| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 4,636,385 | A→T | T127S (ACG→TCG) | creB → | DNA‑binding transcriptional regulator CreB |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 4,636,385 | 0 | A | T | 94.8% | 147.5 / ‑0.6 | 58 | T127S (ACG→TCG) | creB | DNA‑binding transcriptional regulator CreB |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (2/1); new base T (28/27); total (30/28) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 3.18e-01 | |||||||||||
CAAGCAGGTACCCGACGTCATGATTCTCGATGTTGGTCTGCCGGATATTAGCGGCTTTGAATTGTGCCGCCAGTTACTGGCGCTCCATCCGGCGTTACCTGTACTGTTCCTGACGGCCCGAAGTGAAGAGGTCGATCGCCTGCTTGGGCTGGAAATTGGTG‑CTGACGACTACGTGGCTAAACCGTTTTCACCCCGCGAAGTGTGCGCCAGGGTGCGCACCTTACTGCGTCGGGTGAAGAAGTTCTCGACGCCGTCTCCCGTCATCCGTATTGGACATTTTGAATT‑GAATGAACCCGCGGCGCAGATCAGCTGGTTTGACACGCCATTAGCGCTGACTCGGTATGAGTTTTTATTGTTGAAGACGTTACTCAAGTCACCGGGCCGCGTCTGGTCCCGCCAGCAACTGATGGATAGCGTATGGGAAGATGCGCAGGACACCTACGATCGCACCGTCGATACCCACATTAAAACGCTGCG > NC_000913/4636138‑4636614 | ccagcaggctcccGACGTCATGATTCTCGATGTTGGTTTGCCTGATATCAGCGGCTTTGAATTATGCCGCCAGTTACTGGCGCTCCATCCGGCGTTACCTGTACTGTTCCTGACGGCCCGAAGTGAAGAGGTCGATCGCCTGCTTGGGCTGGAAATTGGTG‑CTGACGACTATGTGGCTAAACCGTTTTCACCCCGCGAAGTGTGCGCCAGGGTGCGCACCTTACTGCGTCGGGTGAAGCAGTTCTCGTCGc > 1:155920/11‑251 (MQ=255) gcaggctcccGACGTCATGATTCTCGATGTTGGTTTGCCTGATATCAGCGGCTTTGAATTATGCCGCCAGTTACTGGCGCTCCATCCGGCGTTACCTGTACTGTTCCTGACGGCCCGAAGTGAAGAGGTCGATCGCCTGCTTGGGCTGGAAATTGGTG‑CTGACGACTATGTGGCTAAACCGTTTTCACCCCGCGAAGTGTGCGCCAGGGTGCGCACCTTACTGCGTCGGGTGAAGAAGTTCTCGTCGCCGt > 1:46505/8‑251 (MQ=255) gACGTCATGATTCTCGATGTTGGTTTGCCTGATATCAGCGGCTTTGAATTATGCCGCCAGTTACTGGCGCTCCATCCGGCGTTACCTGTACTGTTCCTGACGGCCCGAAGTGAAGAGGTCGATCGCCTGCTTGGGCTGGAAATTGGTG‑CTGACGCCTATGTGGCTAAACCGATTTCACCCCGCGAAGTGTGCGCCAGGGGGCGCACCTTACTGCGTCGGGCGCAGAAGGTCTCGTCGCCGTATCCCGACAt > 2:155610/1‑251 (MQ=255) gACGTCATGATTCTCGAGGTTGGTTTGCCTGATATCAGCGGCTTTGAATTATGCCGCCAGTTACTGGCGCTCCATCCGGCGTTACCTGTACTGTTCCTGACGGCCCGAAGTGAAGAGGTCGATCGCCTGCTTGGGCTGGAAATTGGTG‑CTGACGACTATGTGGCTAAACCGTTTTCACCCCGCGAAGTGTGCGCCAGGGTGCGCACCTTACTGCGTCGGGTGAAGAAGTTCTCGTCGCCGTCTCCCGTCAt < 2:394211/251‑1 (MQ=255) gTCATGATTCTCGATGTTGGTTTGCCTGATATCAGCGGCTTTGAATTATGCCGCCAGTTACTGGCGCTCCATCCGGCGTTACCTGTACTGTTCCTGACGGCCCGAAGTGAAGAGGTCGATCGCCTGCTTGGGCTGGAAATTGGTG‑CTGACGACTATGTGGCTAAACCGTTTTCACCCCGCGAAGTGTGCGCCAGGGTGCGCACCTTACTGCGTCGGGTGAAGAAGTTCTCGTCGCCGTCTCCCGTCATCCg > 1:172694/1‑251 (MQ=255) gatgctcGATGTTGGTTTTCCTGATATCAGCGGCTTTTAATTATGCCGCCAGTTACTGGCGCTCCAGCCGGCGTTACCTGTACGGTTCCTGACGGCCCGAAGTGAAGAGGTCGATCGCCTGCTTGGGCTGGAAATTGGTG‑CTGACGACTATGTGGCTAAACCGTTTTCACCCCGCGAAGTGTGCGCCAGGGTGCGCACCTTACTGCGTCGGGTGAAGAAGTTCTCGTCGCCGTCTCCCGTCATCCGTAtt < 2:291267/246‑1 (MQ=255) gATTCTCGATGTTGGTTTGCCTGATATCAGCGGCTTTGAATTATGCCGCCAGTTACTGGCGCTCCATCCGGCGTTACCTGTACTGTTCCTGACGGCCCGAAGTGAAGAGGTCGATCGCCTGCTTGGGCTGGAAATTGGTG‑CTGACGACTATGTGGCTAAACCGTTTTCACCCCGCGAAGTGTGCGCCAGGGTGCGCACCTTACTGCGTCGGGTGAAGAAGTTCTCGTCGCCGTCTCCCGTCATCCGTAtt < 1:80121/250‑1 (MQ=255) gATTCTCGATGTTGGTTTGCCTGATATCAGCGGCTTTGAATTATGCCGCCAGTTACTGGCGCTCCATCCGGCGTTACCTGTACTGTTCCTGACGGCCCGAAGTGAAGAGGTCGATCGCCTGCTTGGGCTGGAAATTGGTG‑CTGACGACTATGTGGCTAAACCGTTTTCACCCCGCGAAGTGTGCGCCAGGGTGCGCACCTTACTGCGTCGGGTGAAGAAGTTCTCGTCGCCGTCTCCCGTCATCCGTATTg > 1:360972/1‑251 (MQ=255) ctatgttgtgttgccttatatCAGCGGCTTTGAATTATGCCGCCAGTTACTGGCGCTCCACCCGGCGTTACCTGTACTGTTCCTGACGGCCCGAAGTGAAGAGGTCGATCGCCTGCTTGGGCTGGAAATTGGTG‑CTGACGACTATGTGGCTAAACCGTTTTCACCCCGCGAAGTGTGCGCCAGGGTGCGCACCTTACTGCGTCGGGTGAAGAAGTTCTCGTCGCCGTCTCCCGTCATCCGTATTggtc < 2:326079/231‑3 (MQ=255) cGATGTTGGTCTGCCGGATATTAGCGGCTTTGAATTGTGCCGCCAGTTACTGGCGCTCCATCCGGCGTTACCTGTACTGTTCCTGACGGCCCGAAGTGAAGAGGTCGATCGCCTGCTTGGGCTGGAAATTGGTG‑CTGACGACTACGTGGCTAAACCGTTTTCACCCCGCGAAGTGTGCGCCAGGGTGCGCACCTTACTGCGTCGGGTGAAGAAGTTCTCGACGCCGTCTCCCGTCATCCGTATTGGAc < 1:16259/248‑1 (MQ=255) gATGTTGGTTTGCCTGATATCAGCGGCTTTGAATTATGCCGCCAGTTACTGGCGCTCCATCCGGCGTTACCTGTACTGTTCCTGACGGCCCGAAGTGAAGAGGTCGATCGCCTGCTTGGGCTGGAAATTGGTG‑CTGACGACTATGTGGCTAAACCGTTTTCACCCCGCGAAGTGTGCGCCAGGGTGCGCACCTTACTGCGTCGGGTGAAGAAGTTCTCGTCGCCGTCTCCCGTCATCCGTATTGGTCAttt > 1:48596/1‑251 (MQ=255) gATGTTGGTCTGCCGGATATTAGCGGCTTTGAATTGTGCCGCCAGTTACTGGCGCTCCATCCGGCGTTACCTGTACTGTTCCTGACGGCCCGAAGTGAAGAGGTCGTTCGCCTGCTTGGGCTGGAAATTGGTG‑CTGACGACTACGTGGCTAAACCGTTTTCACCCCGCGAAGTGTGCGCCAGGGTGCGCACCTTACTGCGTCGGGTGAAGAAGTTCTCGACGCCGTCTCCCGTCATCCGTATTGGACAttt > 1:73296/1‑251 (MQ=255) gTTGGTTTGCCTGATATCAGCGGCTTTGAATTATGCCGCCAGTTACTGGCGCTCCATCCGGCGTTACCTGTACTGTTCCTGACGGCCCGAAGTGAAGAGGTCGATCGCCTGCTTGGGCTGGAAATTGGTG‑CTGACGACTATGTGGCTAAACCGTTTTCACCCCGCGAAGTGTGCGCCAGGGTGCGCACCTTACTGCGTCGGGTGAAGAAGTTCTCGTCGCCGTCTCCCGTCATCCGTATTGGTCATTttg < 1:12032/250‑1 (MQ=255) ttGCCTGATATCAGCGGCTTTGAATTATGCCGCCAGTTACTGGCGCTCCATCCGGCGTTACCTGTACTGTTCCTGACGGCCCGAAGTGAAGAGGTCGATCGCCTGCTTGGGCTGGAAATTGGTG‑CTGACGACTATGTGGCTAAACCGTTTTCACCCCGCGAAGTGTGCGCCAGGGTGCGCACCTTACTGCGTCGGGTGAAGGAGTTCTCGTCGCCGTCTCCCGTCATCCGTATTGGGCATTttgaatt‑ga > 2:11497/2‑250 (MQ=255) tgATATCAGCGGCTTTGAATTATGCCGCCAGTTACTGGCGCTCCATCCGGCGTTACCTGTACTGTTCCTGACGGCCCGAAGTGACGAGGTCGATCGCCTGCTTGGGCTGGAAATTGGTG‑CTGACGACTATGTGGCTAAACCGTTTTCACCCCGCGAAGTGTGCGCCAGGGTGCGCACCTTACTGCGACGGGTGAAGAAGTTCTCGTCGCCGTATCCCGTCCTCCGTATTGGTCATTTTGAATT‑GAATGAAc > 2:403328/2‑251 (MQ=255) ttGAATTAGGCCGCCAGTTGCTGGCGCTCCATCCGGCGTTACCTGTACTGTTCCTGACGGCCCGAAGTGAAGAGGTCGATCGCCTGCTTGGGCTGGAAATTGGTG‑CTGACGACTATGTGGCTAAACCGTTTTCACCCCGCGAAGTGTGCGCCAGGGTGCGCACCTTACTGCGTCGGGTGAAGAAGTTCTCGTCGCCGTCTCCCGTCATCCGTATTGGTCATTTTGAATT‑GAATGAACCCGCGGCGCAGa < 2:447001/249‑1 (MQ=255) gAATTATGCCGCCAGTTACTGGCGCTCCATCCGGCGTTACCTGTACTGTTCCTGACGGCCCGAAGTGAAGAGGTCGATCGCCTGCTTGGGCTGGAAATTGGTG‑CTGACGACTATGTGGCTAAACCGTTTTCACCCCGCGAAGTGTGCGCCAGGGTGCGCACCTTACTGCGTCGGGTGAAGAAGTTCTCGTCGCCGTCGCCCGTCATCCGTATTGGTCATTTTGAATT‑GAATGAACCCGCGGCGCAGATCa < 2:479954/250‑1 (MQ=255) aaTTATGCCGCCTGTTACTGGCGCTCCATCCGGCGTTACCTGTACTGTTCCTGACGGCCCGAAGTGAAGAGGTCGATCGCCTGCTTGGGCTGGAAATTGGTG‑CTGACGACTATGTGGCTAAACCGTTTTCACCCCGCGAAGTGTGCGCCAGGGTGCGCACCTTACTGCGTCGGGTGAAGAAGTTCTCGTCGCCGTCTCCCGTCATCCGTATTGGTCATTTTGAATT‑GAATGAACCCGCGGCGCAGATCAGc < 2:158594/251‑1 (MQ=255) attatgcggccAGTTACTGGCGCTCCATCATGCGTTACCTGTACTGTTCCTGACGGCCCGAAGTGCAGAGGTCGATCGCCTGCTTGGGCTGGAAATTGGTG‑CTGACGACTATGTGGCTAAACCGTTTTCACCCCGCGAAGTGTGCGCCAGGAGGCGCACCTTACTGCGTCGGGTGTCGAAGTTCTCGTCGCCGCCTCCCGTCCTCCGTATTGGTCATTTTTAATT‑GAATGAACCAGCGgcgccgtacagct > 2:354579/9‑242 (MQ=255) tatgCCGCCAGTTACTGGCGCTCCATCCGGCGTTACCTGTAATGTTCCTGACGGTCCGAAGTGAAGAGGTCGATCGCCTGCTTGGGCTGGTAATTGGTG‑CTGACGACTATGTGGCTAAACCGTTTTCACCCCGCGAAGTGTGCGCCAGGGAGCGCACCTTACTGAGTCGGGTGAAGAAGTTCTCGTCGCCGTCTCCCGTCATCCGTATTGGGCATTTTGAGTT‑GAATGAACCCGCGGCGCAGTTCAGCTgg > 2:90798/3‑251 (MQ=255) cAGTTACTGGCGCTCCATCCGGCGTTACCTGTACTGTTCCTGACGGCCCGAAGTGAAGAGGTCGATCGCCTGCTTGGGCTGGAAATTGGTG‑CTGACGACTATGTGGCTAAACCGTTTTCACCCCGCGAAGTGTGCGCCAGGGTGCGCACCTTACTGCGTCGGGGGAAGAAGTTCTCGTCGCCGGCTCCCGTCATCCGGATTGGTCATTTTGAATT‑GAGTGAACCCGCGGCGCCGCTCAGCTGGTTTGacac > 2:309595/1‑251 (MQ=255) aCTGGCGCTCCATCCGGCGTTACCTGTACTGTTCCTGACGGCCCGAAGTGAAGAGGTCGATCGCCTGCTTGGGCTGGAAATTGGTG‑CTGACGACTATGTGGCTAAACCGTTTTCACCCCGCGAAGTGTGCGCCAGGGTGCGCACCTTACTGCGTCGGGTGAAGAAGTTCTCGTCGCCGTCTCCCGTCATCCGTATTGGTCATTTTGAATT‑GAATGAACCCGCGGCGCAGATCAGCTGGTTGGACACGCCa < 2:284138/250‑1 (MQ=255) aCTGGCGCTCCATCCGGCGTTACCTGTACTGTTCCGTACGGCCCGAAGTGAAGAGGTCGATCGCCGGCTTGGGCTGGAAATTGGTG‑CTGACGATTATGTGGCTAAACCGTTTTCACCCCGCGAAGTGTGCGCCAGGGTGCGCACCTTACTGCGTCGGGTGAAGAAGTTCTCGTCGCCGTCTCCCGTCATCCGTATTGGTCATTTTGAATT‑GAATGAACCCGCGGCGCAGATCAGCTGGTTTGACACGCCAt < 2:264949/251‑1 (MQ=255) cTGGCGATCCATCCGGCGTTTCCTGTACTGTTCCTGACGGCCCGAAGTGACGAGGTCGATCGCATGCTTGGGCTGTAAATTGGTG‑CTGACGACTATGTGGCTAAACCGTTTTCAACCCGCGAAGTGAGCGCCAGGGTGCGCACCTTACTGCGTCGGGTGAAGAAGTTCTCGTCGCCGTCTCCCGTCATCCGTATTGGTCCTTTTGAATT‑GAATGAACCCGGGGCGACGATCAGCTTGTTTGACACGCCAtt > 2:311463/1‑251 (MQ=255) ggCGCTCCATCCGGCGTTACCTGTACTGTTCCTGACGGCCCGAAGTGAAGCGGTCGATCGCCTGCTTGGGCTGGAAATTGGTG‑CTGACGACTATGTGGCTAAACCGTTTTCACCCCGCGAAGTGTGCGCCAGGGTGCGCACCTTACTGCGTCGGGTGAAGAAGTTCTCGTCGCCGTCTCCCGTCATCCGTATTGGTCATTTTGAATT‑GAATGAACCCGCGGCGCAGATCAGCTGGTTTGACACGCCATTa > 2:329550/1‑250 (MQ=255) cgcTCCATCCGGCGTTACCTGTACTGTTCCTGACGGCCCGAAGTGAAGAGGTCGATCGCCTGCTTGGGCTGGAAATTGGTG‑CTGACGACTATGTGGCTAAACCGTTTTCACCCCGCGAAGTGTGCGCCAGGGTGCGCACCTTACTGCGTCGGGTGAAGAAGTTCTCGTCGCCGTCTCCCGTCATCCGTATTGGTCATTTTGAATt‑gaatga > 2:82883/1‑211 (MQ=255) cgcTCCATCCGGCGTTACCTGTACTGTTCCTGACGGCCCGAAGTGAAGAGGTCGATCGCCTGCTTGGGCTGGAAATTGGTG‑CTGACGACTATGTGGCTAAACCGTTTTCACCCCGCGAAGTGTGCGCCAGGGTGCGCACCTTACTGCGTCGGGTGAAGAAGTTCTCGTCGCCGTCTCCCGTCATCCGTATTGGTCATTTTGAATt‑gaatga < 1:82883/211‑1 (MQ=255) cgcTCCATCCGGCGTTACCTGTACTGTTCCTGACGGCCCGAAGTGAAGAGGTCGATCGCCTGCTTGGGCTGGAAATTGGTG‑CTGACGACTATGTGGCTAAACCGTTTTCACCCCGCGAAGTGTGCGCCAGGGTGCGCACCTTACTGCGTCGGGTGAAGAAGTTCTCGTCGCCGTCTCCCGTCATCCGTATTGGTCATTTTGAATT‑GAATGAACCCGCGGCGCAGATCAGCTGGTTTGACACGCCATTaacg < 1:336927/251‑4 (MQ=255) ccttCCGGCTTTACCTGTACTTTTCCTGACGGCCCGATGTGAAGAGGTCGACCGCCTGCTTGGGCTGGAAATTGGGG‑CGGACGTCTATGTGGCTAAACCGTTTTCACCCCGCGAAGTGTGCGCCAGGTTGCGCCCCTTACTGCGTCGGGTGAAGAAGTTCTCGTCGCCGTCCCCCGTCATCCGTATTGGTAATTTTGAATT‑GAATGACCCCGCGGCGAAGATCAGCTGGTTTGACACGCCATTAACGCTg < 1:265946/247‑1 (MQ=255) ccgtcgttactggttcTGTACCTGACGCCCTGATGGGAAGAGGTCGAGCGCCTGCTTGGGCTGGAAAT‑GGTGGCTGACGACTTTGTGGCTAACCCGTTTTCGCCCGGCGAAGTGTGCGCCGGGGTTCGCACCTTACTGCGTCGGGTGAAGAAGTTCTCGTCGCCGTCTCCCGTCATCCGTAGTGGTCATTTTGAATT‑GAATGAACCCGCGGCGCAGACCAGCGGGTTTGACACGCCATTAACGCTGAcgcg < 2:350709/236‑4 (MQ=255) ccttGTACTGTTCCTGACGGCCCGAAGGGAGGAGGTCGATCGCCTGCTTGGGCTGGAAAGTGGTG‑CTCACGCATATGTGGCTAAACCTTTTTCCCCCCGCTAAGTTTGCCCCAGGTGGCGCACTTTACTGCGTCGGTTGAAGAATTTCTCGTCGCCGTCTCCCGTCATCCTTTTTGTTCATTTTGAATT‑GAATGAACCCGCGGCGCAGATCAGCTGGTTTGACACGCCATTAACGCTGACGCGGTATGAGt < 2:342039/248‑1 (MQ=255) cctgtatggTTCCTGTCGGCCCGAAGGGAAGAGGCCGAGCGCCTGCTTGGGTTGGAAATGGGTG‑CTGACGACTATGTGGCTAAACCGTTTTCACCCCGAGAAGTGTGCGCCAGGGTGCGCCCCTTACTGCGGCGGGTGAAGAAGTTCTCGTCGCCGTCCCCCTTCATCCGTATTGGTCATTTTGAATT‑GAATGAACCCGCGGCGCAGATCAGCTGGTTTGACACGCCATTAACGCTGACGCGGTATGAGtt < 2:429059/243‑1 (MQ=255) tACTGTTCCTGACGGCCCGAAGTGAAGAGGTCGATCGCCTGCTTGGGCTGGAAATTGGTG‑CTGACGACTATGTGGCTAAACCGTTTTCACCCCGCGAAGTGTGCGCCAGGGTGCGCACCTTACTGCGTCGGGTGAAGAAGTTCTCGTCGCCGTCTCCCGTCATCCGTATTGGTCATTTTGAATT‑GAATGAACCCGCGGCGCAGATCAGCTGGTTTGACACGCCCTTAACGCTGACGCGGGATGAGttttt > 2:494703/1‑250 (MQ=255) gtgccggACGGCCCGAAGTGAAGAGGTCGATCGCCTGCTTGGGCTGGAAATTGGTG‑CTGACGACTATGTGGCTAAACCGTTTTCCCCCCGCGAAGTGTGCGCCAGGGTGCGCACCTTACTGCGTCGGGTGAAGAAGTTCTCGTCGCCGTCCCCCGTCATCCGTATTGGTCATTTTGAATT‑GAATGAACCCGCGGCGCAGATCAGCTGGTTTGACACGCCATTAACGCTGACGCGGTATGAGTTTTTAttg < 1:103301/244‑1 (MQ=255) gTTCCTGACGGCCAGAAGTGAAGAGGTCGATCGCCTGCTTGGGCTGGAAATTGGTG‑CTGAAGACTATGTGGCTCAACCGTTTTCACCCCGCGAAGTGTGCGCCAGGGTGCGCACCTTACTGCGTCGGGTGAAGGAGTTCTCGTCGCCGTCTCCCGTCATCCGTATTGGTCATTTTGAATT‑GAATGAACCCGCGGCGCCGACCAGATGGTTTGACACGCCCTTAACGCTGAACCGGTATGAGTTTTTAttgc > 2:259027/1‑250 (MQ=255) aaCGGCCCGAAGGGACGGGGTCGAGTGCCTGCTTGGGTGGGAAATTGGTG‑CTGACGACTATGTGGCTAACCCGTTTCCACCCCGCGAAGTGGGCTCGAGGTTGCGCACCTTACGTCGTCGGGTGAAGAAGTTCTAGTAGCCGTCTCCCGTCATCCGTATTGGTCATTTTGAATT‑GAATGAACCCGTGGCGCAGATCAGCTGGTTTGACACGCCATTAACGCTGACGCGGTATGAGTTTTTATTGCTGAAGa < 2:239618/250‑1 (MQ=255) cccGAAGTGAAGAGGTCGATCGCCTGCTTGGGCTGGAAATTGGTG‑CTGACGACTATGTGGCTAAACCGTTTTCACCCCGCGAAGTGTGCGCCAGGGTGCGCACCTTACTGCGTCGGGTGAAGAAGTTCTCGTCGCCGTCTCCCGTCATCCGTATTGGTCATTTTGAATT‑GAATGAACCCGCGGCGCAGATCAGCTGGTTTGACACGCCATTAACGCTGACGCGGTATGAGTTTTTATTGCTGAAGACGTTa < 1:159992/251‑1 (MQ=255) ccGAAGTGAAGAGGTCGATCGCCTGCTTGGGCTGGCAATTGGTG‑CTGACGACTATGTGGCTAAACCGTTTTCACCCCGCGAAGTGTGCGCCAGGGTGCGCACCTTACTGCGTCGGGTGAAGAAGTTCTCGTCGCCGTCTCCCGTCATCCGTATTGGTCATTTTGAATT‑GAATGAACCCGCGGCGCAGATCAGCTGGTTTGACACGCCATTAACGCTGACGCGGTATGAGTTTTTATTGCTGAAGACGTTAc > 1:200455/1‑251 (MQ=255) gAAGAGGGCGATCGCTTGCTGGGGCAGTAAATTGGTG‑CTGACGACTATGTGGCTAAACCTTTTTCACCCCGCGAAGTGTGCTCCAGGGTGCGTATCTTACGGCGTCGGGTAAAGAAGTTCTCGTCGCCGTCTCCCGTCATCCGTATTGGTCATTTTGAATT‑GAATGAACCCGCGGCGCAGATCAGCTGGTTTGACACGCCATTAACGCTGACGCGGTATGAGTTTTTATTTCTGAAGACGGTACTCAAGTc < 1:436268/251‑1 (MQ=255) aaGAGGTCGATCGCCTGCTTGGGCTGGAAATTGGTG‑CTGACGACTATGTGGCTAAACCGTTTTCCCCCCGCGAAGTGTGCGCCAGGGTGCGCACCTTACTGCGTCGGGTGAAGAAGTTCTCGTCGCCGTCTCCCGTCATCCGTATTGGTCATTTTGAATT‑GAATGAACCCGCGGCGCAGATCAGCTGGTTTGACACGCCATTAACGCTGACGCGGTATGAGTTTTTATTGCTGAAGACGTTACTCAAGTcg < 1:224148/251‑2 (MQ=255) ggTCGATCGCCTGCTTGGGCTGGAAATTGGTG‑ATGAAGACTATGTGGATAAACCGTTTTCACCCCGCGAAGTGTGCGCCAGGGTGCGCACCTTACTGCGTCGGGTGAAGAAGTTCTCGTCGCCGTCTCCCGTCATCCGTATTGGTCATTTTGAATT‑GAATGAACCCGCGGCGCAGATCAGCTGGTTTGACACGCCATTAACGCTGACGCGGTATGAGTTTTTATTGCTGAAGACGTTACTCAAGtggcc > 1:435995/1‑245 (MQ=255) tCGATCGCCTGCTTGGGCTGGAAATTGGGG‑CTGACGACTATGTGGCGACCCCGTTTTCACCCCGCGAAGTGTGCGCCAGGGTGCGCACCTTACTGCGTCGGGTGACCGAGTTCTCGTCGCCGTCTCCCGTCATCCGTATTAGTCGTTTTGAATT‑GAATGAACCCTCGGCGCAGATACGCTGGTTTGACACGCCATTATAGCTGCCGCGGTATGAGTTTTTATTGCTGAAGCCGTTACTCacatcgccggcc > 2:170/1‑240 (MQ=255) cGCCTGCTTGGGCTGGAAATTGGTG‑CTGCCGACTATGTGGCTAAACCGTTTTCACCCCGCGAAGTGTGCGCCAGGGTGCGCACCTTACTGCGTCGGGTGAAGAAGTTCTCGTCGCCGTCTCCCGTCATCCGTATTGGTCATTTTGAATT‑GAATGAACCCGCGGCGCAGATCAGCTGGTTTGACACGCCCTTAACGCTGACGCGGTATGAGTTTTTATTGCTGAAGACGTTAATCAAGTCGCCAGGCCGCGt > 2:492715/1‑251 (MQ=255) ccTGCTTGGGCTGGAAATTGGTG‑CTGACGTCTATGTGGCTAAACCGTTTTCACCCCGCGAAGTGTGCGCCAGGGTGCGCACCTTACTGCGTCGGGTGAAGAAGTTCTCGTCGCCGTCTCCCGTCATCCGTATTGGTCATTTTGAATT‑GAATGAACCCGCGGCGCAGATCAGCTGGTTTGACACGCCATTAACGCTGACGCGGTATGAGTTTTTATTGCTGAAGACGTTACTCAAGTCGCCAGGCCGCGTCt < 1:346616/251‑1 (MQ=255) gggCTGGAAATTGGTG‑CTGACGACTATGTGGCTAAACCGTTTTCACCCCGCGAAGTGTGCGCCAGGGTGCGCACCTTACTGCGTCGGGTGAAGAAGTTCTCGTCGCCGGCTCCCGTCATCCGTATTGGTCATTTTGAATT‑GAATGAACCCGCGGCGCAGATCAGCTGGTTTGACACGCCATTAACGCTGACGCGGTATGAGTTTTTATTGCTGAAGACGTTACTCAAGTCGCCAGGCCGCGTCTGGTccc < 1:492715/250‑1 (MQ=255) ggCTGGAAATTGGTG‑CTGACGACTATGTGGCTAAACCGTTTTCCCCCCGCGAAGTGTGCGCCAGGGTGCGCACCTTACTGCGTCGGGTGAAGAAGTTCTCGTCGCCGTCTCCCGTCATCCGTATTGGTCATTTTGAATT‑GAATGAACCCGCGGCGCAGATCAGCTGGTTTGACACGCCATTAACGCTGACGCGGTATGAGTTTTTATTGCTGAAGACGTTACTCAAGTCGCCAGGCCGCGTCTGGTCCCGc < 1:374008/251‑1 (MQ=255) 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ttttCACCCCGCGAAGTGTGCGCCAGGGTGCGCACCTTACTGCGTCGGGTGAAGAAGTTCTCGTCGCCGTCTCCCGTCATCCGTATTGGTCATTTTGAATT‑GAATGAACCCGCGGCGCAGATCAGCTGGTTTGACACGCCATTAACGCTGACGCGGTATGAGTTTTTATTGCTGAAGACGTTACTCAAGTCGCCAGGCCGCGACTGGTCCCGCCCGCAACTAATGGATAGCGGGTGGGAAGATgcgccgg > 2:413571/1‑247 (MQ=255) cACCCCGCGAAGTGTGCGCCAGGGTGCGCACCTTACTGCGTCGGGTGAAGAAGTTCTCGTCGCCGTCTCCCGTCATCCGTATTGGTCATTTTGAATT‑GAATGAACCCGCGGCGCAGATCAGCTGGTTTGACACGCCATTAACGCTGACGCGGTATGAGTTTTTATTGCTGAAGACGTTACTCAAGTCGCCAGGCCGCGTCTGGTCCCGCCAGCAACTAATGGATAGCGTGTGGGAAGATGCGCAGGACAcc > 1:167717/1‑251 (MQ=255) ggggcgcCAGGGTGCGCACTTTACTGCGTCGGGTGAAGAATTTCTCGTCGCCTTCCCCCGTCATCCGTATTGGTCATTTTGAATT‑AAATGACCCCGCGGCGCAGATCAGCTGGTTTGACACGCCATTAACGCTGACGCGGTATGAGTTTTTATTGCTGAAGACGTTACTCAAGTCGCCAGGCCGCGTCTGGTCCCGCCAGCAACTAATGGATAGCGTGTGGGAAGATGCGCAGGACACCTACGATCGCAcc < 1:262215/248‑1 (MQ=255) aGGGTGCGCACCTTACTGCGTCGGGTGAAGAAGTTCTCGTCGACGTCTCCCGTCATACGTATTGGTCATTTTGAATT‑GAATGAACCCGCGGCGCAGATCAGCTGGTTTGACACGCCATTAACGCTGACGCGGTATGAGTTTTTATTGCTGAAGACGTTACTCAAGTCGCCAGGCCGCGTCTGGTCCCGCCAGCAACTAATGGATAGCGTGTGGGAAGATGCGCAGGACACCTACGATCGCACCGTTGATAc > 1:197167/1‑251 (MQ=255) tGCGCACCTTACTGCGTCGGGTGAAGAAGTTCTCGTCGCCGTCTCCCGTCATCCTTATTGGTCATTTTGAATT‑GAATGAACCCGCGGCGCAGATCAGCTGGTTTGACACGCCATTAACGCTGACGCGGTATGAGTTTTTATTGCTGAAGACGTTACTCACGTCGCCAGGCCGCGTCTGGTCCCGCCAGCAACTAATGGATAGCGTGTGGGAAGATGAGCAGGACACCCACGAACGCACCGTTGATCCCcac > 2:419354/1‑251 (MQ=255) tGCGCACCTTACTGCGTAGGGTGAAGAAGTTCTCGTCGCCGTCTCCCGTCATCCGTATTGGTCATTTTGAATT‑GAATGAACCCGCGGCGCAGATCAGCTGGTTTGACACGCCATTAACGCTGACGCGGTATGAGTTTTTATTGCTGAAGACGTTACTCAAGTCGCCAGGCCGCGTCTGGTCCCGCCAGCAACTAATGGATAGCGTGTGGGAAGATGCGCAGGACCCCTACGAACGCACCGTTGATACCcac > 2:326222/1‑251 (MQ=255) aCTGCGTCGGGTGAAGAAATTCTCGTCGCCGTCTCCCGTCATCCGTATTGGTCATTTTGAATT‑GAATGAACCCGCGGCGCAGATCAGCTGGTTTGACACGCCATTAACGCTGACGCGGTATGAGTTTTTATTGCTGAAGACGTTACTCAAGTCGCCAGGCCGCGTCTGGTCCCGCCAGCAACTAATGGATAGCGTGTGGGAAGATGCGCAGGACACCTACGATCGCACCGTTGATACCCACATTAAAAcct > 2:167476/1‑249 (MQ=255) gCGTGGGGGGAAGAAGTTCTCTTCGCCGCCCCCCTTCCTCCGTTTTGGTCATTT‑GAATTTGAAGGACCCCGCGGCGCAGACCAGCTGGTTTGACACGCCATTAACGCTGACGCGGTATGAGTTTTTATTGCTGAAGACGTTACTCAAGTCGCCAGGCCGCGTCTGGTCCCGCCAGCAACTAATGGATAGCGTGTGGGAAGATGCGCAGGACACCTACGATCGCACCGTTGATACCCACATTAAAACgttg < 1:394652/250‑4 (MQ=255) cGTCGGGTGAAGAAGTTCTCGACGCAGTCTCCCGTCATCCGTATTGGTCATTTTGAATT‑GAATGAACCCGCGGCGCAGATCAGATGGATTGACACGCCATTAACGCTGACGCGGTATGAGTTTTTATTGCTGAAGACGTTACTCAAGTAGCCAGTCCGCGTCTGGTCCCGCCAGCAACTAATGGGTACCGGGGGGGAAGATGCGAAGGACCCCTAAGATAGCACAGTTGATACCCACATTAAAACGTTGCg > 2:387618/1‑251 (MQ=255) | CAAGCAGGTACCCGACGTCATGATTCTCGATGTTGGTCTGCCGGATATTAGCGGCTTTGAATTGTGCCGCCAGTTACTGGCGCTCCATCCGGCGTTACCTGTACTGTTCCTGACGGCCCGAAGTGAAGAGGTCGATCGCCTGCTTGGGCTGGAAATTGGTG‑CTGACGACTACGTGGCTAAACCGTTTTCACCCCGCGAAGTGTGCGCCAGGGTGCGCACCTTACTGCGTCGGGTGAAGAAGTTCTCGACGCCGTCTCCCGTCATCCGTATTGGACATTTTGAATT‑GAATGAACCCGCGGCGCAGATCAGCTGGTTTGACACGCCATTAGCGCTGACTCGGTATGAGTTTTTATTGTTGAAGACGTTACTCAAGTCACCGGGCCGCGTCTGGTCCCGCCAGCAACTGATGGATAGCGTATGGGAAGATGCGCAGGACACCTACGATCGCACCGTCGATACCCACATTAAAACGCTGCG > NC_000913/4636138‑4636614 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |