| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 89,321 | A→G | intergenic (+289/‑313) | cra → / → mraZ | DNA‑binding transcriptional dual regulator Cra/DNA‑binding transcriptional repressor MraZ |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 89,321 | 0 | A | G | 97.4% | 262.4 / NA | 76 | intergenic (+289/‑313) | cra/mraZ | DNA‑binding transcriptional dual regulator Cra/DNA‑binding transcriptional repressor MraZ |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); major base G (40/34); minor base T (0/2); total (40/36) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.21e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.75e-01 | |||||||||||
GAGTACGGGACTGGACATCAATATGCTTAAAGTAAATAAGACTATTCCTGACTATTATTGATAAATGCTTTTAAACCCGCCCGTTAATTAACTCACCAGCTGAAATTCACAATAATTAAGTGATATCGACAGCGCGTTTTTGCATTATTTTGTTACATGCGGCGATGAATTGCCGATTTAACAAACACTTTTCTTTGCTTTTGCGCAAACCCGCTGGCATCAAGCGCCAC‑ACAGACGTAACAAG‑GACTGTTAACCGGGGAAGATATGTCCTAAAATGCCGCTCGCGTCGCAAACTGACACTTTATATTTGCTGTGGAAAATAGTGAGTCATTTTAAAACGGTGATGACGATGAGGGATTTTTTCTTACAGCTATTCATAACGTTAATTTGCTTCGCACGTTGGACGTAAAATAAACAACGCTGATATTAGCCGTAAACATCGGGTTTTTTACCTCGGTATGCCTTGTGACTGGCTTGACAA > NC_000913/89079‑89559 | gagTACGGGAATGGACATCAATATCCTTAAAGTAAATAAGACTATTCCTGACTATTATTGATAAGTTCTTTTAAACCCGCCCGTTAATTAACTCACCAGCTGAAATTCACAATAATTAAGTGATATCGACAGCGCGTTTTTGCATTATTTTGTTACATGCAGAGATGAATTGCCGATTTAACAAGCACTTTTCTTTGCTTTTGCGCAAACCCGCTGGCATCAAGCGCCAC‑ACAGACGCAACAGG‑GACTGtt < 1:986919/251‑1 (MQ=255) gaatggaaataaatagccTTAAAGTAAATAAGACTATTCCTGACTATTATTGATAAGTTCTTTAAAACCCGCCCGTGAATTAACTCACCAGCTGAAATTCACAATAATTAAGTGATATCGACAGCGCGTTTTTGCATTATTTTGTTACATGCAGAGATGAAGTGCCGATTTAACAAGCACTTTTCTTTGCTTTTGCGCAAACCCGCTGGCATCAAGCGCAAC‑ACAGACGCAACATG‑GACTGCTAACCgggt < 2:151573/234‑2 (MQ=255) tGGACATCAATATCCTTAAAGTAAATAAGACTATTCCTGACTATTATTGATAAGTTCTTTTAAACCCGCCCGTTAATTAACTCACCAGCTGAAATTCACAATAATTAAGTGATATCGACAGCGCGTTTTTGCATTATTTTGTTACATGCAGAGATGAATTGCCGATTTAACAAGCACTTTTCTTTGCTTTTGCGCAAACCCGCTGGCATCAAGCGCCAC‑ACAGACGCAACAGG‑GACTGTTAACCGGGGa > 1:719610/1‑249 (MQ=255) aTCAATATCCTTAAAGTAAATAAGACTATTCCTGACTATTATTGATAAGTTCTTTTAAACCCGCCCGTTAATTAACTCACCAGCTGAAATTCACAATAATTAAGTGATCTCGACAGCGCGTTTTTGCATTATTTTGTTACATGCAGAGATGAATTGCCGATTTAACAAGCACTTTTCTTTGCTTTTGCGCAAACCCGCTGGCATCAAGCGCCAC‑ACAGAAGCAACAGG‑GACTGTTAACCGGGGAAGATATg > 2:317366/1‑251 (MQ=255) aTCAATATCCTTAAAGTAAATAAGACTATTCCTGACTATTATTGATAAGTTCTTTTAAACCCGCCCGTTAATTAACTCACCAGCTGAAATTCACAATAATTAAGTGATATCGACAGCGCGTTTTTGCATTATTTTGTTACATGCAGAGATGAATTGCCGATTTAACAAGCACTTTTCTTTGCTTTTGCGCAAACCCGCTGGCATCAAGCGCCAC‑ACAGACGCAACAGG‑GACTGTTAACCGGGGAAGATATg > 1:441213/1‑251 (MQ=255) atatCCTTAAAGTAAATAAGACTATTCCTGACTATTATTGATAAGTTCTTTTAAACCCGCCCGTTAATTAACTCACCAGCTGAAATTCACAATAATTAAGTGATATCGACAGCGCGTTTTTGCATTATTTTGTTACATGCAGAGATGAATCGCCGATTTAACAAGCACTTTTCTTTGCTTTTGCGCAAACCCGCTGGCATCAAGCGCCAC‑ACAGACGCAACAGG‑GACTGTTAACCGGGGAAGATATGTCCt > 1:286547/1‑251 (MQ=255) atccTTAAAGTAAATAAGACTATTCCTGACTATTATTGATAAGTTCTTTTAAACCCGCCCGTTAATTAACTCACCAGCTGAAATTCACAATAATTAAGTGATATCGACAGCGCGTTTTTGCATTATTTTGTTACATGCAGAGATGAATTGCCGATTTAACAAGCACTTTTCTTTACTTTTGCGCAAACCCGCTGGCATCAAGCGCCAC‑ACAGACGCAACAGG‑GACTGTTAACCGGGGAAAATATGTCCTa > 2:884342/4‑250 (MQ=255) aaaGTAAATAAGTCTATTCCTGACTATTATTGATAAGTTCTTTTAAACCCGCCCGTTAATTAACTCACCAGCTGAAATTCACAATAATTAAGTGATATCGACAGCGCGTTTTTGCATTATTTTGTTACATGCAGAGATGAATTGCCGATTTAACAAGCACTTTTCTTTGCTTTTGCGCAAACCCGCTGGCATCAAGCGCCAC‑ACAGACGCAACAGG‑GACTGTTAACCGGGGAAGATATGTCCTAAAATGcc < 2:952396/251‑1 (MQ=255) aaaTAAGACTATTCCTGACTATTATTGATAAGTTCTTTTAAACCCGCCCGTTAATTAACTCACCAGCTGAAATTCACAATAATTAAGTGATATCGACAGCGCGTTTTTGCATTATTTTGTTACATGCAGAGATGAATTGCCGATTTAACAAGCACTTTTCTTTGCTTTTGCGCAAACCCGCTGGCATCAAGCGCCAC‑ACAGACGCAACAGG‑GACTGTTAACCGGGGAAGATATGTCCTAAAATGCCGCTc < 1:945380/250‑1 (MQ=255) aaGACTATTCCTGACTATTATTGATAAGTTCTTTTAAACCCGCCCGTTAATTAACTCACCAGCTGAAATTCACAATAATTAAGTGATATCGACAGCGCGTTTTTGCATTATTTTGTTACATGCAGAGATGAATTGCCGATTTAACAAGCACTTTTCTTTGCTTTTGCGCAAACCCGCTGGCATCAAGCGCCAC‑ACAGACGCAACAGG‑GACTGTTAACCGGGGAAGATATGTCCTAAAATGCCGCTCGCGTc < 1:3094/251‑1 (MQ=255) tATTCCTGCCTATTATTGATACGTTCTTTTAAACCCGCCCGTTAATTAACTCACCAGCTTAAATTCACAATAATTAAGTGATATCGACAGCGCGATTTTGCATTATTTTGTTACATGCAGAGATGAATTGCCGCTTTAACAAGCACTTTTCTTTGCTTTTGCGAAAACCAGCTGGCATCAACCGCCAC‑ACTGACGCAACAGG‑GACTGTCAACCGGGGAAGCTATGTCCTATATGGCCGCTCGCGTCGCaa > 2:733099/1‑250 (MQ=255) aTTCCTGACTATTATTGATAAGTTCTTTTAAACCCGCCCGTTAATTAACTCACCAGCTGAAATTCACAATAATTAAGTGATATCGACAGCGCGTTTTTGCATTATTTTGTTACATGCAGAGATGAATTGCCGATTTAACAAGCACTTTTCTTTGCTTTTGCGCAAACCCGCTGGCATCAAGCGCCAC‑ACAGACGCAACAGG‑GACTGTTAACCGGGGAAGATATGTCCTAAAATGCCGCTCGCGTCGCaaa < 1:345035/250‑1 (MQ=255) tCCTGACTATTATTGATAAGTTCTTTTAAACCCGCCCGTTAATTAACTCACCAGCTGAAATTCACAATAATTAAGTGATATCGACAGCGCGTTTTTGCATTATTTTGTTACATGCAGAGATGAATTGCCGATTTAACAAGCACTTTTCTTTGCTTTTGCGCAAACCCGCTGGCATCAAGCGCCAC‑ACAGACGCAACAGG‑GACTGTTAACCGGGGAAGATATGTCCTAAAATGCCGCTCGCGTCGCAAACt < 1:974290/250‑1 (MQ=255) attattGATAAGTTCTTTTAACCCCGCCCGTTAATTAACTCACCAGCTGAAATTCACAATAATTAAGTGTTATCGACAGCGCGTTTTTGCATTATTTTGTTACATGCAGAGATGAATTGCCGATTTAACAAGCACTTTTCTTTGCTTTTGCGCAAACCCGCTGGCATCAAGCGCCAC‑ACAGACGCAACAGG‑GACTGTTAACCGGGGAAGATATGTCCTAAAATGCCGCTCGCGTCGCAAACTGACACtt < 1:583100/249‑1 (MQ=255) attattGATAAGTTCTTTTAAACCCGCCCGTTAATTAACTCACCAGCTGAAATTCACAATAATTAAGTGATATCGACAGCGCGTTTTTGCATTATTTTGTTACATGCAGAGATGAATTGCCGATTTAACAAGCACTTTTCTTTGCTTTTGCGCAAACCCGCTGGCATCAAGCGCCAC‑ACAGACGCAACAGG‑GACTGTTAACCGGGGAAGATATGTCCTAAAATGCCGCTCGCGTCGCAAACTGACACttt < 1:758860/250‑1 (MQ=255) attattGATAAGTTCTTTTAAACCCGCCCGTTAATTAACTCACCAGCTGAAATTCACAATAATTAAGTGATATCGACAGCGCGTTTTTGCATTATTTTGTTACATGCAGAGATGAATTGCCGATTTAACAAGCACTTTTCTTTGCTTTTGCGCAAACCCGCTGGCATCAAGCGCCAC‑ACAGACGCAACAGG‑GACTGTTAACCGGGGAAGATATGTCCTAAAATGCCGCTCGCGTCGCAAACTGACACtt < 2:654191/249‑1 (MQ=255) tGATAAGTTCTTTTAAACCCGCCCGTTAATTAACTCACCAGCTGAAATTCACAATAATTAAGTGATATCGACAGCGCGTTTTTGCATTATTTTGTTACATGCAGAGATGAATTGCCGATTTAACAAGCACTTTTCTTTGCTTTTGCGCAAACCCGCTGGCATCAAGCGCCAC‑ACAGACGCAACAGG‑GACTGTTAACCGGGGAAGATATGTCCTAAAATGCCGCTCGCGTCGCAAACTGACACTTTATAtt < 1:993345/250‑1 (MQ=255) ataagttcTTTTAAACCCGCCCGTTAATTAACTCACCAGCTGAAATTCACAATAATTAAGTGATATCGACAGCGCGTTTTTGCATTATTTTGTTACATGCAGAGATGAATTGCCGATTTAACAAGCCCTTTTCTTTGCTTTTGCGCAAACCCGCTGGCATCAAGCGCCAC‑ACAGACGCAACAGG‑GACTGTTAACCGGGGAAGATATGTCCTAAAATGCCGCTCGCGTCGCAAACTGACACTTTATATTTGc > 1:750632/8‑251 (MQ=255) atgtcTTTTAAATCCGCCTGTGGATTAACTACCCAGTTGAAATCCCCAATATATCAGTGATAACGACATCTCGTGTTTGCATTATTTAGTTCCATGCAGAGAGGAATTGCCGATTTAACAAGCACTTTTCTTTGCTTTTGCGCAAACCCGCTGGAATCAAGCGCCAC‑ACAGCCTCAACAGG‑GACTGTTAACCGGTTAAGATAGTTCCTAAAATGCCGCTCGCGACGCCAACTGACCCTTTATAGTTGCtgt < 2:727491/247‑1 (MQ=255) agttcTTTTAAACCCGCACGTTAATTAACTCACCAGCTGAAATTCACAATAATTAAGTGATATCGACAGCGCGTTTTTGCATTATTTTGTTACATGCAGAGATGAATTGCCGATTTAACAAGCACTTTTCTTTGCTTTTGCGCAAACCCGCTGGCATCAAGCGCCAC‑ACAGACGCAACAGG‑GACTGTTAACCGGGGAAGATATGTCATAAAATGCCGCTCGCGTCGCACACTGGCACTTTATATTTGCtgt > 1:765948/5‑251 (MQ=255) tcTTTTAAACCCGCCCGTTAATTAACTCACCAGCTGAAATTCAAAATAATTATGTGATATCGACAGCGCGTTTTTGCATTATTTTGTTACATGCAGAGATGAATTGCCGATTTAACAAGCACTTTTCTTTGCTTTTGCGCAAACCCGCTGGCATCAAGCGCCAC‑ACAGACGCAACAGG‑GACTGTTAACCGGGGAAGATATGTCCTAAAATGCCGCTCGCGTCGCAAACTGACACTTTATATTTGCTGTgg > 1:362319/2‑250 (MQ=255) ttAAACCCGCCCGTTAATTAACTCACCAGCTGAAATTCACAATAATTAAGTGATATCGACAGCGCGTTTTTGCATTATTTTGTTACATGCAGAGATGAATTGCCGATTTAACAAGCACTTTTCTTTGCTTTTGCGCACACCCGCTGGCATCAAGCGCCAC‑ACAGACGCAACAGG‑GACTGTTAACCGGGGAAGATATGTCCTAAAATGCCGCTCGCGTCGCAAACTGACACTTTATATTTGCTGTGGAAAAt > 1:891368/1‑251 (MQ=255) ccgccctTTAATTAACTCACCAGCTGAAATTCACAATAATTAAGTGATATCGACAGCGCGTTTTTGCATTATTTTGTTACATGCAGAGATGAATTGCCGATTTAACAAGCACTTTTCTTTGCTTTTGCGCAAACCCGCTGGCATCAAGCGCCAC‑GCAGACGCAACAGG‑GACTGTTAACCGGGGAAGATATGTCCTAAAATGCCGCTCGCGTCGCAAACTGACACTTTATATTTGCTGTGGAAAATAGTGAg < 1:482647/251‑1 (MQ=255) accgTTAATTAACTCACCAGCTGAAATTCACAATAATTAAGTGATATCGACAGCGCGTTTTTGCATTATTTTGTTACATGCAGAGATGAATTGCCGATTTAACAAGCACTTTTCTTTGCTTTTGCGCAAACCCGCTGGCATCAAGCGCCAC‑ACAGACGCAAACGG‑GACTGTTAACAGGGGAAGATATGTCCTAAAATGCCGCTCGCGTCGCAAACTGACACTTTATATTTGCTGTGGAAAATAGTGCGTc > 2:104887/2‑250 (MQ=255) ccgTTAATTAACTCACCAGCTGAAATTCACAATAATTAAGTGATATCGACAGCGCGTTTTTGCATTATTTTGTTACATGCAGAGATGAATTGCCGATTTAACAAGCACTTTTCTTTGCTTTTGCGCAAACCCGCTGGCATCAAGCGCCAC‑ACAGACGCAACAGG‑GACTGTTAACCGGGGAAGATATGTCCTAAAATGCCGCTCGCGTCGCAAACTGACACTTTATATTTGCTGTGGAAAATAGTGAGTCAt < 1:110583/251‑1 (MQ=255) ttaaCTCACCATCTGAAATTCACAATAATTAAGTGATATCTACAGCGCGTTTTTGCATTATTTTGTTACATGCAGAGATGAATTGCCGATTTAACAAGCACTTTTCTTTGCTTTTGCGCAAACCCGCTGGCATCAAGCGCCAC‑ACAGACGCAACAGG‑GACTGTTAACCGGGGCAGATATGTCCTAAAATGCCGCTCGCGTCGCAAACTGACACTTTATATTTGCTTTGGAAAATAGGGAGTCATTATaaa > 2:710039/1‑250 (MQ=255) cACCAGCTGAAATTCACAATAATTAAGTGATATCGACAGCGCGGTTTTGCATTATTTTGTTACATGCAGAGATGAATTGCCGATTTAACAAGCACTTTTCTTTGCTTTTGCGCAAACCCGCGGGCATCAAGCGCCAC‑ACAGACGCAACAGG‑GACTGTTAACCGGGGAAGATATGTCCTAAAATGCCGCTCTCGTCGCAAACTGACACTTGATATTTGCTGTGGAAAATAGTGAGTCATTTTAAAACGGtga < 1:489502/251‑1 (MQ=255) aCCAGCTGTAATTCATACAAATTCAGTGATATCGACAGAGCGTTGTTGCATTTTTGTGTAACATGCAGAGATGAATTGCCGAATTAACCATCACTCTTCTTTGCTTTTGCTCAAACTCGCTGGCATCAAGCGCCAC‑ACAGACGCAA‑ATGTGACTTTTAATCGTGTAAGATAAGTACTAAAATGCCGCTCGAGACGCAAACTGACACTTTATATTTGCTGTGGAAAATATTGAGTCATTTTAATACGGtgat < 2:589684/251‑1 (MQ=255) cAGCTGAAATTCACAATAATTAAGTGATATCGACAGCGCGTTTTTGCATTATTTTGTTACATGCAGAGATGAATTGCCGATTTAACAAGCACTTTTCTTTGCTTTTGCGCAAACCCGCTGGCATCAAGCGCCAC‑ACAGACGCAACAGG‑GACTGTTAACCGGGGAAGATATGTCCTAAAATGCCGCTCGCGTCGCAAACTGACACTTTATATTTGCTGTGGAAAATAGTGAGTCATTTTAAAACGGtgatga < 1:425993/251‑1 (MQ=255) aGCTGAAATTCACAATAATTAAGTGATATCGACAGCGCGTTTTTGCATTATTTTGTTACATGCAGAGATGAATTGCCGATTTAACAAGCACTTTTCTTTGCTTTTGCGCAAACCCGCTGGCATCAAGCGCCAC‑ACAGACGCAACAGG‑GACTGTTAACCGGGGAAGATATGTCCTAAAATGCCGCTCGCGTCGCAAACTGACACTTTATATTTGCTGTGGAAAATAGTGAGTCATTTTAAAACGGTGATGAc > 2:193809/1‑251 (MQ=255) tGAAATTCACAATAATTAAGTGATATCGACAGCGCGTTTTTGCATTATTTTGTTACATGCAGAGATGAATTGCCGATTTAACAAGCACTTTTCTTTGCTTTTGCGCAAACCCGCTGGCATCAAGCGCCAC‑ACAGACGCAACAGG‑GACTGTTAACCGGGGAAGATATGTCCTAAAATGCCGCTCGCGTCGCAAACTGACACTTTATATTTGCTGTGGAAAATAGTGAGTCATTTTAAAACGGTGATGACGAt > 1:158666/1‑251 (MQ=255) aTTCACAATAATTAAGGGATATCGACAGCGCGTTTTTGCATTATTTTGTTACATGCAGAGATGAATTGCCGATTTAACAAGCACTTTTCTTTGCTTTTGCGCAAACCCGCTGGCATCAAGCGCCAC‑ACAGACGCAACAGG‑GACTGTTAACCGGGGAAGATATGTCCTAAAATGCCGCTCGCGTCGCAAACTGACACTTTATATGTGCTGTGGAAAATAGTGAGTCATTTTAAAACGGTGATGACGATGAgg < 2:224965/251‑1 (MQ=255) tCACAATAATTAAGTGATATCGACAGCGCGTTTTTGCATTATTTTGTTACATGCAGAGATGAATTGCCGATTTAACAAGCACTTTTCTTTGCTTTTGCGCAAACCCGCTGGCATCAAGCGCCAC‑ACAGACGCAACAGG‑GACTGTTAACCGGGGAAGATATGTCCTAAAATGCCGCTCGCGTCGCAAACTGACACTTTATATTTGCTGTGGAAAATAGTGAGTCATTTTAAAACGGTGATGACGATGAgggg > 1:356665/1‑250 (MQ=255) aataatTAAGTGATATCGACAGCGCGTTTTTGCATTATTTTGTTACATGCAGAGATGAATTGCCGATTTAACAAGCACTTTTCTTTGCTTTTGCGCAAACCCGCTGGCATCAAGCGCCAC‑ACAGACGCAACAGG‑GACTGTTAACCGGGGAAGATATGTCCTAAAATGCCGCTCGCGTCGCAAACTGACACTTTATATTTGCTGTGGAAAATAGTGAGTCATTTTAAAACGGAGATGACGATGAGGGAtttt > 1:356970/1‑251 (MQ=255) atTAAGTGATATCGACAGCGCGTTTTTGCATTATTTTGTTACATGCAGAGATGAATTGCCGATTTAACAAGCACTTTGCTTTGCTTTTGCGCAAACCCGCTGGCATCAAGCGCCAC‑ACAGACGCAACAGG‑GACTGTTAACCGGGGAAGATATGTCCTAAAATGCCGCTCGCGTCGCAAACTGACACTTTATATTTGCTGTGGAAAATAGTGAGTCATTTTAAAACGGTGATGACGATGAGGGATTTTTTCt < 1:188320/251‑1 (MQ=255) cGACAGCGCGTTTTTGCATTATTTTGTTACATGCAGAGATGAATTGCCGATTTAACAAGCACTTTTCTTTGCTTTTGCGCAAACCCGCTGGCATCAAGCGCCAC‑ACAGACGCAACAGG‑GACTGTTAACCGGGGAAGATATGTCCTAAAATGCCGCTCGCGTCGCAAACTGACACTTTATATTTGCTGTGGAAAATAGTGAGTCATTTTAAAACGGTGATGACGATGAGGGATTTTTTCTTACAGCTATTc < 1:439555/250‑1 (MQ=255) gACAGCGCGTTTTTGCATTATTTTGTTAAATGCAGAGATGAATTGCCGATTTAACAAGCACTTTTCTTTGCTTTTGCGCAAACCCGCTGGCATCAAGCGCCAC‑ACAGACGCAACAGG‑GACTGTTAACCGGGGAAGATATGTCCTAAAATGCCGCTCGCGTCGCAAACTGACACTTTATATTTGCTGTGGAAAATAGTGAGTCATTTTAAAACGGTGATGACGATGAGGGATTTTTTCTTACAGCTATTCAt > 2:620122/1‑251 (MQ=255) gcgTTTTTGCATTATTTTGTTACATGCAGAGATGAATTGCCGATTTAACAAGCACTTTTCTTTGCTTTTGCGCAAACCCGCTGGCATCAAGCGCCAC‑ACAGACGCAACAGG‑GACTGTTAACCGGGGAAGATATGTCCTAAAATGCCGCTCGCGTCGCAAACTGACACTTTATATTTGCTGTGGAAAATAGTGAGTCATTTTAAAACGGTGATGACGTTGAGGGATTTTTTCTTACAGCTATTCATAACGtt > 2:489088/1‑251 (MQ=255) gTTTTTGCATTATTTTGTTACATGCAGAGATGAATTGCCGATTTAACAAGCACTTTTCTTTGCTTTTGCGCAAACCCGCTGGCATCAAGCGCCAC‑ACAGACGCAACAGG‑GACTGTTAACCGGGGAAGATATGTCCTAAAATGCCGCTCGCGTCGCAAACTGACACTTTATATTTGCTGTGGAAAATAGTGAGTCATTTTAAAACGGTGATGACGATGAGGGATTTTTTCTTACAGCTATTCATAACGTTa > 1:582778/1‑250 (MQ=255) tttGTTACATGCAGAGATGAATTGCCGATTTAACAAGCACTTTTCTTTGCTTTTGCGCAAACCCGCTGGCATCAAGCGCCAC‑ACAGACGCAACAGG‑GACTGTTAACCGGGGAAGATATGTCCTAAAATGCCGCTCGCGTCGCAAACTGACACTTTATATTTGCTGTGGAAAATAGTGAGTCATTTTAAAACGGTGATGACGATGAGGGATTTTTTCTTACAGCTATTCATAACGTTAATTTGCTGCGCACg > 1:532500/1‑251 (MQ=255) tttGTTACATGCAGAGATGAATTGCCGATTTAACAAGCACTTTTCTTTGCTTTTGCGCAAACCCGCTGGCATCAAGCGCCAC‑ACAGACGCAACAGG‑GACTGTTAACCGGGGAAGATATGTCCTAAAATGCCGCTCGCGTCGCAAACTGACACTTTATATTTGCTGTGGAAAATAGTGAGTCATTTTAAAACGGTGATGACGATGAGGGATTTTTTCTTACAGCTATTCATAACGTCAATTTGCTGCGCACg > 1:878530/1‑251 (MQ=255) ttGTTACATGCAGAGATGAATTGCCGATTTAACAAGCACTTTTCTTTGCTTTTGCGCAAACCCGCTGGCATCAAGCGCCAC‑ACAGACGCAACAGG‑GACTGTTAACCGGGGAAGATATGTCCTAAAATGCCGCTCGCGTCGCAAACTGACACTTTATATTTGCTGTGGAAAATAGTGAGTCATTTTAAAACGGTGATGACGATGAGGGATTTTTTCTTACAGCTATTCATAACGTTAATTTGCTGCGCACGt > 1:79315/1‑251 (MQ=255) acaagcagagattaaTTGCCGATTTAACAAGCCCTTTTCTTTGCTTTTGCGGAAACCCGCTGGCATCAAGCGCCAC‑ACAGACGCAACAGG‑GACTGTTAACCGGGGAAGATATGTCCTAAAATGCCGCCCGCGTCGCAAACCGACACTTTAAAATTGCTGTGGAAAATAGTGAGTCATTTTAAAACGGTGATGACGATGAGGGATTTTTTCTTACAGCTATTCATAACGTTAATTTGCTGCGCACGTTGGa < 1:458376/237‑1 (MQ=255) aCATGCAGAGATGAATGTCCGATTTAACAAGCACTGTTCTTTGTTTTTGCGCAAACACGCTGGCATCAAGCGTCAC‑TCAGACGCAACAGG‑GACTGTTAACCGGGGAAGATATGTCCTAAAATGCTGCTCGCGTCGCAAACTGACACTGTATATTTGCTGTTTAAAATAGTGAGTCATTTTAAAACGGTTATGGCGATTAGGGATTTTTCCTTACAGCTATTCATAACGTTAATTTGCTGCGCACGTTGGa < 1:677588/250‑1 (MQ=255) cagagATGAATTGCCGATTTAACAAGCACTTTTCTTTGCTTTTGCGCAAACCCGCTGGCATCAAGCGCCAC‑ACAGACGCAACAGG‑GACTGTTAACCGGGGAAGATATGTCCTAAAATGCCGCTCGCGTCGCAAACTGACACTTTATATTTGCTGTGGAAAATAGTGAGTCATTTTAAAACGGTGATGACGATGAGGGATTTTTTCTTACAGCTATTCATAACGTTAATTTGCTGCGCACGTTGGACGTaa > 1:513878/5‑250 (MQ=255) agagATGAATTGCCGATTTAACAAGCTCTTTTCTTTGCTTTTGCGCAAACCCGCTGGCATCAAGCGCCAC‑ACAGACGCAACAGG‑GACTGTTAACCGGGGAAGATATGTCCTAAAATGCCGCTCGCGTCGCAAACTGACACTTTATATTTGCTGTGGAAAATAGTGAGTCATTTTAAAACGGTGATGACGATGAGGGATTTTTTCTTACAGCTATTCATAACGTTAATTTGCTGCGCACGTTGGACGTaaaa < 1:390998/248‑1 (MQ=255) gagATGAATTGCCGATTTAACAAGCACTTTTCTTTGCTTTTGCGCAAACCCGCTGGCATCAAGCGCCAC‑ACAGACGCAACAGG‑GACTGTTAACCGGGGAAGATATGTCCTAAAATGCCGCTCGCGTCGCAAACTGACACTTTATATTTGCTGTGGAAAATAGTGAGTCATTTTAAAACGGTGATGACGATGAGGGATTTTTTCTTACAGCTATTCATAACGTTAATTTGCTGCGCACGTTGGACGTAAAAt > 1:830923/3‑251 (MQ=255) aTTGCCGATTTAACAAGCACTTTTCTTTGCTTTTGCGCAAACCCGCTGGCATCAAGCGCCAC‑ACAGACGCAACAGG‑GACTGTTAACCGGGGAAGATATGTCCTAAAATGCCGCTCGCGTCGCAAACTGACACTTTATATTTGCTGTGGAAAATAGTGAGTCATTTTAAAACGGTGATGACGATGAGGGATTTTTTCTTACAGCTATTCATAACGTTAATTTGCTGCGCACGTTGGACGTAAAATAaacaac > 1:499009/1‑251 (MQ=255) tGCCGATTTAACAAGCACTTTTCTTTGCTTTTGCGCAAACCCGCTGGCATCAAGCGCCAC‑ACAGACGCAACAGG‑GACTGTTAACCGGGGAAGATATGTCCTAAAATGCCGCTCGCGTCGCAAACTGACACTTTATATTTGCTGTGGAAAATAGTGAGTCATTTTAAAACGGTGATGACGATGAGGGATTTTTTCTTAc < 1:466750/198‑1 (MQ=255) tGCCGATTTAACAAGCACTTTTCTTTGCTTTTGCGCAAACCCGCTGGCATCAAGCGCCAC‑ACAGACGCAACAGG‑GACTGTTAACCGGGGAAGATATGTCCTAAAATGCCGCTCGCGTCGCAAACTGACACTTTATATTTGCTGTGGAAAATAGTGAGTCATTTTAAAACGGTGATGACGATGAGGGATTTTTTCTTAc > 2:466750/1‑198 (MQ=255) ccGATTTAACAAGCACTTTTCTTTGCTTTTGCGCAAACCCGCTGGCATCAAGCGCCAC‑ACAGACGCAACAGG‑GACTGTTAACCGGGGAAGATATGTCCTAAAATGCCGCTCGCGTCGCAACCTGACACTTTATATTTGCTGTGGAAAATAGTGAGTCATTTTAAAACGGTGATGACGATGAGGGATTTTTTCTTACAGCTATTCATAACGTTAATTTGCTGCGCACGTTGGACGTAAAATAAACAACGCTg > 1:432902/1‑251 (MQ=255) ccGATTTAACAAGCACTTTTCTTTGCTCTGGCGCAAACCCGCTGGCATCAAGCGCCAC‑ACAGACGCAACAGC‑GACTGTTAACCGGGGAAGATATGTCCTAAAATGCCGCTCGCGTCGCAAACTGGCACTTTATATTTGCTGTGGAAAATAGTGAGTCATTTTAAAACGGTGATGACGATGAGGGATTTTTTCTTACAGCTATTCATAACGTTAATTTGCTGCGCACGTTGGACGTAAAATAAACACCGCTg < 1:612447/251‑1 (MQ=255) tAACAAGCACTTTTCTTTGCTTTTGCGCAAACCCGCTGGCATCAAGCGCCAC‑ACAGACGCAACAGG‑GACTGTTAACCGGGGAAGATATGTCCTAAAATGCCGCTCGCGTCGCAAACTGACACTTTATATTTGCTGTGGAAAATAGTGAGTCATTTTAAAACGGTGATGACGATGAGGGATTTTTTCTTACAGCTATTCATAACGTTAATTTGCTGCGCACGTTGGACGTAAAATAAACAAAGCTGATAtt > 2:926320/1‑250 (MQ=255) aacaagcaCTTTTCTTTGCTTTTGCGCAAACCCGCTGGCATCAAGCGCCAC‑ACAGACGCAACAGG‑GACTGTTAACCGGGGAAGATATGTCCTAAAATGCCGCTCGCGTCGCAAACTGACACTTTATATTTGCTGTGGAAAATAGTGAGTCATTTTAAAACGGTGATGACGATGAGGGATTTTTTCTTACAGCTATTCATAACGTTAATTTGCTGCGCACGTTGGACGTAAAATAAACAACGCTGTTAtt > 2:50669/1‑249 (MQ=255) ttCTTTGCTTTTGCGCAAACCCGCTGGCATCAAGCTCCAC‑ACAGACTCAACAGG‑GACTGTTTACCAGGGAAAATATGTCCTATAATGCCGCTCGCGTCGCAAACTGACACTTTATATTTGCTGTGTAAAATAGTGAGTCATTTTAAAACGGTGATGACGATGAGGGATTTTTTCTTACAGCTATTCATAACGTTAATTTGCTGCGCACGTTGGACGTAAAATAAACAACGCTGATATTAGCCTTAAACAt < 2:106294/250‑1 (MQ=255) cttggCTTTTGCGCAAACCCGCTGGCATCAAGCGCCAC‑ACAGACGCAACAGG‑GACTGTTAACCGGGGAAGATATGTCCTAAAATGCCGCTCGCGTCGCAAACTGACACTTTATATTTGCTGTGGAAAATAGTGAGTCATTTTAAAACGGTGATGACGATGAGGGATTTTTTCTTACAGCTATTAATAACGTTAATTTGCTGCGCACGTTGGACGTAAAATAAACAACGCTGATATTAGCCGTAAACATCgg > 2:516761/5‑251 (MQ=255) cTTTGCTTTTGCGCAAACACGCTGGCATCAAGCGCCAC‑CCAGACGCAACAGG‑GACTGTTAACCGGGGAAGATATGTCCTAAAATGCCGCTCGCGTCGCAAACTGACACTTTATATTTGCTGTGGAAAATAGTGAGTCATTTTAAAACGGGGATGACGATGAGGGATTTTTTCTTACAGCTATTCATAACGTTAATTTGCTGCGCACGTTGGACGTAAAATAACCAACACTGATATTAGCCGTAAACATCgg > 2:925348/1‑251 (MQ=255) gctgttGCGCAAACCCGCTGGCAGCAAGCGCCAC‑ACAGACGCAAAAGG‑GACTGTTAACCGGGGAAGATATGTCCTAAAATGCCGCCCGCGTCGCAAACTGACACTTGATAGTTGCTGTGGAAAATAGTGAGTCATTTTAAAACGGTGATGACGATGAGGGATTTTTTCTTACAGCTATTCATAACGTTAATTTGCTGCGCACGTTGTACGTAAAATAAACAACGCTGATATTAGCCGTAAACATCGGGttt < 2:356970/247‑1 (MQ=255) cTTTTGCGCAAACCCGCTGGCATCAAGCGCCAC‑ACAGACGCAACAGG‑GACTGTTAACCGGGGAAGATATGTCCTAAAATGCCGCTCGCGTCGCAAACTGACACTTTATATTTGCTGTGGAACATAGTGAGTCATTTTAAAACGGTGATGACGATGAGGGATTTTTTCTTACAGCTCTTCATAACGTTAATTTGCTGCGCACGTTGGACGTAAAATAAACAACGCTGGTATTAGCCGTAAACATCGGGtttt > 1:632376/1‑251 (MQ=255) ttGCGCAAACCCGCTGGCATCCAGCGCCAC‑ACAGACGCAACAGG‑GACTGTTAACCGGGGAAGATATGTCCTAAAATGCCGCTCGCGTCGCAAACTGACACTTTATATTTGCTGTGGAAAATAGTGAGTCATTTTAAAACGGTGATGACGATGAGGGATTTTTTCTTACAGCTATTCATAACGTTAATTTGCTGCGCACGTTGGACGTAAAATAAACAACGCTGCTATTAGCCGTAAACATCGGGtttttt > 2:162913/1‑250 (MQ=255) ttGCGCAAACCCGCTGGCATCAAGCGCCAC‑ACAGACGCAACAGG‑GACTGTTAACCGGGGAAGATATGTCCTAAAATGCCGCTCGCGTCGCAAACTGACACTTTATATTTGCTGTGGAAAATAGTGAGTCATTTTAAAACGGTGATGACGATGAGGGATTTTTTCTTACAGCTATTCATAACGTTAATTTGCTGCGCACGTTGGACGTAAAATAAACAACGCTGATATTAGCCGTAAACATCGGGtttttt > 1:749672/1‑250 (MQ=255) gcAAACCCGCTGGCATCAAGCGC‑ACTACAGACGCAACAGG‑GACTGTTAACCGGGGAAGATATGTCCTAAAATGCCGCTCGCGTCGCACACTGACACTTTATAGTTGCTGTGGAAAATAGTGAGTCATTTTAAAACGGTGATGACGATGAGGGATTTTTTCTTACAGTTATTCATAACGTTAATTTGCTGCGCACGTTGGACGTAAAATAAACAACGCTGATATTAGCCGTAAACATCGGGTTTTTTACCTc < 1:325343/251‑1 (MQ=255) cAAACCCGCTGGCATCAAGCGCCAC‑ACAGACGCAACAGG‑GACTGTTAACCGGGGAAGATATGTCCTAAAATGCCGCTCGCGTCGCAAACTGACACTTTATATTTGCTGTGGAAAATAGTGAGTCATTTTAAAACGGTGATGACGATGAGGGATTTTTTCTTACCGCTATTCATAACGTTAATTTGCTGCGCACGTTGGACGTAAAATAAACAACGCTGATATTAGCCGTAAACATCGGGTTTTTTACCTCg > 1:728214/1‑251 (MQ=255) cAAACCCGCTGGCATCAAGCGCCAC‑ACAGACGCAACAGG‑GACTGTTAACCGGGGAAGATATGTCCTAAAATGCCGCTCGCGTCGCAAACTGACACTTTATATTTGCTGTGGAAAATAGTGAGTCATTTTAAAACGGTGATGACGATGAGGGATTTTTTCTTACAGCTATTCATAACGTTAATTTGCTGCGCACGTTGGACGTAAAATAAACAACGCTGATATTAGCCGTAAACATCGGGTTTTTTACCTCg > 1:169558/1‑251 (MQ=255) aaCCCGCTGGCATCAAGCGCCAC‑ACAGACGCAACAGG‑GACTGTTAACCGGGGAAGATATGTCCTAAAATGCCGCTCGCGTCGCAAACTGACACTTTATATTTGCTGTGGAAAATAGTGAGTCATTTTAAAACGGTGATGACGATGAGGGATTTTTACTTACAGCTATTCATAACGTTAATTTGCTGCGCACGTTGGACGTAAAATAAACAACGCTGATATTAGCCGTAAACATCGGGTTTTTTACCTCGGt < 1:358048/251‑1 (MQ=255) aaCCCGCTGGCATCAAGCGCCAA‑AAAGACGCAACAGG‑GACTGTTAACCGGGGAAGATATGTCCTAAAATGCCGCTCGCGTCGCAAACTGACGCTTTATATTTGCTGTGGAAAATAGTGAGTCATTTTAAAACGGTGCTGACGTTGAGGGATTTTTTCTTACAGCTATTCATAAAGTTAATTTGCTGCGCACGTTGGACGTAAATTAAACAACGCTGATATTAGCCGTTACCATCGGGttttttctctcgg > 2:134169/1‑243 (MQ=255) aCCCGCTGGCATCAAGCGCCAC‑ACAGACGCAACCGG‑GACTGTTAACCGGGGAAGATATGTCCTAAAATGCCGCTCGCGTCGCAAACTGACACTTTATATTTGCTGTGGAAAATAGTGAGTCATTTTAAAACGGTGATGACGATGAGGGATTTTTTCTTACAGCTATTCATAACGTTAATTTGCTGCGCACGTTGGACGTAAAATAAACAACGCTGATATTAGCCGTAAACATCGGGTTTTTTACCTCGGt > 1:269217/1‑250 (MQ=255) tGGCATCAAGCGCCAC‑ACAGACGCAACAGG‑GACTGTTAACCGGGGAAGATATGTCCTAAAATGCCGCTCGCGTCGCAAACTGACACTTTATATTTGCTGTGGAAAATAGTGAGTCATTTTAAAACGGAGATGACGATGAGGGATTTTTTCTTACAGCTATTCATAACGTTAATTTGCAGCGCACGTTGGACTAAAAATAAACAACACTGATATTAGCCGTAAACATCGGGATTTTTACATCGGTATGCCtt > 1:617752/1‑251 (MQ=255) ggCATCAAGCGCCAC‑ACAGACGCAACAGG‑GACTGTTAACCGGGGAAGATATGTCCTAAAATGCCGCTCGCGTCGCAAACTGACACTTTATATTTGCTGTGGAAAATAGTGAGTCATTTTAAAACGGTGATGACGATGAGGGATTTTTTCTTACAGCTATTCATAACGTTAATTTGCTGCGCACGTTGGACGTAAAATAAACAACGCTGATATTAGCCGTAAACATCGGGTTTTTTACCTCGGTATGCCTtg > 2:265494/1‑251 (MQ=255) gCATCAAGCGCCAC‑ACAGACGCAACAGG‑GACTGTTAACCGGGGAAGATATGTCCTAAAATGCCGCTCGCGTCGCAAACTGACACTTTATATTTGCTGTGGAAAATAGTGAGTCATTTTAAAACGGTGATGACGATGAGGGATTTTTTCTTACAGCTATTCATAACGTTAATTTGCTGCGCACGTTGGACGTAAAATAAACAACGCTGATATTAGCCGTAAACATCGGGTTTTTTACCTCGGTATGCCTtgt < 1:905929/251‑1 (MQ=255) gCATCAAGCGCCAC‑ACAGACGCAACAGG‑GACTGTTAACCGGGGAAGATATGTCCTAAAATGCCGCTCGCGTCGCAAACTGACACTTTATATTTGCTGTGGAAAATAGTGAGTCATTTTAAAACGGTGATGACGATGAGGGATTTTTTCTTACAGCTATTCATAACGTTAATTTGCTGCGCACGTTGGACGTAAAATAAACAACGCTGATATTAGCCGTAAACATCGGGTTTTTTACCTCGGTATGCCTtgt < 1:805962/251‑1 (MQ=255) gCATCAAGCGCCAC‑ACAGACGCAACAGG‑GACTGTTAACCGGGGAAGATATGTCCTAAAATGCCGCTCGCGTCGCAAACTGACACTTTATATTTGCTGTGGAAAATAGTGAGTCATTTTAAAACGGTGATGACGATGAGGGATTTTTTCTTACAGCTATTCATAACGTTAATTTGCTGCGCACGTTGGACGTAAAATAAACAACGCTGATATTAGCCGTAAACATCGGGTTTTTTACCTCGGTATGCCTtgt < 1:748058/251‑1 (MQ=255) cATCAAGCGCCAC‑ACAGACGCAACAGG‑GACTGTTAACCGGGGAAGATATGTCCTAAAATGCCGCTCGCGTCGCAAACTGACACTTTATATTTGCTGTGGAAAATAGTGAGTCATTTTAAAACGGTGATGACGATGAGGGATTTTTTCTTACAGCTATTCATAACGTTAATTTGCTGCGCACGTTGGACGTAAAATAAACAACGCTGATATTAGCCGTAAACATCGGGTTTTTTACCTCGGTATGCCTtgtg < 1:738021/251‑1 (MQ=255) cAAGCGCCAC‑ACAGACGCAACAGG‑GACTGTTAACCGGGGAAGATATGTCCTAAAATGCCGCTCGCGTCGCAAACTGACACTTTATATTTGCTGTGGAAAATAGTGAGTCATTTTAAAACGGTGATGACGATGAGGGATTTTTTCTTACAGCTATTCATAACGTTAATTTGCTGCGCACGTTGGACGTAAAATAAACAACGCTGATATTAGCCGTAAACATCGGGTTTTTTACCTCGGTATGCCTTGTGAc < 2:229572/250‑1 (MQ=255) ccccaGACGCAACAGG‑GTCTTTTAACCGGGGAAGATATGTCCTAAAAGGCCGCTCGCGTCGCAAACTGACCCTTTATATTGGCTGTGGAAAATAGTGAGTCATTTTAAAACGGTGATGACGATGAGGGAGTTTTTCTTACAGCTATTCATAACGTTAATTTGCTGCGCACGTTGGACGTAAAATAAACAACGCTGATATTAGCCGTAAACATCGGGTTTGTTACCTCGGTATGCCTTGTGACTGGCTTGAc < 2:891368/248‑1 (MQ=255) acaGACGCAACAGG‑GACTGTTAACCGGGGAAGATATGTCCTAAAATGCCGCTCGCGTCGCAAACTGACACTTTATATTTGCTGTGGAAAATAGTGAGTCATTTTAAAACGGTTATGACGATGAGGGATTTTTTCTTACAGCTATTCATAACGTTAATTTGCTGCGCACGTTGGACGTAAAATAAACAACGCTGATATTAGCCGTAAACAGCGGGTTTTTTACCTCGGTATGCCTTGTGACTGGCTTGACaa < 2:286547/251‑1 (MQ=255) | GAGTACGGGACTGGACATCAATATGCTTAAAGTAAATAAGACTATTCCTGACTATTATTGATAAATGCTTTTAAACCCGCCCGTTAATTAACTCACCAGCTGAAATTCACAATAATTAAGTGATATCGACAGCGCGTTTTTGCATTATTTTGTTACATGCGGCGATGAATTGCCGATTTAACAAACACTTTTCTTTGCTTTTGCGCAAACCCGCTGGCATCAAGCGCCAC‑ACAGACGTAACAAG‑GACTGTTAACCGGGGAAGATATGTCCTAAAATGCCGCTCGCGTCGCAAACTGACACTTTATATTTGCTGTGGAAAATAGTGAGTCATTTTAAAACGGTGATGACGATGAGGGATTTTTTCTTACAGCTATTCATAACGTTAATTTGCTTCGCACGTTGGACGTAAAATAAACAACGCTGATATTAGCCGTAAACATCGGGTTTTTTACCTCGGTATGCCTTGTGACTGGCTTGACAA > NC_000913/89079‑89559 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |