| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 17,245 | C→G | intergenic (+235/‑244) | sokC → / → nhaA | small regulatory RNA antitoxin SokC/Na(+):H(+) antiporter NhaA |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 17,245 | 0 | C | G | 90.2% | 109.4 / 7.3 | 42 | intergenic (+235/‑244) | sokC/nhaA | small regulatory RNA antitoxin SokC/Na(+):H(+) antiporter NhaA |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (2/2); new base G (22/15); total (24/18) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 2.59e-01 | |||||||||||
GCTTTTCTCTATCTGCCGTTCAGCTAATGCCTGAGACAGACAGCCTCAAGCACCCGCCGCTATTATATCGCTCTCTTTAACCCATTTTGTTTTATCGATTCTAATCCTGAAGACGCCTCGCATTTTTGTGGCGTAATTTTTTAATGATTTAATTATTTAACTTTAATTTATCTCTTCATCGCAATTATTGACGACAAGCTGGATTATTTTTGAAATATTGGCCTAACAAGCATCGCCGACTGACAACAAATTAATTATTACTTTTCCTAATTAATCCCTCAGGAATCCTCACCTTAAGCTATG‑ATTATCTAGGCTTAGGGTCACTCGTGAGCGCTTACAGCCGTCAA‑AA‑A‑C‑GCATCTCACCGCTGATGGCGCAAATTCTTCAATAGCTCGTAAAAAACGAATTATTCCTACACTATAATCTGATTTTAACGATGATTCGTGCGGGGTAAAATAGTAAAAACGATCTATTCACCTGAAAGAGA > NC_000913/16999‑17480 | gCTTTTCTCTATCTGCCGTTCAGCTAATGCCTGAGACAGATAGCCTCAAGCACCCGCCGCTATTATATCGCTCTCTTTAACCCATTCTGTTTTATCGATTCTAATCCTGAAGACGCCTCGCATTTTTGTGGCGTAATTTTTTAATGATTTAATTATTTAACTTTAATTTATCTCTTTATCGCAATTATTGACGACAAGCTGGATTATTTTTGAAATATTGTCCTAACAAATAACGCCGACTGACAAGAaat > 1:151532/1‑251 (MQ=255) cTTTTCTCTATCTGCCGTTCAGCTAATGCCTGAGACAGATAGCCTCAAGCACCCGCCGCTATTATATCGCTCTCTTTAACCCATTCTGTTTTATCGATTCTAATCCTGAAGACGCCTCGCATTTTTGTGGCGTAATTTTTTAATGATTTAATTATTTAACTTTAATTTATCTCTTTATCGCAATTATTGACGACAAGCTGGATTATTTTTGAAATATTGTCCTAACAAATAACGCCGACTGACAAGAaatt > 1:401456/1‑251 (MQ=255) ttCAGCTAATGCCTGAGACAGATAGCCTCAAGCACCCGCCGCTATTATATCGCTCTCTTTAACCCATTCTGTTTTATCGATTCTAATCCTGAAGACGCCTCGCATTTTTGTGGCGTAATTTTTTAATGATTTAATTATTTAACTTTAATTTATCTCTTTATCGCAATTATTGACGACAAGCTGGATTATTTTTGAAATATTGTCCTAACAAATAACGCCGACTGACAAGAAATTAATTATTACTTTTCCt > 2:48024/1‑250 (MQ=255) ccccaaccccccGCCGCTATTATATCGCTCTCTTTAACCCATTCTGTTTTATCGATTCTAATCCTGAAGACGCCTCGCATTTTTGTGGCGTAATTTTTTAATGATTTAATTATTTAACTTTAATTTATCTCTTTATCGCAATTATTGACGACAAGCTGGATTATTTTTGAAATATTGTCCTAACAAATAACGCCGACTGACAAGAAATTAATTATTACTTTTCCTAATTAATCCCTCAGAAATCCTCACCt < 1:100885/242‑1 (MQ=255) cccAAGCACCCGCCGCTATTATATCGCTCTCTTTAACCCATTCTGTTTTATCGATTCTAATCCTGAAGACGCCTCGCATTTTTGTGGCGTAATTTTTTAATGATTTAATTATTTAACTTTAATTTATCTCTTTATCGCAATTATTGACGACAAGCTGGATTATTTTTGAAATATTGTCCTAACAAATAACGCCGACTGACAAGAAATTAATTATTACTTTTCCTAATTAATCCCTCAGAAATCCTCACCtt < 1:50099/249‑1 (MQ=255) aaGCACCCGCCGCTATTATATCGCTCTCTTTAACCCATTTTGTTTTATCGATTCTAATCCTGAAGACGCCTCGCATTTTTGTGGCGTACTTTTTTAATGATTTCATTATTTAACTTTAATTTATCTCTTCATCGCAATTATTGACGACAAGCTGGCTTATTTTTGAACTATTGGCCTAACAAGCATCGCCGCCTGACAACAAATTAATTATTACTTTTCCTAATTAATCCCTCAGGAATCCtaccctta > 2:301432/1‑242 (MQ=255) aGCACCCGCCGCTATTATATCGCTCTCTTTAACCCATTCTGTTTTATCGATTCTAATCCTGAAGACGCCTCGCATTTTTGTGGCGTAATTTTTTAATGATTTAATTATTTAACTTTAATTTATCTCTTTATCGCAATTATTGACGACAAGCTGGATTATTTTTGAAATATTGTCCTAACAAATAACGCCGACTGACAAGAAATTAATTATTACTTTTCCTAATTAATCCCTCAGAAATCCTCACCTTAAGc > 1:427373/1‑251 (MQ=255) cgcTATTATATCGCTCTCTTTAACCCATTCTGTTTTATCGATTCTAATCCTGAAGACGCCTCGCATTTTTGTGGCGTAATTTTTTAATGATTTAATTATTTAACTTTAATTTATCTCTTTATCGCAATTATTGACGACAAGCTGGATTATTTTTGAAATATTGTCCTAACAAATAACGCCGACTGACAAGAAATTAATTATTACTTTTCCTAATTAATCCCTCAGAAATCCTCACCTTAAGCTATG‑ATTAt < 1:203224/251‑1 (MQ=255) gCTCTCTTTAACCCATTCTGTTTTATCGATTCTAATCCTGAAGACGCCTCGCATTTTTGTGGCGTAATTTTTTAATGATTTAATTATTTAACTTTAATTTATCTCTTTATCGCAATTATTGACGACAAGCTGGATTATTTTTGAAATATTGTCCTAACAAATAACGCCGACTGACAAGAAATTAATTATTACTTTTCCTAATTAATCCCTCAGAAATCCTCACCTTAAGCTATG‑ATTATCTGGGCTTAggg > 1:60793/1‑251 (MQ=255) ttAACCCATTCTGTTTTATCGATTCTAATCCTTAAGACGCCTCGCATTTTTGTGGCGTAATTTTTTAATTATTTAATTATTTAACTTGAATTTATCTCATTATCGCAATTATTGACGACAAGCTGGATTATTTTTGAAATATTGGCCTAACAAATAACGCCGACTGACAAGAAATTAATTATTACTTTTCCTAATTAATCCCTCAGAAATCCTCACCTTAAGCTATG‑AATATCTGGGCTTAGGGTCAc < 2:396938/248‑1 (MQ=255) aaCCCATTCTGTTTTATCGATTCTAATCCTGAAGACGCCTCGCATTTTTGTGGCGTAATTTTTTAATGATTTAATTATTTAACTTTAATTTATCTCTTTATCGCAATTATTGACGACAAGCTGGATTATTTTTGAAATATTGTCCTAACAAATAACGCCGACTGACAAGAAATTAATTATTACTTTTCCTAATTAATCCCTCAGAAATCCTCACCTTAAGCTATG‑ATTATCTGGGCTTAGGGTCACTCGTg > 1:417908/1‑251 (MQ=255) aCCCATTCTGTTTTATCGATTCTAATCCTGAAGACGCCTCGCATTTTTGTGGCGTAATTTTTTAATGATTTAATTATTTAACTTTAATTTATCTCTTTATCGCAATTATTGACGACAAGCTGGATTATTTTTGAAATATTGTCCTAACAAATAACGCCGACTGACAAGAAATTAATTATTACTTTTCCTAATTAATCCCTCAGAAATCCTCACCTTAAGCTATG‑ATTATCTGGGCTTAGGGTCACTCGTGa < 1:79782/251‑1 (MQ=255) attctGTTTTATCGATTCTAATCCTGAAGACGCCTCGCATTTTTGTGGCGTAATTTTTTAATGATTTAATTATTTAACTTTAATTTATCTCTTTATCGCAATTATTGACGACAAGCTGGATTATTTTTGAAATATTGTCCTAACAAATAACGCCGACTGACAAGAAATTAATTATTACTTTTCCTAATTAATCCCTCAGAAATCCTCACCTTAAGCTATG‑ATTATCTGGGCTTAGGGTCACTCGTGAgcgc > 1:37814/5‑251 (MQ=255) tttATCGATTCTACTCCTGAAGACGCCTCGCATTTTTGTGGCGTAATTTTTTAATGATTTAATTATTTAACTTTAATTTATCTCTTTATCGCAATTATTGACGACAAGCTGGATTATTTTTGAAATATTGTCCTAACAAATAACGCCGACTGACAAGAAATTAATTATTACTTTTCCTAATTAATCCCTCAGAAATCCTCACCTTAAGCTATG‑ATTATCTGGGCTTAGGGTCACTCGTGAGCGCTTACAGc > 2:330748/1‑251 (MQ=255) tttATCGATTCTAATCCTGACGCCGCCTCGCATTTTTGTGGCGTAATTTTTTACTGATTTAATTATTTAACTTTAATTTATCTCTTTATCGCAATTATTGACGACAAGATGGATTATTTTTGAAATATTGTCCTAACAAATAACGCCGACTGACAAGAAATTAATTATTACTTTTCCTATTTAATCCCTCAGAAATCCTAACCTTAAGCTATG‑ATTATCTTGCCTTAGGGTCACTCGTGAGCGCTTAccgc > 2:91218/1‑248 (MQ=255) tATCGATTCTAATCCTGAAGACGCCTCGCATTTTTGTGGCGTAATTTTTTAATGATTTAATTATTTAACTTTAATTTGTCTCTTTATCGCAATTATTGACGACAAGCTGGATTATTTTTGAAATATTGTCCTAACAAATAACGCCGACTGACAAGAAATTAATTATTACTTTTCCTAATTAATCCCTCAGAAATCCTCACCTTAAGCTATG‑ATTATCTGGGCTTAGGGTCACTCGTGAGCGCTTACAGCCg > 2:406917/1‑251 (MQ=255) aaGACGCCTCGCATTTTTGTGGCGTAATTTTTTAATGATTTAATTATTTAACTTTAATTTATCTCTTTATCGCAATTATTGACGACAAGCTGGATTATTTTTGAAATATTGTCCTAACAAATAACGCCGACTGACAAGAAATTAATTATTACTTTTCCTAATTAATCCCTCAGAAATCCTCACCTTAAGCTATG‑ATTATCTGGGCTTAGGGTCACTCGTGAGCGCTTACAGCCGTCaa‑aa‑aactcatctc > 1:505923/1‑241 (MQ=255) gCCTCGCATTTTTGTGGCGTAATTTTTTAATGATTTAATTATTTAACTTTAATTTATCTCTTTATCGCAATTATTGACGACAAGCTGGATTATTTTTGAAATATTGTCCTAACAAATAACGCCGACTGACAAGAAATTAATTATTACTTTTCCTAATTAATCCCTCAGAAAGCCTCACCTTAAGCTATG‑ATTATCTGGGCTTAGGGTCACTCGTGAGCGCTTACAGCCGTCAA‑AA‑AAC‑TCATCTCACCGCt < 2:417908/251‑1 (MQ=255) tttttAATTATTTAATTATTTAACTTTAATTTAACTCTTTAACGTAATTATTGACGACAATCTGGATTATTTTTGAAATATTGTCCTAACAAATAACGCCGATTGACAATAAATTAATTATTACTTTTCCTAATTAATCCCTCAGAAATCCTCTCCTTAATCTATG‑ATTATCTGGGCTTAGGTTCACTCGTGAGCGTTTACAGCCGTCAA‑AA‑AAC‑TCATCCCACCGTTGATGTCGCAAATTCTTCAAtgg < 2:494893/250‑3 (MQ=255) aTGATTTAATTATTTAACTTTAATTTATCTCTTTATCGCAATTATTGACGACAAGCTGGATTATTTTTATAATATTGTCCTAACAAATAACGCCGACTGACAAGAAATTAATTATTACTTTTCCTAATTAATCCCTCAGAAATCCTCACCTTAAGCTATG‑ATTATCTGGGCTTAGGGTCACTCGTGAGCGCTTACAGCCGTCAA‑AA‑AAC‑TCATCTCACCGATGATGGCGCACATTATTCAATGGATCGTa > 2:397388/1‑250 (MQ=255) attTAACTTTAATTTATCTCTTTATCGCAATTATTGACGACAAGCTTGATTATTTTTGAAATATTGTCCAAACAAATAACGCCGACTGACAAGAAATTAATTATTACTTTTCCTAATTAATCCCTCAGAAATCCTCACCGTAAGCTATG‑ATTATCGGGGCTTAGGGTCACTCGTGAGCGCTGTCAGCCGTCAA‑AA‑AAC‑ACATCTCTCCGCGGATGGCGGAAATTCTTCAATGGATCGTAAAAAACGagtt < 2:308009/250‑4 (MQ=255) attTAACTTTAATTTATCTCTTTATCGCAATTATTGACGACAAGCTGGATTATTTTTGAAATATTGTCCTAACAAATAACGCCGACTGACAAGAAATTAATTATTACTTTTCCTAATTAACCCCTCAGAAATCCTCACCTTAAGCTATG‑ATTATCTGGGCTTAGGGTCACTCGTGAGCGCTTACAGCCGTCAA‑AA‑AAC‑TCATCTCACCGCTGATGGCGCAAATTCTTCAATGGATCGTAAAAAACGagtt < 2:151532/250‑4 (MQ=255) aCTTTAATTTATCTCTTTATCGCAATTATTGACGACAAGCTGGATTATTTTTGAAATATTGTCCTAACAAATAACGCCGACTGACAAGAAATTAATTATTACTTTTCCTACTTAATCCCTCAGAAATCCTCACCTTAAGCTATA‑ATTATCTGGGCTTAGGGTCACTCGTGAGCGCTTACAGCCGTCAA‑AACA‑C‑TAATATCACCGCTGATGGCACAAATTCTTCAATGGATCGTAAAAAACgtgtaattcct > 2:278499/1‑241 (MQ=255) ttATCTCTTTATCGCAATTATTGACGACAAGCTGGATTATTTTTGTAATCTTGTCCTAACAAATAACGCCGACTGACAAGAAATTAATTATTACTTTTCCTAATTAATCCCTCAGAAATCCTCACCTTAAGCTATG‑ATTATCTGGGCTTAGGGTCACTCGTGAGCGCTTACAGCCGTCAA‑AA‑AAC‑TCATCTCACCGCTGATGACGCAAATTCTTCAATGGCTCGTAAAAAACGAGTTATTCATACACtat > 2:426814/1‑250 (MQ=255) ctctTTATCGCACATATTGACGACAAGCTGGATTATTTTTGAAATATTGTCATAACAAATAACGCCGCCTGACAAGAAATTAATTATTACTTTTCCTAATTAATCCCTCAGAAATCCTCCCCTTAAGCTATG‑ATTATCTGGGCTTAGGGTCACTAGTGAGCGCTTACAGCCGTCAA‑AA‑A‑CCTCATATCACCGCTGATGGCGCAAATTCTTCAATGGTTCGAAAACAAAGAGTTATTCCTACACTATCATCt > 2:378540/1‑251 (MQ=255) agcGCAAATATTGACGACAAGCTGGATTATTTGTGTAAGATTGTCCTAACAAATAACGCCGACTGACAAGAAATTAATTATTACTTTTCCTAATTAATCCCTCAGAAATCCTCACCTTAAGCTATG‑ATTATCTGTGCTTAGGGTCACTCGTGAGCGCTTACAGCCGTCAA‑AA‑AAC‑TCATCTCACCGCTGATGGCGCAAATTCTTCAATGGATCGTAAAAAACGAGTTATTCCTACACTATAATCTGAtgt < 2:204937/248‑3 (MQ=255) aTCGCAATTATTGACGACAAGATGGATTATTTTTGAAATATTGTCCTAACAAATAACGCCGACTGACAAGAAATTAATTATTACTTTTCCTAATTAATCCCTCAGAAATCCTCACCTTAAGCTATG‑ATTATCTGGGCTTAGGGTCACTCGTGAGCGCTTACAGCCGTCAA‑AA‑AAC‑TCATCTCACCGCTGATGGCGCAAATTCTTCAATGGATCGTAAAAAACGAGTTATTCCTACACTATAATCTGAtttt > 2:323167/1‑251 (MQ=255) ttattGACGACAAGCTGGATTATTGTTGAAATATTGTCCTAACAAATAACGCCGACTGACAAGAAATTAATTATTACTTTTCCTAATTAATCCCTCAGACATCCTCACATTAAGCTATG‑ATTATCTGGACTTAGGGTCACTCGTGAGCGCTTACATCCGTCAA‑AA‑AAC‑TCATCTCACCGCTGATGGCGCAAATTCTTCAATGGATCGTAAAAAACTAGTTATTCCTACACTATAATCTGATTTTAACgatg > 2:378945/1‑251 (MQ=255) cAAGCTGGATTATTTTTGAAATATTGCCCTACCAATTACCGCCGCCTGCCAAGAAATTAAT‑ATTACTTTTCCTAATTAATCCCTCAGAAATCCTCACCTTAAGCTATG‑ATTATCTGGGCTTAGGGTCACTCGTGAGCGCTTACAGCCGTCAA‑AA‑AAC‑TCATCTCACCGCTGATGGCGCAAATTCTTCAATGGATCGTAAAAAACGAGTTATTCCTACACTATAATCTGATTTTAACGATGATTTGTGCggg < 1:223063/251‑1 (MQ=255) aaaGCTGGATTATTTTGTAAAAATTTTCCTAACAAATAACGCCGACTGACAAGAAATTAATTATTACTTTGCCTAATTAATCCCTCAGAAATCCTCACCTTAAGC‑ATGGATTATCTGGGCTTAGGGGCACTCGTGAGCGCTTACAGTCGTCAA‑AA‑AAC‑GCATCTCCCCGCTGATGGCGCAAATTCTTCAATGGATCGTAAAAAACGAGTTATTCCTACACTATAATCTGATTTTAACGATGATTTGTGCgg < 2:303611/250‑1 (MQ=255) tGGATTATTTTTGAAATATTGTCCTAACAAATAACGCCGACTGACAAGAAATTAATTATTACTTTTCCTAATTAATCCCTCAGAAATCCTCACCTTAAGCTATG‑ATTATCTGGGCTTAGGGTCACTCGTGAGCGCTTACAGCCGTCAA‑AA‑AAC‑TCATCTCACCGCTGATGGCGCAAATTCTTCAATGGATCGTAAAAAACGag > 1:56401/1‑202 (MQ=255) tGGATTATTTTTGAAATATTGTCCTAACAAATAACGCCGACTGACAAGAAATTAATTATTACTTTTCCTAATTAAGCCCTCAGAAATCCTCACCTTAAGCTATG‑ATTATCTGGGCTTAGGGTCACTCGTGAGCGCTTACAGCCGTCAA‑AA‑AAC‑TCATCTCACCGCTGATGGCGCAAATTCTTCAATGGATCGTAAAAAACGag < 2:56401/203‑2 (MQ=255) attattTTTGAAATATTGTCCTAACAAATAACGCCGACTGACAAGAAATTAATTATTACTTTTCCTAATTAATCCCTCAGAAATCCTCACCTTAAGCTATG‑ATTATCTGGGCTTAGGGTCACTCGTGAGCGCTTACAGCCGTCAA‑AA‑AAC‑TCATCTCACCGCTGATGGCGCAAATTCTTCAATGGATCGTAAAAAACGAGTTATTCCTACACTATAATCTGATTTTAACGATGATTTGTGCGGGGTAAAAt < 1:341175/251‑1 (MQ=255) ttattTTTGAAATCTTGTCCTAACAAATAACGCCGAATGAAAAGAACTTAATTATTACTTTTCCTAATTAATCCCTCAGAAATCCTCACCTTAAGCTATA‑ATTATCTGGGATTAGGGTCACTCGTGAGCGCTTACAGCCGTCAACAA‑A‑C‑TCATCTCACCGCTGATGGCGCAACTTCTTCAATGGATCGTAAAAAACGTGTTATTCCTACACTATAACATGATTTTAACgatgctttattcggggaacaat > 1:365850/1‑232 (MQ=255) tttGAAATATTGTCCTAACAAATAACGCCGACTGACAAGAAATTAATTATTACTTTTCCTAATTAATCCCTCAGAAATCCTCACCTTAAGCTATG‑ATTATCTGGGCTTAGGTTCACTCGTGAGCGCTTACAGCCGTCAA‑AA‑AAC‑TCATCTCACCGCTGATGGCGCAAATTCTTCAATGGATCGTAAAAAACGAGTTATTCCTACACTATAATCTGATTTTAACGATGATTTGTGCGGGGAAAAATAGTaa > 1:293822/1‑250 (MQ=255) tGAAATATTGGCCTAACAAGCATCGCCGACTGACAACAAATTAATTATTACTTTTCCTAATTAATCCCTCAGGAATCCTCACCTTAAGCTATG‑ATTATCTAGGCTTAGGGTCACTCGTGAGCGCTTACAGCCGTCAA‑AA‑A‑C‑GCATCTCACCGCTGATGGCGCAAATTCTTCAATAGCTCGTAAAAAACGAATTATTCCTACACTATAATCTGATTTTAACGATGATTCGTGCGGGGTAAAATAGTaaaaa < 1:190485/250‑1 (MQ=255) atTGTCCTAACAAATAACGCCGACTGACAAGAAATTAATTATTACTTTTCCTAATTAATCCCTCAGAAATCCTCACCTTAAGCTATG‑ATTATCTGGGCTTAGGGACACTCGTGAGCGCTTACAGCCGTCAA‑AATA‑C‑TCATCTCACCGCTGATGGCGCAAATTCTTCAATGGATCGTAAAAAACGAGATATTCCTACACTATAATCTGATTTTAACGATGATTTGTGCGGGGTAGACTAGTAAACACGATCt > 1:244306/1‑251 (MQ=255) acaaatcatgCCGACTGACAAGAAATTACTTATTACCCTTCCTAATTAACCCCTCACAAATACTCACCTTAAGCTATG‑ATTTTCTGGGCTTAGGCTCACTAGTGACCGCTTACAGCCGTCAA‑AA‑A‑CATCATCTCACCGCTGACGGCGCAAATTCTTCAATGGATCGTAAAAAAAGAATTATTCCTACACTATAATCTGATTTTAACAATGATTTATGCGGGGTAAACTAGTAAAAAAGCTCTATCCACCTg > 2:236474/10‑251 (MQ=255) aaaaataacGCCGACTGACAAGAAATTAATTATTACTTTTCCTAATTAATCCCTCAGAAATCCTCACCTTAAGCTATG‑ATTATCTGGGCTTAGGGTCACTCGTGAGCGCTTACAGCCGTCAA‑AA‑AAC‑TCAACTCACCGCTGATGGCGCAAATTCTTCAATGGATCGTAAAAAACGAGTTATTCCTACACTATAATCTGATTTTAACGATGATTTGTGCGGGGTAAAATAGTAAAAACGATCTATTCACCTg < 2:427193/243‑1 (MQ=255) cAAGCATCGCCGACTGACAACAAATTAATTATTACTTTTCCTAATTAATCCCTCAGGAATACTCACCTTAAGCTATG‑ATTATCTAGGCTTAGGGTCa > 2:53687/1‑97 (MQ=255) cAAGCATCGCCGACTGACAACAAATTAATTATTACTTTTCCTAATTAATCCCTCAGGAATACTCACCTTAAGCTATG‑ATTATCTAGGCTTAGGGTCa < 1:53687/97‑1 (MQ=255) acGCCGACTGACAAGAAAGTAATTATTACTTTTCCTAATTAATCCCTCAGAAATCCTCACCTTAAGCTATG‑ATTATCTGGGCTTAGGGTCACTCGTGAGCGCTTACAGCCGTCAA‑AA‑AAC‑TCATCTCACCGCTGATGGCGCAAATTCTTCAATGGATCGTAAAAAACGAGTTATTCCTACACTATAATCTGATTTTAACGATGATTTGTGCGGGGTAAAATAGTAAAAACGATCTATTCACCTGAAAgaga < 1:483827/250‑1 (MQ=255) | GCTTTTCTCTATCTGCCGTTCAGCTAATGCCTGAGACAGACAGCCTCAAGCACCCGCCGCTATTATATCGCTCTCTTTAACCCATTTTGTTTTATCGATTCTAATCCTGAAGACGCCTCGCATTTTTGTGGCGTAATTTTTTAATGATTTAATTATTTAACTTTAATTTATCTCTTCATCGCAATTATTGACGACAAGCTGGATTATTTTTGAAATATTGGCCTAACAAGCATCGCCGACTGACAACAAATTAATTATTACTTTTCCTAATTAATCCCTCAGGAATCCTCACCTTAAGCTATG‑ATTATCTAGGCTTAGGGTCACTCGTGAGCGCTTACAGCCGTCAA‑AA‑A‑C‑GCATCTCACCGCTGATGGCGCAAATTCTTCAATAGCTCGTAAAAAACGAATTATTCCTACACTATAATCTGATTTTAACGATGATTCGTGCGGGGTAAAATAGTAAAAACGATCTATTCACCTGAAAGAGA > NC_000913/16999‑17480 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |