| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| JC JC | NC_000913 | 1,495,083 | IS2 (+) +5 bp | intergenic (‑12/‑201) | ydcI ← / → ydcJ | DNA‑binding transcriptional dual regulator YdcI/DUF1338 domain‑containing protein YdcJ |
| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | NC_000913 | 1467910 = | NA (NA) | 41 (1.130) | 34/486 | 0.2 | 100% | noncoding (1331/1331 nt) | IS2 | repeat region |
| ? | NC_000913 | 1495083 = | 0 (0.000) | intergenic (‑12/‑205) | ydcI/ydcJ | DNA‑binding transcriptional dual regulator YdcI/DUF1338 domain‑containing protein YdcJ | |||||
| * | ? | NC_000913 | = 1469240 | NA (NA) | 33 (0.910) | 31/488 | 0.2 | 94.2% | noncoding (1/1331 nt) | IS2 | repeat region |
| ? | NC_000913 | = 1495087 | 2 (0.060) | intergenic (‑16/‑201) | ydcI/ydcJ | DNA‑binding transcriptional dual regulator YdcI/DUF1338 domain‑containing protein YdcJ | |||||
AAAAATTGTTCGCCGGGTAAGGTAAGTTGCGCCCCC‑TGACGACCACGCTCAAACAAGCGAGCGCCAGTCAGCTGCTCCAGTTCATTCAATGTCTTAGAGAGCGCAGGTTGACTCAAATTAAGGGTTTCAGCCGCGCGCCCCAAAGTTCCTTGTTGTGCGACAGCTACGAATGTATGAAGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTATTTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGGTGTCGCTGACAAGTGAAGTTGTTTGATTATGATAACTTGATTGCAAAATATTATTAACAATTAAAGCAATTATGTTACAGCAAAATGGATAATATTGATGTTTTCGCGGCGAGATCACAGTTTGTAAATTCTTCCCGCAAGAGTGAATGCGGTTACCTACACTCCAGATTACTGACCACTGGAGGCAGACACTATGGCGAACAGCATCACGGCGGATGAGATTCGGGAA > NC_000913/1494848‑1495323 | gaaaaTTGTTCGCCTGGTAAGTGAAGTTGCGCCCCCGTG‑CGTCCCCTCGCAACTAAGCGAGCGCCAGGCAGCTGCTCCAGTTCATTCAATGTCTTAGAGAGCGCCGGTTGGCTCAAAGTAAGGGTTTCAGCCGAGCGCCCGAAAGTGGCTTGTTGTGCGACAGCAACGAATGTATGAATGTGGCGCAATCGGATGCGCTGAATAAACAGACTATTTTTGTCCATACGCGATGTTAAAAActagactggcc < 2:385408/249‑11 (MQ=255)aaaaaTTGTTCGCCGGGTAAGGTAAGTTGCGCCCCC‑TGACGACCACGCTCAAACAAGCGAGCGCCAGTCAGCTGCTCCAGTTCATTCAATGTCTTAGAGAGCGCAGGTTGACTCAAATTAAGGGTTTCAGCCGCGCGCCCCAAAGTTCCTTGTTGTGCGACAGCTACGAATGTATGAAGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTATTTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACtagactggcc > 1:147864‑M2/1‑240 (MQ=255) agagtaacggaatagcagagagcttcgtgaaaacgataaagcgtgactacatcagtatcatgcccaaaccagacgggttaacggcagcaaagaaccttgcagaggagttcgagcattataacgaatggcatccgcatagtgcgctgggatatcgctcgccacgggcatatctgcggcagcgggcttgtaatgggtgaagtgataacagatgtctggaaatataggggcaaatccaAAAACGAAGCGgtgt > 1:296440‑M2/236‑250 (MQ=255) aaaaTTGTTCGCCGGGTAAGGTAAGTTGCGCCCCC‑TGACGACCACGCTCAAACAAGCGAGCGCCAGTCAGCTGCTCCAGTTCATTCAATGTCTTAGAGAGCGCAGGTTGACTCAAATTAAGGGTTTCAGCCGCGCGCCCCAAAGTTCCTTGTTGTGCGACAGCTACGAATGTATGAAGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTATTTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACtagactggcccc > 1:232656‑M2/1‑239 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |