| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 9,665 | G→T | V120V (GTG→GTT) | mog → | molybdopterin adenylyltransferase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 9,665 | 0 | G | T | 90.0% | 65.9 / ‑0.4 | 30 | V120V (GTG→GTT) | mog | molybdopterin adenylyltransferase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (2/1); new base T (14/13); total (16/14) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.36e-01 | |||||||||||
CGATGAGCAGGCGATCATCGAGCAAACGTTGTGTGAGCTGGTGGATGAAATGAGTTGCCATCTGGTGCTCACCACGGGCGGAACTGGCCCGGCGCGTCGTGACGTAACGCCCGATGCGACGCTGGCAGTAGCGGACCGCGAGATGCCTGGCTTTGGTGAACAGATGCGCCAGATCAGCCTGCATTTTGTACCAACTGCGATCCTTTCGCGTCAGGTGGGCGTGATTCGCAAACAGGCGCTGATCCTTAACTTACCCGGTCAGCCGAAGTCTATTAAAGAGACGCTGGAAGGTGTGAAGGACGCTGAGGGTAACGTTGTGGTACACGGTATTTTTGCCAGCGTACCGTACTGCATTCAGTTGCTGGAAGGGCCATACGTTGAAACGGCACCGGAAGTGGTTGCAGCATTCAGACCGAAGAGTGCAAGACGCGACGTTAGCGAATAAAAAAATCCCC > NC_000913/9449‑9903 | cGATGAGCAGGTGATCATCGAGCAAACGTTGTGGGGGCGAGTGGATGAAATGTGTTGGCGTCTGGGGCACACCACTGGCGGAACGTGTCCGGCACGTTGTGACGTAACGCCCGATGCGTAGCTGGCATTAGCGTACCGCGAGATGCCTGGCTTTGGTGAACACATGCGCCAGATAAGCCTGCATTTTGTACCAACTGCGATCCTTTAGCGTTAGGTTGGTGTGATTCGCAAACAGGCGCTGATCCTTAACt < 2:28312/251‑1 (MQ=255) 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1:36627/203‑1 (MQ=255) aGTAGCGGACCGCGAGATGCCTGGCTTTGGTGAACAGATGCGCCAGATAAGCCTGCATTTTGTACCAACTGCGATCCTTTCGCGTCAGGTTGGTGTGATTCGCAAACAGGCACTGATCCTTAACTTACCCGGTCAGCCGGAGTCTATTAAAGAAACGCTGGAAGGGGTGAAGGACGCTGCGGGTAAAGTTGTGGTACACGGTATTTTTGCCAGCGTACCGTGCTGCATTCAGTTGCTGGAAGGGCCATACg > 1:343898/1‑251 (MQ=255) gTAGCGGACCGCGAGATGCCTGGCTTTGGTGAACAGATGCGCCAGATAAGCCTGCATTTTGTACCAACTGCGATCCTTTCGCGTCAGGTTGGTGTGATTCGCAAACAGGCGCTGATCCTTAACTTACCCGGTCAGCCGAAGTCTATTAAAGAGACGCTGGAAGGTGTGAAGGACGCTGCGGGTAACGTTGTGGTACACGGTATTTTTGCCAGCGTACCGTACTGCATTCAGTTGCTGGAAGGGCCATACGt > 1:382484/1‑251 (MQ=255) cgAGATGCCTGGCTTTGGTGACCAGATGCGCCAGATAAGCCTGCATTTTGTACCAACTGCGATCCTTTCGCGTCAGGTTGGTGTGATTCGCAAACAGGCGCTGATCCTTAACTTACCCGGTCAGCCGAAGTCTATTAAAGAGACGCTGGAAGGTGTGAAGGACGCTGCGGGTAACGTTGTGGTACACGGTATTTTTGCCAGCGTACCGTACTGCATTCAGTTGCTGGACGGGCCATACGTTGAAACGGCAc > 2:112859/1‑251 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |