| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 4,621,321 | A→G | I147V (ATT→GTT) | deoD → | purine nucleoside phosphorylase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 4,621,321 | 0 | A | G | 98.0% | 145.9 / ‑4.8 | 51 | I147V (ATT→GTT) | deoD | purine nucleoside phosphorylase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/1); new base G (31/18); total (31/20) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.80e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.89e-01 | |||||||||||
ATCCCGTCCTGCTCCATCTACACCAAAGAACTGATCACCGATTTCGGCGTGAAGAAAATTATCCGCGTGGGTTCCTGTGGCGCAGTTCTGCCGCACGTAAAACTGCGCGACGTCGTTATCGGTATGGGTGCCTGCACCGATTCCAAAGTTAACCGCATCCGTTTTAAAGACCATGACTTTGCCGCTATCGCTGACTTCGACATGGTGCGTAACGCAGTAGATGCAGCTAAAGCACTGGGTATTGATGCTCGCGTGGGTAACCTGTTCTCCGCTGACCTGTTCTACTCTCCGGACGGCGAAATGTTCGACGTGATGGAAAAATACGGCATTCTCGGCGTGGAAATGGAAGCGGCTGGTATCTACGGCGTCGCTGCAGAATTTGGCGCGAAAGCCCTGACCATCTGCACCGTATCTGACCACATCCGCACTCACGAGCAGACCACTGCCGCTGAGCGTCAGACTACCTTCAACGACATGATCAAAAT > NC_000913/4621081‑4621565 | aTCCCGTCCTGCTCCATCTACACCAAAGAACTGATCCCCGAGTGCGGCGTGAAGAAAATTATCCGCGTGGGTTCCTGTGGCGCAGTTCTTCCGCACGTAAAACTGCGCGACGTCGTTAGCGGTATGGGTGCCTGCACCGATTCCAAAGTTAACCGTTTCCGTTTTAAAGACCATGACTTTGCCGCTATCGCTGACTTTGACATGGTGCGTAACGCGGTAGACGCGGCTAAAGCACTGGGTGTTGATGCTc < 2:294848/250‑1 (MQ=255) ccTGCTCCATCTACACCAAAGAACTGATCACCGATTTCGGCGTGAAGAAAATTATCCGCGTGGGTTCCTGTGGCGCAGTTCTGCCGCACGTAAAACTGCGCGACGTCGTTATCGGTATGGGTGCCTGCACCGATTCCAAAGTTAACCGTATCCGTTTTAAAGACCATGACTTTGCCGCTATCGCTGACTTTGACATGGTGCGTAACGCGGTAGACGCGGCTAAAGCACTGGGTGTTGATGCTCGCGTGGGt > 1:326775/1‑251 (MQ=255) tGCTCCATCTACAACAAAGAACTGATCACCGATTTCGGCGTGAAGAAAATTATCCGCGTGGGTTCCTGTGGCGCAGTTCTGCCGCACGTAAAACTGCGCGACGTCGTTATCGGTATGGGTGCCTGCACCGATTCCAAAGTTAACCGTATCCGTTTTAAAGACCATGACTTTGCCGCTATCGCTGACTTTGACATGGTGCGTAACGCGGTAGACGCGGCTAAAGCACTGGGTGTTGATGCTCGCGTGGGTa > 1:367154/1‑250 (MQ=255) gCTCCATCTACACCAAAGAACTGATCACCGATTTCGGCGTGAAGAAAATTATCCGCGTGGGTTCCTGTGGCGCAGTTCTGCCGCACGTAAAACTGCGCGACGTCGTTATCGGTATGGGTGCCTGCACCGATTCCAAAGTTAACCGTATCCGTTTTAAAGACCATGACTTTGCCGCTATCGCTGACTTTGACATGGTGCGTAACGCGGTAGACGCGGCTAAAGCACTGGGTGTGGAGGCTCGCGTGGGTAAc < 1:142056/251‑1 (MQ=255) 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tATCCGCGTGGGTTCCTGTGGCGCAGTTCTGCCGCACGTAAAACTGCGCGACGTCGTTATCGGTATGGGTGCCTGCACCGATTCCAAAGTTAACCGTATCCGTTTTAAAGACCATGACTTTGCCGCTATCGCTGACTTTGACATGGTGCGTAACGCGGTAGACGCGGCTAAAGCACTGGGTGTTGATGCTCGCGTGGGTAACCTGTTCTCCGCTGACCTGTTCTACTCTCCGGACGGCGAAATGTTCGAc < 2:106409/250‑1 (MQ=255) cgcgTGGGTTCCTGTGGCGCAGTTCTGCCGCACGTAAAACTGCGCGACGTCGTTATCGGTATGGGTGCCTGCACCGATTCCAAAGTTAACCGTATCCGTTTTAACGACCATGACTTTGCCGCTATCGCTGACTTTGACATGGTGCGTAACGCGGTAGACGCGGCTAAATCACTGGGTGTTGATGCTCGCGTGGGTAACCTGTTCTCCGCTGACCTGTTCTACTCTCCGGACGGCGAAATGTTCGACGTGAt > 1:182984/1‑251 (MQ=255) cgcgTGGGTTCCTGTGGCGCAGTTCTGCCGCACGTAAAACTGCGCGACGTCGTTATCGGTATGGGTGCCTGCACCGATTCCAAAGTTAACCGTATCCGTTTTAAAGACCATGACTTTGCCGCTATCGCTGACTTTGACATGGTGCGTAACGCGGTAGACGCGGCTAAAGCACTGGGTGTTGATGCTCGCGTGGGTAACCTGTTCTCCGCTGCCCTGTTCTACTCTCCGGACGGCGCACTGTTCgccgcga > 2:100621/1‑244 (MQ=255) ccTGTGGCGCAGTTCTGCCGCACGTAAAACTGCGCGACGTCGTTATCGGTATGGGTGCCTGCACCGATTCCAAAGTTAACCGTATCCGTTTTAAAGACCATGACTTTGCCGCTATCGCTGACTTTGACATGGTGCGTAACGCGGTAGACGCGGCTAAAGCACTGGGTGTTGATGCTCGCGTGGGTAACCTGTTCTCCGCTGACCTGTTCTACTCTCCGGACGGCGAAATGTTCGACGTGATGGAAAAATAc > 1:340948/1‑251 (MQ=255) ccTGTGGCGCAGTTCTGCCGCACGTAAAACTGCGCGACGTCGGTATCGGTATGGGTGCCTGCACCGATTCCAAAGTTAACCGTATCCGTGTTAAAGACCATTACTTTGCCGCTATCGCTGACTTTGACATGGTGCGTAACGCGGTAGACGCGGCTAAAGCACTGGGTGTTGTTGCTCGCGTGGGTAACCTGTTCTCCGCGGACCTGTTCTACTCTCCGGACGGCGAAATGTTCGACGTGATGGAAAAATAc < 1:501456/251‑1 (MQ=255) gtgGCGCAGTTCTGCCGCACGTAAAACTGCGCGACGTCGTTATCGGTATGGGTGCCTGCACCGATTCCAAAGTTAACCGTATCCGTTTTAAAGACCATGACTTTGCCGCTATCGCTGACTTTGACATGGTGCGTAACGCGGTAGACGCGGCTAAAGCACTGGGTGTTGATGCTCGCGTGGGTAACCTGTTCTCCGCTGACCTGTTCTACTCTCCGGACGGCGAAATGTTCGACGTGATgg < 2:308409/240‑1 (MQ=255) gtgGCGCAGTTCTGCCGCACGTAAAACTGCGCGACGTCGTTATCGGTATGGGTGCCTGCACCGATTCCAAAGTTAACCGTATCCGTTTTAAAGACCATGACTTTGCCGCTATCGCTGACTTTGACATGGTGCGTAACGCGGTAGACGCGGCTAAAGCACTGGGTGTTGATGCTCGCGTGGGTAACCTGTTCTCCGCTGACCTGTTCTACTCTCCGGACGGCGAAATGTTCGACGTGATgg > 1:308409/1‑240 (MQ=255) cgcAGTTCTGCCGCACGTAAAACTGCGCGACGTCGTTATCGGTATGGGTGCCTGCACCGATTCCAAAGTTAACCGTATCCGTTTTAAAGACCATGACTTTGCCGCTATCGCTGACTTTGACATGGTGCGTAACGCGGTAGACGCGGCTAAAGCACTGGGTGTTGATGCTCGCGTGGGTAACCTGTTCTCCGCTGACCTGTTCTACTCTCCGGACGGCGAAATGTTCGACGTGATGGAAAAATACGGCAtcc < 1:277667/251‑3 (MQ=255) gTTCTGCCGCACGTAAAACTGCGCGACGTCGTTATCGGTATGGGTGCCTGCACCGATTCCAAAGTTAACCGTATCCGTTTTAAAGACCATGACTTTGCCGCTATCGCTGACTTTGACATGGTGCGTAACGCGGTCGACGCGGCTAAAGCACTGGGTGTTGATGCTCGCGTGGGTAACCTGTTCTCCGCTGACCTGTTCTACTCTCCGGACGGCGAAATGTTCGACGTGCTGGAAGAATACTGCATCCTCgg > 2:116660/1‑251 (MQ=255) 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tATCGGTATGGGTGCCTGCACCGATTCCAAAGTTAACCGTATCCGTTTTAAAGACCATGACTTTGCCGCTATCGCTGACTTTGACATGGTGCGTAACGCGGTAGACGCGGCTAAAGCACTGGGGGTTGATGCTCGCGTGGGTAACCTGTTCTCCGCTGACCTGTTTTACTCTCCGGCCGGCGAAATGTTCGACGTGATGGAAAAATACGGCATCCTCGGCGTGGCACTGGAAGCGGCTggggtttatggcg > 2:356145/1‑240 (MQ=255) cGGTATGGGTGCCTGCACCGATTCCAAAGTTAACCGTATCCGTTTTAAAGACCATGACTTTGCCGCTATCGCTGACTTTGACATGGTGCGTAACGCGGTAGACGCGGCTAAAGCACTGGGTGTTGATGCTCGCGTGGGTAACCTGTTCTCCGCTGCCCTGTTCTACTCTCCGGACGGCGAAATGTTCGACGTGATGGAAAAATACGGCATCCTCGGCGTGGAAATGGAAGCGGCTGGGATCTAAGGCGTcc > 2:71460/1‑250 (MQ=255) tGGGTGCCTGCACCGATTCCAAAGTTAACCGTATCCGTTTTAAAGACCATGACTTTGCCGCTATCGCTGACTTTGACATGGTGCGTAACGCGGTAGACGCGGCTAAAGCACTGGGTGTTGATGCTCGCGTGGGTAACCTGTTCTCCGCTGACCTGTTCTACTCTCCGGACGGCGAAATGTTCGACGTGATGGAAAAATACGGCATCCTCGGCGTGGAAATGGAAGCGGCTGGTATCTACGGCGTCGCTGc > 1:258474/1‑250 (MQ=255) 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aCCATGACTTTGCCGCTATCGCTGACTTTGACATGGTGCGTAACGCGGTAGACGCGGCTAACGCACTGGGTGTTGATGCTCGCGTGGGTAACCTGTTCTCCGCTGACCTGTTCTACTCTCCGGACGGCGAAATGTTCGACGTGATGGAAAAATACGGCATCCTCGGCGTGGAAATGGAAGCGGCTGGTATCTCCGGGGTCGCTGCCGAGTTTGGCGCGAAAGCCCCGACCCTCTGCCCCGTGTCTgcaccc > 2:247808/1‑246 (MQ=255) aCCATGACTTTGCCGCTATCGCTGACTTTGACATGGTGCGTAACGCGGTAGACGCGGCTAAAGCACTGGGTGTTGATGCTCGCGTGGGTAACCTGTTCTCCGCTGACCTGTTCTACTCTCCGGACGGCGAAATGTTCGACGTGATGGAAAAATACGGCATCCTCGGCGTGGAAATGGAAGCGGCTGGTATCTACGGCGGCGCTGCGGAGTTTGGCGCGAAAGCCCTGGCCATCTGCACCGTGCCTGACcac > 2:133097/1‑251 (MQ=255) tttGCCGCTATCGCTGACTTTGACATGGTGCGTAACGCGGTAGACGCGGCTAAAGCACTGGGTGTTGATGCTCGCGTGGGTAACCTGTTCTCCGCTGACCTGTTCTACTCTCCGGACGGCGAAATGTTCGACGTGATGGAAAAATACGGCATCCTCGGCGTGGAAATGGAAGCGGCTGGTATCTACGGCGTCGCTGCAGAGTTTGGCGCGAAAGCCCTGACCATCTGCACCGTGTCTGACCACATCCGCAc > 1:243764/1‑251 (MQ=255) gCTATCGCTGACTTTGACATGGTGCGTAACGCGGTAGACGCGGCTAAAGCACTGGGTGTTGATGCTCGCGTGGGTAACCTGTTCTCCGCTGACCTGGTCTACTCTCCGGACGGCGAAATGTTCGACGTGATGGAAAAATACGGCATCCTCGGCGTGGAAATGGAAGCGGCTGGTATCTAAGGCGTCGCTGAAGAGTTTGGCGCGAAAGCCCTTAACATCTGGACCggggcttaccccctcctccctcactg > 2:231353/1‑226 (MQ=255) tATCGCTGACTTTGACATGGTGCGTAACGCGGTAGACGCGGCTAAAGCACTGGGTGTTGATGCTCGCGTGGGTAACCTGTTCTCCGCTGACCTGTTCTACTCTCCGGACGGCGAAATGTTCGACGTGATGGAAAAATACGGCATCCTCGGCGTGGAAATGGAAGCGGCTGGTATCTACGGCGTCGCTGCAGAGTTTGGCGCGAAAGCCCTGACCATCTGCACCGTGTCTGACCACATCCGCACTCACgcgc > 1:77924/1‑248 (MQ=255) aTCGCTGACTTTGACATGGGGCGGAACGCGGTAGACGCGGCTAAAGCACTGGGTGTTGATGCTCGCGTGGGTAACCGGTTCTCCGCTGACCTGTTCTACTCTCCGGACGGCGAAATGGTCGACGTGATGGAAAAATACGGCATCCTCGGCGTGGAAATGGAAGCGGCTGGTATCTACGGCGTCGCTGCAGAGTTTGGCGCGAAAGCCCTGACCATCTGCACCGGGTCTGACCACATCCGCACTCGCGAGc < 2:471840/250‑1 (MQ=255) cGCTGACTTTGACATGGTGCGTAACGCGGTAGACGCGGCTAAAGCACTGGGTGTTGATGCTCGCGTGGGTAACCTGTTCTCCGCTGACCTGTTCTACTCTCCGGACGGCGAAATGtt > 1:375907/1‑117 (MQ=255) cGCTGACTTTGACATGGTGCGTAACGCGGTAGACGCGGCTAAAGCACTGGGTGTTGATGCTCGCGTGGGTAACCTGTTCTCCGCTGACCTGTTCTACTCTCCGGACGGCGAAATGtt < 2:375907/117‑1 (MQ=255) cGCTGACTTTGACATGGTGCGTAACGCGGTAGACGCGGCTAAAGCACTGGGTGTTGATGCTCGCGTGGGTAACCTGTTCTCCGCTGACCTGTTCTACTCTCCGGACGGCGAAATGTTCGACGTGATGGAAAAATACGGCATCCTCGGCGTGGAAATGGAAGCGGCTGGTATCTACGGCGTCGCTGCAGAGTTTGGCGCGAAAGCCCTGACCATCTGCACCGTGTCTGACCACATCCGCACTCACGAGCAg < 2:326775/250‑1 (MQ=255) tGACTTTGACATGGTGCGTAACGCGGTAGACGCGGCTAAAGCACTGGGTGTTGATGCTCGCGTGGGTAACCTGTTCTCCGCTGACCTGTTCTACTCTCCGGACGGCGAAATGTTCGACGTGATGGAAAAATACGGCATCCTCGGCGTGGAAATGGAAGCGGCTGGTATCTACGGCGTCGCTGCAGAGTTTGGCGCGAAAGCCCTGACCATCTGCACCGTGTCTGACCACATCCGCACTCACGAGCAGAccc > 1:43323/1‑250 (MQ=255) gactttgtcATGGTGCGTAACGCGGTATACGCGGCGAAAGCACTGGGTGTTGATGCTCGCGTGGGTAACCTGTTCTCCGCTGACCTGTTCTACTCGCCGGACGGCGAAATGTTCGACGTGATGGAAAAATACGGCATCCTCGGCGTTGAAATGGAAGCGGCTGGTATCTACGGCGTCGCTGCAGAGTTTGGCGCGAAAGCCCTGACCATCTGCTCCGTGTCTGACCACATCCGCACTCACGAGCAGACCa < 1:328006/242‑1 (MQ=255) gACTTTGACATGGTGCGTAACGCGGTAGACGCGGCTAAAGCACTGGGTGTTGATGCTCGCGTGGGGAACCTGTTCTCCGCTGACCTGTTCTACTCTCCGGACGGCGAAATGTTCGGCGTGATGGAAAAATACGGCATCCTCGGCGTGGAAATGGAAGCGGCTG‑TATCTACGGCGTCGCTGCAg > 1:123652/1‑183 (MQ=255) ggTGCGTAACGCGGTAGACGCGGCTAAAGCACTGGGTGTTGATGCTCGCGTGGGTAACCTGTTCTCCGCTGACCTGTTCTACTCTCCGGACGGCGAAATGTTCGACGTGATGGAAAAATACGGCATCCTCGGCGTGGAAATGGAAGCGGCTGGTATCTACGGCGTCGCTGCAGAGTTTGGCGCGAAAGCCCTGACCATCTGCACCGTGTCTGACCACATCCGCACTCACGAGCAGACCACTGCCGCTGAg < 1:152808/250‑1 (MQ=255) gTGCGTAACGCGGTAGACGCGGCTAAAGCACTGGGTGTTGATGCTCGCGTGGGTAACCTGTTCTCCGCTGACCTGTTCTACTCTCCGGACGGCGAAATGTTCGACGTGATGGAAAAATACGGCATCCTCGGCGTGGAAATGGAAGCGGCTGGTATCTACGGCGTCCCTGCAGAGTTTGGCGCGAAAGCCCTGACCCTCTGCACCGTGTCTGGACACATCAGCCCTCCCGAGCAAACCACTGcccatgtgcg > 2:353498/1‑243 (MQ=255) aGCACTGGGTGTTGATGCTCGCGTGGGTAGCCTGTTCTCCGCTGACCTGTTCTACTCTCCGGACGGCGCAATGTTCGACGTGATGGAAAAATACGGCATCCTCGGCGTGGAAATGGAAGCGGCTGGTATCTACGGCGTCGCTGCAGAGTTTGGCGCGAAAGCCCTGACCATCTGCACCGTGTCTGACCACATCCGCACTCCCGAGCAGACCACTGCCGCTGAGCGTCAGACAACCTTCCACGACATgctc > 2:31856/1‑247 (MQ=255) gggTGTTGATGCTCGCGTGGGTAACCTGTTCTCCGCTGACCTGTTCGACTCTCCGGACGGCGAAATGTTCGACGTGATGGAAAAATACGGCATCCTCGGCGTGGAAATGGAAGCGGCTGTTATCTACGGCGTCGCTGCAGAGTTTGGCGCGAAAGCCCTGACCATCTGCACCGTGTCTGACCACATCCGCACTCACGAGCAGACCACTGCCGCTGAGCGTCAGACCACCTTCAACGACATGATCAAAAt < 1:236753/249‑1 (MQ=255) | ATCCCGTCCTGCTCCATCTACACCAAAGAACTGATCACCGATTTCGGCGTGAAGAAAATTATCCGCGTGGGTTCCTGTGGCGCAGTTCTGCCGCACGTAAAACTGCGCGACGTCGTTATCGGTATGGGTGCCTGCACCGATTCCAAAGTTAACCGCATCCGTTTTAAAGACCATGACTTTGCCGCTATCGCTGACTTCGACATGGTGCGTAACGCAGTAGATGCAGCTAAAGCACTGGGTATTGATGCTCGCGTGGGTAACCTGTTCTCCGCTGACCTGTTCTACTCTCCGGACGGCGAAATGTTCGACGTGATGGAAAAATACGGCATTCTCGGCGTGGAAATGGAAGCGGCTGGTATCTACGGCGTCGCTGCAGAATTTGGCGCGAAAGCCCTGACCATCTGCACCGTATCTGACCACATCCGCACTCACGAGCAGACCACTGCCGCTGAGCGTCAGACTACCTTCAACGACATGATCAAAAT > NC_000913/4621081‑4621565 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |