| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | NC_000913 | 2,384,808 | C→T | K305K (AAG→AAA) | yfbK ← | IPR002035/DUF3520 domain‑containing protein YfbK |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 2,384,808 | 0 | C | T | 95.7% | 266.2 / 0.3 | 95 | K305K (AAG→AAA) | yfbK | IPR002035/DUF3520 domain‑containing protein YfbK |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/4); new base T (56/32); total (56/39) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.11e-02 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.67e-01 | |||||||||||
ATACTTTCTGCGCTTCAGAGAGGGTATCAATGTAGCTGTAGTTGCCGTTACCAACATCGGCAATTCGCACCATCATTGCCTCGTTGTAATTGCTATTCCCCACGCCAAACGTCGACAGAGTAACACCAGACTCCCGCTGTTTTTTGACCATTGATTCAATCGATTTTGGA‑TCGTCA‑ATGCCAACGTTAAAGTCACCGTCAGTGGC‑TAATAAAATG‑CGATTGATGCCGCCCTTAATAAACCCCTT‑C‑G‑T‑CGCCTGCTGATAAGCCAGTTCCAGCCCGGCACCGCCATTGGTACTGCCTTCGGCATCCAGCGAATCAATTGCGGCATTAATTTCCGCCTTATGACTCCCGGAGATAGAAGGCAATGCAATACGGGAGTCGCCAGCGTAGGTCACGATGGCAATGTTATCCTGCTCACGAAGTTCTTTGACCAATAATTTCAACGAAGACTGGATAAGTGGCAAACGTTCATCAGAAATCATTGAACCAGA > NC_000913/2384567‑2385053 | agaCTTTCTGCGCTTCAGAGAGGGTATCAATGTAGCTGTAGTTGCCGTTACCAACATCGGCAATTCGCACCATCATTGCCTCGTTGTAATTGCTATTCCCCACGCCAAACGTCGACAGAGTAACACCAGACTCCCGCTGTTTTTTGACCATTGATTCAATCGATTTTGGA‑TCGTCA‑ATGCCAACGTTAAAGTCACCGTCAGTGGC‑TAATAAAATG‑CGATTGATGCCGCCCTTAATAAACCCTTT‑C‑G‑T‑CGcc < 1:110511/249‑1 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ttCTGCGCTTCAGAGAGGGTATCAATGTAGCTGGAGTTGCCGTTACCAACAACGGCAATTCGCACCAACATTGCCTCGTTGTAATTGCTATTCCCCACGCCAAACGTCGACAGAGTAACACCAGACTCCCGCTGTTTTTTGACCATTGATTCAAGAGATTTTGGA‑TCGTCA‑ATGCCAACGTTAAAGTCACCGTCAGTGGC‑TAATAAAATG‑CGATGGATGCCGCCCTGAATAAACCCTTT‑C‑G‑T‑CGCctgct < 2:108737/250‑1 (MQ=255) tCTGCGCTTCAGAGAGGGTATCAATGTAGCTGTAGTTGCCGTTACCAACATCGGCAATTCGCACCATCATTGCCTCGTTGTAATTGCTATTCCCCACGCCAAACGTAGACAGAGTAACACCAGACTCCCGCTGTTTTTTGACCATTGATTCAATCGATTTTGGA‑TCGTCA‑ATGCCAACGTTAAAGTCACCGTCAATGGC‑TAATAAAATG‑CGATTGATGCCGCCCTTAATAAACCCTTT‑C‑G‑T‑CGCcttctg > 2:29321/1‑250 (MQ=255) tCTGCGCTTCAGAGAGGGTAGCAATGTAGCTGTAGTTGCCGTTACCAACATCGGCAATTCGCACCATCATTGCCTCGTTGTAATTGCTATTCCCCACGCCAAACGTCGACAGAGTAACACCAGACTCCCGCTGTTTTTTGACCATTGATTCAATCGATTTTGGA‑TCGTCA‑ATGCCAACGTTAAAGTCACCGTCAGTGGC‑TAATAAAATG‑CGATTGATGCCGCCCTTAATAAACCCTTT‑C‑G‑T‑CGCctgctg < 2:468874/250‑1 (MQ=255) 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gagagGGTATCAATGTAGCTGTAGTTGCCGTTACCAACATCGGCAATTCGCACCATCATTGCCTCGTTGTAATTGCTATTCCCCACGCCAAACGTCGGCAGAGTAACACCAGACTCCCGCTGTTTTTTGACCATTGATTCAATCGATTTTGGA‑TCGTCA‑ATGCCAACGTTAAAGTCACCGTCAGTGGC‑TAATAAAATG‑CGATTGATGCCGCCCTTAATAAACCCTTT‑C‑G‑T‑CGCCTGCTGATAAGCCAGTTc > 1:617362/1‑251 (MQ=255) gagagGGTATCAATGTAGCTGTAGTTGCCGTTACCAACATCGGCAATTCGCACCATCATTGCCTCGTTGTAATTGCTATTCCCCACGCCAAACGTCGACAGAGTAACACCAGACTCCCGCTGTTTTTTGACCATTGATTCAATCGATTTTGGA‑TCGTCA‑ATGCCAACGTTAAAGTCACCGTCAGTGGC‑TAATAAAATG‑CGATTGATGCCGCCCTTAATAAACCCTTT‑C‑G‑T‑CGCCTGCTGATAAGCCAGTTc > 2:372828/1‑251 (MQ=255) gagGGTATCAATGTAGCTGTAGTTGCCGTTACCAACATCGGCAATTCGCACCATCATTGCCTCGTTGTAATTGCTATTCCCCACGCCAAACGTCGACAGAGTAACACCAGACTCCCGCTGTTTTTTGACCATTGATTCAATCGATTTTGGA‑TCGTCA‑ATGCCAACGTTAAAGTCACCGTCGGTGGC‑TAATAAAATG‑CGATTGATGCCGCCCTTAATAAACCCTTT‑C‑G‑T‑CGCCTGCTGATAAGCCAGTTCCa < 1:538470/251‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |