| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| JC JC | NC_000913 | 2,174,650 | IS1 (+) +9 bp | coding (392‑400/453 nt) | gatA ← | galactitol‑specific PTS enzyme IIA component |
| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | NC_000913 | = 2174658 | 1 (0.010) | 65 (0.680) | 60/494 | 0.5 | 98.4% | coding (392/453 nt) | gatA | galactitol‑specific PTS enzyme IIA component |
| ? | NC_000913 | 3583428 = | NA (NA) | noncoding (1/768 nt) | IS1 | repeat region | |||||
GCTTGAGCAGCACGCTATTGCAATACCGCATTGTGAGGCGATTCATGCTAAGTCGTCAGCCATTTATCTGTTAAGGCCAACAAATAAAGTTCATTTTCAGCAAGCGGATGATGATAACGACGTGGCGGTATCGTTGGTTATTGCGTTGATTGTGGAAAATCCGCAGCAGCAATTGAAACTTTTACGCTGTTTATTTGGCAAGTTACAACAGCCCGATATC‑GTCGAGACACTAATCACTCTTCCTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < 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ACTTTTACGCTGTTTATTTGGCAAGTTACAACAGCCCGATATC‑GTCGAGACACTAATCACTCTTCCTGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTG‑TTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTT < 2:841877/147‑1 CTTTTACGCTGTTTATTTGGCAAGTTACAACAGCCCGATATC‑GTCGAGACACTAATCACTCTTCCTGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTG‑TTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTGCTGCCTCAGATTCAGGTTATGCCGCTCAATTCGCTGCGTATATCGCTTGCTGATTACGTGCAGCTTT > 1:475726/1‑251 TACGCTGTTTATTTGGCAAGTTACAACAGCCCGATATC‑GTCGAGACACTAATCACTCTTCCTGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTG‑TTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTGCTGCCTCAGATTCAGGTTATGCCGCTCAATTCGCTGCGTCTATCGCTTGCTGATTACGTGCAGCTTTCCCT > 2:281640/1‑251 TACGCTGTTTATTTGGCAAGTTACAACAGCCCGATATC‑GTCGAGACACTAATCACTCTTCCTGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTG‑TTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTACACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTGCTGCCTCAGATTCAGGTTATGCCGCTCAATTCGCTGCGTATATCGCTTGCTGATTACGTGCAGCTTTCCC < 1:821555/250‑1 GCTGTTTATTTGGCAAGTTACAACAGCCCGATATC‑GTCGAGACACTAATCACTCTTCCTGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTG‑TTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTGCTGCCTCAGATTCAGGTTATGCCGCTCAATTCGCTGCGTATATCGCTTGCTGATTACGTGCAGCTTTCC < 1:836666/246‑1 GCTGTTTATTTGGCAAGTTACAACAGCCCGATATC‑GTCGAGACACTAATCACTCTTCCTGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTG‑TTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTGCTGCCTCAGATTCAGGTTATGCCGCTCAATTCGCTGCGTATATCGCTTGCTGATTACGTGCAGCTTTCC > 2:836666/1‑246 TTATTTGGCAAGTTACAACAGCCCGATATC‑GTCGAGACACTAATCACTCTTCCTGGGTAATGACTCCAACTTATCGATCGGG‑TTTTATGCTCAGATCATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCCATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGCGCTGCCTCAGATTCAGGTTTTCACGCTCAATACGCTGCGTATATCGCTTGCTGCTTACGTGCAGCTTTCCCTTCAGGCcg > 1:457780/1‑249 TTGGCAAGTTACACCAGCCCGATATC‑GTCGAGACACTAATCACTCTTCCTGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTG‑TTTTATGTTCAGATAATGCCCGATTACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTGCTGCCTCAGATTCAGGTTATGCCGCTCAATTCGCTGCGTATATCGCTTGCTGATTACGTGCAGCTTTCCCTTCAGGCGGGAT < 2:502230/250‑1 TTGGCAAGTTACAACAGCCCGATATC‑GTCGAGACACTAATCACTCTTCCTGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTG‑TTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTGCTGCCTCAGATTCAGGTTATGCCGCTCAATTCGCTGCGTATATCGCTTGCTGATTACGTGCAGCTTTCCCTTCAGGCGGGAT < 1:292938/250‑1 GGCAAGTTACAACAGCCCGATATC‑GTCGAGACACTAATCACTCTTCCTGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTG‑TTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGCCAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTGCTGCCTCAGATTCAGGTTATGCCGCTCAATTCGCTGCGTATATCGCTTGCTGATTACGTGCAGCTTTCCCTTCAGGCGGGTTTC > 2:315834/1‑250 GGCAAGTTACAACAGCCCGATATC‑GTCGAGACACTAATCACTCTTCCTGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTG‑TTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTGCTGCCTCAGATTCAGGTTATGCCGCTCAATTCGCTGCGTATATCGCTTGCTGATTACGTGCAGCTTTCCCTTCAGGCGGGATTC < 1:358673/250‑1 ACAACAGCCCGATATC‑GTCGAGACACTAATCACTCTTCCTGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTG‑TTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCCCCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTGCTGCCTCAGATTCAGGTTATGCCGCTCAATTCGCTCCGTATATCGCTTGCTGATTACGTGCAGCTTTCCCTTCAGGCGGGATTCATACAGCGG > 2:232578/1‑251 AACAGCCCGGTATC‑GTCGAGACACTAATAACTCTTCCTGGGTAATGACTACAACTTATTGGTAGTG‑TTTTATGTTCAGATAATACCCGCTGACTTTGTCATGCAGCTCCACAGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGAGCCAGGAGCTGCCTCAGATTCAGGTTATGCCGCTCAATTCGCTGCGGAAATCGCTTGCTGATTACGTGCAGCTTTCCATTCCGGCGGGAATCCTACAGCGGCC > 1:567432/1‑251 AACAGCCCAGTATC‑GTCGAGCCACTAATCACTCTTCCTGGGTAATGAATCCAACTTATTGATAGTG‑TTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATACAGCTCCATCGATTTTGAGAACGAAAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTGCAGCCTACGATTCAGGATATGCCGCTCAATGAGCTGCGTATATCGCTTGCTGATTACGTGATGCTTCCCCTTCAGGCGGGATTTATACAGCGGCC > 2:692950/1‑251 AGCCCGATATC‑GTCGAGACACTAATCACTCTTCCTGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTG‑TTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTGCTGCCTCAGATTCAGGTTATGCCGCTCAATTCGCTGCGTATATCGCTTGCTGATTACGTGCAGCTTTCCCTTCAGGCGGGATTCATACAGCGGCCAGC > 1:566147/1‑251 CCCGATATCTGT‑GAGACACCAATCCCTCTTCCTGGGTAATGACCCCAACTTATTGATAGTG‑TTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGTCGTTGTCAGGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTGCTGCCTCAGATTCAGGTTATGCCGCTCAATTCGCTGCGTATATCGCTTGCTGATTACGTGCAGCTTTCCCTTCAGGCGGGATTCATACAGCGGCCAGCCA < 2:77940/251‑1 CGATATC‑GTCGAGACACTAATCACTCTTCCTGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTG‑TTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTGCTGCCTCAGATTCAGGTTATGCCGCTCAATTCGCTGCGTATATCGCTTGCTGATTACGTGCAGCTTTCCCTTCAGGCGGGATTCATACAGCGGCCAGCCATC > 1:35615/1‑251 ATATC‑GTCGAGACACTAATCACTCTTCCTGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTG‑TTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTGCTGCCTCAGATTCAGGTTATGCCGCTCAATTCGCTGCGTATATCGCTTGCTGATTACGTGCAGCTTTCCCTTCAGGCGGGATTCATACAGCGGCCAGCCATCCG > 1:398889/1‑251 ATC‑GTCGAGACACTAATCACTCTTCCTGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTG‑TTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTGCTGCCTCAGATTCAGGTTATGCCGCTCAATTCGCTGCGTATATCGCTTGCTGATTACGTGCAGCTTTCCCTTCAGGCGGGATTCATACAGCGGCCAGCCATCCGTC > 1:709256/1‑251 CGAGACACTAATCACTCTTCCTGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTG‑TTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTGCT > 1:335949/1‑142 CGAGACACTAATCACTCTTCCTGGGTAAGGACTCCAACTTATTGATAGTG‑TTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTGCT < 2:335949/142‑1 GAGACACTAATCACTCTTCCTGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTG‑TTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGCTTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTGCTGCCTCAGATTCAGGTTATGCCGCTCAATTCGCTGCGTATATCGCTTGCTGATTACGTGCAGCTTTCCCTTCAGGCGGGATTCATACATCGGCCCGCCATCCGTCATCCAT > 2:915753/1‑251 ACACTAATCATCCTTCCTGGGTAATGACTCCAACTTATTGAAAGTT‑TTTTATTTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACTGATTTTGAGAACGACAGCGCCTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTGCTGCCTCAGATTCAGGTTATGCCGCTCAATTCGCTGCGTATATCGCTTGCTGATTACGTGCAGCTTTCCCTTCAGGCGGGATTCATACAGCGGCCAGCCATCCGTCATCCATATC < 2:768147/251‑1 AATCACTCTTCCTGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTG‑TTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTGCTGCCTCAGATTCAGGTTATGCCGCTCAATTCGCTGCGTATATCGCTTGCTGATTACGTGCAGCTTTCCCTTCAGGCGGGATTCATACAGCGGCCAGCCATCCGTCATC < 1:321185/240‑1 AATCACTCTTCCTGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTG‑TTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTGCTGCCTCAGATTCAGGTTATGCCGCTCAATTCGCTGCGTATATCGCTTGCTGATTACGTGCAGCTTTCCCTTCAGGCGGGATTCATACAGCGGCCAGCCATCCGTCATC > 2:321185/1‑240 ATCACTCTTCCTGGGTAATGACTCCAACTTATTGATTGTG‑TTTTATGTTCAGATAATGCCAGATGAACTTGTCATGCAGCTCTACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGCCCCAGCCGTGCCAGGTGCTGCCTCAGATTCAGGTTATGCCGCTCAATTCGCTGCGTATATCGCTTGCTGATTACGTGCAGCTTTCCCTTCAGGCGGGATTCATACAGCGGCCAGCCATCCGTCATCCATATCACCACG < 2:773975/251‑1 TCACTCTTCCTGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTG‑TTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTGCTGCCTCAGATTCAGGTTATGCCGCTCAATTCGCTGCGTATATCGCTTGCTGATTACGTGCAGCTTTCCCTTCAGGCGGGATTCCTACCGCTGCCAGCCATCCGTCCTCCCTATCACCCCGT > 2:877430/1‑251 CTCTTCCTGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTG‑TTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTGCTGCCTCAGATTCAGGTTATGCCGCTCAATTCGCTGCGTATATCGCTTGCTGATTACGTGCAGCTTTCCCTTCAGGCGGGATTCATACAGCGGCCAGCCATCCGTCATCCATATCACCACGTCA > 1:494961/1‑250 CCTGGGTAATGACTCCAACTTATTGACAGTG‑TTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTGCTGCCTCAGATTCAGGTTATGCCGCTCAATTCGCTGCGTATATCGCTTGCTGATTACGTGCAGCTTTCCCTTCAGGCGGGATTCATACAGCGGCCAGCCATCCGTCATCCATATCACCACGTCAAAGGGg > 1:788436/1‑250 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NC_000913/2174894‑2174650‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTG‑TTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTGCTGCCTCAGATTCAGGTTATGCCGCTCAATTCGCTGCGTATATCGCTTGCTGATTACGTGCAGCTTTCCCTTCAGGCGGGATTCATACAGCGGCCAGCCATCCGTCATCCATATCACCACGTCAAAGGGT < NC_000913/3584195‑3583949 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |