| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 3,707,947 | C→A | intergenic (‑242/+669) | dppA ← / ← proK | dipeptide ABC transporter periplasmic binding protein/tRNA‑Pro |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,707,947 | 0 | C | A | 98.2% | 191.9 / NA | 55 | intergenic (‑242/+669) | dppA/proK | dipeptide ABC transporter periplasmic binding protein/tRNA‑Pro |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (1/0); new base A (25/29); total (26/29) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.73e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
GCATTATTCTGCTCCAATTGTGATGTTTGTTGTTTTAACCCTTTGCAGTGGGTTGTCGCTGCCTGACCTTTTTTGTTTTTTGCCCGGTCGGG‑TCAACGTTATGAGGTGGGGATGCCGTACTAATTAACATCAGTGTAACAGTGCGGATCC‑TCCATAAAATGCCCCTCGTGACCTACAA‑TCTGTCAACAGAATGTGAAAA‑CGTCAATACAGCCAACCGGGATTTACACCAACGGTGAGAATCCACACACAAAGATTAAAAAAACTTCAAACAGCTATTTGCAGCAGAGAAATTTGTGCTACTCCAACATGACCAGAACAATCAGCTTAATATTTAGCAACATTTGGTGATTAAGTTTTATGCATTTAATGAAAAAAATCTGAGGAAAAGGTGGATATCTGAGCGATTAATACCATGAACGCTAAAACGCACAGCGGAAAATGCCAGGGCCAGCCATAAGTAACGCAAAAAAAGATTTAAGCAAATATAAAA > NC_000913/3707702‑3708191 | gCATTATTCTGCTCCAATTGTGATGTTTGTTGTTTTAACCCTTTGCAGTGGGTTGTCGCTGCCTGACCTTTTTTGTTTTTTGCCCGGTCGGG‑TCAACGTTATGAGGTGGGGATGCCGTACTAATTAACATCAGTGTAACAGTGCGGATCC‑TCCATAAAATGCCCCTCGTGACCTACAA‑TCTGTCAACAGAATGTGAAAA‑CGTCAATACAGCCAACCGGGATTTACACCAACGGTGAGAATCCacaaacaa > 1:86685/1‑250 (MQ=255) cATTATTCTGCTCCAATTGTGATGTTTGTTGTTTTAACCCTTTGCAGTGGGTTGTCGCTGCCTGACCTTTTTTGTTTTTTGCCCGGTCGGG‑TCAACGTTATGAGGTGGGGATGCCGTACTAATTAACATCAGTGTAACAGTGCGGATCC‑TCCATAAAATGCCCCTCGTGACCTACAA‑TCTGTCAACAGAATGTGAAAA‑CGTCAATACAGCCAACCGGGATTTACACCAACGGTGAGAATCCacaaacaa > 2:277653/1‑249 (MQ=255) attattCTGCTCCAATTGTGATGTTTGTTGTTTTAACCCCTTGCAGTGGGTTGTCGCTGCCTGACCGTTTTTGTTTTTTGCCCGGTCGGG‑TCAACGTTATGAGGTGGGGATGCCGTACTAATTAACATCAGTGTAACAGTGCGGATCC‑TCCATAAAATGCCCCTCGTGACCTACAA‑TCTGTCAACAGAATGTGAAAA‑CGTCAATACAGCCAACCGGGATTTACACCAACGGTGAGAATCCACAAACAAAGa < 2:420909/251‑1 (MQ=255) cTGCTCCAATTGTGATGTTTGTTGTTTTAACCCTTTGCAGTGGGTTGTCGCTGCCTGACCTTTTTTGTTTTTTGCCCGGTCGGG‑TCAACGTTATGAGGTGGGGATGCCGTACTAATTAACATCAGTGTAACAGTGCGGATCC‑TCCATAAAATGCCCCTCGTGACCTACAA‑TCTGTCAACAGAATGTGAAAA‑CGTCAATACAGCCAACCGGGATTTACACCAACGGTGAGAATCCACAAACAAAGATTaaa > 1:177417/1‑250 (MQ=255) aaTTGTGATGTTTGTTGTTTTAACCCTTTGCAGTGGGTTGTCGCTGCCTGACCTTTTTTGTTTTTTGCCCGGTCGGG‑TCAACGTTATGAGGTGGGGATGCCGTACTAATTAACATCAGTGTAACAGTGCGGATCC‑TCCATAAAATGCCCCTCGTGACCTACAA‑TCTGTCAACAGAATGTGAAAA‑CGTCAATACAGCCAACCGGGATTTACACCAACGGTGAGAATCCACAAACAAAGATTAAAAAAACTTc < 1:690551/251‑1 (MQ=255) ttGTGATGTTTGTTGTTTTAACCCTTTGCAGTGGGTTGTCGCTGCCTGACCTTTTTTGTTTTTTGCCCGGTCGGG‑TCAACGTTATGAGGTGGGGATGCCGTACTAATTAACATCAGTGTAACAGTGCGGATCC‑TCCATAAAATGCCCCTCGTGACCTACAA‑TCTGTCAACAGAATGTGAAAA‑CGTCAATACAGCCAACCGGGATTTACACCAACGGTGAGAATCCACAAACAAAGATTAAAAAAACTTCa > 1:800729/1‑250 (MQ=255) gATGTTTGTTGTTTTAACCCTTTGCAGTGGGTTGTCGCTGCCTGACCTTTTTTGTTTTTTGCCCGGTCGGG‑TCAACGTTATGAGGTGGGGATGCCGTACTAATTAACATCAGTGTAACAGTGCGGATCC‑TCCATAAAATGCCCCTCGTGACCTACAA‑TCTGTCAACAGAATGTGAAAA‑CGTCAATACAGACAACCGGGATTTACACCAACGGTGAGAATCCACAAACAAAGATTAAAAAAACTTCAAACa < 1:772117/250‑1 (MQ=255) ttgttgTTTTAACCCTTTGCAGTGGGTTGTCGCTGCCTGACCTTTTTTGTTTTTTGCCCGGTCGGG‑TCAACGTTCTGCGGTGGGGATGCCGTACTAATTAACATCAGTGTAACAGTGCGGATCC‑TCCATAAAATGCCCCTCGTGACCTACAA‑TCTGTCAACAGAATGTGAAAA‑CGTCAATACAGCCAACCGGGATTTACACCAACGGTGAGAATCCACAAACAAAGATTAACAAAACTTCAAACAGCTAtt > 2:266400/1‑251 (MQ=255) tAACCCTTTGCAGTGGGTTGTCGCTGCCTGACCTTTTTTGTTTTTTGCCCGGTCGGG‑TCAACGTTATGAGGTGGGGATGCCGTACTAATTAACATCAGTGTAACAGTGCGGATCC‑TCCATAAAATGCCCCTCGTGACCTACAA‑TCTGTCAACAGAATGTGAAAA‑CGTCAATACAGCCAACCGGGATTTACACCAACGGTGAGAATCCACAAACAAAGATTAAAAAAACTTCAACCAGCTATTTgcagc > 2:589810/1‑248 (MQ=255) tAACCCTTTGCAGTGGGTTGTCGCTGCCTGACCTTTTTTGTTTTTTGCCCGGTCGGG‑TCAACGTTATGAGGTGGGGATGCCGTACTAATTAACATCAGTGTAACAGTGCGGATCC‑TCCATAAAATGCCCCTCGTGACCTACAA‑TCTGTCAACAGAATGTGAAAA‑CGTCAATACAGCCAACCGGGATTTACACCAACGGTGAGAATCCACAAACAAAGATTAAAAAAACTTCAAACAGCTATTTgcagc > 2:486989/1‑248 (MQ=255) ccTTTGCAGTGGGTTGTCGCTGCCTGACCTTTTTTGTTTTTTGCCCGGTCGGG‑TCAACGTTATGAGGTGGGGATGCCGTACTAATTAACATCAGTGTAACAGTGCGGATCC‑TCCATAAAATGCCCCTCGTGACCTACAA‑TCTGTCAACAGAATGTGAAAA‑CGTCAATACAGCCAACCGGGATTTACACCAACGGTGAGAATCCACAAACAAAGATTAAAAAAACTTAAAACAGCTATTTGCAGCAGAGaa > 2:743489/1‑250 (MQ=255) gTCGCTGCCTGACCTTTTTTGTCTTGTGCCCGGTCGGG‑TCAACGTTATGAGGTGGGGATGCCGTACGAATTAACATCAGTGTAACAGTGCGGATCC‑TCCATAAAATGCCCCTCGTGACCTACAA‑TCTGTCAACAGAATGTGAAAA‑CGTCAATACAGCCAACCGGGATTTACACCAACGGTGAGAATCCACAAACAAAGATTAAAAAAACTTCAAACAGCTATTTGCAGCAGAGAAATTTGTGCTACTCCaa < 1:560655/251‑1 (MQ=255) gTCGCTGCCTGACCTTTTTTGGTTTTTGCCCGGTCGGG‑TCAACGTTATGAGGTGGGGATGCCGTACTAATTAACATCAGTGTAACAGTGCGGATCC‑TCCATAAAATGCCCCTCGTGACCTACAA‑TCTGTCAACAGAATGTGAAAA‑CGTCAATACAGCCAACCGGGATTTACACCAACGGTGAGAATCCACAAACAAAGATTAAAAAAACTTCAAACAGCTATTTGCAGCAGAGAAATTTGTGCTACTCCa < 1:310596/250‑1 (MQ=255) ccgttgctggacctttttgttttttgtCCGGGCGGGGTAAACGTAATGAGGGGGGAATGCCGTCCTAATTACCACCAGGGAAACA‑TGCCGATCCCTCCATAAAATCCCCCTCGT‑ACCCACAAATTTG‑CAAAAGGAAGTGAAAAACG‑CAATACAGCCAACCGGGATTTACACCAACGGTGAGAATCCACAAACAAAGATTAAAAAAACTTCAAACAGCTATTTGCAGCAGAGAAATTTGTGCTACTCCAACa < 2:380798/238‑1 (MQ=255) gCCTGACCTTTTTTGTTTTTTGCCCGGTCGGG‑TCAACGTTATGAGGTGGGGATGCCGTACTAATTAACATCAGTGTAACAGTGCGGATCC‑TCCATAAAATGCCCCTCGTGACCTACAA‑TCTGTCAACAGAATGTGAAAA‑CGTCAATACAGCCAACCGGGATTTACACCAACGGTGAGAATCCACAAACAAAGATTAAAAAAACTTCAAACAGCTATTTGCAGCAGAGAAATTTGTGCTACTCCAACATGAc > 1:344300/1‑251 (MQ=255) ccTGACCTTTTTTGTTTTTTGCCCGGTCGGG‑TCAACGTTATGAGGTGGGGATGCCGTACTAATTAACATCAGTGTAACAGTGCGGATCC‑TCCATAAAATGCCCCTCGTGACCTACAA‑TCTGTCAACAGAATGTGAAAA‑CGTCAATACAGCCAACCGGGATTTACACCAACGGTGAGAATCCacaaacaa < 2:240429/189‑1 (MQ=255) ccTGACCTTTTTTGTTTTTTGCCCGGTCGGG‑TCAACGTTATGAGGTGGGGATGCCGTACTAATTAACATCAGTGTAACAGTGCGGATCC‑TCCATAAAATGCCCCTCGTGACCTACAA‑TCTGTCAACAGAATGTGAAAA‑CGTCAATACAGCCAACCGGGATTTACACCAACGGTGAGAATCCacaaacaa > 1:240429/1‑189 (MQ=255) tttttgtgttttgCCCGGTCGGG‑TCATCGTTATGATGTGGGGATGCCGTACTAATTAACATCAGTGTAACAGTGCGGATCC‑TCCATAAAATGCCCCTCGTGACCTACAA‑TCTGTCAACAGAATGTGAAAA‑CGTCAATACAGCCAACCGGGATTTACACCAACGGTGAGAATCCACAAACAAAGATTAAAAAAACTTCATACAGCTATTTGCAGCAGAGAAATTTGTGCTACGCCAACATGACCAGAACac < 2:153469/250‑2 (MQ=255) ttgttttttgCCCGGTCGGG‑TCAACGTTATGAGGTGGGGATGCCGTACTAATTAACATCAGTGTAACAGTGCGGATCC‑TCCATAAAATGCCCCTCGTGACCTACAA‑TCTGTCAACAGAATGTGAAAA‑CGTCAATACAGCCAACCGGGATTTACACCAACGGTGAGAATCCACAAACAAAGATTAAAAAAACTTCAAACAGCTATTTGCAGCAGAGAAATTTGTGCTACTCCAACATGACCAGAACAATc > 2:280007/1‑249 (MQ=255) ggtttgggCCCGGTCGGG‑GCAACGTTATGAGGTGGGGATGCCGTACTAATTAACATCATTGTAACAGTGCGGATCC‑TCCATAAAATGCCCCGCGTGACCTACAA‑TCTGTCAACAGAATGTGAAAA‑CGTCAATACAGCCAACCGGGATTTACACCAACGGTGAGAATCCACAAACAAAGATTAAAAAAACTTCAAACAGCTATTTGCAGCAGAGAAATTTGTGCTACTCCAACATGACCAGAACAATCAGCt < 1:565350/244‑1 (MQ=255) gCCCGGTCGGG‑TCAACGTTATGAGGTGGGGATTCCGTACTTATTAACATCAGTGTAACAGTGCGGAACC‑TCCATAAAATGCCCCTCGTGACCTACAA‑TCTGTCAACAGAATGTGAAAA‑CGACAATACAGCCAACCGGTATTTACACCAACGGTGAGAATCCACAAACAAAGATTAAAAAAACTTCAAACAGCTATTTTCAGCAGAGAAATTTGTGCTACTCCAACATGACCAGAACAATCAGCTTAAGAtt < 2:222657/251‑1 (MQ=255) cGGTCGGG‑TCAACGTTATGAGGTGGGGATGCCGTACTAATTAACATCAGTGTAACAGTGCGGATCC‑TCCATAAAATGCCCCTCGTGACCTACAA‑TCTGTCAACAGAATGTGAAAA‑CGTCAATACAGCCAACCGGGATTTACACCAACGGTGAGAATCCACAAACAAAGATTAAAAAAACTTCAAACAGCTATTTGCAGCAGAGAAATTTGTGCTACTCCAACATGACCAGAACAATCAGCTTAATATTTAg < 2:377030/251‑1 (MQ=255) gTCGGG‑TCAACGTTATGAGGTGGGGATTCCGTACTAATTAACATCAGTGTAACAGTGCGGATCC‑TCCATAAAATGCCCCTCGTGACCTACAA‑TCTGTCAACAGAATGTGAAAA‑CGTCAATACAGCCAACCGGGATTTACACCAACGGTGAGAATCCACAAACAAAGATTAAAAAAACTTCAAACAGCTATTTGCAGCAGAGAAATTTGTGCTACTCCAACATGACCAGAACAATCAGCTTAATATTTAGCa < 2:539425/251‑1 (MQ=255) gTCGGG‑TCAACGTTATGAGGTGGGGATGCCGTACTAATTAACATCAGTGTAACAGTGCGGATCC‑TCCATAAAATGCCCCTCGTGACCTACAA‑TCTGTCAACAGAATGTGAAAA‑CGTCAATACAGCCAACCGGGATTTACACCAACGGTGAGAATCCACAAACAAAGATTAAAAAAACTTCAAACAGCTATTTGCAGCAGAGAAATTTGTGCTACTCCAACATGACCAGAACAATCAGCTTAATATTTAGc > 2:225545/1‑250 (MQ=255) cGGG‑TCAACGTTATGAGGTGGGGATGCCGTACTAATTAACATCAGTGTAACAGTGCGGATCC‑TCCATAAAATGCCCCTCGTGACCTACAA‑TCTGTCAACAGAATGTGAAAA‑CGTCAATACAGCCAACCGGGATTTACACCAACGGTGAGAATCCACAAACAAAGATTAAAAAAACTTCAAACAGCTATTTGCAGCAGAGAAATTTGTGCTACTCCAACATGACCAGAACAATCAGCTTAATATTTAGCAAc < 1:277653/251‑1 (MQ=255) gtg‑TCAACGTTATGAGGTGGGGAAGCCGTACTAATTAACATCAGTGTAACAGTGCGGATCC‑TCCATAAAATGCCCCTCGTGACCTACAA‑TCTGTCAACAGAATGTGAAAA‑CGCCAATACAGCCAACCGGGAATTACACCAACGGTGAGAATCCACAAACAAAGATTAAAAAAACTTCAAACAGCTATTTGCAGCAGAGAAATTTGTGCTACTCCAACATGACCAGAACAATCAGCTTAATATTTAGCAACa < 2:84951/249‑1 (MQ=255) gATGCCGTACTAATTAACATCAGTGTAACAGTGCGGATCC‑TCCATAAAATGCCCCTCGTGACCTACAA‑TCTGTCAACAGAATGTGAAAA‑CGTCAATACAGCCAACCGGGATTTACACCAACGGTGAGAATCCACAAACAAAGATTAAAAAAACTTCAAACAGCTATTTGCAGCAGAGAAATTTGTGCTACTCCAACATGACCAGAACAATCAGCTTAATATTGAGCAACATTTGGTGATTAAGTTTTATGc < 2:142285/251‑1 (MQ=255) aTGCCGTACTAATTAGCATCAGTGTAACAGTGCGGGTCC‑TCCATAAAATGCCCCTCGTGAACTACAA‑TCTGTCAACAGAATGTGAAAA‑CGTCAATACAGCCAACCGGGATTTACACCAACGGTGAGAATCCACAAACAAAGATTAAAAAAACTTCAAACAGCTATTTGCAGCAGAGAAATTTGTGCTACTCCAACATGACCAGAACAATCAGCTTAATATTTAGCAACATTTGGTGATTAAGTTTTATGc > 2:746991/1‑250 (MQ=255) gCCGTACTAATTAACATCAGTGTAACAGTGCGGATCC‑TCCATAAAATGCCCCTCGTGACCTACAA‑TCTGTCAACAGAATGTGAAAA‑CGTCAATACAGCCAACCGGGATTTACACCAACGGTGAGAATCCACAAACAAAGATTAAAAAAACTTCAAACAGCTATTTGCAGCAGAGAAATTTGTGCTACTCCAACATGACCAGAACAATCAGCTTAATATTTAGCAACATTTGGTGATTAAGTTTTATGCAtt > 1:80953/1‑251 (MQ=255) cGTACTAATTAACATCAGTGTAACCGGGCGGATCC‑TCCATAAAATGCCCCTCGTGACCTACAA‑TCTGTCAACAGAATGTGAAAA‑CGACACTACAGCCAAACGGGATTTACACCAACGGTGAGAATCCACACCCAAAGATTAAAAAAACTTCAAACAGCTATTTGCAGCGGAGAAATTTGTGCTACTCCAACATGACCAGAACAATCAGCTTAATATTTAGAAACATTTGGTGATTAAGTTTTATGCAttt > 1:106824/1‑250 (MQ=255) tACTAATTAACATCAGTGTAACAGTGCGGATCC‑TCCATAAAATGCCCCTCGTGACCTACAA‑TCTGTCAACAGAATGTGAAAA‑CGTCAATACAGCCAACCGGGATTTACACCAACGGTGAGAATCCACAAACAAAGATTAAAAAAACTTCAAACAGCTATTTGCAGCAGAGAAATTTGTGCTACTCCAACATGACCAGAACAATCAGCTTAATATTTAGCAACATTTGGTGATTAAGTTTTATGCATTTAAt > 2:285026/1‑251 (MQ=255) aTTAACATCAGTGTAACAGTGCGGCTCC‑TCCATAAAATGCCCCTCGTGACCTACGA‑TCTATCAACAGAATGTGAAAA‑CGTCAATACAGCCAACCGGGATTTACACCAACGGTGAGAATCCACAAACAAAGATTAAAAAAACTTCAAACAGCTAt > 2:284567/1‑154 (MQ=255) aTTAACATCAGTGTAACAGTGCGGATCC‑TCCATAAAATGCCCCTCGTGACCTACGA‑TCTATCAACAGAATGTGAAAA‑CGTCAATACAGCCAACCGGGATTTACACCAACGGTGAGAATCCACAAACAAAGATTAAAAAAACTTCAAACAGCTag < 1:284567/154‑2 (MQ=255) aTTAACATCAGTGTAACAGTGCGGATCC‑TCCATAAAATGCCCCTCGTGACCTACAA‑TCTGTCAACAGAATGTGAAAA‑CGTCAATACAGCCAACCGGGATTTACACCAACGGTGAGAATCCACAAACAAAGATTAAAAAAACTTCAAACAGCTATTTGCAGCAGAGAAATTTGTGCTACTCCAACATGACCAGAACAATCAGCTTAATATTTAGCAACATTTGGTGATTAAGTTTTATGCATTTAATGaaa > 2:283192/1‑250 (MQ=255) cAGTGCGGATCC‑TCCATAAAATGCCCCTCGTGACCTACAA‑TCTGGCAACAGAATGTGAAAA‑CGTCAATACAGCCAACCGGGATTTACACCAACGGTGAGAATCCACAAACAAAGATTAAAAAAACTTCAAACAGCTATTTGCAGCAGAGAAATTTGTGCTACTCCAACATGACCAGAACAATCAGCTTAATATTTAGCAACATTTGGTGATTAAGTTTTATGCATTTAATGAAAAAAATCTGAGGAAAAgg < 1:208616/251‑1 (MQ=255) aTCC‑TCCATAAAATGCCCCTCGTGACCTACAA‑TCTGTCAACAGAATGTGAAAA‑CGTCAATACAGCCAACCGGGATTTACACCAACGGTGAGAATCCACAAACAAAGATTAAAAAAACTTCAAACAGCTATTTGCAGCAGAGAAATTTGTGCTACTCCAACATGACCAGAACAATCAGCTTAATATGTAGCAACATTTGGTGATTAAGTTTTATGCATTTAATGAAAAAAATCTGAGGAAAAGGTGGATATc < 2:340067/251‑1 (MQ=255) aaaaTGCCCCTCGTGACCTACAA‑TCTGTCAACAGAATGTGAAAA‑CGTCAATACAGCCAACCGGGATTTACACCAACGGTGAGAATCCACAAACAAAGATTAAAAAAACTTCAAACAGCTATTTGCAGCAGAGAAATTTGTGCTACTCCAACATGACCAGAACAATCAGCTTAATATTTAGCAACATTTGGTGATTAAGTTTTATGCATTTAATGAAAAAAATCTGAGGAAAAGGTGGATATCTGAGCGAtt > 1:79589/1‑251 (MQ=255) gCCCCTCGTGACCTACAA‑TCTGTCAACAGAATGTGAAAA‑CGTCAATACAGCCAACCGGGATTTACACCAACGGTGAGAATCCACAAACAAAGATTAAAAAAACTTCAAACAGCTATTTGCAGCAGAGAAATTTGTGCTACTCCAACATGACCAGAACAATCAGCTTAACATTTAGCAACATTTGATGATTAAGTTTTATGCATTTAATGAAAAAAATCTGAGGAAAAGGTGGATATCTGAGCGATTAATa < 1:743489/250‑1 (MQ=255) gTGACCTACAA‑TCTGTCAACAGAATGTGAAAA‑CGTCAATACAGCCAACCGGGATTTACACCAACGGTGAGAATCCACAAACAAAGATTAAAAAAACTTCAAACAGCTATTTGCAGCAGAGAAATTTGTGCTACTCCAACATGACCAGAACAATCAGCTTAATATTTAGCAACATTTGGTGATTAAGTTTTATGCATTTAATGAAAAAAATCTGAGGAAAAGGTGGATATCTGAGCGATTAATACCATGAAc < 1:196539/251‑1 (MQ=255) aa‑TCTGTCAACAGAATGTGAAAA‑CGTCAATACAGCCAACCGGGATTTACACCAACGGTGAGAATCCACAAACAAAGATTAAAAAAACTTCAAACAGCTATTTGCAGCAGAGAAATTTGTGCTACTCCAACATGACCAGAACAATCAGCTTAATATTTAGCAACATTTg < 2:388129/168‑1 (MQ=255) aa‑TCTGTCAACAGAATGTGAAAA‑CGTCAATACAGCCAACCGGGATTTACACCAACGGTGAGAATCCACAAACAAAGATTAAAAAAACTTCAAACAGCTATTTGCAGCAGAGAAATTTGTGCTACTCCAACATGACCAGAACAATCAGCTTAATATTTAGCAACATTTg > 1:388129/1‑168 (MQ=255) a‑TCTGTCAACAGAATGTGAAAA‑CGTCAATACAGCCAACCGGGATTTACACCAACGGTGAGAATCCACAAACAAAGATTAAAAAAACTTCAAACAGCTATTTGCAGCAGAGAAATTTGTGCTACTCCAACATGACCAGAACAATCAGCTTAATATTTAGCAACATTTGGTGATTAAGTTTTATGCATTTAATGAAAAAAATCTGAGGAAAAGGTGGATATCTGAGCGATTAATACCATGAACGCTAAAACGc > 1:789531/1‑251 (MQ=255) cTGTCAACAGAATGTGAAAA‑CGTCAATACAGCCAACCGGGATTTACACCAACGGTGAGAATCCACAAACAAAGATTAAAAAAACTTCAAACAGCTATTTGCAGCAGAGAAATTTGTGCTACTCCAACATGACCAGAACAATCAGCTTAATATTTAGCAACATTTGGTGATTAAGTTTTATGCATTTAATGAAAAAAATCTGAGGAAAAGGTGGATATCTGAGCGATTAATACCATGAACGCTAAAACGcac > 1:779709/1‑251 (MQ=255) gTCAACAGAATGTGAAAA‑CGTCAATACAGCCAACCGGGATTTACACCAACGGTGAGAATCCACAAACAAAGATTAAAAAAACTTCAAACAGCTATTTGCAGCAGAGAAATTTGTGCTACTCCAACATGACCAGAACAATCAGCTTAATATTTAGCAACATTTGGTGATTAAGTTTTATGCATTTAATGAAAAAAATCTGAGGAAAAGGTGGATATCTGAGCGATTAATACCATGAACGCTAAAACGcac > 2:319336/1‑249 (MQ=255) gTCAACAGAATGTGAAAA‑CGTCAATACAGCCAACCGGGATTTACACCAACGGTGAGAATCCACAAACAAAGATTAAAAAAACGTCAAACAGCTATTTGCAGCAGAGAAATTTGTGCTACTCCAACATGACCAGAACAATCAGCTTAATATTTAGCAACATTTGGTGATTAAGTTTTATGCATTTAATGAAAAAAATCTGAGGAAAAGGTGGATATCTGAGCGATTAATACCATGAACGCTAAAACGc < 2:79589/247‑1 (MQ=255) aaTGTGAAAA‑CGACAATACAGCCAACCGGGATTTACACCAACGGTGAGAATCCACAAACAAAGATTAAAAAAACTTCAAACAGCTATTTGCAGCAGAGAAATTTGTGCTACTCCAACATGACCAGAACAATCAGCTTAATATTAAGCAACAGTTTGTGATTAAGTTTTATGCATTTAATGAAAAAAATCTGAGGAAAAGGGGGATATCTGAGCGATTAATACCATGAACGCTAAAACGCACAGCGGAAAAt < 2:80953/251‑1 (MQ=255) aTGTGAAAA‑CGTCAATACAGCCAACCGGGATTTACACCAACGGTGAGAATCCACAAACAAAGATTAAAAAAACTTCAAACAGCTATTTGCAGCAGAGAAATTTGTGCTACTCCAACATGACCAGAACAATCAGCTTAATATTTAGCAACATTTGGTGAtt < 1:266919/160‑1 (MQ=255) aTGTGAAAA‑CGTCAATACAGCCAACCGGGATTTACACCAACGGTGAGAATCCACAAACAAAGATTAAAAAAACTTCAAACAGCTATTTGCAGCAGAGAAATTTGTGCTACTCCAACATGACCAGAACAATCAGCTTAATATTTAGCAACATTTGGTGAtt > 2:266919/1‑160 (MQ=255) aaaa‑CGTCAATACAGCCAAACGGGATTTACACCAACGGTGAGAATCCACAAACAAAGATTAAAAAAACTTCAAACAGCTATTTGCAGCAGAGAAATTTGGGCTACTCCAACATGACCAGAACAATCAGCTTAATATTTAGCAACATTTGGTGATTAAGTTTTATGCATTTAATGAAAAAAATCTGAGGAAAAGGTGGAGATCTGAGCGATTAATACCATGAACGCTAAAACGCACAGCGGAAAATGCCAgg < 2:683143/251‑1 (MQ=255) cAGCCAACCGGGATTTACACCAACGGTGAGAATCCACAAACAAAGATTAAAAAAACTTCAAACAGCTATTTGCAGCAGAGAAATTTGTGCTACTCCAACATGACCAGAACAATCAGCTTAATATTTAGCAACATTTGGTGATTAAGTTTTATGAATTTAATGAAAAAAATCTGAGGAAAAGGTGGATATCTGAGCGATTAATACCATGAACGCTAAAACGCACAGCGGAAAATGCCAGGGCCAGCCATa > 1:807167/1‑249 (MQ=255) ccAACCGGGATTTACACCAACGGTGAGAATCCACAAACAAAGATTAAAAAAACTTCAAACAGCTATTTGCAGCAGAGAAATTTGTGCTACTCCAACATGACCAGAACAATCAGCTTAATATTTAGCAACATTTGGTGATTAAGTTTTATGCATTTAATGAAAAAAATCTGAGGAAAAGGTGGATATCTGAGCGATTAATACCATGAACGCTAAAACGCACAGCGGAAAATGCCAGGGCCAGCCATAAGTaa < 1:280007/251‑1 (MQ=255) ccAACCGGGATTTACACCAACGGTGAGAATACACAAACAAAGATTAAAAAAACTTCAAACAGCTATTTGCAGCAGAGAAATTTGGGCTACTCCAACATGACCAGAACAATCAGCTTAATATTTAGCAACATTTGGTGATTAAGTTTTATGCATTTAATGAAAAAAATCTGAGGAAAAGGTGGATATCTGAGCGATTAATACCATGAACGCTAAAACGCACAGCGGAAAATGCCAGGGCCAGACATAAGTaa < 2:475974/251‑1 (MQ=255) gggATTTACACCAACGGTGAGAATCCCCAAACAAAGATTAAAAAAGCTTCAAACAGCTAGTTGCATCAGAGAAATTTGTGCTACTCCAACATGACCAGAACAATCAGTTTAATATTTAGCAACATTTGGTGATTAAGTTTTATTCATTTAATGAAAAAAAACTGAGGAAAAGGTGGATATCTGAGCGATTAATACCAGGAACGCTAAAACGCACAGCGGAAAAGTCCAGGGCCAGCCATAAGTATCGCaaa < 1:520875/251‑1 (MQ=255) gggATTTACACCAACGGTGAGAATCCACAAACAAAGATTAAAAAAACTTCAAACAGCTATTTGCAGCAGAGAAATTTGTGCTACTCCAACATGACCAGAACAATCAGCTTAATATTTAGCAACATTTGGTGATTAAGTTTTATGCATTTAATGAAAAAAATCTGAGGAAAAGGTGGATATCTGAGCGATTAATACCATGAACGCTAAAACGCACAGCGGAAAATGCCAGGGCCAGCCATAAGTAACGCaaa < 1:486989/251‑1 (MQ=255) tttACACCAACGGTGAGAATCCACAAACAAAGATTAAAAAAACTTCAAACAGCTATTTGCAGCAGAGAAATTTGTGCTACTCCAACATGACCAGAACAATCAGCTTAATATTTAGCAACATTTGGTGATTAAGTTTTATGCATTTAATGAAAAAAATCTGAGGAAAAGGTGGATATCTGAGCGATTAATACCATGAACGCTAAAACGCACAGCGGAAAATGCCAGGGCCAGCCATAAGTAACGCaaaaaa > 1:562885/1‑250 (MQ=255) tACACCAACGGTGAGAATCCACAAACAAAGATTAAAAAAACTTCAAACAGCTATTTGCAGCAGAGAAATTTGTGCTACTCCAACATGACCAGAACAATCAGCTTAATATTTAGCAACATTTGGTGATTAAGTTTTATGCATTTAATGAAAAAAATCTGAGGAAAAGGTGGATATCTGAGCGATTAATACCATGAACGCTAAAACGCACAGCGGAAAATGCCAGGGCCAGCCATAAGAAACGCaaaaaa > 1:17965/1‑248 (MQ=255) acacCAACGGTGAGAATCCACAAACAAAGATTAAAAAAACTTCAAACAGCTATTTGCAGCAGAGAAATTTGTGCTACTCCAACATGACCAGAACAATCAGCTTAATATTTAGCAACATTTGGTGATTAAGTTTTATGCATTTAATGAAAAAAATCTGAGGAAAAGGTGGATATCTGAGCGATTAATACCATGAACGCTAAAACGCACAGCGGAAAATGCCAGGGCCAGCCATAAGTAACGCa > 1:411665/1‑242 (MQ=255) aaacCAACGGGGAGAATCCACAAACAAAGATTAAAAAAACTTCAAACAGCTATTTGCAGCAGAGAAATTTGTGCTACTCCAACATGACCAGAACAATCAGCTTAATATTTAGCAACATTTGGTGATTAAGTTTTATGCATTTAATGAAAAAAATCTGAGGAAAAGGTGGATATCTGAGCGATTAATACCATGAACGCTAAAACGCACAGCGGAAAATGCCAGGGCCAGCCATAAGTAACGCa < 2:411665/240‑1 (MQ=255) ccACAAACAAAGATTAAAAAAACTTCAAACAGCTATTTGCAGCAGAGAAATTTGTGCTACTCCAACATGACCAGAACAATCAGCTTAATATTTAGCAACATTTGGTGATTAAGTTTTATGCATTTAATGAAAAAAATCTGAGGAAAAGGTGGATATCTGAGCGATTAATACCATGAACGCTAAAACGCACAGCGGAAAATGCCAGGGCCAGCCATAAGTAACGGAAAAAAAGATTTAAGCAAATATaaaa > 2:553553/1‑250 (MQ=255) | GCATTATTCTGCTCCAATTGTGATGTTTGTTGTTTTAACCCTTTGCAGTGGGTTGTCGCTGCCTGACCTTTTTTGTTTTTTGCCCGGTCGGG‑TCAACGTTATGAGGTGGGGATGCCGTACTAATTAACATCAGTGTAACAGTGCGGATCC‑TCCATAAAATGCCCCTCGTGACCTACAA‑TCTGTCAACAGAATGTGAAAA‑CGTCAATACAGCCAACCGGGATTTACACCAACGGTGAGAATCCACACACAAAGATTAAAAAAACTTCAAACAGCTATTTGCAGCAGAGAAATTTGTGCTACTCCAACATGACCAGAACAATCAGCTTAATATTTAGCAACATTTGGTGATTAAGTTTTATGCATTTAATGAAAAAAATCTGAGGAAAAGGTGGATATCTGAGCGATTAATACCATGAACGCTAAAACGCACAGCGGAAAATGCCAGGGCCAGCCATAAGTAACGCAAAAAAAGATTTAAGCAAATATAAAA > NC_000913/3707702‑3708191 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 17 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |