| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 84,267 | G→C | intergenic (‑559/‑101) | leuL ← / → leuO | leu operon leader peptide/DNA‑binding transcriptional dual regulator LeuO |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 84,267 | 0 | G | C | 86.5% | 96.4 / 9.2 | 39 | intergenic (‑559/‑101) | leuL/leuO | leu operon leader peptide/DNA‑binding transcriptional dual regulator LeuO |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (3/2); new base C (17/15); total (20/19) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 5.20e-01 | |||||||||||
ATTTGGTGAATATTATTGATCAATTAATGTTAAGAATTAATGCATTAAATATATAAATTAATTATTAAATAAGCACATTTAATCCATTTTGTAGATGATTGAGTATTCGCGGTAGTTATGATTAGATTGTTTTCGCAACAAAAACATTATGGATTATTATGCTGTGGTAAATGACTCATTCCACGGCAATGGATTCTGTTTTTATCAGAACCCGTATCTTTATGTTTTCCGAATTTTACTCATTTTGCTTTTTCTTATTTTATATGCATGATAAATCATATTCT‑TCAGGATTATTTCTCTGCATTCCAATAAGGGAAAGGGAGTTAAGTGTGACAGTGGAGTTAAGTATGCCAGAGGTACAAACAGATCATCCAGAGACGGCGGAGTTAAGCAAACCACAGCTACGCATGGTCGATCTCAACTTATTAACCGTTTTCGATGCCGTGATGCAGGAGCAAAACATTACTCGTGCCGCTCATGTTCTGG > NC_000913/84021‑84506 | atcttgtgtatatTAATAATCTATTAATGTTAAAAATTAATGCATTTAATATATAAATTAAATATTAAATAAGCACAATTAAGCCATTTTGGTGATGATTGAGTATTCGCGGTAGTTATGATTAGATTGTTTTCGAAACAAAAACATTATGTATTATTATGCTGTAGTAAATGACTCATTCCACGGCAATGGATTTTGTTTTTTTCAGAACCCGTATCTTTATGTTTGCCTAATTTTACTCCTTTTCCtt < 2:466509/241‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |