| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 3,500,129 | G→A | G74S (GGC→AGC) | frlA → | fructoselysine/psicoselysine transporter |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,500,129 | 0 | G | A | 84.6% | 22.8 / ‑3.1 | 13 | G74S (GGC→AGC) | frlA | fructoselysine/psicoselysine transporter |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/2); new base A (2/9); total (2/11) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.40e-01 | |||||||||||
TCGCTATGGGAAGCCAGGAACTCCAACGCAAGCTCGGATTTTGGGCCGTTCTTGCAATCGCCGTCGGGACAACCGTCGGCTCCGGTATTTTTGTATCTGTGGGTGAAGTGGCAAAAGCAGCGGGCACGCCGTGGCTTACGGTGCTCGCGTTTGTCATTGGCGGGTTAATTGTGATCCCGCAAATGTGCGTCTATGCGGAACTATCCACCGCTTATCCGGAAAATG‑GCGCAGATTATGTTTATCTGAAAAATGCCGGAAGCCGACCGCTGGCTTTCCTCTCCGGCTGGGCCAGCTTCTGGGCCAACGATGCGCCGTCATTGTCGATTATGGCGCTGGCGATTGTCAGCAATCTTGGCTTTTTAACGCCTATCGATCCGTTGCTCGGTAAATTTATCGCCGCCGGATTAATTATCGCCTTTATGTTGCTACACCTGCGCTCCGTTGAAGGC > NC_000913/3499905‑3500353 | ccGCTATGGGAAGCCAGGAACTCCAACGCAAGCTCGGATTTTGGGCCGTTCTTGCAATCGCCGTCGGGACAACCGTCGGCTCCGGTATTTTTGTATCTGTGGGTGAAGTGGCAAAAGCAGCGGGCACGCCGTGGCTTACGGTGCTCGCGTTTGTCATTGGCGGGTTAATTGTGATCCCGCAAATGTGCGTCTATGCGGAACTATCCACCGCTTATCCGGAAAATG‑GCGCAGATTATGTTTATCTGAAAAAt < 1:149026/250‑1 (MQ=255) ggAAGCCAGGAACTCCAACGCAAGCTCGGATTGTGGGCCGTTCTTGCAATCGCCGGCGGGACAACCGTCGGCTCCGGTATGTTTGTATCTGTGGGTGAAGTGGCAAAAGCAGCGGGCACGCCGTGGCTTACGGTGCTCGCGTTTGTCATTGGCGGGTTAATTGTGATCCCGCAAATGTGCGTCTATGCGGAACTATCCACCGCTTATCCGGAAAATA‑GCGCAGATTATGTTTATCTGAAAAATg < 1:228921/244‑1 (MQ=255) cgccagaagctccgactcAAGCCCGGGTTTTGGGCCTTTCTTGCACTCGCCGTCGGGACAACCGTCTGCTCCGGTATTTTTGTATCTGTGGGTGAAGTGGCAAAAGCAGCGGGCACGCCGTGCCTTACGTTGCTCGCGTTTGTCATTGGCTGGTTAATTGTGATCCCGCAAATGTGCGTCTATGCGGAACTATCCACCGCTTATCCGGAAAATA‑GCGCAGATTAGGTTTATCTGAAAAATGCCggtcgtcg < 2:91073/234‑7 (MQ=255) tGGGCCGTTCTTGCAATCGCCGTCGGGACAACCGTCGGCTCCGGTATTTTTGTAGCTGTGGGTGAAGTGGCAAAAGCAGCGGGCACGCCGTGGCTTACGGTGCTCGCGTTTGTCATTGGCGGGTTAATTGTGATCCCGCAAATGTGCGTCTATGCGGAACTATCCACCGCTTATCCGGAAAATA‑GCGCAGATTATGTTTATCTGAAAAATGCCGGAAGCCGACCGCTGGCTTTCCTCTCCGGCTGGGCCa < 2:192389/250‑1 (MQ=255) gTGAAGTGGCAAAAGCAGCGGGCACGCCGTGGCTTACGGTGCTCGCGTTTGTCATTGGCGGGCTAATTGTGATTCCGCAAATGTGGGGCTTTGCGGAACCATCCACCGCTTATCCGGAAAATA‑GAGGAGATTTTGTTTATTTGAAAAATTCCGGGAGCCCCCCGCCGGCTTTCCTCTCCGGCTGGGGCAGCCTTTGGGCCAACGATACGCCCTCATTCGCGCTTTTGGCGCTGGCGATTGtttgccatctt > 1:33932/1‑241 (MQ=255) gggCTCGCCGTGGCTTACGGTGCTCGCGTTTGTCATTGGCGGGTTAATTGTGATCCCGCAAATGGGCGTCTATGCGGAACTATCCACCGCTTATCCGGAAAATA‑GCGCAGATTATGTTTATCTGAAAAATGCCGGAAGCCGACCGCTGGCTTTCCTCTCCGGCTGGGCCAGCTTCTGGGCCAACGATGCGCCGTCATTGTCGATTATGGCGCTGGCGATTGTCAGCAATCTTGGCTTTTTAACGCCTATCg < 1:141964/251‑1 (MQ=255) gTGCTCGCGTTTGTCATTGGCGGGTTAATTGTGATCCCGCAAATGTGCGTCTATGCGGAACTATCCACCGCTTATCCGGAAAATA‑GCGCAGATTATGTTTATCTGAAAAATGCCGGAAGCCGACCGCTGGCTTTCCTCTCCGGCTGGGCCAGCTTCTGGGCCAACGATGCGCCGTCATTGTCGATTATGGCGCTGGCGATTGTCAGCAATCTTGGCTTTTTAACGCCTATCGATCCGTTGCTCGGTAAAtt < 1:188315/251‑1 (MQ=255) cgtgTTTGTCATTGGCGGGTTAATTGTGATCCCGCAAATGTGCGTCTATGCGGAACTAGCCACCGCTTATCCGGAAAATA‑GCGCAGATTATGTTTATCTGAAAAATGCCGGAAGCCGACCGCTGGCTTTCCTCTCCGGCTGGGCCAGCTTCTGGGCCAACGATGCGCCGTCATTGTCGATTATGGCGCTGGCGATTGTCAGCAATCTTGGCTTTTTAACGCCTATCGATCCGTTGCTCGGTAAATTTAt < 1:126030/246‑1 (MQ=255) cgcggttttCATTTGCTGGTTAAATGTTATCCCGCAAATGTGCGTCTATTCGGAACTATCCTCCGCTTATCCGGAAAATA‑GCTCCGATTATGTTTATCTGAAAATTGCCGTACGCCGCCCGCTGGCTTTCCTTTCCGGCTGGGCCAGCTTCTGGGCCAACGATGCGCCGTCATTGTCGATTATGGCGCTGGCGATTGTCAGCAATCTTGGCTTTTTAACGCCTACCGATCCGTTGCTCGGTAAATTTATcg < 2:59043/243‑1 (MQ=255) aaTTGTGATCCCGCAAATGTGCGGCTATGCGGAACTATCCACCGCTTATCCGGAAAATA‑GCGCAGATTATGTTTATCTGAAAAATGCCGGAAGCCGACCGCTGGCTTTCCTCTCCGGCTGGGCCAGCTTCTGGGCCAACTATGCGCCGTCATTGTCGATTATGGCGCTGGCGATTGTCAGCAATCTTGGCTTTTTAACGCCTATCGATCCGTTGCTCGGTAAATTTATCGCCGCCGGATTAATTATCGcc < 1:355977/250‑1 (MQ=255) gtaaaatgttcttatagtcGGAACTATTCACCTCTTACCCGGAAA‑TGAGCGACGATTATGTTTATCTGAAAAATGCCGGAAGCCGACCGCTGGCTGTCCTGTCCGGCTGGGCCTGCTTCTGGGCCAACGATGCGCCGTCATTGTCGAGTATGGCGCTGGCGATTGTCAGCAATCTTGGCTTTTTAACGCCTATCGATCCGTTGCTCGGTAAATTGATCGCCGCCGGAGTAATTATCGCCTTTATGTTGc < 2:271326/231‑1 (MQ=255) gtaaaTGTGCGTCTATGCGGAACGATCCACCGCTTATCCGGAAAATA‑GCGCAGATTATGTTTATCTGAAAAATGCCGGAAGCCGACCGCTGGCTTTCCTCTCCGGCTGGGCCAGCTTCTGGGCCAACGATGCGCCGTCATTGTCGATTATGGCGCTGGCGATTGTCAGCAATCTTGGCTTTTTAACGCCTATCGATCCGTTGCTCGGTAAATTTATCGCCGCCGTATTAATTATCGCCTTTATGTTGCTac < 2:33932/249‑1 (MQ=255) aaCTATCCACCGCTTATCCGGAAAATA‑GCGCAGATTATGTTTATCTGAAAAATGCCGGAAGCCGACCGCTGGCTTTCCTCTCCGGCTGGGCCAGCTTCTGGGCCAACGATGCGCCGTCATTGTCGCTTATGGCGCTGGCGATTGTCAGCAATCTTGGCTTTTTAACGCCTATCGATCCGTTGCTCGGTAAATTTATCGCCGCCGGATTAATTATCGCCTTTATGTTGCTACACCTGCGCTCCGTTGACggc > 1:49907/1‑251 (MQ=255) | TCGCTATGGGAAGCCAGGAACTCCAACGCAAGCTCGGATTTTGGGCCGTTCTTGCAATCGCCGTCGGGACAACCGTCGGCTCCGGTATTTTTGTATCTGTGGGTGAAGTGGCAAAAGCAGCGGGCACGCCGTGGCTTACGGTGCTCGCGTTTGTCATTGGCGGGTTAATTGTGATCCCGCAAATGTGCGTCTATGCGGAACTATCCACCGCTTATCCGGAAAATG‑GCGCAGATTATGTTTATCTGAAAAATGCCGGAAGCCGACCGCTGGCTTTCCTCTCCGGCTGGGCCAGCTTCTGGGCCAACGATGCGCCGTCATTGTCGATTATGGCGCTGGCGATTGTCAGCAATCTTGGCTTTTTAACGCCTATCGATCCGTTGCTCGGTAAATTTATCGCCGCCGGATTAATTATCGCCTTTATGTTGCTACACCTGCGCTCCGTTGAAGGC > NC_000913/3499905‑3500353 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |