| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | NC_000913 | 246,747 | G→T | S12S (TCG→TCT) | yafL → | NlpC/P60 family protein YafL |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 246,747 | 0 | G | T | 97.0% | 427.9 / NA | 135 | S12S (TCG→TCT) | yafL | NlpC/P60 family protein YafL |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/4); new base T (78/53); total (78/57) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.99e-02 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 135 total aligned reads displayed.
ATTGGGGTATCTCCTGTGCTGTATATTTATTCAGCTTGAATTGTAGCTCAAATGAGCAACAGCGACAATCCATGAGTAATTTAATAAACGGATGTTTTTACATAATTAACTGAAATATATATGTTAATTTTATAATAA‑TGGTTTATTAAGTTTGTTCAGAAA‑CGATCCGGGATACACTGCAACATTAAAGCATGACCAGCCATTATTGAGT‑ATG‑TCCTTGCCGTCGATTCCATCCTTTGTATTGTCGGGATTACTGT‑TGATTTGTTTGCCGTTTTCTTCATTTGCCAGCGCCACCACATCACATATCTCTTTCAGCTACGCCGCCCGCCAGCGGATGCAAAACCGTGCGCGTTTATTAAAACAGTACCAAACTCATCTGAAAAAGCAGGCCAGCTATATTGTGGAAGGCAATGCCGAAAGCAAAAGGGCGCTACGCCAGCACAACCGGGAGCAGATAAAACAGCATCCAGAATGGTTTCCTGCTCCGCTC > NC_000913/246501‑246990 | ggttATCTCCTGTGATGTATATTTATTCAGCTTGAATTGTAGCTCAAATAATCAACAACGACAATCCAATATTAATTTAATAAACGGATTTTTTTACATAATTAACTGAAATATATATGTTAATTTTATAATAA‑TGGTTTAATAAGTTTTTTCACAAA‑CGATCCGGGATACACTTCAACATTAAACCATAACCAGCCATTATTGAGT‑ATG‑TCCTTGCCATCTATTCCATCCTTTGTATTGTCTGTATTACt < 2:359101/248‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |