| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 3350563 | 62 (0.650) | 3 (0.030) | 3/494 | 8.0 | 4.6% | intergenic (‑104/‑14) | elbB/arcZ | low activity glyoxalase ElbB/small regulatory RNA ArcZ |
| ? | NC_000913 | = 3584195 | NA (NA) | noncoding (768/768 nt) | IS1 | repeat region | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
GATAACATCAACCTGCTGCTTATCCGGTGCAAAGCAGACCGCCTGCGCACCGCTGCGTGAAATAGCTAACAACGTCAACACCGCTTCATGAATTTCAGAACCGTCATAGACGCCGCATCCGCTCAGAATTACGCCAATTTTCTTCATTGTGATCATCCTTTCGCAATTGACTGAAACACATTAATTTTTTTAATAAAAATGGTACGCATCACACATTTAACTGATTCATGTAACAAATCATTTAAGTTTTGCTATCTTAACTGCGTGCGGCCTGAAAAACAGTGCTGTGCCCTTGTAACTCATCATAATAATTTACGGCGCAGCCAAGATTTCCCTGGTGTT‑GGCGCAGTATTCGCGCACCCCGGTCTAGCCGGGGTCATTTTTTAGTGGCTTTTGCCACCCACGCTTTCAGCACTTCTACGTCGTGACGCCACTCTTCTTTCATCTCTTCAATCCATTCACCGACGTTATCTTCCCAGGCCGGAAGGTCAGGAGACT > NC_000913/3350313‑3350810 | gATAACATCAACCTGCTGCTTATCCGGTGCAAAGCAGACCGCCTGCGCACCGCTGCGTGAAATAGCTAACAACGTCAACACCGCTTCATGAATTTCAGAACCGTCATAGACGCCGCATCCGCTCAGAATTACGCCAATTTTCTTCATTGTGATCATCCTTTCGCAATTGACTGAAACACATTAATTTTTTTAATAAAAATGGTACGCATCACACATTTAACTGATTCATGTAACAAATCATTTAAGTTTTg < 1:230523/251‑1 (MQ=255) aCATCAACCGGCTGCTTATCCGGAGCAAAGCAGACCGCCTGCGCACCGCTGCGTGAAATAGCTAACAACGTCAACCCCGTTTCATGAATTTCAGAACCGTCATAGACGCCGCATCCGCTCAGAATTACGCCAATTTTCTTCATTGTGATCATCCTTTCGCAATTGACTGAAACACATTAATTTTTTTAATAAAAATGGTACGCATCACACAGTTAACTGATTCATGTAACAAATCATTTAAGTTTTGCTAt < 2:713248/251‑1 (MQ=255) cATCAACCTGCTGCTTATCCGGTGCAAAGCAGACCGCCTGCGCACCGCTGCGTGAAATAGCTAACAACGTCAACACCGCTTCATGAATTTCAGAACCGTCATAGACGCCGCATCCGCTCAGAATTACGCCAATTTTCTTCATTGTGATCATCCTTTCGCAATTGACTGAAACACATTAATTTTTTTAATAAAAATGGTACGCATCACACATTTAACTGATTCATGTAACAAATCATTTAAGTTTTGCTATc > 2:442119/1‑251 (MQ=255) aaacctgcgtatattctggTGAAAAGCAAACCGCCTTCGCACCGCGGCGGTAAATAGCTAACACCGTCAACACCTCTTCATGAATTTCAGAACCTGCATAGACGCCGCATCCGCTCATAATTACGCCAATTTTCTTCATTGTGATCATCCTTTCGCAATTGACTGAAACACATTAATTTTTTTAATAAAAATGGTACGCATCACACATTTAACTGATTCATGTAACAAATCATTTAAGTTTTGCTATCtt < 2:267865/233‑1 (MQ=255) aaCCTGCTGCTTATCCGGTGCAAAGCAGACCGCCTGCGCACCGCTGCGTGAAATAGCTAACAACGTCAACACCGCTTCATGAATTTCAGAACCGTCATAGACGCCGCATCCGCTCAGAATTACGCCAATTTTCTTCATTGTGATCATCCTTTCGCAATTGACTGAAACACATTAATTTTTTTAATAAAAATGGTACGCATCACACATTTAACTGATTCATGTAACAAATAATTTAAGTTTTGCTATCTTa > 2:23579/1‑250 (MQ=255) gTGCAAAGCAGACCGCCTGCGCACCGCTGCGTGAAATAGCTAACAACGTCAACACCGCTTCATGAATTTCAGAACCGTCATAGACGCCGCATCCGCTCAGAATTACGCCAATTTTCTTCATTGTGATCATCCTTTCGCAATTGACTGAAACACATTAATTTTTTTAATAAAAATGGTACGCATCACACATTTAACTGATTCATGTAACAAATCATTTAAGTTTTGCTATCTTAACTGCGTGCGGCCTGaa > 1:598638/1‑250 (MQ=255) gcgcACCGCTGCGTGAAATAGCTAACAACGTCAACACCGCTTCATGAATTTCAGAACCGTCATAGACGCCGCATCCGCTCAGAATTACGCCAATTTTCTTCATTGTGATCATCCTTTCGCAATTGACTGAAACACATTAATTTTTTTAATAAAAATGGTACGCATCACACATTTAACTGATTCATGTAACAAATCATTTAAGTTTTGCTATCTTAACTGCGTGCGGCCTGAAAAACAGTGCTGTGCCCTTg > 2:939636/1‑251 (MQ=255) gcACCGCTGCGTGAAATAGCTAACAACGTCAACACCGCTTCATGAATTTCAGAACCGTCATAGACGCCGCATCCGCTCAGAATTACGCCAATTTTCTTCATTGTGATCATCCTTTCGCAATTGACTGAAACACATTAATTTTTTTAATACAAATGGTACGCATCACACATTTAACTGATTCATGTAACAAATCATTTAAGTTTTGCTATCTTAACTGCGTGCGGCCTGAAAAACAGTGCTGTGCCCTTGt > 2:576025/1‑250 (MQ=255) gCTGCGTGAAATAGCTAACAACGTCAACACCGCTTCATGAATTTCAGAACCGTCATAGACGCCGCATCCGCTCAGAATTACGCCAATTTTCTTCATTGTGATCATCCTTTCGCAATTGACTGAAACACATTAATTTTTTTAATAAAAATGGTACGCAGCACACATTTAACTGATTCATGTAACAAATCATTTAAGTTTTGCTATCTTAACTGCGTGCGGCCTGAAAAACAGTGCTGTGCCCTTGTAACtca < 1:637240/251‑1 (MQ=255) gTGAAATAGCTAACAACGTCAACACCGCTTCATGAATTTCAGAACCGTCATAGACGCCGCATCCGCTCAGAATTACGCCAATTTTCTTCATTGTGATCATCCTTTCGCAATTGACTGAAACACATTAATTTTTTTAATAAAAATGGTACGCATCACACATTTAACTGATTCATGTAACAAATCATTTAAGTTTTGCTATCTTAACTGCGTGCGGCCTGAAAAACAGTGCTGTGCCCTTGTAACTCATCata < 1:716047/251‑1 (MQ=255) acGTCAACACCGCTTCATGAATTTCAGAACCGTCATAGACGCCGCATCCGCTCAGAATTACGCCAATTTTCTTCATTGTGATCATCCTTTCGCAATTGACTGAAACACATTAATTTTTTTAATAAAAATGGTACGCATCACACATTTAACTGATTCATGTAACAAATCATTTAAGTTTTGCTATCTTAACTGCGTGCGGCCTGAAAAACAGTGCTGTGCCCTTGTAACTCATCATAATAATTTACGgcgc > 2:544648/1‑250 (MQ=255) cAACACCGCTTCATGAATTTCAGAACCGTCATAGACGCCGCATCCGCTCAGAATTACGCCAATTTTCTTCATTGTGATCATCCTTTCGCAATTGACTGAAACACATTAATTTTTTTAATAAAAATGGTACGCATCACACATTTAACTGATTCATGTAACAAATCATTTAAGTTTTGCTATCTTAACTGCGTGCGGCCTGAAAAACAGTGCTGTGCCCTTGTAACTCATCATAATAATTTACGGCGCAGCCa < 1:921829/251‑1 (MQ=255) ccGCTTCATGAATTTCAGAACCGTCATAGACGCCGCATCCGCTCAGAATTACGCCAATTTTCTTCATTGTGATCATCCTTTCGCAATTGACTGAAACACATTAATTTTTTTAATAAAAATGGTACGCATCACACATTTAACTGATTCATGTAACAAATCATTTAAGTTTTGCTATCTTAACTGCGTGCGGCCTGAAAAACAGTGCTGTGCCCTTGTAACTCATCATAATAATTTACGGCGCAGCCAAGAtt < 1:862249/251‑1 (MQ=255) cGCTTCATGAATTTCAGAACCGTCATAGACGCCGCATCCGCTCAGAATTACGCCAATTTTCTTCATTGTGATCATCCTTTCGCAATTGACTGAAACACATTAATTTTTTTAATAAAAATGGTACGCATCACACATTTAACTGATTCATGTAACAAATCATTTAAGTTTTGCTATCTTAACTGCGTGCGGCCTGAAAAACAGTGCTGTGCCCTTGTAACTCATCATAATAATTTACGGCGCAGCCAAGAttt < 1:186517/251‑1 (MQ=255) tCATGAATTTCAGAACCGTCATAGACGCCGCATCCGCTCAGAATTACGCCAATTTTCTTCATTGTGATCATCCTTTCGCAATTGACTGAAACACATTAATTTTTTTAATAAAAATGGTACGCATCACACATTTAACTGATTCATGTAACAAATCATTTAAGTTTTGCTATCTTAACTGCGTGCGGCCTGAAAAACAGTGCTGTGCCCTTGTAACTCATCATAATAATTTACGGCGCAGCCAAGATTTcc < 1:307906/249‑1 (MQ=255) cATGAAGTTCAGTACCGTCATACACGCCGCACCCGCGTAGAATTACGACAATTTTCTTCACTGTGATCATCCTTTCGCAATTGACTGAAACACATTAATGTTTTTAATAAAAATGGTACGCATCACTCATTTAACTGATTCATGTAACAAATCATTTAAGTTTTGCGATCTTAACTGCGTGCGGACTGAAAAACAGTGCTGTGCCCTTGTACCGCATCATAATAACTTACGGCGCAGCAAAGAttaccatg < 2:343152/251‑7 (MQ=255) 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cGTCATAGACGCCGCATCCGCTCAGAATTACGCCAATTTTCTTCATTGTGATCATCCTTTCGCAATTGACTGAAACACATTAATTTTTTTAATAAAAATGGTACGCATCACACATTTAACTGATTCATGTAACAAATCATTTAAGTTTTGCTATCTTAACTGCGTGCGGCCTGAAAAACAGTGCTGTGCCCTTGTAACTCATCATAATAATTTACGGCGCAGCCAAGATTTCCCTGGTGTT‑GGCGCAGTAt > 2:722684/1‑251 (MQ=255) cATAGACGCCGCATCCGCTCAGAATTACGCCAATTTTCTTCATTGTGATCATCCTTTCGCAATTGACTGAAACACATTAATTTTTTTAATAAAAATGGTACGCATCACACATTTAACTGATTCATGTAACAAATCATTTAAGTTTTGCTATCTTAACTGCGTGCGGCCTGAAAAACAGTGCTGTGCCCTTGTAACTCATCATAATAATTTACGGCGCAGCCAAGATTTCCCTGGTGTT‑GGCGCAGTATTc < 2:740920/250‑1 (MQ=255) aTAGACGACGCATCCGCTCAGAATTACGCCAATTTTCTTCTTTGTGATCATCCTTTCGCAATTGACTGAAACACATTAATTTTTTTAATAAAAATGGTACGCATCACACATTTAACTGATTCATGTAACAACTCATTTAAGTTTTGCTATCTTAACTGCGTGCGGCCTGAAAAAAAGTGCTGTGCCCTTGTAACTCATCATAGTAATTTACGGCGCAGCCAGTATTTCCCTGGTGTT‑GTCCCAGTAttgtc > 2:196337/1‑248 (MQ=255) cATCCGCTCAGAATTACGCCAATTTTCTTCATTGTGATCATCCTTTCGCAATTGACTGAAACACATTAATTTTTTTAATAAAAATGGTACGCATCACACATTTAACTGATTCATGTAACAAATCATTTAAGTTTTGCTATCTTAACTGCGTGCGGCCTGAAAAACAGTGCTGTGCCCTTGTAACTCATCATAATAATTTACGGCGCAGCCAAGATTTCCCTGGTGTT‑GGCGCAGTATTCGCGCACCCCGGt < 1:222684/251‑1 (MQ=255) ccGCTCAGAATTACGCCAATTTTCTTCATTGTGATCATCCTTTCGCAATTGACTGAAACACATTAATTTTTTTAATAAAAATGGTACGCATCACACATTTAACTGATTCATGTAACAAATCATTTAAGTTTTGCTATCTTAACTGCGTGCGGCCTGAAAAACAGTGCTGTGCCCTTGTAACTCATCATAATAATTTACTGCGCAGCCAAGATTTCCCTGGTGTT‑GGCGCAGTATTCGCGCACCCCGGTCTa < 1:576025/251‑1 (MQ=255) ccGCTCAGAATTACGCCAATTTTCTTCATTGTGATCATCCTTTCGCAATTGACTGAAACACATTAATTTTTTTAATAAAAATGGTACGCATCACACATTTAACTGATTCATGTAACAAATCATTTAAGTTTTGCTATCTTAACTGCGTGCGGCCTGAAAAACAGTGCTGTGCCCTTGTAACTCATCATAATAATTTACGGCGCAGCCAAGATTTCCCTGGTGTT‑GGCGCAGTATTCGCGCACCCCGGTCt > 2:85637/1‑250 (MQ=255) 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acacaTTTAACTGATTCATGTAACAAATCATTTAAGTTTTGCTATCTTAACTGCGTGCGGCCTGAAAAACAGTGCTGTGCCCTTGTAACTCATCATAATAATTCACGGCGCAGCCAAGATTTCCCTGGTGTT‑GGCGCAGTATTCGCGCACCCCGGTCTAGCCGGGGTCATTTTTTAGTGGCTTTTGCCACCCACGCTTTCAGCACTTCTACGTCGTGACGCCACTCTTCTTTCATCTCTTCAATCCATTcc > 1:318222/1‑250 (MQ=255) acaTTTAACTGATTCATGTAACAAATCATTTAAGTTTTGCTATCTTAACTGCGTGCGGCCTGAAAAACAGTGCTGTGCCCTTGTAACTCATCATAATAATTTACGGCGCAGCCAAGATTTCCCTGGTGTT‑GGCGCAGTATTCGCGCACCCCGGTCTAGCCGGGGTCATTTTTTAGTGGCTTTTGCCACCCACGCTTTCAGCACTTCTACGTCGTGACGcc < 1:895146/220‑1 (MQ=255) aTTTAACTGATTCATGTAACAAATCATTTAAGTTTTGCTATCTTAACTGCGTGCGGCCTGAAAAACAGTGCTGTGCCCTTGTAACTCATCATAATAATTTACGGCGCAGCCAAGATTTCCCTGGTGTT‑GGCGCAGTATTCGCGCACCCCGGTCTAGCCGGGGTCATTTTTTAGTGGCTTTTGCCACCCACGCTTTCAGCACTTCTACGTCGTGACGCCACTCTTCTTTCATCTCTTCAATCCATTCACCg > 2:867112/1‑250 (MQ=255) ttAACTGATTCATGTAACAAATCATTTAAGTTTTGCTATCTTAACTGCGTGCGGCCTGAAAAACAGTGCTGTGCCCTTGTAACTCATCATAATAATTTACGGCGCAGCCAAGATTTCCCTGGTGTT‑GGCGCAGTATTCGCGCACCCCGGTCTAGCCGGGGTCATTTTTTAGTGGCTTTTGCCACCCACGCTTTCAGCACTTCTACGTCGTGACGCCACTCTTCTTTCATCTCTTCAATCCATTCACCGAc < 1:763411/250‑1 (MQ=255) ttCATGTAACAAATCATTTAAGTTTTGCTATCTTAACTGCGTGCGGCCTGAAAAACAGTGCTGTGCCCTTGTAACTCATCATAATAATTTACGGCGCAGCCAAGATTTCCCTGGTGTT‑GGCGCAGTATTCGCGCACCCCGGTCTAGCCGGGGTCATTTTTTAGTGGCTTTTGCCACCCACGCTTTCAGCACTTCTACGTCGTGACGCCACTCTTCTTTCATCTCTTCAATCCATTCCCCGACGTTATCTTc > 1:227834/1‑251 (MQ=255) cATGTAACAAATCATTTAAGTTTTGCTATCTTAACTGCGTGCGGCCTGAAAAACAGTGCTGTGCCCTTGTAACTCATCATAATAATTTACGGCGCAGCCAAGATTTCCCTGGTGTT‑GGCGCAGTATTCGCGCACCCCGGTCTAGCCGGGGTCATTTTTTAGTGGCTTTTGCCACCCACGCTTTCAGCACTTCTACGTCGTGACGCCACTCTTCTTTCATCTCTTCAATCCATTCACCGACGTTATCTTccc > 1:405963/1‑251 (MQ=255) aTGTAACAAATCATTTAAGTTTTGCTATCTTAACTGCGTGCGGCCTGAAAAACAGTGCTGTGACCTAGTAACTCATCATAATAATTTACGGCGCAGCCAAGATTTCCCTGGTGTA‑GGCGCAGTATTCGCGCACCCCGGTCTAGCCGGGGTCATTTTTTAGTGGCTTTTGCCACCCACGCATTCAGCACTTCTACGTCGTGACGCAACTCTTCTTTCATCTCTTCAAGCCATTCACCAACGTTATCTTccc > 2:588430/1‑250 (MQ=255) tAACAAATCATTTAAGTTTTGCTATCTTAACTGCGTGCGGCCTGAAAAACAGTGCTGTGCCCTTGTAACTCATCATAATAATTTACGGCGCAGCCAAGATTTCCCTGGTGTT‑GGCGCAGTATTCGCGCACCCCGGTCTAGCCGGGGTCATTTTTTAGTGGCTTTTGCCACCCACGCTTTCAGCACTTCTACGTCGTGACGCCACTCTTCTTTCATCTCTTCAATCCATTCACCGACGTTATCTTCCCAGGc > 1:417944/1‑251 (MQ=255) cAAATCATTTAAGTTTTGCTATCTTAACTGCGTGAGGCCTGAAAAACAGTGCTGTGCCCTTGTAACTCATCATAATAATTTACGGCGCAGCCAAGATTTCCCTGGTGTT‑GGCGCAGTATTCGCGCACCCCGGTCTAGCCGGGGTCATTTTTTAGTGGCTTTTGCCACCCACGCTTTCAGCACTTCTACGTCGTGACGCCACTCTTCTTTCATCTCTTCAATCCATTCACCGACGTTCTCTTCCccggccgg > 2:774192/1‑251 (MQ=255) cAAATCATTTAAGTTTAGCTATCTTAACTGCGTGCGGACTGAAAAAAATTACTGTGCCCTTGTAACTCATCATAATAATTTACGGGGCAGCCCAGATTTCCCTGG‑GTTAGGCGCAGAATTCGCGCACCCCGGTCTAGCCGGGGTCATATTTTAGTGGCTTTTGCCACCCCCGATTTCAGCACTTCTCCGTCGTGACGACACTCTTCTTTCATCTCTTCAATCCATTCACCGACGTTCTCTTCCCAGGACgg > 2:592747/1‑251 (MQ=255) tttGCTATCTTAACTGCGTGCGGCCTGAAAAACAGGGCTGTGCCCTTGTAACTCATCATAATAATTTACGGCGCAGCCAAGATTTCCCTGGTGTT‑GGCGCAGTATTAGCGCACCCCGGGCTAGCCGGGGTCATTTTTTAGTGGCTTTTGCCACCCACGCTTTCAGCACTTCTAAGTCGTGACGCCACTCTTCTTTCATCTCTTCACTCACTTCACCGACGTTATCTTCCCTGGCCGGAAGGTCAGAAGACt > 2:731015/1‑251 (MQ=255) | GATAACATCAACCTGCTGCTTATCCGGTGCAAAGCAGACCGCCTGCGCACCGCTGCGTGAAATAGCTAACAACGTCAACACCGCTTCATGAATTTCAGAACCGTCATAGACGCCGCATCCGCTCAGAATTACGCCAATTTTCTTCATTGTGATCATCCTTTCGCAATTGACTGAAACACATTAATTTTTTTAATAAAAATGGTACGCATCACACATTTAACTGATTCATGTAACAAATCATTTAAGTTTTGCTATCTTAACTGCGTGCGGCCTGAAAAACAGTGCTGTGCCCTTGTAACTCATCATAATAATTTACGGCGCAGCCAAGATTTCCCTGGTGTT‑GGCGCAGTATTCGCGCACCCCGGTCTAGCCGGGGTCATTTTTTAGTGGCTTTTGCCACCCACGCTTTCAGCACTTCTACGTCGTGACGCCACTCTTCTTTCATCTCTTCAATCCATTCACCGACGTTATCTTCCCAGGCCGGAAGGTCAGGAGACT > NC_000913/3350313‑3350810 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |