| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 4,636,175 | C→T | L57L (CTG→TTG) | creB → | DNA‑binding transcriptional regulator CreB |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 4,636,175 | 0 | C | T | 90.5% | 191.5 / 6.7 | 75 | L57L (CTG→TTG) | creB | DNA‑binding transcriptional regulator CreB |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (4/3); new base T (38/29); total (42/33) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.99e-01 | |||||||||||
AAGTTGTAGAAGGTTCGCCGAAAAACGCGATTAGCGCGGTTCCTGTCATGCCGTGGCGGCAATAACAGAGGCGATTTATGCAACGGGAAACGGTCTGGTTAGTGGAAGATGAGCAAGGGATAGCCGACACGCTGGTCTACATGTTGCAGCAGGAAGGTTTTGCCGTCGAGGTCTTTGAGCGAGGCTTGCCGGTGCTGGATAAAGCTCGCAAGCAGGTACCCGACGTCATGATTCTCGATGTTGGTCTGCCGGATATTAGCGGCTTTGAATT‑GTGCCGCCAGTTACTGGCGCTCCATCCGGCGTTACCTGTACTGTTCCTGACGGCCCGAAGTGAAGAGGTCGATCGCCTGCTTGGGCTGGAAATTGGTGCTGACGACTACGTGGCTAAACCGTTTTCACCCCGCGAAGTGTGCGCCAGGGTGCGCACCTTACTGCGTCGGGTGAAGAAGTTCTCGACGCCGTCTCCCGTCATCCGTATTGGACATTTTG > NC_000913/4635930‑4636418 | aaGTTGTAGAAGGTTCGCCGAAAAACGCGATTAGCGCGGTTCCTGTCATGCCGTGGCGGCAATAACAGAGGCGATTTATGCAACGGGAAACGGGCTGGTTAGTGGAAGATGAGCAAGGGATAGCCGACACGCTGGTCTACATGTTGCAGCAGGAAGGTTTTGCCGTCGAGGTCTTTGAGCGAGGCTTGCCGGTGCGGGATAAAGCTCGCCAGCAGGCTCCCGACGTCATGATTCTCGATGTTGGTTTGcct < 1:32489/251‑2 (MQ=255) aaaaCGCGATTAGCGCGGTTCCTGTCATGCCGTGGCGGCAATAACAGAGGCGATTTATGCAACGGGAAACGGTCTGGTTAGTGGAAGATGAGCAAGGGATAGCCGACACGCTGGTCTACATGTTGCAGCAGGAAGGTTTTGCCGTCGAGGTCTTTGAGCGAGGCTTGCCGGTGCTGGATAAAGCTCGCCAGCAGGCTCCCGACGTCATGATTCTCGATGTTGGTTTGCCTGATATCAGCGGCTTTGAAtt > 1:291267/1‑250 (MQ=255) ggATTAGCGCGGTTCCTGTCATGCCGTGGCGGCAATAACAGAGGCGATTTATGCAACGGGAAACGGTCTGGTTAGTGGAAGATGAGCAAGGGATAGCCGACACGCTGGTCTATATGTTGCAGCAGGAAGGTTTTGCCGTCGAGGTCTTTGAGCGAGGCTTGCCGGTGCTGGATAAAGCTCGCCAGCAGGCTCCCGACGTCATGATTCTCGATGTTGGTTTGCCTGATATCAGCGGCTTTGAATT‑ATgccgc < 2:79231/250‑1 (MQ=255) ttAGCGCGGTTCCTGTCATGCCGTGGCGGCAATAACAGAGGCGATTTATGCAACGGGAAACGGTCTGGTTAGTGGAAGATGAGCAAGGGATAGCCGACACGCTGGTCTACATGTTGCAGCAGGAAGGTTTTGCCGTCGAGGTCTTTGAGCGAGGCTTGCCGGTGCTGGATAAAGCTCGCCAGCAGGCTCCCGACGTCATGATTCTCGATGTTGGTTTGCCTGATATCAGCGGCTTTGAATT‑ATgccgcccg > 2:480165/1‑249 (MQ=255) aGCGCGGTTCCTGTCATGCCGTGGCGGCAATAACAGAGGCGATTTATGCAACGGGAAACGGTCTGGTTAGTGGAAGATGAGCAAGGGATAGCCGACACGCTGGTCTACATGTTGCAGCAGGAAGGTTTTGCCGTCGAGGTCTTTGAGCGAGGCTTGCCGGTGCTGGATAAAGCTCGCCAGCAGGCTCCCGACGTCATGATTCTCGATGTTGGTTTGCCTGATATCAGCg < 2:428645/229‑1 (MQ=255) aGCGCGGTTCCTGTCATGCCGTGGCGGCAATAACAGAGGCGATTTATGCAACGGGAAACGGTCTGGTTAGTGGAAGATGAGCAAGGGATAGCCGACACGCTGGTCTACATGTTGCAGCAGGAAGGTTTTGCCGTCGAGGTCTTTGAGCGAGGCTTGCCGGTGCTGGATAAAGCTCGCCAGCAGGCTCCCGACGTCATGATTCTCGATGTTGGTTTGCCTGATATCAGCg > 1:428645/1‑229 (MQ=255) ccTGTCATGCCGTGGCGGCAATAACAGAGGCGATTTAGGCAACGGGAAACGGTCTGGTTAGTGGAAGATGAGCAAGGGATAGCCGACACGCTGGTCTACATGTTGCAGCAGGAAGGTTTTGCCGTCGAGGTCTTTGAGCGAGGCTTGCCGGTGCTGGATAAAGCTCGCCAGCAGGCTCCCGACGTCATGATTCTCGATGTTGGTTTGCCTGATATCAGCGGCTTTGAATT‑ATGCCGCCAGTTACTGGCGCt < 2:360979/251‑1 (MQ=255) cTGTCCTGCCGTGGCGGCAATAACAGAGGCGATTTATGCAACGGGAAACGGTCTGGTTAGTGGAAGATGAGCAAGGGATAGCCGACACGCTGGTCTACATGTTGCAGCAGGAAGGTTTTGCCGTCGAGGTCTTTGAGCGAGGCTTGCCGGTGCTGGATAAAGCTCGCCAGCAGGCTCCCGACGTCATGATTCTCGATGTTGGTTTGCCTGATATCAGCGGCTTCGAATT‑ATGCCGCCAGTTACTGGCGCTc > 2:346616/1‑251 (MQ=255) cTGTCATGCCGTGGCGGCAATAACAGAGGCGATTTATGCAACGGGAAACGGTCTGGTTAGTGGAAGATGAGCAAGGGATAGCCGACACGCTGGTCTACATGTTGCAGCAGGAAGGGTTTGCCGTCGAGGTCTTTGAGCGAGGCTTGCCGGTGCTGGATAAAGCTCGCCAGCAGGCTCCCGACGTCATGATTCTCGATGTTGGTTTGCCTGATATCAGCGGCTTTGAATT‑ATTCCGCCAGTTAATGGCGCTc > 2:263977/1‑251 (MQ=255) tGTCATGCCGTGGCGGCAATAACAGAGGCGATTTATGCAACGGGAAACGGTCTGGTTAGTGGAAGATGAGCAAGGGATAGCCGACACGCTGGTCTACATGTTGCAGCAGGAAGGTTTTGCCGTCGAGGTCTTTGAGCGAGGCTTGCCGGTGCTGGATAAAGCTCGCCAGCAGGCTCCCGACGTCATGATTCTCGATGTTGGTTTGCCTGATATCAGCGGCTTTGAATT‑ATGCCGCCAGTTACTGGCGCTcc > 1:306133/1‑251 (MQ=255) 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gCAACGGGAAACGGTCTGGTTAGTGGAAGATGAGCAAGGGATAGCCGACACGCTGGTCTACATGTTGCAGCAGGAAGGTTTTGCCGTCGAGGTCTTTGAGCGAGGCTTGCCGGTGCTGGATAAAGCTCGCCAGCAGGCTCCCGACGTCATGATTCTCGATGTTGGTTTGCCTGATATCAGCGGCTTTGAATT‑ATGCCGCCAGTTACTGGCGCTCCATCCGGCGTTACCTGTACTGTTCCTGACGGCCCGaa < 1:263977/251‑1 (MQ=255) cAACGGGAAACGGTCTGGTTAGTGGAAGATGAGCAAGGGATAGCCGACACGCTGGACTACATGTTGAAGAAGGAAGGTTTTGCCGTCGAGGACTTTGAGCGAGGCTTGCCGGTGCTGGATAAAGCTCGCCAGCCGGCTCCCGACGTCATGATTCTCGATGTTGGTTTGCCTGATATCAGCGGCTTCGAATT‑ATGCCGCCAGTTACTGGCGCTCCATCCGGCGGTACCTGTACTGTTCCTGACGGCCCGa > 2:464420/1‑249 (MQ=255) aaCGGTCTGGTTAGTGGAAGATGAGCAAGGGATAGCCGACACGCTGGTCTACATGTTGCAGCAGGAAGGTTTTGCCGTCGAGGTCTTTGAGCGAGGCTTGCCGGTGCTGGATAAAGCTCGCAAGCAGGTACCCGACGTCATGATTCTCGATGTTGGTCTGCCGGATATTAGCGGCTTTGAATT‑GTGCCGCCAGTTACTGGCGCTCCATCCGGCGTTACCTGTACTGTTCCTGACGGCCCGAAGTGAAGAgg > 1:451005/1‑251 (MQ=255) 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tGAGCAAGGGATAGCCGACACGCTGGTCTACATGTTGCAGCAGGAAGGTTTTGCCGTCGAGGACTTTGAGCGAGGCTTGCCGGTGCTGGATAAAGCTCGCCAGCAGGCTCCCGACGTCATGATTCTCGATGTTGGTTTGCCTGATATCAGCGGCTTTGAATT‑ATGCCGCCAGTTACTTGCGCTCCATCCGGCGTTACCTGTACTGTTCCTGGCGGCCCGAAGTGAAGAGGTCGACCGCCTTCTTGGGCTgg > 2:15205/1‑251 (MQ=255) aGGGATAGCCGACACGCTGGTCTACATGTTGCAGCAGGAAGGTTTTGCCGTCGAGGTCTTTGAGCGAGGCTTGCCGGTGCTGGATAAAGCTCGCCAGCATGCTCCCGACGTCATGATTCTCGATGTTGGTTTGTCTGATATCAGCGGCTTTGAATT‑ATGCCGCCAGTTACTGGCGCTCCa < 1:236647/180‑1 (MQ=255) aGCCGACACGCTGGTCTACATGTTGCAGCAGGAAGGTTTTGCCGTCGAGGTCTTTGAGCGAGGCTTGCCGGTGCTGGATAAAGCTCGCCAGCAGGCTCCCGACGTCATGATTCTCGATGTTGGTTTGCCTGATATCAGCGGCTTTGAATT‑ATgcc > 2:418140/1‑155 (MQ=255) aGCCGACACGCTGGTCTACATGTTGCAGCAGGAAGGTTTTGCCGTCGAGGTCTTTGAGCGAGGCTTGCCGGTGCTGGATAAAGCTCGCCAGCAGGCTCCCGACGTCATGATTCTCGATGTTGGTTTGCCTGATATCAGCGGCTTTGAATT‑ATgcc < 1:418140/155‑1 (MQ=255) 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gccagcaggctcccGACGTCATGATTCTCGATGTTGGTTTGCCTGATATCAGCGGCTTTGAATT‑ATGCCGCCAGTTACTGGCGCTCCATCCGGCGTTACCTGTACTGTTCCTGACGGCCCGAAGGGAAGAGGTCGATCGCCTGCTTGGGCTGGTAATTGGTGCTGACGACTATGTGGCTAAACCGTTTTCACCCCGCGAAGTGTGCGCCAGGGGGCGCACCTTACTGCGTGGGGGGAAGAAGTTTTCgtcg > 2:262215/12‑248 (MQ=255) ccagcaggctcccGACGTCATGATTCTCGATGTTGGTTTGCCTGATATCAGCGGCTTTGAATT‑ATGCCGCCAGTTACTGGCGCTCCATCCGGCGTTACCTGTACTGTTCCTGACGGCCCGAAGTGAAGAGGTCGATCGCCTGCTTGGGCTGGAAATTGGTGCTGACGACTATGTGGCTAAACCGTTTTCACCCCGCGAAGTGTGCGCCAGGGTGCGCACCTTACTGCGTCGGGTGAAGCAGTTCTCGTCGc > 1:155920/11‑251 (MQ=255) agcaggctcccGACGTCATGATTCTCGATGTTGGTTTGCCTGATATCAGCGGCTTTGAATT‑ATGCCGCCAGTTACTGGCGCTCCATCCGGCGTTACCTGTACTGTTCCTGACGGCCCGAAGTGAAGAGGTc < 1:190064/123‑1 (MQ=255) agcaggctcccGACGTCATGATTCTCGATGTTGGTTTGCCTGATATCAGCGGCTTTGAATT‑ATGCCGCCAGTTACTGGCGCTCCATCCGGCGTTACCTGTACTGTTCCTGACGGCCCGAAGTGAAGAGGTc > 2:190064/9‑131 (MQ=255) 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AAGTTGTAGAAGGTTCGCCGAAAAACGCGATTAGCGCGGTTCCTGTCATGCCGTGGCGGCAATAACAGAGGCGATTTATGCAACGGGAAACGGTCTGGTTAGTGGAAGATGAGCAAGGGATAGCCGACACGCTGGTCTACATGTTGCAGCAGGAAGGTTTTGCCGTCGAGGTCTTTGAGCGAGGCTTGCCGGTGCTGGATAAAGCTCGCAAGCAGGTACCCGACGTCATGATTCTCGATGTTGGTCTGCCGGATATTAGCGGCTTTGAATT‑GTGCCGCCAGTTACTGGCGCTCCATCCGGCGTTACCTGTACTGTTCCTGACGGCCCGAAGTGAAGAGGTCGATCGCCTGCTTGGGCTGGAAATTGGTGCTGACGACTACGTGGCTAAACCGTTTTCACCCCGCGAAGTGTGCGCCAGGGTGCGCACCTTACTGCGTCGGGTGAAGAAGTTCTCGACGCCGTCTCCCGTCATCCGTATTGGACATTTTG > NC_000913/4635930‑4636418 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |