| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 4,431,220 | C→T | L453L (CTG→TTG) | cycA → | D‑serine/alanine/glycine/:H(+)symporter |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 4,431,220 | 0 | C | T | 92.0% | 131.9 / ‑1.6 | 51 | L453L (CTG→TTG) | cycA | D‑serine/alanine/glycine/:H(+)symporter |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (2/2); new base T (19/27); total (21/30) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 5.06e-01 | |||||||||||
TTCACGATGATTACAACCGTTTCCGCGATTCTGTTTATGTTCGTCTGGACGATTATCCTTTGCTCGTACCTTGTGTATCGCAAACAGCGTCCTCATCTACATGAGAAGTCGATCTACAAGATGCCGCTCGGCAAGCTGATGTGCTGGGTATGTATGGCGTTCTTTGTGTTCGTGGTCGTGTTGCTGACACTGGAAGATGACACTCGCCAGGCGCTGCTGGTTACCCCGCTGTGGTTTATCGCGCTGGGGTTGGGCTGGCTGTTTATTGGT‑AAGAAGCGGGCTGCTGAACTGCGGAAATAACCGCATTATCA‑TGCTGGATGGCGCAATGCCATCCAGCTTTTAGATCACTCACCC‑GCCAGCGCGCGTGGGAACAGTACATTGTTTTCCAGACTGATGTGATCCATCAGGTCATCAATCAGTTCATTAATGCCGTTATACATCGCTTTCCAGGTGGTGCAGGCTTCTGGCGGCGGT > NC_000913/4430977‑4431450 | ttCACGATGATTACAACCGTTTCCGCGATTCTGTTTATGTTCGTCTGGACGATTATCCTTTGCTCGTACCTTGTGTATCGCAAACAGCGTCCTCATCTACATGAGAAGTCGATCTACAAGATGCCGCTCGGCAAGCTGATGTGCTGGGTATGTATGGCGTTCTTTGTGTTCGTGGTCGTGTTGCTGACACTGGAAGATGACACTCGCCAGGCGCTGCTGGTTACCCCGCTGTGGTTTATCGCGTTGGGGtt > 2:148119/1‑251 (MQ=255) cGATGATTACAACCGTTTCCGCGATTCTGTTTATGTTCGTCTGGACGATTATCCTTTGCTCGTACCTTGTGTATCGCAAACAGCGTCCTCATCTACATGAGAAGTCGATCTACAAGATGCCGCTCGGCAAGCTGCTGTGCTGGGTATGTATGGCGTTCTTTGTGTTCGTGGTCGTGTTGCTGACACTGGAAGATGACCCTCGCCAGTCGCTGCTGGTTACCCCTCTGTGGTTTCTCGCGCTGGGGTTGggc > 2:119004/1‑251 (MQ=255) aaCCGTTTCCGCGATTCTGTTTATGTTCGTTTGGACGATTATCCGTTGCTCGTACCTTGTGTATCTCAAACAGCGTCCTCATCTACATGAGAAGTCGATCTACAAGATGCCGCTCGGCAAGCTGATGTGCTGGGTATGTATGGCGTTCTTTGTGTTCGTGGTCGTGTTGCTGACACTGGAAGATGACACTCGCCAGGCGCTGCTGGTTACCCCGCTGTGGTTTATCGCGTTGTGGTTGGGCTGGCTGTTTa < 2:438819/251‑1 (MQ=255) aaCCGTTTCCGCGATTCTGTTTATGTTCGTCTGGACGATTATCCTTTGCTCGTACCTTGTGTATCGCAAACAGCGTTCTCATCTACATGAGAAGTCGATCTACAAGATGCCGCTCGGCAAGCTGATGTGCTGGGTATGTATGGCGTTCTTTGTGTTCGGGGTCGTGTTGCTGACACTGGAAGATGACACTCGCCAGGCGCTGCTGTTTACCCCGCTGTGGTTTATCGCGTTGGGGTTGGGCTGGCTGTTTa < 1:264865/251‑1 (MQ=255) tCCGCGATTCTGTTTATGTTCGTCTGGACGATTATCCTTTGCTCGTACCTTGTGTATCGCAAACAGCGTCCTCATCTACATGAGAAGTCGATCTACAAGATGCCGCTCGGCAAGCTGATGTGCTGGGTATGTATGGCGTTCTTTGTGTTCGTGGTCGTGTTGCTGACACTGGAAGATGACACTCGCCAGGCGCTGCTGGTTACCCCGCTGTGGTTTATCGCGTTGGGGTTGGGCTGGCTGTTTATTGGT‑a < 2:305682/250‑1 (MQ=255) ccGCGATTCTGTTTATGTTCGTCTGGACGATTATCCTTTGCTCGTACCTTGTGTATCGCAAACAGCGTCCTCATCTACATGAGAAGTCGATCTACAAGATGCCGCTCGGCAAGCTGATGTGCTGGGTATGTATGGCGTTCTTTGTGTTCGTGGTCGTGTTGCTGACACTGGAAGATGACACTCGCCAGGCGCTGCTGGTTACCCCGCTGTGGTTTATCGCGTTGGGGTTGGGCTGGCTGTTTATTGGT‑aag < 1:394100/251‑1 (MQ=255) gcgtttCTGTTTATGTTCGTCTGGACGATTATCCTTTGCTCGTACCTTGTGTATCGCAAACAGCGTCCTCATCTACATGAGAAGTCGATCTACAAGATGCCGCTCGGCAAGCTGATGTGCTGGGTATGTATGGCGTTCTTTGTGTTCGTGGTCGTGTTGCTGACACTGGAAGATGACACTCGCCAGGCGCTGCTGGTTACCCCGCTGTGGTTTATCGCGCTGGGGTTGGGCTGGCTGTTTATTGGT‑aagaa < 2:129901/247‑1 (MQ=255) aTTCTGTTTATGTTCGTCTGGACGATTATCCTTTGCTCGTACCTTGTGTATCGCAAACAGCGTCCTCATCTACATGAGAAGTCGATCTACAAGATGCCGCTCGGCAAGCTGATGTGCTGGGTATGTATGGCGTTCTTTGTGTTCGTGGTCGTGTTGCTGACACTGGAAGATGACACTCGCCAGGCGCTGCTGGTTACCCCGCTGTGGTTTATCGCGTTGGGGTTGGGCTGGCTGTTTATTGGT‑AAGAAGCg < 2:351342/251‑1 (MQ=255) tGTTTATGTTCGTCTGGACGATTATCCTTTGCTCGTACCTTGTGTATCGCAAACAGCGTCCTCATCTACATGAGAAGTCGATCTACAAGATGCCGCTCGGCAAGCTGATGTGCTGGGTATGTATGGCGTTCTTTGTGTTCGTGGTCGTGTTGCTGCCACTGGAAGATGACACTCGCCAGGCGCTGCTGGTTACCCCGCTGTGGTTTATCGCGTTGGGGTTGGGCTGGCTGTTTATTGGT‑AAGAAGCGGgc < 2:182112/250‑1 (MQ=255) gACGATTATCCTTTGCTCGTACCTTGTGTATCGCAAACAGCGTCCTCATCTACATGCGAAGTAGATCTACAAGATGCCGCTCGGCAAGCTGATGTGCTGGGTATGTATGGCGTTCTTTGTGTTCGTGGTCGTGTTGCTGACACTGGAAGGTGACACTCGCCAGGCGCTGCTGGTTACCCCGCTGTGGTGTATCGCGTTGGGGGTGGGCTGGCTGTTTATTGGT‑AAGAATGGGGCTGCTGAAATGCGGAAAt > 2:275998/1‑251 (MQ=255) cGATTATCCTTTGCTCGTACCTTGTGTATCGCAAACAGCGTCCTCATCTACATGAGAAGTCGATCTACAAGATGCCGCTCGGCAAGCTGATGTGCTGGGTATGTATGGCGTTCTTTGTGTTCGTGGTCGTGTTGCTGACACTGGAAGATGACACTCGCCAGGCGCTGCTGGTTACCCCGCTGTGGTTTATCGCGTTGGGGTTGGGCTGGCTGTTTATTGGT‑AAGAAGCGGGCTGCTGAACTGCGGAAATaa < 2:412600/251‑1 (MQ=255) gATTATCCTTTGCTCGTACCTTGTGTATCGCAAAAAGCGTCCTCATCTACATGTGCAGTCGATCTACAACCTGCCGCTCGGAAAGCTGATGTGCTGGGTATGTATGGCGTTCTTTGTGTTCGTGGTCGTGTTGCTGACCCTGGCAGATGACACTCGCCAGGCGCTGCTGGTTACCCCGCTGTGGTTTATCGCGTTGGGGTTGGGCTGGCTGTTTATTGGT‑AAGAAGCGGGCTGCTGAACTGCGGAAATAAc > 1:445563/1‑251 (MQ=255) ccTTTGCTCGTACCTTGTGTCTCGCAAACAGTGTCCTCATTTACATGAGAAGTCGATCTACAAGATGCCGCTCGGCAAGCTGATGTGTTGGGTATGTATGGCGTTCTTTGTGTTCGTGGTCGTGTTGCTGACACTGGAAGATGACACTCGCCAGGCGCTGCTGGTTACCCCGCTGTGGTTTATCGCGTTGGGGTTGGGCTGGCTGTTTATTGGT‑AAGAAGCGGGCTGCTGAACTGCGGAAATAACCGCAtt < 2:431469/251‑1 (MQ=255) tACCTTGTGTATCGCAAACAGCGTCCTCATCTACATGAGAAGTCGATCTACAAGATGCCGCTCGGCAAGCTGATGTGCTGGGTATGTATGGCGTTCTTTGTGTTCGTGGTCGTGTTGCTGACACTGGAAGATGACACTCGCCAGGCGCTGCTGGTTACCCCGCTGTGGTTTATCGCGTTggg > 1:216772/1‑182 (MQ=255) tACCTTGTGTATCGCAAACAGCGTCCTCATCTACATGAGAAGTCGATCTACAAGATGCCGCTCGGCAAGCTGATGTGCTGGGTATGTATGGCGTTCTTTGTGTTCGTGGTCGTGTTGCTGACACTGGAAGATGACACTCGCCAGGCGCTGCTGGTTACCCCGCTGTGGTTTATCGCGTTggg < 2:216772/182‑1 (MQ=255) tgtgTAACGCAAACAGCGTCCTCATCTACATGAGAAGTCGATCTACAAGATGCCGCTCGGCAAGCTGATGTGCTGGGTATGTATGGCGTTCTTTGTGTTCGTGGTCGTGTTGCTGACACTGGAAGATGACACTCGCCAGGCGCTGCTGGTTACCCCGCTGTGGTTTATCGCGTTGGGGTTGGGCTGGCTGTTTATTGGT‑AAGAAGCGGGCTGCTGAACTGCGGAAATAACCGCATTATCA‑TGCTGGATgg < 1:312119/250‑1 (MQ=255) aaaCAGCGTCCTCATCTACATGAGAAGTCGATCTACAAGATGCCGCTCGGCAAGCTGATGTGCTGGGTATGTATGGCGTTCTTTGTGTTCGTGGTCGTGTTGCTGACACTGGAAGATGACACTCGCCAGGCGCTGCTGGTTACCCCGCTGTGGTTTATCGCGTTGGGGTTGGGCTGGCTGTTTATTGGT‑AAGAAGCGGGCTGCTGAACTGCGGAAATAACCGCATTATCA‑TGCTGGATGGCGCAATGCCAt > 1:186754/1‑251 (MQ=255) cATCTACCTGAAAAGGCGATCTACAAGATGGCGCTCGGCAAACTGATTTGCTGGGTATGTATGGCTTTCTTTGTGTTCGTGGTCGTGTTGCTGACACTTGAAGATGACACTCGCCAGGCGCTGCTGGTTACCCCGCTGTGGTTTATCGCGTTGGGGTTGGGCTGGCTGTTTATTGGT‑AAGAAGCGGGCTGCTGAACTTCGGAAATAACCGCATTATCA‑TGCTGGATGGCGCAATGCCAGCCAGCTTTTAg < 2:101859/250‑1 (MQ=255) tCTACATGAGAAGTCGATCTACAAGATGCCGCTCGGCAAGCTGATGTGCTGGGTATGTATGGCGTTCTTTGTGTTCGTGGTCGTGTTGCTGACACTGGAAGATGACACTCGCCAGGCGCTGCTGGTTACCCCGCTGTGGTTTATCGCGTTGGGGTTGGGCTGGCTGTTTATTGGT‑AAGAAGCGGGCTGCTGAACTGCGGAAATAACCGCATTATCA‑TGCTGGATGGCGCAATGCCATCCAGCtttt > 1:374715/1‑246 (MQ=255) cGATCTACAAGATGCCGCTCGGCAAGCTGATGTGCTGGGTATGTATGGCGTTCTTTGTGTTCGTGGTCGTGTTGCTGACACTGGAAGATGACACTCGCCAGGCGCTGCTGGTTACCCCGCTGTGGTTTATCGCGTTGGGGTTGGGCTGGCTGTTTATTGGT‑AAGAAGCGGGCTGCTGAACTGCGGAAATAACCGCATTATCA‑TGCGGGATGGCGCAATGCCATCCAGCTTTTAGATCACTCACCC‑GCCAgc > 1:46394/1‑251 (MQ=255) aCAAGATGCCGCTCGGCAAGCTGATGTGCTGGGTATGTATGGCGTTCTTTGTGTTCGTGGTCGTGTTGCTGACACTGGAAGATGACACTCGCCAGGCGCTGCTGGTTACCCCGCTGTGGTTTATCGCGTTGGGGTTGGGCTGGCTGTTTATTGGT‑AAGAAGCGGGCTGCTGAACTGCGGAAATAACCGCATTATCA‑TGCTGGATGGCGCAATGCCATCCAGCTTTTAGATCACTCACCC‑GCCAGCGCGCGt > 1:347399/1‑251 (MQ=255) aaaccTGATGGGGTGGGGATGTATGGCGTTTTTTGTGTGCTGGGCCGTGTTGCGGTCCGGGGAAGGTGACCCCCGCCGGGGGCTGTGGGTTTCCCCTCTGTGGTTTATCGCGTTGGGGTGGGGCTGGTTTTTTATTGGT‑AAGAAGCGGGCGGCTGAACTGCGGAAATAACCGCATTATCA‑TGCGGGATGGCGCAATGCCATCCAGTTTTTAGACCACTCACCC‑GCCAGCGCGCGTGGGAACAGTACATTGt < 2:186754/247‑1 (MQ=255) tgtgCTGGGTATGTGTGGCGTTCTTTGTGTTCGTGGTCGTGTTGCTGACACTGGAAGATGACCCTCGCCAGGCGTTGCTGTTTACCCGGCTGTGGTTTATCGCGTTGGGGTTGGGCTGGGTGTTTATTGGT‑AAGAAGCGGGCTGCTGAACTGCGGAAATAACCGCATTATCA‑TGCTGGATGGCGCAATGCCATCCAGCTTTTAGATCACTCACCC‑GCCAGCGCGCGTGGGAACAGTACATTGTTTTCCAg < 1:275998/250‑1 (MQ=255) gtgCTGGGTATGTATGGCGTTCTTTGTGTTCGTGGTCGTGTTGCTGACACTGGAAGATGACACTCGCCAGGCGCTGCTGGTTACCCCGCTGTGGTTTATCGCGTTGGGGTTGGGCTGGCTGTTTATTGGT‑AAGAAGCGGGCTGCTGAACTGCGGAAATAACCGCATTATCA‑TGCTGGATGGCGCAATGCCATCCAGCTTTTAGATCACTCACCC‑GCCAGCGCGCGTGGGAACAGTACATTGTTTTCCAGAc > 2:10914/1‑251 (MQ=255) gtgCTGGGTATGTATGGCGTTCTTTGTGTTCGTGGTCGTGTTGCTGACACTGGAAGATGACACTCGCCAGGCGCTGCTGGTTACCCCGCTGTGGTTTATCGCGTTGGGGTTGGGCTGGCTGGTTATTGGT‑AAGAAGCGGGCTGCTGAACTGCGGAAATAACCGCATTATAG‑TGCTGGATGGCGCAATGCCATCCAGCTTTTAGATCACTCACCC‑GCCTGCGCGCGTGGGCACAGTACATTGTTTTCCAGa > 2:257756/1‑250 (MQ=255) ggtatgtagtgtttgcTTTGGGTCCGTGGTCGTGTGGCTTACACTGGAAGATGACCCTCGCCGGGCGCTGCTGGTTCCCCCGTTGTGGTTTATCGCGCGGGGGTTGGGCTGTCTGTTGATGGGT‑AAGAAGCGGGCTGCTGACCTGCGGAAATAACCGCATTATCA‑TGCTGGATGGCGCAAGGCCATCCAGCTTTTAGATCACTCACCC‑GCCAGCGCGCGTGGGAACAGTACATTGTTTTCCAGACTGAtgt < 2:71796/236‑1 (MQ=255) atgtatgGCGTTCTTTGTGTTCGTGGTCGTGTTGCTGACACTGGAAGATGACACTCGCCAGGCGCTGCTGGTTACCCCGCTGTGGTTTATCGCGCTGGGGTTGGGCTGGCTGTTTATTGGT‑AAGAAGCGGGCTGCTGAACTGCGGAAATAACCGCATTATCA‑TGCTGGATGGCGCAATGCCATCCAGCTTTTAGATCACTCACCC‑GCCAGCGCGCGTGGGAACAGTACATTGTTTTCCAGACTGATGTGAt > 1:184292/1‑251 (MQ=255) atgtatgGCGTTCTTTGTGTTCGTGGTCGTGTTGCTGACACTGGAAGAGGACACTCGCCAGGCGCGGCTGGTTCCCCCGCTGTGGTTTATCGCGTTGGGTTTGGGCTGGTTGTTTATGGGT‑AAGAAGCGGGCTGCTGAACTGCGTAAATACCCGCATTATCA‑TGCTGGATGGCGCAATGCCATCCAGCTTTTAAATCACTCACCC‑GCCAGCGCGCGTGGGAACAGTACATTGTTTTCCAGACTGATGTGAt < 1:397014/251‑1 (MQ=255) tgtatgGGGTTCTTTGTGGTCGTGGTGGGGTTGCTGACACGGGAGGATTACATTCGCCAGTCGTTGCTGTTTACCCCGTTTTGGTTTATCGGTTTGGGTTTGGGCTGGCTGTTTTTTGGT‑AAGAAGCGGGCTGCTGAATTGCGGAAATAACCGTATT‑TCAAGGCTGGATGGCGCATTGCCATCCAGCTTTTAGAACAATCTCCC‑TCCAGCGCGCGTGGGAACAGTACATTGTTTTCCAGACTGATGTGAt < 2:407832/250‑1 (MQ=255) tgtatgGCGTTCTTTGTGTTCGTGGTCGTGTTGCTGACACTGGAAGATGACACTCGCCAGGCGCTGCTGGTTACCCCGCTGTGGTTTATCGCGTTGGGGTTGGGCTGGCTGTTTATTGGT‑AAGAAGCGGGCTGCTGAACTGCGGAAATAACCGCATTATCA‑TGATGGATGGCGCAATGCCATCCAGCTTTTAGATCACTCACCC‑GCCAGCGCGCGGGGGAACAGAACATTGTTTTCCAGACTGATGTGATc > 2:471835/1‑251 (MQ=255) tatgGCGTTCTTTGTGTTCGTGGTCGTGTTGCTGACACTGGAAGATGACACTCGCCAGGCGCTGCTGGTTACCCCGCTGTGGTTTATCGCGTTGGGGTTGGGCTGGCTGTTTATTGGT‑AAGAAGCGGGCTGCTGAACTGCGGAAATAACCGCATTATCA‑TGCTGGATGGCGCAATGCCATCCAGCTTTTAGATCACTCACCC‑GCCAGCGCGCGTGGGAACAGTACATTGTTTTCCAGACTGTTGTGTTcc > 2:361489/1‑250 (MQ=255) gCGTTCTTTGTGTTCGTGGTCGTGTTGCTGACACTGGAAGATGACACTCGCCAGGCGCTGCTGGTTACCCCGCTGTGGTTTATCGCGTTGGGGTTGGGCTGGCTGTTTATTGGT‑AAGAAGCGGGCTGCTGAACTGCGGAAATAACCGCATTATCA‑TGCTGGATGGCGCAATGCCATCCAGCTTTTAGATCACTCACCC‑GCCAGCGCGCGTGGGAACAGTACATTGTTTTCCAGACTGATGTGATCCATCAg < 1:148119/251‑1 (MQ=255) cgtgcTTTGTGTTGTTGGTCGTGTTGCTGACACTGGAAGATGACTCTCGCCGGGCGCTTCTGGTTACCCCGTTGTGGTTGATGGCGTTGGGTTTGGGCTGGCTGTTTATTGGT‑TAGAGGCGGGCTGCTGAACTGCGGAAATAACCTCATTATCA‑GGCTGGATGGCGCAAGGCCATCCAGCTTTTAGTGCCCTCCCCC‑GCCAGCGCGCGTGGGAACAGTACATTGTTTTCCAGACTGATGTGATCCATCAg < 1:426411/246‑1 (MQ=255) tgtgTTCGTGGTCGTGTTGCTGACACGGGAAGATGACACTCGCCAGGCGCTGCTGGTTACCCCGCTGTGGTTTATCGCGTTGGGGTTGGGCTGGCTGTTTATTGGT‑AAGAAGCGGGCTGCTGAACTGCGGAAATAACCGCATTATCA‑TGCTGGATGGCGCAATGCCATCCAGCTTTTAGATCACTCACCC‑GCCAGCGCGCGTGGGAACAGTACATTGTTTTCCAGACTGATGTGATCCATCAGGtcatca < 1:10914/250‑1 (MQ=255) ggttttCGGGGTGGTGTTTCTGACACTGGAAGATGACCCTCGCCAGGCGTGGCTGGTTGCCCCGGGTTGGTTTATCGCGTTGGGGTGGGGCTGGCTGTTTATTGGT‑AAGAAGCGGGCTGCTGAACTGCGGAAATACCCGCATTATCA‑TGCTGGATGGCGCAATGCCATCCAGCTTTTAGATCACTCCCCC‑GCCAGCGCGCGTGGGAACAGTACATTGTTTTCCAGACTGATGTGATCCATCAGGtcatca < 2:92845/246‑1 (MQ=255) tGGTCGTGTTGCTGACACTGGAAGATGACACTCGCCAGGCGCTGCTGGTTACCCCGCTGTGGTTTATCGCGTTGGGGTTGGGCTGGCTGTTTATTGGT‑AAGAAGCGGGCTGCTGAACTGCGGAAATAACCGCATTATCA‑TGCTGGATGGCGAAATGCCATCCAGCTTTTAGATCCCT‑ACCCAGCCAGCGCGCGTGGGCACAGTACCTTGTTTTCCAGGCTGGTGTGATcactccggtcaacaataag > 2:395648/1‑229 (MQ=255) ggttCGTGTTGCTGACACTGGAAGATGACACGCGCCAGGCGCTGCTGGTTACCCCGCTGTGGTTTATCGCGTTGGGGTTTGGCTGGCTGTTTATTGGT‑AAGAAGCGTGCGGCTGAACTGCGGAAATAACCGCATTATCA‑TGCTGGATGGCGCAATGCCATCCAGCTTTTAGATCACTCACCC‑GCCAGCGCGCGTGGGAACAGTACATTGTTTTCCAGACTGATGTGATCCATCAGGTCATCAATCAg < 1:395648/244‑1 (MQ=255) ggTCGTGTTTCTGACACTGGAAGATGACACTCGCCAGGCGCTGCTGGTTACCCCGCTGTGGTTTATCGCGTTGGGGTTGGGCTGGCTGTTTATTGGT‑AAGAAGCGGGCTGCTGAACTGCGGAAATAACCGCATTATCA‑TGCTGGATGGCGCAATGCCATCCAGCTTTTAGATCACTCACCC‑GCCAGCGCGCGTGGGAACAGTACATTGTTTTCCAGACTGATGTGATCCATCAGGTCATCAATCAGTTCAt < 1:127146/251‑1 (MQ=255) 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ggAAGATGACACTCGCCGTGCGCGGCTGGTTGCCCTGCGTTGGTTTATCGCGTTGGGTTTGGGCGGGGTGTTTATTGGT‑AAGAAGCGGGCTGTTGAACTGCGGAAATAACCGCATTATCA‑TGCTGTAGGGCGCAATGCCCTCCAGCTTTTATATCACTCACCC‑GCCAGCGCGCGTGGGAACAGTACATTGTTTTCCAGACTGATGTGATCCATCAGGTCATCAATCAGTTCATTAATGCCGTTATACATc < 1:257756/250‑1 (MQ=255) acgATGACACTCGCCAGGCGCTGCTGGTTACCCCGCTGTGGTTTATCGCGTTGGGGTTGGGCTGGCTGTTTATTGGT‑AAGAAGCGGGCTGCTGAACTGCGGAAATAACCGCATTATCA‑TGCTGGATGGCGCAATGCCATCCAGCTTTTAGATCACTCACCC‑GCCAGCGCGCGTGGGAACAGTACATTGTTTTCCAGACTGATGTGCTCCATCAGGTCATCAATCAGTTCATTACTGCCGTTATACATCGCt > 2:95605/3‑251 (MQ=255) gtgtcaccctccgtgcgcTGTTGTTTCCCCCGTTGGGGTTTACTGCGTTGGGTTTGGGCTGGCTGTTGAT‑GTTGAAGAAGGTGTCTGCTGAACGGCTGAAATAACCGCATTACCA‑TGCTGGCTTGCGTAATCCCAGCCATTTTTTAGATCATTCCCCC‑GCCAGCGCGCGTGGGAACAGTACATTGTTTTCCAGGCTGATGTGATCCATCAGGTCAACAATCAGTTCATTAATGCCCTGATATATCGCTTTc < 2:205167/237‑1 (MQ=255) 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ggttctccctcTGTGGTTTAGCGCGTTGGGGTTGGGTGGGCTGTTTATTGTA‑AAAAAGCGGGCGGCTGACATGCGGAAATAACCGCATTATAA‑TTCTGTAGGGCTCAATGCCTACCAGCTTTTAGATCACTCACCC‑GCCAGCGCGCGTGGGAACAGTACATTGTTTTCCAGACTGATGTGATCCATCAGGTCATCAATCAGTTCATTAATGCCGTTATACATCGCTTTCCAGGTGGTGCAGGTTTCTgtc < 2:194769/240‑3 (MQ=255) tACCCCGCTGTGGTTTATCGCGTTGGGGTTGGGCTGGCTGTTTATTGGT‑AAGAAGCGGGCTGCTGAACTGCGGAAATAACCGCATTATCA‑TGCTGGATGGCGCAATGCCATCCAGCTTTTAGATCACTCACCC‑GCCAGCGCGCGTGGGAACAGTACATTGTTTTCCAGACTGATGTGATCCATCAGGTCATCAATCAGTTCATTAATGCCGTTATACATCGCTTTCCAGGTGGTGCAGGCTTCTGgcggcg > 1:49347/1‑251 (MQ=255) ccccGCTGTGGTTTATCGCGTTGGGGTTGGGCTGGCTGTTTATTGGT‑AAGAAGCGGGCTGCTGAACTGCGGAAATAACCGCATTATCA‑TGCTGGATGGCGCAATGCCATCCAGCTTTTAGATCACTCACCC‑GCCAGCGCGCGTGGGAACAGTACATTGTTTTCCAGACTGATGTGATCCATCAGGTCATCAATCAGTTCATTAATGCCGTTATACATCGCTTTCCAGGTGGTGCAGGCTTCTGGcggcggg > 1:13264/1‑250 (MQ=255) | TTCACGATGATTACAACCGTTTCCGCGATTCTGTTTATGTTCGTCTGGACGATTATCCTTTGCTCGTACCTTGTGTATCGCAAACAGCGTCCTCATCTACATGAGAAGTCGATCTACAAGATGCCGCTCGGCAAGCTGATGTGCTGGGTATGTATGGCGTTCTTTGTGTTCGTGGTCGTGTTGCTGACACTGGAAGATGACACTCGCCAGGCGCTGCTGGTTACCCCGCTGTGGTTTATCGCGCTGGGGTTGGGCTGGCTGTTTATTGGT‑AAGAAGCGGGCTGCTGAACTGCGGAAATAACCGCATTATCA‑TGCTGGATGGCGCAATGCCATCCAGCTTTTAGATCACTCACCC‑GCCAGCGCGCGTGGGAACAGTACATTGTTTTCCAGACTGATGTGATCCATCAGGTCATCAATCAGTTCATTAATGCCGTTATACATCGCTTTCCAGGTGGTGCAGGCTTCTGGCGGCGGT > NC_000913/4430977‑4431450 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |