| Predicted mutation | ||||||
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| RA | NC_000913 | 92,810 | T→C | T466T (ACT→ACC) | ftsI → | peptidoglycan DD‑transpeptidase FtsI |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_000913 | 92,810 | 0 | T | C | 97.4% | 368.4 / ‑1.9 | 120 | T466T (ACT→ACC) | ftsI | peptidoglycan DD‑transpeptidase FtsI |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (1/2); new base C (56/58); total (59/61) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 5.04e-01 | |||||||||||
Only 100 of 121 total aligned reads displayed.
GACTGGGAAAAGCGACCAATTTGGGGTTGGTCGGAGAACGCAGTGGCTTATATCCTCAAAAACAACGGTGGTCTGACATAGAGAGGGCCACCTTCTCTTTCGGCTACGGGCTAATGGTAACACCATTACAGTTAGCGCGAGTCTACGCAACTATCGGCAGCTACGGCATTTATCGCCCACTGTCGATTACCAAAGTTGACCCCCCGGTTCCCGGTGAACGTGTCTTCCCGGAATCCATTGTCCGCACTGTGGTGCATATGATGGAAAGCGTGGCGCTACCAGGCGGCGGCGGCGTGAAGGCGGCGATTAAAGGCTATCGTATCGCCATTAAAACCGGTACCGCGAAAAAGGTCGGGCCGGACGGTCGCTACATCAATAAATATATTGCTTATACC‑GCAGGCGTTGCGCCTGCGAGTCAGCCGCGCTTCGCGCTGGTTGTTGTTATCAACGATCCGCAGGCGGGTAAATACTACGGCGGCGCCGTTTCCGCGCCG > NC_000913/92563‑93056 | gACTGGGAAAAGCGACCAATTTGGGGTTGGTCGGAGAACGCAGTGGCTTATATCCTCAAAAACAACGGTGGTCTGACATAGAGAGGGCCACCTTCTCTTTCGGCTACGGGCTAATGGTAACACCGTTACAGTTAGCGCGAGTCTACGCAACTATCGGCAGCTACGGCATTTATCGCCCACTGTCGATTACCAAAGTTGACCCCCCGGTTCCCGGTGAACGTGTCTTCCCGGAATCCATTGTCCGCACcgtg > 1:746436/1‑251 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |