| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC JC | NC_000913 | 1,226,985 | IS2 (+) +5 bp | intergenic (+17/+82) | ycgJ → / ← pliG | PF05666 family protein YcgJ/inhibitor of g‑type lysozyme |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | ? | NC_000913 | 1226985 = | 1 (0.030) | 34 (0.940) | 31/486 | 0.2 | 97.1% | intergenic (+17/+86) | ycgJ/pliG | PF05666 family protein YcgJ/inhibitor of g‑type lysozyme |
| ? | NC_000913 | 1467910 = | NA (NA) | noncoding (1331/1331 nt) | IS2 | repeat region | |||||
| * | ? | NC_000913 | = 1226989 | 1 (0.030) | 27 (0.750) | 23/484 | 0.5 | 96.4% | intergenic (+21/+82) | ycgJ/pliG | PF05666 family protein YcgJ/inhibitor of g‑type lysozyme |
| ? | NC_000913 | = 1469240 | NA (NA) | noncoding (1/1331 nt) | IS2 | repeat region | |||||
CAGATGGCATTTCCCCAGAGTTAACAAGGAAATATCTCGGCGAAAAAGCCGCTGAAAACTTACAATCATTACAAGGCTACGATCCCAGCGAATTTACATTCGCTAACGGTGTATTTTGCGATGTTAAAGAAAAATTATGTCGTGATGATCGTTATTTTGGTGTGGATGGTAAGCGGAGTGGAAAAATCAATCAAACCACCACAAAGATGTTATTTATGTGTCGTGAGTGATGTCTTGTTTACATTATGTTCTATTCGTCATTAACCTCTTGAGCGACAGAGAGGAGTGGGGCATTAACGTTTATGACGGGGAGAGTCCCCGTCGGTTGACATTTACTTAATTTGAATATCGACGTTATATTTTTTAGTTTTGTTTTTACGGGCGTCGTTTCGGGTTTGCAACACTCGCAGCTCATATTTGCCAGAAGCAGGGAGTGAGTATTGTCCGTGACTATCGAGTTCTGGGGAATATCTGGATAAATCAACTGAATCATCGAT > NC_000913/1226739‑1227235 | gcggagtcaggagagtaacggaatagcagagagcttcgtgaaaacgataaagcgtgactacatcagtatcatgcccaaaccagacgggttaacggcagcaaagaaccttgcagaggcgttcgagcattataacgaatggcatccgcatagtgcgctgggttatcgctcgccccgggaatatctgcggcagcgggcttgtaatgggttaagtgataacagatgtctggaaatataggggcaaatccaTGTTc < 2:22433‑M1/5‑1 (MQ=255) 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CAGATGGCATTTCCCCAGAGTTAACAAGGAAATATCTCGGCGAAAAAGCCGCTGAAAACTTACAATCATTACAAGGCTACGATCCCAGCGAATTTACATTCGCTAACGGTGTATTTTGCGATGTTAAAGAAAAATTATGTCGTGATGATCGTTATTTTGGTGTGGATGGTAAGCGGAGTGGAAAAATCAATCAAACCACCACAAAGATGTTATTTATGTGTCGTGAGTGATGTCTTGTTTACATTATGTTCTATTCGTCATTAACCTCTTGAGCGACAGAGAGGAGTGGGGCATTAACGTTTATGACGGGGAGAGTCCCCGTCGGTTGACATTTACTTAATTTGAATATCGACGTTATATTTTTTAGTTTTGTTTTTACGGGCGTCGTTTCGGGTTTGCAACACTCGCAGCTCATATTTGCCAGAAGCAGGGAGTGAGTATTGTCCGTGACTATCGAGTTCTGGGGAATATCTGGATAAATCAACTGAATCATCGAT > NC_000913/1226739‑1227235 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |