| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 1,112,421 | C→T | S520F (TCT→TTT) | opgH → | osmoregulated periplasmic glucans biosynthesis protein H |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,112,421 | 0 | C | T | 98.2% | 173.5 / ‑4.5 | 57 | S520F (TCT→TTT) | opgH | osmoregulated periplasmic glucans biosynthesis protein H |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/1); new base T (34/22); total (34/23) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.04e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.84e-01 | |||||||||||
TGTCACATGACTTCGTGGAAGCGGCGTTGATGCGCCGTGCAGGTTGGGGGG‑TCTGGATTGCTTACGATCTCCCGGGTTCTTATGAAGAATTGCCGCCTAACTTGCTTGATG‑AGCTAAAAC‑GTGACCGCCGATGGTGCCACGGTAACCTGATGAACTTCCGTCTGTTCCTGGTGAAGGGTATGCACCCGGTTCACCGTGCGGTGTTCCTGACGGGCGTGATGTCTTATCTCTCCGCTCCGCTGTGGTTTATGTTCCTCGCGCTCTCTACTGCATTGCAGGTAGTGCATGCGTTGACCGAACCGCAATACTTCCTGCAACCACGGCAGTTGTTCCCAGTGTGGCCGCAGTGGCGTCCTGAGCTGGCGATTGCACTTTTTGCTTCGACCATGGTGCTGTTGTTCCTGCCGAAGTTATTGAGCATTTTGCTTATCTGGTGCAAAGGAACGAAAGAATACGGCGGCTTCT > NC_000913/1112199‑1112663 | tGTCACATGATTTCGTGGAAGCGGCGTTGATGCGCCGTGCAGGTTGGGGGG‑TCTGGATTGCTTACGATCTCCCGGGTTCTTATGAAGAATTGCCGCCTAACTTGCTTGATG‑AGCTAAAAC‑GTGACCGCCGATGGTGCCACGGTAACCTGATGAACTTCCGTCTGTTCCTGGTGAAGGGTATGCACCCGGTTCACCGTGCGGTGTTCCTGACGGGCGTGATGTTTTATCTCTCCGCTCCGCTGTGGTTTATg > 1:476898/1‑251 (MQ=255) gatttggtggagggggctttGATGCGCCGTG‑GGGTTGGGGGGGTCTGGATTTCTTACGTCCCCCCGGTTTTTTATGAAGATTCGCCGCCAACCTGGCTTGAGG‑AGCTAAACC‑GTGACCGCCGATGGTGCCACGGTAACCTGATGAACTTCCGTCTGTTCCTGGTGAAGGGTATGCACCCGGTTCACCGTGCGGTGTTCCTGACGGGCGTGATGTTTTATCTCTCCGCTCCGCTGTGGTTTATGTTCCTcg < 1:244504/232‑1 (MQ=255) ttCGTGGAAGCGGCGTTGATGCGCCGTGCAGGTTGGGGGG‑TCTGGATTGCTTACGATCTCCCGGGTTCTTATGAAGAATTGCCGCCTAACTTGCTTGATG‑AGCTAAAAC‑GTGACCGCCGATGGTGCCACGGTAACCTCATGAACTTCCGTCTGTTCCTGGTGAAGGGTATGCACCCGGTTCACCGTGCGGTGTTCCTGACGGGCGTGATGTTTTATCTCTCCGCTCCGCTGTGGTTTATGTTCCTCGCGct > 1:289294/1‑251 (MQ=255) cGTGGAAGCGGCGTTGATGCGCCGTGCAGGTTGGGGGG‑TCTGGATTGCTTACGATCTCCCGGGTTCTTATGAAGAATTGCCGCCTAACTTGCTTGATG‑AGCTAAAAC‑GTGACCGCCGATGGTGCCACGGTAACCTGATGAACTTCCGTCTGTTCCTGGTGAAGGGTCTGCACCCGGTTCACCGTGCGGTGTTCCTGACGGGCGTGATGTTTTCTCTCTCCGCTCCGCTGTGGTTTATGTTCCTCgcgccct > 2:419748/1‑248 (MQ=255) gTGGAAGCGGCGTTGATGCGCCGTGCAGGTTGGGGGG‑TCTGGATTGCTTACGATCTCCCGGGTTCTTATGAAGAATTGCCGCCTAACTTGCTTGATG‑AGCTAAAAC‑GTGACCGCCGATGGTGCCACGGTAACCTGATGAACTTCCGTCTGTTCCTGGTGAAGGGTATGCACCCGGTTCACCGTGCGGTGTTCCTGACGGGCGTGATGTTTTATCTCTCCGCTCCGCTGTGGTTTATGTTCCTCGCGctctc > 1:378147/1‑251 (MQ=255) gttgatgctagtggggggTTGGGGGG‑TGTGGATGGCTTACGTTCCCCTGTGTGTTTATGAAGATGTGCCCCCAAATTTG‑TTGGTGGAGCAAAACC‑TTGACCGCCGATGGTGCCACGGTAACCTGATGAACTTCCGTCTGTTCCTGGTGAAGTGTATGCACCCGGTTCACCGTGCGGTGTTCCTGACGGGCGTGATGTCTTATCTCTCCGCTCCGCTGTGGGTTATGTTCCTCGCGCTCTCTACTGCATTGc < 2:194918/235‑1 (MQ=255) gTTGATGCGCCGTGCAGGTTGGGGGG‑TCTGGATTGCTTACGATCTCCCGGGTTCTTATGAAGAATTGCCGCCTAACTTGCTTGATG‑AGCTAAAAC‑GTGACCGCCGATGGTGCCACGGTAACCTGATGAACTTCCGTCTGTTCCTGGTGAAGGGTATGCACCCGGTTCACCGTGCGGTGTTCCTGACGGGCGTGATGTTTTATCTCTCCGCTCCGCTGTGGTTTATGTTCCTCGCGCTCTCTACTGCATTGc > 2:242273/1‑251 (MQ=255) cgcCGTGCAGGTTGGGGGG‑TCTGGATTGCTTACGATCTCCCGGGTTCTTATGAAGAATTGCCGCCTAACTTGCTTGATG‑AGCTAAAAC‑GTGACCGCCGATGGTGCCACGGTAACCTGATGAACTTCCGTCTGTTCCTGGTGAAGGGTATGCACCCGGTTCACCGTGCGGTGTTCCTGACGGGCGTGATGTTTTATCTCTCCGCTCAGCTGTGGTTTATGTTCCTCGAGCTCTCTACTGCAtttccggtcgg > 2:208309/1‑242 (MQ=255) gggggtttgatttGCTTACGACCTCCCGGGTTTTAATGAAGATTTGCCGCCTAATTTGTTGGAGG‑AG‑TAAAACCGTGACCGCCGATGGTGCCACGGTAACCTGATGAACTTCCGTCTGTTCCTGGTGAAGGGTATGCACCCGGTTCACCGTGCGGTGTTCCTGACGGGCGTGATGTTTTATCTCTCCGCTCCGCTGTGGTTTATGTTCCTCGCGCTCTCTACTGCATTGCAGGTAGTGCATGCGTTGACCg < 1:186435/240‑1 (MQ=255) gg‑TCTGGATTGCTTACGATCTCCCGGGTTCTTATGAAGAATTGCCGCCTAACTTGCTTGATG‑AGCTAAAAC‑GTGACCGCCGATGGTGCCACGGTAACCTGATGAACTTCCGTCTGTTCCTGGTGAAGGGTATGCACCCGGTTCACCGTGCGGTGTTCCTGACGGGCGTGATGTTTTATCTCTCCGCTCCGCTGTGGTTTATGTTCCTCGCGCTCTCTACTGCATTGCAGGTAGTGCATGCGTTGACCGAAc > 1:155115/1‑251 (MQ=255) ggtgtggtttctttccGATCTCCCGGGTTTTTATAAAAATTTGCCCCTTAACTTGTTTGATG‑AGCTAAACC‑GTGACCGCCGATGGTGCCACGGTAACCTGATGAACTTCCGTCTGTTCCTGGTGAAGGGTATGCACCCGGTTCACCGTGCGGTGTTCCTGACGGGCGTGATGTTTTATCTCTCCGCTCCGCTGTGGTTTATGTTCCTCGCGCTCTCTACTGCATTGCAGGTAGTGCATGCGTTGACCGAAc < 1:135691/236‑1 (MQ=255) tCTGGATTGCTTACGATCTCCCGGGTTCTTATGAAGAATTGCCGCCTAACTTGCTTGATG‑AGCTAAAAC‑GTGACCGCCGATGGTGCCACGGTAACCTGATGAACTTCCGTCTGTTCCTGGTGAAGGGTATGCACCCGGTTCACCGTGCGGTGTTCCTGACGGGCGTGATGTTTTATCTCTCCGCTCCGCTGTGGTTTATGTTCCTCGCGCTCTCTACTGCATTGCAGGTAGTGCATGCGTTGACCGAACCg > 1:279920/1‑251 (MQ=255) tGAAGAATTGCCGCCTAACTTGCTTGATG‑AGCTAAAAC‑GTGACCGCCGATGGTGCCACGGTAACCTGATGAACTTCCGTCTGTTCCTGGTGAAGGGTATGCACCCGGTTCACCGTGCGGTGTTCCTGACGGGCGTGATGTTTTATCTCTCCGCTCCGCTGTGGTTTATGTTCCTCGCGCTCTCTACTGCATTGCAGGTAGTGCATGCGTTGACCGAACCGCAATACTTCCTGCAACCACGGCAGTTGTTcc > 1:85433/1‑251 (MQ=255) gccgccTAACTTGCTTGATG‑AGCTAAAAC‑GTGACCGCCGATGGTGCCACGGTAACCTGATGAGCTTCCGTCTGTTCCTGGTGAAGGGTATGCACCCGGTTCACCGTGCGGTGTTCCTGACGGGCGTGATGTTTTATCTCTCCGCTCCGCTGTGGTTTATGTTCCTCGCGCTCTCTACTGCATTGCAGGTAGTGCATGCGTTGACCGAACCGCAATACTTCCTGCAACCACGGCAGTTGTTCCCAGTGTGGc > 1:121034/1‑251 (MQ=255) ccgccaaattttctggatg‑aGCAAAAAC‑GTGACCGCCGATGGTGCCACGGTAACCTGATGAACTTCCGTCTGTTCCTGGTGAAGGGTATGCACCCGGTTCACCGTGCGGTGTTCCTGACGGGCGTGATGTTTTATCTCTCCGCTCCGCTGTGGTTTATGTTCCTCGCGCTCTCTACTGCATTGCAGGTAGTGCATGCGTTGACCGAACCGCAATACTTCCTGCAACCACGGCAGTTGTTCCCAGTGTGGcc < 1:160347/236‑1 (MQ=255) cTAACTTGCTTGATG‑AGCTAAAAC‑GTGACCGCCGCTGGTGCCACGGTAACCTGATGAACTTCCGTCTGTTCCTGGTGAAGGGTATGCACCCGGTTCACCGTGCGGTGTTCCTGACGGGCGTGATGTTTTATCTCTCCGCTCCGCTGTGGTTTATGTTCCTCGCGCTCTCTACTGCATTGCAGGTAGTGCATGCGTTGACCGAACCGCAATACTTCCt > 1:480068/1‑217 (MQ=255) cTAACTTGCTTGATG‑AGCTAAAAC‑GTGACCGCCGATGGTGCCACGGTAACCTGATGAACTTCCGTCTGTTCCTGGTGAAGGGTATGCACCCGGTTCACCGTGCGGTGTTCCTGACGGGCGTGATGTTTTATCTCTCCGCTCCGCTGTGGTTTATGTTCCTCGCGCTCTCTACTGCATTGCAGGTAGTGCATGCGTTGACCGAACCGCAATACTTCCTGCAACCACGGCAGTTGTTCCCAGTGTGGCCGc > 2:232957/1‑249 (MQ=255) agtagcaaaacctgtcccgccgATGGTGCCACGGTAACCTGATGAACTTCCGTCTGTTCCTGGTGAAGGGTATGCACCCGGTTCACCGTGCGGTGTTCCTGACGGGCGTGATGTTTTATCTCTCCGCTCCGCTGTGGTTTATGTTCCTCGCGCTCTCTACTGCATTGCAGGTAGTGCATGCGTTGACCGAACCGCAATACTTCCTTCAACCACGGCAGTTGTTCCCAGTGTGGCCGCAGTGGCGTCCTGAg < 1:218836/235‑1 (MQ=255) gggtaaaaactttaCCGCCGATGGTGCCACGGTAACCTGATGAACTTCCGTCTGTTCCTGGTGAAGGGTATGCACCCGGTTCACCGTGCGGTGTTCCTGACGGGCGTGATGTTTTATCTCTCCGCTCCGCTGTGGTTTATGTGCCTCGCGCTCTCTACTGCATTGCAGGTAGTGCATGCGTTGACCGATCCGCAATACTTCCTGCAACCACGGCAGTTGTGCCCAGTGTGGCCGCAGTGGCGTCCTGAGCt < 1:190981/238‑1 (MQ=255) gCTAAAAC‑GTGACCGCCGATGGTGCCACGGTAACCTGATGAACTTCCGTCTGTTCCTGGTGAAGGGAATGAACCCGGTTCACCGTGCGGTGTTCCTGACGGGCGTGATGTTTTATCTATCCGCTACGCTGTGATTTATGTTCCTCGCGCTCTCTACTGCCTTGAAGGTAGTGCATGCGTTGACAGAACCGCAATAATTCCTTCAACCCCGGCAGTTGTTACAAGTGTGGACGCAgagcggtcctgcaatgg > 2:472085/1‑235 (MQ=255) aaacc‑GTGCCCGCCGATGGGGCCACGGTAACCTGATGAACTTCCGTCTGTTCCTGGTGAAGGGTATGCACCCGGTTCACCGTGCGGTGTTCCTGACGGGCGGGATGTTTTATCTCTCCGCTCCGCTGTGGTTTATGTTCCTCGCGCTCTCTACTGCATTGCAGGTAGTGCATGCGTTGACCGAACCGCAATACTTCCTGCAACCACGGCAGTTGTTCCCAGTGTGGCCGCAGTGGCGTCCTGAGCTGGCGa < 2:12857/247‑1 (MQ=255) gcggtggccgccgATGGGGCCACGGTAACCTGATGAACTTCCGTCTGTTCCTGGGGAAGGGTATGCACCCGGTTCACCGTGCGGTGTTCCTGACGGGCGTGATGTTTTATCTCTCCGCTCCGCTGTGGTTTATGTTCCTCGCGCTCTCTACTGCATTGCAGGTAGTGCATGCGTTGACCGAACCGCAATACTTCCTGCAACCACGGCAGTTGTTCCCAGTGTGGCCGCAGTGGCGTCCTGAGCTGGCGAtt < 2:34996/244‑1 (MQ=255) gACCGCCGATGGTGCCACGGTAACCTGATGAACTTCCGTCTGTTCCTGGTGAAGGGTATGCACCCGGTTCACCGTGCGGTGTTCCTGACGGGCGTGATGTTTTATCTCTCCGCTCCGCTGTGGTTTATGTTCCTCGCGCTCTCTACTGCATTGCAGGTAGTGCATGCGTTGACCGAACCGCAATACTTCCTGCAACCACGGCAGTTGTTCCCAGTGTGGCCGCAGTGGCGTCCTGCGCTGGCGATTGCACt > 2:314177/1‑251 (MQ=255) aCCGCCGATGGTCCCACGGTAACCTGATGACCTTCCGTCTGTTCCTGGTGAAGGGTATGCACCCGGTTCACCGTGCGGTGTTCCTGCCGCGCGTGATGTTTTATCTCTCCGCTCCGCTGTGGTTTATGTTCCTCGCGCTCTCTACTGCATTGCAGGTAGTGCATGCGTTGACCGAACCGCAATACTTCCTGCAACCACGGCAGTTGTTCCCAGTGTGGCCGCAGTGGCGTCCTGAGCTGGCGATTgatctt > 2:73605/1‑246 (MQ=255) ccgccgATGGTGCCACGGTAACCTGATGAACTTCCGTCTGTTCCTGGTGAAGGGTATGCACCCGGTTCACCGTGCGGTGTTCCTGACGGGCGTGATGTTTTATCTCTCCGCTCCGCTGTGGTTTATGTTCCTCGCGCTCTCTACTGCATTGCAGGTAGTGCATGCGTTGACCGAACCGCAATACTTCCTGCAACCACGGCAGTTGTTCCCAGTGTGGCCGCAGTGGCGTCCTGAGCTGGCGATTGCACttt > 2:91736/1‑251 (MQ=255) ggCCACGGTAACCTGATGATCTTCCGTCTGTTCCTGGTGAAGGGTATGCACCCGGTTCACCGTGCGGTGTTCCTGACGGGCGTGATGTTTTATCTCTCCGCTCCGCTGTGGTTTATGTTCCTCGCGCTCTCTACTGCATTGCAGGTAGTGCATGCGTTGACCGAACCGCAATACTTCCTGCAACCACGGCAGTTGTTCCCAGTGTGGCCGCAGTGGCGTCCTGAGCTGGCGATTGCACTTTTTGCTTCGAc < 2:52042/250‑1 (MQ=255) cACGGTAACCTGATGAACTTCCGTCTGTTCCTGGTGAAGGGTATGCACCCGGTTCACCGTGCGGTGTTCCTGACGGGCGTGATGTTTTATCTCTCCGCTCCGCTGTGGTTTATGTTCCTCGCGCTCTCTACTGCATTGCAGGTAGTGCATGCGTTGACCGAACCGCAATACTTCCTGCAACCACGGCAGTTGTTCCCAGTGTGGCCGCAGTGGCGTCCTg > 2:110163/1‑220 (MQ=255) cACGGTAACCTGATGAACTTCCGTCTGTTCCTGGTGAAGGGTATGCACCCGGTTCACCGTGCGGTGTTCCTGACGGGCGTGATGTTTTATCTCTCCGCTCCGCTGTGGTTTATGTTCCTCGCGCTCTCTACTGCATTGCAGGTAGTGCATGCGTTGACCGAACCGCAATACTTCCTGCAACCACGGCAGTTGTTCCCAGTGTGGCCGCAGTGGCGTCCTg < 1:110163/220‑1 (MQ=255) cACGGTAACCTGATGAACTTCCGTCTGTTCCTGGTGAAGGGTATGCACCCGGTTCACCGTGCGGTGTTCCTGACGGGCGTGATGTTTTATCTCTCCGCTCCGCTGTGGTTTATGTTCCTCGCGCTCTCTACTGCATTGCAGGTAGTGCATGCGTTGACCGAACCGCAATACTTCCTGCAACCACGGCAGTTGTTCCCAGTGTGGCCGCAGTGGCGTCCTGAGCTGGCGATTGCACTTTTTGCTTCGACCAt > 1:104122/1‑251 (MQ=255) ggTAACCTGATGAACTTCCGTCTGTTCCTGGTGAAGGGTATGCACCCGGTTCACCGTGCGGTGTTCCTGACGGGCGTGATGTTTTATCTCTCCGCTCCGCTGTGGTTTATGTTCCTCGCGCTCTCTACTGCATTGCAGGTAGTGCATGCGTTGACCGAACCGCAATACTTCCTGCAACCACGGCAGTTGTTCCCAGTGTGGCCGCAGTGGCg > 2:152240/1‑212 (MQ=255) ggTAACCTGATGAACTTCCGTCTGTTCCTGGTGAAGGGTATGCACCCGGTTCACCGTGCGGTGTTCCTGACGGGCGTGATGTTTTATCTCTCCGCTCCGCTGTGGTTTATGTTCCTCGCGCTCTCTACTGCATTGCAGGTAGTGCATGCGTTGACCGAACCGCAATACTTCCTGCAACCACGGCAGTTGTTCCCAGTGTGGCCGCAGTGGCg < 1:152240/212‑1 (MQ=255) aaCCTGATGAACTTCCGTCTGTTCCTGGTGAAGGGTATGCACCCGGTTCACCGTGCGGTGTTCCTGACGGGCGTGATGTTTTATCTCTCCGCTCCGCTGTGGTTTATGTTCCTCGCGCTCTCTACTGCATTGCAGGTAGTGCATGCGTTGACCGAACCGCAATACTTCCTGCAACCACGGCAGTTGTTCCCAGTGTGGCCGCAGTGGCGTCCTGAGCTGGCGATTGCACTTTTTGCTTCGCCCATGGTGCt > 1:306806/1‑251 (MQ=255) tgatgaACTTCCGTCTGTTCCTGGTGAAGGGTATGCACCCGGTTCACCGTGCGGTGTTCCTGACGGGCGTGATGTTTTATCTCTCCGCTCCGCTGTGGTTTATGTTCCTCGCGCTCTCTACTGCATTGCAGGTAGTGCATGCGTTGACCGAACCGCAATACTTCCTGCAACCACGGCAGTTGTTCCCAGTGTGGCCGCCGTGGCGTCCTGAGCTGGCGATTGCACTTTTTGCTTCGACCATGGTGCtgttg > 2:217432/1‑251 (MQ=255) tgatgaACTTCCGTCTGTTCCTGGTGAAGGGTATGCACCCGGTTCACCGTGCGGTGTTCCTGACGGGCGTGATGTTTTATCTCTCCGCTCCGCTGTGGTTTATGTTCCTCGCGCTCTCTACTGCATTGCAGGTAGTGCATGCGTTGACCGAACCGCAATACTTCCTGCAACCACGGCAGTTGTTCCCAGTGTGGCCGCAGTGGCGTCCTGAGCTGGCGATTGCACTTTTTGCTTCGAcc < 1:256509/239‑1 (MQ=255) tgatgaACTTCCGTCTGTTCCTGGTGAAGGGTATGCACCCGGTTCACCGTGCGGTGTTCCTGACGGGCGTGATGTTTTATCTCTCCGCTCCGCTGTGGTTTATGTTCCTCGCGCTCTCTACTGCATTGCAGGTAGTGCATGCGTTGACCGAACCGCAATACTTCCTGCAACCACGGCAGTTGTTCCCAGTGTGGCCGCAGTGGCGTCCTGAGCTGGCGATTGCACTTTTTGCTTCGAcc > 2:256509/1‑239 (MQ=255) aCTTCCGTCTGTTCCTGGTGAAGGGTATGCACCCGGTTCACCGTGCGGTGTTCCTGACGGGCGTGATGTTTTATCTCTCCGCTCCGCTGTGGTTTATGTTCCTCGCGCTCTCTACTGCATTGCAGGTAGTGCATGCGTTGACCGAACCGCAATACTTCCTGCAACCACGGCAGTTGTTCCCAGTGTGGACGCAGTGGCGTCCTGAGCTGGCGATTGCCCTTTTTGCTTCGACCATGGGGCTGTTGTTccgg > 2:15751/1‑249 (MQ=255) ggTGAAGGGTATGCACCCGGTTCACCGTGCGGTGTTCCTGACGGGCGTGATGTTTTATCTCTCCGCTCCGCTGTGGTTTATGTTCCTCGCGCTCTCTACTGCATTGCAGGTAGTGCATGCGTTGACCGAACCGCAATACTTCCTGCAACCACGGCAGTTGTTCCCAGTGTGGCCGCAGTGGCGTCCTGAGCTGGCGATTGCACTTTTTGCTTCGACCATGGTGCTGTTGTTCCTGCCGAAGTTATTGAg < 1:424426/249‑1 (MQ=255) gAAGGGTATGCACCCGGTTCACCGTGCGGTGTTCCTGACGGGCGTGATGTTTTATCTCTCCGCTCCGCTGTGGTTTATGTTCCTCGCGCTCTCTACTGCATTGCAGGTAGTGCATGCGTTGACCGAACCGCAATACTTCCTGCAACCACGGCAGTTGTTCCCAGTGTGGCCGCAGTGGCGTCCTGAGCTGGCGATTGCACTTTTTGCTTCGACCATGGTGCTGTTGTTCCTGCCGAAGTTATTGAGCAttt > 2:436222/1‑251 (MQ=255) aGGGTATGCATCCGGTTCACCGTGCGGTGGTCCTGACGGGCGTGATGTTTTATCTCTCCGCTCCGCTGTGGTTTATGTTCCTCGCGCTCTCTACTGCATTGCAGGTAGTGCATGCGTTGACCGAACCGCAATACTTCCTGCAACCACGGCAGTTGTTCCCAGTGTGGCCGCAGTGGCGTCCTGAGCTGGCGATTGCACTTTTTGCTTCGACCATGGTGCTGTTGTTCCTGCCGAAGTTATTGAGCATTTTg < 2:364198/251‑1 (MQ=255) cGGTTCACCGTGCGGTGTTCCTGACGGGCGTGATGTTTTATCTCTCCGCTCCGCTGTGGTTTATGTTCCTCGCGCTCTCTACTGCATTGCAGGTAGTGCATGCGTTGACCGAACCGCAATACTTCCTGCAACCACGGCAGTTGTTCCCAGTGTGGCCGCAGTGGCGTCCTGAGCTGGCGATTGCACTTTTTGCTTCGACCATGGTGCTGTTGTTCCTGCCGAAGTTATTGAGCATTTTGCTTATCTGGTGc < 1:208309/251‑1 (MQ=255) cGGTTCACCGAGCGGTGCTCCTGACGGGCGTGATGTTTTATCTCTCCGCTCCGCTGTGGTTTATGTTCCTCGCGCTCTCTACTGCATTGCAGGTAGTGCATGCGTTGACCGAACCGCAATACTTCCTGCAACCACGGCAGTTGTTCCCAGTGTGGCCGCAGTGGCGTCCTGAGCTGGCGCTTGCACTTTTTGCTTCGACCATGGTGCTGTTGTTCCTGCCGAAGTTATTGAGCATTTTGCTTATCTGTTGc > 2:207468/1‑251 (MQ=255) gTTCCCCGTGCGGTGTTCCTGACGGGCGTGATGTTTTATCTCTCCGCTCCGCTGTGGTTTATGTTCCTCGCGCTCTCTACTGCATTGCAGGTAGTGCATGCGTTGACCGAACCGCAATACTTCCTGCAACCACGGCAGTTGTTCCCAGTGTGGCCGCAGTGGCGTCCTGAGCTGGCGATTGCACTTTTTGCTTCGACCATGGTGCTGTTGTTCCTGCCGAAGTTATTGAGCATTTTGCTTATCTGGTGCaa < 1:363850/251‑1 (MQ=255) cACCGTGCGGTGTTCCTGACGGGCGTGATGTTTTATCTCTCCGCTCCGCTGTGGTTTATGTTCCTCGCGCTCTCTACTGCATTGCAGGTAGTGCATGCGTTGACCGAACCGCAATACTTCCTGCAACCACGGCAGTTGTTCCCAGTGTGGCCGCAGTGGCGTCCTGAGCTGGCGATTGCACTTTTTGCTTCGACCATGGTGCTGTTGTTCCTGCCGAAGTTATTGAGCATTTTGCTTATCTGGTGCAAAg < 2:104122/250‑1 (MQ=255) aCCGTGCGGTGTTCCTGACGGGCGTGATGTTTTATCTCTCCGCTCCGCTGTGGTTTATGTTCCTCGCGCTCTCTACTGCATTGCAGGTAGTGCATGCGTTGACCGAACCGCAATACTTCCTGCAACCACGGCAGTTGTTCCCAGTGTGGCCGCAGTGGCGTCCTGAGCTGGCGATTGCACTTTTTGCTTCGACCATGGTGCTGTTGTTCCTGCCGATGTTATTGCGCATTTTGCTTATCTGGTGCAAAgg > 2:463050/1‑250 (MQ=255) ccgggCGGTGTTCCTGACGGGCGGGATGTTTTATCTCTCCGCTCCGTTGTGGTTTATGTTCCTCGCGCTCTCTACTGCATTGCAGGTAGTGCATGCGTTGACCGAACCGCAATACTTCCTGCAACCACGGCAGTTGTTCCCAGTGTGGCCGCAGTGGCGTCCTGAGCTGGCGATTGCACTTTTTGCTTCGACCATGGTGCTGTTGTTCCTGCCGAAGTTATTGAGCATTTTGCTTATCTGGTGCAAAGGaa < 2:142797/247‑1 (MQ=255) gTGCGGTGTTCCTGACGGGCGTGATGTTTTATCTCTCCGCTCCGCTGTGGTTTCTGTTCCTCGCGCTCTCTACTGCATTGCAGGTAGTGCATGCGTTGACCGAACCGCAATACTTCCTGCAACCACGGCAGTTGTTCCCAGTGTGGCCGCAGTGGCGTCCTGAGCTGGCGCTTGCACTTTTTTCTTCGACCATGGTGCTGTTGTTCCTGCCGAGGGTATTGCGCATTTTGCTTATCTGGTTCAAAGGAACg > 2:279524/1‑251 (MQ=255) tGCGGTGTTCCTGACGGGCGTGATGTTTTATCTCTCCGCTCCGCTGTGGTTTATGTTCCTCGCGCTCTCTACTGCATTGCAGGTAGTGCATGCGTTGACCGAACCGCAATACTTCCTGCAACCACGGCAGTTGTTCCCAGTGTGGCCGCAGTGGCGTCCTGAGCTGGCGATTGCACTTTTTGCTTCGACCATGGTGCTgttgtt > 1:112326/1‑204 (MQ=255) tGCGGTGTGCCTGACGGGCGTGATGTTTTATCTCTCCGCTCCGCTGTGGTTTATGTTCCTCGCGCTCTCTACTGCATTGCAGGTAGTGCATGCGTTGACCGAACCGCAATACTTCCTGCAACCACGGCAGTTGTTCCCAGTGTGGCCGCAGTGGCGTCCTGAGCTGGCGATTGCACTTTTTGCTTCGACCATGGTGCTgttgtt < 2:112326/204‑1 (MQ=255) ggTGTTCCTGACGGGCGTGATGTTTTATCTCTCCGCTCCGCTGTGGTTTATGTTCCTCGCGCTCTCTACTGCATTGCAGGTAGTGCATGCGTTGACCGAACCGCAATACTTCCTGCAACCACGGCAGTTGTTCCCAGTGTGGCCGCAGTGGCGTCCTGAGCTGGCGATTGCACTTTTTGCTTCGACCATGGTGCTGCTGTTCCTGCCGAAGTTATTGGGCATTTTGCTTATCTGGTGCAAAGGAACGaa > 2:419621/1‑249 (MQ=255) gtgtTCGTGACGGGCGTGATTTTTTATGTCTACACACCGTTGTGGTTTATGGTCCTCTTGCTTGCTACTGCATTGCAGGGAGTGCATGCGTTGACCGAACCGCAATACTGCCTGCAACCACTGCAGTTGTGTCCAGTGTAGCCGCAGTGGTGTTCTGAGCTGGCGATTTCACTTTTTGCGTCGTCCATGGGGCAGTTGTTCCTGCCGATGGTATTGAGTATTTTGCTTATCTGGTGCAAAGGAACGAAAGa < 2:335046/251‑1 (MQ=255) tgtTCCCGACGGGAGTGCTGTTTTATATATCCGATCCGCTGTGGCTTATGTTCCTCGCGCTCTCTACTGCATTGCAGGCAGAGCATGCGTTGACCGAACGGCAATACTTCCTGCACCCACGGCAGTTGTTCCCGGTGTGGCCGCAGTGGTGTCCTTAGCTCGCGATTGAACTTGTTGCTTCGCCCCTGGCGCTGTTGTTCTTGCCGCAGTAAGTGTGCATTTTGCtaatacgtggcagtgtcacgcaagg > 2:451835/1‑226 (MQ=255) tCCTGACGGGCGTGATGTTTTATCTCTCCGCTCCGCTGTGGTTTATGTTCCTCGCGCTCTCTACTGCATTGCAGGTAGTGCATGCGTTGACCGAACCGCAATACTTCCTGCAACCACGGCAGTTGTTCCCAGTGTGGCCGCAGTGGCGTCCTGAGCTGGCGATTGCACTTTTTGCTTCGACCATGGTGCTGTTGTTCCTGCCGAAGTTATTGAGCATTTTGCTTATCTGGTGCAAAGGAACGAAAGAATAc > 1:483108/1‑251 (MQ=255) cTGACGGGCGTGATGTTTTATCTCTCCGCTCCGCTGTGGTTTATGTTCCTCGCGCTCTCTACTGCATTGCAGGTAGTGCATGCGTTGACCGAACCGCAATACTTCCTGCAACCACGGCAGTTGTTCCCAGTGTGGCCGCAGTGGCGTCCTGAGCTGGCGATTGCACTTTTTGCTTCGACCATGGTGCTGTTGTTCCTGCCGAAGTTATTGAGCATTTTGCTTATCTGGTGCAAAGGAACGAAAGAATAcgg > 1:466950/1‑251 (MQ=255) gACGGGCGTGATGTTTTATCTTCCCGCTCCGCTGTGGTTTATGTTCCTCGCGCTCTCTACTGCATTGCAGGTAGTGCATGCGTTGACCGAACCGCAATACTTCCTGCAACCACGGCAGTTGTTCCCAGTGTGGCCGCAGTGGCGTCCTGAGCTGGCGATTGCACTTTTTGCTTCGACCATGGTGCTGTTGTTCCTGCCGAAGTTATTGAGCATTTTGCTTATCTGGTGCAAAGGAACGAAAGAATAcggc < 2:476898/250‑1 (MQ=255) gggCGTGATGTTTTATCTCTCCGCTCCGCTGTGGTTTATGTTCCTCGCGCTCTCTACTGCATTGCAGGTAGTGCATGCGTTGACCGAACCGCAATACTTCCTGCAACCACGGCAGTTGTTCCCAGTGTGGCCGCAGTGGCGTCCTGAGCTGGCGATTGCACTTTTTGCTTCGACCATGGTGCTGTTGTTCCTGCCGAAGTTATTGGGCATTTTGCTTATCTGGTGCAAAGGAACGAAAGAATAcggcgg > 2:388661/1‑249 (MQ=255) gggCGTGATGTTTTATCTCTCCGCTCCGCTGTGGTTTATGTTCCTCGCGCTCTCTACTGCATTGCAGGTAGTGCATGCGTTGACCGAACCGCAATACTTCCTGCAACCACGGCAGTTGTTCCCAGTGTGGCCGCAGTGGCGTCCTGAGCTGGCGATTGCACTTTTTGCTTCGACCATGGTGCTGTTGTTCCTGCCGAAGTTATTGAGCATTTTGCTTATCTGGTGCAAAGGAACGAAAGAATAcggcgg < 1:388661/249‑1 (MQ=255) cGTGATGTTTTATCTCTCCGCTCCGCTGTGGTTTATGTTCCTCGCGCTCTCTACTGCATTGCAGGTAGTGCATGCGTTGACCGAACCGCAATACTTCCTGCAACCACGGCAGTTGTTCCCAGTGTGGCCGCAGTGGCGTCCTGAGCTGGCGATTGCACTTTTTGCTTCGACCATGGTGCTGTTGTTCCTGCCGAAGTTATTGAGCATTTTGCTTATCTGGTGCAAAGGAACGAAGGAATACGGCGGCTTCt > 1:323470/1‑251 (MQ=255) | TGTCACATGACTTCGTGGAAGCGGCGTTGATGCGCCGTGCAGGTTGGGGGG‑TCTGGATTGCTTACGATCTCCCGGGTTCTTATGAAGAATTGCCGCCTAACTTGCTTGATG‑AGCTAAAAC‑GTGACCGCCGATGGTGCCACGGTAACCTGATGAACTTCCGTCTGTTCCTGGTGAAGGGTATGCACCCGGTTCACCGTGCGGTGTTCCTGACGGGCGTGATGTCTTATCTCTCCGCTCCGCTGTGGTTTATGTTCCTCGCGCTCTCTACTGCATTGCAGGTAGTGCATGCGTTGACCGAACCGCAATACTTCCTGCAACCACGGCAGTTGTTCCCAGTGTGGCCGCAGTGGCGTCCTGAGCTGGCGATTGCACTTTTTGCTTCGACCATGGTGCTGTTGTTCCTGCCGAAGTTATTGAGCATTTTGCTTATCTGGTGCAAAGGAACGAAAGAATACGGCGGCTTCT > NC_000913/1112199‑1112663 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |