| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 2,866,959 | A→C | I198S (ATC→AGC) | rpoS ← | RNA polymerase sigma factor RpoS |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 2,866,959 | 0 | A | C | 95.2% | 118.4 / ‑5.3 | 42 | I198S (ATC→AGC) | rpoS | RNA polymerase sigma factor RpoS |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (2/0); new base C (18/22); total (20/22) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.21e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.63e-01 | |||||||||||
GAATCGACGTGCCAGCACTTCACGCTGTTTGGCGTTCAGCTCGAACAGCCATTTGACGATGCTCTGCTTCATATCGTCATCTTGCGTGGTATCTTCCGGACCGTTCTCTTTTTCATCGGCCAGGATGTCCAGCAACGCTTTTTCGGAATCACCACCCAGCGGGGTGTCTACCGAGGTAATGCGCTCGTTAAGACGAAGCATACGGCTGACGTCATCAACTGGCTTATCCAGTTGCTCTGCGATCTCTTCCGCAC‑TTGGTTCATGGTCCAGCTTATGGGACAACTCACGTG‑CGGTTCGCAGGTAAACGTTCAGCTCCTTTACGATGTGAATCGGCAAACGAATAGTACGGGTTTGGTTCATAATCGCCCGTTCAATCGTCTGGCGAATCCACCAGGTTGCGTATGTTGAGAAGCGGAAACCACGTTCCGGGTCAAACTTCTCTACCGCGCGGATCAGCCCCAGGTTGCCCTCTTCGATAAGGTC > NC_000913/2866718‑2867200 | gAATCGACGTGCCAGCACTTCACGCTGTTTGGCGTTCAGCTCGAACAGCCATTTGACGATGCTCTGCTTCATATCGTCATCTTGCGTGGTATCTTCCGGACCGTTCTCTTTTTCATCGGCCAGGATGTCCAGCAACGCTTTTTCGGAATCACCACCCAGCGGGGTGTCTACCGAGGTAATGCGCTCGTTAAGACGAAGCATACGGCTGACGTCATCAACTGGCTTATCCAGTTGCTCTGCGCTCTCTTCCg > 1:445313/1‑251 (MQ=255) cAGCACTTCACGCTGTTTGGCGTTCAGCTCGAACAGCCATTTGACGATGCTCTGCTTCATATCGTCATCTTGCGTGGTATCTTCCGGACCGTGCTCTTTTTCATCGGCCAGGATGTCCAGCAACGCTTTTTCGGAATCACCACCCAGCGGGGTGTCTACCGAGGTAATGCGCTCGTTAAGACGAAGCATACGGCTGACGTCATCAACTGGCTTATCCAGTTGCTCTGCGCTCTCTTCCGCAC‑TTGGTTCAt < 1:68941/251‑1 (MQ=255) ccTTCACGCTGTTTGGCGTTCAGCTCGAACAGCCATTTGACGATGCTCTGCTTCATATCGTCATCTTGCGTGGTATCTTCCGGACCGTTCTCTTTTTCATCGGCCAGGATGTCCAGCAACGCTTTTTCGGAATCACCACCCAGCGGGGTGTCTACCGAGGTAATGCGCTCGTTAAGACGAAGCATACGGCTGACGTCATCAACTGGCTTATCCAGTTGCTCTGCGCTCTCTTCCGCAC‑TTGGTTCATGGTc < 1:28202/250‑1 (MQ=255) aCGCTGTTTTGCGTTCAGCACGAACACCCATTTGACGATGATCTGCTTCATCTCGTCATCTTGCGTGGAATCTTCCGGCCCGTTCTCTTTTTCATCGGCCAGGATGACCATCAACGCTTTTTCGGAATCACCACCCAGCGGGGAGTCTACCGAGGTAATGCGCTCGTTAAGCCGAAGCATATGGATGACGCCATCACCTGGCCTATCCAGTTACCCTGCGCTCTCTTCCGCAC‑TGGGTTCCTGGTCCAGCt > 2:277918/1‑251 (MQ=255) cGCTGTTTGGCGTTCAGCTCGAACAGCCATTTGACGATGCTCTGCTTCATATCGTCATCTTGCGTGGTATCTTCCGGACCGTTCTCTTTTTCATCGGCCAGGATGTCCAGCAACGCTTTTTCGGAATCACCACCCAGCGGGGTGTCTACCGAGGTAATGCGCTCGTTAAGACGAAGCATACGGCTGACGTCATCAACTGGCTTATCCAGTTGCTCTGCGCTCTCTTCCGCAC‑TTGGTTCATGGTCCAGCtt < 1:86880/251‑1 (MQ=255) tGGCGTTCAGCTCGAACAGCCATTTGACGATGCTCTGCTTCATATCGTCATCTTGCGTGGTATCTTCCGGACCGTTCTCTTTTTCATCGGCCAGGATGTCCAGCAACGCTTTTTCGGAATCACCACCCAGCGGGGTGTCTACCGAGGTAATGCGCTCGTTAAGACGAAGCATACGGCTGACGTCATCAACTGGCTTATCCAGTTGCTCTGCGCTCTCTTCCGCAC‑TTGGTTCATGGTCCAGCTTATGGGAc > 2:122182/1‑251 (MQ=255) cGTTCAGCTCGAACAGCCATTTGACGATGCTCTGCTTCATATCGTCATCTTGCGTGGTATCTTCCGGACCGTTCTCTTTTTCATCGGCCAGGATGTCCAGCAACGCTTTTTCGGAATCACCACCCAGCGGGGTGTCTACCGAGGTAATGCGCTCGTTAAGACGAAGCATACGGCTGACGTCATCAACTGGCTTATCCAGTTGCTCTGCGCTCTCTTCCGCAC‑TTGGTTCATGGTCCAGCTTATGGGACAAc > 1:216184/1‑251 (MQ=255) ctagAACAGCCATTTGACGATGCTCTGCTTCATATCGTCATCTTGCGTGGTATCTTCCGGACCGTTCTATTTTTCATCGACCAGGATGTCCAGCAACGCTTTTTCGGAATCAAAACACAGCGGGGTGTCTACCGAGGTAATGCGCTCGTTAAGACGAAGCATACGTCTGACGTCATCACAGGGTTTATCCCGTTCCTCTGAGCTCTCTTCCGCGC‑TTGATTTATGTTCCAGCTTAAGGCACAACTAACGTg > 2:363351/4‑251 (MQ=255) cTCGAACAGCCATTTGACGATGCTCTGCTTCATATCGTCATCTTGCGTGGTATCTTCCGGACCGTTCTCTTTTTCATCGGCCAGGATGTCCAGCAACGCTTTTTCGGAATCACCACCCAGCGGGGTGTCTACCGAGGTAATGCGCTCGTTAAGACGAAGCATACGGCTGACGTCATCAACTGGCTTATCCAGTTGCTCTGCGCTCTCTTCCGCAC‑TTGGTTCATGGTCCAGCTTATGGGACAACTCACGTg > 1:2537/1‑251 (MQ=255) ccgCCATTTGACGATGCTCTGCTTCATATCGTCATCTTGCGTGGTATCTTCCGGACCGTTCTCTTTTTCATCGGCCAGGATGTACAGCAACGCTTTTTCGGAATCACCACCCAGCGGGGTGTCTACCGAGGTAATGCGCTCGTTAAGACGCAGCATACGGCTGACGTCATCAACTGGCTTATCCAGTTGCTCTGCGCTCTCTTCCGCAC‑TTGGATCATGGTCCTGCTTATGGGTCAACTAACGTG‑CGATTc > 2:334995/3‑251 (MQ=255) cAGCCATTTGACGATGCTCTGCTTCATATCGTCATCTTGCGTGGTATCTTCCGGACCGTTCTCTTTTTCATCGGCCAGGATGTCCAGCAACGCTTTTTCGGAATCACCACCCAGCGGGGTGTCTACCGAGGTAATGCGCTCGTTAAGACGAAGCATACGGCTGACGTCATCAACTGGCTTATCCAGTTGCTCTGCGCTCTCTTCCGCAC‑TTGGTTCATGGTCCAGCTTATGGGACAACTCACGTG‑CGGTTc > 1:207240/1‑251 (MQ=255) gCCATTTAACGATGCTCTGCTTCATATCGTAATCTTGCGTGGTATCTTCCGGACCGTTCTCTTTTTCATCGGCCAGGATGTCCAGCAACGCTTTTTCGGAATCACCACCCCGCGGGGTGTCTCCCGAGGTAATGCGCTCGTTAAGACGAAACATACGGCTGACGCCATCAAATGGCTTATCCAGGTGCTCTACGATCTCTTCCG‑ACATTGGTTCATGGTCCACCTTTTGGGACAACTCAAGTG‑CGGttagc > 2:175651/1‑248 (MQ=255) tGCTCTGCTTCATATCGTCATCTTGCGTGGTATCTTCCGGACCGTTCTCTTTTTCATCGGCCAGGATGTCCAGCAACGCTTTTTCGGAATCACCACCCAGCGGGGTGTCTACCGAGGTAATGCGCTCGTTAAGACGAAGCATACGGCTGACGTCATCAACTGGCTTATCCAGTTGCTCTGCGCTCTCTTCCGCAC‑TTGGTTCATGGTCCAGCTTATGGGACAACTCACGTG‑CGGTTCGCAGGTAAACGtt > 1:338493/1‑250 (MQ=255) ctGCTTCATATCGTCATCTTGCGTGGTATCTTCCGGACCGTTCTCTTTTTCATCGGCCAGGATGTCCAGCAACGCTTTTTCGGAATCACCACCCAGCGGGGTGTCTACCGAGGTAATGCGCTCGTTAAGACGAAGCATACGGCTGACGTCATCAACTGGCTTATCCAGTTGCTCTGCGCTCTCTTCCGCAC‑TTGGTTCATGGTCCAGCTTATGGGACAACTCACGTG‑CGGTTCGCAGGTAAACGTTCAGCt > 1:383077/1‑251 (MQ=255) cATATCGTCATCTTGCGTGGTATCTTCCGGACCGTTCTCTTTTTCATCGGCCAGGATGTCCAGCAACGCTTTTTCGGAATCACCACCCAGCGGGGTGTCTACCGAGGTAATGCGCTCGTTAAGACGAAGCATACGGCTGACGTCATCAACTGGCTTATCCAGTTGCTCTGCGCTCTCTTCCGCAC‑TTGGTTCATGGTCCAGCTTATGGGACAACTCACGTG‑CGGTTCGCAGGTAAACGTTCAGCTCCttt < 2:5476/250‑1 (MQ=255) cATATCGTCATCTTGCGTGGTATCTTCCGGACCGTTCTCTTTTTCATCGGCCAGGATGTCCAGCAACGCTTTTTCGGAATCACCACCCAGCGGGGTGTCTACCGAGGTAATGCGCTCGTTAAGACGAAGCATACGGCTGACGTCATCAACTGGCTTATCCAGTTGCTCTGCGCTCTCTTCCGCAC‑TTGGTTCATGGTCCAGCTTATGGGACAACTCACGTG‑CGGTTCGCAGGTAAACGTTCAGCTCCTTTa < 1:266158/251‑1 (MQ=255) gcGTCATCTTGCGTGGAATCTTCCGGACCGTTCTCTTTTTCATCGGCCAGGATGTCCAGCAACGCTTTTTCGGAATCACCACCCAGCGGGGTGTCTACCGAGGTAATGCGCTCGTTAAGACGAAGCATACGGCTGACGTCATCAACTGGCTTATCCAGTTGCTCTGCGCTCTCTTCCGCGC‑TTGGTTCATGGTCCAGCTTATGGGACAACTCACGTG‑CGGTTCGCAGGTAAACGTTCAGCTCCTTTACGAt < 1:396268/250‑1 (MQ=255) cgccATCTTGTGTGGTATCTTCCGGACCGTTCTCTTTTCCATCGGCCAGGCTGTCCAGCAACGCTTTTTCGGAATCACCACCCAGCGGGGTGTCTACCGAGGTAATTCGCTCGTTAAGACGAAGCATACGGCTGACGTCATCAACTGGCTTATCCAGTTGCTCTGCGCTCTCTTCCGCAC‑TTGGTTCATGGTCCAGCTTATGGGACAACTCACGTG‑CGGTTCGCAGGTAAACGTTCAGCTCCTTTACGAtg < 2:9985/248‑1 (MQ=255) ttGCGTGGTATCTTCCGGACCGTTCTCTTTTTCATCGGCCAGGATGTCCAGCAACGCTTTTTCGGAATCACCACCCAGCGGGGTGTCTACCGAGGTAATGCGCTCGTTAAGACGAAGCATACGGCTGACGTCATCAACTGGCTTATCCAGTTGCTCTGCGCTCTCTTCCGCAC‑TTGGTTCATGGTCCAGCTTATGGGACAACTCACGTG‑CGGTTCGCAGGTAAACGTTCAGCTCCTTTACGATGTGAATCg > 1:313687/1‑251 (MQ=255) cGTGGTATCTTCCGGACCGTTCTCTTTTTCATCGGCCCGCATGTCCAGCAACGCTTTTTCGGAATCACCACCCAGCGGGGTGTCTACCGAGGTAATGCGCTCGTTAAGACGAAGCATACGGCTGCCGTCATCAACTGGCTTATCCAGTTGCTCTGCGATCTCTTCCGCAC‑TTGGTTCATGGTCCAGCTTATGGGACAACTCACGTG‑CGGTTCGCAGGTAAACGTTCAGCTCCTTTAAGATGTGAATCGGc > 2:229405/1‑250 (MQ=255) gTGGTATCTTCCGGACCGTTCTCTTTTTCATCGGCCAGGATGTCCAGCAACGCTTTTTCGGAATCACCACCCAGCGGGGTGTCTACCGAGGTAATGCGCTCGTTAAGACGAAGCATACGGCTGACGTCATCAACTGGCTTATCCAGTTGCTCTGCGCTCGCTTCCGCAC‑TTGGTTCATGGTCCAGCTTATGGGACAACTCACGTG‑CGGTTCGCAGGTAAACGTTCAGCTCCTTTACGATGTGAATCGGCaa < 1:26547/251‑1 (MQ=255) gTATCTTCCGGACCGTTCTCTTTTTCATAGGCCAGGATGTCCAGCAACGCTTTTACGGAATCACCCCCCAGCGGGGTGTCTACCGAGGTAATGCGCTCGTTAAGACGAAGCATACGGCTGACGTCATCAACTGGCTTATCCAGTTGCTCTGCGCTCTCTTCCGCAC‑TTGGTTCATGGTCCAGCTTATGGGACAACTCACGTG‑CGGTTCGCAGGTAAACGTTCAGCTCCTTTACGATGTGAATCGGCAAACg < 2:86047/251‑1 (MQ=255) tATCTTCCGGACCGTTCTCTTTTTCATAGGCCAGGGTGTCCAGCAACGCTTTTTCGGAATCACCACCCAGCGGGGTGTCTACCGAGGTAATGCGCTCGTTAAGACGAAGCATACGGCTGACGCCATCAACTTGCTCATCCAGTTGATCTGCGCTCTCTTCCGCAC‑TATGATCACTGTCCAGATTCTGGGACAACTC‑CCTGTCGGTTAGCACGTAAAAGTTCAGTCCCTTTActctaggaatcggcacacg > 2:354318/1‑232 (MQ=255) ttttCATCGGCCAGGATGTCCAGCAACGCTTTTTCGGAATCACCACCCAGCGGGGTGTCTACCGAGGTAATGCGCTCGTTAAGACGAAGCATACGGCTGACGTCATCAACTGGCTTATCCAGTTGCTCTGCGCTCTCTTCCGCAC‑TTGGTTCATGGTCCAGCTTATGGGACAACTCACGTG‑CGGTTCGCAGGTAAACGTTCAGCTCCTTTACGATGTGAATCGGCAAACGAATAGTACGGGTTTGGtt < 1:91988/248‑1 (MQ=255) aTCGGACAGGAAGACCAGCAAAGCTTTTTCGAAATCCCCCCCCAGCGGGATGTCTCCCGCGGTAATGCGCTCGTTAAGACGCAGCATACGGCTGACGTCATAACCTGGCTTATCCAGTTGCTCTGCGCTCTCTTCCGCAC‑TTGGTTCATGGTCCAGCTTATGGGTCAACTCACGTG‑CGGTTCGCAGGCAAACGTTCAGCTCCTTTACGATGTGAATCGGCAAACGAATAGAACGGGTTTGGTTCATacacg > 2:226453/1‑247 (MQ=255) ccGGCCAGGTTGTCCAGCATCTCTTGTTCGGAATCACACCCCAGCGGGGTGTCTACCGAGGTAAGGCGCTCGTTACGACGTAGCATCCGGCTGACGTCATTAACTGGCTTATCCAGTTGCTCTGCGCTCGCTTCCGCAC‑TTGGTTCATGGTCCAGCTTATGGGACAACTCACGTG‑CGGTTCGCAGGTAAACGTTCAGCTTCTTTACGATGTGAATCGGCAAACGAATAGTACGGGTTTGGTTCATAATCGc < 2:126232/250‑1 (MQ=255) ggATGTCCAGCAACGCTTTTTCGGAATCACCTCCCAGCGGGGTGTCTACCGAGGTAATGCGCTCGTTAAGACGAAGCATACGGCTGACGTCATCAACTGGCTTATCCAGTTGCTCTGCGCTCTCTTCCGCAC‑TTGGTTCATGGTCCAGCTTATGGGACAACTCACGTG‑CGGTTCGCAGGTAAACGTTCAGCTCCTTTACGATGTGAATCGGCAAACGAATAGTACGGGTTTGGTTCATAATCGCCCGTTCa < 1:332245/251‑1 (MQ=255) gttCCAGCAACGCTTTTTCGGAATCACCACCCAGCGGGGTGTCTACCGAGGTAATGCGCTCGTTAAGACGAAGCATACGGCTGACGTCATCAACTGGCTTATCCAGTTGCTCTGCGCTCGCTTCCGCAC‑TTGGTTCATGGTCCAGCTTATGGGACAACTCACGTG‑CGGTTCGCAGGTAAACGTTCAGCTCCTTTACGAGGTGAATCGGCAAACGAATAGTACGGGTTTGGTTCATAATCGCCCGTTCAATc < 1:38155/249‑1 (MQ=255) gTCCAGCAACGCTTTTTCGGAATCACCACCCAGCGGGGTGTCTACCGAGGTAATGCGCTCGTTAAGACGAAGCATACGGCTGACGTCATCAACTGGCTTATCCAGTTGCTCTGCGCTCTCTTCCGCAC‑TTGGTTCATGGTCCAGCTTATGGGACAACTCACGTG‑CGGTTCGCAGGTAAACGTTCAGCTCCTTTACGATGTGAATCGGCAAACGAATAGTACGGGTTTGGTTCATGATCGCCCGTTCAATCg < 1:297008/251‑1 (MQ=255) ccAGCAACGCTTTTTCGGAATCACCACCCAGCGGGGTGTCTACCGAGGTAATGCGCTCGTTAAGACGAAGCATACGGCTGACGTCATCAACTGGCTTATCCAGTTGCTCTGCGCTCTCTTCCGCAC‑TTGGTTCATGGTCCAGCTTATGGGACAACTCACGTG‑CGGTTCGCAGGTAAACGTTCAGCTCCTTTACGATGTGAATCGGCAAACGAATAGTACGGGTTTGGTTCATAATCGCCCGTTCAATCGTc < 1:122182/251‑1 (MQ=255) cAACGCTGTTTCGGAACCACCACCCAGCAGGGTGTCTTCCGAGGTAATTCGCTCGGTAAGACGAAGCATACGGCTGACGTCATCAACTGGCTTATCCAGTTGCTCTGCGCACTCTTCCGCAC‑TTGTTTCATGGTCCAGCTTATGGGACAACTCACGTG‑CGGTTCGCAGGTAAACGTTCAGCTCCTTTACGATGTGAATCGGCAAACGAATAGTACGTGTTTGGTTCATAATCGCCCGTTCAAGCGTCTGGc < 1:88050/251‑1 (MQ=255) tcttCGGAATCACCACCCAGTGGGTGGTCTACCGAGGTAATGCGCTCGTTAAGACGAAGTATACGGCTGACGGCATCAACTGGCTTATCTAGTTGCTCTGCGCTCTCTTCCTCAC‑TTGGTTCATGGTCCAGCTTATGGGACAACTCACGTG‑CTGTTCGCAGGTAAACGTTCAGCTCCTTTACGATGTGAATCGGCAAACGAATAGTACGGGTTTGGTTCATAATCGCCCGTTcttccgtcttgcgaat < 1:231226/246‑16 (MQ=255) caccacCCAGCGGTGTGTCTACCGAGGTAATGCGCTCGTTAAGACGAAGCATACGGCTGACGTCATCAACTGGCTTATCCAGTTGCTCTGCGCTCTCTTCCGCAC‑TTGGTTCATGGTCCAGCTTATGGGACAACTCACGTG‑CGGTTCGCAGGTAAACGTTCAGCTCCTTTACGATGTGAATCGGCAAACGAATAGTACGGGTTTGGTTCATAATCGCCCGTTCAATCGTCTGGCGAATCCACCAGGTTGc < 1:447962/250‑1 (MQ=255) ccccAGCGGGGTGTCTACCGAGGTAATGCGCTCGTTAAGACGAAGCATACGGCTGACGGCATCAACTGGCTTATCCAGTTGCTCTGCGCTCTCTTCCGCAC‑TTGGTTCATGGTCCAGCTTATGGGACAACTCACGTG‑CGGTTCGCAGGTAAACGTTCAGCTCCTTTACGATGTGAAGCGGCAAACGAATAGTACGGGTTTGGTTCATAATCGCCCGTTCAATCGTCTGGCGAATCCACCAGGTTGCGTATg < 1:346499/250‑1 (MQ=255) cAGCGGGGTGTCTACCGAGGTAATGCGCTCGTTAAGACGAAGCATACGGCTGACGTCATCAACTGGCTTATCCAGTTGCTCTGCGCTCTCTTCCGCAC‑TTGGTTCATGGTCCAGCTTATGGGACAACTCACGTG‑CGGTTCGCAGGTAAACGTTCAGCTCCTTTACGATGTGAATCGGCAAACGAATAGTACGGGTTTGGTTCATAATCGCCCGTTCAATCGTCTGGAGAATCCACCAGGTTGCGTATGttt > 2:225437/1‑250 (MQ=255) ccGAGGTAATGCGCTCGTTAAGACGAAGCATACGGCTGACGTCATCAACTGGCTTATCCAGTTGCTCTGCGCTCTCTTCCGCAC‑TTGGTTCATGGTCCAGCTTATGGGACAACTCACGTG‑CGGTTCGCAGGTAAACGTTCAGCTCCTTTACGATGTGAATCGGCAAACGAATAGTACGGGTTTGGTTCATAATCGCCCGTTCAATCGTCTGGCGAATCCACCAGGTTGCGTATGTTGAGAAGCGGAAAcc > 1:389994/1‑250 (MQ=255) tAATGCGCTCGTTAAGACGAAGCATACGGCTGCCGTCATCAACTGGCTTATCCAGTTGCTCTGCGCTCTCTTCCGCAC‑TTGGTTCATGGTCCAGCTTATGGTACAACTCACGTG‑CGGTTCGCAGGTAAACGTTCAGCTCCTTTACGATGTGAATCGGCAAACGAATAGTACGGGTTTGGTTCATAATCGCCCGTTCCATCGTCTGGCGAATCCACCAGGTTGCGTATGTTGAGAAGCGGAAAcccagttcc > 2:228654/1‑244 (MQ=255) gACGAAGCATACGGCTGACGTCATCAACTGGCTTATCCAGTTGCTCTGCGCTCGCTTCCGCAC‑TTGGTTCATGGTCCAGCTTATGGGACAACTCACGTG‑CGGTTCGCAGGTAAACGTTCAGCTCCTTTACGATGTGAATCGGCAAACGAATAGTACGGGTTTGGTTCATAATCGCCCGTTCAATCGTCTGGCGAATCCACCAGGTTGCGGATGTTTAGAAGCGGAAACCACGTGCCGGGTCAAACTTctct < 1:353727/251‑1 (MQ=255) aaGCATACGGCTGAAGTCATCAACTGGCTTATCCAGTTGCTCTGCGCTCTCTTCCGCAC‑TTGGTTCATGGTCCAGCTTATGGGACAACTCACGTG‑CGGTTCGCAGGTAAACGTTCAGCTCCTTTACGATGTGAATCGGCAAACGAATAGTACGGGTTTGGTTCATAATCGCCCGTTCAATCGTCTGGCGAATCCACCAGGTTGCGTATGTTGAGAAGCGGAAACCACGTTCCGGGTCAAACTTCTCTACcg > 1:142651/1‑251 (MQ=255) cGGCTGACGTCATCAACTGGCTTATCCAGTTGCTCTGCGCTCTCTTCCGCAC‑TTGGTTCATGGTCCAGCTTATGGGACAACTCACGTG‑CGGTTCGCAGGTAAACGTTCAGCTCCTTTACGATGTGAATCGGCAAACGAATAGTACGGGTTTGGTTCATAATCGCCCGTTCAATCGTCTGGCGAATCCACCAGGTTGCGTATGTTGAGAAGCGGAAACCACGTTCCGGGTCAAACTTCTCTACCGCGCGGa > 1:395211/1‑250 (MQ=255) gTCATCAACTGGCTTATCCAGTTGCTCTGCGCTCTCTTCCGCCC‑TTGGTTCATGGTCCAGCTTATGGGACAACTCACGTG‑CGGTTCGCAGGTAAACGTTCAGCTCCTTTACGATGTGAATCGGCAAACGAATAGTACGGGTTTGGTTCATAATCGCCCGTTCAATCGTCTGGCGAATCCACCAGGTTGCGTATGTTGAGAAGCGGAAACCACGTTCCGGGTCAAACTTCTCTACCGCGCGGATCAGCCCCa < 1:189593/251‑1 (MQ=255) gCTCTGCGCTCTCTTCCGCAC‑TTGGTTCATGGTCCAGCTTATGGGACAACTCACGTG‑CGGTTCGCAGGTAAACGTTCAGCTCCTTTACGATGTGAATCGGCAAACGAATAGTACGGGTTTGGTTCATAATCGCCCGTTCAATCGTCTGGCGAATCCACCAGGTTGCGTATGTTGAGAAGCGGAAACCACGTTCCGGGTCAAACTTCTCTACCGCGCGGATCAGCCCCAGGTTGCCCTCTTCGATAAGGTc < 1:330514/250‑1 (MQ=255) | GAATCGACGTGCCAGCACTTCACGCTGTTTGGCGTTCAGCTCGAACAGCCATTTGACGATGCTCTGCTTCATATCGTCATCTTGCGTGGTATCTTCCGGACCGTTCTCTTTTTCATCGGCCAGGATGTCCAGCAACGCTTTTTCGGAATCACCACCCAGCGGGGTGTCTACCGAGGTAATGCGCTCGTTAAGACGAAGCATACGGCTGACGTCATCAACTGGCTTATCCAGTTGCTCTGCGATCTCTTCCGCAC‑TTGGTTCATGGTCCAGCTTATGGGACAACTCACGTG‑CGGTTCGCAGGTAAACGTTCAGCTCCTTTACGATGTGAATCGGCAAACGAATAGTACGGGTTTGGTTCATAATCGCCCGTTCAATCGTCTGGCGAATCCACCAGGTTGCGTATGTTGAGAAGCGGAAACCACGTTCCGGGTCAAACTTCTCTACCGCGCGGATCAGCCCCAGGTTGCCCTCTTCGATAAGGTC > NC_000913/2866718‑2867200 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |