| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 4,636,309 | C→T | Y101Y (TAC→TAT) | creB → | DNA‑binding transcriptional regulator CreB |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 4,636,309 | 0 | C | T | 93.5% | 211.2 / 4.5 | 77 | Y101Y (TAC→TAT) | creB | DNA‑binding transcriptional regulator CreB |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (2/3); new base T (35/37); total (37/40) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 2.95e-01 | |||||||||||
TGGTCTACATGTTGCAGCAGGAAGGTTTTGCCGTCGAGGTCTTTGAGCGAGGCTTGCCGGTGCTGGATAAAGCTCGCAAGCAGGTACCCGACGTCATGATTCTCGATGTTGGTCTGCCGGATATTAGCGGCTTTGAATTGTGCCGCCAGTTACTGGCGCTCCATCCGGCGTTACCTGTACTGTTCCTGACGGCCCGAAGTGAAGAGGTCGATCGCCTGCTTGGGCTGGAAATTGGTG‑CTGACGACTACGTGGCTAAACCGTTTTCACCCCGCGAAGTGTGCGCCAGGGTGCGCACCTTACTGCGTCGGGTGAAGAAGTTCTCGACGCCGTCTCCCGTCATCCGTATTGGACATTTTGAATTGAATGAACCCGCGGCGCAGATCAGCTGGTTTGACACGCCATTAGCGCTGACTCGGTATGAGTTTTTATTGTTGAAGACGTTACTCAAGTCACCGGGCCGCGTCTGGTCCCGC > NC_000913/4636062‑4636534 | tGGTCTACATGTTGCAGCAGGAAGGTTTTGCCGTCGAGGTCTTTGAGCGAGGCTTGCCGGTGCTGGATAAAGCTCGCCAGCAGGCTCCCGACGTCATGATTCTCGATGTTGGTTTGCCTGATATCAGCGGCTTTGAATTATGCCGCCAGTTACTGGCGCTCCATCCGGCGTTACCTGTACTGTTCCTGACGGCCCGAAGTGAAGAGGTCGATCGCCTGCTTGGGCTGGAAATTGGTG‑CTGACGACTAtgtg > 1:264949/1‑251 (MQ=255) tACATGTTGCAGCAGGAAGGTTTTGCCGTCGAGGTCTTTGAGCGAGGCTTGCCGGTGCTGGATAAAGCTCGCCAGCAGGCTCCCGACGTCATGATTCTCGATGTTGGTTTGCCTGATATCAGCGGCTTTGAATTATGCCGCCAGTTACTGGCGCTCCATCCGGCGTTACCTGTACTGTTCCTGACGGCCCGAAGTGAAGAGGTCGATCGCCTGCTTGGGCTGGAAATTGGTG‑CTGACGACTATGTGGCTa > 1:284138/1‑250 (MQ=255) agGAAGGTTTTGCCGTCGAGGTCTTTGAGCGAGGCTTGCCGGTGCTGGATAAAGCTCGCCAGCAGGCTCCCGACGTCATGATTCTCGATGTTGGTTTGCCTGATATCAGCGGCTTTGAATTATGCCGCCAGTTACTGGCGCTCCATCCGGCGTTACCTGTACTGTTCCTGACGGCCCGAAGTGAAGAGGTCGATCGCCTGCTTGGGCTGGAAATTGGTG‑CTGACGACTATGTGGCGAAACCGTTTTCAccc > 2:394652/1‑251 (MQ=255) agGAAGGTTTTGCCGTCGAGGTCTTTGAGCGAGGCTTGCCGGTGCTGGATAAAGCTCGCAAGCAGGTACCCGACGTCATGATTCTCGATGTTGGTCTGCCGGATATTAGCGGCTTTGAATTGTGCCGCCAGTTACTGGCGCTCCATCCGGCGTTACCTGTACTGTTCCTGACGGCCCGAAGTGAAGAGGTCGATCGCCTGCTTGGGCTGGAAATTGGTG‑CTGACGACTACGTGGCTAAACCGTTTTCAccc > 2:16259/1‑251 (MQ=255) gtaaGGTTTTGCCGTCGATGTCTTTGAGCGAGGCTTGCCGGTGCTGGATAAAGCTCGCCAGCAGGCTCCCGACGTCATGATTCTCGATGTTGGTTTGCCTGATATCAGCGGCTTTGAATTATGCCGCCAGTTACTGGCGCTCCATCCGGCGTTACCTGTACTGTTCCTGACGGCCCGAAGTGAAGAGGTCGATCGCCTGCTTGGGCTGGAAATTGGTG‑CTGACGACTATGTGGCTAAACCGTTTTCAcccc < 1:127509/249‑1 (MQ=255) gAAGGTTTTGCCGTCGAGGTCTTTGAGCGAGGCTTGCCGGTGCTGGATAACGCTCGCCAGCAGGCTCCCGACGTCATGATTCTCGATGTTGGTTTGCCTGATATCAGCGGCTTTGAATTATGACGCCAGTTACTGGCGCTCCATCCGGCGTTACCTGTACTGTTCCTGACGGCCCGAAGTGAAGCGGTCGATCGCCTGCTTGGGCTGGAAATTGGTG‑CTGACGACTATGTGGCTCAACCGTTTTCAccccc > 2:476576/1‑250 (MQ=255) tGCCGTCGAGGTCTTTGAGCGAGGCTTGCCGGTGCTGGATAAAGCTCGCCAGCAGGCTCCCGACGTCATGATTCTCGATGTTGGTTTGCCTGATATCAGCGGCTTTGAATTATGCCGCCAGTTACTGGCGCTCCATCCGGCGTTACCTGTACTGTTCCTGACGGCCCGAAGTGAAGAGGTCGATCGCCTGCTTGGGCTGGAAATTGGTG‑CTGACGACTATGTGGCTAAACCGTTTTCACCCCGCGAAgtgt > 2:252816/1‑251 (MQ=255) cGTCGAGGTCTTTGAGCGAGGCTTGCCGGTGCTGGATAAAGCTCGCCAGCAGGCTCCCGACGTCATGATTCTCGATGTTGGTTTGCCTGATATCAGCGGCTTTGAATTATGCCGCCAGTTACTGGCGCTCCATCCGGCGTTACCTGTACTGTTCCTGACGGCCCGAAGTGAAGAGGTCGATCGCCTGCTTGGGCTGGAAATTGGTG‑CTGACGACTATGTGGCTAAACCGTTTTCACCCCGCGAAGTGTgcg < 1:480165/251‑1 (MQ=255) cGTCGAGGTCTTTGAGCGAGGCTTGCCGGTGCTGGATAAAGCTCGCCAGCAGGCTCCCGACGGCATGATTCTCGATGTTGGTTTGCCTGATATCAGCGGCTTTGAATTATGCCGCCAGTTACTGGCGCGCCATCCGGCGTTACCTGTACTGTTCCTGACGGCCCGAAGTGAAGAGGTCGATCGCCTGCTTGGGCTGGAAATTGGTG‑CTGACGACTATGTGGCTAAACCGTTTTCACCCCGCGAAGTGTgcg < 2:53615/251‑1 (MQ=255) gTCGAGGTCTTTGAGCGAGGCTTGCCGGTGCTGGATAAAGCTCGCCAGCAGGCTCCCGACGTCATGATTCTCGATGTTGGTTTGCCTGATATCAGCGGCTTTGAATTATGCCGCCAGTTACTGGCGCTCCATCCGGCGTTACCTGTACTGTTCCTGACGGCCCGAAGTGAAGAGGTCGATCGCCTGCTTGGGCTGGAAATTGGTG‑CTGACGACTATGTGGCTAAACCGTTTTCACCCCGCGAAGTGTgcgc > 1:326079/1‑251 (MQ=255) 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cgtGCCGGTGCTGGATAAAGCCCGCCAGCAGGCTCCCGACGTCAGGATTCTCGATGTTGGTTTGCCTGATATCAGCGGCTGTGAATTATGCCGCCAGTTACTGGCGCTCCATCCGGCGTTACCTGTACTGTTCCTGACGGCCCGAAGTGAAGAGGTCGACCGCCTGCTTGGGCTGGAAATTGGTG‑CTGACGACTATGTGGCTAAACCGTTTACACCCCGCGAAGTGTGCGCCAGTGTGCGCACCTTACTGc < 2:255824/249‑1 (MQ=255) cTTGCCGGTGCTGGATAAAGCTCGCCAGCAGGCTCCCGACGTCATGATTCTCGATGTTGGTTTGCCTGATATCAGCGGCTTTGAATTATGCCGCCAGTTACTGGCGCTCCATCCGGCGTTACCTGTACTGTTCCTGACGGCCCGAAGTGAAGAGGTCGATCGCCTGCTTGGGCTGGAAATTGGTG‑CTGACGACTATGTGGCTAAACCGTTTTCACCCCGCGAAGTGTGCGCCAGGGTGCGCACCTTACTGc > 1:479954/1‑251 (MQ=255) gCCGGTGCTGGATAAAGCTCGCAAGCAGGTACCCGACGTCATGATTCTCGATGTTGGCCTGCCGGATATTAGCGGCTTTGAATTGTGCCGCCAGTTACTGGCGCTCCATCCGGCGTTACCTGTACTGTTCCTGACGGCCCGAAGTGAAGAGGTCGATCGCCTGCTTGGGCTGGAAATTGGTG‑CTGACGACTACGTGGCTAAACCGTTTTCACCCCGCGAAGTGTGCGCCAGGGTGCGCACCTTACTGCGTc < 1:196431/251‑1 (MQ=255) 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cgcTCCATCCGGCGTTACCTGTACTGTTCCTGACGGCCCGAAGTGAAGAGGTCGATCGCCTGCTTGGGCTGGAAATTGGTG‑CTGACGACTATGTGGCTAAACCGTTTTCACCCCGCGAAGTGTGCGCCAGGGTGCGCACCTTACTGCGTCGGGTGAAGAAGTTCTCGTCGCCGTCTCCCGTCATCCGTATTGGTCATTTTGAATtgaatga < 1:82883/211‑1 (MQ=255) cgcTCCATCCGGCGTTACCTGTACTGTTCCTGACGGCCCGAAGTGAAGAGGTCGATCGCCTGCTTGGGCTGGAAATTGGTG‑CTGACGACTATGTGGCTAAACCGTTTTCACCCCGCGAAGTGTGCGCCAGGGTGCGCACCTTACTGCGTCGGGTGAAGAAGTTCTCGTCGCCGTCTCCCGTCATCCGTATTGGTCATTTTGAATTGAATGAACCCGCGGCGCAGATCAGCTGGTTTGACACGCCATTaacg < 1:336927/251‑4 (MQ=255) ccttCCGGCTTTACCTGTACTTTTCCTGACGGCCCGATGTGAAGAGGTCGACCGCCTGCTTGGGCTGGAAATTGGGG‑CGGACGTCTATGTGGCTAAACCGTTTTCACCCCGCGAAGTGTGCGCCAGGTTGCGCCCCTTACTGCGTCGGGTGAAGAAGTTCTCGTCGCCGTCCCCCGTCATCCGTATTGGTAATTTTGAATTGAATGACCCCGCGGCGAAGATCAGCTGGTTTGACACGCCATTAACGCTg < 1:265946/247‑1 (MQ=255) ccgtcgttactggttcTGTACCTGACGCCCTGATGGGAAGAGGTCGAGCGCCTGCTTGGGCTGGAAAT‑GGTGGCTGACGACTTTGTGGCTAACCCGTTTTCGCCCGGCGAAGTGTGCGCCGGGGTTCGCACCTTACTGCGTCGGGTGAAGAAGTTCTCGTCGCCGTCTCCCGTCATCCGTAGTGGTCATTTTGAATTGAATGAACCCGCGGCGCAGACCAGCGGGTTTGACACGCCATTAACGCTGAcgcg < 2:350709/236‑4 (MQ=255) ccttGTACTGTTCCTGACGGCCCGAAGGGAGGAGGTCGATCGCCTGCTTGGGCTGGAAAGTGGTG‑CTCACGCATATGTGGCTAAACCTTTTTCCCCCCGCTAAGTTTGCCCCAGGTGGCGCACTTTACTGCGTCGGTTGAAGAATTTCTCGTCGCCGTCTCCCGTCATCCTTTTTGTTCATTTTGAATTGAATGAACCCGCGGCGCAGATCAGCTGGTTTGACACGCCATTAACGCTGACGCGGTATGAGt < 2:342039/248‑1 (MQ=255) cctgtatggTTCCTGTCGGCCCGAAGGGAAGAGGCCGAGCGCCTGCTTGGGTTGGAAATGGGTG‑CTGACGACTATGTGGCTAAACCGTTTTCACCCCGAGAAGTGTGCGCCAGGGTGCGCCCCTTACTGCGGCGGGTGAAGAAGTTCTCGTCGCCGTCCCCCTTCATCCGTATTGGTCATTTTGAATTGAATGAACCCGCGGCGCAGATCAGCTGGTTTGACACGCCATTAACGCTGACGCGGTATGAGtt < 2:429059/243‑1 (MQ=255) tACTGTTCCTGACGGCCCGAAGTGAAGAGGTCGATCGCCTGCTTGGGCTGGAAATTGGTG‑CTGACGACTATGTGGCTAAACCGTTTTCACCCCGCGAAGTGTGCGCCAGGGTGCGCACCTTACTGCGTCGGGTGAAGAAGTTCTCGTCGCCGTCTCCCGTCATCCGTATTGGTCATTTTGAATTGAATGAACCCGCGGCGCAGATCAGCTGGTTTGACACGCCCTTAACGCTGACGCGGGATGAGttttt > 2:494703/1‑250 (MQ=255) gtgccggACGGCCCGAAGTGAAGAGGTCGATCGCCTGCTTGGGCTGGAAATTGGTG‑CTGACGACTATGTGGCTAAACCGTTTTCCCCCCGCGAAGTGTGCGCCAGGGTGCGCACCTTACTGCGTCGGGTGAAGAAGTTCTCGTCGCCGTCCCCCGTCATCCGTATTGGTCATTTTGAATTGAATGAACCCGCGGCGCAGATCAGCTGGTTTGACACGCCATTAACGCTGACGCGGTATGAGTTTTTAttg < 1:103301/244‑1 (MQ=255) gTTCCTGACGGCCAGAAGTGAAGAGGTCGATCGCCTGCTTGGGCTGGAAATTGGTG‑CTGAAGACTATGTGGCTCAACCGTTTTCACCCCGCGAAGTGTGCGCCAGGGTGCGCACCTTACTGCGTCGGGTGAAGGAGTTCTCGTCGCCGTCTCCCGTCATCCGTATTGGTCATTTTGAATTGAATGAACCCGCGGCGCCGACCAGATGGTTTGACACGCCCTTAACGCTGAACCGGTATGAGTTTTTAttgc > 2:259027/1‑250 (MQ=255) 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tCGATCGCCTGCTTGGGCTGGAAATTGGGG‑CTGACGACTATGTGGCGACCCCGTTTTCACCCCGCGAAGTGTGCGCCAGGGTGCGCACCTTACTGCGTCGGGTGACCGAGTTCTCGTCGCCGTCTCCCGTCATCCGTATTAGTCGTTTTGAATTGAATGAACCCTCGGCGCAGATACGCTGGTTTGACACGCCATTATAGCTGCCGCGGTATGAGTTTTTATTGCTGAAGCCGTTACTCacatcgccggcc > 2:170/1‑240 (MQ=255) cGCCTGCTTGGGCTGGAAATTGGTG‑CTGCCGACTATGTGGCTAAACCGTTTTCACCCCGCGAAGTGTGCGCCAGGGTGCGCACCTTACTGCGTCGGGTGAAGAAGTTCTCGTCGCCGTCTCCCGTCATCCGTATTGGTCATTTTGAATTGAATGAACCCGCGGCGCAGATCAGCTGGTTTGACACGCCCTTAACGCTGACGCGGTATGAGTTTTTATTGCTGAAGACGTTAATCAAGTCGCCAGGCCGCGt > 2:492715/1‑251 (MQ=255) ccTGCTTGGGCTGGAAATTGGTG‑CTGACGTCTATGTGGCTAAACCGTTTTCACCCCGCGAAGTGTGCGCCAGGGTGCGCACCTTACTGCGTCGGGTGAAGAAGTTCTCGTCGCCGTCTCCCGTCATCCGTATTGGTCATTTTGAATTGAATGAACCCGCGGCGCAGATCAGCTGGTTTGACACGCCATTAACGCTGACGCGGTATGAGTTTTTATTGCTGAAGACGTTACTCAAGTCGCCAGGCCGCGTCt < 1:346616/251‑1 (MQ=255) 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ggAAATTGGGG‑CTGACGACTATGTGGCTAAACCGTTTTCACCCCGCGAAGTGTGCGCCAGGGTGCGCACCTTACTGCGTCGGGTGAAGAAGTTCTCGTCGCCGTCTCCCGTCATCCGTATTGGTCATTTTGAATTGAATGAACCCGCGGCGCAGATCAGCTGGTTTGACACGCCATTAACGCTGACGCGGTATGAGTTTTTATTGCTGAAGACGTTACTCAAGTCGCCAGGCcgcg < 2:138445/236‑1 (MQ=255) | TGGTCTACATGTTGCAGCAGGAAGGTTTTGCCGTCGAGGTCTTTGAGCGAGGCTTGCCGGTGCTGGATAAAGCTCGCAAGCAGGTACCCGACGTCATGATTCTCGATGTTGGTCTGCCGGATATTAGCGGCTTTGAATTGTGCCGCCAGTTACTGGCGCTCCATCCGGCGTTACCTGTACTGTTCCTGACGGCCCGAAGTGAAGAGGTCGATCGCCTGCTTGGGCTGGAAATTGGTG‑CTGACGACTACGTGGCTAAACCGTTTTCACCCCGCGAAGTGTGCGCCAGGGTGCGCACCTTACTGCGTCGGGTGAAGAAGTTCTCGACGCCGTCTCCCGTCATCCGTATTGGACATTTTGAATTGAATGAACCCGCGGCGCAGATCAGCTGGTTTGACACGCCATTAGCGCTGACTCGGTATGAGTTTTTATTGTTGAAGACGTTACTCAAGTCACCGGGCCGCGTCTGGTCCCGC > NC_000913/4636062‑4636534 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |