| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 4,546,601 | C→T | I502I (ATC→ATT) | fimD → | type I fimbriae usher protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 4,546,601 | 0 | C | T | 98.6% | 248.8 / ‑6.7 | 70 | I502I (ATC→ATT) | fimD | type I fimbriae usher protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); major base T (33/36); minor base A (0/1); total (33/37) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.98e-01 | |||||||||||
GTGCTTTTAATTTCGGTATCGGGAAAAACATGGGGGCACTGGGCGCTCTGTCTGTGGATATGACGCAGGCTAATTCCACACTTCCCGATGACAGTCAGCATGACGGACAATCGGTGCGTTTTCTCTATAACAAATCGCTCAATGAATCAGGCACGAATATTCAGTTAGTGGGTTACCGTTATTCGACCAGCGGATATTTTAATTTCGCTGATACAACATACAGTCGAATGAATGGCTACAACATCGAAACACAGGACGGAGTTATTCAGGTTAAGCCGAAATTCACCGACTATTACAACCTCGCTTATAACAAACGCGGGAAATTACAACTCACCGTTACTCAGCAACTCGGGCGCACATCAACACTGTATTTGAGTGGTAGCCATCAAACTTATTGGGGAACGAGTAATGTCGATGAGCAATTCCAGGCTGGATTAAATACTGCGTTCGAAGATATCAACTGGACGCTCAGCTATAGCCTGACG > NC_000913/4546357‑4546841 | gTGCTTTTAATTTCGGTATCGGGAAAAACATGGGGGCACTGGGCGCTCTGTCTGTGGATATGACGCAGGCTAATTCCACACTTCCCGATGACAGTCAGCATGACGGACAATCGGTGCGTTTTCTCTATAACAAATCGCTCAATGAATCAGGCACGAATATTCAGTTAGTGGGTTACCGTTATTCGACCAGCGGATATTTTAATTTCGCTGATACAACATACAGTCGAATGAATGGCTACAACATTGAAaca < 1:669445/251‑1 (MQ=255)gTGCTTTTAATTTCGGTATCGGGAAAAACATGGGGGCACTGGGCGCTCTGTCTGTGGATATGACGCAGGCTAATTCCACACTTCCCGATGACAGTCAGCATGACGGACAATCGGTGCGTTTTCTCTATAACAAATCGCTCAATGAATCAGGCACGAATATTCAGTTAGTGGGTTACCGTTATTCGACCAGCGGATATTTTAATTTCGCTGATACAACATACAGTCGAATGAATGGCTACAACATTGAAaca < 1:655195/251‑1 (MQ=255) aaTTTCGGTATCGGGAAAAACATGGGGGCACTGGGCGCTCTGTCTGTGGATATGACGCAGGCTAATTCCACACTTCCCGATGACAGTCAGCATGACGGACAATCGGTGCGTTTTCTCTATAACAAATCGCTCAATGAATAAGGAACGAATCTTCAGTTAGTGGGTTACCGTTATTCGACCAGCGGATATTTTAATTTTGCTGATACAACATACAGTCGAATGAATGGCTACAACATTGAAACACAGGACgg > 1:483593/1‑251 (MQ=255) gggaTCGGGAAAAACATGGGGGCACTGGGCGCTCTGTCTGTGGATATGACGCAGGCTAATTCCACACTTCCCGATGACAGTCAGCATGACGGACAATCGGTGCGTTTTCTCTATAACAAATCGCTCAATGAATCAGGCACGAATATTCAGTTAGTGGGTTACCGTTATTCGACCAGCGGATATTTTAATTTCGCTGATACAACATACAGTCGAATGAATGGCTACAACATTGAAACACAGGACGGAGTTAt < 1:296777/248‑1 (MQ=255) tCGGGAAAAACATGGGGGCACTGGGCTCTCTGTCTTTGGATATGACGCAGGCTAATTCCACACTTCCCGATGACAGTCAGCATGACGGACAATCGGTGCGTTTTCTCTATAACAAATCGCTCAATGAATCAGGCACGAATATTCAGTTAGTGGGTTACCGTTATTCGACCAGCGGATATTTTAATTTCGCTGATACAACATACAGTCGAATGAATGGCTACAACATTGAAACACAGGACGGAGTTATTCa < 2:611632/250‑1 (MQ=255) aaaaaCATGGGTGCACTTGGCGCTCTGTATGGTGATATGACGCGCGCTAAGTCCACACTTCCCGATGACAGTCAGCATTACGGACAATCGGTGCGTTTTCTCTATAACAAATCGCTCAATGAATTAGGCACGAATATTCAGTTAGTGGGTTACCGTTATTCGACCAGCGGATATTTTAATTTCGCTGATACAACATACAGTCGAATGAATGGCTACAAAATAGAAACACAGGACGGAGTTATTCACGTTaa < 2:363718/251‑1 (MQ=255) aaaCATGGGGGCACTGGGCGCTCTGTCTGTGGATATGACGCAGGCTAATTCCACACTTCCCGATGACAGTCAGCATGACGGACAATCGGTGCGTTTTCTCTATAACAAATCGCTCAATGAATCAGGCACGAATATTCAGTTAGTGGGTTACCGTTATTCGACCAGCGGATATTTTAATTTCGCTGATACAACATACAGTCGAATGAATGGCTACAACATTGAAACACAGGACGGAGTTATTCAGGTTAAgg > 2:601602/1‑250 (MQ=255) aCATGGGGGCACTGGGCGCTCTGTCTGTGGATATGACGCAGGCTAATTCCACACTTCCCGATGACAGTCAGCATGACGGACAATCGGTGCGTTTTCTCTATAACAAATCGCTCAATGAATCAGGCACGAATATTCAGTTAGTGGGTTACCGTTATTCGACCAGCGGATATTTTAATTTCGCTGATACAACATACAGTCGAATGAATGGCTACAACATTGAAACACAGGACGGAGTTATTCAGGTTAAGCCg > 1:236437/1‑251 (MQ=255) gggggCACTGGGCGCTCTGTCTGTGGATATGACGCAGGCTAATTCCACACTTCCCGATGACAGTCAGCATGACGGACAATCGGTGCGTTTTCTCTATAACAAATCGCTCAATGAATCAGGCACGAATATTCAGTTAGTGGGTTACCGTTATTCGACCAGCGGATATTTTAATTTCGCTGATACAACATACAGTCGAATGAATGGCTACAACATTGAAACACAGGACGGAGTTATTCAGGTTAAGCCGAAAt > 1:584727/1‑251 (MQ=255) ggCGCTCTGTCTGTGGATATGACGCAGGCTAATTCCACACTTCCCGATGACAGTCAGCATGACGGACAATCGGTGCGTTTTCTCTATAACAAATCGCTCAATGAATCAGGCACGAATATTCAGTTAGTGGGTTACCGTTATTCGACCAGCGGATATTTTAATTTCGCTGATACAACATACAGTCGAATGAATGGCTACAACATTGAAACACAGGACGGAGTTATTCAGGTTAAGCCGAAATTCACCGACt > 1:421380/1‑250 (MQ=255) tctgtctgTGGATATGACGCAGGCTAATTCCACACTTCCCGATGACAGTTAGCATGACGGACAATCGGTGCGTTTTCTCTATAACAAATCGCTCAATGAATCAGGCACGAATATTCAGTTAGTGGGTTACCGTTATTCGACCAGCGGATATTTTAATTTCGCTGATACAACATACAGTCGAATGAATGGCTACAACATTGAAACACAGGACGGAGTTATTCAGGTTAAGCCGAAATTCACCGACTATTAc > 1:592435/1‑250 (MQ=255) tctgtctgTGGATATGACGCAGGCTAATTCCACACTTCCCGATGACAGTCAGCATGACGGACAATCGGTGCGTTTTCTCTATAACAAATCGCTCAATGAATCAGGCACGAATATTCAGTTAGTGGGTTACCGTTATTCGACCAGCGGATATTTTAATTTCGCTGATACAACATACAGTCGAATGAATGGCTACAACATTGAAACACAGGACGGAGTTATTCAGGTTAAGCCGAAATTCACCGACTATTAc > 2:54583/1‑250 (MQ=255) tctgtGGATATGACGCAGGCTAATTCTACACTTCCCGATGACAGTCAGCATGACGGACAATCGGTGCGTTTTCTCTATAACAAATCGCTCAATGAATCAGGCACGAATATTCAGTTAGTGGGTTACCGTTATTCGACCAGCGGATATTTTAATTTCGCTGATACAACATACAGTCGAATGAATGGCTACAACATTGAAACACAGGACGGAGTTATTCAGGTTAAGCCGAAATTCACCGACTATTACAAcc < 2:552876/250‑1 (MQ=255) ctgtGGATATGACGCAGGCTAATTCCACACTTCCCGATGACAGTCAGCATGACGGACAATCGGTGCGTTTTCTCTATAACAAATCGCTCAATGAATCAGGCACGAATATTCAGTTAGTGGGTTACCGTTATTCGACCAGCGGATATTTTAATTTCGCTGATACAACATACAGTCGAATGAATGGCTACAACATTGAAACACAGGACGGAGTTATTCAGGTTAAGCCGAAATTCACCGACTATTACAACCTc > 1:458254/1‑251 (MQ=255) gtgGATATGACGCAGGCTAATTCCACACTTCCCGATGACAGTCAGCATGACGGACAATCGGTGCGTTTTCTCTATAACAAATCGCTCAATGAATCAGGCACGAATATTCAGTTAGTGGGTTACCGTTATTCGACCAGCGTATATTTTAATTTCGCTGATACAACATACAGTCGAATGAATGGCTACAACATTGAAACACAGGACGGAGGTATTCAGGTTAAGCCGAAATTCACCGACTATTACAACCt < 2:478780/248‑1 (MQ=255) atGACGCAGGCTAATTCCACACTGCCCGATGACAGTCAGCATGACGGACAATCGGTGCGTTTTCTCTATAACAAATCGCTCAATGAATCAGGCACGAATATTCAGTTAGTGGGTTACCGTTATTCGACCAGCGGATATTTTAATTTCGCTGATACAACATACAGTCGAATGAATGGCTACAACATTGAAACACAGGACGGAGTTATTCAGGTTAAGCCGAAATTCACCGACTATTACAACCTCGCTTATaa < 2:236437/251‑1 (MQ=255) cGCAGGCTAATTCCACACTTCCCGATGACAGTCAGCATGACGGACAATCGGTGCGTTTTCTCTATAACAAATCGCTCAAGGAATCAGGCACGAATATTCAGTTAGTGGGTTACCGTTATTCGACCAGCGGATATTTTAATGTCGCTGATACAACATACAGTCGAATGAATGGCTACAACATTGAAACACAGGACGGAGTTATTCAGGTTAAGCCGAAATTCACCGACTATTACAACCTCGCTTATAACaaa < 2:58376/251‑1 (MQ=255) gCAGGCTAATTCCACCTTTCCCGATGACAGTCAGCATGACGGACAATCGGTGCGTTTTCTCTATAACAAATCGCTCAATGAATCAGGCACGAATATTCAGTTAGTGGGTTACCGTGATTCGACCAGCGGATATTTTAATTTCGCTGATACAACATACAGTCGAATGAATGGCTACAACATTGAAACACAGGACGGAGTTATTCAGGTTAAGCCGAAATTCACCGACTATTACAACCTCGCTTATAACAAAc < 2:675879/251‑1 (MQ=255) gCTAATTCCACACTTCCCGATGACAGTCAGCATGACGGACAATCGGTGCGTTTTCTCTATAACAAATCGCTCAATGAATCAGGCACGAATATTCAGTTAGTGGGTTACCGTTATTCGACCAGCGGATATTTTAATTTCGCTGATACAACATACAGTCGAATGAATGGCTACAACATTGAAACACAGGACGGAGTTATTCAGGTTAAGCCGAAATTCACCGACTATTACAACCTCGCTTATAACAAACGCgg > 1:575821/1‑251 (MQ=255) cTAATTCCACACTTCCCGATGACAGTCAGCATGACGGACAATCGGTGCGTTTTCTCTATAAAAAATCGCTCAATGAATCAGGCACGAATATTCAGTTAGTGGGTTACCGTTATTCGACCCGCGGATATTTTAATTTCGCTGATACAACATACAGTCGAATGAATGGCTACAACATTGAAACACAGGACGGAGTTATTCAGGTTAAGCCGAAATTCACCGACTATTACAACCTCGCTTATAACAAACGCggg > 2:807584/1‑251 (MQ=255) ccACACTTCCCGATGACAGTCAGCATGACGGACAATCGGTGCGTTTTCTCTATAACAAATCGCTCAATGAATCAGGCACGAATATTCAGTTAGTGGGTTACCGTTATTCGACCAGCGGATATTTTAATTTCGCTGATACAACATACAGTCGAATGAATGGCTACAACATTGAAACACAGGACGGAGTTATTCAGGTTAAGCCGAAATTCACCGACTATTACAACCTCGCTTATAACAAACGCGGGAAAtt > 1:367091/1‑250 (MQ=255) acTTCCCGATGACAGTCAGCATGACGGACAATCGGTGCGTTTTCTCTATAACAAATCGCTCAATGAATCAGGCACGAATATTCAGTTAGTGGGTTACCGTTATTCGACCAGCGGATATTTTAATTTCGCTGATACAACATACAGTCGAATGAATGGCTACAACATTGAAACACAGGACGGAGTTATTCAGGTTAAGCCGAAATTCACCGACTATTACAACCTCGCTTATAACAAACGCGGGAAATTACAAc < 1:54583/251‑1 (MQ=255) gATGACAGTCAGCATGACGGACAATCGGTGCGTTTTCTCTATAACAAATCGCTCAATGAATCAGGCACGAATATTCAGTTAGTGGGTTACCGTTATTCGACCAGCGGATATTTTAATTTCGCTGATACAACATACAGTCGAATGAATGGCTACAACATTGAAACACAGGACGGAGTTATTCAGGTTAAGCCGAAATTCACCGACTATTACAACCTCGCTTATAACAAACGCGGGAAATTACAACTCACCGt < 2:449263/251‑1 (MQ=255) gACAGTCAGCATGACGGACAATCGGTGCGTTTTCTCTATAACAAATCGCTCAATGAATCAGGCACGAATATGCAGTTAGTGGGTTACCGTTATTCGACCAGCGGATATTTTAATTTCGCTGATACAACATACAGTCGAATGAATGGCTACAACATTGAAACACAGGACGGAGTTATTCAGGTGAAGCCGAAAGTCTCCGACTATTACAACCTCGCGTATAACAAACGCGGGAAATTACAACTCTCCGTTa < 2:516921/250‑1 (MQ=255) cAGTAAGCATGACGGACAATCGTTGCGTTTTCTCTATAACAAATCGCTCAGTGAATCAGGCACGAATATTCAGTTAGTGGGATACCGTTATTCGCCCAGCGGATATTTTAATTTCGCTGATACAACATACAGTCGAATGAATGGCTACAACATTGCAACACAGGACGGAGTAATTAAGGTTAAGCCGAAATTCAACGACAATTACAACTTCGCTTATAACAAACGCGGGAACTTACAACTCAACGTTACTc > 2:212364/1‑251 (MQ=255) cATGACGGACAATCGGTGCGTTTTCTCTATAACAAATCGCTCAATGAATCAGGCACGAATATTCAGTTAGTGGGTTACCGTTATTCGACCAGCGGATATTTTAATTTCGCTGATACAACATACAGTCGAATGAATGGCTACAACATTGAAACACAGGACGGAGTTATTCAGGTTAAGCCGAAATTCACCGACTATTACAACCTCGCTTATAACAAACGCGGGAAATTACAACTCACCGTTACTCAGCAACt < 1:353272/251‑1 (MQ=255) cATGACGGACAATCGGTGCGTGTTCTCTATAACAAATCGCTCAATGAATCAGGCACGAATATTCAGTTAGTGGGTTACCGTTATTCGACCAGCGGATATTTTAATTTCGCTGATACAACATACAGTCGAATGAATGGCTACAACATTGAAACACAGGACGGAGTTATTCAGGTTAAGCCGAAATTCACCGACTATTACAACCTCGCTTATAACAAACGCGGGAAATTACAACTCACCGTTACTCAGCAACt < 1:331615/251‑1 (MQ=255) aCAATCTGTGCGTTTTCTCTATAACAAATCGCTTAATTAATCAGGCCCGAATATTCAGTTATTGGGTTACCGTTATTCGACCAGCGTATATTTTAATTTCGCTGATACAACAGACAGTCGAATGAATGGCTACAACATTGAAACACAGGACGGAGTTATTCAGGTTAAGCCGAAATTCACCGACTATTACAACCTCGCTTATAACAAACGCGGGAAATTACAACGCACCGTTACTCAGCAACTCGGGCGca < 2:794598/251‑1 (MQ=255) ggTGCGTTTTCTCTATAACAAATCGCTCAATGAATCAGGCACGAATATTCAGTTAGTGGGTTACCGTTATTCGACCAGCGGATATTTTAATTTCGCTGATACAACATACAGTCGAATGAATGGCTACAACATTGAAACACAGGACGGAGTTATTCAGGTTAAGCCGAAATTCACCGACTATTACAACCTCGCTTATAACAAACGCGGGAAATTACAACTCACCGTTACTCAGCAACTCAGGCGCACATCa > 1:598846/1‑250 (MQ=255) gcggtttCTCTATAACAAATCGCTCAATGAATCAGGCACGAATATTCAGTTAGTGGGTTACCGTTATTCGACCAGCGGATATTTTAATTTCGCTGATACAACATACAGTCGAATGAATGGCTACAACATTGAAACACAGGACGGAGTTATTCAGGTTAAGCCGAAATTCACCGACTATTACAACCTCGCTTATAACAAACGCGGGAAATTACAACTCACCGTTACTCAGCAACTCGGGCGCACATCAaca < 1:328172/246‑1 (MQ=255) ttCTCTATAACAAATCGCGCAATGAATCAGGCACGAATATTCAGTTAGTGGGTTACCGTTATTCGACCAGCGGATATTTTAATTGCGCTGATACAACATACAGTCGAATGAATGACTACAACAGTGAAACACAGGACGGAGTTATTCAGGTTAAGCCGAAATACACCTACGTTTACAACCTCGCTTATAACAAACGCGCGAAATTACAACTCACCGTTACTCAGCAACTCGGGCGCACATCAACACTGTa < 1:753685/250‑1 (MQ=255) ctctATAACAAATCGCTCAATGAATCAGGCACGACTATTCAGTTAGTGGGTTACCGTTATTCGACCAGCGGATATTTTAATTTCGCTGCTACAACATACAGTCGAATGAATGGCTACAACATTGAAACACAGGACGGAGTTATTCAGGTTAAGCCGAAATTCACCGACTATTACAACCTCGCTTATAACAAACGCGGGAAATTACAACTCACCGTTACTCAGCAACTCGGGCGCACATCACAACTGTAttt > 2:694580/1‑251 (MQ=255) cctATAACAAATCGCTCAATGAATCAGGCACGAATATTCAGTTAGTGGTTTACCGTTAGTCGACCAGCGGATATTTTAATTTCGCTGATACAACATACAGTCGAATGAATGGCTACAACATTGAAACACAGTACGGAGTTATTCAGGTTAAGCCGAAATTCACCGACTATTACAACCTCGCTTATAACAAACGCGGGAAATTACAACTCACCGTTACTCAGCAACTCGGGCGCACATCAACACTGTATTTg < 2:809423/250‑1 (MQ=255) aaCAAATCGCTCAATGAATCAGGCACGAATATTCAGTTAGTGGGTTACCGTTATTCGACCAGCGGATATTTTAATTTCGCTGATACAACATACAGTCGAATGAATGGCTACAACATTGAAACACAGGACGGAGTTATTCAGGTTAAGCCGAAATTCACCGACTATTACAACCTCGCTTATAACAAACGCGGGAAATTACAACTCACCGTTACTCAGCAACTCGGGCGCACATCAACACTGTATTTGAGTg < 1:418559/250‑1 (MQ=255) aCAAATCGCTCAATGAATCAGGCACGAATATTCAGTTAGTGGGTTACCGTTATTCGACCAGCGGATATTTTAATTTCGCTGATACAACATACAGTCGAATGAATGGCTACAACATTGAAACACAGGACGGAGTTATTCAGGTTAAGCCGAAATTCACCGACTATTACAACCTCGCTTATAACAAACGCGGGAAATTACAACTCACCGTTACTCAGCAACTCGGGCGCACATCAACACTGTATTTGAGTGGt < 2:650718/251‑1 (MQ=255) cAAATCGCTCAATGAATCAGGCACGAATATTCAGTTAGTGGGTTACCGTTATTCGACCAGCGGATATTTTAATTTCGCTGATACAACATACAGTCGAATGAATGGCTACAACATTGAAACACAGGACGGAGTTATTCAGGTTAAGCCGAAATTCACCGACTATTACAACCTCGCTTATAACAAACGCGGGAAATTACAACTCACCGTTACTCAGCAACTCGGGCGCACATCAACACTGTATTTGAGTGGTa < 1:568797/251‑1 (MQ=255) tCAATGAATCAGGCACGAATATTCAGTTAGTGGGTTACCGTTATTCGACCAGCGGATATTTTAATTTCGCTGATACAACATACAGTCGAATGAATGGCTACAACATTGAAACACAGGACGGAGTTATTCAGGTTAAGCCGAAATTCACCGACTATTACAACCTCGCTTATAACAAACGCGGGAAATTACAACTCACCGTTACTCAGCAACTCGGGCGCACATCAACACTGTATTTGAGTGGTAGCCATCa > 1:23750/1‑250 (MQ=255) aaTGAATCAGGCACTAATATTCATTTAGTGGGTTACCGTTAGTCGACCAGCGGATATTTTAATTTCGCTGATACAACATACAGTCGAATGAATGGCTACAACATTGAAACACAGGACGGAGTTATTCAGGTTAAGCCGAAATTCACCGACTATTACAACCTCGCTTATAACAAACGCGGGATATTACAACTCACCGTTACTCAGCAACTCGAGCGCACATCAACACTGTATTTGAGTGTTAGCCATCAAAc < 1:795864/251‑1 (MQ=255) aaTGAATCAGGCACGAATATTCAGTTAGTGGGTTACCGTTATTCGACCAGCGGATATTTTAATTTCGCTGATACAACATACAGTCGAATGAATGGCTACAACATTGAAACACAGGACGGAGTTATTCAGGTTAAGCCGAAATTCACCGACTATTACAACCTCGCTTATAACAAACGCGGGAAATTACAACTCACCGTTACTCAGCAACTCGGGCGCACATCAACACTGTATTTGAGTGGTAGCCATCAAAc < 1:136225/251‑1 (MQ=255) aaTGAATCAGGCACGAATATTCAGTTAGTGGGTTACCGTTATTCGACCAGCGGATAATTTAATTTCGCTGATACAACATACAGTCGAATGAATGGCTACAACATTGAAACACAGGACGGAGTTATTCAGGTTAAGCCGAAATTCACCGACTATTACAACCTCGCTTATAACAAACGCGGGAAATTACAACTCACCGTTACTCAGCAACTCGGGCGCACATCAACACTGTATTTGAGTGGTAGCCATCAAAc < 2:315870/251‑1 (MQ=255) aTGAATCAGGCACGAATATTCAGTTAGTGGGTTACCGTTATTCGACCAGCGGATATTTTAATTTCGCTGATACAACATACAGTCGAATGAATGGCTACAACATTGAAACACAGGACGGAGTTATTCAGGTTAAGCCGAAATTCACCGACTATTACAACCTCGCTTATAACAAACGCGGGAAATTACAACTCACCGTTACTCAGCAACTCGGGCGCACATCAACACTGTATTTGAGTGGTAGCCATCAAACt > 2:472785/1‑251 (MQ=255) gAATCAGGCACGAATATTCAGTTAGTGGGTTACCGTTATTCGACCAGCGGATATTTTAATTTCGCTGATACAACATACAGTCGAATGAATGGCTACAACATTGAAACACAGGACGGAGTTATTCAGGTTAAGCCGAAATTCACCGACTATTACAACCTCGCTTATAACAAACGCGGGAAATTACAACTCACCGTTACTCAGCAACTCGGGCGCACATCAACACTGTATTTGAGTGGTAGCCATCAAACtt < 1:687461/250‑1 (MQ=255) gAATCAGGCACGAATATTCAGTTAGTGGGTTACCGTTATTCGACCAGCGGATATTTTAATTTCGCTGATACAACATACAGTCGAATGAATGGCTACAACATTGAAACACAGGACGGAGTTATTCAGGTTAAGCCGAAATTCACCGACTATTACAACCTCGCTTATAACAAACGCGGGAAATTACAACTCACCGTTACTCAGCAACTCGGGCGCACATCAACACTGTATTTGAGTGGTAGCCATCAAACTTa < 1:807584/251‑1 (MQ=255) tCAGTTAGTGGGTTACCGTTATTCGACCAGCGGATATTTTAATTTCGCTGATACAACATACAGTCGAATGAATGGCTACAACATTGAAACACAGGACGGAGTTATTCAGGTTAAGCCGAAATTCACCGACTATTACAACCTCGCTTATAACAAACGCGGGAAATTACAACTCACCGTTa < 2:783086/179‑1 (MQ=255) tCAGTTAGTGGGTTACCGTTATTCGACCAGCGGATATTTTAATTTCGCTGATACAACATACAGTCGAATGAATGGCTACAACATTGAAACACAGGACGGAGTTATTCAGGTTAAGCCGAAATTCACCGACTATTACAACCTCGCTTATAACAAACGCGGGAAATTACAACTCACCGTTa > 1:783086/1‑179 (MQ=255) aGTTAGTGGGTTACCGTTATTCGACCAGCGGATATTTTAATTTCGCTGATACAACATAAAGTCGAATGAATGGCTACAACATTGAAACACAGGACGGAGTTATTCAGGTTAAGCCGAAATTCACCGACTATTACAACCTCGCTTATAACAAACGCGGGAAATTACAACTCACCGTTACTCAGCAACTCGGGCGCACATCAACACTGTATTTGAGTGGTAGCCATCAAACTTATTGGGGAACGAGTAATGTc < 2:681298/251‑1 (MQ=255) gTGGGTTACCGTTATTCGACCAGCGGATATTTTACTTTCGCTGATACAACATACAGTCGCATGAATGGCTACAACATTGAAACACAGGACGGAGTTATTCAGGTTAAGCCGAAATTCACCGACTATTACAACCTCGCTTATAACAACCGCGGGAAATTACAACTCACCGTTACTCAGAAACTCGGGCGCACATCAACACTGTATTTGAGTGTTATCCATCAAACATATTGGGGACCGAGTAATGTCGATg > 2:703364/1‑250 (MQ=255) gggTTACCGTTATTCGACCAGCGGATATTTTAATTTCGCTGATACAACATACAGTCGAATGAATGGCTACAACATTGAAACACAGGACGGAGTTATTCAGGTTAAGCCGAAATTCACCGACTATTACAACCTCGCTTATAACAAACGCGGGAAATTACAACTCACCGTTACTCAGCAACTCGGGCGCACATCAACACTGTATTTGAGTGGTAGCCATCAAACTTATTGGGGAACGAGTAATGTCGATGAGc > 1:459360/1‑251 (MQ=255) ggTTACCGTTATTCGACCAGCGGATATTTTAATTTCGCTGATACAACATACAGTCGAATGAATGGCTACAACATTGAAACACAGGACGGAGTTATTCAGGTTAAGCCGAAATTCACCGACTATTACAACCACGCTTATAACAAACGCGGGAAATTACAACTCACCGTTACTCAGCAACTCGGGCGCCCATCAAAACTGTATTTGAGTGGTAGCCATCAAACTTATTGGGGAACGAATAATGTCGATGAGc > 2:226913/1‑250 (MQ=255) aCCGTTATTCGACCAGCGGATATTTTAATTTCGCTGATACAACATACAGTCGAATGAATGGCTACAACATTGAAACACAGGACGGAGTTATTCAGGTTAAGCCGAAATTCACCGACTATTACAACCTCGCTTATAACAAACGCGGGAAATTACAACTCACCGTTACTCAGCAACTCGGGCGCACATCAACACTGTATTTGAGTGGTAGCCATCAAACTTATTGGGGAACGAGTAATGTCGATGAGCAATTc > 2:571619/1‑251 (MQ=255) tATTCGACCAGCGGATATTTTAATTTCGCTGATACAACATACAGTCGAATGAATGGCTACAACATTGAAACACAGGACGGAGTTATTCAGGTTAAGCCGAAATTCACCGACTATTACAACCTCGCTTATAACAAACGCGGGAAATTACAACTCACCGTTACTCAGCAACTCGGGCGCACATCAACACTGTATTTGAGTGGTAGCCATCAAACTTATTGGGGAACGAGTAATGTCGATGAGCAATTCCAgg < 2:575821/250‑1 (MQ=255) aTTCGACCAGCGGATATTTTAATTTCGCTGATACAACATACAGTCGAATGAATGGCTACAACATTGAAACACAGGACGGAGTTATTCAGGTTAAGCCGAAATTCACCGACTATTACAACCTCGCTTATAACAAACGCGGGAAATTACAACTCACCGTTACTCAGCAACTCGGGCGCACATCAACACTGTATTTGAGTGGTAGCCATCAAACTTATTGGGGAACGAGTAATGTCGATGAGCAATTCCAGGCt > 2:292733/1‑251 (MQ=255) aTTCGACCAGCGGATATTTTAATTTCGCTGATACAACATACAGTCGAATGAATGGCTACAACATTGAAACACAGGACGGAGTTATTCAGGTTAAGCCGAAATTCACCGACTATTACAACCTCGCTTATAACAAACGCGGGAAATTACAACTCACCGTTACTCAGCAACTCAGGCGCACATCAACACTGTATTTGAGTGGTAGCCATCAAACTTATTGGGGAACGAGTAATGTCGATGAGCAATTCCAGGc < 2:598846/250‑1 (MQ=255) cAGCGGATATTTTAATTTCGCTGATACAACATACAGTCGAATGAATGGCTACAACATTGAAACACAGGACGGAGTTATTCAGGTTAAGCCGAAATTCACCGACTATTACAACCTCGCTTATAACAAACGCGGGAAATTACAACTCACCGTTACTCAGCAACTCGGGCGCACATCAACACTGTATTTGAGTGGTAGCCATCAAACTTATTGGGGAACGAGTAATGTCGATGAGCAATTCCAGGCTGGATTa > 1:676490/1‑250 (MQ=255) atatTTTAATTTCGCTGATACAACATACAGTCGAATGAATGGCTACAACATTGAAACACAGGACGGAGTTATTCAGGTTAAGCCGAAATTCACCGACTATTACAACCTCGCTTATAACAAACGCGGGAAATTACAACTCACCGTTACTCAGCAACTCGGGCGCACATCAACACTGTATTTGAGTGGTAGCCATCAAACTTATTGGGGAACGAGTAATGTCGATGAGCAATTCCAGGCTGGATTAAATACTg < 1:764480/251‑1 (MQ=255) tatTTTAATTTCGCTGATACAACATACAGTCGAATGAATGGCTACAACATTGAAACACAGGACGGAGTTATTAAGGTTAAGCCGAAATTCACCGACTATTACAACCACGCTTATAACAAACGCGGGAAATTACAACTCACCGTTACTCAGCAACTCGGGCGCACATCAACACTGTATTTGAGTGGTAGCCATCAAACTTATTGGGGAACGAGTAATGTCGATGAGCAATTCCAGGCTGGATTaactcctgc > 1:486454/1‑244 (MQ=255) ttAATTTCGCTGATACAACATACAGTCGAATGAATGGCTACAACATTGAAACACAGGACGGAGTTATTCAGGTTAAGCCGAAATTCACCGACTATTACAACCTCGCTTATAACAAACGCGGGAAATTACAACTCACCGTTACTCAGCAACTCGGGCGCACATCAACACTGTATTTGAGTGGTAGCCATCAAACTTATTGGGGAACGAGTAATGTCGATGAGCAATTCCAGGCTGGATTAAATACTGCGtt < 1:368636/250‑1 (MQ=255) taaattCGCGGATACAACATACAGTCGAATGAATGGCTACAACATTGAAACACAGGACGGAGTTATTCAGGTTAAGCCGAAATTCACCGACTATTACAACCTCGCTTATAACAAACGCGGGAAATTACAACTCACCGTTACTCAGCAACTCGGGCGCACATCAACACTGTATTTGAGTGGTAGCCATCAAACTTATTGGGGAACGAGTAATGTCGATGAGCAATTCCAGGCTGGATTAAATACTGCGTTc < 2:367091/246‑1 (MQ=255) tAATTTCGCTGCTACAACATACAGTCGAATGAATGGCTACAACATTGAAACCCAGGACGGAGTTATTCAGGTTAAGCCGCAATTCACCGACTATTACAACCTCGCTTATTACAACAGCGGGAAATTCCAACTCACCGTTACTCAGCAAATCGGGCGCACATCAACATTGTATTTGAGTGGTAGCCATCCCACTTATTGGGAAACGAGTCATGTCGTTGCGCTATTCCAGGCTGGCTTAAATACTGCTTTCg > 2:480536/1‑251 (MQ=255) tAATTTCGCTGATACAACATACAGACGAATGAATGGCTACAACATTGAAACACAGGACGGAGTTATTCAGGTTAAGCCGAAATTCACCGACTATTACAACCTCGCTTATAACAAACGCGGGAAATTACAACTCACCGTTACTCAGCAACTCGGGCGCACATCAACACTGTATTTGAGTGGTAGCCATCAAACTTATTGGGGAACGAGTAATGTCGATGAGCAATTCCAGGCTGGATTAAATACTGCGTTc < 2:459360/250‑1 (MQ=255) tGATACAACATACAGTCGAATGAATGGCTACAACATTGAAACACAGGACGGAGTTATTCAGGTTAAGCCGAAATTCACCGACTATTACAACCTCGCTTATAACAAACGCGGGAAATTACAACTCACCGTTACTCAGCAACTCGGGCGCACATCAACACTGTATTTGAGTGGTAGCCATCAAACTTATTGGGGAACGAGTAATGTCGATGAGCAATTCCAGGCTGGATTAAATACTGCGTTCGAAGATATc > 1:233085/1‑250 (MQ=255) aTACAACATACAGTCGAATGAATGGCTACAACATTGAAACACAGGACGGAGTTATTCAGGTTAAGCCGAAATTCACCGACTATTACAACCTCGCTTATAACAAACGCGGGAAATTACAACTCACCGTTACTCAGCAACTCGGGCGCACATCAACACTGTATTTGAGTGGTAGCCATCAAACTTATTGGGGAACGAGTAATGTCGATGAGCAATTCCAGGCTGGATTAAATACTGCGTTCGAAGATATCAAc > 1:429946/1‑251 (MQ=255) aTACAGTCGAATGAATGGCTACAACATTGAAACACAGGACGGAGTTATTCAGGTTAAGCCGAAATTCACCGACTATTACAACCTCGCTTATAACAAACGCGGGAAATTACAACTCACCGTTACTCAGCAACTCGGGCGCACATCAACACTGTATTTGAGTGGTAGCCATCAAACTTATTGGGGAACGAGTAATGTCGATGAGCAATTCCAGGCTGGATTAAATACTGCGTTCGAAGTTATCAACTGGACGc > 2:656654/1‑251 (MQ=255) aGTCGAATGAATGGCTACAACATTGAAACACAGGACGGAGTTATTCAGGTTAAGCCGAAATTCACCGACTATTACAACCTCGCTTATAACAAACGCGGGAAATTACAACTCACCGTTACTCAGCAACTCGGGCGCACATCAACACTGTATTTGAGTGGTAGCCATCAAACTTATTGGGGAACGAGTAATGTCGATGAGCAATTCCAGGCTGGATTAAATACTGCGTTCGAAGATATCAACTGGACGCTc > 2:431800/1‑249 (MQ=255) aGTCGAATGAATGGCTACAACATTGAAACACAGGACGGAGTTATTCAGGTTAAGCCGAAATTCACCGACTATTACAACCTCGCTTATAACAAACGCGGGAAATTACAACTCACCGTTACTCAGCAACTCGGGCGCACATCAACACTGTATTTGAGTGGTAGCCATCAAACTTATTGGGGAACGAGTAATGTCGATGAGCAATTCCAGGCTGGATTAAATACTGCGTTCGAAGATATCAACTGGACGCTCAg < 1:317309/251‑1 (MQ=255) tCGAATGAATGGCTACAACATTGAAACACAGGACGGAGTTATTCAGGTTAAGCCGAAATTCACCGACTATTACAACCTCGCTTATAACAAACGCGGGAAATTACAACTCACCGTTACTCAGCAACTCGGGCGCACATCAACACTGTATTTGAGTGGTAGCCATCAAACTTATTGGGGAACGAGTAATGTCGATGAGCAATTCCAGGCTGGATTAAATACTGCGTTCGAAGATATCAACTGGACGCTCAGCt > 2:115562/1‑251 (MQ=255) gaatgaagGGCTATAACATTGAAACACAGGACGGAGTTATTCAGGTTAAGCCGAAATTCATCTACTATTAAAACCTCGCTTATAACAAACGCGGGAAATTACAACTCACCGTTACTCCGCAACTCGGGCGCACATCAACACTGTATTTGAGTGTTAGCCATCAAACTTATTGGGGAACGAGTAATTTCGATGAGCAATTCCAGGCTGGATTAAATACTGCGTTCGAAGATATCAACTGTACCCTCAGCtat < 2:378188/251‑1 (MQ=255) tgaatgGCTACAACATTGAAACACCGGACGGAGTTATTCAGGTTAAGCCGACATTCACCGACTATTACAACCTCGCTTATAACAAACGCGGGAAATTACAACTCACCGTTACTCAGCAACTCGGGCGCACATCAACACTGTATTTGAGTGGAAGCCCTCAAACTTATTGGGGAACGAGTCATGTCGATGAGCAATTCCAGGCTGGATTAAATAATGCGTTCGAAGATATCAACTGGCCGATCAGCTATAGc > 2:465425/1‑251 (MQ=255) cTACAACATTGAAACACAGGACGGAGTTATTCAGGTTAAGCCGAAATTCACCGACTATTACAACCTCGCTTATAACAAACGCGGGAAATTACAACTCACCGTTACTCAGCAACTCGGGCGCACATCAACACTGTATTTGAGTGGTAGCCATCAAACTTATTGGGGAACGAGTAATGTCGATGAGCAATTCCAGGCTGGATTAAATACTGCGTTCGAAGATATCAACTGGACGCTCAGCTATAGCCTGACg > 1:409300/1‑250 (MQ=255) cTACAACATTGAAACACAGGACGGAGTTATTCAGGTTAAGCCGAAATTCACCGACTATTACAACCTCGCTTATAACAAACGCGGGAAATTACAACTCACCGTTACTCAGCAACTCGGGCGCACATCAACACTGTATTTGAGTGGTAGCCATCAAACTTATTGGGGAACGAGTAATGTCGATGAGCAATTCCAGGCTGGATTAAATACTGCGTTCGAAGATATCAACTGGACGCTCAGCTATAGCCTGACg > 1:244103/1‑250 (MQ=255) | GTGCTTTTAATTTCGGTATCGGGAAAAACATGGGGGCACTGGGCGCTCTGTCTGTGGATATGACGCAGGCTAATTCCACACTTCCCGATGACAGTCAGCATGACGGACAATCGGTGCGTTTTCTCTATAACAAATCGCTCAATGAATCAGGCACGAATATTCAGTTAGTGGGTTACCGTTATTCGACCAGCGGATATTTTAATTTCGCTGATACAACATACAGTCGAATGAATGGCTACAACATCGAAACACAGGACGGAGTTATTCAGGTTAAGCCGAAATTCACCGACTATTACAACCTCGCTTATAACAAACGCGGGAAATTACAACTCACCGTTACTCAGCAACTCGGGCGCACATCAACACTGTATTTGAGTGGTAGCCATCAAACTTATTGGGGAACGAGTAATGTCGATGAGCAATTCCAGGCTGGATTAAATACTGCGTTCGAAGATATCAACTGGACGCTCAGCTATAGCCTGACG > NC_000913/4546357‑4546841 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |