| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC JC | NC_000913 | 3,546,574 | IS2 (+) +5 bp | coding (16‑20/1317 nt) | gntT → | high‑affinity gluconate transporter |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 2996361 = | NA (NA) | 122 (1.270) | 102/494 | 0.0 | 98.4% | noncoding (1331/1331 nt) | IS2 | repeat region |
| ? | NC_000913 | 3546574 = | 2 (0.020) | coding (16/1317 nt) | gntT | high‑affinity gluconate transporter | |||||
| * | ? | NC_000913 | 3186096 = | NA (NA) | 63 (0.660) | 60/490 | 0.5 | 96.9% | noncoding (1/1331 nt) | IS2 | repeat region |
| ? | NC_000913 | = 3546578 | 2 (0.020) | coding (20/1317 nt) | gntT | high‑affinity gluconate transporter | |||||
GCTTACGCCAGAGAAATAACTGGCTGGCTGCTACACCATGTTGCCGGGCAACGAGGGAGACCGTCATCCCCGGTTCAAAGCTCTGCTGAACAATTGCGATCTTTTCCTGTGTGGTACGCCGTCTGCGTT‑TCTCCGGCCCTAAGACATCAATCATCTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/3186340‑3186096‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑taGCAACAATGACTAATGGCATGATTTACCTGGCCTTTCATTTGTTATGGGTAACGTCAATTTTCTGACGACAAACTCTAATTATCCCAATCGGGAACAGAGATATTGCGGCACCACGACTGATACCCACTAAAACTAATTATTGTAGTCAGATGTCAGGAGTATGTTTGGTACCCATGTGAATGATACGGGTAACATCTGGCGTTTGAGAATCACCAGAGCGGGGTAAATTTAAATTATGAGAGGTTGG < NC_000913/3546578‑3546331 GCTTACGTCAGAGAAATAACTGGCTGGCTGCTACACCATGTTGCCGGGCAACGAGGGAGACCGTCAGCCCCGGTTCAAAGCTCTGCTGAACAATTGCGATCTTTTCCTGTGTGGTACGCCGTCTGCGTT‑TCTCCGGCCCTAAGACATCAATCATCTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAGCAAC < 1:524616/250‑1 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TAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAGCAACAATGACTAATGGCATGATTTACCTGGCCTTTCATTTGTTATGGGTAACGTCAATTTTCTGACGACAAACTCTAATTATCCCAATCGGGAACAGAGATATTGCGGCACCACGACTGATACCCACTAAAACTAATTATTGTAGTCAGATGTCAGGAGTATGTTTGGTACCCATGTGAATGATAC > 1:900796/1‑251 TAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAGCAACAATGACTAATGGCATGATTTACCTGGCCTTTCATTTGTTATGGGTAACGTCAATTTTCTGACGACAAACTCTAATTATCCCAATCGGGAACAGAGATATTGCGGCACCACGACTGATACCCACTAAAACTAATTATTGTAGTCAGATGTCAGGAGTATGTTTGGTACCCATGTGAATGATACGGGTA > 1:942252/1‑250 ACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAGCAACAATGACTAATGGCATGATTTACCTGGCCTTTCATTTGTTATGGGTAACGTCAATTTTCTGACGACAAACTCTAATTATCCCAATCGGGAACAGAGATATTGCGGCACCACGACTGATACCCACTAAAACTAATTATTGTAGTCAGATGTCAGGAGTATGTTTGGTACCCATGTGAATGATACGGGTAACATC > 1:298043/1‑251 CTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAGCAACAATGACTAATGGCATGATTTACCTGGCCTTTCATTTGTTATGGGTAACGTCAATTTTCTGACGACAAACTCTAATTATCCCAATCGGGAACAGAGATATTGCGGCACCACGACTGATACCCACTAAAACTAATTATTGTAGTAAGATGTCAGGAGTATGTTTGGTACCCATGTGAATGATACGGGTAACATCT > 1:565751/1‑251 ATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAGCAACAATGACTAATGGCATGATTTACCTGGCCTTTCATTTGTTATGGGTAACGTCAATTTTCTGACGACAAACTCTAATTATCCCAATCGGGAACAGAGATATTGCGGCACCACGACTGATACCCACTAAAACTAATTATTGTAGTCAGATGTCAGGAGTATGTTTGGTACCCATGTGAATGATACGGGTAACATCTG < 1:452181/250‑1 CACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAGCAACAATGACTAATGGCATGATTTACCTGGCCTTTCATTTGTTATGGGTAACGTCAATTTTCTGACGACAAACTCTAATTATCCCAATCGGGAACAGAGATATTGCGGCACCACGACTGATACCCACTAAAACTAATTATTGTAGTCAGATGTCAGGAGTATGTTTGGTACCCATGTGAATGATACGGGTAACATCTGGCG < 2:378839/251‑1 TTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAGCAACAATGACTAATGGCATGATTTACCTGGCCTTTCATTTGTTATGGGTAACGTCAATTTTCTGACGACAAACTCTAATTATCCCAATCGGGAACAGAGATATTGCGGCACCACGACTGATACCCACTAAAACTAATTATTGTAGTCAGATGTCAGGAGTATGTTTGGTACCCATGTGAATGAAACGGGTAACATCTGGCGTTTG > 1:317946/1‑248 TGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAGCAACAATGACTAATGGCATGATTTACCTGGCCTTTCATTTGTTATGGGTAACGTCAATTTTCTGACGACAAACTCTAATTATCCCAATCGGGAACAGAGATATTGCGGCACCACGACTGATACCCACTAAAACTAATTATTGTAGTCAGATGTCAGGAGTATGTTTGGTACCCATGTGAATGATACGGGTAACATCTGGCGTTTGAGAATCACCAGAG < 1:830841/250‑1 GGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAGCAACAATGACTAATGGCATGATTTACCTGGCCTTTCATTTGTTATGGGTAACGTCAATTTTCTGACGACAAACTCTAATTATCCCAATCGGGAACAGAGATATTGCGGCACCTCGACTGATGCCCACTAAAACTAATTATTGTAGTCAGATGTCAGGAGTATGTTTGGTACCCATGTGAATGATACGGGTAACATCTGGCGTTTGAGAATCACCAGAGCGGGGTAA < 2:451209/249‑1 TCAGGGGGCCAGTCTAGCAACAATGACTAATGGCATGATTTACCTGGCCTTTCATTTGTTATGGGTAACGTCAATTTTCTGACGACAAACTCTAATTATCCCAATCGGGAACAGAGATATTGCGGCACCACGACTGATACCCACTAAAACTAATTATTGTAGTCAGATGTCAGGAGTATGTTTGGTACCCATGTGAATGATACGGGTAACATCTGGCGTTTGAGAATCACCAGAGCGGGGTAAATTTAAAT > 1:902327/1‑251 GGGCCAGTCTAGCAACAATGACTAATGGCATGATTTACCTGGCCTTTCATTTGTTATGGGTAACGTCAATTTTCTGACGACAAACTCTAATTATCCCAATCGGGAACAGAGATATTGCGGCACCACGACTGATACCCACTAAAACTAATTATTGTAGTCAGGTGTCAGGAGTATGTTTGGTACCCATGTGAATGATACGGGTAACATCTGGCGTTTGAGAATCACCAGAGCGGGGTAAATTTAAATTATGA < 1:932249/251‑1 AGTCTAGCAACAATGACTAATGGCATGATTTACCTGGCCTTTCATTTGTTATGGGTAACGTCAATTTTCTGACGACAAACTCTAATTATCCCAATCGGGAACAGAGATATTGCGGCACCACGACTGATACCCACTAAAACTAATTATTGTAGTCAGATGTCAGGAGTATGTTTGGTACCCATGTGAATGATACGGGTAACATCTGGCGTTTGAGAATCACCAGAGCGGGGTAAATTTAAATTATGAGAGGT < 1:544612/251‑1 CTAGCAACAATGAATAATGGCATGGTTTACCTGGCCTTTCATTTGATATGGGTAACGTCACTTTTCTGACGACACACTCTCATTATCCCAATCGGGCACAGAGATATTGCGGCACCACGACTGATACCCACTAAAACTAATTATTGTAGTCAGATGTCAGGAGTATGTTTGGAACCCATGTGACTGATACGGGTACAATCTGGCGTTTGAGATTCAACAGAGCGGGGTAACTTAAAATTATGAGAGGTTGG > 2:463005/1‑251 GCTTACGCCAGAGAAATAACTGGCTGGCTGCTACACCATGTTGCCGGGCAACGAGGGAGACCGTCATCCCCGGTTCAAAGCTCTGCTGAACAATTGCGATCTTTTCCTGTGTGGTACGCCGTCTGCGTT‑TCTCCGGCCCTAAGACATCAATCATCTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/3186340‑3186096‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑taGCAACAATGACTAATGGCATGATTTACCTGGCCTTTCATTTGTTATGGGTAACGTCAATTTTCTGACGACAAACTCTAATTATCCCAATCGGGAACAGAGATATTGCGGCACCACGACTGATACCCACTAAAACTAATTATTGTAGTCAGATGTCAGGAGTATGTTTGGTACCCATGTGAATGATACGGGTAACATCTGGCGTTTGAGAATCACCAGAGCGGGGTAAATTTAAATTATGAGAGGTTGG < NC_000913/3546578‑3546331 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 17 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |