| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 224140 = | NA (NA) | 3 (0.070) | 3/476 | 3.9 | 7.2% | noncoding (370/1542 nt) | rrsH | 16S ribosomal RNA |
| ? | NC_000913 | = 1408753 | 39 (0.850) | coding (704/984 nt) | zntB | Zn(2(+)):H(+) symporter | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
GATGCGTTGACCGATCATTCCAGTGAATTTATCGAGCAGCTGCACGATAAAATTATCGACCTTGAAGATAATCTCCTTGATCAGCAAATTCCACCGCGTGGATTCCTGGCTCTGCTGCGCAAACAATTAATTGTGATGCGTCGCTATATGGCACCGCAACGTGATGTTTATGCTCGTCTTGCCAGTGAACGTTTGCCGTGGATGAGCGATGACCAACGCCGTCGGATGCAGGATATTGCCGATCGCCTTGGGCGCGGCCTTGACGAAATCGACGCCTGTATAGCACGGACTGGCGTGATGGCGGATGAAATCGCTCAGGTGATGCAGGAAAATTTAGCTCGTCGTACCTATACAATGTCGTTGATGGCAATGGTCTTTTTACCCAGTACCTTTCTGACCGGGTTATTTGGCGTCAACCTTGGTGGGATCCCTGGCGGCGGGTGGCAATTCGGATTTTCAATTTTTTGTATTCTGTTAGTTGTTCTTATTGGTGGTGTT > NC_000913/1408503‑1409000 | gATGCGTTGACCGATCATTCCAGTGAATTTATCGAGCAGCTGCACGATAAAATTATCGACCTTGAAGATAATCTCCTTGATCAGCAAATTCCACCGCGTGGATTCCTGGCTCTGCTGCGCAAACAATTAATTGTGATGCGTCGCTATATGGCACCGCAACGTGATGTTTATGCTCGTCTTGCCAGTGAACGTTTGCCGTGGATGAGGGATTACCAACGCGGTCGGATGCAGGATATTGCCGATCGCCTTgg < 1:428735/251‑1 (MQ=255) aTGCGTTGACCGATCATTCCAGTGAATTTATCGAGCAGCTGCACGATAAAATTATCGACCTTGAAGATAATCTCCTTGATCAGCAAATTCCACCGCGTGGATTCCTGGCTCTGCTGCGCAAACAATTAATTGTGATGCGTCGCTATATGGCACCGCAACGTGATGTTTATGCTCGTCTTGCCAGTGAACGTTTGCCGTGGATGAGCGATGACCAACGCCGTCGGATGCAGGATATTGCCGATCGCCTTggg > 1:285460/1‑251 (MQ=255) gCGTTGACCGATCATTCCAGTGAATTTATCGAGCAGCTGCACGATAAAATTATCGACCTTGAAGATAATCTCCTTGATCAGCAAATTCCACCGCGTGGATTCCTGGCTCTGCTGCGCAAACAATTAATTGTGATGCGTCGCTATATGGCACCGCAACGTGATGTTTATGCTCGTCTTGCCAGTGAACGTTTGCCGTGGATGAGCGATGACCAACGCCGTCGGATGCAGGATATTGCCGATCGCCTTGGgc < 1:396641/250‑1 (MQ=255) gCGTTGACCGATCATTCCAGTGAATTTATCGAGCAGCTGCACGATAAAATTATCGACCTTGAAGATAATCTCCTTGATCAGCAAATTCCACCGCGTGGATTCCTGGCTCTGCTGCGCAAACAATTAATTGTGATGCGTCGCTATATGGCACCGCAACGTGATGTTTATGCTCGTCTTGCCAGTGAACGTTTGCCGTGGATGAGCGATGACCAACGCCGTCGGATGCAGGATATTGCCGATCGCCTTGGgc < 1:7125/250‑1 (MQ=255) ccactccttCCAGTGAAGTCATCGAGCAGCTGCTCGATTAAATTAGCGACCTTGAAAATAATCTCCTTGATCAGCAAAGTCCACCGCGTGGATTCCTGGCTCTGCTGCGCAAACAATTAATTGGTAGGCTTCGCTCTATGGCACCGCAACGTGATGTTTATGCTCGTCTGGCTAGTGAACGTTTGCCGGGGATGTGCGATGACCAACGCCGGCGGATGCAGGATATTGCCGATCGCCTTGGGCGCGGCCtt < 2:265972/244‑1 (MQ=255) gATCATTCCAGTGAATTTATCGAGCAGCTGCACGATAAAATTATCGACCTTGAAGATAATCTCCTTGATCAGCAAATTCCACCGCGTGGATTCCTGGCTCTGCTGCGCAAACAATTAATTGTGATGCGTCGCTATATGGCACCGCAACGTGATGTTTATGCTCGTCTTGCCAGTGAACGTTTGCCGTGGATGAGCGATGACCAACGCCGTCGGATGCAGGATATTGCCGATCGCCTTGGGCGCGGCCTTGa < 1:411837/251‑1 (MQ=255) cATTCCAGTGAATTTATCGAGCAGCTGCACGATAAAATTATCGACCTTGAAGATAATCTCCTTGATCAGCAAATTCCACCGCGTGGATTCCTGGCTCTGCTGCGCAAACAATTAATTGTGATGCGTCGCTATATGGCACCGCAACGTGATGTTTATGCTCGTCTTGCCAGTGAACGTTTGCCGTGGATGAGCGATGACCAACGCCGTCGGATGCAGGATATTGCCGATCGCCTTGGGCGCGGCCTTgccg > 2:15823/1‑247 (MQ=255) aTTCCAGTGAATTTATCGAGCAGCTGCACGATAAAATTATCGACCTTGAAGATAATCTCCTTGATCAGCAAATTCCACCGCGTGGATTCCTGGCTCTGCTGCGCAAACAATTAATTGTGATGCGTCGCTATATGGCACCGCAACGTGATGTTTATGCTCGTCTTGCCAGTGAACGTTTGCCGTGGATGAGCGATGACCAACGCCGTCGGATGCAGGATATTGCCGATCGCCTTGGGCGCGGCCTTGACGa > 2:422384/1‑250 (MQ=255) ttCCAGTGAATTTAACGAGCAGCTGCGCGATAAAATTATCGACCTTGAAGATAATCTCCTTGATAAGCAAATTCCACCGCGTGGATTCCTGGCTCTGCTGCGCAAACAATTAATTGTGATGCGTCGCTATATGGCACCGCAACGTGATGTTTATGCTCGTCTTGCCAGTGAACGTTTGCCGTGGATGAGCGATGACCAACGCCGTCGGATGCAGGATATTGCCGAGCGCCTTGGGCGCGGCCTTGACGaa < 2:335458/250‑1 (MQ=255) cGAGCAGCTGCACGATAAAATTATCGACCTTGAAGATAATCTCCTTGATCAGCAAATTCCACCGCGTGGATTCCTGGCTCTGCTGCGCAAACAATTAATTGTGATGCGTCGCTATATGGCACCGCAACGTGATGTTTATGCTCGTCTTGCCAGTGAACGTTTGCCGTGGATGAGCGATGACCAACGCCGTCGGATGCAGGATATTGCCGATCGCCTTGGGCGCGGCCTTGACGGAATCGCCGCCTGtat > 2:345526/1‑249 (MQ=255) agcTGCACGATAAAATTATCGACCTTGAAGATAATCTCCTTGATCAGCAAATTCCACCGCGTGGATTCCTGGCTCTGCTGCGCAAACAATTAATTGTGATGCGTCGCTATATGGCACCGCAACGTGATGTTTATGCTCGTCTTGCCAGTGAACGTTTGCCGTGGATGAGCGATGACCAACGCCGTCGGATGCAGGATATTGCCGATCGCCTTGGGCGCGGCCTTGACGAAATCGACGCCTGTATAGCACgg > 2:463850/1‑251 (MQ=255) cGATAAAATTATCGACCTTGAAGATAATCTCCTTGATCAGCAAATTCCACCGCGTGGATTCCTGGCTCTGCTGCGCAAACAATTAATTGTGATGCGTCGCTATATGGCACCGCAACGTGATGTTTATGCTCGTCTTGCCAGTGAACGTTTGCCGTGGATGAGCGATGACCACCGCCGTCGGATGCAGGATCTTGCCGATCGCCTTGGGCGCGGCCTTGACGAAATCGACGCCTGTATAGCACGGACTGGCg > 2:334427/1‑251 (MQ=255) gATAAAATTATCGACCTTGAAGATAATCTCCTTGATCAGCAAATTCCACCGCGTGGATTCCTGGCTCTGCTGCGCAAACAATTAATTGTGATGCGTCGCTATATGGCACCGCAACGTGATGTTTATGCTCGTCTTGCCAGTGAACGTTTGCCGTGGATGAGCGATGACCAACGCCGTCGGATGCAGGATATTGCCGATCGCCTTGGGCGCGGCCTTGACGAAATCGACGCCTGTATAGCACGGACTGGCGt < 1:308988/251‑1 (MQ=255) aTCGACCTTGAAGATAATCTCCTTGATCAGCAAATTCCACCGCGTGGATTCCTGGCTCTGCTGCGCAAACAATTAATTGTGATGCGTCGCTATATGGCACCGCAACGTGATGTTTATGCTCGTCTTGCCAGTGAACGTTTGCCGTGGATGAGCGATGACCAACGCCGTCGGATGCAGGATATTGCCGATCGCCTTGGGCGCGGCCTTGACGAAATCGACGCCTGTATAGCACGGACTGGCGTGATGGCgg < 1:101325/250‑1 (MQ=255) aTCGACCTTGAAGATAATCTCCTTGATCAGCAAATTCCACCGCGTGGATTCCTGGCTCTGCTGCGCAAACAATTAATTGTGATGCGTCGCTATATGGCACCGCAACGTGATGTTTATGCTCGTCTTGCCAGTGAACGTTTGCCGTGGATGAGCGATGACCAACGCCGTCGGATGCAGGATATTGCCGATCGCCTTGGGCGCGGCCTTGACGAAATCGACGCCTGTATAGCACGGACTGGCGTGATGGCgg < 2:395774/250‑1 (MQ=255) gAAGATAATCTCCTTGATCAGCAAATTCCACCGCGTGGATTCCTGGCTCTGCTGCGCAAACAATTAATTGTGATGCGTCGCTATATGGCACCGCAACGTGATGTTTATGCTCGTCTTGCCAGTGAACGTTTGCCGTGGATGAGCGATGACCAACGCCGTCGGATGCAGGATATTGCCGATCGCCTTGGGCGCGGCCTTGACGAAATCGACGCCTGTATAGCACGGACTGGCGTGATGGCGGATGAAATCGc > 1:80596/1‑251 (MQ=255) gATAATCTCCTTGATCAGCAAATTCCACCGCGTGGATTCCTGGCTCTGCTGCGCAAACAATTAATTGTGATGCGTCGCTATATGGCACCGCAACGTGATGTTTATGCTCGTCTTGCCAGTGAACGTTTGCCGTGGATGAGCGATGACCAACGCCGTCGGATGCAGGATATTGCCGATCGCCTTGGGCGCGGCCTTGACGAAATCGACGCCTGTATAGCACGGACTGGCGTGATGGCGGATGAAATCGCTCa < 1:463850/251‑1 (MQ=255) aaTCTCCTTGATCAGCAAATTCCACCGCGTGGATTCCTGGCTCTGCTGCGCAAACAATTAATTGTGATGCGTCGCTATATGGCACCGCAACGTGATGTTTATGCTCGTCTTGCCAGTGAACGTTTGCCGTGGATGAGCGATGACCAACGCCGTCGGATGCAGGATATTGCCGATCGCCTTGGGCGCGGCCTTGACGAAATCGACGCCTGTATAGCACGGACTGGCGTGATGGCGGATGAAATCGCTCAGGt < 1:15823/251‑1 (MQ=255) ccTTGAGCAGCAAATTCCACCGCGTGGATTCCTGGCTCTGCTGCGCAAACAATTAATTGTGATGCGTCGCTATATGGCACCGCAACGTGATGTTTATGCTCGTCTTGCCAGTGAACGTTTGCCGTGGATGAGCGATGACCAACGCCGTCGGATGCAGGATATTGCCGATCGCCTTGGGTGCGGCCTTGACGAAATCGACGCCTGTATAGCACGGACTGGCGTGATGGCGGATGAAATCGCTCAGGTGAt < 2:426240/249‑1 (MQ=255) gCAAATTCCACCGCGTGGATTCCTGGCTCTGCTGCGCAAACAATTAATTGTGATGCGTCGCTATATGGCACCGCAACGTGATGTTTATGCTCGTCTTGGCAGTGAACGTTTGCCGTGGATGAGCGATGACCAACGCCGTCGGATGCAGGATATTGCCGATCGCCTTGGGCGCGGCCTTGACGAAATCGACGCCTGTATAGCACGGACTGGCGTGATGGCGGATGAAATCGCTCAGGTGATGCAGGAAAAtt < 1:274995/251‑1 (MQ=255) cAAATTCCACCGCGTGGATTCCTGGCTCTGCTGCGCAAACAATTAATTGTGATGCTTCGCTATATGGCACCGCAACGTGATGTTTATGCTCGTCTTGCCAGTGAACGTTTGCCGTGGATGAGCGATGACCAACGCCGTCGGATGCAGGATATTGCCGATCGCCTTGGGCGCGGCCTTGACGAAATCGACGCCTGTATAGCACGGACTGGCGTGATGGCGGATGAAATCGCTCAGGTGATGCAGGAAAAttt < 1:232593/251‑1 (MQ=255) cacgacgctcgtcctatctgCTCCGCTGCGCAAACAATGAAGTGTGAGGCGTCGCTATATGGCACCGCAACGTGAGGTTTATGCTCGTCTTGCCAGGGAACGGTTGCCGTGGATGAGCGATGACCAACGCCGTCTGATGCAGGATATTGCCGATCGCCTTGGGCGCGTCCTTGACGAAATCGACGCCTGTATAGCACGGACTTGCGTGATGGCGGATGAAATCGCTCAGGTGATGCAGGAAAAGTTAGCtc < 2:53048/232‑1 (MQ=255) tGGATTCCTGGCTCTGCTGCGCAAACAATTAATTGTGATGCGTCGCTATATGGCACCGCAACGTGATGTTTATGCTCGTCTTGCCAGTGAACGTTTGCCGTGGATGAGCGATGACCAACGCCGTCGGATGCAGGATATTGCCGATCGCCTTGGGCGCGGCCTTGACGAAATCGACGCCTGTATAGCACGGACTGGCGTGATGGCGGATGAAATCGCTCAGGTGATGCAGGAAAATTTAGCTCGTCGTACCt > 1:357558/1‑251 (MQ=255) gCTCTGCTGCGCAAACAATTAATTGTGATGCGTCGCTATATGGCACCGCAACGTGATGTTTATGCTCGTCTTGCCAGTGAACGTTTGCCGTGGATGAGCGATGACCAACGCCGTCGGATGCAGGATATTGCCGATCGCCTTGGGCGCGGCCTTGACGAAATCGACGCCTGTATAGCACGGACTGGCGTGATGGCGGATGAAATCGCTCAGGAGATGCAGGAAAATTTAGCtc > 1:53048/1‑232 (MQ=255) ctgcGCAAACAATTAATTGTGATGCGTCGCTATATGGCACCGCAACGAGAGGTTTATGTTCGTCTTGCCAGTGAACGTTTGCTGGGGATGAACGATGACCAACGCCGTCGGATGCAGGTTAATGCCGATCGCCTTGGGCGAGGCCTTGACGCAATCGAAGCCTGTATAGCACGGACTGGCGTGATGGCGGGTGAAATAGTTCCGGTGATGAAAGTAAAGTTATGTCGGGGTATCTATACAATGACGTTGAt > 1:251501/1‑251 (MQ=255) 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gTCGCTATATGGCACCGCAACGTGATGTTTATGCTCGTCTTGCCAGTGAACGTTTGCCGTGGATGAGCGATGACCACCGCCGTCGGATGCAGGATATTGCCGATCGCCTTGGGCGCGGCCTTGACGAAATCGACGCCTGTATAGCACGGACTGGCGTGATGGCGGATGAAATCGCTCAGGTGATGCAGGAAAATTTAGCTCGTCGTACCTATACAATGTCGTTGATGGCAATGGTCTTTTTACCCAGTAcc > 1:218306/1‑251 (MQ=255) cGCTATATGGCACCGCAACGTGATGTTTATGCTCGTCTTGCCAGTGAACGTTTGCCGTGGATGAGCGATGACCAACGCCGTCGGATGCAGGATATTGCCGATCGCCTTGGGCGCGGCCTTGACGAAATCGACGCCTGTATAGCACGGACTGGCGTGATGGCGGATGAAATCGCTCAGGTGATGCAGGAAAATTTAGCTCGTCGTACCTATACAATGTCGTTGATGGCAATGGTCTTTTTACCCAGTACCtt > 1:277748/1‑251 (MQ=255) cgatgTGATGTGTATGGTGGTCTGGCCAGTGAACGTTTGCCGTGGATGAGGGATGTCCACCTCTGGCGGATGCAGGATCGTGCCGATCGCATTGTGCGCGGCCTTGACGAAATCGACGCCTGTATAGCACGGACTGGCGTGATGGCGGATTAAATCGCTCAGGTTATGCAGGAAAATTTAGCTCGTCGTCCCTACACAATGGCGGTGATGGCAATGGACTTTTTACCCAGTACTTTTCGGACCGGGTTAtt < 2:291554/247‑1 (MQ=255) tGCCAGTGAACGTTTGCCGTGGATGAGCGATGACCAACGCCGTCGGATGCAGGATATTGCCGATCGCCTTGGGCGCGGCCTTGACGAAATCGACGCCTGTATAGCACGGACTGGCGTGATGGCGGATGAAATCGCTCAGGTGATGCAGGAAAATTTAGCTCGGCGTACCTATACAATGTCGTTGATGGCAATGGTCTTTTTACCCAGTACCTTTCTGACCGGGTTATTTGGCGTCAACCTTGGTGGGAt < 1:403126/249‑1 (MQ=255) cAGTGAACGTTTGCCGTGGGTGAGCGATGACCAACGCCGTCGGATGCAGGATATTGCCGATCGCCTTGGGCGCGGCCTTGACGAAATCGACGCATGTATAGCACGGACTGGAGTGATGGCGGATGAAATCGCTCAGGTGATGCAGGCAAATTTAGCTCGTCGTACCTATACAATGTCGTTGATGGCAATGGTTTTTTTACCCAGTTCCTTTCTGACAGGGTTATTGTGCGTCAACCTTTGTGGGATACCTg > 2:444833/1‑251 (MQ=255) gATGACCAACGCCGTCGGATGCAGGATAGTGCCGATCGCCTTGGGCGCGGCCTTGACGAAAGCGACGCCTGTATAGCACGGACTGGCGTGATGGCGGATGAAATCGCTCAGGTGATGCAGGAAAATTTAGCTCGTCGTACCTATACAATGTCGTTGATGGCAATGGTCTTTTTACCCAGTACCTTTCTGACCGGGTTATTTGGCGTCAACCTTGGTGGGATCCCTGGCGGCGGGTGGCAATTCGGATTTTc < 1:450849/251‑1 (MQ=255) tGACCAACGCCGTCGGATGCAGGATATTGCCGCTCGCCTTGGGCGCGGCCTTGACGAAATCGACGCCTGTATAGCACGGACTGGCGTGATGGCGGATGAAATCGCTCAGGTGATGCAGGCAAATTTAGCTCGTCGTACCTATACAATGTCGTTGATGGCAATGGTCTTTTTACCCAGTACCTTTCTGACCGGGTTATTTGGCGTCAACCTTGGGGGGATCCCTGGCGGCGGGGGGCAATTCGGAttttta > 2:177334/1‑248 (MQ=255) gCAGGATATTGGCGATCGCCTTGGGCGCGGCCTGGACGAAATCGACGCCTGTATAGCACGGACTGGCGTGATGGCGGATGAAAGCGCTCAGGTGATGCAGGAAAATTGAGCTCGTCGTTCCTATACAATGTCGTTGATGGCAATGGTCTTTTTACCCAGTACCTTTCTGACCGGGTTATTTGGCGTCAACCTTGGTGGGATCCCTGGCGGCGGGTGGCAATTCGGATTTTCAATTTTTTGTATTCTGTTa < 2:285460/250‑1 (MQ=255) tatTGCCGATCGCCTTGGGCGCGGCCTTGACGAAATCGACGCCTGTATAGCACGGACTGGCGTGATGGCGGATGAAATCGCTCAGGTGATGCAGGAAAATTTAGCTCGTCGTACCTATACAATGTCGTTGATGGCAATGGTCTTTTTACCCAGTACCTTTCTGACCGGGTTa > 1:378708/1‑172 (MQ=255) tatTGCCGATCGCCTTGGGCGCGGCCTTGACGAAATCGACGCCTGTATAGCACGGACTGGCGTGATGGCGGATGAAATCGCTCAGGTGATGCAGGAAAATTTAGCTCGTCGTACCTATACAATGTCGTTGATGGCAATGGTCTTTTTACCCAGTACCTTTCTGACCGGGTTa < 2:378708/172‑1 (MQ=255) aTCGCCTTGGGCGCGGCCTTGACGAAATCGACGCCTGTATAGCACGGACTGGCGTGATGGCGGATGAAATCGCTCAGGTGATGCAGGAAAATTTAGCTCGTCGTACCTATACAATGTCGTTGATGGCAATGGTCTTTTTACCCAGTACCTTTCTGACCGGGTTATTTGGCGTCAACCTTGGTGGGATCCCTGGCGGCGGGGGGCAATTCGGATTTTCAATTTTTTGTATTCTGTTAGTTGTTCTTATtggt > 2:370106/1‑251 (MQ=255) tGGGCGCGGCCTTGACGAAATCGACGCCTGTATAGCACGGACTGGCGTGATGGCGGATGAAATCGCTCAGGTGATGCAGGAAAATTTAGCTCGTCGTACCTATACAATGTCGTTGATGGCAATGGTCTTTTTACCCAGTACCTTTCTGACCGGGTTATTTGGCGTCAACCTTGGTGGGATCCCTGGCGGCGGGTGGCAATTCGGATTTTCAATTTTTTGTATTCTGTTAGTTGTTCTTATTGGTGGTGtt < 1:370106/250‑1 (MQ=255) | GATGCGTTGACCGATCATTCCAGTGAATTTATCGAGCAGCTGCACGATAAAATTATCGACCTTGAAGATAATCTCCTTGATCAGCAAATTCCACCGCGTGGATTCCTGGCTCTGCTGCGCAAACAATTAATTGTGATGCGTCGCTATATGGCACCGCAACGTGATGTTTATGCTCGTCTTGCCAGTGAACGTTTGCCGTGGATGAGCGATGACCAACGCCGTCGGATGCAGGATATTGCCGATCGCCTTGGGCGCGGCCTTGACGAAATCGACGCCTGTATAGCACGGACTGGCGTGATGGCGGATGAAATCGCTCAGGTGATGCAGGAAAATTTAGCTCGTCGTACCTATACAATGTCGTTGATGGCAATGGTCTTTTTACCCAGTACCTTTCTGACCGGGTTATTTGGCGTCAACCTTGGTGGGATCCCTGGCGGCGGGTGGCAATTCGGATTTTCAATTTTTTGTATTCTGTTAGTTGTTCTTATTGGTGGTGTT > NC_000913/1408503‑1409000 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |