| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 70,371 | T→C | intergenic (‑323/‑16) | araB ← / → araC | ribulokinase/DNA‑binding transcriptional dual regulator AraC |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 70,371 | 0 | T | C | 94.2% | 151.1 / 0.6 | 53 | intergenic (‑323/‑16) | araB/araC | ribulokinase/DNA‑binding transcriptional dual regulator AraC |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/3); new base C (23/26); total (24/29) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.45e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 2.58e-01 | |||||||||||
AATCTTATGGATAAAAATGCTATGGCATAGCAAAGTGTGACGCCGTGCAAATAATCAATGTGGACTTTTCTGCCGTGATTATAGACACTTTTGTTACGCGTTTTTGTCATGGCTTTGGTCCCGCTTTGTTACAGAATGCTTTTAATAAGCGGGGTTACCGGTTGGGTTAGCGAGAAGAGCCAGTAAAAGACGCAGTGACGGCAATGTCTGATGCAATATGGACAATTGGTTTCTTCTCTGAATGGTGGGAGTATGAAAAGTATGGCTGAAGCGCAAAATGATC‑CCCTGCTGCCGGGATACTCGTTTAACGCCCATCTGGTGGCGGGTTTAACGCCGATTGAGGCCAACGGTTATCTCGATTTTTTTATCGACCGACCGCTGGGAATGAAA‑GGTTATATTCT‑C‑AATCTCACCATTCGCGGTCAGGGGGTGG‑TGAAAAATCAGGGACGAGAATTTGTCTGCCGACCGGGTGATATTTTGCTGTTCCCGCC > NC_000913/70126‑70613 | aaTCTTATGGATAAAAATGCTATGGCATAGCAAAGTGTGACGCCGTTCAAATAATCAATGTGGACTTTTCTGCCGTGATTATAGACTCTTTTGTTACGCGTTTTTGTCATGGCTTTGGTCCCGCTTTGTTACAGAATGCTTTTAATAAGCGGGGTTACCGGTTTGGTTAGCGAGAAGAGCCAGTAAAAGACGCAGTGACGGCAATGTCTGATGCAATATGGACAATTGGTTTCTTCTCTGAATGGCGGGAg < 2:152459/251‑1 (MQ=255) tATGGATAAAAATGCTATGGCATAGCAAAGTGTGACGCCGTGCAAATAATCAATGTGGACTTTTCTGCCGTGATTATAGACACTTTTGTTACGCGTTTTTGTCATGGCTTTGGTCCCGCTTTGTTACAGAATGCTTTTAATAAGCGGGGTTACCGGTTTGGTTAGCGAGAAGAGCCAGTAAAAGACGCAGTGACGGCAATGTCTGATGCAATATGGACAATTGGTTTCTTCTCTGAATGGCGGGAGt < 1:354895/247‑1 (MQ=255) gggATAAAAATGCTATGGCATAGCAAAGTGTGTCGCCGTGCAAATAATCAATGTGGACTTTTCTGCCGTGATTATAGACACTTTTGTTACGCGTTTTTGTCATGGCTTTGGTCCCGCTTTGTTACAGAATGCTTTTAATAAGCGGGGTTACCGGTTTGGTTAGCGAGAAGAGCCAGTAAAAGACGCAGTGACGGCAATGTCTGATGCAATATGGACAATTGGTTTCTTCTCTGAATGGCGGGAGTATGaaa < 2:421602/250‑1 (MQ=255) tGGCATAGCAAAGTGTGACGCCGTGCAAATAATCAATGTGGACTTTTCTGCCGTGATTATAGACACTTTTGTTACGCGTTTTTGTCATGGCTTTGGTCCCGCTTTGTTACAGAATGCTTTTAATAAGCGGGGTTACCGGTTTGGTTAGCGAGAAGAGCCAGTAAAAGACGCAGTGACGGCAATGTCTGATGCAATATGGACAATTGGTTTCTTCTCTGAATGGCGGGAGTATGAAAAGTATgggttaaggg > 1:595927/1‑243 (MQ=255) tGGCATAGCAAAGTGTGACGCCGTGCAAATAATCAATGTGGACTTTTCTGCCGTGATTATAGACACTTTTGTTACGCGTTTTTGTCATGGCTTTGGTCCCGCTTTGTTACAGAATGCTTTTAATAAGCGGGGTTACCGGTTTGGTTAGCGAGAAGAGCCAGTAAAAGACGCAGTGACGGCAATGTCTGATGCAATATGGACAATTGGTTTCTTCTCTGAATGGCGGGAGTATGAAAAGTATGGCTGAAgcg > 1:521364/1‑251 (MQ=255) gCATAGCAAAGTGTGACGCCGTGCAAATAATCAATGTGGACTTTTCTGCCGTGATTATAGACACTTTTGTTACGCGTTTTTGTCATGGCTTTGGTCCCGCTTTGTTACAGAATGCTTTTAATAAGCGGGGTTACTGGTTGGGTTAGCGAGAAGAGCCAGTAAAAGACGCAGTGACGGCAATGTCTGATGCAATATGGACAATTGGTTTCTTCTCTGAATGGTGGGAGTATGAAAAGTATGGCTGAAGCGCa < 1:41845/251‑1 (MQ=255) gCATAGCAAAGTGTGACGCCGTGCAAATAATCAATGTGGACTTTTATGCCGTGATTATAGACACTTTTGTTACGCGTTTTTGTCATGGCTTTGGTCCCGCTTTGTTACAGAATGCTTTTAATAAGCGGGGTTACTGGTTGGGTTAGCGAGAAGAGCCAGTAAAAGACGCAGTGACGGCAATGTCTGATGCATTATGGACAATTGGTTTCTTCTCTGATTGTGGGGAGTATGAAAAGTATGGTTGAAgcccc > 2:41845/1‑248 (MQ=255) aGCAAAGTGTGACGCCGTGCAAATAATCAATGTGGACTTTTCTGCCGTGATTATAGACACTTTTGTTACGCGTTTTTGTCATGGCTTTGGTCCCGCTTTGTTACAGAATGCTTTTAATAAGCGGGGTTACCGGTTTGGTTAGCGAGAAGAGCCAGTAAAAGACGCAGTGACGGCAATGTCTGATGCAATATGGACAATTGGTTTCTTCTCTGAATGGCGGGAGTATGAAAAGTATGGCTGAAGCGCaaaa < 1:475968/250‑1 (MQ=255) aaGTGTGACGCCGTGCAAATAATCAATGTGGACTTTTCTGCCGTGATTATAGACACTTTTGTTACGCGTTTTTGTCATGGCTTTGGTCCCGCTTTGTTACAGAATGCTTTTAATAAGCGGGGTTACCGGTTTGGTTAGCGAGAAGAGCCAGTAAAAGACGCAGTGACGGCAATGTCTGATGCAATATGGACAATTGGTTTCTTCTCTGAATGGCGGGTGGATGAAAAGTATGGCTGAAGCGCAAAATGATc > 2:109031/1‑251 (MQ=255) cGTGCAAATAATCAATGTGGACTTTTCTGCCGTGATTATAGACACTTTTGTTACGCGTTTTTGTCATGGCTTTGGTCCCGCTTTGTTACAGAATGCTTTTAATAAGCGGGGTTACCGGTTTGGTTAGCGAGAAGAGCCAGTAAAAGACGCAGTGACGGCAATGTCTGATGCAATATGGACAATTGGTTTCTTCTCTGAATGGCGGGAGTATGAAAAGGATGGCTGAAGCGCAAAATGATT‑CCCTGCTGCCg > 1:397649/1‑251 (MQ=255) aatCAATGTGGACTTTTCTGCCGTGATTATAGACACTTTTGTTACGCGTTTTTGTCATGGCTTTGGTCCCGCTTTGTTACAGAATGCTTTTAATAAGCGGGGTTACCGGTTTGGTTAGCGAGAAGAGCCAGTAAAAGACGCAGTGACGGCAATGTCTGATGCAATATGGACAATTGGTTTCTTCTCTGAATGGCGGGAGTATGAAAAGTATGGCTGAAGCGCAAAATGATC‑CCCTGCTGCCGGGATACTCg < 1:653138/251‑1 (MQ=255) aatCAATGTGGACTTTTCTGCCGTGATTATAGACACTTTTGTTACGCGTTTTTGTCATGGCTTTGGTCCCGCTTTGTTACAGAATGCTTTTAATAAGCGGGGTTACCGGTTGGGTTAGCGAGAAGAGCCAGTAAAAGACGCAGTGACGGCAATGTCTGATGCAATATGGACAATTGGTTTCTTCTCTGAATGGTGGGAGTATGAAAAGTATGGCTGAAGCGCAAAATGATC‑CCCTGCTGCCGGGATACTc < 1:318261/250‑1 (MQ=255) atCAATGTGGCCTTTTCTGCCGTGATTATAGACACTTTTGTTACGCGTTTTTGTCATGGCTTTGGTCCCGCTTTGTTACAGAATGCTTTTAATAAGCGGGGTTACCGGTTTGGTTAGCGAGAAGAGCCAGTAAAAGACGCAGTGACGGCAATGTCTGATGCAATATGGACAATTGGTTTCTTCTCTGAATGGCGGGCGTGTGAAAAGGATGGCTGAAGCGCAAAATGATCACCCT‑CTGCCGGGATAccggt > 2:321355/1‑247 (MQ=255) cAATGTGGACTTTTCTGCCGTGATTATAGACACTTTTGTTACGCGTTTTTGTCATGGCTTTGGTCCCGCTTTGTTACAGAATGCTTTTAATAAGCGGGGTTACCGGTTTGGTTAGCGATAAGAGCCAGTAAAAGACGCAGTGACGGCAATGTCTGATGCAATATGGACAATTGGTTTCTTCTCTGAATGGCGGGAGTATGAAAAGTATGGCTGAAGCGCAAAATGATC‑CCCTGCTGCCGGGATACTCGtt < 1:176268/250‑1 (MQ=255) cAATGTGGACTTTTCTGCCGTGATTATAGACACTTTTGTTACGCGTTTTTGTCATGGCTTTGGTCCCGCTTTGTTACAGAATGCTTTTAATAAGCGGGGTTACCGGTTTGGTTAGCGAGAAGAGCCAGTAAAAGGCGCAGTGACGGCAATGTCTGATGCAATATGGACAATTGGTTTCTTCTCTGAATGGCGGGAGTATGAAAAGTATGGCTGAAGCGCAAAATGATC‑CCCTGCTGCCGGGATACTCGtt < 1:468087/250‑1 (MQ=255) gttctatgcTGCCGCGATGATAGTCTCTTTTGTTACGCTCTTTTGTCATGGCTTTGGTCCCGCGTTGTTACTGAATGCTTTAAATAATCGGGGTCACCGGTTTGGTGAGCGAGAAGAGCCAGGAAAAGACGCAGTGACGGCAATGTCTGATGCAATATGGACAAGTGGTTTCTTCTCTGAATTGCGGGAGTATGAAAAGTATGTCTGAAGCGCAAAATGATC‑CCCTGCTGTCGGGATACTCGATTAATGcc < 2:516151/243‑1 (MQ=255) actcTTTTGTTACGCGGTTTTGTCATGGCTTTGGTCCCGCTTTGTTACAGAATGCTTTTAATAAGCGGGGTTACCGGTTTGGGTAGCGAGAAGAGCCAGTAAAAGACGCAGTGACGGCAATGTCTGATGCAATATGGACAATTGGTTTCTTCTCTGAATGGCGGGAGTATGAAAAGTATGGCTGAAGCGCAAAATGATC‑CCCTGCTGCCGGGATACTCGTTTAATGCCCATCTGGTGGCGGGTTTAACGcc < 1:434164/248‑1 (MQ=255) tGTTACGCGTTTTTGTCATGGCTTTGGTCCCGCTTTGTTACAGAATGCTTTTAATAAGCGGGGTTACCGGTTTGGTTAGCGAGAAGAGCCAGTAAAAGACGCAGTGACGGCAATGTCTGATGCAATATGGACAATTGGTTTCTTCTCTGAATGGCGGGAGTATGAAAAGTATGGCTGAAGCGCAAAATGATC‑CCCTGCTGCCGGGGTACTCGTTTAATGCCCATCTGGGGGCGGGGTTAAACCCGATTggg > 1:46907/1‑249 (MQ=255) ttACGCGTTTTTGTCATGGCTTTGGTCCCGCTTTGTTACAGAATGCTTTTAATAAGCGGGGTTACCGGTTTGGTTAGCGAGAAGAGCCAGTAAAAGACGCAGTGACGGCAATGTCTGATGCAATATGGACAATTGGTTTCTTCTCTGAATGGCGGGGGTATGAAAAGAATGGCTGGAGCGCCAAATGATT‑CCCTGCTGGCGGGGTACTCGTTTTATGCCCCTCTGGTGGCGGGttttgagccgcttgaggg > 2:98028/1‑236 (MQ=255) cgcgTTTTTGTCATGGCTTTGGTCCCGCTTTGTTACAGAATGCTTTTAATAAGCGGGGTTACCGGTTTGGTTAGCGAGAAGAGCCAGTAAAAGACGCAGTGACGGCAATGTCTGATGCAATATGGACAATTGGTTTCTTCTCTGAATGGCGGGAGTATGAAAAGTATGGCTGAAGCGCAAAATGTTC‑CCCTGCTGCCGGGATACTCGTTTAATGCCCATCTGGTGGCGGGTTTAACGCCGGTTGAGGccc > 1:199882/1‑249 (MQ=255) ggTCCCGCTTTGTTACAGAATGCTTTTAATAAGCGGGGTTACCGGTTTGGTTAGCGAGAAGAGCCAGTAAAAGACGCAGTGACGGCAATGTCTGATGCAATATGGACAATTGGATTCTTCTCTGAATGGCGGGAGTATGAAAAGTATGGCTGAAGAGCAAAATGATC‑CCCTGCTGCCGGGATACTCGTTTAATGCCCATCTGGTGGCGGGTTTAACGCCGCTTGTGGCCAACGGGTATTTCGAtttttttt > 1:624616/1‑250 (MQ=255) acGCTTTGTTACAGAATGCTTTTAATAAGCGGGGTTACCGGTTTGGTTAGCGAGAAGAGCCAGTAAAAGACGCAGTGACGGCAATGTCTGATGCAATATGGACAATTGGTTTCTTCTCTGAATGGCGGGAGTATGAAAAGTATGGCTGAAGCGCAAAATGATC‑CCATGCTGCCGGGATACTCGTTTAATGCCCATCTGGTGGCGGGTTTAACGACGATTGGGGCCAACGGTTTTCTCGATTTTTTTATcg > 1:24829/2‑250 (MQ=255) gCTTTGTTACAGAATGCTTTTAATAAGCGGGGTTACCGGTTTGGTTAGCGAGAAGAGCCAGTAAAAGACGCAGTGACGGCAATGTCTGATGCAATATGGACAATTGGTTTCTTCTCTGAATGGCGGGAGTATGAAAAGTATGGCTGAAGCGCAAAATGATC‑CCCTGCTGCCGGGATACTCGTTTAATGCCCATCTGGTGGCGGGTTTAACGCCGATTGAGGCCAACGGTTATCTCGATTTTTTTATcgacc < 2:521364/251‑1 (MQ=255) gCTTTGTTACAGAATGCTTTTAATAAGCGGGGTTACCGGTTTGGTTAGCGAGAAGAGCCAGTAAAAGACGCAGTGACGGCAATGGCTGATGCAATATGGACAATTGGTTTCTTCTCTGAATGGCGGGAGTATGAAAAGTATGGCTGAAGCGCAAAATGATC‑CCCTGCTGCCGGGATACTCGTTTAATGCCCATCTGGTGGCGGGTTTAAc < 1:407069/210‑1 (MQ=255) cTTTGTTACAGAATGCTTTTAATAAGCGGGGTTACCGGTTTGGTTAGCGAGAAGAGCCAGTAAAAGACGCAGTGACGGCAATGTCTGATGCAATATGGACAATTGGTTTCTTCTCTGAATGGCGGGAGTATGAAAAGTATGGCTGAAGCGCAAAATGATC‑CCCTGCTGCCGGGATACTCGTTTAATGCCCATCTGGTGGCGGGTTTTACGCCGCTTGAGGCCCACGGTTTTTTCGATTTTTTTTTcgaccc > 1:389190/1‑250 (MQ=255) tttGTTACAGAATGCTTTTAATAAGCGGGGTTACCGGTTTGGTTAGCGAGAAGAGCCAGTAAAAGACGCAGTGACGGCAATGTCTGATGCAATATGGACAATTGGTTTCTTCTCTGAATGGCGGGGGTATGGAAAGTATGGGTGAAGAGCCAAATGATC‑CCCTGCTGCCGGGATAATCGTTTAATGCCCATCTGGTGGCGGGTTTTACGCCCATTTAGGCCCAAGGGTATCTCGATTTTTTTTTcgcacgg > 1:697393/1‑246 (MQ=255) ttGTTACAGAATGCTTTTAATAAGCGGGGTTACCGGTTTGGTTAGCGAGAAGAGCCAGTAAAAGACGCAGTGACGGCAATGTCTGATGCAATATGGACAATTGGTTTCTTCTCTGAATGGCGGGAGTATGAAAAGTATGGCTGAAGCGCAAAATGATC‑CCCTGCTGCCGGGATACTCGTTTAATGCCCATCTGGTGGCGGGTTTAACGCCGGTTGAGGCCCACGGGTATCTCGGTTTTTTTATcgaccgac > 1:604919/1‑251 (MQ=255) cAGAATGCTTTTAATAAGCGGGGTTACCGGTTTGGTTAGCGAGAAGAGCCAGTAAAAGACGCAGTGACGGCAATGTCTGATGCAATATGGACAATTGGTTTCTTCTCTGAATGGCGGGAGTATGAAAAGTATGGCTGAAGCGCAAAATGATC‑CCCTGCTGCCGGGATACTCGTTTAATGCCCATCTGGTGGCGGGTTTAACGCCGATTGAGGCCAACGGTTATCTCGATTTTTTTATCGACCGACCGCTgg < 1:267106/251‑1 (MQ=255) aTGCTTTTAATAAGCGGGGTTACCGGTTTGGTTAGCGAGAAGAGCCAGTAAAAGACGCAGTGACGGCAATGTCTGATGCAATATGGACAATTGGTTTCTTCTCTGAATGGCGGGAGTATGAAAAGTATGGCTGAAGCGCAAAATGATC‑CCCTGCTGCCGGGATACTCGTTTAATGCCCATCTGGTGGCGGGTTTAACGCCGATTGAGGCCAACGGTTATCTCGATTTTTTTATCGACCGACCGCTGGGAAt < 1:98028/251‑1 (MQ=255) ataaGCGGGGTTACCGGTTTGGTTAGCGAGAAGAGCCAGTAAAAGACGCAGTGACGGCAATGTCTGATGCAATATGGACAATTGGTTTCTTCTCTGAATGGCGGGAGTATGAAAAGTATGGCTGAAGCGCAAAATGATC‑CCCTGCTGCCGGGATACTCGTTTAATGCCCATCTGGTGGCGGGTTTTAAGGCGATTGGGGGCCACGGGTTTCTCGGTTTTTTTTTCGACCGACCGCTgggggatcggaaa > 1:486778/1‑239 (MQ=255) aaaaGCGTGGTTACCTGTTTGGTTAGCGAGAAGAGCCAGTAAAAGACGCAGTGACGGCAATGTCTGATGCAATATGGACAATTGGTTTCTTCTCTGAATGGCGGGAGTATGAAAAGTATGGCTGAAGCGCAAAATGATC‑CCCTGCTGCCGGGATACTCGTTTAATGCCCATCTGGTGGCGGGTTTAACGCCGATTGAGGCCAACGGTTATCTCGATTTTTTTATCGACCGACCGCTggg < 2:486778/237‑1 (MQ=255) ggggTTACCGGTTTGGTTAGCGAGAAGAGCCAGTAAAAGACGCAGTGACGGCAATGTCTGATGCAATATGGACAATTGGTTTCTTCTCTGAATGGCGGGAGTATGAAAAGTATGGCTGAAGCGCAAAATGATC‑CCCTGCTGCCGGGATACTCGTTTAATGCCCATCTGGTGGCGGGtt < 2:227290/178‑1 (MQ=255) ggggTTACCGGTTTGGTTAGCGAGAAGAGCCAGTAAAAGACGCAGTGACGGCAATGTCTGATGCAATATGGACAATTGGTTTCTTCTCTGAATGGCGGGAGTATGAAAAGTATGGCTGAAGCGCAAAATGATC‑CCCTGCTGCCGGGATACTCGTTTAATGCCCATCTGGTGGCGGGtt > 1:227290/1‑178 (MQ=255) gttttcGGTTTGGTTAGCGGGAAGAGCCAGTAAAAGACGCAGTGACGGCAATGTCTGATGCAATATGGACAATTGGTTTCTTCACTGAATGGCGGGAGTATGAAAAGTATGGCTGAAGCGCAAAATGATC‑CCCTGCTGCCGGGATACTCGTTTAATGCCCATCTGGTGGCGGGTTTAACGCCGATTGAGGCCAAAGGTTATCTCGATTTTTTTATCGACCGACCGCTGGGAATGAAA‑GGTTATATTCT‑C‑aa < 2:429565/246‑1 (MQ=255) actggTTTGGTTAGAGAGAAGAGCCATTAAAAGACGCAGTTACGGCAATGTCTGATGCAATATGGACAATTGGTTTCTTCTCTGAATGGCGGGAGTATGAAAAGTATGGCTGAAGCGCAAAATGATC‑CCCTGCTGCCGGGATACTCGTTTAAGGCCCATCTGGTGGCGGGTTTAACGCCGATTGAGGTCAACGGTTATCTCGATTTTTT‑ATCGACCGACCGCTGTGAATGAAA‑GGTTATATTCT‑C‑AAtctc < 2:81429/248‑1 (MQ=255) accgtttttgTTAGCGAGAATAGCCAGTAAAAGCCGCAGGGACGGTAATGTCTGATGCAATATGGACAATTGGTTTCGTCTCTGAATGGCGGGAGGATGAAAAGTATTGCTGAAGCGCAAAATGATC‑CCCTGCTGCCGGGATACTCGTTTAATGCCCATCTGGTGGCGGGTGTAACGCCGATTGAGGCCAACGGTTATCTCGATTTTTTTATCGACCGACCGCTGGGAATGAAA‑GGTTATATTCT‑C‑AAtct < 2:383132/242‑1 (MQ=255) aCCGGTTTGGTTAGCGAGAAGAGCCAGTAAAAGACGCAGTGACGGCAATGTCTGATGCAATATGGACAATTGGTTTCTTCTCTGAATGGCGGGAGTATGAAAAGTATGGCTGAAGCGCAAAATGATC‑CCCTGCTGCCGGGATACTCGTTTAATGCCCATCTGGTGGCGGGTTTAACGCCGATTGAGGCCAACGGTTATCTCGATTTTTTTATCGACCGACCGCTGGGAATGAAA‑GGTTATATTCT‑C‑AAtct < 2:199882/251‑1 (MQ=255) cGGTTTGGTTAGCGAGAAGAGCCAGTAAAAGACGCAGTGACGGCAATGTCTGATGCAATATGGACAATTGGTTTCTTCTCTGAATGGCGGGAGTATGAAAAGTATGGCTGAAGCGCAAAATGATC‑CCCTGCTGCCGGGATACTCGTTTAATGCCCATCTGGTGGCGGGTTTAACGCCGATTGGGGCCAACGGTTAt > 1:189118/1‑196 (MQ=255) gTTAGCGAGAAGAGCCAGTAAAAGACGCAGTGACGGCAATGTCTGATGCAATATGGACAATTGGTTTCTTCTCTGAATGGCGGGAGTATGAAAAGTATGGCTGAAGCGCAAAATGATC‑CCCTGCTGCCGGGGTAATCGTTTAATGCCCATCTGGGGGCGGGGTTTACGCCGGTTTGGGCCAACGGTTCTCTCGATTTTTTTATTGACCGCACGCGGGGGATGAAA‑GGGTATTTTTT‑C‑AATCTCACCATTcg > 2:192308/1‑251 (MQ=255) agCCAGTTAAAGTCGCAGTGACGGCAATGTCTGATGCAATATGGACAATTGGTTTCTTCTCTGAATGGCGGGAGTATGAAAAGTATGGCTGAAGCGCAAAATGATC‑CCCTGCTGCCGGGATACTCGTTTAATGCCCATCTGGTGGCGGGTTTAACGCCGATTGAGGCCAACGGTTATCTCGATTTTTTTATCGACCGACCGCTGGGAATGAAA‑GGTTATATTCT‑C‑AATCTCACCATTCGCGGTCAGGGggt < 2:397649/251‑1 (MQ=255) agaaGACGCAGTGAAGGTAATGGCTGATGTAATAGGGACGATGTGTTTCTTCTCTTAATGGCGGGAGTATGAAAAGTATGGCTGAAGCGCAATATGATC‑CCCTGCTGCCTGGATACTCGTTTAATGCCCATCTGGTGGCGGGGTTAACGCCGAGTGAGGCCAACGGTTATCGCGATTTTTTTATCGAGCGACTGCTGGGGAGGAAA‑GGTTATATTCG‑C‑AATCTCCCCATTCGCGGTCAGGGGGTGG‑TGaaa < 2:51452/249‑1 (MQ=255) aaaaGACGCAGTGACGGCAATGTCTGATGCAATATGGACAATTGGTTTCTTCTCTGAATGTCGGGAGTATGAAAAGTATGGCTGAAGCGCAAAATGATC‑CCCTGCTGCCGGGATACTCGTTTAATGCCCATCTGGTGGCGGGTTTAACGCCGATTGAGGCCAACGGTTATCTCGATTTTTTTATCGACCGACCGCTGGGAATGAAA‑GGTTATATTCT‑C‑AATCTCACCATTCGCGGTCAGGGGGTGG‑TGaaa < 1:321355/251‑1 (MQ=255) aGTGACGGCAATGTCTGATGCAATATGGACAATTGGTTTCTTCTCTGAATGGCGGGAGTATGAAAAGTATGGCTGAAGCGCAAAATGATC‑CCCTGCTGCCGGGATACTCGTTTAATGCCCATCTGGTGGCGGGTTTAACGCCGATTGAGGCCAACGGTTATCTCGATTTTTTTATCGACCGACCGCTGGGAATg > 1:373188/1‑194 (MQ=255) aGTGACGGCAATGTCTGATGCAATATGGACAATTGGTTTCTTCTCTGAATGGCGGGAGTATGAAAAGTATGGCTGAAGCGCAAAATGATC‑CCCTGCTGCCGGGATACTCGTTTAATGCCCATCTGGTGGCGGGTTTAACGCCGATTGAGGCCAACGGTTATCTCGATTTTTTTATCGACCGACCGCTGGGAATg < 2:373188/194‑1 (MQ=255) tGTCTGATGCAATATGGACAATTGGTTTCTTCTCTGAATGGCGGGGGGATGAAAAGTATGGCTGAAGCGCAAAAAGATC‑CCCTGCTGCCGGGATAATCGTTTAATGCACATTTGGTGGAGGGGTTAAAGCCGATTTAGGACCACGGGTCTCTCGAATTTTTTTTCGGCCGTCAGGTGGGAATGAAAAGGTT‑TATTCT‑CCAAT‑TAACCAATACAGGTCAGGGGGTGGGTGATAATTCAGG‑ACGAGAAttttt > 1:86873/1‑249 (MQ=255) tCTGATGCAATATGGACAATTGGTTTCTTCTCTGAATGGCGGGGGAATGGAAAGTATGGCTGCAGCGCAAAATCATC‑CCCTGCTGCCGGGATACTCGATTAATGCCCATCTGGTGGCGGGGTTAACGCCGATTGAGGCCACAGGTTTTCTCGTTTTTTTTATTGCACGCCCGCTGGGACTTAAA‑CGTTATTTTCT‑C‑CATCTTCCCATTCTCGCGCAGGGGGGGG‑GGAAAAATCAGGGatcaggatttgttt > 1:40661/1‑238 (MQ=255) gATGCAATATGGACAATTGGTTTCTTCTCTGAATGGCGGGAGTATGAAAAGTATGGCTGAAGCGCAAAATGATC‑CCCTGCTGCCGGGATACTCGTTTAATGCCCATCTGGTGGCGGGTTTAACGCCGATTGAGGCCAACGGTTATCTCGATTTTTTTATCGACCGACCGCTGGGAATGAAA‑GGTTATATTCT‑C‑AATCTCACCATTCGCGGTCAGGGGGTGG‑TGAAAAATCAGGGACGAGAATTTGttt < 1:192308/248‑3 (MQ=255) gATGCAATATGGACAATTGGTTTCTTCTATGAATGGCGGGAGTATGAAAAGTATGGCTGCAGCGCAAAATGATC‑CCCTGCTGCCGGGATACTCGTTTAATGCCCATCTGGTGGCGGGTTTAACGCCGATTGAGGCCCACGGTTATCTCCGTTTTTTTATCGACCGACCCCTGGGGATGAAA‑GGTTTTATTCT‑C‑AATCTCACCCTTCGCGGTCAGGGGGGGG‑GGAAAAATTAGGGACGAGAATTTGTTTGcc > 1:136549/1‑251 (MQ=255) aCAATTGGTTTCTTCTCTGAATGGCGGGAGTATGAAAAGTATGGCTGAAGCGCAAAATGATC‑CCCTGCTGCCGGGATACTCGTTTAATGCCCATCTGGTGGCggg < 2:593818/105‑1 (MQ=255) aCAATTGGTTTCTTCTCTGAATGGCGGGAGTATGAAAAGTATGGCTGAAGCGCAAAATGATC‑CCCTGCTGCCGGGATACTCGTTTAATGCCCATCTGGTGGCggg > 1:593818/1‑105 (MQ=255) tttCTTCTCTGAATGGCGGGAGTATGAAAAGGATGGCTGAAGCGCCAAATGATC‑CCCTGCTGCCGGGATACTCGTTTAATGCCCATCTGGTGGCGGGTTTAAAGCCGATTGAAGCCAAAGGTTATCTCGGTTTTTTTTTCGAACGACCGCTGGGAATGAAA‑GATTATATTCTTC‑AAT‑TTACCAATTGCGGGCATGGGGTGG‑TGAAAAATCCGGGGGGAGAATTTTTTTTCCGACCGGGGGATATTTTGCTg > 1:191411/1‑251 (MQ=255) ctGAATGGCGGGAGTATGAAAAGTATGGCTGAAGCGCAAAATGATC‑CCCTGCTGCCGGGATACTCGTTTAATGCCCATCTGGTGGCGGGTTTAACGCCGATTGAGGCCAACGGTTATCTCGATTTTTTTATCGACCGACCGCTGGGAATGAAA‑GGTTATATTCT‑C‑AATCTCACCATTCGCGGTCAGGGGGTGG‑TGAAAAATCAGGGACGAGAATTTGTTTGCCGACCGGGTGATATTTTGCTGTTccc < 2:604919/248‑1 (MQ=255) gAATGGTGGGAGTATGAAAAGTATGGCTGAAGCGCAAAATGATC‑CCCTGCTGCCGGGATACTCGTTTAACGCCCATCTGGTGGCGGGTTTAACGCCGATTGAGGCCAACGGTTATCTCGATTTTTTTATCGACCGACCGCTGGGAATGAAA‑GGTTATATTCT‑C‑AATCTCACCATTCGCGGTCAGGGGGTGG‑TGAAAAATCAGGGACGAGAATTTGTCTGCCGACCGGGTGATATTTTGCTGTTCCCGcc < 1:11023/249‑1 (MQ=255) | AATCTTATGGATAAAAATGCTATGGCATAGCAAAGTGTGACGCCGTGCAAATAATCAATGTGGACTTTTCTGCCGTGATTATAGACACTTTTGTTACGCGTTTTTGTCATGGCTTTGGTCCCGCTTTGTTACAGAATGCTTTTAATAAGCGGGGTTACCGGTTGGGTTAGCGAGAAGAGCCAGTAAAAGACGCAGTGACGGCAATGTCTGATGCAATATGGACAATTGGTTTCTTCTCTGAATGGTGGGAGTATGAAAAGTATGGCTGAAGCGCAAAATGATC‑CCCTGCTGCCGGGATACTCGTTTAACGCCCATCTGGTGGCGGGTTTAACGCCGATTGAGGCCAACGGTTATCTCGATTTTTTTATCGACCGACCGCTGGGAATGAAA‑GGTTATATTCT‑C‑AATCTCACCATTCGCGGTCAGGGGGTGG‑TGAAAAATCAGGGACGAGAATTTGTCTGCCGACCGGGTGATATTTTGCTGTTCCCGCC > NC_000913/70126‑70613 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |