| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 3,400,207 | G→A | T294I (ACC→ATC) | mreB ← | dynamic cytoskeletal protein MreB |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,400,207 | 0 | G | A | 97.3% | 210.2 / NA | 75 | T294I (ACC→ATC) | mreB | dynamic cytoskeletal protein MreB |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (1/1); major base A (41/30); minor base C (2/0); total (44/31) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.09e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
AAAATTGGCTTCATAAGTTATGCGTATTCTCGTATCAGACCAGGCAGGGTAAACAGACACTTCCCCTGCCTGCATCCGATTACTCTTCGCTGAACAGGTCGCCGCCGTGCATGTCGATCATTTCCAGCGCTTTGCCGCCACCGCGCGCCACACAGGTCAGCGGGTCTTCAGCAACAACGACTGGAATGCCGGTTTCTTCCATTAACAAACGGTCAAGGTTACGCAGCAGTGCGCCACCACCGGTGAGCACCATGCCGCGCTCGGAGATGTCGGAAGCCAGTTCCGGCGGGCACTGTTCCAGTGCAACCATTACCGCGCTCACAATACCGGTCAGCGGTTCCTGCAGTGCTTCGAGGATTTCATTGGAGTTCAGGGTAAAACCGCGTGGAACACCTTCTGCCAGGTTACGGCCACGAACTTCGATTTCACGGACTTCATCGCCCGGATAAGCCGAACCGATTTCGTGCTTGATACGTTCTGCGGTGGCT > NC_000913/3399965‑3400452 | aaaaTTGGCTTCATAAGTTATGCGTATTCTCGTATCAGACCAGGCAGGGTAAACAGACACTTCCCCTGCCTGCATCCGATTACTCTTCGCTGAACAGGTCGCCGCCGTGCATGTCGATCATTTCCAGCGCTTTGCCGCCACCGCGCGCCACACAGGTCAGCGGGTCTTCAGCAACAACGACTGGAATGCCGGTTTCTTCCATTAACAAACGGTCAAGGTTACGCAGCAGTGCGCCACCACCGATGAGcccc > 2:420208/1‑248 (MQ=255) 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AAAATTGGCTTCATAAGTTATGCGTATTCTCGTATCAGACCAGGCAGGGTAAACAGACACTTCCCCTGCCTGCATCCGATTACTCTTCGCTGAACAGGTCGCCGCCGTGCATGTCGATCATTTCCAGCGCTTTGCCGCCACCGCGCGCCACACAGGTCAGCGGGTCTTCAGCAACAACGACTGGAATGCCGGTTTCTTCCATTAACAAACGGTCAAGGTTACGCAGCAGTGCGCCACCACCGGTGAGCACCATGCCGCGCTCGGAGATGTCGGAAGCCAGTTCCGGCGGGCACTGTTCCAGTGCAACCATTACCGCGCTCACAATACCGGTCAGCGGTTCCTGCAGTGCTTCGAGGATTTCATTGGAGTTCAGGGTAAAACCGCGTGGAACACCTTCTGCCAGGTTACGGCCACGAACTTCGATTTCACGGACTTCATCGCCCGGATAAGCCGAACCGATTTCGTGCTTGATACGTTCTGCGGTGGCT > NC_000913/3399965‑3400452 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |