| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 4,431,220 | C→T | L453L (CTG→TTG) | cycA → | D‑serine/alanine/glycine/:H(+)symporter |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 4,431,220 | 0 | C | T | 95.3% | 184.5 / ‑0.4 | 65 | L453L (CTG→TTG) | cycA | D‑serine/alanine/glycine/:H(+)symporter |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/3); new base T (27/34); total (27/38) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.57e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 3.63e-01 | |||||||||||
GCGTTCACGATGATTACAACCGTTTCCGCGATTCTGTTTATGTTCGTCTGGACGATTATCCTTTGCTCGTACCTTGTGTATCGCAAACAGCGTCCTCATCTACATGAGAAGTCGATCTACAAGATGCCGCTCGGCAAGCTGATGTGCTGGGTATGTATGGCGTTCTTTGTGTTCGTGGTCGTGTTG‑CTGACACTGGAAGATGACACTCGCCAGGCGCTGCTGGTTACCCCGCTGTGGTTTATCGCGCTGGGGTTGGGCTGGCTGTTTATTGGTAAGAAGCGGGCTGCTGAACTGCGGAAATAACCGCATTATCATGCTGGATGGCGCAATGCCATCCAGCTTTTAGATCACTCACCCGCCAGCGCGCGTGGGAACAGTACATTGTTTTCCAGACTGATGTGATCCATCAGGTCATCAATCAGTTCATTAATGCCGTTATACATCGCTTTCCAGGTGGTGCAGGCTTCTGGCGGCGG > NC_000913/4430974‑4431449 | ggggtCACTATGATTACAACCGTTTCCGCGATTCTGTTTATGTTCGTCTGGACGTTTATCCTTGGCCCGTCCCTTGTGTATCGCAAACAGCGTCCTCATCTACATGAGAAGTCGATCTACAAGATGCCGCTCGGCAAGCTGATGTGCTGGGTATGTATGGCGTTCTTTGTGTTCGTGGTCGTGTTG‑CTGACACTGGAAGATGACTCGCGCCAGGCGCTGCTGGTTACCCCGCTGTGGTTTATCGCGTTggg < 2:35624/247‑1 (MQ=255) ttCACGATGATTACAACCGTTTCCGCGATTCTGTTTATGTTCGTCTGGACGCTTATCCTTTGCTCGTACCTTGTGTATCGCAAACAGCGTCCTCATCTACATGAGAAGTCGATATACAAGATGCCGCTCGGCAAGCTGATGTGCTGGGTATGTATGGCGTTCTTTGTGTTCGTGGTCGTGTTG‑CTGCCACTGGAAGATGACACTCGCCAGGCGCTGCTGGTTACCCCGCTGTGGTTTATCGCGTTGGGGtg > 1:80232/1‑250 (MQ=255) tCACGATGATTACAACCGTTTCCGCGATTCTGTTTATGTTCGTCTGGACGATTATCCTTTGCTCGTACCTTGTGTATCGCAAACAGCGTCCTCATCTACATGAGAAGTCGATCTACAAGATGCCGCTCGGCAAGCTGATGTGCTGGGTATGTATGGCGTTCTTTGTGTTCGTGGTCGTGTTG‑CTGACACTGGAAGATGACACTCGCCAGGCGCTGCTGGCTACCCCGCTGTGGTTTATCGCGTTGGGGTTg > 1:22843/1‑251 (MQ=255) cACGATGATTACCACCGTTTCCGCGATTCTGGTTATGTTCGTCTGGACGATTATCCTTTGCTCGTACCTTGTGTATCGCAAACAGCGTCCTCATCTACATGAGAAGTCGATCTACAAGATGCCGCTCGGCAAGCTGATGTGCTGGGTATGTATGGCGTTCTTTGTGTTCGTGGTCGTGTTG‑CTGACACTGGAAGATGACACTCGCCAGGCGCTGCTGGTTACCCCGCTGTGGTTTATCGCGCTGGGGTTg < 2:215907/250‑1 (MQ=255) aCGATGATTACAACCGTTTCCGCGATTCTGTTTATGTTCGTCTGGACGATTATCCTTTGCTCGTACCTTGTGTATCGCAAACAGCGTCCTCATCTACATGAGAAGTCGATCTACAAGATGCCGCTCGGCAAGCTGATGTGCTGGGTATGTATGGCGTTCTTTGTGTTCGTGGTCGTGTTG‑CTGACACTGGAAGATGACACTCGCCAGGCGCTGCTGGTTACCCCGCTGTGGTTTATCGCgttggggttggg > 1:189238/1‑251 (MQ=255) tgatTACAACCGTTTCCGCGATTCTGTTTATGTTCGTCTGGACGATTATCCTTTGCTCGTACCTTGTGTATCGCAAACAGCGTCCTCATCTACATGAGAAGTCGATCTACAAGATGCCGCTCGGCAAGCTGATGTGCTGGGTATGTATGGCGTTCTTTGTGTTCGTGGTCGTGTTG‑CTGACACTGGAAGATGACACTCGCCAGGCGCTGCTGGTTACCCCGCTGTGGTTTATCGCGTTGGGGTTGggctgg > 1:224627/1‑251 (MQ=255) gatTACAACCGTTTCCGCGATTCTGTTTATGTTCGTCTGGACGATTATCCTTTGCTCGTACCTTGTGTATCGCAAACAGCGTCCTCATCTACATGAGAAGTCGATCTACAAGATGCCGCTCGGCAAGCTGATGTGCTGGGTATGTATGGCGTTCTTTGTGTTCGTGGTCGTGTTG‑CTGACACTGGAAGATGACACTCGCCAGGCGCTGCTGGTTACCCCGCTGTGGTTTATCGCGTTGGGGTTGggctgg < 1:76303/250‑1 (MQ=255) ccAACCGTTTCCGCGATTCTGTTTATGTTCGTCTGGACGATTATCCTTTGCTCGTACCTTGTGTATCGCAAACAGCGTCCTCATCTACATGAGAAGTCGATCTACAAGATGCCGCTCGGCAAGCTGATGTGCTGGGTATGTATGGCGTTCTTTGTGTTCGTGGTCGTGTTG‑CTGACACTGGAAGATGACACTCGCCAGGCGCTGCTGGTTACCCCGCTGTGGTTTATCGCGTTGGGGTTGGGCTGGCTGt < 2:188162/249‑1 (MQ=255) aCAACCGTTTCCGCGATTCTGTTTATGTTCGTCTGGACGATTATCCTTTGCTCGTACCTTGTGTATCGCAAACAGCGTCCTCATCTACATGAGAAGTCGATCTACAAGATGCCGCTCGGCAAGCTGATGTGCTGGGTATGTATGGCGTTCTTTGTGTTCGTGGTCGTGTTG‑CTGACACTGGAAGATGACACTCGCCAGGCGCTGCTGGTTACCCCGCTGTGGTTTATCGCGTTGGGGTTGGGCTGGCTGtt > 1:197105/1‑251 (MQ=255) cAACCGTTTCCGCGATTCTGTCTATGTTCGTCTGGACGATTATCCTTTGCTCGTCCCTTGTGTATCGCAAACAGCGTCCTCATCTACATGAGAAGTCGATCTACAAGATGCCGCTCGGCAAGCTGATGTGCTGGGTATGTATGGCGTTCTTTGTGTTCGTGGTCGTGTTG‑CTGACACTGGAAGATGACACTCGCCAGGCGCTGCTGGTTACCCCGCTGTGGTTTATCGCGTTGGGGTTGGGCTGGCTGttt < 1:385669/251‑1 (MQ=255) aCCGTTTCCGCGCCTCTGTTTCTGTTCGTCTGGACGATTATCCTTTGCTCGTACCTTGTGTATCGCAAACAGCGTCCTCATCTACATGCGAAGTCGATCTACAAGCTGCCGCTCGGCAAGCCGGTGTGCTGGGTATGTATGGCGTTCTTTGTGTTCGTGGTCGTGTTG‑CTGACCGTGGAAGATGACACTCGCCAGGCGCTGCTGGTTACCCCGCTGTGGGTTATCGCGTTGGGGCTGGACGGGCTGTTTAt > 2:470970/1‑251 (MQ=255) cgATTCTGTTTATGTTCGTCTGGACGATTATCCTTTGCTCGTACCTTGTGTATCGCAAACAGCGTCCTCATCTACATGAGAAGTCGATCTACAAGATGCCGCTCGGCAAGCTGATGTGCTGGGTATGTATGGCGTTCTTTGTGTTCGTGGTCGTGTTG‑CTGACACTGGAAGATGACACTCGCCAGGCGCTGCTGGTTACCCCGCTGTGGTTTATCGCGTTGGGGTTGGGCGGGCTGTTTATTGGTaagaag < 2:296211/251‑1 (MQ=255) aTTCTGTTTATGTTCGTCTGGACGATTATCCTTTGCTCGTACCTTGTGTATCGCAAACAGCGTCCTCATCTACATGAGAAGTCGATCTACAAGATGCCGCTCGGCAAGCTGATGTGCTGGGTATGTATGGCGTTCTTTGTGTTCGTGGTCGTGTTG‑CTGACACTGGAAGATGACACTCGCCAGGCGCTGCTGGTTACCCCGCTGTGGTTTATCGCGTTGGGGTTGGGCTGGCTGTTTATTGGTAAGAAGCg < 1:100466/251‑1 (MQ=255) gTTTATGTTCGTCTGGACGATTATCCTTTGCTCGTTCCTTGTGTATCGCAAAGAGCGTCCTCATCTACATGAGAAGTCGATCTACAAGATGCCGCTCGGCAAGCTGATGTTCTGGGTATGTATGGCGTGCTTTGTGTGCGTGGTCGTGTTG‑CTGACACTTGAAGATGACACTCGCCAGGCGCTGCTGGTTGCCCCGCTGTGGTTTATCGCGTTGGGGTTGGGCTGGCTGTTTATTGGTAAGAAGCGGgct < 1:328828/250‑1 (MQ=255) tATGTTCGTCTGGACGATTATCCTTTGCTCGTACCTTGTGTATCGCAAACAGCGTCCTCATCTACATGAGAAGTCGATCTACAAGATGCCGCTCGGCAAGCTGATGTGCTGGGTATGTATGGCGTTCTTTGTGTTCGTGGTCGTGTTG‑CTGACACTGGAAGATGACACTCGCCAGGCGCTGCTGGTTACCCCGCTGTGGTTTATCGCGTTGGGGTTGGGCTGGCTGTTTATTGGTAAGAAGCGGgctgct < 2:413965/250‑1 (MQ=255) tATGTTCGTCTGGACGATTATCCTTTGCTCGTACCTTGTGTATCGCAAACAGCGTCCTCATCTACATGAGAAGTCGATCTACAAGATGCCGATCGGCAAGCTCATGTGCTGGGTATGTATGGCGTTCTTTGTGTTCGTGGTCGTGTTG‑CTGACACTGGAAGATGACACTCGCCAGGCGCTGCTGGTTACCCCGCTGTGGTTTATCGCGTTGGGGTTGGGCTGGCTGTTTATTGGTAAGAAGAGGgctgctt > 2:398766/1‑250 (MQ=255) gTTCGTCTGGACGATTATCCTTTGCTCGTACCTTGTGTATCGCAAACAGCGTCCTCATCTACATGAGAAGTCGATCTACAAGATGCCGCTCGGCAAGCTGATGTGCTGGGTATGTATGGCGTTCTTTGTGTTCGTGGTCGTGTTG‑CTGACACTGGAAGATGACACTCGCCAGGCGCTGCTGGTTACCCCGCTGTGGTTTATCGCGTTGGGGTTGGGCTGGCTGTTTATTGGTAAGAAGCGGGCTGCTGAAc > 1:66780/1‑251 (MQ=255) cGTCTGGACGATTATCCTTTGCTCGTACCTTGTGTATCGCAAACAGCGTCCTCATCTACATGAGAAGTCGATCTACAAGATGCCGCTCGGCAAGCTGATGTGCTGGGTATGTATGGCGTTCTTTGTGTTCGTGGTCGTGTTG‑CTGACACTGGAAGATGACACTCGCCAGGCGCTGCTGGTTACCCCGCTGTGGTTTATCGCGTTGGGGTTGGGCTGGCTGTTTATTGGTAAGAAGCGGGCTGCTGAACTg < 1:233883/250‑1 (MQ=255) cGTCTGGACGATTATCCTTTGCTCGTACCTTGTGTATCGCAAACAGCGTCCTCATCTACATGAGAAGTCGAGCTACAAGATGCCGCTCGGCAAGCTGATGTGCTGGGTATGTATGGCGTTCTTTGTGTTCGTGGTCGTGTTG‑CTGACACTGGAAGATGACACTCGCCAGGCGCTGCTGGTTACCCCGCTGTGGTTTATCGCGTTGGGGTTGGGCTGGCTGTTTATTGGTAAGAAGCGGGCTGCTGAACTg < 2:239550/250‑1 (MQ=255) ggACGATTATCCTTTGCTCGTACCTTGTGTATCGCAAACAGCGTCCTCATCTACATGAGCAGTCGATCTACAAGATGCCGCTCGGCAAGCTGATGTGCTGGGTATGTATGGCGTTCTTTGTGTTCGTGGTCGTGTTG‑CTGCCACTGGAAGATGACACTCGCCAGGCGCTGCTGGTTACCCCGCTGTGGTTTATCGCGTTGGGGTTGGGCTGGCTGTTTATTGGTAAGAAGCGGGCTGCTGCACTGCGGaa > 2:86911/1‑250 (MQ=255) gACGATTATCCTTTGCTCGTACCTTGTGTATCGCAAACAGCGTCCTCATCTACATGCGAAGTCGATCTACAAGATGCCGCTCGGCAAGCTGCTGTGCTGGGTATGTATGGCGTTCTTTGTGTTCGTGGTCGTGTTG‑CTGACACTGGAAGATGACACTCGCCAGGCGCTGCTGGTTACCCCGCTGTGGTTTATCGCGTTGGGGTTGGGCTGGCTGTTTATTGGTAAGAAGAGGGCTGCTGAACTGCGGAAAt > 1:414013/1‑251 (MQ=255) gATTATCCTTTGCTCGTACCTTGTGTATCGCAAACAGCGTCCTCATCTACATGAGAAGTCGATCTACAAGATGCCGCTCGGCAAGCTGATGTGCTGGGTATGTATGGCGTTCTTTGTGTTCGTGGTCGTGTTG‑CTGACACTGGAAGATGACACTCGCCAGGCGCTGCTGGTTACCCCGCTGTGGTTTATCGCGTTGGGGTTGGGCTGGCTGTTTATTGGTAAGAAGCGGGCTGCTGAACTGCGGAAATAAc > 1:295344/1‑251 (MQ=255) aTTATCCTTTGCGCGTACCTTGTGTATCGCAAACAGCGTCCTCAGCTACATGAGAAGTCGATCTACAAGATGCCGCTCGGCAAGCTGATGTGCTGGGTATGTATGGCGTTCTTTGTGTTCGTGGTCGTGTTG‑CTGACACGGGAAGATGACACTCGCCAGGCGCTGCTGGTTACCCCGCTGTGGTTTATCGCGTTGGGGTTGGGCTGGCTGTGTATTGGTAAGAAGCGGGCTGCTGAACTGCGGAAATAAcc < 1:171858/251‑1 (MQ=255) tGCTCGTACCTTGTGTATCGCAAACAGCGTCCTCAGCTACATGAGAAGTCGATCTACAAGATGCCGTTCGGCAAGCTGAGGTGCTGGGTATGTATGGCGTTCTTTGTGTTCGTTGTCGTGTTG‑CTGACACTGGAAGATGACACTCGCCAGGCGCTGCTGGTTACCCCGCTGTGGTTTATCGCGTTGGGGTTGGGCTGGCTGTTTATTGGTAAGAAGCGGGCTGCTGAACTGCGGAAATAACCGCATTATc < 2:486213/250‑1 (MQ=255) gCTCGTACCTTGTGTATCGCAAACAGCGTCCTCATCTACATGAGAAGTCGATCTACAAGATGCCGCTCGGCAAGCTGATGTGCTGGGTATGTATGGCGTTCTTTGTGTTCGTGGTCGTGTTG‑CTGACACTGGAAGATGACACTCGCCAGGCGCTGCTGGTTACCCCGCTGTGGTTTATCGCGTTGGGGTTGGGCTGGCTGTTTATTGGTAAGAAGCGGGCTGCTGAACTGCGGAAATAACCGCATTATCAt < 2:224627/251‑1 (MQ=255) gCTCGTACCTTGTGTATCGCAAACAGCGTCCTCATCTACATGAGAAGTCGATCTACAAGATGCCGCTCGGCAAGCTGATGTGCTGGGTATGTATGGCGTTCTTTGTGTTCGTGGTCGTGTTG‑CTGACACTGGAAGATGACACTCGCCAGGCGCTGCTGGTTACCCCGCTGTGGTTTATCGCGCTGGGGTTGGGCTGGCTGTTTATTGGTAAGAAGCGGGCTGCTGAACTGCGGAAATAACCGCATTATCaa < 1:236325/251‑2 (MQ=255) cGTACCTTGTGTATCGCAAACAGCGTCCTCATCTACATGAGAAGTCGATCTACAAGATGCCGCTCGGCAAGCTGATGTGCTGGGTATGTATGGCGTTCTTTGTGTTCGTGGTCGTGTTG‑CTGACACTGGAAGATGACACTCGCCAGGCGCTGCTGGTTACCCCGCTGTGGTTTATCGCGCTGGGGTTGGGCTGGCTGTTTATTGGTAAGAAGCGGGCTGCTGAACTGCGGAAATAACCGCATTATCATGCt < 1:470392/251‑1 (MQ=255) cTTGTGTATCGCAAACAGCGTCCTCATCTACATGAGAAGTCGATCTACAAGATGCCGCTCGGCAAGCTGATGTGCTGGGTATGAATGGCGTTCTTTGTGTTCGTGGTCGTGTTG‑CTGACACTGGAAGATGACAATCGCCAGGCGCTGCTGGTTACCCCGCTGTGGTTTATCGCGTTGGGGTTGGGCTGGCTGTTTGTTGGTAAGAAGCGGGCTGCTGCACTGCGGGAATAACCGCATTAt > 2:486671/1‑240 (MQ=255) cTTGTGTATAGCAACCAGCGTCCTCATCTACATGCGAAGTCGATCTACAAGATGCCGCTCGGCAAGCTGATGTGCTGGGTATGTATGGCGTTCTTTGTGTTCGTGGTCGTGTTG‑CTGACACTGGAAGATGACACTCGCCAGGCGCTGCTGGTTACCCCGCTGTGGTTTATCGCGTTGGGGTTGGGCTGGCTGTCTATTGGTAAGAAGCGGGCTGCTGAACTGCGGAAATAACCGCATTAt < 1:486671/240‑1 (MQ=255) gtATCGCAAACAGCGTCCTCATCTACATGAGAAGTCGATCTACAAGATGCCGCTCGGCAAGCTGATGTGCTGGGTATGTATGGCGTTCTTTGTGTTCGTGGTCGTGTTG‑CTGACACTGGAAGATGACACTCGCCAGGCGCTGCTGGTTACCCCGCTGTGGTTTATCGCGTTGGGGTTGGGCTGGCTGTTTATTGGTAAGAAGCGGGCTGCTGAACTGCGGAAATAACCGCATTATCATGCTGGATGGCGCa < 1:51012/251‑1 (MQ=255) cGCAAACAGCGTCCTCATCTACATGAGAAGTCGATCTACAAGATGCCGCTCGGCAAGCTGATGTGCTGGGTATGTATGGCGTTCTTTGTGTTCGTGGTCGTGTTG‑CTGACACTGGAAGATGACACTCGCCAGGCGCTGCTGGTTACCCCGCTGTGGTTTATCGCGTTGGGGTTGGGCTGGCTGTTTATTGGTAAGAAGCGGGCTGCTGAACTGCGGAAATAACCGCATTATCATGCTGGATGGCGCAATGc > 1:245745/1‑251 (MQ=255) cAAACAGCGTCCGCATCTACATGAGAAGTCGATCTACAAGATGCCGCTCGGCAAGCTGATGTGCTGGGTATGTATGGCGTTCTTTGTGTTCGTGGTCGTGTTG‑CTGACACTGGAAGATGACACTCGCCAGGCGCTGCTGGTTACCCCGCTGTGGTTTATCGCGTTGGGGTTGGGCTGGCTGTTTATTGGTAAGAAGCGGGCTGCTGAACTGCGGAAATAACCGCATTATCATGCTGGATGGCGCAATGCCa < 2:197105/251‑1 (MQ=255) aaaCAGCGTCCTCATCTACATGAGAAGTCGATCTACAAGATGCCGCTCGGCAAGCTGATGTGCTGGGTATGTATGGCGTTCTTTGTGTTCGTGGTCGTGTTG‑CTGACACTGGAAGATGACACTCGCCAGGCGCTGCTGGTTACCCCGCTGTGGTTTATCGCGTTGGGGTTGGGCTGGCTGTTTATTGGTAAGAAGCGGGCTGCTGAACTGCGGAAATAACCGCATTATCATGCTGGATGGCGCAATGCCAt > 1:436383/1‑251 (MQ=255) aCAGCGTCCTCATCTACATGAGAAGTCGATCTACAAGATGCCGCTCGGCACGCTGATGTGCTGGGAATGTATGGCGTTCTTTGTGTTCGTGGTCGTGTTG‑CTGACACTGGAAGATGACACTCGCCAGGCGCTGCTGGTTACCCCGCTGTGGTTTATCGCGTTGGGGTTGGGCTGGCTGTTTATTGGTAAGAATCGGTCGGCTGAACTGCGTATATAACCGCGTTATCATGCTGGATAGCGCAATGCCaacc > 2:110639/1‑248 (MQ=255) aCAGAGTCCTCATCTCCATGGGACGTCGATCTTCAAGATGCAGCTCGTCAAGCTGATGTGCTGGGTATGTATGGCGTTCTTTGTGTTCGTGGTCGTGTTG‑CTGACACCGGAAGATGACACTCGCCAGGCGCTGCTGGTTACCCCGCTGTGGGTTAGCGCGTTGGGGTTGGGCTGGCTGTTTATTGGTAAGAAGCGGGCTGCTGAACTGCGGAAATAACCGCCTTATCATGCTGTAGGGCGCAATGCCATcc < 2:76058/251‑1 (MQ=255) cATCTACATGAGAAGTCGATCTACAAGATGCCGCTCGGCAAGCTGATGTGCTGGGTATGTATGGCGTTCTTTGTGTTCGTGGTCGTGTTG‑CTGACACTGGAAGATGACACTCGCCAGGCGCTGCTGGTTACCCCGCTGTGGTTTATCGCGTTGGGGTTGGGCTGGCTGTTTATTGGTAAGAAGCGGGCTGCTGAACTGCGGAAATAACCGCATTATCATGCTGGATGGCGCAATGCCATCCAGCTTTTa < 1:497780/249‑1 (MQ=255) aCATTAGAAGTCGATCTTCAAGTTGCCGCTCGTCAAGCTGATGTGTTAGGTATGTATGGCGTACTTTGTGTGCGTGGTCGTGTTG‑CTGACACTTGAAGATGACACTCGCCAGGCGCTGCTGGTTACCCCGCTGTGGTTTATCACGTTGGGGTTGGGCTGGCTTTTTATTGGTAAGAGGCGGGCTGCTTAACTGCGGAAATAACCGCATTATCATGCTGGATGGCGCAATGCCATCCAGCTTTTAGAtcac < 1:375939/250‑1 (MQ=255) aCATGAGAAGTCGATCTACAAGATGCCGCTCGGCAAGCTGATGTGCTGGGTATGTATGGCGTTCTTTGTGTTCGTGGTCGTGTTG‑CTGACGCTGGAAGATGACACTCGCCAGGCGCTGCTGGTGACCCCGCTGTGGTTTATCGCGTTGGGGTTGGGCTGGCTGTTTATTGGTAAGAAGCGGGCTGCTGAACTGCGGAAATAACCGCATTATCATGCTGGATGGCGCAATGCCATCCGGCTGTTAGAtc < 2:28999/248‑1 (MQ=255) aTGAGAAGTCGATCTACAAGATGCCGCTCGGCAAGCTGATGTGCTGGGTATGTATGGCGTTCTTTGTGTTCGTGGTCGTGTTG‑CTGACACTGGAAGATGACACTCGCCAGGCGCTGCTGGTTACCCCGCTGTGGTTTATCGCGTTGGGGTTGGGCTGGCTGTTTATTGGTAAGAAGCGGGCTGCTGAACTGCGGAAATAACCGCATTATCATGCTGGATGGCGCAATGCCCTCCAGCTTTTAGAtcactc > 1:379429/1‑250 (MQ=255) agaAGTCGATCTACAAGATGCCGCTCGGCAAGCTGATGTGCTGGGTATGTATGGCTTTCTTTGTGTTCGTGGTCGTGTTG‑CTGACACTGGAAGATGACACTCGCCAGGCGCTGCTGGTTACCCCGCTGTGGTTTATCGCGTTGGGGTTGGGCTGGCTGTTTATTGGTAAGAAGCGGGCTGCTGAACTGCGGAAATAACCGCATTATCATGCTGGATGGCGCAATGCCATCCAGCTTTTAGATCACTCAccc < 1:302488/251‑1 (MQ=255) gaAGTCGATCTACAAGATGGCGCTCGGCAAGCTGATGTGCTGGGTATGTATGGCGTTCTTTGTGTTCGTGGTCGTGTTG‑CTGACACTGGAAGATGACACTCGCCAGGCGCTGCTGGTTACCCCGCTGTGGTTTATCGCGTTGGGGTTGGGCTGGCTGTTTATTGGTAAGAAGCGGGCTGCTGAACTGCGGAAATAACCGCATTATCATGCTGGATGGCGCAATGCCATCCAGCTTTTAGATCACTCACCCg < 2:309973/251‑1 (MQ=255) gTCGATCTACAAGATGCCGCTCGGCAAGCTGGTGTGCTGGGTATGTATGGCGTTCTTTGTGTTCGTGGTCGTGTTG‑CTGACACTGGAAGATGACACTCGCCAGGCGCTGCTGGTTACCCCGCTGTGGTTTATCGCGTTGGGGTTGggctggct > 2:466617/1‑153 (MQ=255) gTCGATCTACAAGATGCCGCTCGGCAAGCTGATGTGCTGGGTATGTATGGCGTTCTTTGTGTTCGTGTTCGTGTTG‑CTGACACTGGAAGATGACACTCGCCAGGCGCTGCTGGTTACCCCGCTGTGGTTTATCGCGTTGGGGTTGggctggct < 1:466617/153‑1 (MQ=255) tACAAGATGCCGCTCGGCAAGCTGATGTGCTGGGTATGTATGGCGTTCTTTGTGTTCGTGGTCGTGTTG‑CTGACACTGGAAGATGACAATCGCCAGGCGCTGCTGGTTACCCCGCTGTGGTTTATCGCGTTGGGGTTGGGCTGGCTGTTTATTGGTAAGAAGCGGGCTGCTGAACTGCGGAAATAACCGCATTATCATGCTGGATGGCGCAATGCCATCCAGCTTTTAGATCACTCACCCGCCAGcgcgcg > 2:419019/1‑251 (MQ=255) aCAAGATGCCGCGCGGCAAGCGTATGTGCTGGGTATGTATGGCGTTCTTTGTGTTCGTGGTCGTGTTG‑CTGACACTGGAAGATGACACTCGCCAGGCGCTGCTGGTTACCCCGCTGTGGTTTATCGCGTTGGGGTTGGGCTGGCTTTTTATTGGTAAGAAGCGGGCTGCTGAACTGCGGAAATAACCGCATTATCATGCTGGATGGCGCAAGGCCATCCAGCTTTTAGATCACTCCCCCGCCAGCGCGCGt < 1:233777/251‑1 (MQ=255) aaGATGCCGCTCGGCAAGCTGATGTGCTGGGTATGTATGGCGTTCTTTGTGTTCGTGGTCGTGTTG‑CTGACACTGGAAGATGACACTCGCCAGGCGCTGCTGGTTACCCCGCTGTGGTTTATCGCGTTGGGGTTGGGCTGGCTGTTTATTGGTAAGAAGCGGGCTGCTGAACTGCGGAAATAACCGCATTATCATGCTGGATGGCGCAATGCCATCCCGCTTTTAGATCCCTCACCCGCCAGCGCGCGTgg > 2:65097/1‑251 (MQ=255) ccGCTCGGCAGGCGGATGTGCTGGGTATGTAGGGTGTTCTTTGTGTTCGTTGGCG‑GTGGGCTGACCCGGGAAGATGCCCCGCGCCAGGCGCTGCTGGTTCCCCCGCGGTGGTTTATCGCGTTGGGGTTGGGCTGGCTGTTTATTGGTAAGAAGCGGGCTGCTGAACTGCGGAAATAACCGCATTATCATGCTGGAGGGCGCAATGCCATCCAGCTTTTAGATCCCTCCCCCGCCAGCGCGCGTGGGAACAg < 2:414013/251‑1 (MQ=255) cGGCAAGCTGATGTGCTGGGTATGTATGGCGTTCTTTGTGTTCGTGGGCGTGTTG‑CTGACACTGGAAGATGACACTCGCCAGGCGCTGCTGGTTACCCCGCTGTGGTTTATCGCGTTGGGGTTGGGCTGGCTGTTTATTGGTAAGAAGCGGGCTGCTGAACTGCGGAAATAACCGCATTATCATGCTGGATGGCGCAATGCCATCCAGCTTTTAGATCACTCACCCGCCAGCGCGCGTGGGAACAGTACa < 1:368310/250‑1 (MQ=255) gatggggtGGGTATGTATGGCTTTCTTTGTGTTGGTGGTCGTGTTG‑CTGACATTGGAAGATGCCACTCGCCAGGCGCTGCTGTTTACCCCGCTGTGGGTTATCGCGTTGGGGTTGGGCTGGCTGTTTATTGGTAAGAAGCGGGCTGCTGAACTGCGGAAATAACCGCATTATCATGCTGGATGGCGCAATGCCATCCAGTTTTTAGATCACACCCCCGCCAGCGCGCGTGGGAACAGTACATTGTTTTCCa < 2:83078/244‑1 (MQ=255) gtgCTGGGTATGTATGGCGTTCTTTGTGTTCGTGGTCGTGTTG‑CTGACACTGGAAGATGACACTCGCCAGGCGCTGCTGGTTACCCCGCTGTGGTTTATCGCGTTGGGGTTGGGCTGGCTGTTTATTGGTAAGAAGCGGGCTGCTGAACTGCGGAAATAACCGCATTATCATGCTGGATGGCGCAATGCCATCCAGCTTTTAGATCACTCACCCGCCAGCGCGCGTGGGGACAGTACATTGTTCTCCAGAc > 2:501096/1‑251 (MQ=255) atgtatgGCGTTCTTTGTGTTCGTGGTCGTGTTG‑CTGACACTGGAAGATGACACTCGCCAGGCGCTGCTGGTTACCCCGCTGTGGTTTATCGCGTTGGGGTTGGGCTGGCTGTTTATTGGTAAGAAGCGGGCTGCTGAACTGCGGAAATAACCGCATTATCATGCTGGATGGCGCAATGCCATCCAGCTTTTAGATCACTCACCCGCCAGCGCGCGTGGGCACAGTACATTGTTTTCCAGACTGATGTGAt > 2:437686/1‑251 (MQ=255) gtatgGCGTTCTTTGTGTTCGTGGTCGTGTTG‑CTGACACTGGAAGGTGACACTCGCCAGGCGCTGCTGGTTACCCCGCTTTGGTTTATCGCGTTGGGGTTGGGCTGGCTGTTTATTGGTAAGAAGCGGGCTGCTGGACTGCGGAAATAACCGCATTATCATGCTGGCTGGCGCAATGCCATCCAGCTTTTAGATCACTCACCCACCAGCGCGCGTGGGCACAGTACATGGTTTTCCAGCCTgctttgatac > 2:270799/1‑242 (MQ=255) tttttgttgtTCGTGGTCGTGTGT‑CTGACACTGGAAGATGACACTCTCCGGGCGGTGTTGGTTACCCCGCTGTGGTTTAGCGCGTTGGGGTTGGGCTGGCTGTTTATTGGTAAGAGGCGGGCTGCTGAACTGCGGAAATAACCGCATTATCATGCGGGTTGGCGCAATGCCATCCAGTTTTTAGATCACTCACCCGCCAGCGCGCGTGGGAACAGTACATTGTTTTCCAGACTGATGTGATCCATCAGGt < 2:45250/243‑1 (MQ=255) tCTTTGTGTTCGTGGTCGTGTTG‑CTGACACTGGAAGATGACACTCGCCAGGCGCTGCTGGTTACCCCGCTGTGGTTTATCGCGTTGGGGTTGGGCTGGCTGATTATTGGTAAGAAGCGGGCTGCTGAACTGCGGAAATAACCGCATTATCATGCTGGATGGCGCAATGCCATCCAGCTTTTAGATCACTCACCCGCCAGCGCGCGTGGGAACAGTACATTGTTTTCCAGACTGATGTGATCCATCAGGtc > 1:348500/1‑250 (MQ=255) tttgtgtgtgggggcgttttG‑CTGACAGTGGAAGATGACACTCGCCGGGCGCGGCTGTTTACCCCGCTGTGGTTTATCGCGTTGGGGTTGGGCTGGCTGTTTATTGGTAAGAAGCGGGCTGCTGACCTGCGGAAATAACCGCATTATCATGCTGGATGGCGCAATGCCATCCAGCTTTTAGATCACTCACCCGCCAGCGCGCGTGGGAACAGTACATTGTTTTCCAGACTGATGTGATCCATCAGGtcat < 2:436383/232‑1 (MQ=255) tttGTGTTCGTGGTCGTGTTG‑CTGACACTGGAAGATGACACTCGCCAGGCGCTGCTGGTTACCCCGCTGTGGTTTATCGCGTTGGGGTTGGGCTGGCTGTTTATTGGTAAGAAGCGGGCTGCTGAACTGCGGAAATAACCGCATTATCATGCTGGATGGCGCAATGCCATCCAGCTTTTAGATCACTCACCCGCCAGCGCGCGTGGGAACAGTACATTGTTTTCCAGACTGATGTGATCCATCAGGtcatc > 1:217679/1‑251 (MQ=255) tttGTGTTCGTGGTCGTGGGG‑CTGACACTGGAAGATGACACTCGCCAGGCGCTGCTGGTTACCCCGCTGGGGTTTATCGCGTTGGGTTTGGGCGGGCTGTTTATGGGTAAGAAGGGGGCTGCTGAACTGCGGAAATAACCGCATTTTCATGTTGGATGGCGCAATGCCATCCGGCTTTGAGATCACTCACCCGCCAGCGCGCGTGGGAACAGTACATTGTTTTCCAGACTGATGTGATCCATCAGGtcat < 1:251306/250‑1 (MQ=255) tgtcgtgggggtgtTG‑CTGACACTGGAAGATGACACTCGCCAGGCGCTGCTGGTTACCCCGCTGTGGTTTATCGCGGTGGGGTTGGGCTGGCTGTTTATTGGTAAGAAGCGGGCTGCTGAACTGCGGAAATAACCGCATTATCATGCTGGATGGCGCAATGCCATCCAGCTTTTAGATCACTCACCCGCCAGCGCGCGTGGGAACAGTACATTGTTTTCCAGACTGATGTGATCCATCAGGTCatcaatc < 2:189238/240‑1 (MQ=255) tgtTG‑CTGACACTGGAAGATGACACTCGCCAGGCGCTGCTGGTTACCCCGCTGTGGTTTATCGCGTTGGGGTTGGGCTGGCTGTTTATTGGTAAGAAGCGGGCTGCTGAACTGCGGAAATAACCGCATTATCATGCTGGATGGCGCAATGCCATCCAGCTTTTAGATCACTCACCCGCCAGCGCGCGTGGGAACAGTACATTGTTTTCCAGACTGATGTGATCCATCAGGTCATCAATCAGTTCATTAATg > 1:372905/1‑251 (MQ=255) g‑CTGACACTGGAAGATGACACTCGCCAGGCGCTGCTGGTTACCCCGCTGTGGTTTATCGCGTTGGGGTTGGGCTGGCTGTTTATTGGTAAGAAGCGGGCTGCTGAACTGCGGAAATAACCGCATTATCATGCTGGATGGCGCAATGCCATCCGGCTTTTAGATCACTCACCCGCCAGCGCGCGTGGGAACAGTACATTGTTTTCCAGACTGATGTGATCCATCAGGTCATCAATCAGTTCATTAATGCCGt < 1:462512/251‑1 (MQ=255) aTGACACTCGCCAGGCGCTGCTGGTTCCCCCGCTGTGGTTTATCGCGTTGGGGTTGGGCTGGCTGTTTATTGGTAAGAAGCGGGCTGCTGAACTGCGGAAATAACCGCATTATCATGCTGGATGGCGCAATGCCATCCAGCTTTTAGATCACTCACCCGCCAGCGCGCGTGGGAACAGTACATTGTTTTCCAGACTGATGTGATCCATCAGGTCATCAATCAGTTCATTAATGCCGTTATACATCGCTTTc < 1:86911/251‑1 (MQ=255) cTCGCCAGGCGCTGCTGGTTACCCCGCTGTGGTTTATCGCGTTGGGGTTGGGCTGGCTGTTTATTGGTAAGAAGCGGGCTGCTGAACTGCGGAAATAACCGCATTATCATGCTGGATGGCGCAATGCCATCCAGCTTTTAGATCACTCACCCGCCAGCGCGCGTGGGAACAGTACATTGTTTTCCAGACTGATGTGATCCATCAGGTCATCAATCAGTTCATTAATGCCGTTATACATCGCTTTCCAggtg > 1:277337/1‑251 (MQ=255) ccGCCAGGCCCGGCTGGTTACCCCGCTGTGGTTTAGCGCGTTGGGGTTGGGCTGGCTGTTTATTGGTAAGAAGCGGGCTGCGGAACTGCGGAAATAACCGCATTATCATGCTGGATGGCGCAATGCCATCCAGTTTTTAGATCACTCACCCGCCAGCGCGCGTGGGAACAGTACATTGTTTTCCAGACTGATGTGATCCATCAGGTCATCAATCAGTTCATTAATGCCGTTATACATCGCTTTCCAggt < 2:134822/248‑1 (MQ=255) gCCAGGCGCTGCTGGTTACCCCGCTGTGGTTTATCGCGTTGGGGTTGGGCTGGCTGTTTATTGGTAAGAAGCGGGCTGCTGAACTGCGGAAATAACCGCATTATCATGCTGGATGGCGCAATGCCATCCAGCTTTTAGATCACTCACCCGCCAGCGCGCGTGGGGACAGTACATTGTTTTCCAGCCTGATGTGATCCATCAGGTAATCAATAAGTTCATTAATGCCGTTATACATCGCTTTCCAGggggtg > 2:440494/1‑251 (MQ=255) ccAGGCGCTGCTGGTTACCCCGCTGTGGTTTATCGCGTTGGGGTTGGGCTGGCTGTTTATTGGTAAGAAGCGGGCTGCTGAACTGCGGAAATAACCGCATTATCATGCTGGATGGCGCAATGCCATCCAGCTTTTAGATCACTCACCCGCCAGCGCGCGTGGGAACAGTACATTGTTTTCCAGACTGATGTGATCCATCAGGGCATCAATCAGTTCATTAATGCCGTTATACATCGCTTTCCAGGTGGTGc > 2:391145/1‑251 (MQ=255) cccccGCTGTGGTTTAGCGCGTTGGGGTTGGGCTGGCTGTTTATTGGTAAGAAGCGGGCTGCTGAACTGCGGAAATAACCGCATTATCATGCTGGATGGCGCAATGCCATCCAGCTTTTAGATCACTCACCCGCCAGCGCGCGTGGGAACAGTACATTGTTTTCCAGACTGATGTGATCCATCAGGTCATCAATCAGTTCATTAATGCCGTTATACATCGCTTTCCAGGTGGTGCAGGCTTCTGGcggcgg < 1:255845/250‑1 (MQ=255) | GCGTTCACGATGATTACAACCGTTTCCGCGATTCTGTTTATGTTCGTCTGGACGATTATCCTTTGCTCGTACCTTGTGTATCGCAAACAGCGTCCTCATCTACATGAGAAGTCGATCTACAAGATGCCGCTCGGCAAGCTGATGTGCTGGGTATGTATGGCGTTCTTTGTGTTCGTGGTCGTGTTG‑CTGACACTGGAAGATGACACTCGCCAGGCGCTGCTGGTTACCCCGCTGTGGTTTATCGCGCTGGGGTTGGGCTGGCTGTTTATTGGTAAGAAGCGGGCTGCTGAACTGCGGAAATAACCGCATTATCATGCTGGATGGCGCAATGCCATCCAGCTTTTAGATCACTCACCCGCCAGCGCGCGTGGGAACAGTACATTGTTTTCCAGACTGATGTGATCCATCAGGTCATCAATCAGTTCATTAATGCCGTTATACATCGCTTTCCAGGTGGTGCAGGCTTCTGGCGGCGG > NC_000913/4430974‑4431449 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |