| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 1268866 = | 35 (0.740) | 3 (0.060) | 3/480 | 4.7 | 6.5% | coding (702/855 nt) | kdsA | 3‑deoxy‑D‑manno‑octulosonate 8‑phosphate synthase |
| ? | NC_000913 | = 4292560 | 52 (1.110) | coding (1049/1659 nt) | nrfE | putative cytochrome c‑type biogenesis protein NrfE | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
GCTGTCGCTGCTGGGCACCTTAATTGTCCGTTCTGGCATTCTGGTTTCGGTTCATGCGTTCGCGCTGGATAACGTCCGCGCCGTGCCGTTGTTCAGCCTGTTTGCACTGATTAGCCTTGCGTCTCTGGCTCTGTATGGCTGGCGAGCGCGGGACGGTGGCCCGGCGGTGCATTTTTCGGGGTTATCGCGGGAAATGTTAATCCTCGCTACGCTGTTGCTGTT‑TTGCGCAGTGCTACTGATCGTGCTGGTGGGAACGCTTTATCCGATGATTTACGGCCTGCTGGGCTGGGGACGCCTCTCCGTTGGCGCGCC‑GTATTTTAACCGCGCGACGTTACCGTTTGGTCTGTTGATGCTGGTGGTGATTGTGCTGGCGACGTTT‑GTCTCTGGCAAACGCGTGCAGCTTCCGGCGCTGGTAGCTCATGCGGGCGTGCTGTTATTTGCCGCTGGGGTCGTGGTCTCCAGCGTCAGCCGTCAGGAGATCAGCCTGAATTTACAGCC > NC_000913/4292312‑4292809 | gcggTCGCTGCTGGGCACCTTAATTGTCCGTTCTGGCATTCTGGTTTCGGTTCATGCGTTCGCGCTGGATAACGTCCGCGCCGTGCCGTTGTTCAGCCTGTTTGCACTGATTAGCCTTGCGTCTCTAGCTCTGTATGGCTGGCGAGCGCGGGACGGTGGCCCGGCGGTGCATTTTTCGGGGTTATCGCGGGAAATGTTAATCCTCGCTACGCTGTTGCTGTT‑TTGCGCAGTGCTACTGATCGTGCtggtgg < 2:89902/248‑1 (MQ=255) gTCGCTGCTGGGCACCTTAATTGGCCGTTCTGGCATTCTGGTTTCGGTTCATGCGTTCGCGCTGGATAACGTCCGCGCCGTGCCGTTGTTCAGCCTGTTTGCACTGATTAGCCTTGCGTCTCTGGCTCTGTATGGCTGGCGAGCGCGGGACGGTGGCCCGGCGGTGCATTTTTCGGGGTTATCGCGGGAAATGTTAATCCTCGCTACGCTGTTGCTGTT‑TTGCGCAGTGCTACTGATCGTGCTGGTGGGaa < 1:384978/251‑1 (MQ=255) cGCTGCTGGGCTCCTTAATTGTCCGTTCTGGCATTCTGGTTTCGGTTCATGCGTTCGCGCTGGATAACGTCCGCGCCGTGCCGTTGTTCAGCCTGTTTGCACTGATTAGCCTTGCGTCTCTGGCTCTGTATGGCTGGCGAGCGCGGGACGGTGGCCCGGCGGTGCATTTTTCGGGGTTATCGCGGGAAATGTTAATCCTCGCTACGCTGTTGCTGTT‑TTGCGCAGTGCTACTGATCGTGCTGGTGGGAACg < 1:288933/251‑1 (MQ=255) cggctgGGCACCTTAATTGTCCGTTCTGGCATTCTGGTTTCGGTTCATGCGTTCGCGCTGGATAACGTCCGCGCCGTGCCGTTGTTCAGCCTGTTTGCACTGATTAGCCTTGCGTCTCTGGCTCTGTATGGCTGGCGAGCGCGGGACGGTGGCCCGGCGGTGCATTTTTCGGGGTTATCGCGGGAAATGTTAATCCTCGCTACGCTGTTGCTGTT‑TTGCGCAGTGCTACTGATCGTGCTGGTGGGAACGCt < 1:337643/249‑1 (MQ=255) ctgGGCACCTTAATTGTCCGTTCTGGCATTCTGGTTTCGGTTCATGCGTTCGCGCTGGATAACGTCCGCGCCGTGCCGTTGTTCAGCCTGTTTGCACTGATTAGCCTTGCGTCTCTGGCTCTGTATGGCTGGCGAGCGCGGGACGGTGGCCCGGCGGTGACTTTTTCGGGGTTATCGCGGGAAATGTTAATCCTCGCTACGCTGTTGCTGTT‑TTGCGCCGTGCTACTGATCGTGCTGGTGGGGACGAtttt > 2:405799/1‑250 (MQ=255) ctgGGCACCTTAATTGTCCGTTCTGGCATTCTGGTTTCGGTTCATGCGTTCGCGCTGGATAAAGTCCGCGACGTGCCGTTGTTCAGCCTGTTTGCACTGATTAGCCTTGCGTCTCTGGCTCTGTATGGCTGGCGAGCGCGGGACGGTGGCCCGGCGGTGCATTTTTCGGGGTTATCGCGGGAAATGTTAATCCTCGCTACGCTGTTGCTGTT‑TTGCGCAGTGCTACTGATCGTGCTGGTGGGAACGCtttt > 1:318682/1‑250 (MQ=255) ttAATTGTCCGTTCTGGCATTCTGGTTTCGGTTCATGCGTTCGCGCTGGATAACGTCCGCGCCGTGCCGTTGTTCAGCCTGTTTGCACTGATTAGCCTTGCGTCTCTGGCTCTGTATGGCTGGCGAGCGCGGGACGGTGGCCCGGCGGTGCATTTTTCGGGGGTATCGCGGGGAATGTTAATCCTCGCTACGCTGTTGCTGTT‑TTGCGCAGTGATACTGATCGTGCTGGTGGGAACGCTTTATCCgatgat > 1:397446/1‑251 (MQ=255) aTTGTACGTTCTGGCATTATGGTTTCGGTTCATGCGTTCGCGCTGGATAACGTCCGCGCCGTGCCGTTGTTCAGCCTGTTTGCACTGATTAGCCTTGCGTCTCTGGCTCTGTATGGCTGGCGAGCGCGGGACGGTGGCCCGGCGGAGCATTTTTCGGGGTTTTCGCGGGGACTTTTGATCCTCGCTACGCTGTTGCTGTT‑TTGCGAAGTGCTACTTGTCTTGCTGGTGGGGACGCTTTATCCGTTGAtttt > 2:316734/1‑250 (MQ=255) tGTCCGTTCTGGCATTCTGGTTTCGGTTCATGCGTTCGCGCTGGATAACGTCCGCGCCGTGCCGTTGTTCAGCCTGTTTGCACTGATTAGCCTTGCGTCTCTGGCTCTGTATGGCTGGCGAGCGCGGGACGGTGGCCCGGCGGTGCATTTTTCGGGGTTATCGCGGGAAATGTTAATCCTCGCTACGCTGTTGCTGTT‑TTGCGCAGTGCTACTGATCGTGCTGGTGGGAACGCTTTATCCGATGATTTAc < 2:130819/250‑1 (MQ=255) tCCGTTCTGGCATTCTGGTTTCGGTTCATGCGTTCGCGCTGGATAACGTCCGCGCCGTGCCGTTGTTCAGCCTGTTTGCACTGATTAGCCTTGCGTCTCTGGCTCTGTATGGCTGGCGAGCGCGGGACGGTGGCCCGGCGGTGCATTTTTCGGGGTTATCGCGGGAAATGTTAATCCTCGCTACGCTGTTGCTGTT‑TTGCGCAGTGCTACTGATCGTGATGGTGGGACCGCTTTATCAGCTGATTTTCGGc > 2:415631/1‑251 (MQ=255) cGTTATGGCATTCTGGTTTCGGTTCCTGCGTTCGCGCTGGATAACGTCCGCGCCGTGCCGTTGTTCAGCCTGTTTGCACTGATTAGCCTTGCGTCTCTGGCTCTGTATGGCTGGCGAGCGCGGGCCGGTGGCCCGGCGGTGCATTTTTCTGGGTTATCGCGGGAATTGATAATCCTCGCTACGCTGTTGCGGTT‑TTGCGCAGTGCTACAGAACGTGCTGGGGGTGACACTTTCTCCGGTGTTTTACGGCct > 2:333743/1‑251 (MQ=255) tGGCATTCTGGTTTCGGTTCATGCGTTCGCGCTGGATAACGTCCGCGCCGTGCCGTTGTTATGCCTGTTTGCACTGGTTAGCCTTGCGTCTCTGGCTCTGCATGGCTGGCGAGCGCGGGACGGTGGACCGGCGGTGCCTTTTTAGGGGTTATCGCGGGAAATGTTTATCCTCGCCACTCTGTTGCTGTT‑TTGCGCGGTGCTAACGATCGGGCTGGCGGGCCCGCTTTATCCGATGATTTACGGGCTgatgg > 2:156599/1‑251 (MQ=255) tgCATTCTGGTTTCGGTTCATGCGTTCGCGCTGTATAACGTCCGCGCCGTGCCGTTGTTCAGCCGGTTTGCACTGATTAGCCTTGCGTCTCTGGCTCTGTATGGCTGGCGAGCGCGGGACGGTGGCCCGGCGGTGCATTTTGCGGGGTTATCGCGGGAAATGTTAATCCTCGCTACGCTGTTGCTGTT‑TTGCGCAGTTCTACTGATCGTGCTGGTGGGAACGCTTTATCCGATGATTTACGGCctgctg < 1:307852/248‑1 (MQ=255) gCATTCTGGTTTCGGTTCATGCGTTCGCGCTGGATAACGTCCGCGCCGTGCCGTTGTTCAGCCTGTTTGCACTGATTAGCCTTGCGTCTCTGGCTCTGTATGGCTGGCGAGCGCGGGACGGTGGCCCGGCGGTGCATTTTTCGGGGTTATCGCGGGAAATGTTAATCCTCGCTACGCTGTTGCTGTT‑TTGCGCAGTGCTACTGATCGTGCTGGTGGGAACGCTTTATCCGATGATTTACGGCCTgctgggc > 1:44173/1‑251 (MQ=255) aTTCTGGTTTCGGTTCATGCGTTCGCGCTGGATAACGTCCGCGCCGTGCCGTTGTTCAGCCTGTTTGCACTGATTAGCCTTGCGTCTCTGGCTCTGTATGGCTGGCGAGCGCGGGACGGTGGCCCGGCGGTGCATTTTTCGGGGTTATCGCGGGAAATGTTAATCCTCGCTACGCTGTTGCTGTT‑TTGCGCAGTGCTACTGATCGTGCTGGTGGGAACGCTTTATCCGATGATTTACGGCCTgctgggctg < 1:218217/251‑1 (MQ=255) tGGTTTCGGTTCATGCGTTCGCGCTGGATAACGTCCGCGCCGTGCCGTTGTTCAGCCTGTTTGCACTGATTAGCCTTGCGTCTCTGGCTCTGTATGGCTGGCGAGCGCGGGACGGTGGCCCGGCGGTGCATTTTTCGGGGCTATCGCGGGAAATGTTAATCCTCGCTACGCTGTTGCTGGT‑TTGCGCAGTGCTACTGGTCGCGCTGGTCGGAACGCTTTATCCGATGATTTACGGCCTGCtggggtggggg > 2:471944/1‑250 (MQ=255) cGGTTCATGCGATCGCGCTGGATAACGTCCGCGCCGCGCCGTTGTTAAGCCTGTTTGCACTGATTAGCCTTGCGTCTCTGGCTCTGTATGGCTGGCGAGCGCGTGACGGTGGCCCGGCGGTGCATTTTTCGGGGTTATCGCGGGAAATGTTAATCCTCGCGACGCTGTTGCTGTT‑TTGCGCAGTGCGAATGATAGTTCTGGTGGTAAGGCTTTCTACGCTGATTTAGGGCctgcgtggttggagaggcctc > 2:76353/1‑234 (MQ=255) ggTTCATGCGTTCGCGCTGGATAACGTCCGCGCCGTGCCGTTGTTCAGCCTGTTTGCACTGATTAGCCTTGCGTCTCTGGCTCTGTATGGCTGGCGAGCGCGGGACGGTGGCCCGGCGGTGCATTTTTCGGGGTTATCGCGGGAAATGTTAATCCTCGCTACGCTGTTGCTGTT‑TTGCGCAGTGCTACTGATCGTGCTGGTGGGAACGCTTTATCCGATGATTTACGGCCTGCTGGGCTGGGGCCGCctct > 1:36125/1‑251 (MQ=255) aTGCGTTCGCGCTGGATAACGTCCGCGCCGTGCCGTTGTTCAGCCTGTTTGCACTGATTAGCCTTGCGTCTCTGGCTCTGTATGGCTGGCGAGCGCGGGACGGTGGCCCGGCGGTGCATTTTTCGGGGTTATCGCGGGAAATGTTAATCCTCGCTACGCTGTTGCTGTT‑TTGCGCAGTGCTACTGATCGTGCTGGTGGGAACGCTTTATCCGATGATTTACGGCCTGCTGGGCTGGGGACGCCTCTCCGtt > 1:102796/1‑251 (MQ=255) cGTTCGCGCTGGATAACGTCCGCGCCGAGCCGTTGTTCAGCCTGTTTGCACTGATTAGCCTTGCGTCTCTGGCTCTGTATGGCTGGCGAGCGCGGGACGGTGGCCCGGCGGTGCATTTTTCGGGGTTATCGCGGGAAATGTTAATCCTCGCTACGCTGTTGCTGTT‑TTGCGCAGTGCTACTGATCGTGCTGGTGGGAACGCTTTATCCGATGATTTACGGCCTGCTGGGCTGGGGACGCCTCTCCGTTGgc < 2:348461/251‑1 (MQ=255) cgcgCTGGATAACGTCCGCGCCGTGCCGTTGTTCAGCCTGTTTGCACTGATTAGCCTTGCGTCTCTGGCTCTGTATGGCTGGCGAGCGCGGGACGGTGGCCCGGCGGTGCATTTTTCGGGGTTATCGCGGGAAATGTTAATCCTCGCTACGCTGTTGCTGTT‑TTGCGCAGTGCTACTGATCGTGCTGGTGGGAACGCTTTATCCGATGATTTAAGGCCTGCTGGGCTGGGGACGCCTCTCCGTTGgcgcgc > 1:15207/1‑251 (MQ=255) tAACGTCCGCGCCGTGCCGTTGTTCAGCCTGTTTGCACTGATTAGCCTTGCGTCTCTGGCTCTGTATGGCTGGCGAGCGCGGGACGGTGGCCCGGCGGTGCATTTTTCGGGGTTATCGCGGGAAATGTTAATCCTCGCTACGCTGTTGCTGTT‑TTGCGCAGTGCTACTGATCGTGCTGGTGGGAACGCTTTATCCGATGATTTACGGCCTGCTGGGCTGGGGACGCCTCTCCGTTGGCGCGCC‑GGAtttt > 1:493163/1‑250 (MQ=255) ccgccgttccgtgccgtTGTGCTGCCTGTTTGCACTGATGAGCCGTGCGTCTCTGGCTCTGTATGGCTGGCGTGCGCGGGGCGGTGGCCCGGCGGTGCATTTTTCGGGGTTATCGCGGGAAATGTTAATCCGCGCTTCGTTGCTGCTGTT‑TTTCGCAGTGCTTCTGATCGTGCTGGTGGGAACGCTTTATCCGATGATTTACGGCCTGCTGGGCTGGGGACGCCTCTCCGTTGCCGCGCC‑GTACTTTaccc < 2:438528/243‑4 (MQ=255) cGTCCGCGCCGTGCCGTTGTTCAGCCTGTTTGCACTGATTAGCCTTGCGTCTCTGGCTCTGTATGGCTGGCGAGCGCGGGACGGTGGCCCGGCGGGGCATTTTTCGGGGTTATCGCGGGGAATGTTAATCCTCGCTACCCCGTTGCTGTTCTTG‑GCGGGCCTACTGATCGGGCTGGTGGGCACGCCTTTTTCGATGATTTTCGGCCCGCTAAGCTGGTGTCGCCACTCCGTTGGCGCGAC‑Gtgtcgtgacc > 2:13116/1‑242 (MQ=255) cgcCGTGCCGTTGTTCAGCCTGTTTGCACTGATTAGCCTTGCGTCTCTGGCTCTGTATGGCTGGCGAGCGCGGGACGGTGGCCCGGCGGTGCATTTTTCGGGGTTATCGCGGGAAATGTTAATCCTCGCTACGCTGTTGCTGTT‑TTGCGCAGTGCTACTGATCGTGCTGGTGGGAACGCTTTATCCGTTGATTTACGGCCTGCTGGGCTGGGGACGCCTCTCCGTTGGCGCGCC‑GTTTTTTAACcgcgcgg > 2:387762/1‑250 (MQ=255) tgttCAGCCTGTTTGCACTGATTAGCCTTGCGTCTCTGGCTCTGTATGGCTGGCGAGCGCGGGCCGGTGGCCCGGCGGTGCCTTTTTCGGGGTTATCGCGGGAAATGGTTATCCTCGCTACGCTGTTGCTGTT‑TTGCGCAGTGCTACTGTTCGTGCTGGTGGGAACGCTTTATCCGATGCTTTACGGCCTGCTGGGCTGGGGGCGCCTCTCCGGTGGCGCGCC‑GGATTTTAACCGCGGGGCGTTACCGttt > 2:14098/1‑251 (MQ=255) ccTGTTTGCACTAATTAGCCTTGCGTCTCTGGCTCTGTATGGCTGGCGAGCGCGGGACGGTGGCCCGGCGGTGCATTTTTCGGGGTTATCGCGGGACATGTTAATCCTCGCTACGCTGTTGCTGTT‑TTGCGCAGGGCTACTGATCGTGCTGGTGGGTACGCTTTATCCGATGATTTTCGGCATGCTGGGCTGGGGACGCCTCTCCGTTGGCGAGCC‑GTATTTTAACCGCGCGACGTTAACGTTTGGTCTGt > 1:490228/1‑251 (MQ=255) cACTGATTAGCCTTGCGTCTCTGGCTCTGTATGGCTGGCGAGCGCGGGACGGTGGCCCGGCGGTGCCTTTTTCGGGGTTATCGCGGGGAATGTTAATCCTCGCTACGCTGTTGCTGTT‑TTGCGCAGTGCTACTGATCGTGCTGGTGGGAACGCTTTATCCGATGATTTACGGCCTGCTGGGCTGGGGGCGCCTCTCCGTTGGC‑CGCCCGTCTTTTAACCGCGCGCCCGTACCGTTTTGTCTGTTGATGCtg > 2:232430/1‑251 (MQ=255) tAGCCTTGCGTCTCTGGCTCTGTATGGCTGGCGAGCGCGGGACGGTGGCCCGGCGGTGCATTTTTCGGGGTTATCGCGGGAAATGTTAATCCTCGCTACGCTGTTGCTGTT‑TTGCGCAGTGCTACTGATCGTGCTGGTGGGAACGCTTTATCCGATGATTTACGGCCTGCTGGGCTGGGGACGCCTCTCCGTTGGCGCGCC‑GTATTTTAACCGCGCGACGTTACCGTTTGGTCTGTTGATGCTGgtggtg < 1:102381/250‑1 (MQ=255) tgcttcgtgggCTCGGTATGGCTGGCGAGCGCGGGGCGGTGGCCCGGGGGTGCATTTTTCGGGGTTATCGCGGGAAATGTTAAGCCGCGCTACGCTGTTGCTGTT‑TTGCGCAGTGCTACTGATCGTGCTGGTGGGAACGCTTTATCCGATGATTTACGGCCTGCTGGGCTGGGGACGCCTCTCCGTTGGCGCGCC‑GTATTTTAACCGCGCGACGTTACCGTTTGGTCTGTTGATGCTGGTGGTGATtgt < 2:137042/240‑1 (MQ=255) gTCTCTGGCTCTGTATGGCTGGCGAGCGCGGGACGGTGGCCCGGCGGTGCATTTTTCGGGGTTATCGCGGGAAATGTTAATCCTCGCTACGCTGTTGCTGTT‑TTGCGCAGTGCTACTGATCGTGCTGGTGGGAACGCTTTATCCGATGATTTACGGCCTTCTGGGCTGGGGACGCCTCTcc > 2:179571/1‑181 (MQ=255) gTCTCTGGCTCTGTATGGCTGGCGAGCGCGGGACGGTGGCCCGGCGGTGCATTTTTCGGGGTTATCGCGGGAAATGTTAATCCTCGCTACGCTGTTGCTGTT‑TTGCGCAGTGCTACTGATCGTGCTGGTGGGAACGCTTTATCCGATGATTTACGGCCTGCTGGGCTGGGGACGCCTCTcc < 1:179571/181‑1 (MQ=255) ctctGGCTCTGTATGGCTGGCGAGCGCGGGACGGTGGCCCGGCGGTGCATTTTTCGGGGTTATCGCGGGAAATGTTAATCCTCGCTACGCTGTTGCTGTT‑TTGCGCAGTGCTACTGATCGTGCTGGTGGGAACGCTTTATCCGATGATTTACGGCCTGCTGGGCTGGGGACGCCTCTCCGTTGGCGCGCC‑GTATTTTAACCGCGCGACGTTAc > 1:493749/1‑213 (MQ=255) cctGTATGGCTGGCGAGCGCGGGACGTTGGCCCGGCGGGGCATTTTTCGGGGTTATCGCGGGAAATGTTAATCCTCGCTACGCTGTTGCTGTT‑TTGCGCAGTGCTACTGATCGTGCTGGTGGGAACGCTTTATCCGATGATTTACGGCCTGCTGGGCTGGGGACGCCTCTCCGTTGGCGCGCC‑GTATTTTAACCGCGCGACGTTACCGTTTGGTCTGTTGATGCTGGTGGTGATTGTGCTGGCGACGTTT‑g < 2:44173/250‑1 (MQ=255) aTGGCTGGCGAGCGCGGGACGGTGGCCCGGCGGTGCATTTTTCGGGGTTATCGCGGGAAATGTTAATCCTCGCTACGCTGTTGCTGTT‑TTGCGCAGTGCTACTGATCGTGCTGGTGGGAACGCTTTATCCGATGATTTACGGCCTGCTGGGCTGGGGACGCCTCTCCGTTGGCGCGCC‑GTATTTTAACCGCGCGCCGTTACCGTTTGGTCTGTTGATGCTGGTGGTGCTTGGGCTGGCGACGTTT‑GTctct > 1:69888/1‑251 (MQ=255) ggctgccGAGCGCGGGACGGTGGCACGGCGGTGCATTTTTCGTGGTTATCGCTGTAAATGTTAAGCCTCGCTTCGCTGTTGCTGTT‑TGGCTCAGTGCTACTGAGCGTGCTGGTGGGAACGCTTTATCCGATGATTTACGGCCTGCTGGGCTTGGGACGCCGCTCCGGTGGCTCGCC‑GTATTTTAACCTCGCGACGTTACCGTTTGGTCCGTTGATGCTGGTGGTGATTGTGCTGGCGACGTTT‑GTCTCTg < 1:65403/250‑1 (MQ=255) cgcgGGACGGTGGCCCGGCGGTGCATTTTTCGGGGTTATCGCGGGAAATGTTAATCCTCGCTCGGCTGTTGCTGTT‑TTGCGCAGTGCTACTGATCGTGCTGGTGGGAACGCTTTATCCGATGATTTACGGCCTGCTGGGCTGGGGACGCCTCTCCGTTGGCGCGCC‑GTATTTTAACCGCGCGACGTTACCGTTTGGTCTGTTGATGCTGGTGGTGATTGTGCTGGCGACGTTT‑GTCTCTGGCAAACGCGTg < 2:289658/251‑1 (MQ=255) gACGGTGGCCAGGCGGTGCATTTTTCGGGGTTATCCCGGGAAATGTTAATCCTCGCTACGCTGTTGCTGTT‑TTGCGCAGTGCTAATGATCGTGCCGGTGGGAACGGTTTATCCGATGATTTACGGCCTGCTGGGCTGGGGACGCCTCTCCGTTGGCTCGCC‑GTATTTTAACCGCGCGACGTTACCGTTTGGTCTGTTGGTGCTGGTGGTGTTTGTGCTGGCGACGTTTTGT‑TCTGGCAAACTCGTGCAGcc > 2:305434/1‑250 (MQ=255) cGGTGGCCCGGCGGTGCATTTTTCGGGGTTATCGCGGGAAATGTTAATCCTCGCTACGCTGTTGCTGTT‑TTGCGCAGTGCTACTGATCGTGCTGGTGGGAACGCTTTATCCGATGATTTACGGCCTGCTGGGCTGGGGACGCCTCTCCGTTGGCGCGCC‑GTATTTTAACCGCGCGACGTTACCGTTTGGTCTGTTGATGCTGGTGGTGATTGTGCTGGCGACGTTT‑GTCTCTGGCAAACGCGTGCAGCTTc < 1:135198/251‑1 (MQ=255) ccGGCGGTGCATTTTTCGGGGTTATCGCGGGAAATGTTAATCCTCGCTACGCTGTTGCTGTT‑TTGCGCAGTGCTACTGATCGTGCTGGTGGGAACGCTTTATCCGATGATTTACGGCCTGCTGGGCTGGGGACGCCTCTCCGTTGGCGCGCC‑GTATTTTAACCGCGCGACGTTACCGTTTGGTCTGTTGATGCTGGTGGTGATTGTGCTGGCGACGTTT‑GTCTCTGGCAAACGCGTGCAGCTTCCGGCGCt < 1:428166/251‑1 (MQ=255) aTTTTTCGGGGTTATCGCGGGAAATGTTAATCCTCGCTACGCTGTTGCTGTT‑TTGCGCAGTGCTACTGATCGTGCTGGTGGGAACGCTTTATCCGATGATTTACGGCCTGCTGGGCTGGGGACGCCTCTCCGTTGGCGCGCC‑GTATTTTAACCGCGCGACGTTACCGTTTGGTCTGTTGATGCTGGTGGTGATTGTGCTGGCGACGTTT‑GTCTCTGGCAAACGCGTGCAGCTTCCGGCGCTGGTAGCTCAt < 1:401445/251‑1 (MQ=255) cGGGGTTATCGCGGGAAATGTTAATCCTCGCTACGCTGTTGCTGTT‑TTGCGCAGTGCTACTGATCGTGCTGGTGGGAACGCTTTATCCGATGATTTACGGCCTGCTGGGCTGGGGACGCCTCTCCGTTGGCGCGCC‑GTATTTTAACCGCGCGACGTTACCGTTTGGTCTGTTGATGCTGGTGGTGATTGTGCTGGCGACGTTT‑GTCTCTGGCAAACGCGTGCAGCTTCCGGCGCTGGTAGCTCATGCGGGc > 1:415219/1‑251 (MQ=255) ggggTTATCGCGGGAAATGTTAATCCTCGCTACGCTGTTGCTGTT‑TTGCGCAGTGCTACTGATCGTGCTGGTGGGAACGCTTTATCCGATGATTTACGGCCTGCTGGGCTGGGGACGCCTCTCCGTTGGCGCGCC‑GTATTTTAACCGCGCGACGTTACCGTTTGGTCTGTTGATGCTGGTGGTGATTGTGCTGGCGACGTTT‑GTCTCTGGCAAACGCGTGCAGCTTCCGGCGCTGGTAGCTCATGCGGGCg > 1:218391/1‑251 (MQ=255) gTTAATCCTCGCTACGCTGTTGCTGTT‑TTGCGCAGTGCTACTGATCGTGCTGGTGGGAACGCTTTAGCCGATGATTTACGGCCTGCTGGGCTGGGGACGCCTCTCCGTTGTCGCGCC‑GTATTTTAACCGCGCGACGTTACCGTTTGGTCTGTTGATGCTGGTGGTGATTGTGCTGGCGACGTTT‑GTCTCTGGCAAACGCGTGCAGCTTCCGGCGCTGGTAGCTCATGCGGGCGTGCTGTTATTTGCCGCt < 1:252252/250‑1 (MQ=255) aatccgggctccGCTGTTGCTGTT‑TTGAGTAGTGCTCCTGTTGGTGCTGGTGGGAACGCTTTATCCGATGATTTACGGCCTGCTGGGCTGGGGACGCCTCTCCGTTGGCGCGCC‑GTATTTTAACCGCGCGACGTTACCGTTTGGTCTGTTGATGCTGGTGGTGATTGTGCTGGCGACGTTT‑GTCTCTGGCAAACGCGTGCAGCTTCCGGCGCTGGTAGCTCATGCGGGCGTGCTGTTATTTGCCGCTgggg < 2:343764/240‑1 (MQ=255) aTCCTCGCTACGCTGTTGCTGTT‑TTGCGCAGTGCTACTGATCGTGCTGGTGGGAACGCTTTATCCGATGATTTACGGCCTGCTGGGCTGGGGACGCCTCTCCGTTGGCGCGAC‑GTATTTTAACCGCGCGACGTTACCGTTTGGTCTGTTGATGCTGGTGGTGCTTGTGCTGGCGACGTTT‑GTCTCTGGCAAACGCGTGCAGCTTCCGGCGCTGGTAGCTCATGCGGGCGGGCTGTTATTTGCCGCTggggg > 1:384421/1‑250 (MQ=255) cGCTACGCTGTTGCTGTT‑TTGCGCAGTGCTACTGATCGTGCTGGTGGGAACGCTTTATCCGATGATTTACGGCCTGCTGGGCTGGGGACGCCTCTCCGTTGGCGCGCC‑GTATTTTAACCGCGCGACGTTACCGTTTGGTCTGTTGATGCTGGTGGTGATTGTGATGGCGACGTTT‑GTCTCTGGCAAACGCGTGCAGCTTCCGGCGCTGGTAGCTCATGCGGGCGTGCTGTTATTTGCCTCTGGGGtgggtg > 2:412345/1‑246 (MQ=255) aCGCTGTTGCTGTT‑TTGCGCAGTGCTACTGATCGTGCTGGTGGGAACGCTTTATCCGATGATTTACGGCCTGCTGGGCTGGGGACGCCTCTCCGTTGGCGCGCC‑GTATTTTAACCGCGCGACGTTACCGTTTGGTCTGTTGATGCTGGTGGTGATTGTGCTGGCGACGTTT‑GTCTCTGGCAAACGCGTGCAGCTTCCGGCGCTGGTAGCTCATGCGGGCGTGCTGTTATTTGCCGCTGGGGTCGTGGtctc < 1:127852/251‑1 (MQ=255) tgctgtt‑TTGCGCAGTGCTACTGATCGTGCTGGTGGGAACGCTTTATCCGATGATTTACGGCCTGCTGGGCTGGGGACGCCTCTCCGTTGGCGCGCC‑GTATTTTAACCGCGCGACGTTACCGTTTGGTCTGTTGATGCTGGTGGTGATTGTGCTGGCGACGTTT‑GTCTCTGGCAAACGCGTGCAGCTTCCGGCGCTGGTAGCTCATGCGGGCGTGCTGTTATTTGCCGCTGGGGTCGTGGTCTCCAGCGTc > 1:445478/1‑251 (MQ=255) tt‑ttGCGCAGTGCTACTGATCGTGCTGGTGGGCACGCTTTATCCGATGATTTACGGCCTGCTGGGCTGGGGACGCCTCACCGTTGGCGCGCC‑GTATTTTAACCGCGCGACGTTACCGTTTGGTCTGTTGATGCTGGTGGTGATTGTGCTGGCGACGTTT‑GTCTCTGGCAAACGCGTGCAGCTTCCGGCGCTGGTAGCTCATGCGGGCGTGCTGTTATTTGCCGCTGGGGTCGTGGTCTCCAGCGTCAGCCg > 1:477380/1‑251 (MQ=255) gcAGTGCTACTGATCGTGCTGGTGGGAACGCTTTATCCGATGATTTACGGCCTGCTGGGCTGGGGACGCCTCTCCGTTGGCGCGCC‑GTATTTTAACCGCGCGACGTTACCGTTTGGTCTGTTGATGCTGGTGGTGATTGTGCTGGCGACGTTT‑GTCTCTGGCAAACGCGTGCAGCTTCCGGCGCTGGTAGCTCATGCGGGCGTGCTGTTATTTGCCGCTGGGGTCGTGGTCTCCAGCGTCAGCCGTCAggg > 1:203805/1‑250 (MQ=255) aTCGTGCTGGTGGGAACGCTTTATCCGATGATTTACGGCCTGCTGGGCTGGGGACGCCTCTCCGTTGGCGCGCC‑GTATTTTAACCGCGCGACGTTACCGTTTGGTCTGTTGATGCTGGTGGTGATTGTGCTGGCGACGTTT‑GTCTCTGGCAAACGCGTGCAGCTTCCGGCGCTGGTAGCTCATGCGGGCGTGCTGTTATTTGCCGCTGGGGTCGTGGTCTCCAGCGTCAGCCGTCAGGAGATCAGCCTGaa < 1:415631/251‑1 (MQ=255) aTCGTGCTGGTGGGAACGCTTTATCCGATGATTTACGGCCTGCTGGGCTGGGGACGCCTCTCCGTTGGCGCGCC‑GTATTTTAACCGCGCGACGTTACCGTTTGGTCTGTTGATGCTGGTGGTGATTGTGCTGGCGACGTTT‑GTCTCTGGCAAACGCGTGCAGCTTCCGGCGCTGGTAGCTCATGCGGGCGTGCTGTTATTTGCCGCTGGGGTCGTGGTCTCCAGCGTCAGCCGTCAGGAGATCAGCCTGa > 1:20172/1‑250 (MQ=255) gtggGAACGCTTTATCCGATGATTTACGGCCTGCTGGGCTGGGGACGCCTCTCCGTTGGCGCGCC‑GTATTTTAACCGCGCGACGTTACCGTTTGGTCTGTTGATGCTGGTGGTGATTGTGCTGGCGACGTTT‑GTCTCTGGCAAACGCGTGCAGCTTCCGGCGCTGGTAGCTCATGCGGGCGTGCTGTTATTTGCCGCTGGGGTCGTGGTCTCCAGCGTCAGCCGTCAGGAGATCAGCCTGAATTTACAGcc > 1:325255/1‑251 (MQ=255) | GCTGTCGCTGCTGGGCACCTTAATTGTCCGTTCTGGCATTCTGGTTTCGGTTCATGCGTTCGCGCTGGATAACGTCCGCGCCGTGCCGTTGTTCAGCCTGTTTGCACTGATTAGCCTTGCGTCTCTGGCTCTGTATGGCTGGCGAGCGCGGGACGGTGGCCCGGCGGTGCATTTTTCGGGGTTATCGCGGGAAATGTTAATCCTCGCTACGCTGTTGCTGTT‑TTGCGCAGTGCTACTGATCGTGCTGGTGGGAACGCTTTATCCGATGATTTACGGCCTGCTGGGCTGGGGACGCCTCTCCGTTGGCGCGCC‑GTATTTTAACCGCGCGACGTTACCGTTTGGTCTGTTGATGCTGGTGGTGATTGTGCTGGCGACGTTT‑GTCTCTGGCAAACGCGTGCAGCTTCCGGCGCTGGTAGCTCATGCGGGCGTGCTGTTATTTGCCGCTGGGGTCGTGGTCTCCAGCGTCAGCCGTCAGGAGATCAGCCTGAATTTACAGCC > NC_000913/4292312‑4292809 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |