| Predicted mutation | ||||||
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| RA | NC_000913 | 4,515,348 | A→C | L444V (TTG→GTG) | fecA ← | ferric citrate outer membrane transporter |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_000913 | 4,515,348 | 0 | A | C | 98.6% | 228.3 / NA | 71 | L444V (TTG→GTG) | fecA | ferric citrate outer membrane transporter |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (1/0); new base C (33/37); total (34/37) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.79e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
GAAGCGGTGCGTTATAGCTCACTTCTTCGTGCGTGCCTGTGATGGCGTTGTTCTGGTATGACTCGATATGTTCGAAACGCATACCCGGCGTGATGGTCCAGTTGCCGATGTCGATTTTGTCATCCAGATACCAGGCGTGCGCCTCGGTGCCGGAACGCGTATCGCGGTCGTAAGGGCTTGAGCCGGACGGCAACTGCCCGCTGCTGGTGGCGGTGTAGTAACGCATTTCATGCGTTGATTCATTCAAATAGCGATAGCCCACGCCCACTTCGTGCGCGGAAGGGCCGATCATAAAGATCTGGCTGTAGCGTGGCTCAATACCGCGCACCCAGTAGTTACGCGGCGAGAGGGTG‑ATGCGTTTGCCTTGCTCCAGGTAGCCGCTGCGCAGGGTTTGGGTGTAGAACCCCTGAATGTTGAATTTATGCTGGCTGTCTGGCTGGAACTGGTAGCCCAGGCTCGCCAGCTTGCGACGACCCCAGAAGCG > NC_000913/4515102‑4515585 | gaagcgtggcggtataGCTCGCTTCTGCGTGCGTGCCTGGGATGGCGTTGTTCTGGTATGACTCGATATGTTCGAAACGCATACCCGGCGTGATGGTCCAGTTGCCGATGTCGATTTTGTCAGCCAGATACCAGGCGTGCGCCTCGGTGCCGGAACGCGGATCGCGGTCGTAAGGGCTTGAGCCGGACGGCAACTGCCCGCTGCTGGTGGCGGTGTAGTAACGCATTTCATGCGTTGATTCATTCACATAg < 2:235290/239‑1 (MQ=255) 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GAAGCGGTGCGTTATAGCTCACTTCTTCGTGCGTGCCTGTGATGGCGTTGTTCTGGTATGACTCGATATGTTCGAAACGCATACCCGGCGTGATGGTCCAGTTGCCGATGTCGATTTTGTCATCCAGATACCAGGCGTGCGCCTCGGTGCCGGAACGCGTATCGCGGTCGTAAGGGCTTGAGCCGGACGGCAACTGCCCGCTGCTGGTGGCGGTGTAGTAACGCATTTCATGCGTTGATTCATTCAAATAGCGATAGCCCACGCCCACTTCGTGCGCGGAAGGGCCGATCATAAAGATCTGGCTGTAGCGTGGCTCAATACCGCGCACCCAGTAGTTACGCGGCGAGAGGGTG‑ATGCGTTTGCCTTGCTCCAGGTAGCCGCTGCGCAGGGTTTGGGTGTAGAACCCCTGAATGTTGAATTTATGCTGGCTGTCTGGCTGGAACTGGTAGCCCAGGCTCGCCAGCTTGCGACGACCCCAGAAGCG > NC_000913/4515102‑4515585 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |