| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 2,042,171 | G→A | intergenic (+146/‑197) | zinT → / → yodB | metal‑binding protein ZinT/putative cytochrome b561 YodB |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 2,042,171 | 0 | G | A | 100.0% | 61.3 / NA | 20 | intergenic (+146/‑197) | zinT/yodB | metal‑binding protein ZinT/putative cytochrome b561 YodB |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base A (10/10); total (10/10) | |||||||||||
TTCACAGCAATCTTTATTAAATGAAATGGAAAACTGGCCAACGTATTATCCATATCAGTTGAGTAGCGAAGAAGTGGTCGAGGAAATGATGTCTCATTGAGTATTCTCATGATAACGCCTCGATGCCGCTTTAGTAAGTTATCATAACTGCCACTGGTCCATCCACAAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACGCTCATCACTATGACGTGTCTGTATATTAATAAGCTAACCCGCATTGAGTTAACCAATAACGGATTCCATACACAATACGGCCAACAGAGAAAGATACCTGTGCTCACGCCATTGCTTATATTGGCTGGTTACAATATGCACTATCAATTTTTTAAATAACAAATTATTAAAACCACATCTGTATAAGGAATTTTTAAGGTTCGTGGGATAGCTTGACTGTGAAAATCACAGGAGCTACAAAAATGAACCGATTCTCAAAAACTCAAATTTATTTACATTGGATAACG > NC_000913/2041926‑2042412 | ttcacataaaTCTTTATAAAATGAAATGGAAAACGGGCAAACGTATTATCCATATCAGTTGAGTAGCGAAGAAGTGGGCGAGGAAAGGATGTCTCATTGAGTATTCTCATGATAACGCCCCGAGGCCGCTTTAGTAAGTTATCATAACTGCCACTGGTCCATCCACAAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACGTTCATCACTATGACGTGTCTGTATATTAATAAGCTAACCCGCATTAAGtt < 2:8427/242‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |