| Predicted mutation | ||||||
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| RA | NC_000913 | 9,754 | A→C | E150A (GAG→GCG) | mog → | molybdopterin adenylyltransferase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_000913 | 9,754 | 0 | A | C | 97.3% | 221.0 / ‑1.4 | 73 | E150A (GAG→GCG) | mog | molybdopterin adenylyltransferase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (1/1); new base C (26/45); total (27/46) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 2.56e-01 | |||||||||||
GCTCACCACGGGCGGAACTGGCCCGGCGCGTCGTGACGTAACGCCCGATGCGACGCTGGCAGTAGCGGACCGCGAGATGCCTGGCTTTGGTGAACAGATGCGCCAGATCAGCCTGCATTTTGTACCAACTGCGATCCTTTCGCGTCAGGTGGGCGTGATTCGCAAACAGGCGCTGATCCTTAACTTACCCGGTCAGCCGAAGTCTATTAAAGAGACGCTGGAAGGTGTGAAGGACGCTGAGGGTAACGTTGTGGTACACGGTATTTTTGCCAGCGTACCGTACTGCATTCAGTTGCTGGAAGGGCCATACGTTGAAACGGCACCGGAAGTGGTTGCAGCATTCAGACCGAAGAGTGCAAGACGCGACGTTAGCGAATAAAAAAATCCCCCCGAGCGGGGGGATCTCAAAACAATTAGTGGGATTCACCAATCGGCAGAACGGTGCGACCAAACTGCTCGTTCAGTACTTCACCCAT > NC_000913/9515‑9990 | gCTCACCACGGGCGGAACTGGCCCGGCGCGTCGTGACGTAACGCCCGATGCGACGCTGGCAGTAGCGGACCGCGAGATGCCTGGCTTTGGTGAACAGATGCGCCAGATAAGCCTGCATTTTGTACCAACTGCGATCCTTTCGCGTCAGGTTGGTGTGATTCGCAAACAGGCGCTGATCCTTAACTTACCCGGTCAGCCGAAGTCTATTAAAGAGACGCTGGAAGGTGTGAAGGACGCTGCGGGTAACGTtg < 1:391535/251‑1 (MQ=255) cTCACCACGGGCGGAACTGGCCCGGCGCGTCGTGACGTAACGCCCGATGCGACGCTGGCAGTAGCGGACCGCGAGATGCCTGGCTTTGGTGAACAGATGCGCCAGATAAGCCTGCATTTTGTACCAACTGCGATCCTTTCGCGTCAGGTTGGTGTGGTTCGCAAACAGGCGCTGATCCTTAACTTACCCGGTCAGCCGAAGTCTATTAAAGAGACGCTGGAAGGTGTGAAGGCCGCTGCGGGTAAAGTtgt > 2:540519/1‑251 (MQ=255) tCACCACGGGCGGAACTGGCCCGGCGCGTCGTGACGTAACGCCCGATGCGACGCTGGCAGTAGCGGACCGCGAGATGCCTGGCTTTGGTGAACAGATGCGCCAGATAAGCCTGCATTTTGTACCAACTGCGATCCTTTCGCGTCAGGTTGGTGTGATTCGCAAACAGGCGCTGATCCTTAACTTACCCGGTCAGCCGAAGTCTATTAAAGAGACGCTGGAAGGTGTGAAGGACGCTGCGGGTAACGTtgtg > 1:111019/1‑251 (MQ=255) caccacGGGCGGAACTGGCCCGGCGCGTCGTGACGTAACGCCCGATGCGACGCTGGCAGTAGCGGACCGCGAGATGCCTGGCTTTGGTGAACAGATGCGCCAGATAAGCCTGCATTTTGTACCAACTGCGATCCTTTCGCGTCAGGTTGGTGTGATTCGCAAACAGGCGCTGATCCTTAACTTACCCGGTCAGCCGAAGTCTATTAAAGAGACGCTGGAAGGTGTGAAGGACGCTGCGGGTAACGTtgt < 1:342430/249‑1 (MQ=255) caccacGGGCGGAACTGGCCCGGCGCGTCGTGACGTAACGCCCGATGCGACGCTGGCAGTAGCGGACCGCGAGATGCCTGGCTTTGGTGAACAGATGCGCCAGATAAGCCTGCATTTTGTACCAACTGCGATCCTTTCGCGTCAGGTTGGTGTGATTCGCAAACAGGCGCTGATCCTTAACTTACCCGGTCAGCCGAAGTCTATTAAAGAGACGCTGGAAGGTGTGAAGGACGCTGCGGGTAACGTTGTgg < 1:243531/251‑1 (MQ=255) caccacGGGCGGAACTGGCCCGGCGCGTCGTGACGTAACGCCCGATGCGACGCTGGCAGTAGCGGACCGCGAGATGCCTGGCTTTGGTGAACAGATGCGCCAGATAAGCCTGCATTTGGTACCAACTGCGATCCTTTCGCGTCAGGTTGGTGTGATTCGCAAACAGGCGCTGATCCTTAACTTACCCGGTCAGCCGAAGTCTATTAAAGAGACGCTGGAAGGTGTGAAGGACGCTGCGGGTAACGTTGTgg < 1:678881/251‑1 (MQ=255) cccacGGGCGGAACTGGCCCGGCGCTTCGTGACGTAACGCCCGATGCGACGCTGGCAGTAGCGGACCGCGAGATGCCTGGCTTTGGTGAACAGATGCGCCAGATAAGCCTGCATTTTGTACCAACTGCGATCCTTTCGCGTCAGGTTGGTGTGATTCGCAAACAGGCGCTGATCCTTAACTTACCCGGTCAGCCGAAGTCTATTAAAGAGACGCTGGAAGGTGTGAAGGACGCTGCGGGTAACGTTGTGGt < 1:103771/250‑1 (MQ=255) 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GCTCACCACGGGCGGAACTGGCCCGGCGCGTCGTGACGTAACGCCCGATGCGACGCTGGCAGTAGCGGACCGCGAGATGCCTGGCTTTGGTGAACAGATGCGCCAGATCAGCCTGCATTTTGTACCAACTGCGATCCTTTCGCGTCAGGTGGGCGTGATTCGCAAACAGGCGCTGATCCTTAACTTACCCGGTCAGCCGAAGTCTATTAAAGAGACGCTGGAAGGTGTGAAGGACGCTGAGGGTAACGTTGTGGTACACGGTATTTTTGCCAGCGTACCGTACTGCATTCAGTTGCTGGAAGGGCCATACGTTGAAACGGCACCGGAAGTGGTTGCAGCATTCAGACCGAAGAGTGCAAGACGCGACGTTAGCGAATAAAAAAATCCCCCCGAGCGGGGGGATCTCAAAACAATTAGTGGGATTCACCAATCGGCAGAACGGTGCGACCAAACTGCTCGTTCAGTACTTCACCCAT > NC_000913/9515‑9990 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |