| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC JC | NC_000913 | 1,652,623 | IS2 (–) +5 bp | intergenic (+2638/+101) | ydfD → / ← ynfP | lysis protein/protein YnfP |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 1651548 | NA (NA) | 20 (0.780) | 20/486 | 0.3 | 79.7% | noncoding (706/706 nt) | IS2 | repeat region |
| ? | NC_000913 | = 1652627 | 5 (0.200) | intergenic (+2642/+101) | ydfD/ynfP | lysis protein/protein YnfP | |||||
| * | ? | NC_000913 | 1652623 = | 3 (0.120) | 15 (0.590) | 12/484 | 0.9 | 83.0% | intergenic (+2638/+105) | ydfD/ynfP | lysis protein/protein YnfP |
| ? | NC_000913 | = 2070271 | NA (NA) | noncoding (1/1331 nt) | IS2 | repeat region | |||||
CTGAAGTGTCAGCGAGAGTAAAAAATTATGGTGACCATTTTACCGTTGACTCAATAAGGCAGATGTGGGACGCAGCGATAAAACGTGCCGGACTCCGCCATCGAAAATCATATCAGTCGAGACATACTTATGCCTGCTGGTCGCTGACAGCTGGTGCTAACCCGGCATTTATAGCAAACCAGATGGGCCATGCAGATGCGCAAATGGTATTTCAGGTATACGGAAAATGGATGTCTGAAAACAATAATGCACAGGTAGCTTTGTTAAATACACAGTTAAGCGAGTTTGCCCCAACCATGCCCCATAACGAAGCAATGAAAAATTAATTTAATATTTATCAAATAGTTAACACGCATGACTCTTGAAATCCATAAATTCAAGCGCAGTGCCCAGCCATCCCGATACTGCTGCTTTCACCAAATCCTTAGTGCTTCTTTCGTGTTTTTCTATTGTCATAATGGTTATCTCTAAAAAAGAGGTAAGATGCGTAC > NC_000913/1652383‑1652873 | cgcctgagaaatcacttgccggctgccacaccatgttgccgggtaactagtgagaccgtcatccccggttcaaagctctgctgaacaatttcgatcttttcctgtgtggtacgccttctgcgtttctccggccctaagacatcaatcatctgttctccaatgactagtctataaactagtattaagactttcacttatttaagttatattggttttctggagattcagggggccagtctaACAATAATgcc > 2:216789‑M1/241‑250 (MQ=255) aaGTGTCAGCGAGAGTTAAAAATTATGGTGACCATTTTACCGGTGACTCAATAAGGCAGATGTGGGTCGCAGCGATAAAACGTGCCGGACTCCGCTACCGAAAATCATATCAGGTGAGACATACTTATGCCTGCTGGTCGCTGACAGCTGGTGCTAACCCGGCATTTATAGCAAACCAGATGGGCCATGCAGATGCGCAAATGGGATTTCAGGTATGCGGAAAATGGATGTCTGAAAACAATtggatttgc > 1:238395‑M2/1‑242 (MQ=255) aGTGTCAGCGAGAGTAAAAAATTATGGTGACCATTTTACCGTTGACTCAATAAGGCAGATGTGGGACGCAGCGATAAAACGTGCCGGACTCCGCCATCGAAAATCATATCAGTCGAGACATACTTATGCCTGCTGGTCGCTGACAGCTGGTGCTAACCCGGCATTTATAGCAAACCAGATGGGCCATGCAGATGCGCAAATGGTATTTCAGGTATACGGAAAATGGATGTCTGAAAACAATAATGCACAgg < 2:57827/251‑1 (MQ=255) tgtCAGCGAGAGTAAAACATTATGGAGACCATTTTACCGTTGACTCAATAAGGCAGATGAGGGACGCAGCGATAAAACGTGCCGGACTCCGCAATCGAAAATCATATCAGTCGAGACATACTTATGCCTGATGGTCGCTGACAGCTGGTGCTAACCCGGCATTTATAGCAAACCAGATGGGCAATGCAGATGCGCAAATGGTATTTCAGGGATACGGAAAATGGCTGTAGGAAAACAATtggatttgcccc < 2:53126‑M2/251‑13 (MQ=255) aaataactggctggctgctacaccatgttgccgggcaacgagggagaccgtcatccccggttcaaagctctgctgaacaattgcgatcttttcctgtgtggtacgccgtctgcgtttctccggccctaagacatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaACAATAATGCACAGGTAGc > 1:79729‑M1/233‑251 (MQ=255) cAGCGAGAGTAAAAAATTATGGTGACCATTTTACCGTTGACTCAATAAGGCAGATGTGGGACGCAGCGATAAAACGTGCCGGACTCCGCCATCGAAAATCATATCAGTCGAGACATACTTATGCCTGCTGGTCGCTGACAGCTGGTGCTAACCCGGCATTTATAGCAAACCAGATGGGCCATGCAGATGCGCAAATGGTATTTCAGGTATACGGAAAATGGATGTCTGAAAACAATtggatttgcccctat < 1:24987‑M2/251‑16 (MQ=255) atcgagaggtaaaaaTTATGGTGACCATTTTACCGTTGACTCAATAAGGCAGATGTGGGACTCAGCGATAAAACGGGCCGGACTCCACCATCGAAAATCATATCAGGCGAGTCATACTTATGCCTGCTGGTCGCTGACAGCTGGTGATAACCCGGCATTTATAGCAAACCAGATGGGCCATGCAGATGCGCAAATGGTATTTCAGGTATACGGAAAATGGATGTCTGAAAACAATAATGCACAGGTAGCtt < 2:128534/241‑1 (MQ=255) gTAAAAAATTATGGTGACCATTTTACCGTTGACTCAATAAGGCAGATGTGGGACGCAGCGATAAAACGTGCCGGACTCCGCCATCGAAAATCATATCAGTCGAGACATACTTATGCCTGCTGGTCGCTGACAGCTGGTGCTAACCCGGCATTTATAGCAAACCAGATGGGCCATGCAGATGCGCAAATGGTATTTCAGGTATACGGAAAATGGATGTCTGAAAACAATtggctttgcccctatatttcca < 2:4137‑M2/250‑23 (MQ=255) aaTTATGGTGACCATTTTACCGTTGACTCAATAAGGCAGATGTGGGACGCAGCGATAAAACGTGCCGGACTCCGCCATCGAAAATCATATCAGTCGAGACATACTTATGCCTGCTGGTCGCTGACAGCTGGTGCTAACCCGGCATTTATAGCAAACCAGATGGGCCATGCAGATGCGCAAATGGTATTTCAGGTATACGGAAAATGGATGTCTGAAAACAATtggatttgcccctatatttccagacatct > 1:205919‑M2/1‑222 (MQ=255) ggTGACCATTTTACCGTTGACTCAATAAGGCAGATGTGGGACGCAGCGATAAAACGTGCCGGACTCCGCCATCGAAAATCATATCAGTCGCGACATACTTATGCCTGCTGGTCGCTGACAGCTGGTGCTAACCCGGCATTTATAGCAAACCAGATGGGCCATGCAGATGCGCAAATGGTATTTCAGGTATACGGAAAATGGATTTTTGAAAACAATtggttttgcccctatctttccagacatctgttctc < 2:2900‑M2/251‑36 (MQ=255) 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tgtgtggtacgccgtctgcgtttctccggccctaagacatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaACAATAATGCACAGGTAGCTTTGTTAAATACACAGTTAAGCGAGTTTGCCCCAACCATGCCCCATAACGAAGCAATGaaa > 2:86590‑M1/139‑218 (MQ=255) tgtgtggtacgccgtctgcgtttctccggacctaagacatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaACAATAATGCACAGGTAGCTTTGTTAAATACACAGTTAAGCGAGTTTGCCCCAACCATGCCCCATAACGAAGCAATGaaa < 1:86590‑M1/80‑1 (MQ=255) atCAGTCGATACATACTTAGTCCTGCTGGTCGCTGACAGCTGGTGCTAACCCGGCATTTATAGCAAACAAGATGGGCCATGCAGATGCGCAAATGGTATTTCAGGTATACGGAAAATGGATGTCTGAAAACTATtggatttgccccgatatttccagacagctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataatccagcgcactatgcggatgccattcgtta > 2:97548‑M2/1‑134 (MQ=255) ccgtctgcgtttctccggccctaagacatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaACAATAATGCACAGGTAGCTTTGTTAAATACACAGTTAAGCGAGTTTGCCCCAACCATGCCCCATAACGAAg > 1:31433‑M1/128‑199 (MQ=255) ccgtctgcgtttctccggccctaagacatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaACAATAATGCACAGGTAGCTTTGTTAAATACACAGTTAAGCGAGTTTGCCCCAACCATGCCCCATAACGAAg < 2:31433‑M1/72‑1 (MQ=255) gTCGAGACATACTTATGCCTGCTGGTCGCTGACAGCTGGTGCTAACCCGGCATTTATAGCAAACCAGATGGGCCATGCAGATGCGCAAATGGTATTTCAGGTATACGGAAAATGGATGTCTGAAAACAATAATGCACAGGTAGCTTTGTTAAATACACAGTGAAGCGAGTTTGCCCCAACCATGCCCCATAACGAAGCAATGAAAAATTAATTTAATATTTATCAAATAGTTATCACGCATGACTCTTGaa < 1:123112/251‑1 (MQ=255) ttATGCCTGCTGGTCGCTGACAGCTGGTTCTAACCCGGCATTTATAGCAAACCCGATGGGCCATGCAGATGCGCAAATGGTATTTCAGGAATACGGAAAATGGCTGTCTGAAAACAATgggatttgcccctatatttccagacatctattatcacttaacccattacaagccagctgccgccgtacttcccggggcgagagataacccagcgcaatctgcggataccactcgttctaatgctcgaacgccc < 2:101266‑M2/251‑134 (MQ=255) 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gCTGGTGCTAACCCGGCATTTATAGCAAACCAGATGGGCCATGCAGATGCGCAAATGGTATTTCAGGTATACGGAAAATGGATGTCTGAAAACAATtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccagcgcactatgcggatgccattcgttataatgctcgaacgcctctgcaaggttctttgctgccgt < 2:105811‑M2/251‑156 (MQ=255) gttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagagtcagggggccagtctaACAATAATGCACAGGTAGCTTTGTTAAATACACAGTTAAGCGAGTTTGCCCCAACCATGCCCCATAACGAAGCAATGAAAAATTAATTTAATATTTATCAAATAGTTAACACGCATGACTCTTGAAATCCATAAATTCAAGCGCAGTGCCCAGCCATccc > 1:116915‑M1/90‑249 (MQ=255) ggCCATGCAGATGCGCAAATGGTATTTCAGGTATACGGAAAATGGATGTCTGAAAACAATtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaaaccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccagcgcactatgcggatgccattcgttataatgctcgaacgcctctgcaaggttctttgctgccgttaacccgtctggtttgggcatgatactgatgtagtc < 1:87869‑M2/251‑192 (MQ=255) 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gAAAACAATtggctttgaccctatatttccagaaatctgttatcacttaacccattacaagcccgctaccgcagatattcacgtggcgagcgataccccagcgcactatgcggatcccattcgttataatgctcgaacgcctctgcaaggttctttgctgccgttatcccgtctggtttgggcatgttactgatgtagtcacgctttatcgttttcacgaagctctctgctattccgttactctcaggact < 2:108146‑M2/251‑243 (MQ=255) aaaCAATtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccagcgcactatgcggatgccattcgttataatgctcgaacgcctctgcaaggttctttgctgccgttaacccgtctggtttgggcatgatactgatgtagtcacgctttatcgttttcacgaagctctctgctattccgttactctccggactcc > 1:105811‑M2/1‑7 (MQ=255) aaCAATAATGCACAGGTAGCTTTGTTAAATACACAGTTAAGCGAGTTTGCCCCAACCATGCCCCATAACGAAGCAATGAAAAATTAATTTAATATTTATCAAATAGTTAACACGCATGACTCTTGAAATCCATAAATTCAAGCGCAGTGCCCAGCCATCCCGATACTGCTGCTTTCACCAAATCCTTAGTGCTTCTTTCGTGTTTTTCTATTGTCATAATGGTTATCTCTAAAAAAGAGGTAAGATGCGt < 1:85794/250‑1 (MQ=255) cAATtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccagcgcactatgcggatgccattcgttataatgctcgaacgcctctgcaaggttctttgctgccgttaacccgtctggtttgggcatgatactgatgtagtcacgctttatcgttttcacgaagctctctgctattccgttactctccggactccgc < 1:108844‑M2/250‑247 (MQ=255) | CTGAAGTGTCAGCGAGAGTAAAAAATTATGGTGACCATTTTACCGTTGACTCAATAAGGCAGATGTGGGACGCAGCGATAAAACGTGCCGGACTCCGCCATCGAAAATCATATCAGTCGAGACATACTTATGCCTGCTGGTCGCTGACAGCTGGTGCTAACCCGGCATTTATAGCAAACCAGATGGGCCATGCAGATGCGCAAATGGTATTTCAGGTATACGGAAAATGGATGTCTGAAAACAATAATGCACAGGTAGCTTTGTTAAATACACAGTTAAGCGAGTTTGCCCCAACCATGCCCCATAACGAAGCAATGAAAAATTAATTTAATATTTATCAAATAGTTAACACGCATGACTCTTGAAATCCATAAATTCAAGCGCAGTGCCCAGCCATCCCGATACTGCTGCTTTCACCAAATCCTTAGTGCTTCTTTCGTGTTTTTCTATTGTCATAATGGTTATCTCTAAAAAAGAGGTAAGATGCGTAC > NC_000913/1652383‑1652873 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |