| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 1,040,126 | G→T | L277L (CTG→CTT) | appB → | cytochrome bd‑II subunit 2 |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,040,126 | 0 | G | T | 99.1% | 361.1 / ‑5.3 | 112 | L277L (CTG→CTT) | appB | cytochrome bd‑II subunit 2 |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/1); new base T (54/57); total (54/58) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 6.58e-01 | |||||||||||
Only 100 of 112 total aligned reads displayed.
ATTCATCTGCGTTCACAGCTGGCGACCAAACGCGCTGCACTGT‑TGGTGATGCTGTGCTTTTTGCTGGCGGGTTACTGGCTGTGGGTCGGTATTGATGGCTTTGTACTGCTCGCCCAGGATGCTAACGGTCCTTCCAATCCGTTAATGAAACTGGTGGCAGTGCTACCTGGTGCCTGGATGAATAATTTTGTCGAGTCGCCCGTTTTGTGGATCTTCCCGCTGCTG‑GGATTCTTCTGCCCATTGCTGACGGTGATGGCGATTTATCGTGGTCGCCCGGG‑TTGGGGATTTTTGATGGCATCATTGATGCAATTTGGCGTGATTTTCACGGCAGGCATCAC‑GCTGTTCCCCTTTGTCATGCCGTCAAGCGTGAGTCCGATCTCCAGCCTGACGTTGTGGGACAGTACTTCCAGTCAGCTGACGCTGAGCATTATGTTGGTAATCGTGCTGATATTTTTGCCCATTGTGTTGCTCTACACTCTCTGGAGCTAC > NC_000913/1039881‑1040369 | aTTCATCTGCGTTCACAGCTGGCGACCAAACGCGCTGCACTGT‑TGGTGATGCTGTGCTTTTTGCTGGCGGGTTACTGGCTGTGGGTCGGTATTGATGGCTTTGTACTGCTCGCCCAGGATGCTAACGGTCCTTCCAATCCGTTAATGAAACTGGTGGCAGTGCTACCTGGTGCCTGGATGAATAATTTTGTCGAGTCGCCCGTTTTGTGGATCTTCCCGCTGCTG‑GGATTCTTCTGCCCATTGCTTACGGt < 1:640683/251‑1 (MQ=255) cATCTGCGTTCACAGCTGGCGACCAAACGCGCTGCACTGT‑TGGTGATGCTGTGCTTTTTGCTGGCGGGTTACTGGCTGTGGGGCGGGATTGATGGCTTTGTACTGCTCGCCCAGGATGCTAAAGGTCCTTCCAATCCGTTAATGAAACTGGGGGCAGTGCTACCTGGTGCCTGGATGAATAATTTTGTCGAGTCGCCCGTTTTTTGGATCTTCCCGCTGCTG‑GGATTCTTCTGCCCCTTGCTTACGGGGAt > 1:83224/1‑251 (MQ=255) tCACAGCTGGCGACCAAACGCGCTGCACTGT‑TGGTGATGCGGTGCTTTTTGCTGGCGGGGTACTGGCTGTGGGTCGGGATTGATGGCTTTGTACTGCTCGCCCAGGATGCTAACGGTCCTTCCAATCCGTTAATGAAACTGGTGGCAGTGCTACCTGGTGCCTGGATGAATAATTTTGTCGAGTCGCCCGTTTTGTGGATCTTCCCGCTGCTG‑GGATTCTTCTGCCCATTGCTTACGGTGATGGCGAttt < 2:164894/250‑1 (MQ=255) cacaGCTGGCGACCAAACGCGCTGCACTGT‑TGGTGATGCTGTGCTTTTTGCTGGCGGGTTACTGGCTGTGGGTCGGTATTGATGGCTTTGTTCTGCTCGCCCCTGATGCTAACGGTCCTTTCAATCCGTTAATGAAACTGGTGGCAGTGCTTCCCGGTGCCTGGTTGAATAATTTTTTCGAGTCGCCCGTTTTGTGGTTCTTCCCGCTGCTG‑GGATTCTTCTGCCCCTTGCTTACGGTTATGGGGAttttt > 2:860098/1‑249 (MQ=255) ccaGCTGGAGACCAAACGCGCTGCACTGT‑TGGTGATGCTGTGCTTTTTGCTGGCGGGTTACTGGATGGGGGGCGTTATTGATGGCTTTGTACTGCTCGCCCAGGATGCTAACGGTCCTTCCAATCCGTTAATGAAACTGGTGGCAGTGCTACCTGGTGCCTGGATGAATAATTTTGTCGAGTCGCCCGTTTTGTGGATCTTCCCGCTGCTG‑GGATGCTTCTGCCCATTGCTTACGGTGATGGCGATTTATc < 2:289662/250‑1 (MQ=255) aGCTGGCGACCAAACGCGCTGCACTGT‑TGGTGATGCTGTGCTTTTTGCTGGCGGGATACTGGCTGTGGGGAGGGATTGAGTGCTTTGTAATGCTCGCCCAGGATGCTAACGGTCCTTCCAATACGTTTATGAAACTTGTGGCAGTTCTAACTGGTGCCTGGGTGAATAATTTTGTCGAGTCGCCCGTTTTGTGGATCTTCCCGC‑GGTGTGAATTCTTCTGCCCATTGCTTACGGTGGTGGAGTTTTAtggt > 2:604971/1‑248 (MQ=255) gCTGGCGACCAATCGCGCTTCACTGT‑TGGTGAGGCTGTGCTTTTTGCGGGCGGGTTACTGGCTGTGGGTCGGTATTGTTGGCTTTGTACTGCTCGCCCAGGATGCTAACGGTCCTTCCAATCCGTTAATGAAACTGTTGGCAGTGCTACCTGGTGCCTGGATGAATAATTTTGTCGAGTCGCCCGTTTTGTGGATCTTCCCGCTGCTG‑GGATTCTTCTGCCCATTGCTTACGGTGATGGCGATTTATCGtt < 2:661920/251‑2 (MQ=255) gCTGGCGACCAAACGCGCTGCACTGT‑TGGTGATGCTGTGCTTTTTGCTGGCGGGTTACTGGCTGTGGGTCGGTATTGATGGCTTTGTACTGCTCGCCCAGGATGCTAACGGTCCTTCCAATCCGTTAATGAAACTGGTGGCAGTGCTACCTGGTGCCTGGATGAATAATTTTGTCGAGTCGCCCGTTTTGTGGATCTTCCCGCTGCTG‑GGATTCTTCTGCCCATTGCTTACGGTGATGGCGATTTATCGTg < 1:697255/251‑1 (MQ=255) gCTGGCGACCAAACGCGCTGCACTGT‑TGGTGATGCTGTGCTTTTTGCTGGCGGGTTACTGGCTGTGGGTCGGTATTGATGGCTTTGTACTGCTCGCCCAGGATGCTAACGGTCCTTCCAATCCGTTAATGAAACTGGTGGCAGTGCTACCTGGTGCCTGGATGAATAATTTTGTCGAGTCGCCCGTTTTGTGGATCTTCCCGCTGCTG‑GGATTCTTCTGCCCATTGCTTACGGTGATGGCGATTTATCGTg < 1:880204/251‑1 (MQ=255) cTGGCGACCAAACGCGCTGCACTGT‑TGGTGATGCTGTGCTTTTTGCTGGCGGGTTACTGGCTGTGGGTCGGTATTGATGGCTTTGTACTGCTCGCCCAGGATGCTAACGGTCCTTCCAATCCGTTAATGAAACTGGTGGCAGTGCTACCTGGTGCCTGGATGAATAATTTTGTCGAGTCGCCCGTTTTGTGGATCTTCCCGCTGCTT‑GGATTCTTCTGCCCATTGCTTACGGTGATGGCGGTTTATCGTgg > 1:343418/1‑251 (MQ=255) gccAAACGCGCTGCACTGT‑TGGTGATGCGGTGCTTTTTGCTGGCGGGGTACTGGCTGTGGGTCGGTATTGATGGCTTTGTACTGCTCGCCCAGGATGCTAACGGTCCTTCCAATCCGTTAATGAAACTGGTGGCAGTGCTACCTGGTGCCTGGATGAATAATTTTGTCGAGGCGCCCGTTTTGTGGATCTTCCCGCTGCTG‑GGATTCTTCTGCCCATTGCTTACGGTGATGGCGATTTATCGTGGTCGccc < 2:462124/250‑1 (MQ=255) ccAACCGCGCTGCACTGT‑TGGTGATGCTGTGCTTTTTGCTGGCGGGTTACTGGCTGGGGGTCGGGATTGATGGCTTTTTTCCGCTCGCCCAAGATGCTAAAGGTCCTTCCAATCCGTTTATGAAAATGGTGGCAGAGCTAACTTGTGCCTGGGTGGATAATTTTTTTGAGTCGCCCGTTTTGTGGGTCTTCCCGCTGCTG‑GGGATCTTCTGCCCCTTGCTTACGGGGATGGCGTTTTATCGTGGGCGCCCg > 2:768955/1‑251 (MQ=255) cAAACGCGCTGCACTGT‑TGGTGATGCTGTGCTTTTTGCTGGCGGGTTACTGGCTGTGGGTCGGTATTGATGGCTTTGTACTGCTCCCCCAGGATGCTAACGGTCCTTCCAATCCGTTAATGAAACTGGTGGCAGTGCTACCTGGTGCCTGGCTGAATAATTTTGTCGAGTCGCCCGTTTTGTGGGGCTTCCCGCTGCTG‑GGGTTCTTCTGCCCATTGCTTACGGTGATGGCGGTTTTTCGGGGTCGCCCgg > 1:147476/1‑251 (MQ=255) aaCGCGCTGCACTGT‑TGGTGATGCTGTGCTTTTTGCTGGCGGGTTACTGGCTGTGGGTCGGTATTGATGGCTTTGTACTGCTCGCCCAGGATGCTAACGGTCCTTCCAATCCGTTAATGAAACTGGTGGCAGTGCTACCTGGTGCCTGGATGAATAATTTTGTCGAGTCGCCCGTTTTGTGGATCTTCCCGCTGCTG‑GGATTCTTCTGCCCATTGCTTACGGTGATGGCGATTTATCGTGGTCGCCCGGG‑t < 1:683858/251‑1 (MQ=255) aaCGCGCTGCACTGT‑TGGTGATGCTGTGCTTTTTGCTGGCGGGTTACTGGCTGTGGGTCGGTATTGATGGCTTTGTACTGCTCGCCCAGGATGCTAACGGTCCTTCCAATCCGTTAATGAAACTGGTGGCAGTGCTACCTGGTGCCTGGATGAATAATTTTGTCGAGTCGCCCGTTTTGTGGATCTTCCCGCTGCTG‑GGATTCTTCTGCCCATTGCTTACGGTGATGGCGATTTATCGTGGTCGCCCGGG‑t < 1:628243/251‑1 (MQ=255) gcgcTGCACTGTGTGG‑GATTCTGGGCTTTTTGCTGGCGGGTTACGGGCTTTGGGTCGGTAGTGATGGCTTTGTACTTCTCGCCCAGGATGCTAACGGTCCTTCCAATCCGTTAATGATACTGGTGGCAGTGCTTCCTGGTGCCTGGATGAATAATTTTGTCGAGTCGCCCGTTTTGTTGATCTTCCCGCTGCTG‑GGATTCTTCTGCCCATTGCTTACGGTGATGGCGATTTATCGTGGTCGCCCGGG‑TTgg < 1:649221/251‑1 (MQ=255) cgcTGCACTGT‑TGGTGATGCTGTGCTTTTTGCTGGCGGGTTAATGGCTGGGGGTCGGTATTGATGGCTTTGTACTGCTCGCCCAGGATGCTAACGGTCCTTCCAATCCGTTAATGAAACTGGTGGCAGGGCTACCTGGTGCCTGGGTGGATAATTTTGTCGAGTCGCCCGTTTTGTGGATCTTCCCGCTGCTG‑GGGTTCTTCTGCCCATTGCTTACGGTGATGGCGATTTATCGTGGTCGCCCGGG‑TTggg > 1:284759/1‑251 (MQ=255) gcTGCACTGT‑TGGTGATGCTGTGCTTTTTGCTGGCGGGTTACTGGCTGTGGGGCGGTAGTGGTGGCTTTGTACTGCTCGCCCAGGATGCTAACGGGCCTTCCAATCCGTTTATGAAACTGGGGGAAGGGCTACCTGGTGCCTGGGTGAATAATTTTGTCGAGGTGCCCGTTTTGTGGATCTTCCCGCTGCTT‑GGATTCTTCTGCCCATTGCTTTCGGGGTTAGCGGGTTTTCGTGGTCGCCCGGGGTTggg > 2:861985/1‑251 (MQ=255) gCACTGT‑TGGTGATGCTGTGCTTTTTGCTGGCTGGTTACTGGCTGTGGGTCGGTATTGATGGCTTTGTACTGCTCGCCCAGGATGCTAACGGTCCTTCCAATCCTTTAATGAAACTGGTGGCAGTGCTACCTGGTGCCTGGATGAATAATTTTGTCGAGTCGCCCGTTTTGTGGATCTTCCCGCTGCTG‑GGATTCTTCTGCCCATTGCTTACGGTGATGGCGATTTATCGTGGTCGCCCGGG‑TTGGGGAt < 2:637876/250‑1 (MQ=255) gCACTGT‑TGGTGATGCTGTGCTTTTTGCTGGCGGGTTACTTGCTGTTGGTCGGTATTGATGGCTTTGTACGGCTCGCCCAGGGTTGTAACGGTCCTTCCAATACCTTAATGAAACTGGTGGCCGGGCGACCTTGGGCCTGGGTGGATTATTTTGTCGAGTCACCCGTTTTGTGGGGCTTTCCGCTGCTG‑GGGTTCTTCTGCCCATTGCTTACGGTGATGGCGCTTTATCGTTGTCGCCCGGG‑GTGGGGagt > 1:8241/1‑249 (MQ=255) gCACTGT‑TGGTGATGCTGTGCTTTTTGCTGGCGGGTTACTGGCTGTGGGTCGGTATTGATGGCTTTGTACTGCTCGCCCAGGATGCTAACGGTCCTTCCAATCCGTTAATGAAACTGGTGGCAGTGCTACCTGGTGCCTGGATGAATAATTTTGTCGAGTCGCCCGTTTTGTGGATCTTCCAGCTGCTG‑GGATTCTTCTGCCCATTGCTTACGGTGATGGCGATTTATCGTGGTCGCCCGGG‑TTGGGGAtt < 1:497146/251‑1 (MQ=255) gtgCTTTTTGCTGGCGGGTTACTGGCTGTGGGTCGGTATTGATGGCTTTGTACTGCTCGCCCAGGATGCTAACGGTCCTTCCAATCCGTTAATGAAACTGGTGGCAGTGCTACCTGGTGCCTGGATGAATAATTTTGTCGAGTCGCCCGTTTTGTGGATCTTCCCGCTGCTG‑GGATTCTTCTGCCCATTGCTTACGGTGATGGCGATTTATCGTGGTCGCCCGGG‑TTGGGGATTTTTGATGGCATCATTGa < 1:504068/251‑1 (MQ=255) gCTTTTTGCTGGCGGGTTACTGGCTGTGGGTCGGTATTGATGGCTTTGTACTGCTCGCCCAGGATGCTAACGGTCCTTCCAATCCGTTAATGAAACTGGTGGCAGTGCTACCTGGTGCCTGGATGAATAATTTTGTCGAGTCGCCCGTTTTGTGGATCTTCCCGCTGCTG‑GGATTCTTCTGCCCATTGCTTACGGTGATGGCGATTTATCGTGGTCGCCCGGG‑TTGGGGATTTTTGATGGCATCATTGAt < 1:150469/250‑1 (MQ=255) gCTTTTTGCTGGCGGGTTACTGGCTGTGGGTCGGTATTGATGGCTTTGTACTGCGCGCCCAGGATGCTAACGGTCCTTCCAATCCGTTAATGAAACTGGTGGCAGTGCTACCTGGTGCCTGGATGAATAATTTTGTCGAGTCGCCCGTTTTGTGGATCTTCCCGCTGCTG‑GGATTCTTCTGCCCATTGCTTACGGTGATGGCGATTTATCGTGGTCGCCCGGG‑TTGGGGATTTTTGATGGCATCATTGAt < 1:426550/250‑1 (MQ=255) cTTTTTGCTGGCGGGTTACTGGCTGTGGGTCGGTATTTATGGCCTTGAACTGCTCGCCCCGGATGCTAACGGTCCTTTCAAATCGTTCTTGAAACTGGTGGCAGTGCTTCCCGGGGCCTGGATTGATTATTTTGTCGGGACGCCCGTTTTGTGGATTTTTCCGCTGCTG‑GGAGTCTTTTGCCCATTGCTTCAGGTGTTGGCGATTTATCGTGGTCGACCGGG‑TTGGGGGttttttgtggcgtcctttgtgt > 2:56837/1‑234 (MQ=255) ttttGCTGGCGGGTTACTGGCTGTGGGTCGGTATTGATGGCTTTGTACTGCGCGCCCAGGATGCTAACGGTCCTTCCAAGCCGTTAATGGAACTGGTGGCAGTGCTACCTGGTGCCTGGATGAATAATTTTGTCGAGTCGCCCGTTTTGTGGATCTTCCCGCTGCTG‑GGATTCTTCTGCCCATTGCTTACGGTGATGGCGATTTATCGTGTTCGCCCGGG‑TTGGGGATTTTTGATGGCATCATTGATGc < 1:234001/249‑1 (MQ=255) gCTGGCGGGTTACTGGCTGTGGGTCGGTATTGATGGTTTTGTACTGCTCGCCCAGGATGCTAACGGTCCTTCCAATCCGTTAATGAAACTGGTGGCAGTGCTACCTGGTGCCTGGATGAATAATTTTGTCGAGTCGCCCGTTTTGTGGATCTTCCCGCTGCTG‑GGATTCTTCTGCCCATTGCTTACGGTGATGGCGATTTATCGTGGTCGCCCGGG‑TTGGGGATTTTTGATGGCATCATTGATGCAAttt < 2:193867/250‑1 (MQ=255) tGGCGGGGTACTGGCTTGGGGTCGGAATTGATGGCTTTGTACTGCTCGCCCAGGATGCTAACGGTCCTTCCAATCCGTTAATGAAACTGGTGGCATTGCTACCTGGTGCCTGGATTAATAATTTTGGCGAGCCGCCCGTTTTGTGGATCTTCCCGCTGCTG‑GGATTCTTCTGCCCATTGGTTCAGGTGGTTGCCATTTATCGTGGTCGCCCGGG‑TTGGGGGTTTTTGATGGCATCATTGATGCAATTTGGc > 2:476563/1‑251 (MQ=255) ggCGGGTTACTGGCTGTGGGTCGGTATTGATGGCTTTGTACTGCTCGCCCAGGATGCTAACGGTCCTTCCAATCCGTTAATGAAACTGGTGGCAGTGCTACCTGGTGCCTGGATGAATAATTTTGTCGAGTCGCCCGTTTTGTGGATCTTCCCGCTGCTG‑GGATTCTTCTGCCCATTGCTTACGGTGATGGCGATTTATCGTGGTCGCCCGGG‑TTGGGGATTTTTGATGGCATCATTGATGCAATTTGGc < 1:617300/250‑1 (MQ=255) ggCGGGTTACTGGCTGTGGGTCGGTATTGATGGCTTTGTACTGCTCGCCCAGGATGCTAACGGTCCTTCCAATCCGTTAATGAAACTGGTGGCAGTGCTACCTGGGGCCTGGATGAATAATTTTGTCGAGTCGCCCGTTTTGTGGATCTTCCCGCTGCTG‑GGATTCTTCTGCCCATTGCTTACGGTGATGGCGATTTATCGTGGTCGCCCGGG‑TTGGGGATTTTTGATGGCATCATTGATGCAATTTGGCg < 1:205434/251‑1 (MQ=255) ggCGGGTTACTGGCTGTGGGTCGGTATTGATGGCTTTGTACTGCTCGCCCAGGATGCTAACGGGCCTTCCAATCCGTTAATGAAACTGGTGGCAGTGCTACCTGGTGCCTGGATGAATAATTTTGTCGAGTCGCCCGTTTTGTGGATCTTCCCGCTGCTG‑GGATTCTTCTGCCCATTGCTTACGGTGATGGCGATTTATCGTGGTCGCCCGGG‑TTGGGGATTTTTGATGGCATCATTGATGCAATTTgg < 2:735159/249‑1 (MQ=255) ggTTACTGGCTGTGGGAAGGTATTGATGGCTTTGTACTGCTCGCCCAGGATGCTAACGGTCCTTCCAATCCGTTAATGAAACTGGTGGCAGTGCTACCTGGTGCCTGGATGAATAATTTTGTCGAGTCGCCCGTTTTGTGGATCTTCCCGCTGCTG‑GGATTCTTCTGCCCATTGCTTACGGTGATGGCGATTTATCGTGGTCGCCCGGG‑TTGGGGATTTTTGATGGCCTCATTGATGCAATTTGGCGTGAt > 2:101608/1‑251 (MQ=255) tACTGGCTGTGGGTCGGTATTGATGGCTTTGTACTGCTCGCCCAGGATGCTAACGGTCCTTCCAATCCGTTAATGAAACTGGTGGCAGTGCTACCTGGTGCCTGGATGAATAATTTTGTCGAGTCGCCCGTTTTGTGGATCTTCCCGCTGCTG‑GGATTCTTCTGCCCATTGCTTACGGTGATGGCGATTTATCGTGGTCGCCCGGG‑TTGGGGATTTTTGATGGCATCATTGATGCAATTTGGCGTGAttt < 1:490453/250‑1 (MQ=255) aCTGGCTTTGGGTCGGTATTGATGGCTTTGTACTGCTCGCCCAGGATGCTAACGGTCCTTCCAATCCGTTAATGAAACTGGTGGCAGTGCTACCTGGTGCCTGGATGAATAATTTTGTCGAGTCTCCCGTTTTGTGGATCTTCCCGCTGCTG‑GGATTCTTCTGCCCATTGCTTACGGTGATGGCGATTTATCGTGGTCGCCCGGG‑TTGGGGATTTTTGATGGCATCATTGATGCAATTTGGCGTGATTTTc < 1:613190/251‑1 (MQ=255) aCTGGCTGTGGGTCGGTATTGATGGCTTTGTACTGCTCGCCCAGGATGCTAACGGTCCTTCCAATCCGTTAATGAAACTGGTGGCAGTGCTACCTGGTGCCTGGATGAATAATTTTGTCGAGTCGCCCGTTTTGTGGATCTTCCCGCTGCTG‑GGATTCTTCTGCCCATTGCTTACGGTGATGGCGATTTATCGTGGTCGCCCGGG‑TTGGGGATTTTTGATGGCATCATTGATGCAATTTGGCGTGATTTTc < 1:289393/251‑1 (MQ=255) tGGCTGTGGGTCGGTATTGATGGCTTTGTACTGCTCGCCCAGGATGCTAACGGTCATTCCAATCCGTTAATGAAACTGGAGGCAGTGCTACCTGGTGCCTGGATGAATAATTTTGTCGAGTCGCCCGTTTTGTGGATCTTCCCGCTGCTG‑GGATTCTTCTGCCCATTGCTTACGGTGATGGCGATTTATCGTGGTCGCCCGGG‑TTGGGGATTTTTGATGGCATCATTGATGCAATTTGGCGTGATTTTCAc > 1:891894/1‑251 (MQ=255) ggctggtggtcggtttggttGGCTGTGTATTGCGCGCCCTGAATGCGAACGGTCCTGCCAAGTCGTTAATGAATCTGGTGGAAGTGTTACCTGGTGCCTGGATGAATAATTGTGTCGAGTCGTCCGATTTGTGTATCTACCCGCTGCTG‑GGATTCTTCTGCCCATTGCTTACGGGGATGGCGATTTATCGTGGTCGCCCGGG‑TTGGGGATTTTTGATGGCATCATTGATGCAATTGGGCGTGATTTCCAct < 2:690154/232‑2 (MQ=255) gtgGGTCGGTATTGATGGCTTTGTACTGCTCGCCCAGGATGCTAACGGTCCTTCCAATCCGTTAATGAAACTGGTGGCAGTGCTACCTGGTGCCTGGATGAATAATTTTGTCGAGTCGCCCGTTTTGTGGATCTTCCCGCTGCTG‑GGATTCTTCTGCCCATTGCTTACGGTGATGGCGATTTATCGTGGTCGCCCGGG‑TTGGGGATTTTTGATGGCATCATTGATGCAATTTGGCGTGATTTTCACggc > 1:916995/1‑249 (MQ=255) gtgGGTCGGTATTGATGGCTTTGGCCTGCTCGCCCAGGATGCTAACGGTCCTGCCAATCCGTTAATGAAACTGGTGGCAGTGCTACCTGGTGCCTGGATGAATAATTTTGTCGAGTCGCCCGTTTTGTGGATCTTCCCGCTGCTG‑GGATTCTTCTGCCCATTGCTTACGGTGATGGCGATTTATCGTGGTCGCCCGGG‑TTGGGGATTTTTGATGGCATCATTGATGCAATTTGGCGTGATTTTCACggcag < 2:410531/251‑1 (MQ=255) tCGGTATTGATGGCTTTGTACTGCTCGCCCAGGATGCTAACGGTCCTTCCAATCCGTTAATGAAACTGGTGGCAGTGCTACCTGGTGCCTGGATGAATAATTTTGTCGAGTCGCCCGTTTTGTGGATCTTCCCGCTGCTG‑GGATTCTTCTGCCCATTGCTTACGGTGATGGCGATTTATCGTGGTCGCCCGGG‑TTGGGGATTTTTGATGGCATCATTGATGCAATTTGGCGTGATTTTCACggcaggcctc > 1:24213/1‑248 (MQ=255) ggTATTGATGGCTTTGTACTGCTCGCCCAGGATGCTAACGGTCCTTCCAATCCGTTAATGAAACTGGTGGCAGTGCTACCTGGTGCCTGGATGAATAATTTTGTCGAGTCGCCCGTTTTGTGGATCTTCCCGCTGCTG‑GGATTCTTCTGCCCATTGCTTACGGTGATGGCGATTTATCGTGGTCGCCCGGG‑TTGGGGATTTTTGATGGCATCATTGCTGCAATTTGGCGTGATTTTCACggcaggccgccc > 2:33117/1‑246 (MQ=255) gTATTGATGGCTTTGTACGGCTCGCCCAGGATGCTAACGGTCCTTCCAATCCGTTAATGAAACTGGTGGCAGTGCTACCTGGTGCCTGGATGAATAATTTTGTCGAGTCGCCCGTTTTGTGGATCTTCCCGCTGCTG‑GGATTCTTCTGCCCATTGCTTACGGTGATGGCGATTTATCGTGGTCGCCCGGG‑TTGGGGATTTTTGATGGCATCATTGATGCAATTTGGCGTGATTTTCACGGCAGGCATCAC‑g < 2:10187/251‑1 (MQ=255) aTGGCTTTGTACTGCTCGCCCAGGATGCTAACGGTCCTTCCAATCCGTTAATGAAACTGGTGGCAGTGCTACCTGGTGCCTGGATGAATAATTTTGTCGAGTCGCCCGTTTTGTGGATCTTCCCGCTGCTG‑GGATTCTTCTGCCCATTGCTTACGGTGATGGCGATTTATCGTGGTCGCCCGGG‑TTGGGGATTTTTGATGGCATCATTGATGCAATTTGGCGTGATTTTCACGGCAGGCATCAC‑GCTGTTc > 1:770915/1‑251 (MQ=255) aTGGCTTTGTACTGCTCGCCCAGGATGCTAACGGTCCTTCCAATCCGTTAATGAAACTGGTGGCAGTGCTACCTGGTGCCTGGATGAATAATTTTGTCGAGTCGCCCGTTTTGTGGATCTTCCCGCTGCTG‑GGATTCTTCTGCCCATTGCTTACGGTGATGGCGATTTATCGTGGGCGCCCGGG‑TTGGGGATTTTTGATGGCATCATTGATGCAATTTGGAGTGATTTTCACGGCAGGAATCAC‑GCTGttt > 2:749239/1‑250 (MQ=255) ggCTTTGTACTGCTCGCCCAGGATGCTAACGGTCCTTCCAATCCGTTAATGAAACTGGTGGCAGTGCTACCTGGTGCCTGGATGAATAATTTTGTCGAGTCGCCCGTTTTGTGGATCTTCCCGCTGCTG‑GGATTCTTCTGCCCATTGCTTACGGTGATGGCGATTTATCGTGGTCGCCCGGG‑TTGGGGATTTTTGATGGCATCATTGATGCAATTTGGCGTGATTTTCACGGCAGGCATCAC‑GCTGTTccc < 1:324263/251‑1 (MQ=255) ggCTTTGTACTGCTCGCCCAGGATGCTAACGGTCCTTCCAATCCGTTAATGAAACTGGTGGCAGTGCTACCTGGTGCCTGGATGAATAATTTTGTCGAGTCGCCCGTTTTGTGGATCTTCCCGCTGCTG‑GGATTCTTCTGCCCATTGCTTACGGTGATGGCGATTTATCGTGGTCGCCCGGG‑TTGGGGATTTTTGAGGGCATCATTGATGCAATTTGGCGTGATTTTCACGGCAGGCATCAC‑GCTGTTcc < 1:578148/250‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |