| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 256107 | 58 (1.850) | 19 (0.630) | 18/464 | 0.7 | 26.4% | coding (131/459 nt) | gpt | xanthine‑guanine phsophoribosyltransferase |
| ? | NC_000913 | 371382 = | 50 (1.650) | coding (144/867 nt) | mhpC | 2‑hydroxy‑6‑ketonona‑2,4‑dienedioate hydrolase | |||||
CAACTGGCGTAGCGAAGGGCGTTATTACCGCCCAATCCCGGAGTGGATTGCCGGATTTGGCTCGTTAAGCGCCAGAACAGAGAACTGAATATGCAGGAGAAGATGATGAGTTATCAGCCACAAACCGAAGCCGCCACCAGCCGTTTTCTGAATGTAGAAGAAGCGGGTAAAACGCTGCGCATCCATTTTAATGACTGCGGACAAGGCGACGAAACCGTTGTCCTGCTGCATGGTTCCGGCCCGGGTGCTACTGGCTGGGCGAACTTCAGCCGCAATATCGATCCGCTGGTAGAGGCGGGCTATC‑GGGTGATCCTGCT‑GGATTGTCCGGGTTGGGGCAAGAGCGATTCGGTCGTTAATAGTGGTTCGCGATCGGATCTTAATGCACGAATCCTGAAAAGCGTGGTGGATCAACTGGATATCGCCAAAATCCACCTGCTGGGCAACTCGATGGGGGGCCATAGTTCTGTGGCGTTCACCCTTAA > NC_000913/371134‑371615 | cAACGGGCGTTGCGAAGGGATGTATTACCGCCCTACCCTGGAGTGGATTGCCGGATTTGGCTCGTTAAGCGCCAGAAAAGAGAACTGAATAGGCAGGAGAAGAGGATGAGTTATCAGCCACACACCGAAGCCGCCACCAGCCGTTTTCTGAATGTAGAAGAAGCGGGTAAAACGCTGCGCTTCCATTTTATTGACTGCGGAGAAGGCTACGAAACCGTTGTCCTGCTGCATGGTTCCGGCCCGGGTGCttc < 2:18113/251‑3 (MQ=255) 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acatggCGACGAAACCGTTGTCCGGCTGCATGGGTCCGGCCCGGGTGCTACGGGCTGGGCGAACTTCAGCCGCAATATCGATCCGCTGGTAGAGGCGGGCTATT‑GGGTGATCCTGCT‑GGATTGTCCGGGTTGGGGCAAGAGCGATTCGGTCGTTAATAGTGGTTCGCGATCGGATCTTAATGCACGAATCCTGAAAAGCGTGGTTGATCAACTGGAGATCGCCAAAATCCACCTGCTGGGCAACTCGATgg < 2:31368/247‑1 (MQ=255) gaAACCGTTGTCCTGCTGCATGGTTCCGGCCCGGGTGCTACTGGCTGGGCGAACTTCAGCCGCAATATCGATCCGCTGGTAGAGGCGGGCTATC‑GGGTGATCCTGCT‑GGATTGTCCGGGTTGGGGCAAGAGCGATTCGGTCGTTAATAGTGGTTCGCGATCGGATCTTAATGCACGAATCCTGAAAAGCGTGGTGGATCAACTGGATATCGCCAAAATCCACCTGCTGGGCAACTCGATGGGGGGCCATAg < 1:210310/251‑1 (MQ=255) aaCCGTTGTTCGGCTGCATGGTCCCGGCCTGGGTGCTACTGGCTGGGCGAACTTCAGCCGCAATATCGATCCGCTGGTAGATGCGGGCTATC‑GGGTTATCCTGCT‑GGATTGTCCGGTTTGGGGCATGTGCGATTCGGTCGTTAAGAGTGGTTCGCGATCGGATCTTAATGCACGAATCCTGAAAAGCGTGGTGGATCAACTGGATATCGCCAAAATCCACCTGCTGGGCAACTCGATGGGGGGCCATAGtt < 1:338192/251‑1 (MQ=255) ccGTTGTCCTGCTGCATGGTTCCGGCCCGGGTGCTACTGGCTGGGCGAACTTCAGCCGCAATATCGATCCGCTGGTAGAGGCGGGCTATC‑GGGTGATCCTGCT‑GGATTGTCCGGGTTGGGGCAAGAGCGAt < 1:64654/131‑1 (MQ=255) gTTGTCCTGCTGCATGGTTCCGGCCCGGGTGCTACTGGCTGGGCGAACTTCAGCCGCAATATCGATCCGCTGGTAGAGGCGGGCTATC‑GGGTGATCCTGCT‑GGATTGTCCGGGTTGGGGCAAGAGCGATTCGGTCGTTAATAGTGGTTCGCGATCGGATCTTAATGCACGAATCCTGAAAAGCGTGGTGGATCAACTGGATATCGCCAAAATCCACCTGCTGGGCAACTCGATGGGGGGCCATAGTTCtgt < 1:172604/251‑1 (MQ=255) gTCCTGCTGCATGGTTCCGGCCCGGGTGCTACGGGCTGGGCGAACTTCAGCCGCAATATCGATCCGCTGGTAGGGGCGGGCTATC‑GGGTGATCCTGCT‑GGATTGTCCGGGTTGGGGCAAGAGCGATTCGGTCGTTAATAGTGGTTCGCGATCGGATCTTAATGCACGAATCCTGAAAAGCGTGGTGGATCAACTGGATATCGCCAAAATCCACCTGCTGGGCAACTCGATGGGGGGCCATAGTTCtgtgt < 2:72994/250‑2 (MQ=255) tggcggtctggtaccgggtgcTACTGGCTGGGCGAACTTCAGCCGCAATATCGATCCGCTGGTAGAGGCGGGCTATC‑GGGTGATCCTGCT‑GGATTGTCCGGGt < 1:312169‑M2/82‑1 (MQ=255) cATGGTTCCGGCCCGGGTGCTACTGGCTGGGCGAACTTCAGCCGCAATATCGATCCGCTGGTAGAGGCGGGCTATC‑GGGTGATCCTGCT‑GGATTGTCCGGGTTGGGGCAAGAGCGATTCGGTCGTTAATAGTGGTTCGCGATCGGATCTTAATGCACGAATCCTGAAAAGCGTGGTGGATCAACTGGATATCGCCAAAATCCACCTGCTGGGCAACTCGATGGGGGGCCATAGTTCTGTGGCGTTCACCCt < 1:107492/251‑1 (MQ=255) ggtctggtaccgggtgcTACTGGCTGGGCGAACTTCAGCCGCAATATCGATCCGCTGGTAGAGGCGGGCTATC‑GGGTGATCCTGCT‑GGATTGTCCGGGTTGGGGCAAGAGCGATTCGGTCGTTAATAGTGGTTCGCGATCGGATCTTAATGCACGAATCCTGAAAAGCGTGGTGGATCAACTGGATATCGCCAAAATCCACCTGCTGGGCAACTCGATGGGGGGCCATAGTTCTGTGGCGTTCACCCTTaa < 1:5426‑M2/234‑1 (MQ=255) ggtctggtaccGGGTGCTACTGGCTGGGCGAACTTCAGCCGCAATATCGATCCGCTGGTAGAGGCGGGCTATC‑GGGTGATCCTGCT‑GGGTTGTCCGGGTTGGGGCAAGAGGGATTCGGGCGTTAAAAGTGGTTCGCGATCGGGTCTTAAAGCACGGATCCTGAAAAGCGTGGGGGGTCAAATGGATATCGCCAAAATACACACGCTGGGGAAATCGGTGGGGGGGCAAAGTTCTGTGGGGttaccactta > 2:323883/10‑242 (MQ=255) ggtaccgggtgcTACTGGCTGGGCGAACTTCAGCCGCAATATCGATCCGCTGGTAGAGGCGGGCTATC‑GGGTGATCCTGCT‑GGATTTTCCGGGTTGGGGCAAGAGCGATTCGGTCGTTAATAGTGGTTCGCGATc > 1:142243‑M2/13‑135 (MQ=255) ggtaccgggtgcTACTGGCTGGGCGAACTTCAGCCGCAATATCGATCCGCTGGTAGAGGCGGGCTATC‑GGGTGATCCTGCT‑GGATTGTCCGGGTTGGGGCAAGAGCGATTCGGTCGTTAATAGTGGTTCGCGATc < 2:142243‑M2/123‑1 (MQ=255) ggCCCGGGTGCTACTGGCTGGGCGAACTTCAGCCGCAATATCGATCCGCTGGTAGAGGCGGGCTATC‑GGGTGATCCTGCT‑GGATTGTCCGGGTTGGGGCAAGAGCGATTCGGTCGTTAAt < 1:2380/120‑1 (MQ=255) ggCCCGGGTGCTACTGGCTGGGCGAACTTCAGCCGCAATATCGATCCGCTGGTAGAGGCGGGCTATC‑GGGTGATCCTGCT‑GGATTGTCCGGGTTGGGGCAAGAGCGATTCGGTCGTTAATAGTGGTTCGCGATCGGATc > 1:118883/1‑139 (MQ=255) ggCCCGGGTGCGACTGGCTGGGCGAACTTCAGCCGCAATATCGATCCGCTGGTAGAGGCGGGCTATC‑GGGTGATCCTGCT‑GGATTGTCCGGGTTGGGGCAAGAGCGATTCGGTCGTTAATAGTGGTTCGCGATCGGATc < 2:118883/139‑1 (MQ=255) gTGCTACTGGCTGGGCTAACTTCAGCCGCAATATCGATCCGCTGGTAGAGGCGGGCTATC‑GGGTGATCCTGCT‑GGATTGTCCGGGTTGGGGCAAGAGCGATTCGGTCGTTAATAGTGGGTCGCGATCGGATCTTAATGCACGAATCCTGAAAAGCGTGGTGGATCAACTGGATATc < 2:17115/176‑1 (MQ=255) | CAACTGGCGTAGCGAAGGGCGTTATTACCGCCCAATCCCGGAGTGGATTGCCGGATTTGGCTCGTTAAGCGCCAGAACAGAGAACTGAATATGCAGGAGAAGATGATGAGTTATCAGCCACAAACCGAAGCCGCCACCAGCCGTTTTCTGAATGTAGAAGAAGCGGGTAAAACGCTGCGCATCCATTTTAATGACTGCGGACAAGGCGACGAAACCGTTGTCCTGCTGCATGGTTCCGGCCCGGGTGCTACTGGCTGGGCGAACTTCAGCCGCAATATCGATCCGCTGGTAGAGGCGGGCTATC‑GGGTGATCCTGCT‑GGATTGTCCGGGTTGGGGCAAGAGCGATTCGGTCGTTAATAGTGGTTCGCGATCGGATCTTAATGCACGAATCCTGAAAAGCGTGGTGGATCAACTGGATATCGCCAAAATCCACCTGCTGGGCAACTCGATGGGGGGCCATAGTTCTGTGGCGTTCACCCTTAA > NC_000913/371134‑371615 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |