| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 2,597 | T→C | V754A (GTC→GCC) | thrA → | fused aspartate kinase/homoserine dehydrogenase 1 |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 2,597 | 0 | T | C | 95.8% | 123.8 / ‑1.9 | 48 | V754A (GTC→GCC) | thrA | fused aspartate kinase/homoserine dehydrogenase 1 |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (1/1); new base C (23/23); total (24/24) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 2.18e-01 | |||||||||||
TTCTGGTATGGATGTGGCGCGTAAACTATTGATTCTCGCTCGTGAAACGGGACGTGAACTGGAGCTGGCGGATATTGAAATTGAACCTGTGCTGCCCGCAGAGTTTAACGCCGAGGGTGATGTTGCCGCTTTTATGGCGAATCTGTCACAACTCGACGATCTCTTTGCCGCGCGCGTGGCGAAGGCCCGTGATGAAGGAAAAGTTTTGCGCTATGTTGGCAATATTGATGAAGATGGCGTCTGCCGCGTGAAGATTGCCGAAGTGGATGGTAATGATCCGCTGTTCAAAGTG‑AAAAATGGCGAAAACGCCCTGGCCTTCTATAGCCACTATTATCAGCCGCTGCCGTTGGTACTGCGCGGATATGGTGCGGGCAATGACGTTACAGCTGCCGGTGTCTTTGCTGATCTGCTACGTACCCTCTCATGGAAGTTAGGAGTCTGACATGGTTAAAGTTTATGCCCCGGCTTCCAGTGCCAATA > NC_000913/2358‑2837 | ttCTGGTATGGATGTAGCGCGTAAGCGATTGATTCTCGCTCGTGAAACGGGACGTGAACTGGAGCTGGCGGATATTGAAATTGAACCTGTGCTGCCCGCAGAGTTTAACGCTGAGGGTGATGTTGCCGCTTTTATGGCGAATCTGTCACAGCTCGACGATCTCTTTGCCGCGCGCGTGGCGAAGGCCCGTGATGAAGGAAAAGTTTTGCGCTATGTTGGCAATATTGATGAAGATGGTGCCTGCCGCGt < 1:119108/249‑1 (MQ=255) gtagcgcGTAAGCTATTGATTCTCGCTCGTGACACGGGACGTGAACTGGAGCTGGCGGATATTGAAATTGAACCTGTGCTGCCCGCAGAGTTTAACGCTGAGGGTGATGTTGCCGCTTTTATGGCGAATCTGTCACAGCTCGACGATCTCTTTGCCGCGCGCGTGGCGAAGGCCCGTGATGAAGGAAAAGTTTTGCGCTATGTTGGCAATATTGATGACGATGGGGCCTGCCGCGGGGAGGTTGCCggagg > 2:50490/4‑247 (MQ=255) cgcgTAAGCTATTGATTCTCGCTCGTGAAACGGGACGTGAACTGGAGCTGGCGGATATTGAAATTGAACCTGTGCTGCCCGCAGAGTTTAACGCTGAGGGTGATGTTGCCGCTTTTATGGCGAATCTGTCACAGCTCGACGATCTCTTTGCCGCGCGCGTGGCGAAGGCCCGTGATGAAGGAAAAGTTTTGCGCTATGTTGGCAATATTGATGAAGATGGTGCCTGCCGCGTGAAGATTGCCGAAGTGGAt < 2:358612/251‑1 (MQ=255) aTTGATTCTCGCTCGTGAAACGGGACGTGAACTGGAGCTGGCGGATATTGAAATTGAACCTGTGCTGCCCGCAGAGTTTAACGCTGAGGGTGATGTTGCCGCTTTTATGGCGAATCTGTCACAGCTCGACGATCTCTTTGCCGCGCGCGTGGCGAAGGCCCGTGATGAAGGAAAAGTTTTGCGCTATGTTGGCAATATTGATGAAGATGGTGCCTGCCGCGTGCAGATTGCCGAAGTGGATGGTAATGATc > 1:291734/1‑251 (MQ=255) ttaTTCTCGGTCGTGAAACGGGACGTGAACTGGAGCTGGCGGATATTGAAATTGAACCTGTGCTGCCCGCAGAGTTTAACGCTGAGGGTGATGTTGCCTCTTTTATGGCGAATCTGTCACAGCTCGACGATCTCTTTGCCGCGCGCGTGGCGAAGGCCCGTGATGAAGGAAAAGTTTTGCGCTATGTTGGCAATATTGATGAAGATGGTGCCTGCCGCGTGAAGATTGCCGAAGTGGATGGTAATGATcc < 2:492039/248‑1 (MQ=255) ggtcttgcgagtggaaCGGGACGCGTGCTGGGGCTGGCGGATAGTGACATTGAGCCTGTGCTGGCCGCAGAGTGTAGCGCTGGGGGGTATGTGGCCGCTTTGATGGCGAATCTGTCACAGCTCGACGATCTCTTGGCCGCGCGCGGGGCGAAGGCCCGTGATGAAGGAAAAGTTTTGCGCTATGTCGTCAATATTGAGGAAAATGGTGCCTGCCGCGTGAAGATTGCCGAAGTGGATAGTaagtagcctct < 2:259179/237‑10 (MQ=255) aTTCTCGCTCGTGAAACGGGACGTGAACTGGAGCTGGCGGATATTGAAATTGAACCTGTGCTGCCCGCAGAGTTTAACGCTGAGGGTGATGTTGCCGCTTTTATGGCGAATCTGTCACAGCTCGACGATCTCTTTGCCGCGCGCGTGGCGAAGGCCCGTGATGAAGGAAAAGTTGTGCGCTATGTTGGCAATATTGATGAAGATGGTGCCTGCCGCGTGAAGATTGCCGAAGTGGATGGTAATGATCCGCt < 1:50490/251‑1 (MQ=255) cgctcgTGAAACGGGACGTGAACTGGAGCTGGCGGATATTGAAATTGAACCTTTGCTGCCCGCAGAGTTTAACGCTGAGGGTGATGTTGCCGCTTTTATGGCGAATCTGTCACAGCTCGACGATCTCTTTGCCGCGCGCGTGGCGAAGGCCCGTGATGAAGGAAAAGTTTTGCGCTATGTTGGCAATATTGATGAAGATGGTGCCTGCCGCGTGAAGATTGCCGAAGTGGATGGTAATGATCCGCTGTTc < 1:181212/250‑1 (MQ=255) gggACGTGAACTGGAGCTGGCGGATATTGAAATTGAACCTGTGCTGCCCGCAGAGTTTAACGCTGAGGGTGATGTTGCCGCTTTTATGGCGAATCTGTCACAGCTCGACGATCTCTTTGCCGCGCGCGTGGCGAAGGCCCGTGATGAAGGAAAAGTTTTGCGCTATGTTGGCAATATTGATGAAGATGGTGCCTGCCGCGTGAAGATTGCCGAAGTGGATGGTAATGATCCGCTGTTCAAAGTG‑AAAAATg < 1:423138/251‑1 (MQ=255) gACGTGAACTGGAGCTGGCGGATATTGAAATTGAACCTGTGCTGCCCGCAGAGTTTAACGCTGAGGGTGATGTTGCCGCTTTTATGGCGAATCTGTCACAGCTCGACGATCTCTTTGCCGCGCGCGTGGCGAAGGCCCGTGATGAAGGAAAAGTTTTGCGCTATGTTGGCAATATTGATGAAGATGGTGCCTGCCGCGTGAAGATTGCCGAAGTGGATGGTAATGATCCGCTGTTCAAAGGG‑AAAAATggg > 1:119142/1‑250 (MQ=255) gAACTGGAGCTGGCGGATATTGAAATTGAACCTGTGCTGCCCGCAGAGTTTAACGCTGAGGGTGATGTTGCCGCTTTTATGGCGAATCTGTCACAGCTCGACGATCTCTTTGCCGCGCGCGTGGCGAAGGCCCGTGATGAAGGAAAAGTTTTGCGCTATGTTGGCAATATTGATGAAGATGGTGCCTGCCGCGTGAAGATTGCCGAAGTGGATGGTAATGATCCGCTGTTCAAAGTG‑AAAAATGGCGaaaa < 1:42596/251‑1 (MQ=255) gCTGGCGGATATTGAAATTGAACCTGTGCTGCCCGCAGAGTTTAACGCTGAGGGTGATGTTGCCGCTTTTATGGCGAATCTGTCACAGCTCGACGATCTCTTTGCCGCGCGCGTGGCGAAGGCCCGTGATGAAGGAAAAGTTTTGCGCTATGTTGGCAATATTGATGAAGATGGTGCCTGCCGCGTGAAGATTGCCGAAGTGGATGGTAATGATCCGCTGTTCAAAGTG‑AAAAATGGCGAAAACGCCCTgg < 1:100529/251‑1 (MQ=255) gCGGAAATTGAAATGGAACCTGTGCGGACCGCAGAGTTTTACGCTGAGGGTGATGGTGCCGCTTTTATTGCGAAGCGGTCACAGCTCGACGAACTCTTTGCCGCGCGCGTGGCGAAGGCCCGTGATGAAGGAAAAGGTTTGCGCTATGTTGGCAATATTGATGAAGATGGTGCCTGCCGCGTGAAGATTGCCGAAGTGGATGGTAATGATCCGCGGTTCAAAGTG‑AAAAAGGGCGAAAACGCCCTGGCCtt < 2:39345/251‑1 (MQ=255) cGGATATTGAAATTGAACCTGTGCTGCCCGCAGAGTTTAACGCTGAGGGTGATGTTGCCGCTTTTATGGCGAATCTGTCACAGCTCGACGATCTCTTTGCCGCGCGCGTGGCGAAGGCCCGTGATGAAGGAAAAGTTTTGCGCTATGTTGGCAATATTGATGAAGATGGTGCCTGCCGCGTGAAGATTGCCGAAGTGGATGGTAATGATCCGCTGTTCAAAGTG‑AAAAATGGCGAAAACGCCCTGGCCttt > 1:154563/1‑250 (MQ=255) atatTGAAATTGAACCTGTGCTGCCCGCAGAGTTTAACGCTGAGGGTGATGGTGCCGCTTTTAGGGCGAATCTGTCACAGCTCGACGATCTCTTTGCCGCGCGCGTGGCGAAGGCCCGTGATGAAGGAAAAGTTTTGCGCTATGTTGGCAATATTGATGAAGATGGTGCCTGCCGCGTGAAGATTGCCGAAGTGGATGGTAATGATCCGCTGTTCAAAGTG‑AAAAATGGCGAAAACTCCCTGGccgtttat < 1:403650/251‑7 (MQ=255) tgaaattgaaCCTGTGCTGCCCGCAGAGTTTAACGCTGAGGGTGATGTTGCCGCTTTTATGGCGAATCTGTCACAGCTCGACGATCTCTTTGCCGCGCGCGTTGCGAAGGCCCGTGATGAAGGAAAAGTTTTGCGCTATGTTGGCAATATTGATGAAGATGGTGCCTGCCGCGTGAAGATTGCCGAAGTGGATGGTAATGATCCGCTGTTCAAAGTG‑AAAAATGGCGAAAACGCCCTGGCCTTTTATAGc < 1:249885/250‑1 (MQ=255) gaaCCTGTGCTAGCCGCAGAGTTTAACGAGGAGGTGGATGTTGCCGCTTTTATGGCGAATCTGTCACAGCTCGACGATCCCGTTGCCGCGCGCGTGGCGAAGGCCCGTGATGAAGGAAAAGTTTTGCGCTATGTTGGCAATATTGATGAAGATGGTGCCTGCCGCGTGAAGATTGCCGAAGTGGATGGGAATGATCCGCTGTTCAAAGTG‑AAAAATGGCGAAAACGCCCTGGCCTTTTATAGCCACtatta < 2:28912/251‑1 (MQ=255) tgctgcCGGCAGAGTTTAACGCTGAGGGTGATGTTGCCGCTTTTATGGCGACTCTGTCCCAGCACGACGATCTCTTTGCCGCGCGCGTGGCGAAGGCCCGTGATGAAGGAAAAGTTTTGCGCTATGTTGGCAATATTGATGAAGATGGTGCCTGCCGCGTGAAGGTTGCCGAAGTGGATGGTAATGGACCGCTGTTCACAGTG‑AAAAATGGCGAAAACGCCCTGGCCTTTTATAGCCACTATTATCAGCCg > 2:452474/1‑251 (MQ=255) tgctgcCCGCAGAGTTTAACGCTGAGGGTGATGTTGCCGCTTTTATGGCGAATCTGTCACAGCTCGGCGATCTCTTTGCCGCGCGCGTGGCGAAGGCCCGTGATGAAGGAAAAGTTTTGCGCTATGTTGGCAATATTGATGAAGATGGTGCCTGCCGCGTGAAGATTGCCGAAGTGGATGGTAATGATCCGCTGTTCAAAGTG‑AAAAATGGCGAGAACGACCTGGCCTTTTATAGCCACTATTCTCAGCCg > 1:131538/1‑251 (MQ=255) tgcCCGCAGAGTTTAACGCTGAGGGTGATGTTGCCGCTTTTATGGCGAATCTGTCACAGCTCGACGATCTCTTTGCCGCGCGCGTGGCGAAGGCCCGTGATGAAGGAAAAGTTTTGCGCTATGTTGGCAATATTGATGAAGATGGTGCCTGCCGCGTGAAGATTGCCGAAGTGGATGGTAATGATCCGCTGTTCAAAGTG‑AAAAATGGCGAAAACGCCCTGGCCTTTTATAGCCACTATTATCAGCCGCTg > 1:457083/1‑251 (MQ=255) ccGCAGAGTTTAAAGCTGAGGGTGATGTTGCCGCTTTTATGGCGCATCTGTCACAGCTCGACGGTCTCTTTGCCGCGCGCGTGGCGAAGGCCCGTGATGAAGGGACAGTTTTGCGATATGTTGGCAATATTGATGAAGATGGTGCCTGCCGCGTGAAGATTGACGAAGTGGATGGTAATGATCCGCTGTTCCAAGGG‑ACAAATGGCGCAAACTCCCTGGCCTTTTTGAGCCACTATTAACAGcagactgcg > 2:215774/1‑243 (MQ=255) agagTTTAACGCTGAGGGTGATGTTGCCGCTTTTATGGCGAATCTGTCACAGCTCGACGATCTCTTTGCCGCGCGCGTGGCGAAGGCCCGTGATGAAGGAAAAGTTTTGCGCTATGTTGGCAATATTGATGAAGATGGTGCCTGCCGCGTGAAGATTGCCGAAGTGGATGGTAATGATCCGCTGTTCAAAGTG‑AAAAATGGCGAAAACGCCCTGGCCTTTTATAGCCACTATTATCAGCCGCTGCCGTTgg < 1:173796/251‑1 (MQ=255) agagTTTAACGCTGAGGGTGATGTTGCCGCTTTTATGGCGAATCTGTCACAGCTCGACGATCTCTTTGCCGCGCGCGTGGCGAAGGCCCGTGATGAAGGAAAAGTTTTGCGCTATGTTGGCAATATTGATGAAGATGGTGCCTGCCGCGTGAAGATTGCCGAAGTGGATGGTAATGATCCGCTGTTCAAAGTG‑AAAAATGGCGAAAACGCCCTGGCCTTTTATAGCCACTATTATCAGCCGCTGCCGTTgg > 1:475592/1‑251 (MQ=255) agagTTTAACGCTGAGGGTGATGTTGCCGCTTTTATGGCGAATCTGTCACAGCTCGACGATCTCTTTGCCGCGCGCGTGGCGAAGGCCCGTGATGAAGGAAAAGTTTTGCGCTATGTTGGCAATATTGATGAAGATGGTGCCTGCCGCGTGAAGATTGCCGAAGTGGATGGTAATGATCCGCTGTTCAAAGTG‑AAAAATGGCGAAAACGCCCGGGCCTTTTATAACCACTATTATCAGCCGCGGCCGGTgg > 2:100320/1‑251 (MQ=255) tgAGGGTGATGTTGCCGCTTTTATGGCGAATCTGTCACAGCTCGACGATCTCTTTGCCGCGCGCGTGGCGAAGGCCCGTGATGAAGGAAAAGTTTTGCGCTATGTTGGCAATCTTGATGAAGATGGTGCCTGCCGCGTGAAGATTGCCGAAGTGGATGGTAATGATCCGCTGTTCAAAGTG‑AACAATGGCGAAAACGCCATGGCCTTTTCTAGCCACTATTATCAGCCGCTGCCGTTGGTGCTgcgggggt > 2:245993/2‑246 (MQ=255) gTTGCCGCTTTTATGGCGAATCTGTCACAGCTCGACGATCTCTTTGCCGCGCGCGTGGCGAAGGCCCGTGATGAAGGAAAAGTTTTGCGCTATGTTGGCAATATTGATGAAGATGGTGCCTGCCGCGTGAAGATTGCCGAAGTGGATGGTAATGATCCGCTGTTCAAAGTG‑AAAAATGGCGAAAACGCCCTGGCCTTTTATAGCCACTATTATCAGCCGCTGCCGTTGGTGCTGCGCGGATATGGTGCggg < 1:59206/251‑1 (MQ=255) ttttATGGCGAATCTGTCACGGCTCGCCGATCTCTTTGCCGCGCGCGTGGCGAAGGCCCGTGATGAAGGAAAAGTTTTGCGCTATGTTGGCAATATTGATGTAGGTGGTGCCTGCCGCGTGAAGATTGCCGACGTGGGTGGTAATGATCCGCTGTTCAAAGGG‑AAAAATGGCGAAAACGCCCTGGCCTTTTATAGCCACTATTATCAGCCGCTGCCGTTGGGGCTGCGCgggtaagatcggaaaggcgtcg > 2:286157/1‑231 (MQ=255) ttttATGGCGAATCTGTCACAGCTCGACGATCTCTTTGCCGCGCGCGTGGCGAAGGCCCGTGATGAAGGAAAAGTTTTGCGCTATGTTGGCAATATTGATGAAGATGGTGCCTGCCGCGTGAAGATTGCCGAAGTGGATGGTAATGATCCGCTGTTCAAAGTG‑AAAAATGGCGATAACGCCCTGGCCTTTTATAGCCACTATTATCAGCCGCTGCCGTTGGTGCTGCGCGGata < 1:286157/234‑1 (MQ=255) ggCGAATCTGTCACAGCTCGACGATCTCTTTGCCGCGCGCGTGGCGAAGGCCCGTGATGAAGGAAAAGTTTTGCGCTATGTTGGCAATATTGATGAAGATGGTGCCTGCCGCGTGAAGATTGCCGAAGTGGATGGTAATGATCCGCTGTTCAAAGTG‑AAAAATGGCGAAAACGCCCTGGCCTTTTATAGCCACTATTATCAGCCGCTGCCGTTGGTGCTGCGCGGATATGGTGCGGGCAATGACGTTAc > 1:110531/1‑249 (MQ=255) agcTCGACGATCTCGTTACCGCGCGCGTGGCGAAGGCCCGTGATGCAGGAAAAGTTTTGCGCTATGTTGGCAATATTGATGAAGATGGTGCCTGCCGCGTGAAGATTGCCGAGGTGGATGGTAATGATCCGCTGTTCAAAGTG‑AAAAATGGCGAAAACGCCCTGGCCTTTTATAGCCACTATTATCAGCCGCTGCCGTTGGTGCTGCGCGGTTATGGTGCGGGCAATgcagttccatctgcggtggtcttt > 2:93634/3‑228 (MQ=255) acgaTCTCTTTGCCGCGCGCGTGGCGAAGGCCCGTGATGAAGGAAAAGTTTTGCGCTATGTTGGCACTATTGATGAAGATGGTGCCTGCCGCGTGAAGATTGCCGAAGTGGATGGTAATGATCCGCTGTTCAAAGTG‑AAAAATGGCGAAAACGCCCTGGCCTTTTATAGCCACTATTATCAGCCGCTGCCGTTGGTGCTGCGCGGTTATGGTGCGGGCAATGACGTTACAGCTGCCGGTGTCTTTGCCGAt > 1:278142/1‑251 (MQ=255) acgaTCTCTTTGCCGCGCGCGTGGCGAAGGCCCGTGATGAAGGAAAAGTTTTGCGCTATGTTGGCAATATTGATGAAGATGGTGCCTGCCGCGTGAAGATTGCCGAAGTGGATGGTAATGATCCGCTGTTCAAAGTG‑AAAAATGGCGAAAACGCCCTGGCCTTTTATAGCCACTATTATCAGCCGCTGCCGTTGGTGCTGCGCGGATATGGTGCGGGCAATGACGTTACAGCTGCCGGTGTCTTTGCCGAt < 2:457083/251‑1 (MQ=255) cgcgcgcgTGGCGAAGGCCCGGGATGAAGGAAAAGTTTTGCGCTATGTGGGCAATATTGATGAAGATGGTGCCTGCCGCGTGAAGATTGCCGAAGTGGATGGTAATGATCCGCTGTTCAAAGTG‑AAAAATGGCGAAAACGCCCTGGCCTTTTATAGCCACTATTATCAGCCGCTGCCGTTGGTGCTGCGCGGATATGGTGCGGGCAATGACGTTACAGCTGCCGGTGTCTTTGCCGATCTGCTACGTAccc < 2:234362/251‑1 (MQ=255) gcgTGGCGAAGGCCCGTGATGAAGGAAAAGTTTTGCGCTATGTTGGCAATATTGATGAAGATGGTGCCTGCCGCGTGAAGATTGCCGAAGTGGATGGTAATGATCCGCTGTTCAAAGTG‑AAAAATGGCGAAAACGCCCTGGCCTTTTATAGCCACTATTATCAGCCGCTGCCGTTGGTGCTGCGCGGATATGGTGCGGGCAATGACGTTACAGCTGCCGGTGTCTTTGCCGATCTGCTACGTACCCTCTCa < 2:110531/251‑1 (MQ=255) gggCGAAGGCCGGTGATGAAGGAAAAGTTTTGCGTTATGTGGGCAATATTGATGAAGATGGGGCCTGCCGCTTGAAGATTGCCGAAGTGGATGGTAATGATCCGCTGTTCAAAGTG‑AAAAAGGGCGAAAACGCCCTGGCCTTTTATAGCCACTATTAACAGCCGCTGCCGTTGGTGCTGCGCGGATATGGTTCGGGCAATGACGTTACAGCTGCCGGTGTCTTTGCCGATCTGCTACGTACCCTCTCATgg < 2:26808/250‑1 (MQ=255) ggCGAAGGCCCGTGAGGAAGGAAAAGTGTTGCGCTATGTTGGCAATATTGATGAAGATGGTGCCTGCCGCGTGAAGATTGCCGAAGTGGATGGTAATGATCCGCTGTTCAAAGTG‑AAAAATGGCGAAAACGCCCTGGCCTTTTATAGCCACTATTATCAGCCGCTGCCGTTGGTGCTGCGCGGATATGGTGCGGGCAATGACGTTACAGCTGCCGGTGTCTTTGCCGATCTGCTACGTACCCTCTCATgg < 1:320511/250‑1 (MQ=255) agggccgggatgaAGGAAAAGTTTTGAGCTATGTTGGCAATCTTGATGAAGATGGTGCCTGCCGCGTGAAGATTGCCGAAGTGGATGGTAATGATCTGCTGTTCACAGTG‑AAAAATGGCGAAAACGCCCTGGACTTTTATAGCCACTATTATCAGCCGCAGCCGTTGGTGCTGCGCGGATATGGTGCGGGCAATGAAGTTACCGCTGCCGGTGTCTTTGCCGAGCTGATACGGACCCTCTCATGGCAGtt > 2:156832/9‑250 (MQ=255) gatgaAGGAAAAGTTTTGCGCTATGTTGGCAATATTGATGAAGATGGTGCCTGCCGCGTGCAGATTGCCGAAGTGGATGGTAATGATCCGCTGTTCAAAGTG‑AAAAATGGCGAAAACGCCCTGGCCTTTTATAGCCACTATTATCAGCCGCTGCCGTTGGTGCTGCGCGGATATGGTGCGGGCAATGACGTTACAGCTGCCGGTGTCTTTGCCGATCTGCTACGTACCCTCTCATGGAAGTTAGGGGTCTg > 2:138113/1‑251 (MQ=255) gaAGGAAAAGTTTTGCGCTATGTTGGCAATATTGATGCAGATGGTGCCTGCCGCGTGAAGATTGCAGAAGTGGATGGTAATGATCCGCTGTTCAAAGTG‑CAAACTGGCGAAAAAGCCCTGGCCTTTTATAGCCACTATTATCAGCCGCTGCCGTTGGTGCTGCGCGGATATGGTGAGGGCAATGACGGTCCAGCTGCCGGTGTCTTTGCCGATCTGCTACGTACCCTCTCATGGAAGTTAGGGATCTGAc > 2:456506/1‑250 (MQ=255) agtgaactttggtcggtATGTTGGAATTATTGTTGAATATGGTGCCGGCCGCGGGAATATGGCTGAAGTGGATGGTAATGATCCGCTGTT‑AAAATGTAAAAAGTACGAAACGGCGCTGTCCTGTTATGGCCACTATTATCAGCAGCTGCCGTTGGTTCTGCTCTTGTATGGTGCGGGCAATGACGTTACAGCTGCCGGTGTCTTTGCCGATATGCTACGTACCCTCTCATGGACGTTAGGAGTCTGACATg < 2:12012/235‑1 (MQ=255) aGTTTTGCGCTATGTTGGCAATATTGATGAAGATGGTGCCTGCCGCGTGAAGATTGCCGAAGTGGATGGTAATGATCCGCTGTTCAAAGTG‑AAAAATGGCGAAAACGCCCTGGCCTTTTATAGCCACTATTATCAGCCGCTGCCGTTGGTGCTGCGCGGCTATGGTGCGGGCAATGACGTTACAGCTGCCGGTGTCTTTGCCGATCTGCTACGTACCCTCTCATGGAAGTTAGGAGTCTGACGTGGTTaa > 2:85710/1‑250 (MQ=255) gTTTTGCGCTATGTTGGCAATATTGATGAATATGGCGTCTGCCGCGTGAAGATTGCCGAAGTGGATGGTAATGATCCGCTGTTCAAAGTG‑AAAAATGGCGAAAACGCCCTGGCCTTCTATAGCCACTATTATCAGCCGCTGCCGTTGGTACTGCGCGGATATGGTGCGGGCAATGAc > 1:26128/1‑177 (MQ=255) gTTTTGCGCTATGTTGGCAATATTGATGAATATGGCGTCTGCCGCGTGAAGATGGCCGAAGTGGATGGTAATGATCCGCTGTTCAAAGTG‑AAAAAGGGCGAAAACGCCCTGGCCGTCTATAGCCACTATTATCAGCCGCTGCCGTTGGTACTGCGCGGATATGGTGCGGGCAATGAc < 2:26128/177‑1 (MQ=255) tGTTGGCAATATTGATGAAGATGGTGCCTGCCGCGTGAAGATTGCCGAAGTGGATGGTAATGATCCGCTGTTCAAAGTG‑AAAAATGGCGAAAACGCCCTGGCCTTTTATAGCCACTATTATCAGCCGCTACCGTTGGTGCTGCGCGGATATGGTGCGGGCAATGACGTTACAGCTGCCGGTGTCTTTGCCGATCTGCTACGTACCCTCTCATGGAAGTTAGGCGTCTGACATGGTTAAAGTTTATGCCCCg > 1:367696/1‑251 (MQ=255) ggCAATATTGATGAAGATGGTGCCTGCCGCGTGAAGATTGCCGAAGTGGATGGTAATGATCCGCTGTTCAAAGTG‑AAAAATGGCGAAAACGCCCTGGCCTTTTATAGCCACTATTATCAGCCGCTGCCGTTGGTGCTGCGCGGATATGGTGCGGGCAATGACGTTACAGCTGCCGGTGTCTTTGCCGATCTGCTACGTACCCTCTCATGGAAGTTAGGAGTCTGACATGGTTAAAGTTTATGCCCCGGCtt < 1:408043/251‑1 (MQ=255) tgaAGATGGTGCCTGCCGCGTGAAGATTGCCGAAGTGGATGGTAATGATCCGCTGTTCAAAGTG‑AAAAATGGCGAAAACGCCCTGGCCTTTTATAGCCACTATTATCAGCCGCTGCCGTTGGTGCTGCGCGGATATGGTGCGGGCAATGACGTTACAGCTGCCGGTGTCTTTGCCGATCTGCTACGTACCCTCTCATGGAAGTTAGGAGTCTGACATGGTTAAAGTTTATGCCCCGGCTTCCAGTGCCAat > 1:486221/1‑251 (MQ=255) gaAGATGGTGCCTGCCGCGTGAAGATTGCCGAAGTGGATGGTAATGATCCGCTGTTCAAAGTG‑AAAAATGGCGAAAACGCCCTGGCCTTTTATAGCCACTATTATCAGCCGCTGCCGTTGGTGCTGCGCGGATATGGTGCGGGCAATGACGTTACAGCTGCCGGTGTCTTTGCCGATCTGCTACGTACCCTCTCATGGGAGTTAGGAGTCTGACATGGTTAAAGTTTATGCCCCGGCTTCCAGTGCCAat > 1:158633/1‑250 (MQ=255) gaGATGGTGCCTGCCGCGTGACGATTGCCGAAGTGGATGGTAATGATCCGCTGTTCAAAGTG‑AAAAATGGCGAAAACGCCCTGGCCTTTTATAGCCACTATTATCAGCCGCTGCCGTTGGTGCTGCGCGGCTATGGTGCGGGCAATGACGTTACAGCTGCCGGGGTCTTTGCCGATCTGCTACGTACCCTCTCATGGACGTTAGGCGTCTGACATGGTTAACGTTTATGCCCCGGCTTCCAGTGCCAata > 2:123219/2‑250 (MQ=255) | TTCTGGTATGGATGTGGCGCGTAAACTATTGATTCTCGCTCGTGAAACGGGACGTGAACTGGAGCTGGCGGATATTGAAATTGAACCTGTGCTGCCCGCAGAGTTTAACGCCGAGGGTGATGTTGCCGCTTTTATGGCGAATCTGTCACAACTCGACGATCTCTTTGCCGCGCGCGTGGCGAAGGCCCGTGATGAAGGAAAAGTTTTGCGCTATGTTGGCAATATTGATGAAGATGGCGTCTGCCGCGTGAAGATTGCCGAAGTGGATGGTAATGATCCGCTGTTCAAAGTG‑AAAAATGGCGAAAACGCCCTGGCCTTCTATAGCCACTATTATCAGCCGCTGCCGTTGGTACTGCGCGGATATGGTGCGGGCAATGACGTTACAGCTGCCGGTGTCTTTGCTGATCTGCTACGTACCCTCTCATGGAAGTTAGGAGTCTGACATGGTTAAAGTTTATGCCCCGGCTTCCAGTGCCAATA > NC_000913/2358‑2837 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |