| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 2,709 | A→G | V791V (GTA→GTG) | thrA → | fused aspartate kinase/homoserine dehydrogenase 1 |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 2,709 | 0 | A | G | 94.5% | 154.6 / ‑3.0 | 56 | V791V (GTA→GTG) | thrA | fused aspartate kinase/homoserine dehydrogenase 1 |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (1/2); new base G (27/25); total (28/28) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.11e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 5.32e-01 | |||||||||||
CGAGGGTGATGTTGCCGCTTTTATGGCGAATCTGTCACAACTCGACGATCTCTTTGCCGCGCGCGTGGCGAAGGCCCGTGATGAAGGAAAAGTTTTGCGCTATGTTGGCAATATTGATGAAGATGGCGTCTGCCGCGTGAAGATTGCCGAAGTGGATGGTAATGATCCGCTGTTCAAAGTG‑AAAAATGGCGAAAACGCCCTGGCCTTCTATAGCCACTATTATCAGCCGCTGCCGTTGGTACTGCGCGGATATGGTGCGGGCAATGACGTTACAGCTGCCGGTGTCTTTGCTGATCTGCTACGTACCCTCTCATGGAAGTTAGGAGTCTGACATGGTTAAAGTTTATGCCCCGGCTTCCAGTGCCAATATGAGCGTCGGGTTTGATGTGCTCGGGGCGGCGGTGACACCTGTTGATGGTGCATTGCTCGGAGATGTAGTCACGGTTGAGGCGGCAGAGACATTCAGTCTCAACAACCTCGGACGCT > NC_000913/2469‑2954 | tgAGGGTGATGTTGCCGCTTTTATGGCGAATCTGTCACAGCTCGACGATCTCTTTGCCGCGCGCGTGGCGAAGGCCCGTGATGAAGGAAAAGTTTTGCGCTATGTTGGCAATCTTGATGAAGATGGTGCCTGCCGCGTGAAGATTGCCGAAGTGGATGGTAATGATCCGCTGTTCAAAGTG‑AACAATGGCGAAAACGCCATGGCCTTTTCTAGCCACTATTATCAGCCGCTGCCGTTGGTGCTgcgggggt > 2:245993/2‑246 (MQ=255) gTTGCCGCTTTTATGGCGAATCTGTCACAGCTCGACGATCTCTTTGCCGCGCGCGTGGCGAAGGCCCGTGATGAAGGAAAAGTTTTGCGCTATGTTGGCAATATTGATGAAGATGGTGCCTGCCGCGTGAAGATTGCCGAAGTGGATGGTAATGATCCGCTGTTCAAAGTG‑AAAAATGGCGAAAACGCCCTGGCCTTTTATAGCCACTATTATCAGCCGCTGCCGTTGGTGCTGCGCGGATATGGTGCggg < 1:59206/251‑1 (MQ=255) ttttATGGCGAATCTGTCACGGCTCGCCGATCTCTTTGCCGCGCGCGTGGCGAAGGCCCGTGATGAAGGAAAAGTTTTGCGCTATGTTGGCAATATTGATGTAGGTGGTGCCTGCCGCGTGAAGATTGCCGACGTGGGTGGTAATGATCCGCTGTTCAAAGGG‑AAAAATGGCGAAAACGCCCTGGCCTTTTATAGCCACTATTATCAGCCGCTGCCGTTGGGGCTGCGCgggtaagatcggaaaggcgtcg > 2:286157/1‑231 (MQ=255) ttttATGGCGAATCTGTCACAGCTCGACGATCTCTTTGCCGCGCGCGTGGCGAAGGCCCGTGATGAAGGAAAAGTTTTGCGCTATGTTGGCAATATTGATGAAGATGGTGCCTGCCGCGTGAAGATTGCCGAAGTGGATGGTAATGATCCGCTGTTCAAAGTG‑AAAAATGGCGATAACGCCCTGGCCTTTTATAGCCACTATTATCAGCCGCTGCCGTTGGTGCTGCGCGGata < 1:286157/234‑1 (MQ=255) ggCGAATCTGTCACAGCTCGACGATCTCTTTGCCGCGCGCGTGGCGAAGGCCCGTGATGAAGGAAAAGTTTTGCGCTATGTTGGCAATATTGATGAAGATGGTGCCTGCCGCGTGAAGATTGCCGAAGTGGATGGTAATGATCCGCTGTTCAAAGTG‑AAAAATGGCGAAAACGCCCTGGCCTTTTATAGCCACTATTATCAGCCGCTGCCGTTGGTGCTGCGCGGATATGGTGCGGGCAATGACGTTAc > 1:110531/1‑249 (MQ=255) agcTCGACGATCTCGTTACCGCGCGCGTGGCGAAGGCCCGTGATGCAGGAAAAGTTTTGCGCTATGTTGGCAATATTGATGAAGATGGTGCCTGCCGCGTGAAGATTGCCGAGGTGGATGGTAATGATCCGCTGTTCAAAGTG‑AAAAATGGCGAAAACGCCCTGGCCTTTTATAGCCACTATTATCAGCCGCTGCCGTTGGTGCTGCGCGGTTATGGTGCGGGCAATgcagttccatctgcggtggtcttt > 2:93634/3‑228 (MQ=255) acgaTCTCTTTGCCGCGCGCGTGGCGAAGGCCCGTGATGAAGGAAAAGTTTTGCGCTATGTTGGCACTATTGATGAAGATGGTGCCTGCCGCGTGAAGATTGCCGAAGTGGATGGTAATGATCCGCTGTTCAAAGTG‑AAAAATGGCGAAAACGCCCTGGCCTTTTATAGCCACTATTATCAGCCGCTGCCGTTGGTGCTGCGCGGTTATGGTGCGGGCAATGACGTTACAGCTGCCGGTGTCTTTGCCGAt > 1:278142/1‑251 (MQ=255) acgaTCTCTTTGCCGCGCGCGTGGCGAAGGCCCGTGATGAAGGAAAAGTTTTGCGCTATGTTGGCAATATTGATGAAGATGGTGCCTGCCGCGTGAAGATTGCCGAAGTGGATGGTAATGATCCGCTGTTCAAAGTG‑AAAAATGGCGAAAACGCCCTGGCCTTTTATAGCCACTATTATCAGCCGCTGCCGTTGGTGCTGCGCGGATATGGTGCGGGCAATGACGTTACAGCTGCCGGTGTCTTTGCCGAt < 2:457083/251‑1 (MQ=255) cgcgcgcgTGGCGAAGGCCCGGGATGAAGGAAAAGTTTTGCGCTATGTGGGCAATATTGATGAAGATGGTGCCTGCCGCGTGAAGATTGCCGAAGTGGATGGTAATGATCCGCTGTTCAAAGTG‑AAAAATGGCGAAAACGCCCTGGCCTTTTATAGCCACTATTATCAGCCGCTGCCGTTGGTGCTGCGCGGATATGGTGCGGGCAATGACGTTACAGCTGCCGGTGTCTTTGCCGATCTGCTACGTAccc < 2:234362/251‑1 (MQ=255) gcgTGGCGAAGGCCCGTGATGAAGGAAAAGTTTTGCGCTATGTTGGCAATATTGATGAAGATGGTGCCTGCCGCGTGAAGATTGCCGAAGTGGATGGTAATGATCCGCTGTTCAAAGTG‑AAAAATGGCGAAAACGCCCTGGCCTTTTATAGCCACTATTATCAGCCGCTGCCGTTGGTGCTGCGCGGATATGGTGCGGGCAATGACGTTACAGCTGCCGGTGTCTTTGCCGATCTGCTACGTACCCTCTCa < 2:110531/251‑1 (MQ=255) gggCGAAGGCCGGTGATGAAGGAAAAGTTTTGCGTTATGTGGGCAATATTGATGAAGATGGGGCCTGCCGCTTGAAGATTGCCGAAGTGGATGGTAATGATCCGCTGTTCAAAGTG‑AAAAAGGGCGAAAACGCCCTGGCCTTTTATAGCCACTATTAACAGCCGCTGCCGTTGGTGCTGCGCGGATATGGTTCGGGCAATGACGTTACAGCTGCCGGTGTCTTTGCCGATCTGCTACGTACCCTCTCATgg < 2:26808/250‑1 (MQ=255) ggCGAAGGCCCGTGAGGAAGGAAAAGTGTTGCGCTATGTTGGCAATATTGATGAAGATGGTGCCTGCCGCGTGAAGATTGCCGAAGTGGATGGTAATGATCCGCTGTTCAAAGTG‑AAAAATGGCGAAAACGCCCTGGCCTTTTATAGCCACTATTATCAGCCGCTGCCGTTGGTGCTGCGCGGATATGGTGCGGGCAATGACGTTACAGCTGCCGGTGTCTTTGCCGATCTGCTACGTACCCTCTCATgg < 1:320511/250‑1 (MQ=255) agggccgggatgaAGGAAAAGTTTTGAGCTATGTTGGCAATCTTGATGAAGATGGTGCCTGCCGCGTGAAGATTGCCGAAGTGGATGGTAATGATCTGCTGTTCACAGTG‑AAAAATGGCGAAAACGCCCTGGACTTTTATAGCCACTATTATCAGCCGCAGCCGTTGGTGCTGCGCGGATATGGTGCGGGCAATGAAGTTACCGCTGCCGGTGTCTTTGCCGAGCTGATACGGACCCTCTCATGGCAGtt > 2:156832/9‑250 (MQ=255) gatgaAGGAAAAGTTTTGCGCTATGTTGGCAATATTGATGAAGATGGTGCCTGCCGCGTGCAGATTGCCGAAGTGGATGGTAATGATCCGCTGTTCAAAGTG‑AAAAATGGCGAAAACGCCCTGGCCTTTTATAGCCACTATTATCAGCCGCTGCCGTTGGTGCTGCGCGGATATGGTGCGGGCAATGACGTTACAGCTGCCGGTGTCTTTGCCGATCTGCTACGTACCCTCTCATGGAAGTTAGGGGTCTg > 2:138113/1‑251 (MQ=255) gaAGGAAAAGTTTTGCGCTATGTTGGCAATATTGATGCAGATGGTGCCTGCCGCGTGAAGATTGCAGAAGTGGATGGTAATGATCCGCTGTTCAAAGTG‑CAAACTGGCGAAAAAGCCCTGGCCTTTTATAGCCACTATTATCAGCCGCTGCCGTTGGTGCTGCGCGGATATGGTGAGGGCAATGACGGTCCAGCTGCCGGTGTCTTTGCCGATCTGCTACGTACCCTCTCATGGAAGTTAGGGATCTGAc > 2:456506/1‑250 (MQ=255) agtgaactttggtcggtATGTTGGAATTATTGTTGAATATGGTGCCGGCCGCGGGAATATGGCTGAAGTGGATGGTAATGATCCGCTGTT‑AAAATGTAAAAAGTACGAAACGGCGCTGTCCTGTTATGGCCACTATTATCAGCAGCTGCCGTTGGTTCTGCTCTTGTATGGTGCGGGCAATGACGTTACAGCTGCCGGTGTCTTTGCCGATATGCTACGTACCCTCTCATGGACGTTAGGAGTCTGACATg < 2:12012/235‑1 (MQ=255) aGTTTTGCGCTATGTTGGCAATATTGATGAAGATGGTGCCTGCCGCGTGAAGATTGCCGAAGTGGATGGTAATGATCCGCTGTTCAAAGTG‑AAAAATGGCGAAAACGCCCTGGCCTTTTATAGCCACTATTATCAGCCGCTGCCGTTGGTGCTGCGCGGCTATGGTGCGGGCAATGACGTTACAGCTGCCGGTGTCTTTGCCGATCTGCTACGTACCCTCTCATGGAAGTTAGGAGTCTGACGTGGTTaa > 2:85710/1‑250 (MQ=255) gTTTTGCGCTATGTTGGCAATATTGATGAATATGGCGTCTGCCGCGTGAAGATTGCCGAAGTGGATGGTAATGATCCGCTGTTCAAAGTG‑AAAAATGGCGAAAACGCCCTGGCCTTCTATAGCCACTATTATCAGCCGCTGCCGTTGGTACTGCGCGGATATGGTGCGGGCAATGAc > 1:26128/1‑177 (MQ=255) gTTTTGCGCTATGTTGGCAATATTGATGAATATGGCGTCTGCCGCGTGAAGATGGCCGAAGTGGATGGTAATGATCCGCTGTTCAAAGTG‑AAAAAGGGCGAAAACGCCCTGGCCGTCTATAGCCACTATTATCAGCCGCTGCCGTTGGTACTGCGCGGATATGGTGCGGGCAATGAc < 2:26128/177‑1 (MQ=255) tGTTGGCAATATTGATGAAGATGGTGCCTGCCGCGTGAAGATTGCCGAAGTGGATGGTAATGATCCGCTGTTCAAAGTG‑AAAAATGGCGAAAACGCCCTGGCCTTTTATAGCCACTATTATCAGCCGCTACCGTTGGTGCTGCGCGGATATGGTGCGGGCAATGACGTTACAGCTGCCGGTGTCTTTGCCGATCTGCTACGTACCCTCTCATGGAAGTTAGGCGTCTGACATGGTTAAAGTTTATGCCCCg > 1:367696/1‑251 (MQ=255) ggCAATATTGATGAAGATGGTGCCTGCCGCGTGAAGATTGCCGAAGTGGATGGTAATGATCCGCTGTTCAAAGTG‑AAAAATGGCGAAAACGCCCTGGCCTTTTATAGCCACTATTATCAGCCGCTGCCGTTGGTGCTGCGCGGATATGGTGCGGGCAATGACGTTACAGCTGCCGGTGTCTTTGCCGATCTGCTACGTACCCTCTCATGGAAGTTAGGAGTCTGACATGGTTAAAGTTTATGCCCCGGCtt < 1:408043/251‑1 (MQ=255) tgaAGATGGTGCCTGCCGCGTGAAGATTGCCGAAGTGGATGGTAATGATCCGCTGTTCAAAGTG‑AAAAATGGCGAAAACGCCCTGGCCTTTTATAGCCACTATTATCAGCCGCTGCCGTTGGTGCTGCGCGGATATGGTGCGGGCAATGACGTTACAGCTGCCGGTGTCTTTGCCGATCTGCTACGTACCCTCTCATGGAAGTTAGGAGTCTGACATGGTTAAAGTTTATGCCCCGGCTTCCAGTGCCAat > 1:486221/1‑251 (MQ=255) gaAGATGGTGCCTGCCGCGTGAAGATTGCCGAAGTGGATGGTAATGATCCGCTGTTCAAAGTG‑AAAAATGGCGAAAACGCCCTGGCCTTTTATAGCCACTATTATCAGCCGCTGCCGTTGGTGCTGCGCGGATATGGTGCGGGCAATGACGTTACAGCTGCCGGTGTCTTTGCCGATCTGCTACGTACCCTCTCATGGGAGTTAGGAGTCTGACATGGTTAAAGTTTATGCCCCGGCTTCCAGTGCCAat > 1:158633/1‑250 (MQ=255) gaGATGGTGCCTGCCGCGTGACGATTGCCGAAGTGGATGGTAATGATCCGCTGTTCAAAGTG‑AAAAATGGCGAAAACGCCCTGGCCTTTTATAGCCACTATTATCAGCCGCTGCCGTTGGTGCTGCGCGGCTATGGTGCGGGCAATGACGTTACAGCTGCCGGGGTCTTTGCCGATCTGCTACGTACCCTCTCATGGACGTTAGGCGTCTGACATGGTTAACGTTTATGCCCCGGCTTCCAGTGCCAata > 2:123219/2‑250 (MQ=255) ggcTGCCGCGTGAAGATGGCCGAATGGGATGGTAAGGATCCGCTGTTCAAAGTG‑AAAAATGGCGAAAACGCCCTGGCCTTTTATAGCCACTATTATCAGCCGCTGCCGTTGGTGCTGCGCGGATATGGTGCGGGCAAGGACGTTACAGCTGCCGGTGTCTTTGCCGATCTGCTACGTACCCTCTCATGGAAGTTAGGAGTCTGACATGGTTAAAGTTTATGCCCCGGCTTTCAGTGCCAATATGAGCGTCg < 2:163236/249‑1 (MQ=255) aaGATTGCCGCAGTGGATGGTAATGATCCGCTGTTCAAAGTG‑AAAAATGGCGAAAACGCCCTGGCCTTTTATAGCCACTATTATCAGCAGCTGCCGTTGGTGCTGCGCGGATATGGTGCGGGCAATGACGTTACAGCTGCCGGTGTCTTTGCCGATCTGCTACGTACCCTCTCATGGACGTTAGGAGTCTGACATGGTTAAAGTTTATGCCCCGGCTTCCAGTGCCAATATGAGCGGCGGGGTTGAtgtgg > 2:434451/1‑250 (MQ=255) gCCGCAGTGGATGGGAATGATCCGCTGTTCAAAGTG‑AAAAATGGCGAAAACGCCCTGGCCTTTTATAGCCACTATTATCAGCCGCTGCCGTTGGTGCTGCGCGGATATGGTGCGGGCAATGACGTTACAGCTGCCGGTGTCTTTGCCGATCTGCTACGTACCCTCTCATGGAAGTTAGGCGTCTGACATGGTTAAAGTTTATGCCCCGGCTTCCAGTGCCAATATGAGCGTCGGGTTTGATGTGCTCgggg > 2:302608/1‑251 (MQ=255) cGAAGTGGATGGTAATGATCCGCTGTTCAAAGTG‑AAACATGGCGAAAACGCCCTGGCCTTTTATAGCCACTATTATCAGCAGCTGCCGTTGGTGCTGCGCGGATATGGTGCGGGCAATGAAGTTACAGCTGACGGTGTCTTTGCCGATCTGCTACGTACCCTCTCATGGAAGTTAGGAGTCTGACATGGTTAAAGTTTATGCCCCGGCTTCCAGTGCCAATACGAGAGTCGGGTTTGATGTGCTCGGggcg > 2:121437/1‑251 (MQ=255) ggTAATGATCCGCTGTTCAAAGTG‑AAAAATGGCGAAAACGCCCTGGCCTTTTATAGCCACTATTATCAGCCGCTGCAGTTGGTGCTGCGCGGGTATGGTACGGGCAATGACGTTACAGCTGCCGGTGTCTTTGCCGATCTGCTACGTAACCTCTCATGGAAGTTAGGCGTCTGCCATGGTTAAAGTTTATGCCCCGGCTTCCAGTGCCAATATGAGAGTCGGGTTTGATGGGATCGGGGCGGCGGTGacac > 1:297402/1‑251 (MQ=255) cgactcccttccgatctCAAAGTG‑AAAAATGGCGAAAACGCCCTTGCCTTTTATAGCCACTATTATCAGCCGCTGCCGTTGGTGCTGCGCGGATATGGTGCGGGCAATGACGTTACAGCTGCCGGTGTCTTTGCCGATCTGCTACGTACCCTCTCATGGAAGTTAGGAGTCTGACATGGTTAAAGTTTATGCCCCGGCTTCCAGTGCCAATATGAGCGTCGGGTTTGATGTGCTCGGGGCGGCGGTGacac < 2:225532/235‑1 (MQ=255) aatgacccgattgtaaaaGTA‑AAAAATGGCGAAAATGCCCTGGCCTTCTATAGCCACTATGATCAGCCGCTGCCGTTGGTAATGCGCGGATATGGTGCGGGCAATGACGTTACAGCTGCCGGTGTCTTTGCTGATCTGCTACGTACCCTCTCATGGAAGTTAGGAGTCTGACATGGTTAAAGTTTATGCCCCGGCTGCCAGTGCCAATATGAGCGTCGGGTTTGATGTGCTCGGGGCGGCGGTGACACCt < 2:431870/235‑1 (MQ=255) cAAAGTG‑AAAAATGGCGAAAACGCCCTGGCCTTTTATAGCCACTATTATCAGCCGCTGCCGTTGGTGCTGCGCGGATATGGTGCGGGCAATGACGTTACAGCTGCCGGTGTCTTTGCCGATCTGCTACGTACCCTCTCATGGAAGTTAGGAGTCTGACATGGTTAAAGTTTATGCCCCGGCTTCCAGTGCCAATATGAGCGTCGGGTTTGATGTGCTCGGGGCGGCGGTGacac > 1:225532/1‑234 (MQ=255) aaaGTG‑AAAAATGGCGAAAACGCCTTGGCCTTTTATATCCACTATTATCAGCCGCTGCCGTTGGTGCTGCGCGGATATGGTGCGGGCAATGACGTTACAGCTGCCGGTGTCTTTGCCGATCTGCTACGTACCCTCTCATGGAAGTTAGGAGTCTGACATGGTTAAAGTTTATGCCCCGGCTTCCAGTGCCAATATGAGCGTCGGGTTTGATGTGCTCGGGGCGGCGGTGACACCTGTTGATGGTGCATTGc < 2:168246/251‑1 (MQ=255) aaaGTG‑AAAAATGGCGAAAACGCCCTGGCCTTTTATAGCCACTATTATCAGCCGCTGCCGTTGGTGCTGCGCGGATATGGTGCGGGCAATGACGTTACAGCTGCCGGTGTCTTTGCCGATCTGCTACGTACCCTCTCATGGAAGTTAGGAGTCTGACATgg > 1:35042/1‑161 (MQ=255) aaaGTG‑AAAAATGGCGAAAACGCCCTGGCCTTTTATAGCCACTATTATCAGCCGCTGCCGTTGGTGCTGCGCGGATATGGTGCGGGCAATGACGTTACAGCTGCCGGTGTCTTTGCCGATCTGCTACGTACCCTCTCATGGAAGTTAGGAGTCTGACATgg < 2:35042/161‑1 (MQ=255) aaGTG‑AAAAATGGCGAAAACGCCCTGGCCTTTTATAGCCACTATTATCAGCCGCTGCCGTTGGTGCTGCGCGGATATGGTGCGGGCAATGACGTTACAGCTGCCGGTGTCTTTGCCGATCTGCTACGTACCCTCTCATGGAAGTTAGGAGTCTGACATGGTTAAAg < 1:354137/166‑1 (MQ=255) aaGTG‑AAAAATGGCGAAAACGCCCTGGCCTTTTATAGCCACTATTATCAGCCGCTGCCGTTGGTGCTGCGCGGATATGGTGCGGGCAATGACGTTACAGCTGCCGGTGTCTTTGCCGATCTGCTACGTACCCTCTCATGGAAGTTAGGAGTCTGACATGGTTAAAg > 2:354137/1‑166 (MQ=255) aaaaaTGGCGAAAACGCCCTGGCCTTTTATAGCCACTATTATCAGCCGCTGCCGTTGGTGCTGCGCGGATATGGTGCGGGCAATGACGTTACAGCTGCCGGTGTCTTTGCCGATCTGCTACGTACCCTCTCATGGAAGTTAGGAGTCTGACa < 1:136578/152‑1 (MQ=255) aaaaaTGGCGAAAACGCCCTGGCCTTTTATAGCCACTATTATCAGCCGCTGCCGTTGGTGCTGCGCGGATATGGTGCGGGCAATGACGTTACAGCTGCCGGTGTCTTTGCCGATCTGCTACGTACCCTCTCATGGAAGTTAGGAGTCTGACa > 2:136578/1‑152 (MQ=255) aaaaaTGGCGAAAACGCCCTGGCCTTTTATAGCCACTATTATCAGCCGCTGCCGTTGGTGCTGCGCGGATATGGTGCGGGCAATGACGTTACAGCTGCCGGTGTCTTTGCCGATCTGCTACGTACCCTCTCATGGAAGTTAGGAGTCTGACATGGTTAAAGTTTATGCCCCGGCTTCCAGTg < 2:255686/182‑1 (MQ=255) aaaaaTGGCGAAAACGCCCTGGCCTTTTATAGCCACTATTATCAGCCGCTGCCGTTGGTGCTGCGCGGATATGGTGCGGGCAATGACGTTACAGCTGCCGGTGTCTTTGCCGATCTGCTACGTACCCTCTCATGGAAGTTAGGAGTCTGACATGGTTAAAGTTTATGCCCCGGCTTCCAGTg > 1:255686/1‑182 (MQ=255) aaaaTGGCGAAAACGCCCTGGCCTTTTATAGCCACTATTATCAGCCGCTGCCGTTGGTGCTGCGCGGATATGGTGCGGGCAATGACGTTACAGCTGCCGGTGTCTTTGCCGATCTGCTACGTACCCTCTCATGGAAGTTAGGAGTCTGACATGGTTAAAGTTTATGCCCCGGCTTCCAGTGCCAATATGAGCGTCGGGTTTGATGTGCTCGGGGCGGCGGTGACACCTGTTGATGGTGCATTGCTCGgagg > 1:24703/1‑250 (MQ=255) aaaTGGCGAAAACGCCCTGGCCTTTTATAGCCACTATTATCAGCCGCTGCCGTTGGTGCTGCGCGGATATGGTGCGGGCAATGACGTTACAGCTGCCGGTGTCTTTGCCGATCTGCTACGTACCCTCTCATGGAAGTTAGGAGTCTGACATGGTTAAAGTTTATGCCCCGGCTTCCAGTGCCAATATGAGCGTCGGGTTTGATGTGCTCGGGGCGGCGGTGACACCTGTTGATGGTGCATTGCTCgg > 1:272209/1‑247 (MQ=255) tgtcGAAAACGCCCTGTCCTTTTATAGCCACTATTATCAGCCGCTGCCGTTGGTGCTGCTCGGATATGGTGCGGTCAATGACGTTACAGCTTCAGGTGTCTTTGCCGATCTGCTACTTACCCTCTCATGTAAGTTAGTACTCTCACATTGTTAAAGTTTAt < 2:220924/158‑1 (MQ=255) tGGCGAAAACGCCCTGGCCTTTTATAGCCACTATTATCAGCCGCTGCCGTTGGTGCTGCGCGGATATGGTGCGGGCAATGACGTTACAGCTGCCGGTGTCTTTGCCGATCTGCTACGTACCCTCTCATGGAAGTTAGGAGTCTGACATGGTTAAAGTTTAt > 1:220924/1‑161 (MQ=255) ggCGAAAACGCCCTGGCCTTTTATAGCCACTATTATCAGCCGCTGCCGTTGGTGCTGCGCGGATATGGTGCGGGCAATGACGTTACAGCTGCCGGTGTCTTTGCCGATCTGCTACGTACCCTCTCATGGAAGTTAGGAGTCTGACATGGTTAAAGTTTATGCCCCGGCTTCCAGTGCCAATATGAGCGTCGGGTTTGATGTGCTCGGGGCGGCGGTGACACCTGTTGATGGTGCATTGCTCGGAGATGTAg < 1:245993/251‑1 (MQ=255) gCGAAAACGCCCTGGCCTTTTATAGCCACTATTATCAGCCGCTGCCGTTGGTGCTGCGCGGATATGGTGCGGGCAATGACGTTACAGCTGCCGGTGTCTTTGCCGATCTGCTACGTACCCTCTCATGGAAGTTAGGAGTCTGACATGGTTAAAGTTTATGCCCCGGCTTCCAGTGCCAATATGAGCGTCGGGTTTGATGTGCTCGGGGCGGCGGTGACACCTGTTGATGGTGCATTGCTCGGAGATGTAGt < 1:275111/251‑1 (MQ=255) aaaCGCCCTGGCCTTTTATAGCCACTATTATCAGCCGCTGCCGTTGGTGCTGCGCGGATATGGTGCGGGCAATGACGTTACAGCTGCCGGTGTCTTTGCCGATCTGCTACGTACCCTCTCATGGAAGTTAGGAGTCTGACATGGTTAAAGTTTATGCCCCGGCTTCCAGTGCCAATATGAGCGTCGGGTTTGATGTGCTCGGGGCGGCGGTGACACCTGTTGATGGTGCATTGCTCTGAGATGTAGTCACg < 1:123219/251‑1 (MQ=255) gCCCTGGCCTTTTATAGCCACTATTATCAGCCGCTGCCGTTGGTGCTGCGCGGATATGGTGCGGGCAATGACGTTACAGCTGCCGGTGTCTTTGCCGATCTGCTACGTACCCTCTCATGGAAGTTAGGAGTCTGACATGGTTAAAGTTTATGCCCCGGCTTCCAGTGCCAATATGAGCGTCGGGTTTGATGTGCTCGGGGCGGCGGTGACACCTGTTGATGGTGCATTGCTCGGAGATGTAGTCACGGTTg > 1:226037/1‑251 (MQ=255) gggCCTTTTATAGCCACTATTATCAGCCGCTGCCGTGGGTGCTGCGCGGATAGGGTGCGGGCAATGACGTTACAGCTTCCGGTGTCTTTGCCGATCTGTTACGTCCCCTCTCATGGAAGTTAGGAGTCGGACATGGTTAAAGTTTATGCCCCGGCTTCCAGTGCCAATATGAGCGTCGGGTTTGAGGTGCTCGGGGCGGCGGTGACACCTGTTGAGGGTGCATTGCTCGGAGATTTAGTCACGGTTGAggc < 2:287142/250‑1 (MQ=255) ggCCTTTTATAGCCACTATTATCAGCCGCTGCCGTTGGTGCTGCGCGGATATGGTGCGGGCAATGACGTTACAGCTGCCGGTGTCTTTGCCGATCTGCTACGTACCCTCTCATGGAAGTTAGGAGTCTGACATGGTTAAAGTTTATGCCCCGGCTTCCAGTGCCAATATGAGCGTCGGGTTTGATGTGCTCGGGGCGGCGGTGACACCTGTTGATGGTGCATTGCTCGGAGATGTAGTCACGGTTGAggcg < 1:1014/251‑1 (MQ=255) tatCAGCCGTGGCCGTTGGTGCTGCGCGGAGATGGTGCGGGCAATGCCGTTACAGCTGCCGGTGTCTTTGCCGATCTGCTACGTCCCCTCTCATGGAAGTTAGGAGTCTGACATGGTTAAAGTTTATGTCCCGGCTTCCAGTGCCAATATGAGCGTCGGGTTTGATGTGCTCGGGGCGGCGGTGACACCTGTTGATGGTGCATTTCTCGGAGATGTAGTCACGGTTGAGGCGGCAGAGCCATTCAGcctc < 2:70531/250‑1 (MQ=255) tatCAGCCGCTGCCGTTGGTGCTGCGCGGATATGGTGCGGGCAATGACGTTACAGCTGCCGGTGTCTTTGCCGATCTGCTACGTACCCTCTCATGGAAGTTAGGAGTCTGACATGGTTAAAGTTTATGCCCCGGCTTCCAGTGCCAATATGAGCGTCGGGTTTGATGTGCTCGGGGCGGCGGTGACACCTGTTGATGGTGCATTGCTCGGAGATGTAGTCACGGTTGAGGCGGCAGAGACATTCAGtctc > 1:3633/1‑250 (MQ=255) cAGCCGCTGCCGTTGGTGCTGCGCGGATATGGGGCGGGCAATGACGTTACAGCTGCCGGTGTCTTTGCCGATCTGCTACGTACCCTCTCATGGAAGTTAGGAGTCTGACATGGTTAAAGTTTATGCCCCGGCTTCCAGTGCCAATACGAGCGTCGGGTTTGATGTGCTCGGGGCGGCGGTGACACCTGTTGATGGTGCATTGCTCGGAGATGTAGTCACGGTTGAGGCGGCAGAGACATTCAGTCTcaaca < 1:452474/251‑1 (MQ=255) gCCGTTGGGGCTGCGCGGAGAGGGGGCGGGCAATGACGTTACAGCTGCCTGTGTCTGTGCCGATCTGCTACGGACCCCCTCATGGAAGTTAGGATTCTGACATGGTTAAAGTTTATGCCCCGGCTTCCAGTGCCAATATGAGCGTCGGGTTTGATGTGCTCGGGGCGGCGGTGACACCTGTTGATGGTGCATTGCGCGGAGATGTAGTCACGGTTGAGGCGGCAGAGACATTCAGTCTCAACAACCTCg < 2:291734/249‑1 (MQ=255) tGGTGCTGCGCGGATATGGTGCGGGCAATGACGTTACAGCTGCCGGTGTCTTTGCCGATCTGCTACGTACCCTCTCATGGAAGTTAGGAGTCTGACATGGTTAAAGTTTATGCCCCGGCTTCCAGTGCCAATATGAGCGTCGGGTTTGATGTGCTCGGGGCGGCGGTGACACCTGTTGATGGTGCATTGCTCGGAGATGTAGTCACGGTTGAGGCGGCAGAGACATTCAGTCTCAACAACCTCGGACGCt < 1:93634/250‑1 (MQ=255) | CGAGGGTGATGTTGCCGCTTTTATGGCGAATCTGTCACAACTCGACGATCTCTTTGCCGCGCGCGTGGCGAAGGCCCGTGATGAAGGAAAAGTTTTGCGCTATGTTGGCAATATTGATGAAGATGGCGTCTGCCGCGTGAAGATTGCCGAAGTGGATGGTAATGATCCGCTGTTCAAAGTG‑AAAAATGGCGAAAACGCCCTGGCCTTCTATAGCCACTATTATCAGCCGCTGCCGTTGGTACTGCGCGGATATGGTGCGGGCAATGACGTTACAGCTGCCGGTGTCTTTGCTGATCTGCTACGTACCCTCTCATGGAAGTTAGGAGTCTGACATGGTTAAAGTTTATGCCCCGGCTTCCAGTGCCAATATGAGCGTCGGGTTTGATGTGCTCGGGGCGGCGGTGACACCTGTTGATGGTGCATTGCTCGGAGATGTAGTCACGGTTGAGGCGGCAGAGACATTCAGTCTCAACAACCTCGGACGCT > NC_000913/2469‑2954 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |