| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 3,647,428 | C→T | A377V (GCG→GTG) | gor → | glutathione reductase (NADPH) |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,647,428 | 0 | C | T | 93.9% | 139.7 / NA | 49 | A377V (GCG→GTG) | gor | glutathione reductase (NADPH) |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); major base T (20/26); minor base G (1/2); total (21/28) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
GTATTTACGCGGTGGGCGATAACACGGGTGCAGTGGAG‑CTGACACCGGTGGCAGTTGCAGCGGGTCGCCGTCTCTCTGAACGCCTG‑TTTAATAA‑CAAGCCGGATGAGCATCTGGATTACAGCAACATTCCGACCGTGGTCTTCAGCCATCCGCCGATTGGTACTGTTGGTTTAACGGAACCGCAGGCG‑CGCGAGCAGTATGGCGACGATCAGGTGAAAGTGTATAAATCCTCTTTCACCGCGATGTATACCGCCGTCACCACTCACCGCCAGCCGTGCCGCATGAAGCTGGTGTGCGTTGGATCGGAAGAGAAGATTGTCGGTATTCACGGCATTGGCTTTGGTATGGACGAAATGTTGCAGGGCTTCGCGGTGGCGCTGAAGATGGGGGCAACCAAAAAAGACTTCGACAATACCGTCGCCATTCACCCAACGGCGGCAGAAGAGTTCGTGACAATGCGTTAA > NC_000913/3647188‑3647651 | gTATTTACTCGGTGGGCGATAACACGGGTGCATTGGAG‑CTGACACCGGTGGCAGTTGCAGCGGGTCGCCGTCTCTCTGAACGCCTG‑TTTAAGAA‑CAAGCCGGATGAGCATCTGGATTACAGCAACATTCCGACCGTGGTCTTCAGCCATCCTCCGATTGGTACTGTTGGTTTAACGGAACAGCAGGCG‑CGCGATCAGTATGGCGACGATCAGGTGAAAGTGTATAAATCCTCTTTCACCGTGATGTATAcc < 2:72554/251‑1 (MQ=255) ttACGCGGTGGGCGATAACACGGGTGCAGTGGAG‑CTGACACCGGTGGCAGTTGCAGCGGGTCGCCGTCTCTCTGAACGCCTG‑TTTAATAA‑CAAGCCGGATGAGCATCTGGATTACAGCAACATTCCGACCGTGGTCTTCAGCCATCCGCCGATTGGTACTGTTGGTTTAACGGAACCGCAGGCG‑CGCGAGCAGTATGGCGACGATCAGGTGAAAGTGTATAAATCCTCTTTCACCGTGATGTATAccgccg > 1:405329/1‑251 (MQ=255) aCGCGGTGGGCGATAACACGGGTGCAGTGGAG‑CTGACACCGGTGGCAGTTGCAGCGGGTCGCAGTCTCTCTGAACGCCTG‑TTTAATAA‑CAAGCCGGATGAGCATCTGGATTACAGCAACATTCCGACCTTGGTCTTCAGCCATCCGCCGATTGGTACTGTTGGTTTAACGGAACCGCAGGCG‑CGCGAGCAGTATGGCGACGATCAGGTGAAAGTGTATAAATCCTCTTTCACCGTGATGTATACCGCCGTc < 1:218111/251‑1 (MQ=255) cgcgGTGGGCGATAACACGGGTGCATGGGAG‑CCGACACCGTTGGCAGTTGCAGCGGGTCGCCGTCTCTCTTAACGCCTG‑TTTAATAA‑CAAGCCGGATGAGCATCTGGCTTACTGCAACATTCCGACCGTGGTCTTCAGCCATCCGCCGATTGGTACTGTTGGTTTAACGGAACCGCAGGCG‑CGCGAGCAGTATGGCGACGATCAGGTGAAAGTGTATAAATCCTCTTTCACCGTGATGTATACCGCCGTca < 2:120589/251‑1 (MQ=255) 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cAGCGGGTCGCCGTCTCTCTGAACGCCTG‑TTTAATAA‑CAAGCCGGATGAGCATCTGGATTACAGCAACATTCCGACCGTGGTCTTCAGCCATCCGCCGATTGGTACTGTTGGTTTAACGGAACCGCAGGCG‑CGCGAGCAGTATGGCGACGATCAGGTGAAAGTGTATAAATCCTCTTTCACCGTGATGTATACCGCCGTCACCACTCACCGCCAGCCGTGCCGCATGAAGCTGGTGTGCGTTGGATCGga > 1:457638/1‑250 (MQ=255) cGGGTCGCCGTCTCTCTGAACGCCTG‑TTTAATAA‑CAAGCCGGATGAGCATCTGGATTACAGCAACATTCCGACCGTGGTCTTCAGCCATCCGCCGATTGGTACTGTTGGTTTAACGGAACCGCAGGCG‑CGCGAGCAGTATGGCGACGATCAGGTGAAAGTGTATAAATCCTCTTTCACCGTGATGTATACCGCCGTCACCACTCACCGCCAGCCGTGCCGCATGAAGCTGGTGTGCGTTGGATCGgaagag < 1:387638/251‑1 (MQ=255) tCGCCGTCTCTCTGAACGCCTG‑TTTAATAA‑CAAGCCGGATGAGCATCTGGATTACAGCAACATTCCGACCGTGGTCTTCAGCCATCCGCCGATTGGTACTGTTGGTTTAACGGAACCGCAGGCG‑CGCGAGCAGTATGGCGACGATCAGGTGAAAGTGTATAAATCCTCTTTCACCGTGATGTATACCGCCGTCACCACTCACCGCCAGCCGTGCCGCATGAAGCTGGTGTGCGTTGGATCGgaagagaagg > 2:171265/1‑250 (MQ=255) cGCCGTCTCTCTGAACGCCTG‑TTTAATAA‑CAAGCCGGATGAGCATCTGGATTACAGCAACATTCCGACCGTGGTCTTCAGCCATCCGCCGATTGGTACTGTTGGTTTAACGGAACCGCAGGCG‑CGCGAGCAGTATGGCGACGATCAGGTGAAAGTGTATAAATCCTCTTTCACCGTGATGTATACCGCCGTCACCACTCACCGCCAGCCGTGCCGCATGAAGCTGGTGTGCGTTGGATCGGAAGAGAAGAt < 1:129147/251‑1 (MQ=255) acgctttttAATAAACAAGCCGGTGGAGCATTGGGATTACAGCAACTTTCCGCCCGTGGTCTCCAGCCTTCCGCCGATTGGTACTGTTGGGTTAACGGAACCGCAGGCG‑CGCGAGCAGTATGGCGACGATCAGGTGAAAGTGTATAAATCCTCTTTCACCGGGATGTATACCGCCGTCACCACTCACCGCCAGCCGTGCCGCATGAAGCTGGTGTGCGTTGGATCGGAAGAGAAGATTGTCGGTATTCACg < 2:143500/245‑1 (MQ=255) ttAATAA‑CAAGCCGGATGAGCATCTGGATTACAGCAACATTCCGACCGTGGTCTTCAGCCATCCGCCGATTGGTACTGTTGGTTTAACGGAACCGCAGGCG‑CGCGAGCAGTATGGCGACGATCAGGTGAAAGTGTATAAATCCTCTTTCACCGTGATGTATACCGCCGTCACCACTCACCGCCAGCCGTGCCGCATGAAGCTGGTGTGCGTTGGATCGGAAGAGAAGATTGTCGGTATTCACGGCATTgg < 1:130962/250‑1 (MQ=255) aataa‑CAAGCCGGATGAGCATCTGGATTACAGCAACATTCCGACCGTGGTCTTCAGCCAGCCGCCGATTGGAACTGTTGGTTTAACGGAACCGCAGGCG‑CGCGAGCCGTATGGCGACGATCAGGTGAAAGTGAATAAATCCTCTTTCACCGTGATGTATACCGCCGTCACCACTCACCGCCAGCCGTGCCGCATGAAGATGGTGTGCGTTGGATCGGAAGAGAAGATTGTCGGTATACACGGCATTGGCtt > 2:425860/1‑251 (MQ=255) aaaaaacggCCGGATGAGTATCGGGATTAAAGAACCATGCCGACCGTGGTCTTCAGCCATCCGCCGATTGGTACTGTTGGTTTAACGGAACCGCAGGCG‑CGCGAGCAGTATGGCGACGATCAGGTGAAAGTGTATAAATCCTCTTTCACCGTGATGTATGCCGCCGTCACCACTCACCGCCAGCCGTGCCGCATGAAGCTGGTGTGCGTTGGATCGGAAGAGAAGATTGTCGGTATTCACGGCATTGGCt < 2:186216/242‑1 (MQ=255) aaGCCGGATGAGCATCTGGATTACAGCAACATCCCGACCGTGGTCTTCAGCCATCCGCCGATTGGTACTGTTGGTTTAACGGAACCGCAGGCG‑CGCGAGCAGTATGGCGACGATCAGGTGAAAGTGTATAAATCCTCTTTCACCGGGATGTATACCGCCGTCACCACTCACCGCCAGCCGTGCCGCATGAAGCTGGTGTGCGTTGGATCGGAAGAGAAGATTGTCGGTATTCACGGCATTGGCTTTGGTAt < 1:200930/251‑1 (MQ=255) gCCGGATGAGCATCTGGATTACAGCAACATTCCGACCGTGGTCTTCAGCCATCCGCCGATTGGTACTGTTGGTTTAACGGAACCGCAGGCG‑CGCGAGCAGTATGGCGACGATCAGGTGAAAGTGTATAAATCCTCTTTCACCGTGATGTATACCGCCGTCACCACTCACCGCCAGCCGTGCCGCATGAAGCTGGTGTGCGTTGGATCGGAAGAGAAGATTGTCGGTATTCCCGGCATTGGCTTTGGTATgg > 2:423269/1‑251 (MQ=255) cGGATGAGCATCTGGATTCCAGCAACATTCCGCCCGTGGTCTTCAGCCATCCGCCGATTGGTACTGTTGGTTTAACGGAACCGCAGGCG‑CGCGAGCAGTATGGCGACGATCAGGTGAAAGTGTATAAATCCTCTTTCACCGTGATGTATACCGCCGTCACCACTCACCGCCAGCCGTGcc < 1:349643/180‑1 (MQ=255) cGGATGAGCATCTGGATTACAGCAACATTCCGACCGTGGTCTTCAGCCATCAGCCGATTGGTACTGTTGGTTTAACGGAACCGCAGGCG‑CGCGAGCAGTATGGCGACGATCAGGTGAAAGTGTATAAATCCTCTTTCACCGTGATGTATACCGCCGTCACCACTCACCGCCAGCCGTGcc > 2:349643/1‑180 (MQ=255) aTGAGCATCTGGATTACAGCAACATTCCGACCGTGGTCTTCAGCCATCCGCCGATTGGTACTGTTGGTTTAACGGAACCGCAGGCG‑CGCGAGCAGTATGGCGACGATCAGGTGAAAGTGTATAAATCCTCTTTCACCGTGATGTATACCGCCGTCACCACTCACCGCCAGCCGTGCCGCATGAAGCTGGTGTGCGTTGGATCGGAAGAGAAGATTGTCGGTATTCACGGCATTGGCTTTGGTATGGACGa > 1:321488/1‑250 (MQ=255) 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ttGGTACTGTTGGTTTAACGGAACCGCAGGCG‑CGCGAGCAGTATGGCGACGATCAGGTGAAAGTGTATAAATCCTCTTTCACCGTGATGTATACCGCCGTCACCACTCACCGCCAGCCGTGCCGCATGAAGCTGGTGTGCGTTGGATCGGAAGAGAAGATTGTCGGTATTCACGGCATTGGCTTTGGTATGGACGAAATGTTGCAGGGCTTCGCGGTGGCGCTGAAGATGGGGGCAACCAAAAAAGACTTc > 1:117846/1‑251 (MQ=255) gTTGGTTTAACGGAATCGCAGGCG‑CGCGAGCAGTATGGCGACGATCAGGTGAAAGTGTATAAATCCTCTTTCACCGTGATGTATACCGCCGTCACCACTCACCGCCAGCCGTGCCGCATGAAGCTGGTGTGCGTTGGATCGGAAGAGAAGATTGTCGGTATTCACGGCATTGGCTTTGGTATGGACGAAATGTTGCAGGGCTTCGCGGTGGCGCTGAAGATGGGGGCAACCAAAAAAGACTTCGACAAt < 1:334124/249‑1 (MQ=255) aaCCGCAGGCG‑CGCGAGCAGTATGGCGACGATCAGGTGAAAGTGTATAAATCCTCTTTCACCGTGATGTATACCGCCGTCACCACTCACCGCCAGCCGTGCCGCATGAAGCTGGTGTGCGTTGGATCGGAAGAGAAGATTGTCGGTATTCACGGCATTGGCTTTGGTATGGACGAAATGTTGCAGGGCTTCGCGGTGGCGCTGAAGATGGGGGCAACCAAAAAAGACTTCGACAATACCGTCGCCATTCAc > 1:320633/1‑251 (MQ=255) 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gaTCAGGTGAAAGTGTATAAATCCTCTTTCACCGTGATGTATACCGCCGTCACCACTCACCGCCAGCCGTGCCGCATGAAGCTGGTGTGCGTTGGATCGGAAGAGAAGATTGTCGGTATTCACGGCATTGGCTTTGGTATGGACGAAATGTTGCAGGGCTTCGCGGTGGCGCTGAAGATGGGGGCAACCAAAAAAGACTTCGACAATACCGTCGCCATTCACCCAACGGCGGCAGAAGAGTTCGTGACAAt > 1:21275/1‑251 (MQ=255) accgggTGAAAGTTTATAAATCCTTTTCCACCGTGATGTATCCCGCCGTCACCACTCACCGCCAGCCGTGCCGCATGAAGCTGGTGTGCGTTGGATCGGAAGAGAAGATTGTCGGTATTCACGGCATTGGCTTTGGTATGGACGAAATGTTGCAGGGCTTCGCGGTGGCGCTGAAGATGGGGGCAACCAAAAAAGACTTCGACAATACCGTCGCCATTCACCCAACGGCGGCAGAAGAGTTCGTGACAATg < 2:9179/247‑1 (MQ=255) aGGTGAAAGTTTATAATTCCCTTTTCCCCGTGATGTATCCCGCCGTCACCACTCACCGCCAGCCGTGCCGCATGAAGCTGGTGTGCGTTGGATCGGAAGAGAAGATTGTCGGTATTCACGGCATTGGCTTTGGTATGGACGAAATGTTGCAGGGCTTCGCGGTGGCGCTGAAGATGGGGGCAACCAAAAAAGACTTCGACAATACCGTCGCCATTCACCCAACGGCGGCAGAAGAGTTCGTGACAATGCGt < 1:264385/251‑1 (MQ=255) aGGTGAAAGTGTATAAATCCTCTTTCACCGTGATGTATACCGCCGTCACCACTCACCGCCAGCCGTGCCGCATGAAGCTGGTGTGCGTTGGATCGGAAGAGAAGATTGTCGGTATTCACGGCATTGGCTTTGGTATGGACGAAATGTTGCAGGGCTTCGCGGTGGCGCTGAAGATGGGGGCAACCaa < 1:158622/187‑1 (MQ=255) aGGTGAAAGTGTATAAATCCTCTTTCACCGTGATGTATACCGCCGTCACCACTCACCGCCAGCCGTGCCGCATGAAGCTGGTGTGCGTTGGATCGGAAGAGAAGATTGTCGGTATTCACGGCATTGGCTTTGGTATGGACGAAATGTTGCAGGGCTTCGCGGTGGCGCTGAAGATGGGGGCAACCaa > 2:158622/1‑187 (MQ=255) gTGAAAGTGTATAAATCCTCTTTCACCGTGATGTATACCGCCGTCACCACTCACCGCCAGCCGTGCCGCATGAAGCTGGTGTGCGTTGGATCGGAAGAGAAGATTGTCGGTATTCACGGCATTGGCTTTGGTATGGACGAAATGTTGCAGGGCTTCGCGGTGGCGCTGAAGATGGTGGCAACCAAAAAAGACTTCGACAATACCGTCACCATTCACCCAACGACGGCAGAAGATGTCGAGACAATGCGtt > 1:250033/1‑250 (MQ=255) tGAAAGTGTATACATCCTCTTTCACCGTGATGTATACCGCCGTCACCACTCACCGCCAGCCGTGCCGCATGAAGCTGGTGTGCGTTGGATCGGAAGAGAAGATTGTCGGTATTCACGGCATTGGCTTTGGTATGGACGAAATGTTGCAGGGCTTCGCGGTGGCGCTGAAGATGGGGGCAACCAAAAAAGACTTCGACAATACCGCCGCCATTCACCCAACGGCGGCAGAAGAGTTCGGGACAATGCggta > 2:457461/1‑247 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |