| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 84,415 | A→G | K16K (AAA→AAG) | leuO → | DNA‑binding transcriptional dual regulator LeuO |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 84,415 | 0 | A | G | 90.6% | 138.7 / 4.4 | 53 | K16K (AAA→AAG) | leuO | DNA‑binding transcriptional dual regulator LeuO |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (2/3); new base G (30/18); total (32/21) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.74e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 5.46e-01 | |||||||||||
TTATTATGCTGTGGTAAATGACTCATTCCACGGCAATGGATTCTGTTTTTATCAGAACCCGTATCTTTATGTTTTCCGAATTTTACTCATTTTGCTTTTTCTTATTTTATATGCATGATAAATCATATTCT‑TCAGGATTATTTCTCTGCATTCCAATAAGGGAAAGGGAGTTAAGTGTGACAGTGGAGTTAAGTATGCCAGAGGTACAAACAGATCATCCAGAGACGGCGGAGTTAAGCAAACCACAGCTACGCATGGTCGATCTCAACTTATTAACCGTTTTCGATGCCGTGATGCAGGAGCAAAACATTACTCGTGCCGCTCATGTTCTGGGAATGTCGCAACCTGCGGTCAGTAACGCTGTTGCACGCCTGAAGGTGATGTTTAATGACGAGCTTTTTGTTCGTTATGGCCGTGGTATTCAACCGACTGCTCGCGCATTTCAACTTTTTGGTTCAGTTCGTCAGGCATTGCAACTAGTACAAA > NC_000913/84174‑84659 | ttattaTGCTGTGGTAAATGACTCATTCCACGGCAATGGATTCTGTTTTTATCAGAACCCGTATCTTTATGTTTTCCTAATTTTACTCATTTTCCTTTTTCTTATTTTATATGCATGATAAATCATATTCT‑CGAGGATTATTTCTCTGCATTCCAATAAGGGAAAGGGAGTTAAGTGTGACAGTGGAGTTAAGTATGCCAGAGGTACAAACAGATCATCCAGAGACGGCGGAGTTAAGCAAGCCACAGCt > 2:286420/1‑250 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |