| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 1,314,837 | T→A | I130F (ATC→TTC) | yciE ← | DUF892 domain‑containing protein YciE |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,314,837 | 0 | T | A | 98.3% | 173.4 / NA | 59 | I130F (ATC→TTC) | yciE | DUF892 domain‑containing protein YciE |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/1); major base A (31/26); minor base G (0/1); total (31/28) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.66e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.78e-01 | |||||||||||
ACACGATAGCGTACGCCTCGATCCGTGGGTGTTTATGTTCTCAGCAGGATATCGTTTTTAATTCCGCACAAAAACGACCCCGTAATA‑TACGGGGTCAATAAGGACATGGTATAAAGGGTATTATTTCTTCGCTTCTACGCCATCAGTTTCAGAGCGAATTAAAAATTTCTCAGTTGTTTGCGGAATATTCTGAATCAGCCAGTCGGCCATTTGCTTTTCCTCATTTAAAATCGCTTCGATGGTTGGAATTGAAGCTGTATCACCGGCATTTTTTGCTGCTGCTAATAGTGAGGTGTAACAGGCGATTTCAAATTGCTCGAAGACATATCCGCTAATAGAGCCTTTGACTATTTCATCAGAAGGGAATATACCACCGATTGACTGCCCAAGCGCAGCCATTTTACTCATGGAATCTTTAATGACTGAACGTGAAATGTCATTACGATCAAGAATAGTTTCCAGTTGAACA > NC_000913/1314598‑1315066 | acacGATAGCGTACGCCCTGATCCGTGGGTGTTTATTTTCTCAGCAGGATATCGTTTTTAATTCCGCACAAAAACGACCCCGTAATA‑TACGGGGTCAATAAGGACATGGTATAAAGTGTATTATTTCTTCGCTTCTACGCCATCAGTTTCAGAGCGAATTAAAAATTTCTCAGTTGTTTGCTGAATATTCTGAATCATCCAGTCGGCCATTTGCTTTTCCTCATTTAAAATCGCTTCGAAGGTTGGAATTg < 2:740695/251‑1 (MQ=255) 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gTCGGCCATTTGCTTTTCCTCATTTAAAATCGCTTCGAAGGTTGGAATTGAAGCTGTATCACCGGCATTTTTTGATGCTGCTAATAGTGAGGTGTAACAGGCGATTTCAAATTGCTCGAAGACATATCCGCTAATAGAGCCTTTGACTATTTCATCAGAAGGGAATATACCACCGATTGACTGCACAAGCGCAGCCATTTTACTCATGGACTCTTTAATGACTGAACGTGACATGTCATTACGATCAAGa > 1:908312/1‑250 (MQ=255) gTCGGCCATTTGCTTTTCCTCATTTAAAATCGCTTCGAAGGTTGGAAGTGAAGCTGTATCACCGGCATTTTTTGCTGCTGCTAATAGTGAGGTGTAACAGGCGATTTCAAATTGCTCGAAGACATATCCGCTAATAGAGCCTTTGACTATTTCATCAGAAGGGAATATACCACCGATTGACTGCCCAAGCGCAGCCATTTTACTCATGGAATCTTTAATGACTGAACGTGAAATGTCATTACGATCAAGaa < 1:643022/251‑1 (MQ=255) ggCCATTTGCTTTTCCTCATTTAAAATCGCTTCGAAGGTTGGAATTGAAGCTGTATCACCGGCATTTTTTGCTGCTGCTAATAGTGAGGTGTAACAGGCGATTTCAAATTGCTCGAAGACATATCCGCTAATAGAGCCTTTGACTATTTCATCAGAAGGGAATATACCACCGATTGACTGCCCAAGCGCAGCCATTTTACTCATGGAATCTTTAATGACTGAACGTGAAATGTCATTACGATCAAGAAt > 1:953143/1‑249 (MQ=255) gCCATTTGCTTTTCCTCATTTAAAATCGCTTCGAAGGGTGGAATTGAAGCTGTATCACCGGCATTTTTTGCTGCTGCTAATAGTGAGGTGTAACAGGCGATTTCAAATTGCTCGAAGACATATCCGCTAATAGAGCCTTTGACTATTTCATCAGAAGGGAATATACCACCGATTGACTGCCCAAGCGCAGCCATTTTACTCATGAAATCTTTAATGACTGAACGTGAAATGTCATTACGATCAAGTATAGt > 1:310804/1‑251 (MQ=255) tGCTTTTCCTCATTTAACATCGCTTCGAAGGTTGTAATTGAAGCTGTATCACCGGCATTTTTTGCTGCTGCTAATAGTGAGGTGTAACAGGCGATTTCAAATTGCTCGAAGACATATCCGCTAATAGAGCCTTTGACTATTTCATCAGAAGGGAATATACCACCGATTGACTGCCCAAGCGCAGCCATTTTACTCATGGAATCTTTAATGACTGAACGTGAAATGTCATTACGATCAAGAATAGTTTCCa < 1:243009/250‑1 (MQ=255) atCCTCATTTAAAATCGCTTCGAAGGTTGGAATTGAAGCTGTATCACCGGCATTTTTTGCTGCTGCTAATAGTGAGGTGTAACAGGCGATTTCAAATTGCTCGAAGACATATCCGCTAATAGAGCCTTTGACTATTTCATCAGAAGGGAATATACCACCGATTGACTGCCCAAGCGCAGCCATTTTACTCATGGAATCTTTAATGACTGAACGTGAAATGTCATTACGTTCAAGAATAGTTTCCAGTTGa > 2:706860/2‑250 (MQ=255) ccTCAGTTAAAATCGCTTCGAAGGTTGGAAGTGAAGCTGTATCACCGGCATTTTTTGCTGCTGCTAATAGTGAGGTGTAACAGGCGATGTCAAATTGCTCGAAGACATATCCGCTAATAGAGCCTTTGACTATTTCATCAGAAGGGAATATACCACCGATTGACTGCCCAAGCGCAGCCATTTTACTCATGGAATCTTTAATGACTGAACGTGAAATGTCATTACGATCAAGAATAGTTTCCAGTTGAACa < 2:607667/251‑1 (MQ=255) | ACACGATAGCGTACGCCTCGATCCGTGGGTGTTTATGTTCTCAGCAGGATATCGTTTTTAATTCCGCACAAAAACGACCCCGTAATA‑TACGGGGTCAATAAGGACATGGTATAAAGGGTATTATTTCTTCGCTTCTACGCCATCAGTTTCAGAGCGAATTAAAAATTTCTCAGTTGTTTGCGGAATATTCTGAATCAGCCAGTCGGCCATTTGCTTTTCCTCATTTAAAATCGCTTCGATGGTTGGAATTGAAGCTGTATCACCGGCATTTTTTGCTGCTGCTAATAGTGAGGTGTAACAGGCGATTTCAAATTGCTCGAAGACATATCCGCTAATAGAGCCTTTGACTATTTCATCAGAAGGGAATATACCACCGATTGACTGCCCAAGCGCAGCCATTTTACTCATGGAATCTTTAATGACTGAACGTGAAATGTCATTACGATCAAGAATAGTTTCCAGTTGAACA > NC_000913/1314598‑1315066 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |