| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 4,636,139 | A→C | K45Q (AAG→CAG) | creB → | DNA‑binding transcriptional regulator CreB |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 4,636,139 | 0 | A | C | 91.0% | 177.7 / 2.7 | 67 | K45Q (AAG→CAG) | creB | DNA‑binding transcriptional regulator CreB |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (4/2); new base C (34/27); total (38/29) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.91e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.74e-01 | |||||||||||
ACGCAACGCGCTCGCTTATCTGGCTTACTCCGACAAAGTTGTAGAAGGTTCGCCGAAAAACGCGATTAGCGCGGTTCCTGTCATGCCGTGGCGGCAATAACAGAGGCGATTTATGCAACGGGAAACGGTCTGGTTAGTGGAAGATGAGCAAGGGATAGCCGACACGCTGGTCTACATGTTGCAGCAGGAAGGTTTTGCCGTCGAGGTCTTTGAGCGAGGCTTGCCGGTGCTGGATAAAGCTCGCAAGCAGGTACCCGACGTCATGATTCTCGATGTTGGTCTGCCGGATATTAGCGGCTTTGAATT‑GTGCCGCCAGTTACTGGCGCTCCATCCGGCGTTACCTGTACTGTTCCTGACGGCCCGAAGTGAAGAGGTCGATCGCCTGCTTGGGCTGGAAATTGGTGCTGACGACTACGTGGCTAAACCGTTTTCACCCCGCGAAGTGTGCGCCAGGGTGCGCACCTTACTGCGTCGGGTGAAGAAGTT > NC_000913/4635895‑4636380 | acgcaacgcGCTCGCGTATCTGGCTTACTCCGACAAAGTTGTAGAAGGTTCGCCGAAAAACGCGATTAGCGCGGTTCCTGTCATGCCGGGGCGGCAATAACAGAGGCGATGTATGCAACGGGAAACGGTCTGGTTAGTTGAAGATGAGCAAGGGATAGCCGACACGCTGGTCTACATGTTGCAGCAGGAAGGTTTTGCCGTCGAGGTCTTTGAGCGAGGCTTGCCGGTGCTGGATAAAGCTCGCCAGCAgg < 1:443010/251‑1 (MQ=255) aacgcGCTCGCTTATCTGGCTTACTCCGACAAAGTTGTAGAAGGTTCGCCGAAAAACGCGATTAGCGCGGTTCCTGTCATGCCGTGGCGGCAATAACAGAGGCGATTTATGCAACGGGAAACGGTCTGGTTAGTGGAAGATGAGCAAGGGATAGCCGACACGCTGGTCTACATGTTGCAGCAGGAAGGTTTTGCCGTCGAGGTCTTTGAGCGAGGCTTGCCGGGGCTGGATAAAGCTCGCAAGCAGGTAcc > 2:196431/1‑251 (MQ=255) acgcGCTCGCTTATCTGGCTTACTCCGACAAAGTTGTAGAAGGTTCGCCGAAAAACGCGATTAGCGCGGTTCCTGTCATGCCGTGGCGGCAATAACAGAGGCGATTTATGCAACGGGAAACGGTCTGGTTAGTGGAAGATGAGCAAGGGATAGCCGACACGCTGGTCTACATGTTGCAGCAGGAAGGTTTTGCCGTCGAGGTCTTTGAGCGAGGCTTGCCGGTGCTGGATAAAGCTCGCCAGCAggctccc < 2:33296/251‑6 (MQ=255) gcgcTCGCTTATCTGGCTTACTCCGACAAAGTTGTAGAAGGTTCGCCGAAAAACGCGATTAGCGCGGTTCCTGTCATGCCGTGGCGGCAATAACAGAGGCGATTTATGCAACGGGAAACGGTCTGGTTAGTGGAAGATGAGCAAGGGATAGCCGACACGCTGGTCTACATGTTGCAGCAGGAAGGTTTTGCCGTCGAGGTCTTTGAGCGAGGCTTGCCGGGGCTGGATAAAGCTCGCCAGCAggctcccg > 1:302681/1‑244 (MQ=255) ctcgctTATCTGGCTTACTCCGACAAAGTTGTAGAAGGTTCGCCGAAAAACGCGATTAGCGCGGTTCCTGTCATGCCGTGGCGGCAATAACAGAGGCGATTTATGCAACGGGAAACGGTCTGGTTAGTGGAAGATGAGCAAGGGATAGCCGACACGCTGGTCTACATGTTGCAGCAGGAAGGTTTTGCCGTCGAGGTCTTTGAGCGAGGCTTGCCGGTGCTGGATAAAGCTCGCCAGCAGGCTCCCGACGt > 1:360979/1‑251 (MQ=255) tACTCCGACAAAGTTGAAGAAGGTTCGCCGAAAAACGCGATTAGCGCGGTTCCTGTCATGCCGTGGCGGCAATAACAGAGGCGATTTATGCAACGGGAAACGGTCTGGTTAGTGGAAGATGAGCAAGGGATAGCCGACACGCTGGTCTACATGTTGCAGAAGGAAGGTTTTGCCGTCGAGGTCTTTGAGCGAGGCTTGCCGGTGCTGGATAAAGCTCGCCAGCAGGCTCCCGAGGTCAGGATTCTCGATgg > 2:103301/1‑250 (MQ=255) aCAAAGTTGTAGAAGGTTCGCCGAAAAACGCGATTAGCGCGGTTCCTGTCATGCCGTGGCGGCAATAACAGAGGCGATTTATGCAACGGGAAACGGTCTGGTTAGTGGAAGATGAGCAAGGGATAGCCGACACGCTGGTCTACATGTTGCAGCAGGAAGGTTTTGCCGTCGAGGTCTTTGAGCGAGGCTTGCCGGTGCTGGATAAAGCTCGCCAGCAGGCTCCCGACGTCATGATTCTCGATGTTGGtttg > 1:447001/1‑248 (MQ=255) 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cATGCCGTGGCGGCAATAACAGAGGCGATTTATGCAACGGGAAACGGTCTGGTTAGTGGAAGATGAGCAAGGGATAGCCGACACGCTGGTCTACATGTTGCAGCAGGAAGGTTTTGCCGTCGAGGTCTTTGAGCGAGGCTTGCCGGTGCTGGATAAAGCTCGCAAGCAGGTACCCGACGTCATGATTCTCGATGTTGGTCTGCCGGATATTAGCGTCTTTGAATT‑GTGCCGCCAGTTACTGGCGCTCCATc > 1:74350/1‑251 (MQ=255) gCCGTGGCGGCAATAACAGAGGCGATTTATGCAACGGGAAACGGTCTGGTTAGTGGAAGATGAGCAAGGGATAGCCGACACGCTGGTCTACATGTTGCAGCAGGAAGGTTTTGCCGTCGAGGTCTTTGAGCGAGGCTTGCCGGTGCTGGATAAAGCTCGCCAGCAGGCTCCCGACGTCATGATTCTCGATGTTGGTTTGCCTGATATCAGCGGCTTTGAATT‑ATGCCGCCAGTTACTGGCGCTCCATCCgg < 2:470257/251‑1 (MQ=255) ggcggcAATAACAGAGGCGATTTATGCAACGGGAAACGGTCTGGTTAGTGGAAGATGAGCAAGGGATAGCCGACACGCTGGTCTACATGTTGCAGCAGGAAGGTTTTGCCGTCGAGGTCTTTGAGCGAGGCTTGCCGGTGCTGGATAAAGCTCGCCAGCAGGCTCCCGACGTCATGATTCTCGATGTTGGTTTGCCTGATATCAGCGGCTTTGAATT‑ATGCCGCCAGTTACTGGCGCTCCATCCGGCGTTa < 2:423365/251‑1 (MQ=255) cAATAACAGAGGCGATTTATGCAACGGGAAACGGTCTGGTTAGTGGAAGATGAGCAAGGGATAGCCGACACGCTGGTCTACATGTTGCAGCAGGAAGGTTTTGCCGTCGAGGTCTTTGAGCGAGGCTTGCCGGTGCTGGATAAAGCTCGCCAGCAGGCTCCCGACGTCATGATTCTCGATGTTGGTTTGCCTGATATCAGCGGCTTTGAATT‑ATGCCGCCAGTTACTGGCGCTCCATCCGGCGTTACCTGt > 1:347478/1‑251 (MQ=255) aaTAACAGAGGCGATTTATGCAACGGGAAACGGTCTGGTTAGTGGAAGATGAGCAAGGGATAGCCGACACGCTGGTCTACATGTTGCAGCAGGAAGGTTTTGCCGTCGAGGTCTTTGAGCGAGGCTTGCCGGTGCTGGATAAAGATCGCCAGCAGGCTCCCGACGTCATGATTCTCGATGTTGGTTTGCCTGATATCAGCGGCTTTGAATT‑ATGCCGCCAGTTACTGGCGCTCCATCCGGCGTTACCTGt > 1:255824/1‑250 (MQ=255) cAGAGGCGATTTATGCAACGGGAAACGGTCTGGTGAGTGGCAGATGAGCAAGGGATAGCCGACACGCTGGTCTACATGTTTCAGAAGGAAGGTTTTGACGGCGCCGTCTTTGAGCGAGGCTTGCCGGTGCTGGATAAAGCTCGCCAGCAGGATCCCGACGACATGATTCTCGCTGTTGGTTTGCCTGCAATCAGCGGCTTTGCATTAGT‑AAGCCAGTTATTGGCGCTCCATCCgtggttaacgtaacggtt > 2:409656/1‑234 (MQ=255) 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gCGAGGCTTGCCGGTGCTGGATAAAGCTCGCCAGCAGGCTCCCGACGTCATGATTCTCGATGTTGGTTTGCCTGATATCAGCGGCTTTGAATT‑ATGCCGCCAGTTACTGGCGCTCCATCCGGCGTTACCTGTACTGTTCCTGACGGCCCGAAGTGAAGAGGTCTATCGCCTGCTTGGGCTGGAAATTGGTGCTGACGACTATGTGGCTAAACCGTTTTCACCCCGCGAAGTGTGCGCCAGGGTGCGCACCt < 2:209685/251‑1 (MQ=255) gCGAGGCTTGCCGGTGCTGGATAAAGCTCGCCAGCAGGCCCCCGACGTCATGATTCTCGATGTTGGTTTGCCTGATATCAGCGGCTATGAATT‑ATGCCGCCAGTTTCTGGCGCTCCATCCGGCGTTACCTGTACTGTTCCTGACGGCCCGAAGTGAAGAGGTCGATCGCCTGCTTGGTCTGGAAATTGGTGCTGACGACTATGTGGCTAAACCGTTTTCACCCCGCGAAGTGTGCGCCAGGGTGCGCACCt < 1:488818/251‑1 (MQ=255) cGAGGCTTGCCGGTGCTGGATAAAGCTCGCAAGCAGGTACCCGTCGTCATGATTCTCGAGGTTGGTCTGCCGGATATTAGCGGCTTTGAATT‑GTGCCGCCAGGTACTGGCGCTCCATCCGGCGTTACCTGTACTGTTCCTGACGGCCCGAAGTGAAGAGGTCGATCGCCTGCTTGGGCTGGAAATTGGTGCTGACGACTACGTGGCTAAACCGTTTTCACCCCGCGAAGTGTGCGCCAGGGTGCGCACCtt < 2:451005/251‑1 (MQ=255) 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cTTGCCGGTGCTGGATAAAGCTCGCCAGCAGGCTCCCGACGTCATGATTCTCGATGTTGGTTTGCCTGATATCAGCGGCTTTGAATT‑ATGCCGCCAGTTACTGGCGCTCCATCCGGCGTTACCTGTACTGTTCCTGACGGCCCGAAGTGAAGAGGTCGATCGCCTGCTTGGGCTGGAAATTGGTGCTGACGACTATGTGGCTAAACCGTTTTCACCCCGCGAAGTGTGCGCCAGGGTGCGCACCTTACTGc > 1:479954/1‑251 (MQ=255) gCCGGTGCTGGATAAAGCTCGCAAGCAGGTACCCGACGTCATGATTCTCGATGTTGGCCTGCCGGATATTAGCGGCTTTGAATT‑GTGCCGCCAGTTACTGGCGCTCCATCCGGCGTTACCTGTACTGTTCCTGACGGCCCGAAGTGAAGAGGTCGATCGCCTGCTTGGGCTGGAAATTGGTGCTGACGACTACGTGGCTAAACCGTTTTCACCCCGCGAAGTGTGCGCCAGGGTGCGCACCTTACTGCGTc < 1:196431/251‑1 (MQ=255) ggTGCTGGATAAAGCTCGCCAGCAGGCTCCCGACGTCATGATTCTCGATGTTGGTTTGCCTGATATCAGCGGCTTTGAATT‑ATGCCGCCAGTTACTGGCGCTCCATCCGGCGTTACCTGTACTGTTCCTGACGGCCCGAAGTGAAGAGGTCGATCGCCTGCTTGGGCTGGAGCTTGGTGCTGACGACTATGTGGCTAAACCGTTTTCACCCCGCGCAGTGTGCGCCAGGGTGCGCACCTTACTGCGTCggg > 2:150218/1‑251 (MQ=255) tGGATAAAGCTCGCCAGCAGGCTCCCGACGTCATGATTCTCGATGTTGGTTTGCCTGATATCAGCGGCTTTGAATT‑ATGCCGCCAGTTACTGGCGCTCCATCCGGCGTTACCTGTACTGTTCCTGACGGCCCGAAGTGAAGAGGTCGATCGCCTGCTTGGGCTGGAAATTGGTGCTgac < 2:127312/179‑1 (MQ=255) tGGATAAAGCTCGCCAGCAGGCTCCCGACGTCATGATTCTCGATGTTGGTTTGCCTGATATCAGCGGCTTTGAATT‑ATGCCGCCAGTTACTGGCGCTCCATCCGGCGTTACCTGTACTGTTCCTGACGGCCCGAAGTGAAGAGGTCGATCGCCTGCTTGGGCTGGAAATTGGTGCTgac > 1:127312/1‑179 (MQ=255) aTAAAGCTCGCCAGCAGGCTCCCGACGTCATGATTCTCGATGTTGGTTTGCCTGATATCAGCGGCTTTGAATT‑ATGCCGCCAGTTACTGGCGCTCCATCCGGCGTTACCTGTACTGTTCCTGACGGCCCGAAGTGAAGAGGTCGATCGCCTGCTTGGGCTGGAAATTGGTGCTGACGACTATGTGGCTAAACCGTTTTCACCCCGCGAAGTGTGCGCCAGGGTGCGCACCTTACTGc > 2:109297/1‑237 (MQ=255) aTAAAGCTCGCCAGCAGGCTCCCGACGTCATGATTCTCGATGTTGGTTTGCCTGATATCAGCGGCTTTGAATT‑ATGCCGCCAGTTACTGGCGCTCCATCCGGCGTTACCTGTACTGTTCCTGACGGCCCGAAGTGAAGAGGTCGATCGCCTGCTTGGGCTGGAAATTGGTGCTGACGACTATGTGGCTAAACCGTTTTCACCCCGCGAAGTGTGCGCCAGGGTGCGCACCTTACTGc < 1:109297/237‑1 (MQ=255) aaaGCTCGCCAGCAGGCTCCCGTCGTCAGGATTCGCGATGTTGGTTTGCCTGATACCAGCGGCTTTGAATT‑ATGCCGCCAGTTACTGGCGCTCCAGCCTGCGTTACCTGTACTGTTCCTGACGGCCCGAAGTGAAGAGGTCGATCGTCTGCTTGGGCTGTAAATTGGTGCTGACGACTATGTGGCTAAACCGTTTTCACCCCGCGAAGTGTGCGCCAGGGTGCGCACCTTACTGCGTCggttcaataagtt < 2:394031/251‑12 (MQ=255) | ACGCAACGCGCTCGCTTATCTGGCTTACTCCGACAAAGTTGTAGAAGGTTCGCCGAAAAACGCGATTAGCGCGGTTCCTGTCATGCCGTGGCGGCAATAACAGAGGCGATTTATGCAACGGGAAACGGTCTGGTTAGTGGAAGATGAGCAAGGGATAGCCGACACGCTGGTCTACATGTTGCAGCAGGAAGGTTTTGCCGTCGAGGTCTTTGAGCGAGGCTTGCCGGTGCTGGATAAAGCTCGCAAGCAGGTACCCGACGTCATGATTCTCGATGTTGGTCTGCCGGATATTAGCGGCTTTGAATT‑GTGCCGCCAGTTACTGGCGCTCCATCCGGCGTTACCTGTACTGTTCCTGACGGCCCGAAGTGAAGAGGTCGATCGCCTGCTTGGGCTGGAAATTGGTGCTGACGACTACGTGGCTAAACCGTTTTCACCCCGCGAAGTGTGCGCCAGGGTGCGCACCTTACTGCGTCGGGTGAAGAAGTT > NC_000913/4635895‑4636380 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |