| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 4,213,765 | 0 | A | C | 37.2% | 56.7 / 11.0 | 43 | V120G (GTG→GGG) | yjaB | peptidyl‑lysine N‑acetyltransferase YjaB |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (26/1); new base C (0/16); total (26/17) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.41e-11 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Rejected as consensus: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
GTCGCTGGGGCAACGTTAATGAAATATCGCCAGTTCCACATCCATGCGCAATCAGCGGTACTCAGTGATAGTGCGGTCATGGCAATGCTTAAGCAGAAATAATCGTGTCACCATTGGTGGGTACTAAACCTGAAGTTCAGCCCACCGGGATGAGAAAAAATCGCCTACGCCCCCACATACGCCAGATTCAGCAACGGATACGGTTTCCCCAAAT‑CGTCCACCTCAGAGCGTCCCGTAACCTTAAAACCCACCTTCTTATAGAACCCAACCGCCTGCTCATTTTGCTCATTAACGTTGGTTGTCAGTTCCGGTGCCATCGAGAGCGCATGCTCCACCAGCACCCGACCTACGCCGCAGCCGCGCACATCAGGATCGATAAACAGCGCATCCATATGCTGCCCACTTAGCAACATAAATCCAACCGGCTGATCCCGCTCATTAACCGCGACCCACAACGGCGCTTCCGGCAGGAAGGAACGAACTAGGTCCTCC > NC_000913/4213516‑4214007 | gTCGCTGGGGCAACGTTAATGAAATATCGCCAGTTCCACATCCATGCGCAATCAGCGGTACTCAGTGATAGTGCGGTCATGGCAATGCTTAAGCAGAAATAATCGTGTCACCATTGGTGGGTACTAAACCTGAAGTTCAGCCCACCGGGATGAGAAAAAATCGCCTACGCCCCCACATACGCCAGATTCAGCAACGGATACGGTTTCCCCAAAT‑CGTCCACCCCAGAGCGTCCCGTAACCTTAAAACCCAc > 2:135738/1‑251 (MQ=255) cGTTAATGAAATATCGCCAGTTCCACATCCATGCGCAATCAGCGGTACTCAGTGATAGTGCGGTCATGGCAATGCTTAAGCAGAAATAATCGTGTCACCATTGGTGGGTACTAAACCTGAAGTTCAGCCCACCGGGATGAGAAAAAATCGCCTACGCCCCCACATACGCCAGATTCAGCAACGGATACGGTTTCCCCAAAT‑CGTCCACCTCAGAGCGTCCCGTAACCTTAAAACCCACCTTCTTATAGAAc > 1:102226/1‑251 (MQ=255) cGCCAGTTCCACATCCATGCGCAATCAGCGGTACTCAGTGATAGTGCGGTCATGGCAATGCTTAAGCAGAAATAATCGTGTCACCATTGGTGGGTACTAAACCTGAAGTTCAGCCCACCGGGATGAGAAAAAATCGCCTACGCCCCCACATACGCCAGATTCAGCAACGGATACGGTTTCCCCAAAT‑CGTCCACCTCAGAGCGTCCCGTAACCTTAAAACCCACCTTCTTATAGAACCCAACCGCCTGCTc > 1:678234/1‑251 (MQ=255) aGTTCCACATCCATGCGCAATCAGCGGTACTCAGTGATAGTGCGGTCATGGCAATGCTTAAGCAGAAATAATCGTGTCACCATTGGTGGGTACTAAACCTGAAGTTCAGCCCACCGGGATGAGAAAAAATCGCCTACGCCCCCACATACGCCAGATTCAGCAACGGATACGGTTTCCCCAAAT‑CGTCCACCTCAGAGCGTCCCGTAACCTTAAAACCCACCTTCTTATAGAACCCAACCGCCTGCTCAttt > 2:698130/1‑251 (MQ=255) cATGCGCAATCAGCGGTACTCAGTGATAGTGCGGTCATGGCAATGCTTAAGCAGAAATAATCGTGTCACCATTGGTGGGTACTAAACCTGAAGTTCAGCCCACCGGGATGAGAAAAAATCGCCTACGCCCCCACATACGCCAGATTCAGCAACGGATACGGTTTCCCCAAAT‑CGTCCACCTCAGAGCGTCCCGTAACCTTAAAACCCACCTTCTTATAGAACCCAACCGCCTGCTCATTTTGCTCATTAAc > 1:209738/1‑251 (MQ=255) tGCGCAATCAGCGGTACTCAGTGATAGTGCGGTCATGGCAATGCTTAAGCAGAAATAATCGTGTCACCATTGGTGGGTACTAAACCTGAAGTTCAGCCCACCGGGATGAGAAAAAATCGCCTACGCCCCCACATACGCCAGATTCAGCAACGGATACGGTTTCCCCAAAT‑CGTCCACCTCAGAGCGTCCCGTAACCTTAAAACCCACCTTCTTATAGAACCCAACCGCCTGCTCATTTTGCTCATTAACgt > 1:613649/1‑251 (MQ=255) ccAGCGTTACTCAGGGATAGTGCGGTCATGCCAATGCTTAAGCAGAAATAATCGTGTCCCCATTGGGGGTTACTAACCCTGAAGTTCACCCCACCGGGATGAGAAAAAACCGCCTCCCCCCCCACATACGCCAGATTCAGCAACGAATACGGTTTCCCAAAAT‑CGTCCCCCTCAGAGCGCCCCGTAACTTTAAACCCCCCCTTCTTATAGAACCCAACCGCCTGCTCATTTTGCTCATTAACGTTGGTTGt < 2:307720/250‑1 (MQ=255) gTACTCAGTTATAGTGCGGTCATGGCAATGCTTAAGCAAAAAAAATGGTGCCCCCATTGGTGGGTCCTAAACCTGAAGTTCAGCCCACCGGGATGAGAAAAAACCGCCTACGCCCCCACATACGCCAGATTCAGCAACGGATACGGTTCCCCAAAAT‑CGTCCCCCTCAGAGCGTCCCGTATCCTTAAACCCCCCCTTCTTATAGACCCCAACCGCCTGCTCATTTTGCTCATTAACGTTGGTTGTCAGTTc < 1:381198/251‑1 (MQ=255) gTGATAGTGCGATCATGGCAATGCTTCAGCGGAAATACTCGTGTCACCATTGGTGGGTACTAAACCTGAAGTTCAGCCAACCGGGATGAGAAAAAATCGCCTAAGCCCCCACATACGCAAGATTCAGCAACGGATACGGTTTACCCAAAT‑CGTCCACCTCAGAGCATCCCGTAACCTTCAAACCCACCTTCTTATCTAACCCAACCTCATACTCCTTTTGCTCATTACAGTTGGTTGTCCGTTCCGGTGcc > 2:532872/1‑251 (MQ=255) tGATAGTGCGGTCATGGCAATGCTTAAGCAGAAATAATCGTGTCACCATTGGTGGGTACTAAACCTGAAGTTCAGCCCACCGGGATGAGAAAAAATCGCCTACGCCCCCACATACGCCAGATTCCGCACCGGATACGGTTTCCCCAAAT‑CGTCCACCTCAGCGCGTCCCGTAACCTTAAAACCCACCTTCTTATAGAACCCAACCGCCTGCTCATTTTGCTCATTAACGTTGGTTGTCAGTTACGGTGcc > 1:781758/1‑250 (MQ=255) gATAGTGCGGTCATGGCAATGCTTAAGCAGAAATAAGCGTGTCACCATGGGTGGGTACTAAACCTGAAGTTCACCCCACCGGGATGAGAAAAAATCGCCTACGCCCCCACATACGCCAGATCCAGAACCGAATACGGTTTCCCCAAAT‑CGTCCACCTCAGAGCGCCCCGTACCCTTAAACCCCCCCTTCTTAAATAACCCAACCGCCTGCTCATTTTGCTCATTATCGTTGGTTGTCAGTTCCGGTGCCAt < 1:258587/251‑1 (MQ=255) aattcTTAAGCAGAAAAAATCGTGTCCCCATTGGTGGGTACTAAACCGAAAGTCCAGCCCACCGGGATGAAAAAAAATCGCCTACCCCCCCACATACGCCAGATTCAGCAACGGATACGTTTTCCCCAAAT‑CGCCCCCCTCAGAGCGTCCCTTACCCTAAAACCCCCCCTTCTTATAGAACCCAACCGCCTGCTCa < 1:698121/192‑1 (MQ=255) aaTGCTTAAGCAGAAATAATCGTGTCACCATTGGTGGGTACTAAACCTGAAGTTCAGCCCACCGGGATGAGAAAAAATCGCCTACGCCCCCACATACGCCAGATTCAGCAACGGATACGGTTTCCCCAAAT‑CGTCCACCTCAGAGCGTCCCGTAACCTTAAAACCCACCTTCTTATAGAACCCAACCGCCTGCTCa > 2:698121/1‑196 (MQ=255) aTGCTTAAGCAGAAATAATCGTGTCACCTTTGGTGGTTACTAAACCTGAAGTTCACCCCACCGGGATGAGAAAAAATCGCCACCGCCCCCCCATACCCCAGTTTCAGCAACGGATACGTTTTCCCCAAAT‑CGTCCCCCTCAGAGCGTCCCGTAACCTTAAACCCCCCCTTCTTATAGACCCCAACCGCCTGCTCATTTTGCTCATTAACGTTGGTTGTCAGTTCCGGTGCCATCGAGAGCGCATGCTccac < 1:204591/251‑1 (MQ=255) aaGCAGAAATAATCGTGTCACCATTGGTGGGTACTAACCCTGAAGATCAGCCCACCGGGATGAGAAAAAATCGCCTACGCCCCCACATACGCCAGATTCAGCAACGGATACGGTTTCCCCAAAT‑CGTCCACCTCAGAGCGTCCCGTAACCTTAAAACCCACCTTCTTATAGAACCCAACCGCCTGCTCATTTTGCTCATTAACGTTGGTTGTCAGTTCCGGTGCCATCGAGAGCGCATGCTCCACCAGCAc > 1:212741/1‑251 (MQ=255) aaGAAATAACCGTGTCCCCATTGGGGGGTACTAACCCTGAAGTTCAGCCCACCGGAATGAAAAAAAACCGCCTTCGCCCCCACTTCCGCCAGATCCAGCAACGGATACGGTTTCCCCAAAT‑CGTCCCCCACAGAGCGTCCCGTAACTTTAAACCCCACCTTCTTATAGACCCCAACCGCCTGCTCATTTTGCTCATTAACGTTGGTTGTCAGTACCGGTGCCATCGAGAGCGCATGCTCCACCAGCACCCg < 1:277811/250‑1 (MQ=255) gAAATAATCGTGTCACCATTGGTGGGTACTAAACCTGAAGTTCAGCCCACCGGGATGAGAAAAAATCGCCTACGCCCCCACATACGCCAGATTCAGCAACGGATACGGTTTCCCCAAAT‑CGTCCACCTCAGAGCGTCCCGTAACCTTAAAACCCACCTTCTTATAGAACCCAACCGCCTGCTCATTTTGCTCATTAACGTTGGTTGTCAGTTCCGGTGCCATCGAGAGCGCATGCTCCACCAGCACCCGAc > 1:156162/1‑251 (MQ=255) cATTGGTGGTTACTAACCCGGAATTCCAGCCCTCGGGGTTAACAAAAAACCGCCTACGCCCCCACAAACGCCAGATTCAGCAACGGATCCGGTTTCCCCAAAT‑CGTCCACCTCAGCGCGTCCGTTAACCTAAAAACCCCCCTTCTTATAGAACCCAACCGCCTGCTCATTTTGCTCATTAACGTTGGTTGTCAGTTCCGGTGCCATCGAGAGCGCATGCTCCACCAGCACCCGACCTACGCCGCAGCcgcg < 2:166797/251‑1 (MQ=255) tACTAAACCTGAAGTTCAGCCCACCGGGATGAGAAAAAATCGCCTACGCCCCCACATACGCCAGATTCAGCAACGGATACGGTTTCCCCAAAT‑CGTCCACCTCAGAGCGTCCCGTAACCTTAAAACCCACCTTCTTATAGAACCCAACCGCCTGCTCATTTTGCTCATTAACGTTGGTTGTCAGTTCCGGTGCCATCGAGAGCGCATGCTCCACCAGCACCCGACCTACGCCGCAGCCGCGCACATCAgg > 1:442399/1‑250 (MQ=255) accggAAGTTCAGCCCATGGGGAGAAAAAAAAATCGCCCCCGCCCCCATATACACCAGATCCCGCAACGGATACGGTTCCCCAAAAC‑CGCCCCCCTCAGAGCGTCCGGTACCCTTAACACCCCCCTTTTTATAAACCCCAACCGCCTGCTCATTTTGCTCATTAACGTTGGTTGTCAGTTCCGGTGCCATCGAGAGCGCATGCTCCACCAGCACCCGACCTACGCCGCAGCCGCGCACATCAGGATCGATa < 1:127527/247‑1 (MQ=255) cccACCGGGATGAGAAAAAACCGCCTCCGCCCCCACATCCGCCAGATCCATCAACGGATACGGTTTCCCCAAAT‑CGTCCACCTCAGAGCGTCCCGTAACCTTAAACCCCCCCTTCTTATAGACCCCAACCGCCTGCTCATTTTGCTCATTAACGTTGGTTGTCAGTTCCGGTGCCATCGAGAGCGCATGCTCCACCAGCACCCGACCTACGCCGCAGCCGCGCACATCAGGATCGATAAACAGCGCATCCa < 1:164529/251‑1 (MQ=255) gaAAAAATCGCCTACGCCCCCACATACGCCAGATTCAGCAACGGATACGGTTTCCCCAAAT‑CGTCCACCTCAGAGCGTCCCGTAACCTTAAAACCCACCTTCTTATAGAACCCAACCGCCTGCTCATTTTGCTCATTAACGTTGGTTGTCAGTTCCGGTGCCATCGAGAGCGCATGCTCCACCAGCACCCGACCTACGCCCCAGCCGCGCACATCAGGATCGATAAACAGCGCATCAATATGCTGCCCACt > 2:597142/1‑251 (MQ=255) aaaaTCGCCTACGCCCCCACATACGCCAGATTCAGCAACGGATACGGTTTCCCCAAAT‑CGTCCACCTCAGAGCGTCCCGTAACCTTAAAACCCACCTTCTTATAGAACCCAACCGCCTGCTCATTTTGCTCATTAACGTTGGTTGTCAGTTCCGGTGCCATCGAGAGCGCATGCTCCACCAGCACCCGACCTACGCCGCAGCCGCGCACATCAGGATCGATAAACAGCGCATCCATATGCTGCCCACtt > 1:520638/1‑249 (MQ=255) aaaTCGCCTACGCCCCCACATACCCCAGATTCAGCAACGACTACGGTT‑CCCCAAATTCGCCCACCTCAGAGCGCCCCTAAACCTAAACACCCCCCTTCTTATAGACCCCAACCGCCTGCTCATTTTGCTCATTAACGTTGGTTGTCAGTTCCGGTGCCATCGAGAGCGCATGCTCCACCAGCACCCGACCTACGCCGCAGCCGCGCACATCAGGATCGATAAACAGCGCATCCATATGCTGCCCACTTAGc < 2:628655/251‑1 (MQ=255) aagcGCCGACGCCCCCACATCCGCAAGATTCAGCAACGGATACGGTTTCCCAAAAT‑CGCCCCCCTCAGGGCGCCCCGTAACCTTAAAACCCCCCTTCTTATAGACCCCAACCGCCTGCTCATTTTGCTCATTAACGTTGGTTGTCAGTTCCGGTGCCATCGAGAGCGCATGCTCCACCAGCACCCGACCTACGCCGCAGCCGCGCACATCAGGATCGATAAACAGCGCATCCATATGCTGCCCACTTAGCa < 1:320482/248‑1 (MQ=255) ccccTACCCCCCCACATCCCCCAAATTCACCAACGTATCCGTTTTCCCCAAAC‑CTCCCCCCTCAGAGCGCCCCGTACCCTTAAACCCCCCCTTCTTATAGACCCCAACCGCCTGCTCATTTTGCTCATTAACGTTGGTTGTCAGTTCCGGTGCCATCGAGAGCGCATGCTCCACCAGCACCCGACCTACGCCGCAGCCGCGCACATCAGGATCGATAAACAGCGCATCCATATGCTGCCCACTTAGCAACa < 1:182148/249‑1 (MQ=255) tACGCCCCCACATACGCCAGATTCAGCAACGGATACGGTTTCCCCAAAT‑CGTCCACCTCAGAGCGTCCCGTAACCTTAAAACCCACCTTCTTATAGAACCCAACCGCCTGCTCATTTTGCTCATTAACGTTGGTTGTCAGTTCCGGTGCCATCGAGAGCGCATGCTCCACCAGCACCCGACCTACGCCGCAGCCGCGCACATCAGGATCGATAAACAGCGCATCCATATGCTGCCCACTTAGCAACATaa > 1:196265/1‑250 (MQ=255) cacaTACGCCAGATTCAGCAACGGATACGGTTTCCCCAAAT‑CGTCCACCTCAGAGCGTCCCGTAACCTTAAAACCCACCTTCTTATAGAACCCAACCGCCTGCTCATTTTGCTCATTAACGTTGGTTGTCAGTTCCGGTGCCATCGAGAGCGCATGCTCCACCAGCACCCGACCTACGCCGCAGCCGCGCACATCAGGATCGATAAACAGCGCATCCATAtgcggc > 2:555754/1‑223 (MQ=255) cacaTACGCCAGATCCAGCAACGGATACGGTTCCCCAAAAC‑CGGCCCCCTCAGAGCGCCCCGTACCCTAAAACCCCCCCTTTTTATAGAACCCAACCGCCTGCTCATTTTGCTCATTAACGTTGGTTGTCAGTTCCGGTGCCATCGAGAGCGCATGCTCCACCAGCACCCGACCTACGCCGCAGCCGCGCACATCAGGATCGATAAACAGCGCATCCATAtgctgc < 1:555754/226‑1 (MQ=255) gATTCAGCAACGGATACGGTTTCCCCAAAT‑CGTCCACCTCAGAGCGTCCCGTAACCTTAAAACCCACCTTCTTATAGAACCCAACCGCCTGCTCATTTTGCTCATTAACGTTGGTTGTCAGTTCCGGTGCCATCGAGAGCGCATGCTCCACCAGCACCCGACCTACGCCGCAGCCGCGCACATCAGGATCGATAAACAGCGCATCCATATGCTGCCCACTTAGCAACATAAATCCAACCGGCTGATCCCGc > 1:755675/1‑251 (MQ=255) tttCAGCAACGGCTACGGTTTCCCCAAAT‑CGTCCCCCTCAGAGCGTCCCGTAACCTTAAAACCCACCTTCTTATAGAACCCAACCGCCTGCTCATTTTGCTCATTAACGTTGGTTGTCAGTTCCGGTGCCATCGAGAGCGCATGCTCCACCAGCACCCGACCTACGCCGCAGCCGCGCACATCCGGATCGATAAACAGCGCATCCATATGCTGCCCACTTAGCACCATAACTCCAACCGGCTAATCACGcc > 2:10212/2‑250 (MQ=255) aaCGGATACGGTTTCCCCAAAT‑CGTCCACCTCAGAGCGTCCCGTAACCTTAAAACCCACCTTCTTATAGAACCCAACCGCCTGCTCATTTTGCTCATTAACGTTGGTTGTCAGTTCCGGTGCCATCGAGAGCGCATGCTCCACCAGCACCCGACCTACGCCGCAGCCGCGCACATCAGGATCGATAAACAGCGCATCCATATGCTGCCCACTTAGCAACATAAATCCAACCGGCTGa > 1:775662/1‑237 (MQ=255) gATACGTTTTCCCAAAAT‑CTCCCACCCCAGAGCGTCCCGTACCCTTAAACCCCCCCTTCTTATAGAACCCAACCGCCTGCTCATTTTGCTCATTAACGTTGGTTGTCAGTTCCGGTGCCATCGAGAGCGCATGCTCCACCAGCACCCGACCTACGCCGCAGCCGCGCACATCAGGATCGATAAACAGCGCATCCATATGCTGCCCACTTAGCAACATAAATCCAACCGGCTGATCCCGCTCATTAACcgcg < 1:288691/251‑1 (MQ=255) gTTTCCCCAAAT‑CGTCCACCTCAGAGCGTCCCGTAACCTTAAAACCCACCTTCTTATAGAACCCAACCGCCTGCTCATTTTGCTCATTAACGTTGGTTGTCAGTTCCGGTGCCATCGAGAGCGCATGCTCCACCAGCACCCGACCTACGCCGCAGCCGCGCACATCAGGATCGATAAACAGCGCATCCATATGCTGCCCACTTAGCAACATAAATCCAACCGGCTGATCCCGCTCATTAACCGCGACCcac > 1:615286/1‑251 (MQ=255) tcccccAAAT‑CGTCCCCCCCAGAGCGCCCCTTAACTTTAACACCCCCCTTCTTATAGACCCCAACCGCCTGCTCATTTTGCTCATTAACGTTGGTTGTCAGTTCCGGTGCCATCGAGAGCGCATGCTCCACCAGCACCCGACCTACGCCGCAGCCGCGCACATCAGGATCGATAAACAGCGCATCCATATGCTGCCCACTTAGCAACATAAATCCAACCGGCTGATCCCGCTCATTAACCGCGACCcaca < 1:204250/248‑1 (MQ=255) t‑CGTCCACCTCAGAGCGTCCCGTAACCTTAAAACCCACCTTCTTATAGAACCCAACCGCCTGCTCATTTTGCTCATTAACGTTGGTTGTCAGTTCCGGTGCCATCGAGAGCGCATGCTCCACCAGCACCCGACCTACGCCGCAGCCGCGCACATCAGGATCGATAAACAGCGCATCCATATGCTGCCCACTTAGCAACATAAATCCAACCGGCTGATCCCGCTCATTAACCGCGACCCACAACGGCGCTTc > 1:353368/1‑251 (MQ=255) tCAGAGCGTCCCGTAACCTTAAAACCCACCTTCTTATAGAACCCAACCGCCTGCTCATTTTGCTCATTAACGTTGGTTGTCAGTTCCGGTGCCATCGAGAGCGCATGCTCCACCAGCACAAGACCTACGCCGCAGCCGCGCACATCAGGATCGATAAACAGCGCATCCATATGCTGCCCACTTAGCAACATAAATCCAACCGGCTGATCCCGCTCATTAACCGCGACCCACACCGGCGCTTCCGGCagga > 1:266458/1‑250 (MQ=255) tCCCGTAACCTTAAAACCCACCTTCTTATAGAACCCAACCGCCTGCTCATTTTGCTCATTAACGTTGGTTGTCAGTTCCGGTGCCATCGAGAGCGCATGCTCCACCAGCACCCGACCTACGCCGCAGCCGCGCACATCAGGATCGATAAACAGCGCATCCATATGCTGCCCACTTAGCAACATAAATCCAACCGGCTGATCCCGCTCATTAACCGCGACCCACAACGGCGCTTCCGGCAGGAAGgaacgac > 1:595779/1‑250 (MQ=255) tCCCGTAACCTTAAAACCCACCTTCTTATAGAACCCAACCGCCTGCTCATTTTGCTCATTAACGTTGGTTGTCAGTTCCGGTGCCATCGAGAGCGCATGCTCCACCAGCACCCGACCTACGCCGCAGCCGCGCACATCAGGATCGATAAACAGCGCATCCATATGCTGCCCACTTAGCAACATAAATCCAACCGGCTGATCCCGCTCATTAACCGCGACCCACAACGGCGCTTCCGGCAGGAAGgaacga > 1:688809/1‑250 (MQ=255) gtatccTTAAAACCCCCCTACTTATAGAACCAAACCGCCTGCTCATTTTGCTCATTAACGTTGGTTGTCAGTTCCGGTGCCATCGAGAGCGCATGCTCCACCAGCACCCGACCTACGCCGCAGCCGCGCACATCAGGATCGATAAACAGCGCATCCATATGCTGCCCACTTAGCAACATAAATCCAACCGGCTGATCCCGCTCATTAACCGCGACCCACAACGGCGCTTCCGGCAGGAAGGAACGAACTAg < 1:358602/247‑1 (MQ=255) cctaaaaaCCCCCCTTCTTATAGACCCCAACCGCCTGCTCATTTTGCTCATTAACGTTGGTTGTCAGTTCCGGTGCCATCGAGAGCGCATGCTCCACCAGCACCCGACCTACGCCGCAGCCGCGCACATCAGGATCGATAAACAGCGCATcc < 1:335378/148‑1 (MQ=255) ccTTAAAACCCACCTTCTTATAGAACCCAACCGCCTGCTCATTTTGCTCATTAACGTTGGTTGTCAGTTCCGGTGCCATCGAGAGCGCATGCTCCACCAGCACCCGACCTACGCCGCAGCCGCGCACATCAGGATCGATAAACAGCGCATcc > 2:335378/1‑152 (MQ=255) tAAAACCCACCTTCTTATAGAACCCAACCGCCTGCTCATTTTGCTCATTAACGTTGGTTGTCAGTTCCGGTGCCATCGAGAGCGCATGCTCCACCAGCACCCGACCTACGCCGCAGCCGCGCACATCAGGATCGATAAACAGCGCATCCATATGCTGCCCACTTAGCAACATAAATCCAACCGGCTGATCCCGCTCATTAACCGCGACCCACAACGGCGCTTCCGGCACGAAGGAACGACCTAGGtcctcc > 2:254263/1‑251 (MQ=255) | GTCGCTGGGGCAACGTTAATGAAATATCGCCAGTTCCACATCCATGCGCAATCAGCGGTACTCAGTGATAGTGCGGTCATGGCAATGCTTAAGCAGAAATAATCGTGTCACCATTGGTGGGTACTAAACCTGAAGTTCAGCCCACCGGGATGAGAAAAAATCGCCTACGCCCCCACATACGCCAGATTCAGCAACGGATACGGTTTCCCCAAAT‑CGTCCACCTCAGAGCGTCCCGTAACCTTAAAACCCACCTTCTTATAGAACCCAACCGCCTGCTCATTTTGCTCATTAACGTTGGTTGTCAGTTCCGGTGCCATCGAGAGCGCATGCTCCACCAGCACCCGACCTACGCCGCAGCCGCGCACATCAGGATCGATAAACAGCGCATCCATATGCTGCCCACTTAGCAACATAAATCCAACCGGCTGATCCCGCTCATTAACCGCGACCCACAACGGCGCTTCCGGCAGGAAGGAACGAACTAGGTCCTCC > NC_000913/4213516‑4214007 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |