| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC JC | NC_000913 | 2,089,842 | IS1 (+) +9 bp | intergenic (‑129/‑146) | yefM ← / → hisL | YefM antitoxin of the YoeB‑YefM toxin‑antitoxin pair and DNA binding transcriptional repressor/his operon leader peptide |
| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | NC_000913 | 1978503 = | NA (NA) | 62 (0.830) | 55/484 | 0.4 | 95.2% | noncoding (768/768 nt) | IS1 | repeat region |
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| * | ? | NC_000913 | = 2089850 | 3 (0.040) | 62 (0.830) | 57/484 | 0.3 | 95.2% | intergenic (‑137/‑146) | yefM/hisL | YefM antitoxin of the YoeB‑YefM toxin‑antitoxin pair and DNA binding transcriptional repressor/his operon leader peptide |
| ? | NC_000913 | 3583428 = | NA (NA) | noncoding (1/768 nt) | IS1 | repeat region | |||||
Only 100 of 127 total aligned reads displayed.
ACACAAGCCTCTCCATTCTGACGAGTAATAAGGATCGGGGCATGATCTTCAACGGCTTTCATCATTGTTGCCGACAAATTCTGACGCGCTTCGCTGTAGCTAATTGTACGCATGTCAATCTCCTCTTTTGTACAGTTCATTGTACAATGATGAGCGTTAATTAACTATTTATTAATTAGTTTGTAGATCAAGGTATTGTCAGTGAGACGAAAATCCAGGCTTCGCTATTTTTGGTGCCATCAGCTAAGAGGACAGTCCTCTTAGCCCCCTCCTTTCCCCGCTCATTCATTAAACAAATCCATTGCCATAAAATATATAAAAAAGCCCTTGCTTTCTAACGTGAAAGTGGTTTAGGTTAAAAGACATCAGTTGAATAAACATTCACAGAGACTTTTATGACACGCGTTCAATTTAAACACCACCATCATCACCATCATCCTGACTAGTCTTTCAGGCGATGTGTGCTGGAAGACATTCAGATCTTCCAGTGGTGCAT > NC_000913/2089601‑2090096 | tgacgtggtgatagggatgacggatggctggccgctgtatgaatcccgcctgaagggaaagctgcacgtaatcagcaagcgatatacgcagcgaattgagcggcataacctgaatcggaggcagcacctggcacggctgggacggaagtcgctgtcgttctcaaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccAGCTAagag < 1:52238‑M2/9‑1 (MQ=255) gtcgggttgatatggatgacggatggctggccgcggtattaatcccgcctgaagggaaagctgcacgtaatcagcaagcgatatacgcagcgaattgagcggcatatcctgaatctgaggcagcacctggcacggctgggacggaagtcgctgtcgttctcaaaatcggtggagctgcatgacaaagtcagcgggcattatctgaacataaatccctatcaataagttggagtcattaccAGCTAAGAGGa < 2:718827‑M2/11‑1 (MQ=255) cgtggtgatatggatgacggatggctggccgctgtatgaatcccgcctgaagggaaagctgcacgtaatcagcaagcgatatacgcagcgaattgagcggcataacctgaatctgaggcagcacctggcacggctgggacggaagtcgctgtcgttctcaaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccAGCTAAGAGGAc > 1:102598‑M2/239‑250 (MQ=255) cgtggggatatggatgacggagggctggccgctgtaagaatcccgcctgaagggaaagctgcacgtaatcagcaagcgatatacgcagcgaattgagcggcataacctgaatctgaggcagcacctggcacggctgggacggaagtcgctgtcgttctcaaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccAGCTAAGAGGACa < 2:657951‑M2/13‑1 (MQ=255) gtggtgatatggatgacggatggctggccgctgtatgaatcccgcctgaagggaaagctgcacgtaatcagcaagcgatatacgcagcgaattgagcggcataacctgaatctgaggcagcacctggcacggctgggacggaagtcgctgtcgttctcaaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccAGCTAAGAGGAc > 1:430087‑M2/238‑249 (MQ=255) aGCCTCTCCATTCTGACGAGTAATAAGGATCGGGGCATGATCTTCAACGGCTTTCATCATTGTTGCCGACAAATTCTGACGCGCTTCGCTGTAGCTAATTGTACGCATGTCAATCTCCTCTTTTGTACAGTTCATTGTACAATGATGAGCGTTAATTAACTATTTATTAATTAGTTTGTAGATCAAGGTATTGTCAGTGAGACGAAAATCCAGGCTTCGCTATATTTGGTGCCATCAGCTAAGAGggtgat > 2:546117‑M1/1‑245 (MQ=255) aGCCTCTCCATTCTGACGAGTAATAAGGATCGGGGCATGATCTTCAACGGCTTTCATCATTGTTGCCGACAAATTCTGACGCGCTTCGCTGTAGCTAATTGTACGCATGTCAATCTCCTCTTTTGTACAGTTCATTGTACAATGATGAGCGTTAATTAACTATTTATTAATTAGTTTGTAGATCAAGGTATTGGCAGTGAGACGAAAATCCAGGCTTCGCTATTTTTGGTGCCATCAGCTAAGAGggtgat < 1:488850‑M1/251‑7 (MQ=255) ggtgatatggaagacggatggctgtccgctgtatgaatcccgcctgaagggaaagctgcacgtaatcagcaagcgatatacgcagcgaattgagcggcataacctgaatctgaggcagcacctggcacggctgggacggaagtcgctgtcgttctcaaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattagctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccAGCTAAGAGGACAGt < 2:144028‑M2/15‑1 (MQ=255) ctctCCATTCTGACGAGTAATAAGGATCGGGGCATGATCTTCAACGGCTTTCATCATTGTTGCCGACAAATTCTGACGCGCTTCGCTGTAGCTAATTGTACGCATGTCAATCTCCTCTTTTGTACAGTTCATTGTACAATGATGAGCGTTAATTAACTATTTATTAATTAGTTTGTAGATCAAGGTATTGTCAGTGAGACGAAAATCCAGGCTTCGCTATTTTTGGTGCCATCAGCTAAGAGggtgatgct > 1:312445‑M1/1‑242 (MQ=255) tatggatgacggatggctggccgctgtatgaatcccgcctgaagggaaagctgcacgtaatcagcaagcgatatacgcagcgaattgagcggcataacctgaatctgaggcagcacctggcacggctgggacggaagtcgctgtcgttctcaaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccAGCTAAGAGGACAGTCCTCtt > 1:118613‑M2/231‑251 (MQ=255) 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atcccgcctgcagggaaagctgcacgtaatcagcaagcgatatacgcagcgaattgagcggcataacctgaatctgaggcagcacctggcacggctgggacggaagtcgctgtcgttctcaaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccAGCTAAGAGGACAGTCCTCTTAGCCCCCTCCTTTCCCCg > 2:64348‑M2/200‑238 (MQ=255) atcccgcctgaagggaaagctgcacgtaatcagcaagcgatatacgcagcgaattgagcggcataacctgaatctgaggcagcacctggcacggctgggacggaagtcgctgtcgttctcaaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccAGCTAAGAGGACAGTCCTCTTAGCCCCCTCCTTTCCCCg < 1:64348‑M2/39‑1 (MQ=255) cccgcctgaagggaaagctgcacgtaatcagcaagcgatatacgcagcgaattgagcggcataacctgaatctgaggcagcacctggcacggctgggacggaagtcgctgtcgttctcaaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccAGCTAAGAGGACAGTCCTCTTAGCCCCCTCCTTTCCCCGCTCATTCATTAAACa < 1:736094‑M2/54‑1 (MQ=255) aTCTTCAACGGCTTTCATCATTGTTGCCGACAAATTCTGACGCGCTTCGCTGTAGCTAATTGTACGCATGTCAATCTCCTCTTTTGTACAGTTCATTGTACAATGATGAGCGTTAATTAACTATTTATTAATTAGTTTGTAGATCAAGGTATTGTCAGTGAGACGAAAATCCAGGCTTCGCTATTTTTGGTGCCATCAGCTAAGAGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttg > 2:710074‑M1/1‑206 (MQ=255) gcctgaagggaaagctgcacggaatcagcaagcgatatacgcagcgaattgagcggcataacctgaagctgaggcagcacctggcacggctgggacggaagtcgctgtcgttctcaaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccAGCTAAGAGGACAGTCCTCTTAGCCCCCTCCTTTCCCCGCTCATTCATTAAACAAAt < 2:658316‑M2/57‑1 (MQ=255) cacgtaatcagcaagcgatatacgcagcgaattgagcggcataacctgaatctgaggcagcacctggcacggctgggacggaagtcgctgtcgttctcaaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccAGCTAAGAGGACAGTCCTCTTAGCCCCCTCCTTTCCCCGCTCATTCATTAAACAAATCCATTGCCATAAAatat > 2:694983‑M2/178‑251 (MQ=255) cacgtaatcagcaagcgatatacgcagcgaattgagcggcataacctgaatctgaggcagcacctggcacggctgggacggaagtcgctgtcgttctcaaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccAGCTAAGAGGACAGTCCTCTTAGCCCCCTCCTTTCCCCGCTCATTCATTAAACAAATCCATTGCCATAAAatat > 2:348430‑M2/178‑251 (MQ=255) cacggtagctgcaagcgatatacgcagctaattgagcggcataacctgaatctgaggcagcacctggcacggctgggacggaagtcgctgtcgttctcaaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccAGCTAAGAGGACAGTCCTCTTAGACCACTCCTTTCCTCGCTCATTCAGTAAACAAATCCATTGCCATAAAatat < 1:646055‑M2/74‑1 (MQ=255) tgttgACGACAAATTCTGACGCGCTTCGCTGTAGCTAATTGTACGCATTTCAATCGCCGTTTTTGTACAGTTCATTGTAAAATGATGAGAGTGAATTAACTATTTATTAATTAGTTTGTAGATCAAGGTATTGTCAGTGAGACGAAAATCCAGGCTTCGCTATTTTTGGTGTCATCAGCTAAGAGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctcaagcggcttctg < 2:296961‑M1/250‑66 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 17 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |