| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | NC_000913 | 82,909 | C→T | L207L (TTG→TTA) | leuA ← | 2‑isopropylmalate synthase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_000913 | 82,909 | 0 | C | T | 95.2% | 331.5 / ‑4.9 | 107 | L207L (TTG→TTA) | leuA | 2‑isopropylmalate synthase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (5/0); new base T (40/60); total (47/60) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.27e-02 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 107 total aligned reads displayed.
ACAATGGCTTTGTTTGCCGGGATCGGCATATTACAAATCTGGCTAACTAACTGGCTGGTGCGCCATATCTCCTGGTGATTAATGGCGGTGTGGACGTTGAGAATATCCTTACGAACT‑TTGATCGCC‑ATGATGACTTCTTCCA‑GGGAACAGTTTCCGGCACGCTCGCCGATCCCGTTCATTGCGCCTTCCACCTGGCGTGCACCGGCATGTACCGCCGCC‑AGTGAGTTTCCGACCGCCAGGCC‑CAAATCGTCGTGGGTATGTACGGAGATAATGGCTTTGTCGATGTTAGGCACGCGTTCATACAGGCCGCTGATGATTCCGGCGAACT‑CAAACGGCATGGTGTAGCCCACGGTGTCCGGAATGTTGATGGTGGTGGCACCGGCATTAATCGCCGCTTCGACCACTCGCGCCAGATCGGCAATGGGTGTACGCCCGGCATCTTCGCAAGAAAATTCAACATCATCGGTGTAATTACGGGCGCGTTTC > NC_000913/82667‑83152 | aaTGGCTTTGTTTGCCGGGATCGGCATATTACAAATCTGGCTAACTAACTGGCTGGTGCGCCATATCTCCTGGTGATTAATGGCGGTGTGGACGTTGGGAATATCCTTTCGAACT‑TTTATCGCC‑CTGATGACTTCTTTCC‑GGGAACAGTTTTCGGCCAGCTCGCCGATCCCGTTCATTGCGCCTTCCACCTGGCGTGCACCGGCCTGTACCCCCGCCCAG‑GAGTTGCCGACCGCCAGGCC‑CAAAtactcgg > 1:779105/1‑245 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
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Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |