGGAGCATGTGTTACACCCGTGGGTGGCGTATCTGATTTTGCCGCTGTTTGCATTTGCTAATGCTGGCGTTTCACTGCAAGGTGTCACGCGGGATGGCTTGACCTCCATTCTGCCATTgggg < 2:333330/243‑1 (MQ=255) gagtctgggtgGCGTAGTGTTGTGGACTGCGGTGTTTAAATCGGGGGTTCACGCAACCCTGGCGGGGGTAATTGTCGGCTTCTTTATTCCTTTGAAAGAGAAGCATGGGCGTTCTCCAGCGATGCGACTGGAGCATGTGTTACACCCGTGGGTGGCGTATCTGATTTTGCCGCGGTTTGCATTTGCTAATGCTGGCGTTTCACTGCAAGGTGTCACGCTGGATGGCTTGACCTCCATTCTGCCATTgggg < 2:49909/241‑1 (MQ=255) ttCTGGTTGGCGGTGTGTTGGGGACTGCGGTGTTGAAACCGGGGGTTCACGCAACCCTGGCGGGGTTAATTGTCGGCTTCTTTATTCCTTTGAAAGAGAAGCATGGGCGTTCGCCAGCGAAGCGACTGTAGCATGTGTTACTCCCGTTGGTGGCGTATCTGATTTTGCCGCTGTTTGCAGTTGCTAATGCTGTCGTTTCTCTGCAAGGTGTCACGCTGGATGGCTTGACCTCCATTCTGCCATTGGGGat < 1:665657/250‑1 (MQ=255) | CTACTGACATTGCTTTTGCACTTGGTGTACTGGCGCTGTTGGGAAGTCGTGTTCCGTTAGCGCTGAAGATCTTTTTGATGGCTCTGGCTATTATCGACGATCTTGGGGCCATCATTATCATCGCATTGTTCTACACTAATGACTTATCGATGGCCTCTCTTGGCGTCGCGGCTGTAGCAATTGCGGTACTCGCGGTATTGAATCTGTGTGGTGCACGCCGCACGGGCGTCTATATTCTTGTTGGCGTGGTGTTGTGGACTGCGGTGTTGAAATCGGGGGTTCACGCAACTCTGGCGGGGGTAATTGTCGGCTTCTTTATTCCTTTGAAAGAGAAGCATGGGCGTTCTCCAGCGAAGCGACTGGAGCATGTGTTGCACCCGTGGGTGGCGTATCTGATTTTGCCGCTGTTTGCATTTGCTAATGCTGGCGTTTCACTGCAAGGCGTCACGCTGGATGGCTTGACCTCCATTCTGCCATTGGGGAT > NC_000913/17880‑18363 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |