| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 1,126,518 | C→T | A121V (GCC→GTC) | yceH → | DUF480 domain‑containing protein YceH |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,126,518 | 0 | C | T | 98.0% | 159.0 / ‑4.9 | 51 | A121V (GCC→GTC) | yceH | DUF480 domain‑containing protein YceH |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/1); new base T (29/21); total (29/22) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.31e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.09e-01 | |||||||||||
AAAACGAACCGTGAACCGGTCATGAATCTGAGTGAATCCGAAGTGCAGGAACAGCTGGATAATCTGGTCAAACGTCATTATCTACGCACAGTGAGCGGTTTTGGTAATCGGGTCACCAAATATGAGCAACGTTTTTGTAATTCAGAATTTGGCGATCTGAAACTGAGCGCAGCGGAAGTGGCGTTAATCACCACGTTGTTATTGCGTGGTGCCCAGACGCCAGGTGAACTGCGCAGCCGCGCCGCGCGAATGTATGAATTCAGCGATATGGCGGAAGTGGAGTCGACGCTGGAACAACTGGC‑AAATCGCGAAGATGGTCCTTTTGTGGTGCGTCTGGCCCGCGAACCGGGTAAACGCGAAAACCGCTACATGCATCTTTTCAGTGGTGAGGTTGAAGATCAGCCGGCGGTGACGGATATGTCGAACGCGGTTGACGGTGATTTACAGGCCCGCGTCGAAGCCCTGGAAATC > NC_000913/1126277‑1126747 | aaaaCGAACCGTGAACCGGTCATGAATCTGAGTGAATCCGAAGTGCAGGAACAGCTGGATAATCTAGTCAAACGTCATTATCTACGCACAGTGAGCGGTTTTGGTAATCGGGTCACCAAATATGAGCAACGTTTTTGTAATTCAGAATTTGGCGATCTGAAACTGAGCGCAGCGGAAGTGGCGTTAATCACCACGTTGTTATTGCGTGGTGCCCAGACGCCAGGTGAACTGCGCAGCCGCGCCGCGCGAAt < 2:199849/251‑1 (MQ=255) ggAATCCAAAGTGCAGGAACAGCTGGATAATCTGGTCAAACGTCATTATCTACGCACAGTGAGCGGTTTTGGTAATCGGGTCACCAAATATGAGCAACGTTTTTGTAATTCAGAATTTGGCGATCTGAAACTGAGCGCAGCGGAAGTGGCGTTAATCACCACGTTGTTATTGCGTGGTGCCCAGACGCCAGGTGAACTGCGCAGCCGCGTCGCGCGAATGTATGAATTCAGCGATATGGCGGAAGTGGAGt < 2:60413/250‑1 (MQ=255) gAATCCAAAGTGCAGGAACAGATGGATAATCTGGTCCAACGTCATTATCTACGCACAGTGAGCGGTTTTAGTAATCGGGTCACCAAATCTCAGCAACGTTTTTGTAATTCAGAATTTGGCGATCTGAAACTGAGCGCAGCGGAAGTGGCGTTAATCACCACGTTGTTATTGCGTGGTGCCCAGACGCCAGGTGAACTGCGCAGCCGCGTCGCGCGAATGTATGAATTCAGCGGTCTGGCggcagaggtgtg > 2:5347/1‑241 (MQ=255) aaTCCAAAGTGCAGGAACAGCTGGATAATCTGGTCAAACGTCATTATCTACGCACAGTGAGCGGTTTTGGTAATCGGGTCACCAAATATGAGCAACGTTTTTGTAATTCAGAATTTGGCGATCTGAAACTGAGCGCAGCGGAAGTGGCGTTAATCACCACGTTGTTATTGCGTGGTGCCCAGACGCCAGGTGAACTGCGCAGCCGCGTCGCGCGAATGTATGAATTCAGCGATATGGCGGAAGTGGAGTCg < 2:409022/251‑1 (MQ=255) gCAGGAACAGCTGGATAATCTGGTCAAACGTCATTATCTACGCACAGTGAGCGGTTTTGGTAATCGGGTCACCAAATATGAGCAACGTTTTTGTAATTCAGAATTTGGCGATCTGAAACTGAGCGCAGCGGAAGTGGCGTTAATCACCACGTTGTTATTGCGTGGTGCCCAGACGCCAGGTGAACTGCGCAGCCGCGTCGCGCGAATGTATGAATTCAGCGATATGGCGGAAGTGGAGTCGACGCTGGaa < 1:191114/250‑1 (MQ=255) ggAACAGCTGGATAATCTGGTCAAACGTCATTATCTACGCACAGTGAGCGGTTTTGGTAATCGGGTCACCAAATATGAGCAACGTTTTTGTAATTCAGAATTTGGCGATCTGAAACTGAGCGCAGCGGAAGTGGCGTTAATCACCACGTTGTTATTGCGTGGTGCCCAGACGCCAGGTGAACTGCGCAGCCGCGTCGCGCGAATGTATGAATTCAGCGATATGGCGGAAGTGGGGTCGACGCTGGaacaac > 1:199110/1‑251 (MQ=255) tCAAACGTCATTATCTACGCACAGTGAGCGGTTTTGGTAATCGGGTCACCAAATATGAGCAACGTTTTTGTAATTCAGAATTTGGCGATCTGAAACTGAGCGCAGCGGAAGTGGCGTTAATCACCACGTTGTTATTGCGTGGTGCCCAGACGCCAGGTGAACTGCGCAGCCGCGTCGCGCGACTGTATGAATTCAGCGATATGGCGGAAGTGGAGTCGACGCTGGAACAACTGGC‑AAATCGCGAAGATggg > 1:383691/1‑250 (MQ=255) tCAAACGTCATTATCTACGCACAGTGAGCGGTTTTGGTAATCGGGTCACAAAATATGAGCAACGTTTTTGTAATTCAGAATTTGGCGATCTGAAACTGAGCGCAGCGGAAGTGGCGTTAATCACCACGTTGTTATTGCGTGGTGCCCAGACGCCAGGTGAACTGCGCAGCCGCGTCGCGCGAATGTATGAATTCAGCGATATGGCGGCTGTGGAGGCGGCGCTGGgacaacatgcgaagcgcggagacggg > 2:240848/1‑231 (MQ=255) gTCATTATCTACGCACAGTGAGCGGTTTTGGTAATCGGGTCACCAAATATGAGCAACGTTTTTGTAATTGAGAATTTGGAGATCTGAACCTGAGCGCAGCGGAAGTGGAGTTAATCACCACGTTGTTATTGCGTGGTGCCCAGACGCCAGGTGCACTGCGCAGCCGCGTCGCGCGAATGTATGAATTCAGCGATATGCCGGAAGTGGAGTCGACGCCAGAACAAATGGC‑AAATCGCGAAGATGGTCCattt > 1:407871/1‑251 (MQ=255) tCATTATCTACGCACAGTGAGCGGTTTTGGTAATCGGGTCACCAAATATGAGCAACGTTTTTGTAATTCAGAATTTGGCGATCTGAAACTGAGCGCAGCGGAAGTGGCGTTAATCACCACGTTGTTATTGCGTGGTGCCCAGACGCCAGGTGAACTGCGCAGCCGCGTCGCGCGAATGTATGAATTCAGCGATATGGCGGAAGTGGAGTCGACGCTGGAACAACTGGC‑AAATCGCGAAGATGGTCCTTTtg > 1:291636/1‑251 (MQ=255) atgatcttcgaacaGTGAGCGGGTGTGGTAAGCGGGTCACCAAATATGAGCAACGTTTTTGTAATTCAGAATTTGGCGATCTGAAACTGAGCGCAGCGGAAGTGGTGTTAATCACCACGTTGTTATTGCGTGGTGCCCAGACGCCAGGTGAACTGCGCAGCCTCGTCGCGCGAATGTATGAATTCAGCGATATGGCGTAAGTGGAGTCGACGCTGGAACAACTTGC‑AAATCGCGAAGATGGTCCTTTtgtg < 2:347946/240‑1 (MQ=255) tATCTACGCACAGTGAGCGGTTTTGGTAATCGGGTCACCAAATATGAGCAACGTTTTTGTAATTCAGAATTTGGCGATCTGAAACTGAGCGCAGCGGAAGTGGCGTTAATCACCACGTTGTTATTGCGTGGTGCCCAGACGCCAGGTGAACTGCGCAGCCGCGTCGCGCGAATGTATGAATTCAGCGATATGGCGGAAGTGGAGTCGACGCTGGAACAACTGGC‑AAATCGCGAAGATGGTCCTTTTgtgg < 1:208811/250‑1 (MQ=255) ggTTTTGTTAATCGGGTCACCAAATATGAGCAACGGTTTTGTAATTCAGAATTTGGCGATCTGAAACTGAGCGCAGCGGAAGTGGCGTTAATCACCACGTTGTGATTGCGTGGTGCCCAGACGCCAGGTGAACTGCGCAGCCGCGTCGCGCGAATGTATGAATTCAGCGATATGGCGGAAGTGGAGTCGACGCTGGAACAACTGGC‑AAATCGCGAAGATGGTCCTTTTGTGGTGCGTATGGCCCGCGAAcc < 2:478877/251‑1 (MQ=255) ggTTTTGGTAAGCGGGTCACCAAATATGAGCAACGTTTTTGTAATTCAGAATTTGGCGATCTGAAACTGAGCGCAGCGGAAGTGGCGTTAATCACCACGGTGTTATGTCGTGGTGCCCAGACGCCAGGTGAACTGCGCAGCCGCGTCGCGCGAATGTATGAATTCAGCGATATGGCGGAAGTGGAGTCGACGCTGGAACAACTGGC‑AAATCGCGAAGATGGTCCTTTTGTGGTGCGTCTGGCCCGCGAAcc < 2:478901/251‑1 (MQ=255) tGGTAATCGGGTCACCAAATATGAGCAACGTTTTTGTAATTCAGAATTTGGCGATCTGAAACTGAGCGCAGCGGAAGTGGCGTTAATCACCACGTTGTTATTGCGTGGTGCCCAGACGCCAGGTGAACTGCGCAGCCGCGTCGCGCGAATGTATGAATTCAGCGATATGGCGGAAGGGGGGTCGACGCTGGAACAACTGGC‑AAATCGCGAAGATGGTCCTTTTGTGGTGCGTCTGGCCCGCGAACCggggg > 2:95213/1‑249 (MQ=255) ggTAATCGGGTCACCAAATATGAGCAACGTTTTTGTAATTCAGAATTTGGCGATCTGAAACTTAGCGCAGCGGAAGTGGCGTTAATCACCACGTTGTTATTGCGTGGTGCCCAGACGCCAGGTGAACTGCGCAGCCGCGTCGCGCGAATGTATGAATTCAGCGATATGGCGGAAGTGGAGTCGACGCTGGAACAACTGGC‑AAATCGCGAAGATGGTCCTTTTGTGGTGCGTCTGGCCCGCGAACCGGGTaa < 1:302654/251‑1 (MQ=255) tCACCACATATGAGCAACGTTTTTGTAATTCAGAATTTGGCGATCTGAAACTGAGCGCAGCGGAAGTGGCGTTAATCACCACGTTGTTATTGCGTGGTGCCCAGACGCCAGGTGAACTGCGCAGCCGCGTCGCGCGAATGTATGAATTCAGCGATATGGCGGAAGTGGAGTCGACGCTGGGACCACTGGC‑AAATCGCGACGATGGTCCTTTTGTGGTGCGTCTGGGCCGCGAACCGgggaaaagggaaaa > 2:223617/1‑250 (MQ=255) acACCAAATATGAGCAACGTTTTTGTAATTCAGAATTTGGCAATCTGAAACTCAGCGCAGCGATAGTAGCGTTAATAACCACGGTGTTACTGCGTGGTGCCCAGACGTCCGGTGAACTGCGCAGCCGCGTAGCGCGAACGGATGAATTCAGCGTTATGGCGGTGGAGGAGTAGAAGCTTGAAAACCTGGA‑AAAGCACATAGATGGTCCTTTTGTGGAGCGTCTTGACCGCGCACCGGGGCAAcgcgcaac > 2:443052/2‑246 (MQ=255) cACCAAATATGAGCAACGTTTTTGTAATTCAGAATTTGGCGATCTGAAACTGAGCGCAGCGGAAGTGGCGTTAATCACCACGTTGTTATTGCGTGGTGCCCAGACGCCAGGTGAACTGCGCAGCCGCGTCGCGCGAATGTATGAATTCAGCGATATGGCGGAAGTGGAGTCGACGCTGGAACAACTGGC‑AAATCGCGAAGATGGTCCTTTTGTGGTGCGTCTGGCCCGCGAACCGGGTAAACGCGAAAAc < 1:223617/250‑1 (MQ=255) aaaTATGAGCAACGTTTTTGTAATTCAGAATTTGGCGATCTGAAACTGAGCGCAGCGGAAGTGGCGTTAATCACCACGTTGTTATTGCGTGGTGCCCAGACGCCGGGTGAACTGCGCAGCCGCGTCGCGCGAATGTATGAATTCAGCGATATGGCGGAAGTGGAGGCGACGCTGGAACAACTGGC‑ACATCGCGAAGATGGTCCCTTTTTGGTGCGTCTGGCCCGCGAACCGGGGAAAAGAGGAAACCGCtc > 2:305347/1‑250 (MQ=255) aaTATGAGCAACGTTTTTGTAATTCAGAATTTGGCGATCTGAAACTGAGCGCAGCGGAAGTGGCGTTAATCACCACGTTGTTATTGCGTGGTGCCCAGACGCCAGGTGAACTGCGCAGCCGCGTCGCGCGAATGTATGAATTCAGCGATATGGCGGAAGTGGAGTCGACGCTGGAACAACTGGC‑AAATCGCGAAGATGGTCCTTTTGTGGTGCGTCTGGCCCGCGAACCGGGTAAACGCGAAAACCGCTAc > 1:362255/1‑251 (MQ=255) atGAGCAACGTTTTTGTAATTCAGAATTTGGCGATCTGAAACTGAGCGCAGCGGAAGTGGCGTTAATCACCACGTTGTTATTGCGTGGTGCCCAGACGCCAGGTGAACTGCGCAGCCGCGTCGCGCGAATGTATGAATTCAGCGATATGGCGGAAGTGGAGTCGACGCTGGAACAACTGGC‑AAATCGCGAAGATGGTCCTTTTGTGGTGCCTCTGGCCCGCGAACCGGGGAAACGCGAAAACCGCTACAtt > 2:38907/1‑250 (MQ=255) aaCGTTTTTGTAATTCAGAATTTGGCGATCTGAAACTGAGCGCAGCGGAAGTGGCGTTAATCACCACGTTGTTATTGCGTGGTGCCCAGACGCCAGGTGAACTGCGCAGCCGCGTCGCGCGAATGTATGAATTCAGCGATATGGCGGAAGTGGAGTCGACGCTGGAACAACTGGC‑AAATCGCGAAGATGGTCCTTTTGTGGTGCGTCTGGCCCGCGAACCGGGTAAACGCGAAAACCGCTACATGCATCtt < 1:459567/251‑1 (MQ=255) aaCGTTTTTGTAATTCAGAATTTGGCGATCTGAAACTGAGCGCAGCGGAAGTGGCGTTAATCACCACGTTGTTATTGCGTGGTGCCCAGACGCCAGGTGAACTGCGCAGCCGCGTCGCGCGAATGTATGAATTCAGCGATATGGCGGAAGTGGAGTCGACGCTGGAACAACTGGC‑AAATCGCGAAGATGGTCCTTTTGTGGTGCGTCTGGCCCGCGAACCGGGTAAACGCGAAAACCGCTACATGCATCtt > 1:483192/1‑251 (MQ=255) cGTTTTTGTAATTCAGAATTTGGCGATCTGAACCTGCGCGCAGCGGAAGTGGCGTTAATCACCACGTTGTTATTGCGTGGTGCCCAGACGCCAGGTGAACTGCGCAGCCGCGTCACGCGAATGTATGAATTCAGCGATATGGCGGCAGTGGAGTCGGCGCTGGCACAACTGGC‑AAATCGCGCCGCTGGTCCTTTTGTGGTGCGTCTGGCCCCCGTACCGGGGAAACGCGACAACCGccacccgcctctttt > 2:213301/1‑237 (MQ=255) ttttGTAATTCAGAATTTGGCGATCTGAAACTGAGCGCAGCGGAAGTGGCGTTAATCACCACGTTGTTATTGCGTGGTGCCCAGACGCCAGGTGAACTGCGCAGCCGCGTCGCGCGAATGTATGAATTCAGCGATATGGCGGAAGTGGAGTCGACGCTGGAACAACTGGC‑AAATCGCGAAGATGGTCCTTTTGTGGTGCGTCTGGCCCGCGAACCGGGTAAACGCGAAAACCGCTACATGCATCTTTTCa < 1:422682/250‑1 (MQ=255) tttGTAATTCAGAATTTGGCGATCTGAAACTGAGCGCAGCGGAAGTGGCGTTAATCACCACGTTGTTATTGCGTGGTGCCCAGACGCCAGGTGAACTGCGCAGCCGCGTCGCGCGAATGTATGAATTCAGCGATATGGCGGAAGTGGAGTCGACGCTGGAACAACTg > 1:139832/1‑167 (MQ=255) tttGTAATTCAGAATTTGGCGATCTGAAACTGAGCGCAGCGGAAGTGGCGTTAATCACCACGTTGTTATTGCGTGGTGCCCAGACGCCAGGTGAACTGCGCAGCCGCGTCGCGCGAATGTATGAATTCAGCGATATGGCGGAAGTGGAGTCGACGCTGGAACAACTg < 2:139832/167‑1 (MQ=255) tttGTAATTCAGAATTTGGCGATCTGAAACTGAGCGCAGCGGAAGTGGCGTTAATCACCACGTTGTTATTGCGTGGTGCCCAGACGCCAGGTGAACTGCGCAGCCGCGTCGCGCGAATGTATGAATTCAGCGATATGGCGGAAGTGGAGTCGACGCTGGAACAACTGGC‑AAATCGCGAAGATGGTCCTTTTGTGGTGCGTCTGGCCCGCGAACCGGGTAAACGCGAAAACCGCTACATGCATCTTTTCAgt > 1:455674/1‑251 (MQ=255) aaTTCAGAATTTGGCGATCTGAAACTGAGCGCAGCGGAAGTGGCGTTAATCACCACGTTGTTATTGCGTGGTGCCCAGACGCCAGGTGAACTGCGCAGCCGCGTCGCGCGAATGTATGAATTCAGCGATATGGCGGGAGTGGGGTCGACGCTGGAACAACTGGC‑AAAACGCGAAGATGGTCCTTTTGTGGTGCGTCTGGCCCGCGCACCCGGTAAAATGGAAAACCGccaacaggaacttttcagtggggg > 2:128689/1‑228 (MQ=255) ttCAGAATTTGGCGATCTGAAACTGAGCGCAGCGGAAGTGGCGTTAATCACCACGTTGTTATTGCGTGGTGCCCAGACGCCAGGTGAACTGCGCAGCCGCGTCGCGCGAATGTATGAATTCAGCGATATGGCGGAAGTGGAGTCGACGCTGGAACAACTGGC‑AAATCGCGAAGATGGTCCTTTTGTGGTGCGTCTGGCCCGCGAACCGGGTAAACGCGAAAACCGCTACATGCATCTTTTCAGTGGTGAgg > 1:135540/1‑251 (MQ=255) aGAATTTGGCGATCTGAAACTGAGCGCAGCGGAAGTGGCGTTAATCACCACGTTGTTATTGCGTGGTGCCCAGACGCCAGGTGAACTGCGCAGCCGCGTCGCGCGAATGTATGAATTCAGCGATATGGCGGGAGTGGAGTCGCCGCTGGAACAACTGGC‑CAATCGCGCAGATGGGCCTTTTGTGGGGCGTCTGGCCCGCGAACCGGGGAAACGCGCAAACCCCCACAGGCATCtttttcggggtggggggg > 2:462315/1‑237 (MQ=255) aGAATTTGGCGATCTGAAACTGAGCGCAGCGGAAGTGGCGTTAATCACCACGTTGTTATTGCGTGGTGCCCAGACGCCAGGTGAACTGCGCAGCCGCGTCGCGCGAATGTATGAATTCAGCGATATGGCGGAAGTGGAGTCGACGCTGGAACAACTGGC‑AAATCGCGAAGATGGTCCTTTTGTGGTGCGTCTGGCCCGCGAACCGGGTAAACGCGAAAACCGCTACATGCATCTTTTCAGTGGTGAgg < 1:462315/248‑1 (MQ=255) aGAATTTGGCGATCTGAAACTGAGCGCAGCGGAAGTGGCGTTAATCACCACGTTGTTATTGCGTGGTGCCCAGACGCCAGGTGAACTGCGCAGCCGCGTCGCGCGAATGTATGAATTCAGCGATATGGCGGAAGTGGAGTCGACGCTGGAACAACTGGC‑AAATCGCGAAGATGGTCCTTTTGTGGTGCGTCTGGCCCGCGAACCGGGTAAACGCGAAAACCGCTACATGCATCTTTTCAGTGGTGAGGTTg > 1:188915/1‑251 (MQ=255) gCGATCTGAAACTGAGCGCAGCGGAAGTGGCGTTAATCACCACGTTGTTATTGCGTGGTGCCCAGACGCCAGGTGAACTGCGCAGCCGCGTCGCGCGAATGTATGAATTCAGCGATATGGCGGAAGAGGAGTCGGCCCTGGAACAAATGGG‑CCATCGCGAAGATGGTCCTTTTGTGGTGGGTCTGGCCCGGGAACCGGGGGAACGCGATCACCGCTACATGCCTCTTTTCCGTGGTGAgggggaaggta > 2:184259/1‑240 (MQ=255) cGATCTGAAACTGAGCGCAGCGGAAGTGGCGTTAATCACCACGTTGTTATTGCGTGGTGCCCAGACGCCAGGTGAACTGCGCAGCCGCGTCGCGCGAATGTATGAATTCAGCGATATGGCGGAAGTGGAGTCGACGCTGGAACAACTGGC‑AAATCGCGAAGATGGTCCTTTTGTGGTGCGTCTGGCCCGCGAACCGGGTAAACGCGAAAACCGCTACATGCATCTTTTCAGTGGTGAGGTTGAAGATCAGc > 1:242847/1‑251 (MQ=255) cTGAAACTGAGCGCAGCGGAAGTGGCGTTAATCACCACGTTGTTATTGCGTGGTGCCCAGACGCCAGGTGAACTGCGCAGCCGCGTCGCGCGAATGTATGAATTCAGCGATATGGCGGAAGTGGAGTCGACGCTGGAACAACTGGC‑AAATCGCGACGATGGTCCTTTTGTGGTGCGTCTGGCCCGCGAACCGGGTAAACGCGAAAACCGCTACATGCATCTTTTCTGTGGTGAGGTTGAAGATCAGCcggg > 1:36830/1‑250 (MQ=255) cTGAAACTGAGCGCAGCGGAAGTGGCGTTAATCACCACGTTGTTATTGCGTGGTGCCCAGACGCCAGGTGAACTGCGCAGCCGCGTCGCGCGAATGTATGAATTCAGCGATATGGCGGAAGTGGAGTCGACGCTGGAACAACTGGC‑AAATCGCGAAGATGGTCCTTTTGTGGTGCGTCTGGCCCGCGAACCGGGTAAACGCGAAAACCGCTACATGCATCTTTTCAGTGGTGAGGTTGAAGATCAGCcggc > 1:322134/1‑251 (MQ=255) gCGGAAGTGGCGTTAATCACCACGTTGTTATTGCGTGGTGCCCAGACGCCAGGTGAACTGCGCAGCCGCGTCGCGCGAATGTATGAATTCAGCGATATGGCGGAAGTGGAGTCGACGCTGGAACAACTGGC‑AAATCGCGAAGATGGTCCTTTTGTGGTGCGTCTGGCCCGCGAACCGGGTAAACGCGAAAACCGCTACATGCATCTTTTCAGTGGTGAGGTTGAAGATCAGCCGGCGGTGACGGATATGTc < 1:420131/251‑1 (MQ=255) gCGGAAGTGGCGTTAATCACCAAGTTGTTATTGCGTGGTGCCCAGACGCCAGGTGAACTGCGCAGCCGCGTCGCGCGAATGTATGAATTCAGCGATATGGCGGAAGTGGCGGCGGCGCCGGGACAACTGGCCAAACCCGGAAG‑TTGTCCTTTTTTTGTGGGACTGGCTCGCGAACCGGGGAGAAGCGAAAGCCGGTAAATGCTTCTTTTTAGGGGTGGGGGTTAGGGTCAGCcggcgggtgccggtagttc > 2:145779/1‑238 (MQ=255) gggAAGTGGCGTTAATCACCACGTTGTTTTTGCGTGGTGCCCAGACGCCAGGTGAACTGCGCAGCCGCGTCGCGCGAATGTATGAATTCAGCGATATGGCGGAAGTGGAGTCGACGCTGGAACAACTGGC‑AAATCGCGAAGATGGTCCTTTTGTGGTGCGTCTGGCCCGCGAACCGGGTAAACGCGAAAACCGCTACATGCATCTTTTCAGTGGTGAGGTTGAAGATCAGCCGGCGGTGACGGATATGTCg < 2:441897/250‑1 (MQ=255) ggtagttATTGCGTTGTTCCCAGACGCCAGGTGAACAGCGCAGCCGCGTAGCGCGAATGTATGAATGCCGAGAAAGAGCTGAAGTGGAGTCGACGCTAGACCAAGTGGC‑AAAGCGCGAAGATGGTCCTTTTGTGTTGCGTCTGGCACGGGCGACGGGTAAACGCGAAAACCGCTACATGCATCTTTTCAGTAGTGAGGTGGAAGATCAGCAGGCGGTGACGGAGATGGCGCACGCGGTTAACGGTGATTTa < 2:46436/247‑1 (MQ=255) cGTTGTTATTGCGTGGTGCCCAGACGCCAGGTGAACTGCGCAGCCGCGTCGCGCGAATGTATGAATTCAGCGATATGGCGGTAGTGGAGTCGGCGCTGGAACAACTGGC‑AAATCGCGGAGATGGTCCTTTTGTGGTGAGTCTGGACCGCGGACCGGGTAAACGCGAAAACCGCTACATGCATCTTTTCTGTGGGGAGGTTGAAGATCAGCCGGCGGGGACGGATGTGTCGaaagggggtggcggtgcattt > 2:378351/1‑232 (MQ=255) gttATTGCGTGGTGCCCAGACGCCAGGTGAACTGCGCAGCCGCGTCGCGCGAATGTATGAATTCAGCGATATGGCGGAAGTGGAGTCGACGCTGGAACAACTGGC‑AAATCGCGAAGATGGTCCTTTTGTGGTGCGTCTGGCCCGCGAACCGGGTAAACGCGAAAACCGCTACATGCATCTTTTCAGTGGTGAGGTTGAAGATCa > 1:294770/1‑204 (MQ=255) gttATTGCGTGGGGCCCAGACGCCAGGTGAACTGCGCAGCCGCGTCGCGCGAATGTATGAATTCAGCGATATGGCGGAAGTGGAGTCGACGCTGGAACAACTGGC‑AAATCGCGAAGATGGTCCTTTTGTGGTGCGTCTGGCCCGCGAACCGGGTAAACGCGAAAACCGCTACATGCATCTTTTCAGTGGTGAGGTTGAAGATCa < 2:294770/204‑1 (MQ=255) cGTGGTGCCCAGACGCCAGGTGAACTGCGCAGCCGCGTCGCGCGAATGTATGAATTCAGCGATATGGCGGAAGTGGAGTCGACGCTGGAACAACTGGC‑AAATCGCGAAGATGGTCCTTTTGTGGTGCGTCTGGCCCGCGAACCGGGTAAACGCGAAAACCGCTACATGCATCTTTTCAGTGGTGAGGTTGAAGATCAGCCGGCGGTGACGGGTATGTCGAACGCGGTTGACGGTGATTTACAGGCCcgcgg > 1:322883/1‑250 (MQ=255) gCCCAGCCGCCTGGTGAACTGCGCAGCCGCGTCGCGCGAATGTATGAATTCAGCGATATGGCGGAAGTGGAGGCGACGCTGGAACAACTGGC‑AAATCGCGAAGATGGTCCTTTTGTGGTGCGTCTGGCCCGCGAACCGGGTAAACGCGAAAACCGCTACATGCATCTTTTCAGTGGTGAGGTTGAAGATCAGCCGGCGGTGACGGATATGTCGAACGCGGTTGACGGTGATTTACAGGCCCGCGTCGAAg < 1:287912/250‑1 (MQ=255) cAGACGCCAGGTGAACTGCGCAGCCGCGTCGCGCGAATGTATGAATTCAGCGATATGGCGGAAGTGGAGTCGACGCTGGAACAACTGGC‑AAATCGCGAAGATGGTCCTTTTGTGGTGCGTCTGGCCCGCGAACCGGGTAAACGCGAAAACCGCTACATGCATCTTTTCAGTGGTGAGGTTGAAGATCAGCCGGCGGTGACGGATATGTCGAACGCGGTTGACGGTGATTTACAGGCCCGCGTCGAAGCCCt < 1:27194/251‑1 (MQ=255) cAGGTGAACTGCGCAGCCGCGTCGCGCGAATGTATGAATTCAGCGATATGGCGGAAGTGGAGTCGACGCTGGAACAACTGGC‑AAATCGCGAAGATGGTCCTTTTGTGGTGCGTCTGGCCCGCGAACCGGGTAAACGCGAAAACCGCTACATGCATCTTTTCAGTGGTGAGGTTGAAGATCAGCCGGCGGTGACGGATATGTCGAACGCGGTTGACGGTGATTTACAGGCCCGCGTCGAAGCCCTGGAAATc < 1:413912/251‑1 (MQ=255) aGGTGAACTGCGCAGCCGCGTCGCGCGAATGTATGAATTCAGCGATATGGCGGAAGTGGAGTCGACGCTGGAACAACTGGC‑AAATCGCGAAGATGGTCCTTTTGTGGTGCGTCTGGCCCGCGAACCGGGTAAACGCGAAAACCGCTACATGCATCTTTTCAgtg < 2:353627/164‑1 (MQ=255) aGGTGAACTGCGCAGCCGCGTCGCGCGAATGTATGAATTCAGCGATATGGCGGAAGTGGAGTCGACGCTGGAACAACTGGC‑AAATCGCGAAGATGGTCCTTTTGTGGTGCGTCTGGCCCGCGAACCGGGTAAACGCGAAAACCGCTACATGCATCTTTTCAgtg > 1:353627/1‑164 (MQ=255) | AAAACGAACCGTGAACCGGTCATGAATCTGAGTGAATCCGAAGTGCAGGAACAGCTGGATAATCTGGTCAAACGTCATTATCTACGCACAGTGAGCGGTTTTGGTAATCGGGTCACCAAATATGAGCAACGTTTTTGTAATTCAGAATTTGGCGATCTGAAACTGAGCGCAGCGGAAGTGGCGTTAATCACCACGTTGTTATTGCGTGGTGCCCAGACGCCAGGTGAACTGCGCAGCCGCGCCGCGCGAATGTATGAATTCAGCGATATGGCGGAAGTGGAGTCGACGCTGGAACAACTGGC‑AAATCGCGAAGATGGTCCTTTTGTGGTGCGTCTGGCCCGCGAACCGGGTAAACGCGAAAACCGCTACATGCATCTTTTCAGTGGTGAGGTTGAAGATCAGCCGGCGGTGACGGATATGTCGAACGCGGTTGACGGTGATTTACAGGCCCGCGTCGAAGCCCTGGAAATC > NC_000913/1126277‑1126747 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |