| Predicted mutation | ||||||
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| RA | NC_000913 | 9,668 | C→T | G121G (GGC→GGT) | mog → | molybdopterin adenylyltransferase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_000913 | 9,668 | 0 | C | T | 98.8% | 248.0 / ‑4.7 | 84 | G121G (GGC→GGT) | mog | molybdopterin adenylyltransferase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (1/0); new base T (33/49); total (35/49) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.10e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 3.72e-01 | |||||||||||
GAACTGGAAACCCGCTTAATCCCCGATGAGCAGGCGATCATCGAGCAAACGTTGTGTGAGCTG‑GTGGATGAAATGAGTTGCCATCTGGTGCTCACCACGGGCGGAACTGGCCCGGCGCGTCGTGACGTAACGCCCGATGCGACGCTGGCAGTAGCGGACCGCGAGATGCCTGGCTTTGGTGAACAGATGCGCCAGATCAGCCTGCATTTTGTACCAACTGCGATCCTTTCGCGTCAGGTGGGCGTGATTCG‑CAAACAGGCGCTGATCCTTAACTTACCCGGTCAGCCGA‑AGTCTATTAAAGAGACGCTGGAAGGTGTGAAGGACGCTGAGGGTAACGTTGTGGTACACGGTATTTTTGCCAGCGTACCGTACTGCATTCAGTTGCTGGAAGGGCCATACGTTGAAACGGCACCGGAAGTGGTTGCAGCATTCAGACCGAAGAGTGCAAGACGCGACGTTAGCGAATAAAAAAATCCCCCCGAG > NC_000913/9426‑9908 | gcattggcaccccgtgtAATCCCCGTTGAGCAGGCGCTCATCGAGCAATCGTTGTGTG‑GGTGAGTGGATGAAATGAGTTGCCATCTGGTGCGTACCAGTGGCGGAACTGGCCCGGCTCGGCGTGACGTTACGACCGATGCGCCGCTGGCAGTAGCGGACCGCGAGATGCCTGGCTGTGGTGAACAGATGCGCCAGATAAGCCTGCATTTTGTTCCAACTGCGATCCTTTCGCGTCAGTTTGGTGTGATTc < 2:377853/234‑1 (MQ=255) ccGCTTAATCACCGATGAGCAGGCGATCATCGAGCAAACGTTGTGTGAGCTA‑GTGGATGAAATGAGTTGCCATCTGGTGCTCACCACGGGCGGAACTGGCCCGGCGCGTCGTGACGTAACGCCCGATGCGACGCTGGCAGTAGCGGACCGCGAGATGCCTGGCTTTGGTGAACAGTTGCGCCAGATAAGCCTGCATTTTGTACCAACTGCGATCCTTTCGCGTCAGGTTGGTGTGATTCG‑CAAACAGgcgc > 1:284981/1‑251 (MQ=255) tAATCCCCGATGAGCAGGCGATCATCGAGCAAACGTTGTGTGAGCTA‑GTGGATGAAATGAGTTGCCATCTGGTGCTCACCACGGGCGGAACTGGCCCGGCGCGTCGTGACGTAACGCCCGATGCGACGCTGGCAGTAGCGGACCGCGAGATGCCTGGCTTTGGTGAACAGATGCGCCAGATAAGCCTGCATTTTGTACCAACTGCGATCCTTTCGCGTCAGGTTGGTGTGATTCG‑CAAACAGGCGCTGAt < 1:389548/250‑1 (MQ=255) ccccGATGAGCAGGCGATCATCGAGCAAACGTTGTGTGAGCTA‑GTGGATGAAATGAGTTGCCATCTGGTGCTCACCACGGGCGGAACTGGCCCGGCGCGTCGTGACGTAACGCCCGATGCGACGCTGGCAGTAGCGGACCGCGAGATGCCTGGCTTTGGTGAACAGATGCGCCAGATAAGCCTGCATTTTGTACCAACTGCGATCCTTTCGCGTCAGGTTGGTGTGATTCG‑CAAACAGGCGCTGATCCtt < 1:290201/250‑1 (MQ=255) cccGATGAGCAGGCGATCATCGAGCAAACGTTGTGTGAGCTA‑GTGGATGAAATGAGTTGCCATCTGGTGCTCACCACGGGCGGAACTGGCCCGGCGCGTCGTGACGTAACGCCCGATGCGACGCTGGCAGTAGCGGACCGCGAGATGCCTGGCTTTGGTGAACAGATGCGCCAGATAAGCCTGCATTTTGTACCAACTGCGATCCTTTCGCGTCAGGTTGGTGTGATTCG‑CAAACAGGCGCTGATCCTTaa < 1:573022/251‑1 (MQ=255) cccGATGAGCAGGCGATCATCGAGCAAACGTTGTGTGAGCTA‑GTGGATGAAATGAGTTGCCATCTGGTGCTCACCACGGGCGGAACTGGCCCGGCGCGTCGTGACGTAACGCCCGATGCGACGCTGGCAGTAGCGGACCGCGAGATGCCTGGCTTTGGTGAACAGATGCGCCAGATAAGCCTGCATTTTGTACCAACTGCGATCCTTTCGCGTCAGGTTGGTGTGATTCG‑CAAACAGGCGCTGATCCTTa > 1:384750/1‑250 (MQ=255) ccGATGAGCGGGCGATCACCGAGCAAACGTTGTGTGAGCTA‑GTGGATGAAATGAGTTGCCAGCTGGTGCTCACCACGGGCGGAACTGGCCCGGCGCGTCGTGACGTAAAGCCCGATGCGACGCTGGCAGTAGCGGACCGCGAGATGCCTGGCTTTGGTGAACAGATGCGCCAGATAAGCCTGCATTTTGTACCAACTGCGATCCTTTCGCGTCAGGTTGGTGTGATTCG‑CAAACAGGCGCTGATCCTTAAc < 2:105066/251‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |