| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 4,626,886 | C→T | N325N (AAC→AAT) | radA → | DNA recombination protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 4,626,886 | 0 | C | T | 97.9% | 150.1 / NA | 48 | N325N (AAC→AAT) | radA | DNA recombination protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); major base T (23/24); minor base G (0/1); total (23/25) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.31e-01 | |||||||||||
CCGACTCCCGTTTTCGCACCTTGCGCAGCCATAAAAACCGCTTCGGCGCGGTGAATGAGCTGGGCGTCTTCGCGATGACCGAACAGGGGCTGCGTGAAGTCAGCAACCCTTCGGCAATTTTCTTAAGTCGCGGCGATGAAGTGACCTCCGGTAG‑C‑TCAGTGATGGTGGTATG‑GGAAGGAACGCGTCCACTGCTGGTGGAGATTCAGGCGCTGGTCGATCACTCGATGATGGCGAACCCACGCCGCGTGGCAGTGGGGCTGGAACAAAACCGTCTGGCAATCCTGCTGGCTGTGTTGCACCGTCACGGTGGTCTGCAAATGGCCGATCAGGATGTGTTTGTGAACG‑TGGTCGGCGGCGTGAAGGTAACCGAAACCAGTGCCGACTTAGCGTTACTGCTGGCGATGGTTTCCAGCCTGCGCGACAGACCGCTGCCGCAGGATCTGGTGGTGTTTGGTGAAGTCGGGCTGGCA > NC_000913/4626651‑4627120 | ccGACTCCCGTTTTCGCACTTTACGCAGCCATAAAACCCGCTTCGGCGCGGTGAATGAGCTGGGCGTCTTCGCGATGACCGAACAGGGGCTGCGTGAAGTCAGCAACCCTTCGGCAATTTTCTTAAGTCGCGGAGATGAAGTGACCTCCGGCAG‑C‑TCCGTGATGGTGGTGTG‑GGAAGGAACGCGTCCGTTGCTGGTGGAGATTCAGGCGCTGGTCGCTCACTCGATGATGGCGAATCCGCGCCGCGTGGcc > 2:280454/1‑250 (MQ=255)ccGACCCCCGTTTTCGCACTTTACGCAGCCATAAAAACCGCTTCGGCGCGGTGAATGAGCTGGGCGTCTTCGCGATGACCGAACAGGGGCTGCGTGAAGTCAGCAACCCTTCGGCAATTTTCTTAAGTCGCGGAGATGAAGTGACCTCCGGCAG‑C‑GCCGTGATGGTGGTGTG‑GGAAGGAACGCGTCCGTTGCTGGTGGAGATTCAGGCGCTGGTCGATCACTCGATGATGGCGAATCCGCGCCGCGTGGCa < 2:76635/251‑1 (MQ=255) gcctccctgtttCGCACTTTACGCAGCCATAAAAACCGCTTCGGCGCGGTGAATGAGCTGGGCGTCTTCGCGATGACCGAACAGGGGCTGCGTGAAGTCAGCAACCCTTCGGCAATTTTCTTAAGTCGCGGAGATGAAGTGACCTCCGGCAG‑C‑TCCGTGATGGTGGTGTG‑GGAAGGAACGCGTCCGTTGCTGGGGGAGATTCAGGCGCTGGTCGATCACTCGATGATGGCGAATCCGCGCCGCGTGGCAGt < 2:406707/242‑1 (MQ=255) cGTTTTCGCACTTTACGCAGCCATAAAAACCGCTTCGGCGCGGTGAATGAGCTGGGCGTCTTCGCGATGACCGAACAGGGGCTGCGTGAAGTCAGCAACCCTTCGGCAATTTTCTTAAGTCGCGGAGATGAAGTGACCTCCGGCAG‑C‑TCCGTGATGGTGGTGTG‑GGAAGGAACGCGTCCGTTGCTGGTGGAGATTCAGGCGCTGGTCGATCACTCGATGATGGCGAATCCGCGCCGCGTGGCAGTGGGGCt < 1:9160/251‑1 (MQ=255) 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gATGACCGAACAGGGGCTGCGTGAAGTCAGCAACCCTTCGGCAATTTTCTTAAGTCGCGGAGATGAAGTGACCTCCGGCAG‑C‑TCCGTGATGGTGGTGTG‑GGAAGGAACGCGTCCGTTGCTGGTGGAGATTCAGGCGCTGGTCGATCACTCGATGATGGCGAATCCGCGCCGCGTGGCAGTGGGGCTGGAACAAAACCGTCTGGCAATCCTGCTGGCTGTCTTGCACCGTCACGGTGGTCTGCAAATGGCCg > 1:72453/1‑251 (MQ=255) cGAACAGGGGCTGCGTGAAGTCAGCAACCCTTCGGCAATTTTCTTAAGTCGCGGAGATGAAGTGACCTCCGGCAG‑C‑TCCGTGATGGTGGTGTG‑GGAAGGAACGCGTCCGTTGCTGGTGGAGATTCAGGCGCTGGTCGATCACTCGATGATGGCGAATCCGCGCCGCGTGGCAGTGGGGCTGGAACAAAACCGTCTGGCAATCCTGCTGGCTGTCTTGCACCGTCACGGTGGTCTGCAAATGGCCGATCAgg < 1:96014/251‑1 (MQ=255) aaCAGGGGCTGCGTGAAGTCAGCAACCCTTCGGCAATTTTCTTAAGTCGCGGAGATGAAGTGACCTCCGGCAG‑C‑TCCGTGATGGTGGTGTG‑GGAAGGAACGCGTCCGTTGCTGGTGGAGATTCAGGCGCTGGTCGATCACTCGATGATGGCGAATCCGCGCCGCGTGGCAGTGGGGCTGGAACAAAACCGTCTGGCAATCCTGCTGGCTGTCTTGCACCGTCACGGTGGTCTGCAAATGGCCGATCAGGAt > 1:233169/1‑251 (MQ=255) 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gCAATTTTCTTAAGTCGCGGAGATGAAGTGACCTCCGGCAG‑C‑TCCGTGATGGTGGTGTG‑GGAAGGAACGCGTCCGTTGCTGGTGGAGATTCAGGCGCTGGTCGATCACTCGCTGATGGCGACTCCGCGCCGCGTGGCAGTGGGGCTGGAACAAAACCGTCTGGCAATCCTGCTGGCTGTCTTGCACCGTCACCGTGGTCTGCCAATGGCCGATCCGGCTGTGTTTATGAACGCTGG‑CGGCGGCGTGACGGt > 2:17055/1‑251 (MQ=255) cAATTTTCTTAAGTCGCGGAGATGAAGTGACCTCCGGCAG‑C‑TCCGTGATGGTGGTGTG‑GGAAGGAACGCGTCCGTTGCTGGTGGAGATTCAGGCGCTGGTCGATCACTCGATGATGGCGAATCCGCGCCGCGTGGCAGTGGGGCTGGAACAAAACCGTCTGGCAATCCTGCTGGCTGTCTTGCACCGTCACGGTGGTCTGCAAATGGCCGATCAGGATGTGTTTGTGAACG‑TGGTCGGCGGCGTGAAGGt > 1:341481/1‑250 (MQ=255) aGTCGGGGAGATGAAGTGACGTCCGGCAGGC‑GC‑GTGATGGTGGTGTG‑GGAAGGAACGCGTTCGTTGCTGGTGGAGAGTCAGGCGCTGGTCGATCACTCGATGATGGCGAATCCGCGCCGCGTGGCAGTGGGGCTGGAACAAAACCGTCTGGCAATCCTGCTGGCTGTCTTGCACCGTCACGGTGGTCTGCAAATGGCCGATCAGGATGTGTTTGTGAACG‑TGGTCGGCGGCGTGAAGGTAACCGAAACCAg < 2:137365/251‑1 (MQ=255) 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aGTGACCTCCGGCAG‑C‑GCCGTGATGGTGGTGTG‑GGAAGGAACGCGTCCGTTGCTGGTGGAGATTCAGGCGCTGGTCGATCACTCGATGATGGCGAATCCGCGCCGCGTGGCAGTGGGGCTGGAACAAAACCGTCTGGCAATCCTGCTGGCTGTCTTGCACCGTCACGGTGGTCTGCAAATGGCCGATCAGGATGTGTTTGTGAACG‑TGGTCGGCGGCGTGAAGGTAACCGAAACCAGCGCCGACTTAGCGt < 1:396544/251‑1 (MQ=255) ccTCCGGCAG‑C‑TCCGTGATGGTGGTGTG‑GGAAGGAACGCGTCCGTTGCTGGTGGAGATTCAGGCGCTGGTCGATCACTCGATGATGGCGAATCCGCGCCGCGTGGCAGTGGGGCTGGAACAAAACCGTCTGGCAATCCTGCTGGCTGTCTTGCACCGTCACGGTGGTCTGCAAATGGCCGATCAGGATGTGTTTGTGAACG‑TGGTCGGCGGCGTGAAGGTAACCGAAACCAGCGCCGACTTAGCGTTActg < 1:414251/251‑1 (MQ=255) cgTGATGGTGGTGTG‑GGAAGGAACGCGTCCGTTGCTGGTGGAGATTCAGGCGCTGGTCGATCACTCGATGATGGCGAATCCGCGCCGCGTGGCAGTGGGGCTGGAACAAAACCGTCTGGCAATCCTGCTGGCTGTCTTGCACCGTCACGGTGGTCTGCAAATGGCCGATCAGGATGTGTTTGTGAACG‑TGGTCGGCGGCGTGAAGGTAACCGAAACCAGCGCCGCCTTAGCGTTACTGCTGGCGATGGttt > 1:326597/2‑251 (MQ=255) gtG‑GGAAGGAACGCGTCCGTTGCTGGTGGAGATTCAGGCGCTGGTCGATCACTCGATGATGGCGAATCCGCGCCGCGTGGCAGTGGGGCTGGAACAAAACCGTCTGGCAATCCTGCTGGCTGTCTTGCACCGTCACGGTGGTCTGCAAAAGGCCGATCAGGATGTGTTTGTGAACG‑TGGTCGGCGGCGTGAAGGTAACCGAAACCAGCGCCGACTTAGCGTTACTGCTGGCGATGGGTTCCAGCCTgcgtg > 2:381675/2‑249 (MQ=255) cgcgTCCGTTGCTGGTGGAGATCCAGGCGCTGGTCGATCACTCGATGATGGCGAATCCGCGCCGCGTGGCAGTGGGGCTGGAACAAAACCGTCTGGCAATCCTGCTGGCTGTCTTGCACCGTCCCGGTGGTCTGCAAATGGCCGATCAGGATGTGTTTGTGAACG‑TGGTCGGCGGCGTGAAGGTAACCGAAACCAGCGCCGACTTAGCGTTCCTGATGGCGGTGGGTTCCAGCCTGCGGGACAGACCGCTg > 2:267524/1‑251 (MQ=255) gtccgttgctgGTGGAGATTCAGGCGCTGGTCGATCACTCGATGATGGCGAATCCGCGCCGCGTGGCAGTGGGGCTGGAACAAAACCGTCTGGCAATCCTGCTGGCTGTCTTGCACCGTCACGGTGGTCTGCAAATGGCCGATCAGGATGTGTTTGTGAACG‑TGGTCGGCGGCGTGAAGGTAACCGAAACCAGCGCCGACTTAGCGTTACTGCTGGCGATGGTTTCCa < 1:332495/222‑1 (MQ=255) gtccgttgctgGTGGAGATTCAGGCGCTGGTCGATCACTCGATGATGGCGAATCCGCGCCGCGTGGCAGTGGGGCTGGAACAAAACCGTCTGGCAATCCTGCTGGCTGTCTTGCACCGTCACGGTGGTCTGCAAATGGCCGATCAGGATGTGTTTGTGAACG‑TGGTCGGCGGCGTGAAGGTAACCGAAACCAGCGCCGACTTAGCGTTACTGCTGGCGATGGTTTCCAGCCTGCGTGACAGACCGCTGcc > 1:63405/7‑250 (MQ=255) gtccgttgctgGTGGAGATTCAGGCGCTGGTCGATCACTCGATGATGGCGAATCCGCGCCGCGTGGCAGTGGGGCTGGAACAAAACCGTCTGGCAATCCTGCTGGCTGTCTTGCACCGTCACGGTGGTCTGCAAATGGCCGATCAGGATGTGTTTGTGAACG‑GGGTCGGCGGCGTGAAGGTAACCGAAACCAGCGCCGACTTAGCGTTACTGCTGGCGATGGTTTCCa > 2:332495/7‑228 (MQ=255) gtccgttgctgGTGGAGATTCAGGCGCTGGGCGATCACTCGATGATGGCGAATCCGCGCCGCGTGGCAGTGGGGCTGGAACAAAACCGTCTGGCAATCCTGCTGGCTGTCTTGCACCGTCACGGTGGTCTGCAAATGGCCGATCAGGATGTGTTTGTGAACG‑TGGTCGGCGGCGTGAAGGTAACCGAAACCAGCGCCGACTTAGCGTTACTGCTGGCGATGGTTTCCAGCCTGCGTGACAGACCGCTGcc > 1:264871/7‑250 (MQ=255) 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gTCGATCACTCGATGATGGCGAATCCGCGCCGCGTGGCAGTGGGGCTGGAACAAAACCGTCTGGCAATCCTGCTGGCTGTCTTGCACCGTCACGGTGGTCTGCAAATGGCCGATCAGGATGTGTTTGTGAACG‑TGGTCGGCGGCGTGAAGGTAACCGAAACCAGCGCCGACTTAGCGTTACTGCTGGCGATGGTTTCCAGCCTGCGTGACAGACCGCTGCCACAGGATCTGGTGGTGTTTGGTGAAGTCgg > 1:48938/1‑251 (MQ=255) acgcGATGATGGCGAATCCGCGCCGCGTGGCAGTGGGGCTGGAACAAAACCGTCTGGCAATCCTGCTGGCTGTCTTGCACCGTCACGGTGGTCTGCAAATGGCCGATCAGGATGTGTTTGTGAACG‑TGGTCGGCGGCGTGAAGGTAACCGAAACCAGCGCCGACTTAGCGTTACTGCTGGCGATGGTTTCCAGCCTGCGTGACAGACCGCTGCCACAGGATCTGGTGGTGTTTGGTGAAGTCGGGCTGGCa < 1:404505/248‑1 (MQ=255) | CCGACTCCCGTTTTCGCACCTTGCGCAGCCATAAAAACCGCTTCGGCGCGGTGAATGAGCTGGGCGTCTTCGCGATGACCGAACAGGGGCTGCGTGAAGTCAGCAACCCTTCGGCAATTTTCTTAAGTCGCGGCGATGAAGTGACCTCCGGTAG‑C‑TCAGTGATGGTGGTATG‑GGAAGGAACGCGTCCACTGCTGGTGGAGATTCAGGCGCTGGTCGATCACTCGATGATGGCGAACCCACGCCGCGTGGCAGTGGGGCTGGAACAAAACCGTCTGGCAATCCTGCTGGCTGTGTTGCACCGTCACGGTGGTCTGCAAATGGCCGATCAGGATGTGTTTGTGAACG‑TGGTCGGCGGCGTGAAGGTAACCGAAACCAGTGCCGACTTAGCGTTACTGCTGGCGATGGTTTCCAGCCTGCGCGACAGACCGCTGCCGCAGGATCTGGTGGTGTTTGGTGAAGTCGGGCTGGCA > NC_000913/4626651‑4627120 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |