| Predicted mutation | ||||||
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| JC JC | NC_000913 | 2,465,846 | IS3 (–) +3 bp | coding (546‑548/933 nt) | yfdC → | inner membrane protein YfdC |
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| * | ? | NC_000913 | 2170171 = | NA (NA) | 80 (0.840) | 71/492 | 0.3 | 97.5% | noncoding (1/1258 nt) | IS3 | repeat region |
| ? | NC_000913 | 2465846 = | 2 (0.020) | coding (546/933 nt) | yfdC | inner membrane protein YfdC | |||||
GCTTTAGCGGAAAGGATTCGGGAAAATGTTGAGCGTTTAACTGGCGATAATCCTGAATACGCTATACCACAAAAAGTGACGATTAGTATTGGCGCTGTTGTGACTCAGGAAAATGCGTTAAACCCAAATGAGATCTATCGACTGGCTGATAACGCACTTTACGAGGCGAAAGAGACCGGGCGTAATAAGGTGGTTGTGAGGGATGTGGTGAATTTTTGTGAGTCACCATAAAGCGGCATTTTGATC‑CTACCCACGTAATA‑TGGACACAGGCCTAAGCGAGGTTCTTGTTTTCAAA‑TTGTTCCGGACTGAGGCCG‑CCACACCAACTGTGCCGCCGCCACCGATTGTAATCACATTCGATATAATTAAACACCGTTGCCCGCATTATTTCCCGGCTGATAAAGTGTTCTCCATGGATACATTCCACTTTCAGCGAATGAAAGAAGCTTTCCACGCAGGCATTATCGTAGCAGCAACCTTTTGCGCTC > NC_000913/1094004‑1094488 | gCTTTAGCGGATAGGATTCGGGAAAATGTTGAGCGTTTAACTGGCGATCATCCTGAATACGCTATACCACAAAAAGTGACGATTAGTATTGGCGCTGTTGTGACTCAGGAAAATGCGTTAAACCCACATGAGATCTATCGTCTGGCTGTTAACGCACTTTACGAGGCGAACTGTACCGGGCGTAATACTGTGGTTGTGATTGATGTGTTGACTTTTTGTGAGTCACCATAACTCGGCATTTTGATC‑CTAcc > 2:432395/1‑251 (MQ=255) 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ggtTGTTAGGGATGTGGTAAATTTTTGTAAGTTACCATAAAGAGGCATTTTGATC‑CTACCCACGTAATA‑TGGACACAGGCCTAAGCGAGGTTCTTGTTTTCAAA‑TTGTTCCGGACTGAGGCCG‑CCACACCAACTGTGCCGCCGCCACCGATTGTAATCACATTCGATATAATTAAACACCGTTGCCCGCATTATTTCCCGGCTGATAAAGTGTTCTCCATGGATACATTCCACTTTCAGCGAATGAaagaa < 1:380520/251‑1 (MQ=255) gtTGTGAGGGATGTGGTGAATTTTTTGGAGCCACCATAAAGCGGAATTTTGATC‑CTACCACCTTAATA‑TGGACACAGGCATAAGCGAGGTCCTTGTTTTCAAA‑TTGTACCGGCCTGAGGCCG‑CCACCCCAACTGTGCCGCCGCCACCGATTGTAATCACATTCGATATAATTAAACACCGTTGCCCGCATTATTTCCCGGCTGATAAAGTGTTCTCCATGGATACATTCCACTTTCAGCGAATGAaagaag < 2:744694/251‑1 (MQ=14) gggtaTGTGGTGATTTTTTGAGCTTCACCAAAAGGCGGCTTTTTGATCTCT‑CCCACGTAATA‑GGGACACAGGCCTAAGCGAGGTTTTTGTTTTAAAA‑TTGTTCCGGTCGGAGGCCG‑CCACTCCAACTGTGCCGCCGCCACCGATTGTAATCACATTCGATATAATTAAACACCGTTGCCCGCATTATTTCCCGGCTGATAAAGTGTTTTCCATGGATACATTCCACTTTCAGCGAATGAAAGAAGCTTTcc < 2:135601/247‑1 (MQ=11) 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GCTTTAGCGGAAAGGATTCGGGAAAATGTTGAGCGTTTAACTGGCGATAATCCTGAATACGCTATACCACAAAAAGTGACGATTAGTATTGGCGCTGTTGTGACTCAGGAAAATGCGTTAAACCCAAATGAGATCTATCGACTGGCTGATAACGCACTTTACGAGGCGAAAGAGACCGGGCGTAATAAGGTGGTTGTGAGGGATGTGGTGAATTTTTGTGAGTCACCATAAAGCGGCATTTTGATC‑CTACCCACGTAATA‑TGGACACAGGCCTAAGCGAGGTTCTTGTTTTCAAA‑TTGTTCCGGACTGAGGCCG‑CCACACCAACTGTGCCGCCGCCACCGATTGTAATCACATTCGATATAATTAAACACCGTTGCCCGCATTATTTCCCGGCTGATAAAGTGTTCTCCATGGATACATTCCACTTTCAGCGAATGAAAGAAGCTTTCCACGCAGGCATTATCGTAGCAGCAACCTTTTGCGCTC > NC_000913/1094004‑1094488 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |