| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 1301050 = | 14 (0.190) | 45 (0.600) | 40/486 | 0.8 | 76.3% | intergenic (+503/‑132) | insH21/oppA | IS5 family transposase and trans‑activator/oligopeptide ABC transporter periplasmic binding protein |
| ? | NC_000913 | 1978503 = | NA (NA) | noncoding (768/768 nt) | IS1 | repeat region | |||||
GCCAGTGTGACGCCTGCGGGTACATCAGCTGCCAGCGCGACATTCCCTGCCATTAGCGCAGCCAGAACGCCAGCTGCTACTAAACTTCTCTTGGTGATGTTGGTCATTGTTTTTTGGACTCCCTCATTATAATTACTGGTATTAACCAGCATGTGTAATCCCGGATTGGGACCCTGCACAGGCTCGGAGACTTTCTGCTGTCAGGTTACTTTATCGTTACGTATTACTATCACCGACTT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/1301288‑1301050‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTGCTGCCTCAGATTCAGGTTATGCCGCTCAATTCGCTGCGTATATCGCTTGCTGATTACGTGCAGCTTTCCCTTCAGGCGGGATTCATACAGCGGCCAGCCATCCGTCATCCATATCACCACGTCAAAGG > NC_000913/1978503‑1978747 cCCAGTGTGACGCCTGCGGGTCCATCACCTGCCCGCCCGACATTCCCTGCCATTAGCGCAGCCAGAACGCCAGCTGCTACTAAACTTCTCTTGGTGATGTTGGTCATTGTTTTTTGGACTCCCTCATTATAATTACTGGTATTAACCAGCATGTGTAATCCCGGATTGGGACCCTGCACAGGCTCGGAGACTTTCTGCTGTCAGGTTACTTTATCGTTACGTATTACTATCACCGACTTGGTAATGACTCC < 2:443061/250‑1 AGTGTGAAGCCTGCGGGTACATAAGCTGCCAGCGCGACATTCCCTGCCATTAGCGCAGCCAGTACGCCAGCTGCGACTAAACTTCTCTTTGTGATGTTGGTCATTGTTTTTTGGGCTCCCTCATTATAATTACTGGTATTAACCAGCATGTGTAATCCCGGATTGGGACCCTGCACAGGCTCGGAGAATTTTTGCTGTTAGGGTACTTTATCTTTACGTCTTACTATCACCGACTTTGTAATGACACCAAC > 2:425250/1‑251 ACATCAGCTGCCAGCGCGACATTCCCTGCCATTAGCGCAGCCAGAACGCCAGCTGCTACTAAACTTCTCTTGGTGATGTTGGTCATTGTTTTTTGGACTCCCTCATTATAATTACTGGTATTAACCAGCATGTGTAATCCCGGATTGGGACCCTGCACAGGCTCGGAGACTTTCTGCTGTCAGGTTACTTTATCGTTACGTATTACTATCACCGACTTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTAT > 1:90350/1‑251 CTGCCAGCGCGACATTCCCTGCCATTAGCGCAGCCAGAACGCCAGCTGCTACTAAACTTCTCTTGGTGATGTTGGTCATTGTTTTTTGGACTCCCTCATTATAATTACTGGTATTAACCAGCATGTGTAATCCCGGATTGGGACCCTGCACAGGCTCGGAGACTTTCTGCTGTCAGGTTACTTTATCGTTACGTATTACTATCACCGACTTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTC > 1:14151/1‑248 GCCAGCGCAACATTCCCTGCCATTAGCGCAGCCAGAACGCCAGCTGCTACTAAACTTCTCTTGGTGATGTTGGTCATTGTTTTTTGGACTCCCTCATTATAATTACTGGTATTAACCAGCATGTGTAATCCCGGATTGGGACCCTGCACAGGCTCGGAGACTTTCTGCTGTCAGGTTACTTTATCGTTACGTATTACTATCACCGACTTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGAT < 1:252482/250‑1 ATTCCCTGCCATTAGCGCAGCCAGAACGCCAGCTGCTACTAAACTTCTCTTGGTGATGTTGGTCATTGTTTTTTGGACTCCCTCATTATAATTACTGGTATTAACCAGCATGTGTAATCCCGGATTGGGACCCTGCACAGGCTCGGAGACTTTCTGCTGTCAGGTTACTTTATCGTTACGTATTACTATCACCGACTTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGA < 1:448008/251‑1 CCATTAGCGCAGCCAGAACGCCAGCTGCTACTAAACTTCTCTTGGTGATGTTGGTCATTGTTTTTTGGACTCCCTCATTATAATTACTGGTATTAACCAGCATGTGTAATCCCGGATTGGGACCCTGCACAGGCTCGGAGACTTTCTGCTGTCAGGTTACTTTATCGTTACGTATTACTATCACCGACTTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTC > 1:659116/1‑250 CCAGAACGCCAGCTGCTACTAAACTTCTCTTGGTGATGTTGGTCATTGTTTTTTGGACTCCCTCATTATAATTACTGGTATTAACCAGCATGTGTAATCCCGGATTGGGACCCTGCACAGGCTCGGAGACTTTCTGCTGTCAGGTTACTTTATCGTTACGTATTACTATCACCGACTTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACC > 1:788016/1‑251 GCTGCTACTAAACTTCTCTTGGTGATGTTGGTCATTGTTTTTTGGACTCCCTCATTATAATTACTGGTATTAACCAGCATGTGTAATCCCGGATTGGGACCCTGCACAGGCTCGGAGACTTTCTGCTGTCAGGTTACTTTATCGTTACGTATTACTATCACCGACTTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAA < 1:681037/251‑1 TTCTCTTGGTGATGTTGGTCATTGTTTTTTGGACTCCCTCATTATAATTACTGGTATTAACCAGCATGTGTAATCCCGGATTGGGACCCTGCACAGGCTCGGAGACTTTCTGCTGTCAGGTTACTTTATCGTTACGTATTACTATCACCGACTTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTC > 2:217696/1‑251 TTCTCTTGGTGATGTTGGTCATTGTTTTTTGGACTCCCTCATTATAATTACTGGTATTAACCAGCATGTGTAATCCCGGATTGGGACCCTGCACAGGCTCGGAGACTTTCTGCTGTCAGGTTACTTTATCGTTACGTATTACTATCACCGACTTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTC > 1:470498/1‑251 CTTGGTGATGTTGGTCATTGTTTTTTGGACTCCCTCATTATAATTACTGGTATTAACCAGCATGTGTAATCCCGGATTGGGACCCTGCACAGGCTCGGAGACTTTCTGCTGTCAGGTTACTTTATCGTTACGTATTACTATCACCGACTTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCC < 2:90350/248‑1 GGTGATGTTGGTCATTGTTTTTTGGACTCCCTCATTATAATTACTGGTATTAACCAGCATGTGTAATCCCGGATTGGGACCCTGCACAGGCTCGGAGACTTTCTGCTGTCAGGTTACTTTATCGTTACGTATTACTATCACCGACTTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCC < 1:513998/250‑1 ATGTTGGTCATTGTTTTTTGGACTCCCTCATTATAATTACTGGTATTAACCAGCATGGGTAATCCCGGATTGGGACCCTGCACAGGCTCGGAGACTTTCTGCTGTCAGGTTACTTTATCGTTACGTATTACTATCACCGACTTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCG < 2:155406/251‑1 TGTTGGTCATTGTTTTTTGGACTCCCTCATTATAATTACTGGTATTAACCAGCATGTGTAATCCCGGATTGGGACCCTGCACAGGCTCGGAGACTTTCTGCTGTCAGGTTACTTTATCGTTACGTATTACTATCACCGACTTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGg > 1:189365/1‑250 TGGTCATTGTTTTTTGGACTCCCTCATTATACTTACTGGTATTAACCAGCATGTGTAATCCCGGATTGGGACCCTGCACAGGCTCGGGGACTTTCTGCTGTCAGGTTACTTTATTGTTACGTATTACTATCACCGACTTGGTAATGGCTCCAACTTATTGTTAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTAATGCAGCTCCACCGATTTTAAGAACGACAGCAGCTTCCGTCCCCGCCGGGCC > 2:620771/1‑251 TTTTTGGACACCCTCATTATAATTATTGGTAGTAACCAGCATGGGTAATCCCGGATTGGGACCCTGCACAGGTGCGGAGCCTTTCTGCTGTCAGGTTACGTTATCGTTACGTATTACTATCTCCGACTTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCGACACCGATGTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTGCTGC < 2:208032/250‑1 ACTCCCTCATTATAATTACTGGTATTAACCAGCATGTGTAATCCCGGATTGGGACCCTGCACAGGCTCGGAGACTTTCTGCTGTCAGGTTACTTTATCGTTACGTATTACTATCACCGACTTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTGCTGCCTCCGATT > 2:141378/1‑251 CCCTCATTATAATTACTGGTATTAACCAGCATGTGTAATCCCGGATTGGGACCCTGCACAGGCTCGGAGACTTTCTGCTGTCAGGTTACTTTATCGTTACGTATTACTATCACCGACTTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTGCTGCCTCAGATTCA < 2:659116/250‑1 TATAATTACTGGTATTAACCAGCATGTGTAATCCCGGATTGGGACCCTGCACAGGCTCGGAGACTTTCTGCTGTCAGGTTACTTTATCGTTACGTATTACTATCACCGACTTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTGCTGCCTCAGATTCAGGTTATGC > 1:771302/1‑251 TATAATTACTGGTATTAACCAGCATGTGTAATCCCGGATTGGGACCCTGCACAGGCTCGGAGACTTTCTGCTGTCAGGTTACTTTATCGTTACGTATTACTATCACCGACTTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGGTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGAAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGGCTTCAGTCCCAGCCGTGCCAGGTGCTGCCTCAGATTCAGGTTATGC > 1:453482/1‑251 TATAATTACTGGTAGTAACCAGCATGTGTAACCCCGGATGGTGACCCTGCACAGGCTCGGAGACTTTCTGCTGTCAGGTTACTTTAGCGTTACGTATTACCATCACCGACTTGGTAATGCCTCCACCTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTCTGGCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGCTAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTGCTGCCTCAGCGTCAGGTTATc < 2:207312/250‑2 TATTAACCAGCATGTGTAATCCCGGATTGGGACCCTGCACAGGCTCGGAGACTTTCTGCTGTCAGGTTACTTTATCGTTACGTATTACTATCACCGACTTGGTAATGACTCC < 1:283264/112‑1 TATTAACCAGCATGTGTAATCCCGGATTGGGACCCTGCAAAGGCTCGGAGACTTTCTTCTGTCAGGTTGCTTTATCGTTTCGTATTACTATCACCGACTTGGTAATGAATCC > 2:283264/1‑112 TAACCAGCATGTGTAATCCCGGATTGGGACCCTGCACAGGCTCGGAGACTTTCTGCTGTCAGGTTACTTTATCGTTACGTATTACTATCACCGACTTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTGCTGCCTCAGATTCCGGTTATGCCGCTCAATTCGCTGC > 1:749497/1‑251 TAACCAGCATGTGTAATCCCGGATTGGGACCCTGCACAGGCTCGGAGACTTTCTGCTGTCAGGTTACTTTATCGTTACGTATTACTATCACCGACTTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTGCTGCCTCAGATTCAGGTTATGCCGCTCAATTCGCTG < 1:757413/250‑1 AGCATGTGTAATCCCGGATTGGGACCCTGCACAGGCTCGGAGACTTTCTGCTGTCAGGTTACTTTATCGGTACGTATTACTATCACCGACTTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTGCTGCCTCAGATTCAGGTTATGCCGCTCAATTCGCTGCGTATA < 1:96854/251‑1 CATGTGTAATCCCGGATTGGGACCCTGCACAGGCTCGGAGACTTTCTGCTGTCAGGTTACTTTATCGTTACGTATTACTATCACCGACTTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTGCTGCCTCAGATTCAGGTTATGCCGCTCAATTCGCTGCGTATATC < 1:546123/251‑1 gaAATCCCGGATTGGGACCCTGCACAGGCTCGGCGACTTTCTGCTGTCAGGTTACGTTATCGTTACGTATTACTATCACCGACTTGGTAATGAATCCAACTTATTGGTAGTGTTTTATGTTCAGATAAAGCCCGATGACTTTGTCGTGCAGCTCCACCGATTTTGAGAAAGACAGCGACTTCCGTCCCCGCCGTGCCCGGTGCTGCCTCCGATTCCGGGTATGCCGCTCAATTACCTGCTTATATCGCTTG > 2:239855/3‑251 GTAATTCCTGATTGTGACCCTGCACAGGCTCGGAGACTTTCTGCTTTCAGGTTACTTTATCGTTACGTATTACTATCACCGACTTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATTCCCTATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGTTGCTCCCTCAGATTCAGGTGATGCCGCTCAATGCGCTTCGTATATCGCTT < 1:210277/250‑1 cATCCCGGATTGGGACCCTCCACAGGCTCGGAGACTTTCTGCTGTCAGGTTACTTTAGCGTGTCGTATCACTATCACCGACTTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTGCAGATAATGCCAGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCTGTCCCAGCCGTGCCATGAGCTGCCTCAGAATCAGGTTATGCCGCTCAATTCGCTGCGTATATCGCTTGCT < 1:425250/250‑1 CCCGGATTGGGACCCTGCACAGGCTCGGAGACTTTCTGCTGTCAGGTTACTTTATCGTTACGTATTACTATCACCGACTTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTGCTGCCTCAGATTCAGGTTATGCCGCTCAATTCGCTGCGTATATCGCTTGCTGAT < 1:128921/251‑1 ATTGGGACCCTGCACAGGCTCGGAGACTTTCTGCTGTCAGGTTACTTTATCGTTACGTATTACTATCACCGACTTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTGCTGCCTCAGATTCAGGTTATGCCGCTCAATTCGCTGCGTATATCGCTTGCTGATTACGT > 1:209658/1‑251 ggatACTTTCTGCTGTCAGGTTACTTGATCGTTACGTATTACTATCACCGACTTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCTAGCCGTGCCAGGTGCTGCCGCAGATTCAGGTTATGCCGCTCAATTCGCTGCGTATATCGCTTGCTGATTACGTGCAGCTTTCCCTTCAGGCGGG < 1:407031/247‑1 GTCAGGTTACTTTATCGTTACGTATTACTATCACCGACTTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTGCTGCCTCAGATTCAGGTTATGCCGCTCAATTCGCTGCGTATATCGCTTGCTGATTACGTGCAGCTTTCCCTTCAGGCGGGATTCATACAGCGGC > 1:161694/1‑251 TTACTTTATCGTTACGTATTACTATCACCGACTTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTGCTGCCTCAGATTCAGGTTATGCCGCTCAATTCGCTGCGTATATCGCTTGCTGATTACGTGCAGCTTTCCCTTCAGGCGGGATTCATACAGCGGCCAGCC > 1:805401/1‑250 CGTTACGTATTACTATCACCGACTTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTGCTGCCTCAGATTCAGGTTATGCCGCTCAATTCGCTGCGTATATCGCTTGCTGATTACGTGCAGCTTTCCCTTCAGGCGGGATTCATACAACGGCCAGCCATCCGTCATC > 2:181263/1‑251 GTTACGTATTACTATCACCGACTTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTGCTGCCTCAGATTCAGGTTATGCCGCTCAATTCGCTGCGTATATCGCTTGCTGATTACGTGCAGCTTTCCCTTCAGGCGGGATTCATACCGCGGCCAGCCATCCGTCATCC > 2:575609/1‑251 GTTACGTATTACTATCACCGACTTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTGCTGCCTCAGATTCAGGTTATGCCGCTCAATTCGCTGCGTATATCGCTTGCTGATTACGTGCAGCTTTCCCTTCAGGCGGGATTCATACAGCGGCCAGCCATCCGTCATCC < 1:719195/251‑1 ACGTATTACTATCACCGACTTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTGCTGCCTCAGATTCAGGTTATGCCGCTCAATTCGCTGCGTATATCGCTTGCTGATTACGTGCAGCTTTCCCTTCAGGCGGGATTCATACAGCGGCCAGCCATCCGTCATCCAT > 1:159570/1‑250 ACTATCACCGACTTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTTTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTGCTGCCTCAGATTCAGGTTATGCCGCTCAATTCGCTGCGTATATCGCTTGCTGATTACGTGCAGCTTTCCCTTCAGGCGGGATTCATACAGCGGCCAGCCATCCGTCA < 2:575328/238‑1 ACTATCACCGACTTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTGCTGCCTCAGATTCAGGTTATGCCGCTCAATTCGCTGCGTATATCGCTTGCTGATTACGTGCAGCTTTCCCTTCAGGCGGGATTCATACAGCGGCCAGCCATCCGTCA > 1:575328/1‑238 CCGACTTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGCCTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTGCTGCCTCAGATTCAGGTTATGCCGCTCAATTCGCTGCGTATATCGCTTGCTGATTACGTGCAGCTTTCACTTCAGGCGGGATTCATACAGCGGCCAGCCATCCGTCATCCATATCACCACGTCAA > 1:73713/1‑249 CGACTTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTGCTGCCTCAGATTCAGGTTATGCCGCTCAATTCGCTGCGTATATCGCTTGCTGATTACGTGCAGCTTTCCCTTCAGGCGGGATTCATACAGCGGCCAGCCATCCGTCATCCATATCACCACGTCAAAGG > 1:79861/1‑251 TTGGTACTGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTGCTGCCTCAGATTCAGGTTATGCCGCTCAATTCGCTGCGTATATCGCTTGCTGATTACGTGCAGCTTTCCCTTCAGGCGGGATTCATACAGCGGCCAGCCATCCGTCATCCATATCAC > 1:490640/1‑236 GCCAGTGTGACGCCTGCGGGTACATCAGCTGCCAGCGCGACATTCCCTGCCATTAGCGCAGCCAGAACGCCAGCTGCTACTAAACTTCTCTTGGTGATGTTGGTCATTGTTTTTTGGACTCCCTCATTATAATTACTGGTATTAACCAGCATGTGTAATCCCGGATTGGGACCCTGCACAGGCTCGGAGACTTTCTGCTGTCAGGTTACTTTATCGTTACGTATTACTATCACCGACTT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/1301288‑1301050‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTGCTGCCTCAGATTCAGGTTATGCCGCTCAATTCGCTGCGTATATCGCTTGCTGATTACGTGCAGCTTTCCCTTCAGGCGGGATTCATACAGCGGCCAGCCATCCGTCATCCATATCACCACGTCAAAGG > NC_000913/1978503‑1978747 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |