| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 46,277 | T→C | C157C (TGT→TGC) | yaaU → | putative transporter YaaU |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 46,277 | 0 | T | C | 96.3% | 154.7 / ‑4.1 | 54 | C157C (TGT→TGC) | yaaU | putative transporter YaaU |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (1/1); new base C (22/30); total (23/31) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.87e-01 | |||||||||||
TATTTCCGATAAAGTCGGACGGCGCAAAATGTTCCTCATTGATATCATCGCCATCGGCGTGATATCGGTGGCGACGATGTTTGTTTCATCCCCCGTCGAACTGTTGGTGATGCGGGTACTTATCGGCATTGTCATCGGTGCAGATTATCCCATCGCCACCTCAATGATCACCGAGTTCTCCAGTACCCGTCAGCGGGCGTTTTCCATCAGCTTTATTGCCGCGATGTGGTATGTCGGCGCGACCTGTGCCGATCTGGTCGGCTACTGGCTTTATGATGTGGAAGGCGGCTGGCGCTGGATGCTGGGTAGCGCGGCGATCCCCTGTTTGTTGATTTTGATTGGTCGATTCGAACTGCCTGAATCTCCCCGCTGGTTATTACGCAAAGGGCGAGTAAAAGAGTGCGAAGAGATGATGATCAAACTGTTTGGCGAACCGGTGGCTTTCGATGAAGAGCAGCCGCAGCAAACCCGTTTTCGCGATCTGTTT > NC_000913/46031‑46517 | tatTTCCGCTAAAGTCGGACGGCGCAAAATGTTCCTCATTGTTATCATCGCCATCGGCGTGATATCGGTGGCGACGATGTTTGTTTCATCCCCCGTCGAACTGTTGGTGATGCGGGTACTTATCGGCATTGTCCTCGGTGCAGATTATCCCATCGCCACCTCAATGATCACCGGGTTATCCAGTACCCGCCAGCGGGCGTTTTCCATCTGCTTTATCGCCGCCCTGTGGTATGTCGGCGCGACCTGCGCCg > 2:162496/1‑251 (MQ=255) atTTCCGATAAAGTCGGACGGCGCAAAATGTTCCTCATTGATATCATCGCCATCGGCGTGATATCGGTGGCGACGATGTTTGTTTCATCCCCCGTCGAACTGTTGGTGATGCGGGTACTTATCGGCATTGTCATCGGTGCAGATTATCCCATCGCCACCTCAATGATCACCGAGTTCTCCAGTACCCGTCAGCGGGCGTTTTCCATCAGCTTTATCGCCGCCATGTGGTATGTCGGCGCGACCTGCGCCg > 2:16523/1‑250 (MQ=255) cGATAAAGTCGGACGGCGCAAAATGTTCCTCATTGATATCATCGCCATCGGCGTGATATCGGTGGCGACGATGTTTGTTTCATCCCCCGTCGAACTGTTGGTGATGCGGGTACTTATCGGCATTGTCATCGGTGCAGATTATCCCATCGCCACCTCAATGATCACCGAGTTCTCCAGTACCCGTCAGCGGGCGTTTTCCATCAGCTTTATCGCCGCCATGTGGTATGTCGGCGCGACCTGCGCCGATCTgg > 1:277750/1‑251 (MQ=255) gATAAAGTCGGACGGCGCAAAATGTTCCTCATTGATATCATCGCCATCGGCGTGATATCGGTGGCGACGCTGTTTGTTTCATCCCCCGTCGGACTGTTGGTGATGCGGGTACTTAACGGCTTTGTCATCGGTGCAGATTATCCACTCGCCACCTCAATGATCACCGAGTTCTCCAGTCCCCGTCAGCGGGCGTTTTCCATCCGATTTGTCGCCGCCCGGTGGTATGTCGACGCGACCTGCGCCGATCTggg > 2:156947/1‑250 (MQ=255) aGTCGGACGGCGCAAAATGTTCCTCATTGATATCATCGCCATCGGCGTGATATCGGTGGCGACGATGTTTGTTTCATCCCCCGTCGAACTGTTGGTGATGCGGGTACTTATCGGCATTGTCATCGGTGCAGATTATCCCATCGCCACCTCAATGATCACCGAGTTCTCCAGTACCCGTCAGCGGGCGTTTTCCATCAGCTTTATCGCCGCCATGTGGTATGTCGGCGCGACCTGCGCCGATCTGGTCGGCt > 1:329079/1‑251 (MQ=255) gACGGCTCAAAATGTTCCTCATTGATATCATCGCCATCGGCGTGATATCGGTGGCGACGATGTTTGTTTCATCCCCCGTCGAACTGTTGGTGATGCGGGTACTTATCGGCATTGTCAGCGGTGCAGATTATCCCATCGCCACCTCAATGATCACCGAGTTCTCCAGTACCCGTGAGCGGGCTTTATCCATCAGCTTTAGCGCCGCCATGTGGTGTGTCGGCGCGTCCTGCGCCGATCTGGTCGGCTACTgg < 1:159362/251‑1 (MQ=255) gACGGCGCAAAATGTTCCTCATTGATATCATCGCCATCGGCGTGATATCGGTGGCGACGATGTTTGTTTCATCCCCCGTCGAACTGTTGGTGATGCGGGTACTTATCGGCATTGTCATCGGTGCAGATTATCCCATCGCCACCTCAATGATCACTGAGTTCTCCAGTACCCGTCAGCGGGCGTTTTCCATCAGCTTTATCGCCGCCATGTGGTATGTCGGCGCGACCTGCGCCTATCTGGTCGGCTACTgg < 1:130766/251‑1 (MQ=255) cGGCGCAAAATGTTCCTCATGGATATCATCGCCATCGGCGTGATATCGGTGGCGACGATGTTTGTTTCATCCCCCGTCGAACTGTTGGTGATGCGGGTACTTATCGGCATTGTCATCGGTGCAGATTATCCCATCGCCACCTCAATGATCACCGAGTTCTCCAGTACCCGTCAGCGGGCGTTTTCCATCAGCTTTATCGCCGCCATGTGGTATGTCGGCGCGACCTGCGCCGATCTGGTCGGCTACTGGCt < 2:277750/251‑1 (MQ=255) cgcAAAATGTTCCTCATTGATATCATCGCCATCGGCGTGATATCGGTGGCGACGATGTTTGTTTCATCCCCCGTCGAACTGTTGGTGATGCGGGTACTTATCGGCATTGTCATCGGTGCAGATTATCCCATCGCCACCTCAATGATCACCGAGTTCTCCAGTACCCGTCAGCGGGCGTTTTCCATCAGCTTTATCTCCGCCATGTGGTATGTCGGCGCGACCTGCGCCGATCTGGTCGGCTACTGGCttt > 1:392263/1‑250 (MQ=255) cAAAATGTTCCTCATTGATATCATCGCCATCGGCGTGATATCGGTGGCGACGATGTTTGTTTCATCCCCCGTCGAACTGTTGGTGATGCGGGTCCTTATCGGCATTGTCATCGGTGCCGATTATCCCATCGCCACCTCAATGATCACCGAGTTCTCCAGTACCCGTCAGCGGGCGTTTTCCATCTGCTTTATCGCCGCCATGTGGTATGTCGGGCCGGCCTGCGCCGATCTGGTCGGCTGCTGGCtttttt > 2:133016/1‑248 (MQ=255) cAAAATGTTCCTCATTGATATCATCGCCATCGGCGTGATATCGGTGGCGACGATGTTTGTTTCATCCCCCGTCGAACTGTTGGTGATGCGGGTACTTATCGGCATTGTCATCGGTGCAGATTATCCCATCGCCACCTCAATGATCACCGAGTTCTCCAGTAACCGTCAGCGGGCGTTTTCCATCAGCTTTATCGCCGCCATGTGGTATGTCGGCGCGACCTGCGCCGATCTGGTCGGCTACTGGCTTTatg > 1:457891/1‑251 (MQ=255) aaaaTGTTCCTCATTGATATCATCGCCATCGGCGTGATATCGGTGGCGACGATGTTTGTTTCATCCCCCGTCGAACTGTTGGTGATGCGGGTACTTATCGGCATTGTCATCGGTGCAGATTATCCCATCGCCACCTCAATGATCACCGAGTTCTCCAGTACCCGTCAGCGGGCGTTTTCCATCAGCTTTATCGCCGCCATGTGGTATGTCGGCGCGACCTGCGCCGATCTGGTCGGCTACTGGCTTTatg > 1:74243/1‑250 (MQ=255) aTGTTCCTCATTGATATCATCGCCATCGGCGTGATAGCGGTGGCGACGATGTTTGTTTCATCCCCCGTCGAACTGTTGGTGATGCGGGTACTTATCGGCATTGTCATCGGTGCAGATTATCCCATCGCCACCTCAATGATCACCGAGTTCTCCATTACCCGTCAGCGGGCGTTTTCCATCAGCTTTATCGCCGCCATTTGGTATGTCGGCGCGCCCTGCGCCGATCTGGTCGGCTACGGGCTTTATGAtgt < 1:425452/251‑1 (MQ=255) ccTCATTGATATCATCGCCATCGGCGTGATATCGGTGGCGCCGATGTTTGTTTCATCCCCCGTCGGACTGTTGGTGATGCGGGAACTTATCGGCATTGTCATCGGTGCAGATTATCCCATCGCCACCTCAATGATCACCGAGTTCTCCAGTACCCGTCAGAGGGCGTTTTCCATCAGCTTTATCGCCGCCATGTGGGATGTCGACGAGACCTGCGCCGATCTGGTCGGCTACTGGCTTTATGATGTGGa > 1:388897/1‑249 (MQ=255) cATTGATATCATCGCCATCGGCGTGATATCGGTGGCGACGATGTTTGTTTCATCCCCCGTCGAACTGTTGGTGATGCGGGTACTTATCGGCATTGTCATCGGTGCAGATTATCCCATCGCCACCTCAATGATCACCGAGTTCTCCAGTACCCGTCAGCGGGCGTTTTCCATCAGCTTTATCGCCGCCATGTGGTATGTCGGCGCGACCTGCGCCGATCTGGTCGGCTACTGGCTTTATGATGTGGAAgg < 2:387194/249‑1 (MQ=255) cGGTGGCGACGATGTTTGTTTCATCCCCCGTCGAACTGTTGGTGATGCGGGTACTTATCGGCATTGTCATCGGTGCAGATTATCCCATCGCCACCTCAATGATCACCGAGTTCTCCAGTACCCGTCAGCGGGCGTTTTCCATCAGCTTTATCGCCGCCATGTGGTATGTCGGCGCGACCTGCGCCGATCTGGTCGGCTACTGGCTTTATGATGTGGAAGGCGGCTGGCGCTGGATGCTGGGTAGCgcggc < 1:455822/250‑1 (MQ=255) acgaTGTTTGTTTCATCCCCCGTCGAACTGTTGGTGATGCGGGTACTTATCGGCATTGTCATCGGTGCAGCTTATCCCATCGCCACCTCAATGATCACCGAGTTCTCCAGTACCCGTCAGCGGGCGTTTTCCATCAGCTTTATCGCCGCCATGTGGTATGTCGGCGCGCCCTGCGCCGATCTGGTc > 2:210776/1‑186 (MQ=255) acgaTGTTTGGTTCATCCCCCGTCGAACTGTTGGTGATGCGGGTACTTATCGGCATTGTCATCGGTGCAGATTATCCCATCGCCACCTCAATGAGCACCGAGTTCTCCAGTACCCGTCAGCGGGCGTTTTCCATCAGCTTTATCGCCGCCATGTGGTATGTCGGCGCGACCTGCGCCGATCTGGTc < 1:210776/186‑1 (MQ=255) tgtttCATCCCCCGTCGCACTGTTGGTGATGCGGGTACTTATCGGCATTGTCATCGGTGCAGATTATCCCATCGCCACCTCAATGATCACCGAGTTCTCCAGTACCCGTCAGCGGGCGTTTTCCATCAGCTTTATCGCCGCCATGTGGTATGTCGGCGCGACCTGCGCCGATCTGGTCGGCTACTGGCTTTATGATGTGGAAGGCGGCTGGCGCTGGATGCTGGGTAGCGCGGCGATCCCCTGTttgttg > 1:415023/1‑250 (MQ=255) tCATCCCCCGTCGAACTGTTGGTGATGCGGGTACTTATCGGCATTGTCATCGGTGCAGATTATCCCATCGCCACCTCAATGATCACCGAGTTCTCCAGTACCCGTCAGCGGGCGTTTTCCATCAGCTTTATCGCCGCCATGTGGTATGTCGGCGCGACCTGCGCCGATCTGGTCGGCTACTGGCTTTATGATGTGGAAGGCGGCTGGCGCTGGATGCTGGGTAGCGCGGCGATCCCCTGTTTGttgattt < 1:16523/250‑1 (MQ=255) tCATCCCCCGGCGAACTGTTGGTGATGCGCGTTCTTATCGGCATTGTCATCGGTGCAGATTATCCCACCGCCACCTCAATGATCACCGAGTTCTCCAGTACCCGTCAGCGGGCGTTTTCCATCAGCTTTATCGCCGCCATGTGGTATGTCGGCGCGACCTGCGCCGATCTGGTCGGCTACTGGCGTTATGATGTGGAAGGCGGCTGGCGCTGGATGCTTGGTAGCGCGGCGATCCCCTGTTTGttgattt < 2:420028/250‑1 (MQ=255) tCCCCCGTCGAACTGTTGGTGATGCGGGTACTTATCGGCATTGTCATCGGTGCAGATTATCCCATCGCCACCTCAATGATCACCGAGTTCTCCAGTACCCGTCAGCGGGCGTTTTCCATCAGCTTTATCGCCGCCATGTGGTATGTCGGCGCGACCTGCGCCGATCTGGTCGGCTACTGGCTTTATGATGTGGAAGGCGGCTGGCGCTGGATGCTGGGTAGCGCGGCGATCCCCTGTTTGttgattttgat > 2:458258/1‑251 (MQ=255) cccccGTCGAACTGTTGGGGAGGCGGGTACTTATCGGCATTGTCATCGGTGCAGATTATCCCATCGCCACCTCAATGATCACCGAGTTCTCCAGTACCCGTCAGCGGGCGTTTTCCATCAGCTTTATCGCCGCCATGTGGTATGTCGGCGCGACCTGCGCCGATCTGGTCGGCTACTGGCTTTATGATGTGGAAGGCGGCTGGCGCTGGATGCTGGGTAGCGCGGCGATCCCCTGTTTGttgattttgatt < 2:139549/251‑1 (MQ=255) cccGTCGAACTGTTGGAGATGCGGGTACTTATCGGCATTGTCATCGGTGCAGATTATCCCATCGCCACCTCAATGATCACCGAGTTCTCCAGTACCCGTCAGCGGGCGTTTTCCATCAGCTTTATCGCCGCCATGTGGTATGTCGGCGCGACCTGCGCCGATCTGGTCGGCTACTGGCTTTATGATGTGGAAGGCGGCTGGCGCTGGATGCTGGGTAGCGCGGCGATCCCCTGTTTGTTGATTTTGCTTgg > 1:350564/1‑251 (MQ=255) gTACTTATCGGCATTGTCATCGGTGCAGATTATCCCATCGCCACCTCAATGATCACCGAGTTCTCCAGTACCCGTCAGCGGGCGTTTTCCATCAGCTTTATCGCCGCCATGTGGTATGTCGGCGCGACCTGCGCCGATCTGGTCGGCTACTGGCTTTATGATGTGGAAGGCGGCTGGCGCTGGATGCTGGGTAGCGCGGCGATCCCCtgtttgt > 2:326425/1‑214 (MQ=255) gTACTTATCGGCATTGTCATCGGTGCAGATTATCCCATCGCCACCTCAATGATCACCGAGTTCTCCAGTACCCGTCAGCGGGCGTTTTCCATCAGCTTTATCGCCGCCATGTGGTATGTCGGCGCGACCTGCGCCGATCTGGTCGGCTACTGGCTTTATGATGTGGAAGGCGGCTGGCGCTGGATGCTGGGTAGCGCGGCGATCCCCtgtttgt < 1:326425/214‑1 (MQ=255) cTTATCGGCATTGTCATCGGTGCAGATTATCCCATCGCCACCTCAATGATCACCGAGTTCTCCAGTACCCGTCAGCGGGCGTTTTCCATCAGCTTTATCGCCGCCATGTGGTATGTCGGCGCGACCTGCGCCGATCTGGTCGGCTACTGGCTTTATGATGTGGAAGGCGGCTGGCGCTGGATGCTGGGTAGCGCGGCGATCCCCTGTTTGTTGATTTTGATTGGTCGATTCGAACTGCCTGAATCTCCCCg > 1:479399/1‑251 (MQ=255) tGTCAGCGGTGCAGATTATCCCATCGCCACCTCAATGATCACCGAGTTCTCCAGTACCCGTCAGCGGGCGTTTTCCATCAGCTTTATCGCCGCCATGTGGTATGTCGGCGCGACCTGCGCCGATCTGGTCGGCTACTGGCTTTATGATGTGGAAGGCGGCTGGCGCTGGATGCTGGGTAGCGCGGCGATCCCCTGTTTGTTGATTTTGATTGGTCGATTCGAACTGCCTGAATCTCCCCGCTGGttatta < 1:349428/250‑1 (MQ=255) aTCGGTGCAGATTATCCCATCGCCACCTCAATGATCACCGAGTTCTCCAGTACCCGTCAGCGGGCGTTTTCCATCAGCTTTATCGCCGCCATGTGGTATGTCGGCGCGACCTGCGCCGATCTGGTCGGCTACTGGCTTTATGATGTGGAAGGCGGCTGGCGCTGGCTGCTGGGTAGCGCGGCGATCCCCTGTTTGTTGATTTTGATTGGTCGATTCGAACTGCCTGAATCTCCCCGCTGGTTCTTACGcc > 1:234488/1‑249 (MQ=255) ggTGCAGATTATCCCATCGCCACCTCAATGATCACCGAGTTCTCCAGTACCCGTCAGCGGGCGTTTTCCATCAGCTTTATCGCCGCCATGTGGTATGTCGGCGCGACCTGCGCCGATCTGGTCGGCTACTGGCTTTATGATGTGGAAGGCGGCTGGCGCTGGATGCTGGGTAGCGCGGCGATCCCCTGTTTGTTGATTTTGATTGGTCGATTCGAACTGCCTGAATCTCCCCGCTGGTTATTACGCAAAgg < 1:151204/251‑1 (MQ=255) gCAGATTTTCCCATCGCCACCTCAATGATCACCGAGTTCTCCAGTACCCGTCAGCGGGCGTTTGCCACCAGCTTGATTGCCGTGATGTGGTATGTCGGCGCGACCTGTGCCGTTCTGGTCGGCTACTGGCTTTATGATGTGGAAGGCGGCTGGCGCTGGATGCTGGGTAGCGCGGCGATCCCCTGTTTGTTGATTTTGATTGGTCGATTCGAACTGCCTGAATCTCCCCGCTGGTTATTACGCAAAGGGc < 2:137081/250‑1 (MQ=255) aGATTATCCCATCGCCACCTCAATGATCACCGAGTTCTCCAGTTCCCGTCAGCGGGCGTTTTCCATCAGCTTTATCGCCGCCATGTGGTATGTCGGCGCGACCTGCGCCGATCTGGTCGGCTACTGGCTTTATGATGTGGAAGGCGGCTGGCGCTGGATGCTGGGTAGCGCGGCGATCCCCTGTTTGTTGATTTTGATTGGTCGATTCGAACTGCCTGAATCTCCCCGCTGGTTATTACGCAAAGGGCGAg < 1:453858/251‑1 (MQ=255) aTCCCATCGCCACCTCAATGATCACCGCGTTCTCCAGTACCCGTCAGCGGGCGTTTTCCATCAGCTTTATCGCCGCCATGTGGTATGTCGGCGCGACCTGCGCCGATCTGGTCGGCTACTGGCTTTATGATGTGGAAGGCGGCTGGCGCTGGATGCTGGGTAGCGCGGCGATCCCCTGTTTGTTGATTTTGATTGGTCGATTCGAACTGCCTGAATCTCCCCGCTGGTTATTACGCAAAGGGCGAGTaaaa < 1:408697/251‑1 (MQ=255) cccATCGCCACCTCAATGATCACCGAGTTCTCCAGTACCCGTCAGCGGGCGTTTTCCATCAGCTTTATCGCCGCCATGTGGTATGTCGGCGCGACCTGCGCCGATCTGGTCGGCTACTGGCTTTATGATGTGGAAGGCGGCTGGCGCTGGATGCTGGGTAGCGCGGCGATCCCCTGTTTGTTGATTTTGATTGGTCGATTCGAACTGCCTGAATCTCCCCGCTGGTTATTACGCAAAGGGCGAGTAAAag < 1:352706/250‑1 (MQ=255) cccAGCGCTACCTCAATGACCACCGTGTTCTCCAGGATCCGTCAGCGGGCGTTTTCCATCAGCTTTATCGCCGCCATGGTGTAGGTCGGCGCGACCTGCGCCGAACTGGGCGGCTACTGGCGTTATGATGTGGAAGGCGGCTGGCGCTGGATGGTGGGTAGCGCGGCGATCCCCTGTTTGTTGATTTTGATTGGTCGATTCGAACCGCCTGAATCTCCCCGCTGGTTATTACGCAAAGGGCGAGTAAAaga < 1:7667/251‑1 (MQ=255) cGCCACCTCAATGATCACCGAGTTCTCCAGTACCCGTCAGCGGGCGTTTTCCATCAGCTTTATCGCCGCCATGTGGTATGTCGGCGCGACCTGCGCCGATCTGGTCGGCTACTGGCTTTATGATGTGGAAGGCGGCTGGCGCTGGATGCTGGGTAGCGCGGCGATCCCCTGTTTGTTGATTTTGATTGGTCGATTCGAACTGCCTGAATCTCCCCGCTGGTTATTACGCAAAGGGCGAGTAAAAGAGTGc < 1:458221/250‑1 (MQ=255) gCCACCTCAATGATCACCGAGTTCTCCAGTACCCGTCAGCGGGCGTTTTCCATCAGCTTTATCGCCGCCATGTGGTATGTCGGCGCGACCTGCGCCGATCTGGTCGGCTACTGGCTTTATGATGTGGAAGGCGGCTGGCGCTGGATGCTGGGTAGCGCGGCGATCCCCTGTTTGTTGATTTTGATTGGTCGATTCGAACTGCCTGAATCTCCCCGCTGGTTATTACGCCAAGGCCGAGTAAAAGAGTGCg > 1:221670/1‑250 (MQ=255) cACCTCAATGATCACCGAGTTCTCCAGTACCCGTCAGCGGGCGTTTCCCATCAGCTTTATCGCCGCCAGGTGGTATGTCGGCGCGACCTGCGCCGTTCTGGTCGGCTACTGGCTTTATGATGTGGAAGGCGGCTGGCGCTGGATGCTGGGTAGCGCGGCGATCCCCTGTTTGTTGATTTTGATTGGTCGAGTCGAACTGCCTGAATCTCCCCGCTGGTTATTACGCAAAGGGCGAGTAAAAGAGTGCGAag < 2:82061/251‑1 (MQ=255) ccTCAATGATCACCGAGTTCTCCAGTACCCGTCAGCGGGCGTTTTCCATCAGCTTTATCGCCGCCATGTGGTATGTCGGCGCGACCTGCGCCGATCTGGTCGGCTACTGGCTTTATGATGTGGAAGGCGGCTGGCGCTGGATGCTGGGTAGCGCGGCGATCCCCTGTTTGTTGATTTTGATTGGTCGATTCGAACTGCCTGAATCTCCCCGCTGGTTATTACGCAAAGGGCGAGTAAAAGAGTGCGAagag < 1:39539/251‑1 (MQ=255) aaaTGATCACCGAGTTCTCCAGTTCCCGTCAGCGGGCGTTTTCCATCAGCTGTATCGCCGCCATGTGGTATGGCGGCGCGACCTGCGCCGATCTGGTCGGCTACTGGCTTTATGATGTGGAAGGCGGCTGGCGCTGGATGCTGGGTAGCGCGGCGATCCCCTGTTTGTTGATTTTGATTGGTCGATTCGAACTGCCTGAATCTCCCCGCTGGTTATTACTCAAAGGGCGAGTAAAAGAGTGCGAAGAgat < 2:415023/249‑1 (MQ=255) aTCACCGAGTTCTCCAGTACCCGTCAGCGGGCGTTTTCCATCAGCTTTATCGCCGCCATGTGGTATGTCGGCGCGACCTGCGCCGATCTGGTCGGCTACTGGCTTTATGATGTGGAAGGCGGCTGGCGCTGGATGCTGGGTAGCGCGGCGATCCCCTGTTTGTTGATTTTGATTGGTCg > 1:133161/1‑179 (MQ=255) aTCACCGAGTTCTCCAGTACCCGTCAGCGGGCGTTTTCCATCAGCTTTATCGCCGCCATGTGGTATGTCGGCGCGACCTGCGCCGATCTGGTCGGCTACTGGCTTTATGATGTGGAAGGCGGCTGGCGCTGGATGCTGGGTAGCGCGGCGATCCCCTGTTTGTTGATTTTGATTGGTCg < 2:133161/179‑1 (MQ=255) cACCGAGTTCTACAGTACCCGTCAGCGGGCGTTTTCCATCAGCTTTATCGCCGCCATGTGGTATGTCGGCGCGACCTGCGCCGATCTGGTCGGCTACTGGCTTTATGATGTGGAAGGCGGCTGGCGCTGGCTGCTGGGTAGCGCGGCGATCCCCTGTTTGTTGATTTTGATTGGTCGATTCGAACTGCCTGAATCTCTCCGCTGGTTATTACGCAAGGGGCGAGAAACAGTGGGCGTAGAgatgatgata > 2:10585/1‑249 (MQ=255) gTACCCGTCAGCGGGCGTTTTCCATCAGCTTTATTGCCGCGATGTGGTATGTCGGCGCGACCTGTGCCGATCTGGTCGGCTACTGGCTTTATGATGTGGAAGGCGGCTGGCGCTGGATGCTGGGTAGCGCGGCGATCCCCTGTTTGTTGATTTTGATTGGTCGATTCGAACTGCCTGAATCTCCCCGCTGGTTATTACGCAAAGGGCGAGTAAAAGAGTGCGAAGAGATGATGATCAAACTGTTTGGCGa > 1:239655/1‑250 (MQ=255) cGGGCGTTTTCCATCAGCTTTATCGCCGCCATGTGGTATGTCGGCGCGACCTGCGCCGATCTGGTCGGCTACTGGCTTTATGATGTGGAAGGCGGCTGGCGCTGGATGCTGGGTAGCGCGGCGATCCCCtgtttg < 1:89882/135‑1 (MQ=255) cGGGCGTTTTCCATCAGCTTTATCGCCGCCATGTGGTATGTCGGCGCGACCTGCGCCGATCTGGTCGGCTACTGGCTTTATGATGTGGAAGGCGGCTGGCGCTGGATGCTGGGTAGCGCGGCGATCCCCtgtttg > 2:89882/1‑135 (MQ=255) cGGGCGTTTTCCATCAGCTTTATCGCCGCCATGTGGTATGTCGGCGCGACCTGCGCCGATCTGGTCGGCTACTGGCTTTATGATGTGGAAGGCGGCTGGCGCTGGATGCTGGGTAGCGCGGCGATCCCCTGTTTGTTGATTTTGATTGGTCGATTCGAACTGCCTGAATCTCCCCGCTGGTTATTACGCAAAGGGCGAGTAAAAGAGTGCGCAGAGATGATGATaaaa > 2:317761/1‑228 (MQ=255) cGGGCGTTTTCCATCAGCTTTATCGCCGCCATGTGGTATGTCGGCGCGACCTGCGCCGATCTGGTCGGCTACTGGCTTTATGATGTGGAAGGCGGCTGGCGCTGGATGCTGGGTAGCGCGGCGATCCCCTGTTTGTTGATTTTGATTGGTCGATTCGAACTGCCTGAATCTCCCCGCTGGTTATTACGCAAAGGGCGAGTAAAAGAGTGCGAAGAGATGATGATaaaa < 1:317761/228‑1 (MQ=255) gggCGTTTTCCATCAGCTTTATCGCCGGCATGTTGTATGTCGGCGCGACCTGCGCCGATCTGGTCGGCTACTGGCTTTATGATGTGGAAGGCGGCTGGCGCTGGATGCTGGGTAGCGCGGCGATCCCCTGTTTGTTGATTTTGATTGGTCGATTCGAACTGCCTGAATCTCCCCGCTGGTTATTACGCAAAGGGCGAGTAAAAGAGTGCGAAGAGATGATGATAAAACTGTTTGGCGAACCGGTGGCTTTc < 2:329079/251‑1 (MQ=255) gTTTTCCATCAGCTTTATCGCCGCCATGGGGTATGTCGGCGCGACCTGCGCCGATCTGGTCGGCTACTGGCTTTATGATGTGGAAGGCGGCTGGCGCTGGATGCTGGGTAGCGCGGCGATCCCCTGTTTGTTGATTTTGATGGGTCGATTCGAACTGCCTGAATCTCCCCGCTGGTTAGTACGCAAAGGGCGAGTAAAAGAGTGCGAAGAGATGATGATAAAACTGTTTGGCGAACCGGTGGCTTTCGATg < 1:162496/251‑1 (MQ=255) caaTCAGCTTGATCGCCGCCATGTGGTATGTCGGCGCGACCGGCGCCGATCTGGTCGGCTACTGGCTTTATGATGTGGAAGGCGGCTGGCGCTGGATGCTGGGTAGCGCGGCGATCCCCTGTTTGTTGATTTTGATTGGTCGATTCGAACTGCCTGAATCTCCCCGCTGGTTATTACGCAAAGGGCGAGTAAAAGAGTGCGAAGAGATGATGATAAAACTGTTTGGCGAACCGGTGGCTTTCGATGAagag < 1:399451/249‑1 (MQ=255) agctttatcgctgccctgtgGTATGGCTGCGCTACCGGCGCCGATCTGGTCGGCTACTGGCTTTATGATGGGGAATGCGGCTGGCGCTGGATGCTGGGTAGCGCGGCGATCCCCTGTTTGTTGATTTTGATTGGTCGATTCGAACTGCCTGATTCTCCCCGCTGGTTATTACGCAAAGGGCGATTAAAAGAGTGCGAAGAGATGATGATAAAACTGTTTGGCGAACCGGTGGCTTTCGATGAAGATCAGcc < 2:333159/235‑1 (MQ=255) cgccaTGTGGTATGTCGGCGCGACCTGCGCCGATCTGGTCGGCTACTGGCTTTATGATGTGGAAGGCGGCTGGCGCTGGATGCTGGGTAGCGCGGCGATCCCCTGTTTGTTGATTTTGATTGGTCGATTCGAACTGCCTGAATCTCCCCGCTGGTTATTACGCAAAGGGCGAGTAAAAGAGTGCGAAGAGATGATGATAAAACTGTTTGGCGAACCGGTGGCTTTCGATGAAGAGCAGCCGCAGCAAAccc < 1:197826/247‑1 (MQ=255) gcgcGACCTGCGCCGATCTGGTCGGCTACTGGCTTTATGATGTGGAAGGCGGCTGGCGCTGGATGCTGGGTAGCGCGGCGATCCCCTGTTTGTTGATTTTGATTGGTCGATTCGAACTGCCTGAATCTCCCCGCTGGTTATTACGCAAAGGGCGAGTAAAAGAGTGCGAAGAGATGATGATAAAACTGTTTGGCGAACCGGTGGCTTTCGATGAAGAGCAGCCGCAGCAAACCCGTTTTCGCGATCTGttt < 1:160702/251‑1 (MQ=255) | TATTTCCGATAAAGTCGGACGGCGCAAAATGTTCCTCATTGATATCATCGCCATCGGCGTGATATCGGTGGCGACGATGTTTGTTTCATCCCCCGTCGAACTGTTGGTGATGCGGGTACTTATCGGCATTGTCATCGGTGCAGATTATCCCATCGCCACCTCAATGATCACCGAGTTCTCCAGTACCCGTCAGCGGGCGTTTTCCATCAGCTTTATTGCCGCGATGTGGTATGTCGGCGCGACCTGTGCCGATCTGGTCGGCTACTGGCTTTATGATGTGGAAGGCGGCTGGCGCTGGATGCTGGGTAGCGCGGCGATCCCCTGTTTGTTGATTTTGATTGGTCGATTCGAACTGCCTGAATCTCCCCGCTGGTTATTACGCAAAGGGCGAGTAAAAGAGTGCGAAGAGATGATGATCAAACTGTTTGGCGAACCGGTGGCTTTCGATGAAGAGCAGCCGCAGCAAACCCGTTTTCGCGATCTGTTT > NC_000913/46031‑46517 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |