| Predicted mutation | ||||||
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| RA | NC_000913 | 4,431,220 | C→T | L453L (CTG→TTG) | cycA → | D‑serine/alanine/glycine/:H(+)symporter |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_000913 | 4,431,220 | 0 | C | T | 87.5% | 131.7 / 6.6 | 56 | L453L (CTG→TTG) | cycA | D‑serine/alanine/glycine/:H(+)symporter |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (4/3); new base T (18/31); total (22/34) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.15e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.95e-01 | |||||||||||
TTCACGATGATTACAACCGTTTCCGCGATTCTGTTTATGTTCGTCTGGACGATTATCCTTTGCTCGTACCTTGTGTATCGCAAACAGCGTCCTCATCTACATGAGAAGTCGATCTACAAGATGCCGCTCGGCAAGCTGATGTGCTGGGTATGTATGGCGTTCTTTGTGTTCGTGGTCGTGTTGCTGACACTGGAAGATGACACTCGCCAGGCGCTGCTGGTTACCCCGCTGTGGTTTATCGCGCTGGGGTTGGGCTGGCTGTTTATTGGTAAGAAGCGGGCTGCTGAACTGCGGAAATAACCGCATTATCATGCTGGATGGCGCAATGCCATCCAGCTTTTAGATCACTCACCCGCCAGCGCGCGTGGGAACAGTACATTGTTTTCCAGACTGATGTGATCCATCAGGTCATCAATCAGTTCATTAATGCCGTTATACATCGCTTTCCAGGTGGTGCAGGCTTCTGGCGGCGGTGTGACGTTATTGGT > NC_000913/4430977‑4431464 | ttCACGATGATTACAACCGTTTCCGCGATTCTGTTTATGTTCGTCTGGACGATTATCCTTTGCTCGTACCTTGTGTATCGAAAACAGCGTCCTCATCTACATGAGAAGTCGATCTACAAGATGCCGCTCGGCAAGCTGATGTGCTGGGAATGTATGGCGTTCTTTGTGTTCGTGGTCGTGGTGCGGACACTGGACGATGACACTCGCCAGGCGCTGCTGGTTACCCCGCTGTGGTTTTTCGAGTTgggggt > 2:166799/1‑249 (MQ=255) tcacgtagatgtcaccctgttCCGCTATTCTGTTTATGTTCGTCTGGACGATTATCCTTTGCTCGTACCTTGTGTATCGCAAACAGCGTCCGCATCTACATGAGAAGTCGATCTACAAGATGCTGCTCGGCAAGCTGATGTGCTGGGTATGTATGGCGTTCTTCTTGTTCGTGGGCGTGTTGCTGAGACTGGAAGATGACACTCGCCAGGCGTTGCTGGTGACCCCGCTGTTGTGTATCGCGTTGGGGtt < 2:57612/231‑1 (MQ=255) tCACGATGATTACAACCGTTTCCGCGATTCTGTTTATGTTCGTCTGGACGATTATCCTTTGCTCGTACCTTGTGTATCGCAAACAGCGTCCTCATCTACATGAGAAGTCGATCTACAAGATGCCGCTCGGCAAGCTGATGTGCTGGGTATGTATGGCGTTCTTTGTGTTCGTGGTCGTGTTGCTGACACTGGAAGATGACACTCGCCAGGCGCTGCTGGTTACCCCGCTGTGGTTTATCGCGTTGGGGtt < 1:123255/250‑1 (MQ=255) cACGATGATTACAACCGTTTCCGCGATTCTGTTTATGTTCGTCTGGACGATTATCCTTTGCTCGTACCTTGTGTATCGCAAACAGCGTCCTCATCTACATGAGAAGTCGATCTACAAGATGCCGCTCGGCAAGCTGATGTGCTGGGTATGTATGGCGTTCTTTGTGTTCGTGGTCGTGTTGCTGACACTGGAAGATGACACTCGCCAGGCGCTGCTGGTTACCCCGCTGTGGTTTATCGCGTTGGGGTTgg > 2:282869/1‑251 (MQ=255) atgatTACAACCGTTTCCGCGATTCTGTTTATGTTCGTCTGGACGATTATCCTTTGCGCGTACCGTGTGTATCGCAAACAGCGTCCTCATCTACATGAGAAGTCGATCTACAAGATGCCGCGCGGCAAGCTGATGTGCTGGGTATGGATGGCGTTCTTTGTGTTCGTGGTCGTGTTGCTGACACTGGAAGATGACACTCGCCAGGCGCTGCTGGTTACCCCGCTGTGGTTTATCGCGTTGGGGTTGggctg < 2:376464/251‑1 (MQ=255) tgatTACAACCGTTTCCGCGATTCTGTTTATGTTCGTCTGGACGATTATCCTTTGCTCGTACCTTGTGTATCGCAAACAGCGTCCTCATCTACATGAGAAGTCGATCTACAAGATGCCGCTCGGCAAGCTGATGTGCTGGGTATGTATGGCGTTCTTTGTGTTCGTGGTCGTGTTGCTGACACTGGAAGATGACACTCGCCAGGCGCTGCTGGTTACCCCGCTGTGGTTTATCGCGTTGGGGTTGggctgg > 1:330538/1‑251 (MQ=255) ttACAACCGTTTCCGCTATTCTGGTTATGGTCGTCATGACGATTATCCTTTTCTCGTACCGTGTTTATCGCAAACAGCGTCCTCATCTACATGAGAAGTCGATCTACAAGATGCCGCTCGGCAATCTGATGTGCTGGGTATGTATGGCGTTCTTTGGGTTCGTGGTCGTGTTGCTGACACTGGAAGTTGACACTCGCCAGGCGCTGCTGGTTACCCCGCTGTGGTTTAGCGCGTTGGGGTTGggctggct < 1:381678/250‑1 (MQ=255) tACAACCTTTTCCGCGATTCTGTTTATGTTCGTCTGGACGATTATCCTTTGCTCGTACCTTGTGTATCGCAAACAGCGTCCTCATCTACATGAGAAGTCGATCTACAAGATGCCGCTCGGCAAGCTGATGTGCTGGGTATGTATGGCGTTCTTTGTGTTCGTGGTCGTGTTGCTGACACTGGAAGATGACACTCGCCAGGCGCTGCTGGTTACCCCGCTGTGGTTTATCGCGTTGGGGTTGGgctggctg < 1:211214/250‑1 (MQ=255) aCAACCGTTTCCGCGATTCTGTTTATGTGCGTCTGGCCGATTATCCTTTGCTCGTCCCTTGTGTAGCGCAAACAGCGTCCGCATCTACATGAGAAGTCGATCTACAAGATGCCGCTCGGCAAGCTGATGTGCTGGGTATGTATGGCGTTCTTTGTGTTCGTGGTCGGGTTGCTGACACTGGAAGATGACACTCGCCAGGCGCTGCTGGTTACCCCGCTGTGGTTTATCGCGTTGGGGTTGGGCTGGCTGt < 2:34686/250‑1 (MQ=255) cAACCGTTTCCGCGATTCTGTTTATGTTCGTCTGGACGATTATCCTTTGCTCGTACCTTGTGTATCGCAAACAGCGTCCTCATCTACATGAGAAGTCGATCTACAAGATGCCGCTCGACAAGCTGATGTGCTGGGTATGTATGGCGTTCTTTGTGTTCGTGGTCGTGTTGCTGACACTGGTAGATGACACTCGCCAGGCGCTGCTGGTTACCCCGCTGTGGTTTATCGCGTTGCGGTTTGGCTGGCTGttt > 1:336280/1‑251 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |